MMP28

MMP28
Ідентифікатори
Символи	MMP28, EPILYSIN, MM28, MMP-25, MMP-28, MMP25, matrix metallopeptidase 28
Зовнішні ІД	OMIM: 608417 MGI: 2153062 HomoloGene: 41559 GeneCards: MMP28
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0070122 peptidase activity • hydrolase activity • metallopeptidase activity • metalloendopeptidase activity • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • extracellular region • цитоплазма • GO:0005578 Позаклітинна матриця • collagen-containing extracellular matrix • міжклітинний простір Біологічний процес • протеоліз • negative regulation of macrophage chemotaxis • extracellular matrix organization • collagen catabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	79148	118453
Ensembl	ENSG00000278843 ENSG00000271447	ENSMUSG00000020682
UniProt	Q9H239	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001032278 NM_024302 NM_032950	NM_080453 NM_172797 NM_001320300
RefSeq (білок)	NP_001027449 NP_077278 NP_116568 NP_116568.1	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 17: 35.76 – 35.8 Mb	Хр. 11: 83.33 – 83.35 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

MMP28 (англ. Matrix metallopeptidase 28) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 520 амінокислот, а молекулярна маса — 58 939.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVARVGLLLR		ALQLLLWGHL		DAQPAERGGQ		ELRKEAEAFL		EKYGYLNEQV
PKAPTSTRFS		DAIRAFQWVS		QLPVSGVLDR		ATLRQMTRPR		CGVTDTNSYA
AWAERISDLF		ARHRTKMRRK		KRFAKQGNKW		YKQHLSYRLV		NWPEHLPEPA
VRGAVRAAFQ		LWSNVSALEF		WEAPATGPAD		IRLTFFQGDH		NDGLGNAFDG
PGGALAHAFL		PRRGEAHFDQ		DERWSLSRRR		GRNLFVVLAH		EIGHTLGLTH
SPAPRALMAP		YYKRLGRDAL		LSWDDVLAVQ		SLYGKPLGGS		VAVQLPGKLF
TDFETWDSYS		PQGRRPETQG		PKYCHSSFDA		ITVDRQQQLY		IFKGSHFWEV
AADGNVSEPR		PLQERWVGLP		PNIEAAAVSL		NDGDFYFFKG		GRCWRFRGPK
PVWGLPQLCR		AGGLPRHPDA		ALFFPPLRRL		ILFKGARYYV		LARGGLQVEP
YYPRSLQDWG		GIPEEVSGAL		PRPDGSIIFF		RDDRYWRLDQ		AKLQATTSGR
WATELPWMGC		WHANSGSALF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

• Marchenko G.N., Strongin A.Y. (2001). MMP-28, a new human matrix metalloproteinase with an unusual cysteine-switch sequence is widely expressed in tumors. Gene. 265: 87—93. PMID 11255011 DOI:10.1016/S0378-1119(01)00360-2
• Lohi J., Wilson C.L., Roby J.D., Parks W.C. (2001). Epilysin, a novel human matrix metalloproteinase (MMP-28) expressed in testis and keratinocytes and in response to injury. J. Biol. Chem. 276: 10134—10144. PMID 11121398 DOI:10.1074/jbc.M001599200
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 17