MMP10

MMP10
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1Q3A, 3V96, 4ILW
Ідентифікатори
Символи	MMP10, SL-2, STMY2, matrix metallopeptidase 10
Зовнішні ІД	OMIM: 185260 MGI: 97007 HomoloGene: 20546 GeneCards: MMP10
шифр КФ	3.4.24.22
Онтологія гена Молекулярна функція • zinc ion binding • GO:0070122 peptidase activity • metalloendopeptidase activity • hydrolase activity • metallopeptidase activity • зв'язування з іоном металу • serine-type endopeptidase activity Клітинна компонента • extracellular region • міжклітинний простір • GO:0005578 Позаклітинна матриця Біологічний процес • collagen catabolic process • extracellular matrix disassembly • regulation of cell migration • протеоліз • response to hypoxia • extracellular matrix organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4319	17384
Ensembl	ENSG00000166670	ENSMUSG00000047562
UniProt	P09238	O55123
RefSeq (мРНК)	NM_002425	NM_019471
RefSeq (білок)	NP_002416	NP_062344
Локус (UCSC)	Хр. 11: 102.77 – 102.78 Mb	Хр. 9: 7.5 – 7.51 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

MMP10 (англ. Matrix metallopeptidase 10) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 476 амінокислот, а молекулярна маса — 54 151.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MMHLAFLVLL		CLPVCSAYPL		SGAAKEEDSN		KDLAQQYLEK		YYNLEKDVKQ
FRRKDSNLIV		KKIQGMQKFL		GLEVTGKLDT		DTLEVMRKPR		CGVPDVGHFS
SFPGMPKWRK		THLTYRIVNY		TPDLPRDAVD		SAIEKALKVW		EEVTPLTFSR
LYEGEADIMI		SFAVKEHGDF		YSFDGPGHSL		AHAYPPGPGL		YGDIHFDDDE
KWTEDASGTN		LFLVAAHELG		HSLGLFHSAN		TEALMYPLYN		SFTELAQFRL
SQDDVNGIQS		LYGPPPASTE		EPLVPTKSVP		SGSEMPAKCD		PALSFDAIST
LRGEYLFFKD		RYFWRRSHWN		PEPEFHLISA		FWPSLPSYLD		AAYEVNSRDT
VFIFKGNEFW		AIRGNEVQAG		YPRGIHTLGF		PPTIRKIDAA		VSDKEKKKTY
FFAADKYWRF		DENSQSMEQG		FPRLIADDFP		GVEPKVDAVL		QAFGFFYFFS
GSSQFEFDPN		ARMVTHILKS		NSWLHC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 11