Перейти до вмісту

MMP16

Очікує на перевірку
Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
MMP16
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи MMP16, C8orf57, MMP-X2, MT-MMP2, MT-MMP3, MT3-MMP, matrix metallopeptidase 16
Зовнішні ІД OMIM: 602262 MGI: 1276107 HomoloGene: 55939 GeneCards: MMP16
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_005941
NM_022564
NM_032297
NM_019724
NM_001379518
NM_001379519
RefSeq (білок)
NP_005932
NP_062698
NP_001366447
NP_001366448
Локус (UCSC) Хр. 8: 88.03 – 88.33 Mb Хр. 4: 17.85 – 18.12 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

MMP16 (англ. Matrix metallopeptidase 16) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 607 амінокислот, а молекулярна маса — 69 521[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MILLTFSTGRRLDFVHHSGVFFLQTLLWILCATVCGTEQYFNVEVWLQKY
GYLPPTDPRMSVLRSAETMQSALAAMQQFYGINMTGKVDRNTIDWMKKPR
CGVPDQTRGSSKFHIRRKRYALTGQKWQHKHITYSIKNVTPKVGDPETRK
AIRRAFDVWQNVTPLTFEEVPYSELENGKRDVDITIIFASGFHGDSSPFD
GEGGFLAHAYFPGPGIGGDTHFDSDEPWTLGNPNHDGNDLFLVAVHELGH
ALGLEHSNDPTAIMAPFYQYMETDNFKLPNDDLQGIQKIYGPPDKIPPPT
RPLPTVPPHRSIPPADPRKNDRPKPPRPPTGRPSYPGAKPNICDGNFNTL
AILRREMFVFKDQWFWRVRNNRVMDGYPMQITYFWRGLPPSIDAVYENSD
GNFVFFKGNKYWVFKDTTLQPGYPHDLITLGSGIPPHGIDSAIWWEDVGK
TYFFKGDRYWRYSEEMKTMDPGYPKPITVWKGIPESPQGAFVHKENGFTY
FYKGKEYWKFNNQILKVEPGYPRSILKDFMGCDGPTDRVKEGHSPPDDVD
IVIKLDNTASTVKAIAIVIPCILALCLLVLVYTVFQFKRKGTPRHILYCK
RSMQEWV

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

[ред. | ред. код]
  • Takino T., Sato H., Shinagawa A., Seiki M. (1995). Identification of the second membrane-type matrix metalloproteinase (MT-MMP-2) gene from a human placenta cDNA library. MT-MMPs form a unique membrane-type subclass in the MMP family. J. Biol. Chem. 270: 23013—23020. PMID 7559440 DOI:10.1074/jbc.270.39.23013
  • Matsumoto S., Katoh M., Saito S., Watanabe T., Masuho Y. (1997). Identification of soluble type of membrane-type matrix metalloproteinase-3 formed by alternatively spliced mRNA. Biochim. Biophys. Acta. 1354: 159—170. PMID 9396633 DOI:10.1016/S0167-4781(97)00120-6
  • Shofuda K., Yasumitsu H., Nishihashi A., Miki K., Miyazaki K. (1997). Expression of three membrane-type matrix metalloproteinases (MT-MMPs) in rat vascular smooth muscle cells and characterization of MT3-MMPs with and without transmembrane domain. J. Biol. Chem. 272: 9749—9754. PMID 9092507 DOI:10.1074/jbc.272.15.9749
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7162 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  4. UniProt, P51512 (англ.) . Архів оригіналу за 1 червня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]