ZBTB7A

ZBTB7A
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2IF5, 2NN2
Ідентифікатори
Символи	ZBTB7A, FBI-1, FBI1, LRF, ZBTB7, ZNF857A, pokemon, TIP21, zinc finger and BTB domain containing 7A, MNDLFH
Зовнішні ІД	OMIM: 605878 MGI: 1335091 HomoloGene: 7820 GeneCards: ZBTB7A
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • histone acetyltransferase binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • transcription corepressor binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001106 transcription corepressor activity • sequence-specific DNA binding • SMAD binding • androgen receptor binding Клітинна компонента • клітинне ядро • цитоплазма • NuRD complex • site of double-strand break • DNA-dependent protein kinase complex Біологічний процес • multicellular organism development • диференціація клітин • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome • regulation of glycolytic process • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • ремоделювання хроматину • cellular response to DNA damage stimulus • B cell differentiation • negative regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway • protein localization to nucleus • regulation of apoptotic process • erythrocyte maturation • fat cell differentiation • negative regulation of Notch signaling pathway • regulation of DNA-binding transcription factor activity • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • negative regulation of androgen receptor signaling pathway • double-strand break repair via classical nonhomologous end joining • regulation of transcription regulatory region DNA binding Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51341	16969
Ensembl	ENSG00000178951	ENSMUSG00000035011
UniProt	O95365	O88939
RefSeq (мРНК)	NM_015898 NM_001317990 NM_020224	NM_010731
RefSeq (білок)	NP_001304919 NP_056982	NP_034861 NP_001391790 NP_001391791 NP_001391792 NP_001391793 NP_001391794 NP_001391795 NP_001391796
Локус (UCSC)	Хр. 19: 4.04 – 4.07 Mb	Хр. 10: 80.97 – 80.99 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ZBTB7A (англ. Zinc finger and BTB domain containing 7A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 584 амінокислот, а молекулярна маса — 61 439.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAGGVDGPIG		IPFPDHSSDI		LSGLNEQRTQ		GLLCDVVILV		EGREFPTHRS
VLAACSQYFK		KLFTSGAVVD		QQNVYEIDFV		SAEALTALMD		FAYTATLTVS
TANVGDILSA		ARLLEIPAVS		HVCADLLDRQ		ILAADAGADA		GQLDLVDQID
QRNLLRAKEY		LEFFQSNPMN		SLPPAAAAAA		ASFPWSAFGA		SDDDLDATKE
AVAAAVAAVA		AGDCNGLDFY		GPGPPAERPP		TGDGDEGDSN		PGLWPERDED
APTGGLFPPP		VAPPAATQNG		HYGRGGEEEA		ASLSEAAPEP		GDSPGFLSGA
AEGEDGDGPD		VDGLAASTLL		QQMMSSVGRA		GAAAGDSDEE		SRADDKGVMD
YYLKYFSGAH		DGDVYPAWSQ		KVEKKIRAKA		FQKCPICEKV		IQGAGKLPRH
IRTHTGEKPY		ECNICKVRFT		RQDKLKVHMR		KHTGEKPYLC		QQCGAAFAHN
YDLKNHMRVH		TGLRPYQCDS		CCKTFVRSDH		LHRHLKKDGC		NGVPSRRGRK
PRVRGGAPDP		SPGATATPGA		PAQPSSPDAR		RNGQEKHFKD		EDEDEDVASP
DGLGRLNVAG		AGGGGDSGGG		PGAATDGNFT		AGLA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Impens F., Radoshevich L., Cossart P., Ribet D. (2014). Mapping of SUMO sites and analysis of SUMOylation changes induced by external stimuli. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 111: 12432—12437. PMID 25114211 DOI:10.1073/pnas.1413825111
• Schubot F.D., Tropea J.E., Waugh D.S. (2006). Structure of the POZ domain of human LRF, a master regulator of oncogenesis. Biochem. Biophys. Res. Commun. 351: 1—6. PMID 17052694 DOI:10.1016/j.bbrc.2006.09.167
• Stogios P.J., Chen L., Prive G.G. (2007). Crystal structure of the BTB domain from the LRF/ZBTB7 transcriptional regulator. Protein Sci. 16: 336—342. PMID 17189472 DOI:10.1110/ps.062660907

Див. також

• Хромосома 19