POU2F2

POU2F2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1HDP
Ідентифікатори
Символи	POU2F2, OCT2, OTF2, Oct-2, POU class 2 homeobox 2
Зовнішні ІД	OMIM: 164176 MGI: 101897 HomoloGene: 55674 GeneCards: POU2F2
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • protein domain specific binding • DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • sequence-specific DNA binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро • цитоплазма • нуклеоплазма • внутрішньоклітинна мембранна органела Біологічний процес • humoral immune response • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • cell maturation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • mature B cell differentiation • transcription by RNA polymerase II • snRNA transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5452	18987
Ensembl	ENSG00000028277	ENSMUSG00000008496
UniProt	P09086	Q00196
RefSeq (мРНК)	NM_001207025 NM_001207026 NM_001247994 NM_002698 NM_001393934 NM_001393935 NM_001393936 NM_001394376 NM_001394377 NM_001394378	NM_001163554 NM_001163555 NM_001163556 NM_011138
RefSeq (білок)	NP_001193954 NP_001193955 NP_001234923 NP_002689	NP_001157026 NP_001157027 NP_001157028 NP_035268
Локус (UCSC)	Хр. 19: 42.09 – 42.2 Mb	Хр. 7: 24.79 – 24.88 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

POU2F2 (англ. POU class 2 homeobox 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 479 амінокислот, а молекулярна маса — 51 209.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVHSSMGAPE		IRMSKPLEAE		KQGLDSPSEH		TDTERNGPDT		NHQNPQNKTS
PFSVSPTGPS		TKIKAEDPSG		DSAPAAPLPP		QPAQPHLPQA		QLMLTGSQLA
GDIQQLLQLQ		QLVLVPGHHL		QPPAQFLLPQ		AQQSQPGLLP		TPNLFQLPQQ
TQGALLTSQP		RAGLPTQAVT		RPTLPDPHLS		HPQPPKCLEP		PSHPEEPSDL
EELEQFARTF		KQRRIKLGFT		QGDVGLAMGK		LYGNDFSQTT		ISRFEALNLS
FKNMCKLKPL		LEKWLNDAET		MSVDSSLPSP		NQLSSPSLGF		DGLPGRRRKK
RTSIETNVRF		ALEKSFLANQ		KPTSEEILLI		AEQLHMEKEV		IRVWFCNRRQ
KEKRINPCSA		APMLPSPGKP		ASYSPHMVTP		QGGAGTLPLS		QASSSLSTTV
TTLSSAVGTL		HPSRTAGGGG		GGGGAAPPLN		SIPSVTPPPP		ATTNSTNPSP
QGSHSAIGLS		GLNPSTGPGL		WWNPAPYQP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Clerc R.G., Corcoran L.M., Lebowitz J.H., Baltimore D., Sharp P.A. (1988). The B-cell-specific Oct-2 protein contains POU box- and homeo box-type domains. Genes Dev. 2: 1570—1581. PMID 3265124 DOI:10.1101/gad.2.12a.1570
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Mueller M.M., Ruppert S., Schaffner W., Matthias P. (1988). A cloned octamer transcription factor stimulates transcription from lymphoid-specific promoters in non-B cells. Nature. 336: 544—551. PMID 2904653 DOI:10.1038/336544a0
• Ko H.-S., Fast P., McBride W., Staudt L.M. (1988). A human protein specific for the immunoglobulin octamer DNA motif contains a functional homeobox domain. Cell. 55: 135—144. PMID 2901913 DOI:10.1016/0092-8674(88)90016-5
• Tanaka M., Lai J.-S., Herr W. (1992). Promoter-selective activation domains in Oct-1 and Oct-2 direct differential activation of an snRNA and mRNA promoter. Cell. 68: 755—767. PMID 1739980 DOI:10.1016/0092-8674(92)90150-B
• Sivaraja M., Botfield M.C., Mueller M., Jancso A., Weiss M.A. (1994). Solution structure of a POU-specific homeodomain: 3D-NMR studies of human B-cell transcription factor Oct-2. Biochemistry. 33: 9845—9855. PMID 7914745 DOI:10.1021/bi00199a005

Див. також

• Хромосома 19