Insulin A
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Trujillo - Per
2016 00
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Bioinformtica: Insulina
P.C.
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formas de prender y apagar los genes, a fin de que la clula slo fabrique lo que necesita. Por ello en las
secuencias promotoras (o promotores genticos) algunos nucletidos del ADN funcionan como
secuencias reguladoras (son llamados elementos CIS), localizados en la regin 5del ADN adyacente al
sitio de la transcripcin, los cuales pueden recibir unas protenas especiales que prenden o apagan el
gen. A estas protenas especiales que se unen al promotor se les llama Factores de Transcripcin.
En humanos, el gen de la insulina se encuentra en una sola copia en el genoma. El gen est
formado por tres exones separados por dos intrones cuyas secuencias son altamente conservadas. El
intrn 1 (179 pb) se localiza en la regin 5no traducida; el intrn 2, dentro de la secuencia que codifica
para el pptido C. La transcripcin est fuertemente regulada y slo las clulas B del Pncreas pueden
realizarla.
Elementos Cis del gen de la Insulina: dentro de las primeras 400 pb (-400 en el ADN) en la regin
5, adyacente al gen de la insulina se encuentra la regin de la regulacin de la transcripcin. Posee un
elemento promotor proximal ubicado en la regin 5a -100 pb del inicio de la transcripcin. Se
encuentran dos tipos de secuencias reguladoras en CIS; las tipo E; que se describen: CANNTG (N,
simboliza cualquier nucletido) y las tipo A, que se describen como: TAAT. Existen sitios negativos de
regulacin, como en la posicin -279 a -265 por arriba del gen, contiene tres sitios de unin a protenas y
funciona como un apagador (silenciador de la transcripcin), inhibiendo el complejo ARN polimerasa. (3)
Regulacin del gen de la insulina por la glucosa. La insulina es sintetizada y secretada en respuesta
a varios estmulos, siendo la glucosa el principal agonista. La glucosa estimula los grnulos de secrecin
y acta a varios niveles para aumentar: 1) la sntesis de insulina, a nivel de la transcripcin y
procesamiento del pre ARNm aumentado la velocidad de corte del segundo intrn, 2) la estabilidad del
mensajero, disminuyendo su velocidad de degradacin y 3) la traduccin y el procesamiento de
proinsulina a insulina.
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3.
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5.
Bovin
Horse
Human
Mouse
Pantr
Pig
Sheep
Toro:
Caballo
Hombre
Ratn
Chimpanc
Cerdo
Oveja
En la parte superior, seleccione download y hacer click en Go. Por defecto las secuencias son
mostradas en formato FASTA.
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6.
Aparecen la lista de secuencias proteicas para cada protena seleccionada. Copie el texto en un
archivo .txt y gurdelo (con el nombre Ins_sequences). Para smbolo de aminocidos ver Anexo I.
2.
3.
Retorne a la pgina inicial page, seleccione Click to Enter the Biology Workbench, coloque su
User ID and password y luego haga click en enter.
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4.
En la nueva pgina, haga click en Session Tools (nota: es tambin posible escoger el color del
fondo: gris, rosado o azul).
5.
En la lista que aparece en el casillero en blanco seleccione Start New Session y luego hacer click
en Run.
6.
Da un nombre a la nueva sesin (ej. insulin) y hacer click en Start New Session otra vez.
7.
La pgina previa aparecer otra vez con el nombre de la nueva sesin y la fecha.
8.
Ahora haga click en Protein Tools. De la lista que aparece en la ventana blanca, seleccione Add
New Protein Sequence y luego click en Run.
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9.
10. La secuencia puede ser importada, una por una, en Workbench. Luego haga click en Save.
11. En este punto, la pgina inicial de Protein Tools est actualizada con el nombre de la sesin y
las secuencias de las protenas importadas.
12. Primero, vamos a comparar dos secuencias, ej. Humana y de pollo. Ellas pueden ser seleccionadas
marcando el recuadro que se encuentra a la izquierda del nombre. En el casillero central en blanco,
debe buscar y seleccionar CLUSTALW Multiple Sequence Alignment. Luego click en Run.
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13.
La pgina resultante mostrar las secuencias seleccionadas: confirme las elegidas haciendo click
en Submit. De otra manera, retornar a la pgina previa y repetir la seleccin.
14.
15.
Ahora intente comparar todas las secuencias proteicas de la insulina que nosotros tenemos. Haz
click en Return para retornar a la pgina inicial Protein Tools. Marca todas las secuencias,
selecciona CLUSTALW Multiple Sequence Alignment y luego hacer click en Run.
16.
En la pgina, verifica que todas las secuencias escogidas estn seleccionadas y haz click Submit.
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17.
