ADAMTS12

ADAMTS12
Ідентифікатори
Символи	ADAMTS12, PRO4389, ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 12
Зовнішні ІД	OMIM: 606184 MGI: 2146046 HomoloGene: 12808 GeneCards: ADAMTS12
Пов'язані генетичні захворювання
інсульт, цереброваскулярні хвороби
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • GO:0070122 peptidase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • metalloendopeptidase activity • hydrolase activity • metallopeptidase activity • zinc ion binding Клітинна компонента • extracellular region • GO:0005578 Позаклітинна матриця • collagen-containing extracellular matrix Біологічний процес • regulation of endothelial tube morphogenesis • proteoglycan catabolic process • negative regulation of hepatocyte growth factor receptor signaling pathway • negative regulation of cellular response to vascular endothelial growth factor stimulus • cellular response to tumor necrosis factor • cellular response to BMP stimulus • negative regulation of cellular response to hepatocyte growth factor stimulus • протеоліз • negative regulation of chondrocyte differentiation • cellular response to interleukin-1 • regulation of inflammatory response • proteolysis involved in cellular protein catabolic process • cell-matrix adhesion • cell migration Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	81792	239337
Ensembl	ENSG00000151388 ENSG00000281690	ENSMUSG00000047497
UniProt	P58397	Q811B3
RefSeq (мРНК)	NM_030955 NM_001324511 NM_001324512	NM_175501
RefSeq (білок)	NP_001311440 NP_001311441 NP_112217	NP_780710
Локус (UCSC)	Хр. 5: 33.52 – 33.89 Mb	Хр. 15: 11.06 – 11.35 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ADAMTS12 (англ. ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 12) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 594 амінокислот, а молекулярна маса — 177 676.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPCAQRSWLA		NLSVVAQLLN		FGALCYGRQP		QPGPVRFPDR		RQEHFIKGLP
EYHVVGPVRV		DASGHFLSYG		LHYPITSSRR		KRDLDGSEDW		VYYRISHEEK
DLFFNLTVNQ		GFLSNSYIME		KRYGNLSHVK		MMASSAPLCH		LSGTVLQQGT
RVGTAALSAC		HGLTGFFQLP		HGDFFIEPVK		KHPLVEGGYH		PHIVYRRQKV
PETKEPTCGL		KDSVNISQKQ		ELWREKWERH		NLPSRSLSRR		SISKERWVET
LVVADTKMIE		YHGSENVESY		ILTIMNMVTG		LFHNPSIGNA		IHIVVVRLIL
LEEEEQGLKI		VHHAEKTLSS		FCKWQKSINP		KSDLNPVHHD		VAVLLTRKDI
CAGFNRPCET		LGLSHLSGMC		QPHRSCNINE		DSGLPLAFTI		AHELGHSFGI
QHDGKENDCE		PVGRHPYIMS		RQLQYDPTPL		TWSKCSEEYI		TRFLDRGWGF
CLDDIPKKKG		LKSKVIAPGV		IYDVHHQCQL		QYGPNATFCQ		EVENVCQTLW
CSVKGFCRSK		LDAAADGTQC		GEKKWCMAGK		CITVGKKPES		IPGGWGRWSP
WSHCSRTCGA		GVQSAERLCN		NPEPKFGGKY		CTGERKRYRL		CNVHPCRSEA
PTFRQMQCSE		FDTVPYKNEL		YHWFPIFNPA		HPCELYCRPI		DGQFSEKMLD
AVIDGTPCFE		GGNSRNVCIN		GICKMVGCDY		EIDSNATEDR		CGVCLGDGSS
CQTVRKMFKQ		KEGSGYVDIG		LIPKGARDIR		VMEIEGAGNF		LAIRSEDPEK
YYLNGGFIIQ		WNGNYKLAGT		VFQYDRKGDL		EKLMATGPTN		ESVWIQLLFQ
VTNPGIKYEY		TIQKDGLDND		VEQQMYFWQY		GHWTECSVTC		GTGIRRQTAH
CIKKGRGMVK		ATFCDPETQP		NGRQKKCHEK		ACPPRWWAGE		WEACSATCGP
HGEKKRTVLC		IQTMVSDEQA		LPPTDCQHLL		KPKTLLSCNR		DILCPSDWTV
GNWSECSVSC		GGGVRIRSVT		CAKNHDEPCD		VTRKPNSRAL		CGLQQCPSSR
RVLKPNKGTI		SNGKNPPTLK		PVPPPTSRPR		MLTTPTGPES		MSTSTPAISS
PSPTTASKEG		DLGGKQWQDS		STQPELSSRY		LISTGSTSQP		ILTSQSLSIQ
PSEENVSSSD		TGPTSEGGLV		ATTTSGSGLS		SSRNPITWPV		TPFYNTLTKG
PEMEIHSGSG		EEREQPEDKD		ESNPVIWTKI		RVPGNDAPVE		STEMPLAPPL
TPDLSRESWW		PPFSTVMEGL		LPSQRPTTSE		TGTPRVEGMV		TEKPANTLLP
LGGDHQPEPS		GKTANRNHLK		LPNNMNQTKS		SEPVLTEEDA		TSLITEGFLL
NASNYKQLTN		GHGSAHWIVG		NWSECSTTCG		LGAYWRRVEC		STQMDSDCAA
IQRPDPAKRC		HLRPCAGWKV		GNWSKCSRNC		SGGFKIREIQ		CVDSRDHRNL
RPFHCQFLAG		IPPPLSMSCN		PEPCEAWQVE		PWSQCSRSCG		GGVQERGVFC
PGGLCDWTKR		PTSTMSCNEH		LCCHWATGNW		DLCSTSCGGG		FQKRTVQCVP
SEGNKTEDQD		QCLCDHKPRP		PEFKKCNQQA		CKKSADLLCT		KDKLSASFCQ
TLKAMKKCSV		PTVRAECCFS		CPQTHITHTQ		RQRRQRLLQK		SKEL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз. Задіяний у таких біологічних процесах, як альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

• Cal S., Argueelles J.M., Fernandez P.L., Lopez-Otin C. (2001). Identification, characterization, and intracellular processing of ADAM-TS12, a novel human disintegrin with a complex structural organization involving multiple thrombospondin-1 repeats. J. Biol. Chem. 276: 17932—17940. PMID 11279086 DOI:10.1074/jbc.M100534200
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 5