MMP8

MMP8
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1A86, 1JAP, 1I76, 1ZVX, 3TT4, 2OY2, 1ZS0, 1JAN, 1MMB, 1I73, 1A85, 1KBC, 1ZP5, 1JH1, 3DPF, 1JAQ, 3DPE, 1BZS, 4QKZ, 1JAO, 3DNG, 2OY4, 1MNC
Ідентифікатори
Символи	MMP8, CLG1, HNC, MMP-8, PMNL-CL, matrix metallopeptidase 8
Зовнішні ІД	OMIM: 120355 MGI: 1202395 HomoloGene: 22482 GeneCards: MMP8
Реагує на сполуку
cts-1027
Онтологія гена Молекулярна функція • zinc ion binding • GO:0070122 peptidase activity • hydrolase activity • metallopeptidase activity • зв'язування з іоном металу • serine-type endopeptidase activity • metalloendopeptidase activity • endopeptidase activity Клітинна компонента • GO:0005578 Позаклітинна матриця • extracellular region • specific granule lumen • tertiary granule lumen • міжклітинний простір • collagen-containing extracellular matrix Біологічний процес • collagen catabolic process • extracellular matrix disassembly • endodermal cell differentiation • протеоліз • neutrophil degranulation • GO:1901313 positive regulation of gene expression • negative regulation of gene expression • negative regulation of interleukin-10 production • positive regulation of interleukin-6 production • positive regulation of DNA binding • positive regulation of MAPK cascade • positive regulation of nitric oxide biosynthetic process • positive regulation of JNK cascade • regulation of neuroinflammatory response • positive regulation of neuroinflammatory response • positive regulation of NIK/NF-kappaB signaling • positive regulation of reactive oxygen species biosynthetic process • regulation of microglial cell activation • positive regulation of microglial cell activation • extracellular matrix organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4317	17394
Ensembl	ENSG00000118113	ENSMUSG00000005800
UniProt	P22894	O70138
RefSeq (мРНК)	NM_001304441 NM_001304442 NM_002424	NM_008611
RefSeq (білок)	NP_001291370 NP_001291371 NP_002415	NP_032637
Локус (UCSC)	Хр. 11: 102.71 – 102.73 Mb	Хр. 9: 7.56 – 7.57 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

MMP8 (англ. Matrix metallopeptidase 8) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 467 амінокислот, а молекулярна маса — 53 412.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MFSLKTLPFL		LLLHVQISKA		FPVSSKEKNT		KTVQDYLEKF		YQLPSNQYQS
TRKNGTNVIV		EKLKEMQRFF		GLNVTGKPNE		ETLDMMKKPR		CGVPDSGGFM
LTPGNPKWER		TNLTYRIRNY		TPQLSEAEVE		RAIKDAFELW		SVASPLIFTR
ISQGEADINI		AFYQRDHGDN		SPFDGPNGIL		AHAFQPGQGI		GGDAHFDAEE
TWTNTSANYN		LFLVAAHEFG		HSLGLAHSSD		PGALMYPNYA		FRETSNYSLP
QDDIDGIQAI		YGLSSNPIQP		TGPSTPKPCD		PSLTFDAITT		LRGEILFFKD
RYFWRRHPQL		QRVEMNFISL		FWPSLPTGIQ		AAYEDFDRDL		IFLFKGNQYW
ALSGYDILQG		YPKDISNYGF		PSSVQAIDAA		VFYRSKTYFF		VNDQFWRYDN
QRQFMEPGYP		KSISGAFPGI		ESKVDAVFQQ		EHFFHVFSGP		RYYAFDLIAQ
RVTRVARGNK		WLNCRYG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Knaeuper V., Kraemer S., Reinke H., Tschesche H. (1990). Characterization and activation of procollagenase from human polymorphonuclear leucocytes. N-terminal sequence determination of the proenzyme and various proteolytically activated forms. Eur. J. Biochem. 189: 295—300. PMID 2159879 DOI:10.1111/j.1432-1033.1990.tb15489.x
• Blaeser J., Knaeuper V., Osthues A., Reinke H., Tschesche H. (1991). Mercurial activation of human polymorphonuclear leucocyte procollagenase. Eur. J. Biochem. 202: 1223—1230. PMID 1662606 DOI:10.1111/j.1432-1033.1991.tb16494.x
• Blaeser J., Triebel S., Reinke H., Tschesche H. (1992). Formation of a covalent Hg-Cys-bond during mercurial activation of PMNL procollagenase gives evidence of a cysteine-switch mechanism. FEBS Lett. 313: 59—61. PMID 1330697 DOI:10.1016/0014-5793(92)81184-N
• Knaeuper V., Kraemer S., Reinke H., Tschesche H. (1990). Partial amino acid sequence of human PMN leukocyte procollagenase. Biol. Chem. Hoppe-Seyler. 371: 295—304. PMID 2169256
• Knaeuper V., Kraemer S., Reinke H., Tschesche H. (1990). Biol. Chem. Hoppe-Seyler. 371: 733—733. {{cite journal}}: Пропущений або порожній |title= (довідка) PMID 2169766

Див. також

• Хромосома 11