CUESTIONARIO
1) La insulina es sintetizada en una forma llamada preproinsulina, un polipptido de 110 aminocidos
de longitud, el cual contiene secuencias adicionales que sern eliminadas: una secuencia amino
terminal pre (pptido seal, 24 aa), que posibilita la secrecin de la protena, y una secuencia pro
(pptido C, 35 aa)) que determina el correcto plegamiento de la cadena polipeptdica. En la cadena
polipeptdica las secuencias son ubicadas en el siguiente orden:
Pptido seal
Cadena B
Cadena C
Cadena A
Cadena B
INS_HUMAN_Insulin_ MALWMRLLPLLALLALWGPDPAAAFVNQHLCGSHLVEALYLVCCERGFFYTPKT
INS_CHICK_Insulin_
** .. :
Cadena C
HUMAN
CHICK
Cadena A
*. .
. * .
. : *
* * * ** ** * *
. * ******* ** *
Cadena B
Cadena C
Cadena A
15
62.5%
26
86.7%
11
31.4%
18
85.7%
2) Cules secuencias son las ms conservadas? Cules son las menos conservadas? Da las
razones por la que t piensas que algunas secuencias son ms conservadas que otras.
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3)
Compare la secuencia de la insulina humana con aquellas de otros animales. Por ejemplo:
INS_HUMAN vs INS_PANTR, or INS_HUMAN vs INS_PIG, etc. Calcule los porcentajes de
conservacin de los diferentes segmentos.
Pptido seal
n
Cadena B
n
Cadena C
n
Cadena A
n
INS_HUMAN Vs.
INS_BOVIN
Pptido seal
n
Cadena B
n
Cadena C
n
Cadena A
n
INS_HUMAN Vs.
INS_HORSE
Pptido seal
n
Cadena B
n
Cadena C
n
Cadena A
n
INS_HUMAN Vs.
INS1_MOUSE
Pptido seal
n
Cadena B
n
Cadena C
n
Cadena A
n
INS_HUMAN Vs.
INS_PANTR
Pptido seal
n
Cadena B
n
Cadena C
n
Cadena A
n
INS_HUMAN Vs.
INS_PIG
Pptido seal
n
Cadena B
n
Cadena C
n
Cadena A
n
INS_HUMAN Vs.
INS_SHEEP
4)
5)
En biologa el trmino similaridad indica una caracterstica cuantitativa que correlaciona dos o ms
secuencias (tal como el porcentaje de identidad (igualdad), porcentaje de mutaciones
conservadas...). Identifica las dos especies que comparten el ms alto porcentaje de identidad para
la secuencia de aminocidos de la insulina.
Basado en la homologa de las secuencias de insulina, cul especie animal podra usted considerar
la ms adecuada para extraer esta hormona?. Usted piensa que el uso de este animal podra
generar problemas ticos y comerciales (considere si esta especie est extendida, es fcil de criar,
o es una especie en va de extincin, etc.)?. Basado en esas consideraciones, y teniendo cuidado
de la homologa, cul animal podr ser el donador ideal?
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720
780
840
900
960
1020
1080
1140
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3
ARN
aa
NH2
11
12
3
5
3
COOH
Cadena B
ADN
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22
5
3
ARN
aa
NH2
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29
30
3
5
3
COOH
Anexo 3: Aminocidos
Smb. 1 letra
Abreviat. 3 letras
A
C
D
E
F
G
H
I
K
L
M
N
P
Q
R
S
T
V
W
Y
Ala
Cys
Asp
Glu
Phe
Gly
His
IIe
Lys
Leu
Met
Asn
Pro
Gln
Arg
Ser
Thr
Val
Trp
Tyr
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Aminocido primario
Alanine
Cysteine
Aspartic acid
Glutamic acid
Phenylalanine
Glycine
Histidine
Isoleucine
Lysine
Leucine
Methionine
Asparagine
Proline
Glutamine
Arginine
Serine
Threonine
Valine
Tyrosine
Tryptophan
Alanina
Cisteina
Acido asprtico
Acido glutmico
Fenilalanina
Glicina
Histidina
Isoleucina
Lisina
Leucina
Metionina
Asparagina
Prolina
Glutamina
Arginina
Serina
Treonina
Valina
Tirosina
Triptfano
Codones
GCA, GCC, GCG, GCU
UGC, UGU
GAC, GAU
GAA, GAG
UUC, UUU
GGA, GGC, GGG, GGU
CAC, CAU
AUA, AUC, AUU
AAA, AAG
UUA, UUG, CUA, CUC, CUG; CUU
AUG
AAC, AAU
CCA, CCC, CCG, CCU
CAA, CAG
AGA, AGG, CGA, CGC, CGG, CGU
AGC, AGU, UCA, UCC, UCG, UCU
ACA, ACC, ACG, ACU
GUA. GUC, GUG, GUU
UAC, UAU
UGG
P.C.
Secuencia de insulina
http://library.uams.edu/assets/COM/BioChem/AminoAcidsPeptides/Amino_Acids_and_Peptides6.html
Estructura 3D de insulina.
http://cdn.rcsb.org/pdb101/learn/resources/insulin-activity-assets/insulin-activity.pdf
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