SOX7

SOX7
Ідентифікатори
Символи	SOX7, SRY-box 7, SRY-box transcription factor 7
Зовнішні ІД	OMIM: 612202 MGI: 98369 HomoloGene: 7949 GeneCards: SOX7
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • regulation of canonical Wnt signaling pathway • positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • endoderm formation • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • negative regulation of cell population proliferation • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • диференціація клітин Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	83595	20680
Ensembl	ENSG00000171056 ENSG00000285438	ENSMUSG00000063060
UniProt	Q9BT81	P40646
RefSeq (мРНК)	NM_031439	NM_011446
RefSeq (білок)	NP_113627	NP_035576
Локус (UCSC)	Хр. 8: 10.72 – 10.73 Mb	Хр. 14: 64.18 – 64.19 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SOX7 (англ. SRY-box 7) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 8-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 388 амінокислот, а молекулярна маса — 42 197.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASLLGAYPW		PEGLECPALD		AELSDGQSPP		AVPRPPGDKG		SESRIRRPMN
AFMVWAKDER		KRLAVQNPDL		HNAELSKMLG		KSWKALTLSQ		KRPYVDEAER
LRLQHMQDYP		NYKYRPRRKK		QAKRLCKRVD		PGFLLSSLSR		DQNALPEKRS
GSRGALGEKE		DRGEYSPGTA		LPSLRGCYHE		GPAGGGGGGT		PSSVDTYPYG
LPTPPEMSPL		DVLEPEQTFF		SSPCQEEHGH		PRRIPHLPGH		PYSPEYAPSP
LHCSHPLGSL		ALGQSPGVSM		MSPVPGCPPS		PAYYSPATYH		PLHSNLQAHL
GQLSPPPEHP		GFDALDQLSQ		VELLGDMDRN		EFDQYLNTPG		HPDSATGAMA
LSGHVPVSQV		TPTGPTETSL		ISVLADATAT		YYNSYSVS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 8