ATF4

ATF4
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1CI6
Ідентифікатори
Символи	ATF4, CREB-2, CREB2, TAXREB67, TXREB, activating transcription factor 4
Зовнішні ІД	OMIM: 604064 MGI: 88096 HomoloGene: 1266 GeneCards: ATF4
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • core promoter sequence-specific DNA binding • protein C-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • leucine zipper domain binding • protein heterodimerization activity • protein kinase binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • ATF1-ATF4 transcription factor complex • ATF4-CREB1 transcription factor complex • transcription regulator complex • dendrite membrane • клітинне ядро • Lewy body core • nuclear periphery • мембрана • клітинна мембрана • нуклеоплазма • центр організації мікротрубочок • neuron projection • цитоскелет • CHOP-ATF4 complex • центросома • GO:0009327 protein-containing complex • RNA polymerase II transcription regulator complex Біологічний процес • gamma-aminobutyric acid signaling pathway • глюконеогенез • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to endoplasmic reticulum stress • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of oxidative stress-induced neuron death • cellular response to amino acid starvation • mRNA transcription by RNA polymerase II • circadian regulation of gene expression • response to endoplasmic reticulum stress • PERK-mediated unfolded protein response • response to manganese-induced endoplasmic reticulum stress • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of neuron apoptotic process • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to endoplasmic reticulum stress • GO:1901313 positive regulation of gene expression • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to oxidative stress • циркадний ритм • negative regulation of potassium ion transport • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to arsenic-containing substance • cellular response to glucose starvation • negative regulation of translational initiation in response to stress • ритмічний процес • cellular response to UV • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to stress • cellular amino acid metabolic process • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • positive regulation of apoptotic process • positive regulation of vascular endothelial growth factor production • positive regulation of transcription by RNA polymerase I • cellular response to dopamine • response to toxic substance • neuron differentiation • cellular response to oxygen-glucose deprivation • positive regulation of endoplasmic reticulum stress-induced intrinsic apoptotic signaling pathway • cellular calcium ion homeostasis • positive regulation of biomineral tissue development • negative regulation of cold-induced thermogenesis • positive regulation of vascular associated smooth muscle cell apoptotic process • positive regulation of sodium-dependent phosphate transport Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	468	11911
Ensembl	ENSG00000128272	ENSMUSG00000042406
UniProt	P18848	Q06507
RefSeq (мРНК)	NM_182810 NM_001675	NM_001287180 NM_009716
RefSeq (білок)	NP_001666 NP_877962	NP_001274109 NP_033846
Локус (UCSC)	Хр. 22: 39.52 – 39.52 Mb	Хр. 15: 80.14 – 80.14 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ATF4 (англ. Activating transcription factor 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 351 амінокислот, а молекулярна маса — 38 590.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTEMSFLSSE		VLVGDLMSPF		DQSGLGAEES		LGLLDDYLEV		AKHFKPHGFS
SDKAKAGSSE		WLAVDGLVSP		SNNSKEDAFS		GTDWMLEKMD		LKEFDLDALL
GIDDLETMPD		DLLTTLDDTC		DLFAPLVQET		NKQPPQTVNP		IGHLPESLTK
PDQVAPFTFL		QPLPLSPGVL		SSTPDHSFSL		ELGSEVDITE		GDRKPDYTAY
VAMIPQCIKE		EDTPSDNDSG		ICMSPESYLG		SPQHSPSTRG		SPNRSLPSPG
VLCGSARPKP		YDPPGEKMVA		AKVKGEKLDK		KLKKMEQNKT		AATRYRQKKR
AEQEALTGEC		KELEKKNEAL		KERADSLAKE		IQYLKDLIEE		VRKARGKKRV
P

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, біологічні ритми. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, мембрані.

Література

• Karpinski B.A., Morle G.D., Huggenvik J., Uhler M.D., Leiden J.M. (1992). Molecular cloning of human CREB-2: an ATF/CREB transcription factor that can negatively regulate transcription from the cAMP response element. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89: 4820—4824. PMID 1534408 DOI:10.1073/pnas.89.11.4820
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Hai T., Liu F., Coukos W.J., Green M.R. (1989). Transcription factor ATF cDNA clones: an extensive family of leucine zipper proteins able to selectively form DNA-binding heterodimers. Genes Dev. 3: 2083—2090. PMID 2516827 DOI:10.1101/gad.3.12b.2083
• Ohoka N., Yoshii S., Hattori T., Onozaki K., Hayashi H. (2005). TRB3, a novel ER stress-inducible gene, is induced via ATF4-CHOP pathway and is involved in cell death. EMBO J. 24: 1243—1255. PMID 15775988 DOI:10.1038/sj.emboj.7600596
• Su N., Kilberg M.S. (2008). C/EBP homology protein (CHOP) interacts with activating transcription factor 4 (ATF4) and negatively regulates the stress-dependent induction of the asparagine synthetase gene. J. Biol. Chem. 283: 35106—35117. PMID 18940792 DOI:10.1074/jbc.M806874200
• Shoval Y., Berissi H., Kimchi A., Pietrokovski S. (2011). New modularity of DAP-kinases: alternative splicing of the DRP-1 gene produces a ZIPk-like isoform. PLoS ONE. 6: E17344—E17344. PMID 21408167 DOI:10.1371/journal.pone.0017344

Див. також

• Хромосома 22