MMP1

MMP1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1AYK, 1CGE, 1CGF, 1CGL, 1HFC, 1SU3, 2AYK, 2CLT, 2J0T, 2TCL, 3AYK, 3SHI, 4AUO, 4AYK
Ідентифікатори
Символи	MMP1, CLG, CLGN, matrix metallopeptidase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 120353 MGI: 1933846 HomoloGene: 20544 GeneCards: MMP1
Реагує на сполуку
cipemastat
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0070122 peptidase activity • zinc ion binding • endopeptidase activity • metalloendopeptidase activity • hydrolase activity • metallopeptidase activity • зв'язування з іоном металу • serine-type endopeptidase activity Клітинна компонента • GO:0005578 Позаклітинна матриця • extracellular region • міжклітинний простір Біологічний процес • collagen catabolic process • extracellular matrix disassembly • GO:0022415 viral process • leukocyte migration • протеоліз • positive regulation of protein oligomerization • cytokine-mediated signaling pathway • extracellular matrix organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4312	83995
Ensembl	ENSG00000196611	ENSMUSG00000043089
UniProt	P03956	Q9EPL5
RefSeq (мРНК)	NM_002421 NM_001145938	NM_032006
RefSeq (білок)	NP_001139410 NP_002412	NP_114395
Локус (UCSC)	Хр. 11: 102.79 – 102.8 Mb	Хр. 9: 7.46 – 7.48 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

MMP1 (англ. Matrix metallopeptidase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 469 амінокислот, а молекулярна маса — 54 007.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MHSFPPLLLL		LFWGVVSHSF		PATLETQEQD		VDLVQKYLEK		YYNLKNDGRQ
VEKRRNSGPV		VEKLKQMQEF		FGLKVTGKPD		AETLKVMKQP		RCGVPDVAQF
VLTEGNPRWE		QTHLTYRIEN		YTPDLPRADV		DHAIEKAFQL		WSNVTPLTFT
KVSEGQADIM		ISFVRGDHRD		NSPFDGPGGN		LAHAFQPGPG		IGGDAHFDED
ERWTNNFREY		NLHRVAAHEL		GHSLGLSHST		DIGALMYPSY		TFSGDVQLAQ
DDIDGIQAIY		GRSQNPVQPI		GPQTPKACDS		KLTFDAITTI		RGEVMFFKDR
FYMRTNPFYP		EVELNFISVF		WPQLPNGLEA		AYEFADRDEV		RFFKGNKYWA
VQGQNVLHGY		PKDIYSSFGF		PRTVKHIDAA		LSEENTGKTY		FFVANKYWRY
DEYKRSMDPG		YPKMIAHDFP		GIGHKVDAVF		MKDGFFYFFH		GTRQYKFDPK
TKRILTLQKA		NSWFNCRKN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як взаємодія хазяїн-вірус. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Brinckerhoff C.E., Ruby P.L., Austin S.D., Fini M.E., White H.D. (1987). Molecular cloning of human synovial cell collagenase and selection of a single gene from genomic DNA. J. Clin. Invest. 79: 542—546. PMID 3027129 DOI:10.1172/JCI112845
• Clark I.M., Cawston T.E. (1989). Fragments of human fibroblast collagenase. Purification and characterization. Biochem. J. 263: 201—206. PMID 2557822 DOI:10.1042/bj2630201
• Springman E.B., Angleton E.L., Birkedal-Hansen H., Van Wart H.E. (1990). Multiple modes of activation of latent human fibroblast collagenase: evidence for the role of a Cys73 active-site zinc complex in latency and a 'cysteine switch' mechanism for activation. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87: 364—368. PMID 2153297 DOI:10.1073/pnas.87.1.364
• Desrochers P.E., Jeffrey J.J., Weiss S.J. (1991). Interstitial collagenase (matrix metalloproteinase-1) expresses serpinase activity. J. Clin. Invest. 87: 2258—2265. PMID 1645757 DOI:10.1172/JCI115262
• Saarinen J., Welgus H.G., Flizar C.A., Kalkkinen N., Helin J. (1999). N-glycan structures of matrix metalloproteinase-1 derived from human fibroblasts and from HT-1080 fibrosarcoma cells. Eur. J. Biochem. 259: 829—840. PMID 10092871 DOI:10.1046/j.1432-1327.1999.00105.x

Див. також

• Хромосома 11