MMP12

MMP12
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1JIZ, 1JK3, 1OS2, 1OS9, 1RMZ, 1ROS, 1UTT, 1UTZ, 1Y93, 1YCM, 1Z3J, 2HU6, 2JXY, 2K2G, 2K9C, 2KRJ, 2MLR, 2MLS, 2OXU, 2OXW, 2OXZ, 2POJ, 2W0D, 2WO8, 2WO9, 2WOA, 2Z2D, 3BA0, 3EHX, 3EHY, 3F15, 3F16, 3F17, 3F18, 3F19, 3F1A, 3LIK, 3LIL, 3LIR, 3LJG, 3LK8, 3LKA, 3N2U, 3N2V, 3NX7, 3RTS, 3RTT, 3TS4, 3TSK, 3UVC, 4EFS, 4GQL, 4GR0, 4GR3, 4GR8, 4GUY, 4H30, 4H49, 4H76, 4H84, 4I03, 4IJO, 2N8R, 5I4O, 5I0L, 5I2Z, 5I3M, 5I43
Ідентифікатори
Символи	MMP12, HME, ME, MME, MMP-12, Matrix metallopeptidase 12
Зовнішні ІД	OMIM: 601046 MGI: 97005 HomoloGene: 20547 GeneCards: MMP12
Реагує на сполуку
	cts-1027
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0070122 peptidase activity; • endopeptidase activity; • hydrolase activity; • metallopeptidase activity; • зв'язування з іоном металу; • serine-type endopeptidase activity; • metalloendopeptidase activity; • calcium ion binding; • collagen binding; • zinc ion binding; • sequence-specific DNA binding;
Клітинна компонента	• GO:0005578 Позаклітинна матриця; • extracellular region; • міжклітинний простір; • клітинне ядро; • цитоплазма;
Біологічний процес	• collagen catabolic process; • wound healing, spreading of epidermal cells; • extracellular matrix disassembly; • positive regulation of epithelial cell proliferation involved in wound healing; • Загоєння ран; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • протеоліз; • protein import into nucleus; • GO:1901313 positive regulation of gene expression; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • regulation of defense response to virus by host; • negative regulation of type I interferon-mediated signaling pathway; • positive regulation of type I interferon-mediated signaling pathway; • cellular response to virus; • response to hypoxia; • elastin catabolic process; • negative regulation of endothelial cell-matrix adhesion via fibronectin; • extracellular matrix organization; • response to amyloid-beta;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	4321
	17381
	ENSG00000262406
	ENSMUSG00000049723
	P39900
	P34960
	NM_002426
	NM_008605; NM_001320076; NM_001320077
	NP_002417
	NP_001307005; NP_001307006; NP_032631
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

MMP12 (англ. Matrix metallopeptidase 12) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 470 амінокислот, а молекулярна маса — 54 002^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MKFLLILLLQ	ATASGALPLN	SSTSLEKNNV	LFGERYLEKF	YGLEINKLPV
TKMKYSGNLM	KEKIQEMQHF	LGLKVTGQLD	TSTLEMMHAP	RCGVPDVHHF
REMPGGPVWR	KHYITYRINN	YTPDMNREDV	DYAIRKAFQV	WSNVTPLKFS
KINTGMADIL	VVFARGAHGD	FHAFDGKGGI	LAHAFGPGSG	IGGDAHFDED
EFWTTHSGGT	NLFLTAVHEI	GHSLGLGHSS	DPKAVMFPTY	KYVDINTFRL
SADDIRGIQS	LYGDPKENQR	LPNPDNSEPA	LCDPNLSFDA	VTTVGNKIFF
FKDRFFWLKV	SERPKTSVNL	ISSLWPTLPS	GIEAAYEIEA	RNQVFLFKDD
KYWLISNLRP	EPNYPKSIHS	FGFPNFVKKI	DAAVFNPRFY	RTYFFVDNQY
WRYDERRQMM	DPGYPKLITK	NFQGIGPKID	AVFYSKNKYY	YFFQGSNQFE
YDFLLQRITK	TLKSNSWFGC

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Nar H., Werle K., Bauer M.M.T., Dollinger H., Jung B. (2001). Crystal structure of human macrophage elastase (MMP-12) in complex with a hydroxamic acid inhibitor. J. Mol. Biol. 312: 743—751. PMID 11575929 DOI:10.1006/jmbi.2001.4953
Shapiro S.D., Kobayashi D.K., Ley T.J. (1993). Cloning and characterization of a unique elastolytic metalloproteinase produced by human alveolar macrophages. J. Biol. Chem. 268: 23824—23829. PMID 8226919

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Matrix metallopeptidase 12 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7158 (англ.) . Архів оригіналу за 15 червня 2017. Процитовано 8 вересня 2017. [Архівовано 2017-06-15 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, P39900 (англ.) . Архів оригіналу за 5 жовтня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 11

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Сполуки, які фізично взаємодіють з Matrix metallopeptidase 12 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7158 (англ.) . Архів оригіналу за 15 червня 2017. Процитовано 8 вересня 2017. [Архівовано 2017-06-15 у Wayback Machine.]

[UniProt-5] UniProt, P39900 (англ.) . Архів оригіналу за 5 жовтня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

п о р Протеази: металоендопептидази (EC 3.4.24)
Білки ADAM	Альфа-секретази ADAM9 ADAM10 ADAM17 ADAM19 ADAM2 ADAM7 ADAM8 ADAM11 ADAM12 ADAM15 ADAM18 ADAM22 ADAM23 ADAM28 ADAM33 ADAMTS1 ADAMTS2 ADAMTS3 ADAMTS4 ADAMTS5 ADAMTS8 ADAMTS9 ADAMTS10 ADAMTS12 ADAMTS13
Матриксні металопротеїнази	Колагенази MMP1 MMP8 Желатинази MMP2 MMP9 MMP3 MMP7 MMP10 MMP11 MMP12 MMP13 MMP14 MMP15 MMP16 MMP17 MMP19 MMP20 MMP21 MMP23A MMP23B MMP24 MMP25 MMP26 MMP27 MMP28