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    20-Les Anaérobies 1

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    Les Bactéries Anaérobies

    Présentée par Dr S. Kara Slimane.


    Maître-Assistante en microbiologie.
    Chu Béjaia.
    [email protected] 1
    Définition- Généralités:

    • Anaérobies obligatoires: sont incapables de métabolisme aérobie mais sont


    variablement tolérants à l'oxygène.
    • Les bactéries anaérobies se multiplient sur des sites à faible potentiel
    d'oxydoréduction (p. ex., tissus nécrotiques dévascularisés).
    L'oxygène est toxique pour elles.
    Les anaérobies obligatoires ont été classés en fonction de leur tolérance à
    l'oxygène en:
    - Stricts: ils ne tolèrent que ≤ 0,5% d'oxygène
    - Modérés: ils tolèrent 2 à 8% d'oxygène.
    - Anaérobies aérotolérants: ils tolèrent l'oxygène atmosphérique sur une durée
    limitée.
    • Habitat ; flore exogene et endogene

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    Le Pouvoir pathogène:
    Les infections à anaérobies: sont habituellement suppuratives, entraînant la
    formation d'abcès, une nécrose tissulaire et une thrombophlébite septique et/ou la
    formation de gaz.
    De nombreux anaérobies produisent des enzymes détruisant les tissus et des
    toxines paralysantes parmi les plus puissantes.
    Habituellement, plusieurs espèces d'anaérobies sont présentes dans les tissus
    infectés; des aérobies sont souvent présents (infections anaérobies mixtes).
    Les signes en faveur d'une infection à anaérobies sont:
    • Flore polymicrobienne à la coloration de Gram ou en culture.
    • Les bactéries sont visibles avec la coloration de Gram, mais les cultures aérobies
    sont stériles.
    • Gaz dans le pus ou les tissus infectés.
    • Odeur nauséabonde du pus ou des tissus infectés
    • Tissus nécrotiques infectés
    • Site de l'infection à proximité de la muqueuse où la microflore anaérobie réside.
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    Clostridium sp.
    • Les Prélèvements:
    - C. difficile :
    Coproculture → colite pseudo-membraneuse ou de diarrhée post-
    antibiothérapie (attention : portage chez 3% de la population,
    et 50-70% des enfants de moins de 2 ans)
    - C. perfringens :
    infections des plaies, septicémies, pneumonies nécrosantes, entérocolites,
    cholecystites
    - C. botulinum, C. tetani : laboratoires spécialisés.
    • Culture:
    Gélose au sang en anaérobiose.
    - C. difficile : milieux enrichis et sélectifs tels que CCFA (Cyclosérine, Céfoxitine,
    Fructose, jaune d’œuf) ± taurocholate de sodium (favorise la formation de
    spores), en anaérobie stricte → colonies à bords irréguliers, non hémolytiques,
    odeur caractéristique de crottin de cheval
    - C. perfringens : milieu TGY (double hémolyse) ou milieu TSN (Néomycine,
    Polymyxine, citrate de fer) 7
    Clostridium sp.

    • Identification:
    - C. difficile :
    Gros bacille Gram +, anaérobie strict, mobile et sporulé
    (spore sub-terminale, ovale, déformante)
    - C. perfringens : gros bacille Gram + immobile, non sporulé, capsulé.

    • Examens complémentaires:
    C. difficile :
    - Recherche des toxine A (entérotoxine) et B (cytotoxine) sur les selles (voire sur la
    culture) : ELISA, Immunochromatographie, PCR …
    - Recherche d’antigène dans les selles (glutamate déshydrogénase)
    - Endoscopie
    - Typage phénotypique ou génotypique
    - Moxifloxacine R et Erythromycine R orientent vers les souches O27
    hypertoxinogènes
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    PRINCIPALE CARACTÉRISTIQUE DE CULTURE

    • Prélèvements - transport - hémoculture: sans oxygène

    • Culture - Isolement :
    Les contraintes évoquées s'appliqueront en évitant le contact avec l'oxygène:

    • soit en travaillant en chambre spéciale (chambre dite de Freiter) avec


    mélange gazeux divers (C02, N2...).
    • soit en mini-chambre (jarre ou poche plastique) et utilisation d'un
    catalyseur chimique (sachet) en ensemencant des milieux solides tel gélose au sang
    frais.
    • L'incubation est normalement effectuée dans une étuve en "air ambiant" à
    37°C.
    • Leur culture est, difficile et lente

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    Le traitement :
    débuté sans attendre en ayant recours aux antibiotiques des familles suivantes:

    • ß-lactamines avec inhibiteur de ß-lactamase tel amoxicilline-acide clavulanique


    • imidazolés dont le métronidazole
    • glycocopeptides : vancomycine

    • La résistance naturelle à certains antibiotiques dont les aminoglycosides ou


    les céphalosporines

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