Les Staphylocoques

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COCCI A GRAM POSITIF

Cours de bactériologie spéciale


3ème année Pharmacie
Année 2018-2019
Pr. Yassine Sekhsokh

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 Cocci réguliers à Gram positif disposés en
amas ou en chainettes
 Bactéries commensales de la peau et
muqueuse
 Fréquemment isolés en bactériologie
 Pathogènes ou saprophytes
 Deux familles: Micrococcaceae et
Streptococcaceae
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Caractères distinctifs entre
Micrococcaceae et Streptococcaceae

Morphologie Catalase
Micrococcaceae Cocci groupés en Positive
(Staphylocoque..) amas ou en courtes
chainettes
Streptococcaceae Cocci en Négative
(Streptocoque…) diplocoques ou en
longues chainettes

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Familles des Micrococcaceae
 Comporte 4 genres: Micrococcus,
Stomatococcus, Planococcus, et
Staphylococcus
 Pathologie humaine : Micrococcus,
Staphylococcus
 Micrococcus: Environnement, faible
pouvoir pathogène (rares cas
d’endocardite, septicémie)
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Plan

 I- Taxonomie et classification
 II- Caractères bactériologiques
 III- Epidémiologie
 IV- Clinique
 V- Diagnostic bactériologique
 VI- Traitement
 VII- Prévention
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I- Taxonomie et classification
Genre Staphylococcus regroupe 50 espèces et sous-espèces

Staphylococcus. aureus : Staphylococcus. non aureus :


coagulase + (S aureus) coagulase – (S epidermidis,
S saprophyticus

Staphylocoque « doré », Staphylocoque blanc

Staphylocoque« pathogène » habituellement commensales

Infections pyogènes graves Pathogènes opportunistes

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II- Caractères bactériologiques

1.Morphologie
 Cocci Gram + , isolés ou
groupés en diplocoque ou en
grappe de raisin ;

 sphériques, immobiles.

 0,5 à1,5.

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2. Caractères culturaux
 Les staphylocoques se développent
en 24h à 37°C sur les milieux usuels
(pas exigeants), T: 37°C

 Culture sur milieux de type gélose au sang : zone d'hémolyse bêta


 Milieux spéciaux : Milieu sélectif de Chapman à 7,5% de Na Cl
(milieu hypersalé + mannitol) et milieu de Baird-Parker au tellurite
(colonies noires avec halo clair).

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3. Caractères biochimiques

 Catalase (+):
 Ce test permet de les ≠ des streptocoques (-)

 Aéro anaérobie facultatifs sauf :


S hominis est aérobie strict
S saccharolyticus anaérobie strict

 Fermentent le glucose et le glycérol.

 Résistants au Composé 0/129 et à Bacitracine.

 Sensibles à Nitrofurantoïne.

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4.Facteurs de virulence

A. Adhésines
 Permettent au S. aureus de coloniser la peau et les muqueuses

 Plus d’une dizaine d’adhésines ont été identifiées, les plus


caractérisées sont :

 La protéine A ;
 Les protéines de liaison au collagène de type I, II et IV ;
 La protéine de liaison à la fibronectine ;
 Les protéines de liaison au fibrinogène.

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B. Facteurs protégeant la bactérie de la
phagocytose:
 La capsule
 Composée exo polysaccharides
 Produite par 90% des souches de S. aureus

 La coagulase
 Se lie à la prothrombine polymérisation du fibrinogène
en fibrine formation d’un caillot protégeant la
bactérie de la phagocytose

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C. Facteurs conduisant à l’extension locale de
l’infection:
 les toxines formant les pores: PFT
Toxines cytolytiques : capacité de détruire les cellules de défense
de l’hôte en formant des pores au niveau des membranes
cellulaires
 Toxines à activité protéolytique
Capables de dégrader le tissu conjonctif (Protéases, Elastase
Hyaluronidase)

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D. Facteurs conduisant à la diffusion
hématogène:

 Staphylokinase
 Activateur du plasminogène en plasmine
 Effet inverse à celui de la coagulase.
 Conduit à la dislocation du thrombus très riche en
bactéries : localisations septiques

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 E- Toxines responsables de syndromes
spécifiques
 TSST-1 (Toxic Shock Syndrome Toxin-1)
 Choc toxique staphylococcique ,

 Scarlatine staphylococcique,

 Entérotoxines (A à E et G à R)
 Intoxications alimentaires

 Exfoliatines A,B et D ou Toxines épidermolytiques


ciblent l’épiderme ( lésions bulleuses)

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III- Epidémiologie
1- Réservoir du germe
S. aureus = germe commensal

-Saprophyte ubiquitaire : sol, air, eau, taux de portage nasal : 20-55%


poussière porteurs permanents : 20%

porteurs intermittents : 60%


-S.aureus : Fausses nasales: portage
permanent chez 20% des sujets non porteurs : 20%

aisselles, périnée, mains, gorge et


tube digestif autres sites : creux axillaires
périnée
plaies cutanées

-S.coagulase négative: bactéries


saprophytes qui forment une grande Kluytmans 1997, Vandenbergh 1999, Peacock 2001

partie de la flore humaine.

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2- Modes de transmission :
 Direct: Manuportage
 Indirect: instrument, eau, alimentation
3- Facteurs favorisants :
 Hygiène défectueuse
 Facteurs d’adhésions, ou associés (Diabète, hémodialysé…..
 Antibiothérapie préalable et toxémies staphylococciques.
4- Aspects épidémiologiques :
 Sporadiques.
 Épidémies d’infections nosocomiales, épidémies de Toxi-
infection alimentaire (TIAC) .
5- Sujet réceptif :
 Réceptivité totale.
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IV- Clinique
1- Infections dues au S.aureus
 Infections suppuratives:
Infections loco-régionales
- Cutanéo-muqueuses: folliculite, furoncle, impétigo….
- Infections profondes : Pulmonaires, osseuses (ostéomyélite)
Infections généralisées
- Septicémies thrombophlebitiques métastasantes
- Endocardites (toxicomanes, valves)
 Maladies liées aux toxines
- Pneumonies nécrosantes
- Exfoliation généralisée
- Syndrome du choc staphylococcique
- Toxi-infections alimentaires
 Infections nosocomiales et iatrogènes: infections du site
opératoire, Infections sur matériel et prothèses, endophtalmies.
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Syndrome de la peau ébouillantée
Impétigo bulleux staphylococcique
dû à l’épidermolysine A

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2- Particularités des SCN 
 La majorité des SCN sont des bactéries opportunistes.

 Rôle des facteurs favorisant


 l’immunodépression

 La présence de cathéters veineux

 La présence de matériaux prothétiques,

 la multirésistance des SCN aux antibiotiques.

 S. epidermidis est l’espèce la plus fréquemment isolée en milieu


hospitalier

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V- Diagnostic bactériologique
1- Prélèvement :
 Correctement identifié + renseignements cliniques +++(interprétation)

 Prélèvements très variés, fonction de la nature de l’infection: pus ,


hémoculture, urines, matériel de prothèse…

 Les conditions d’asepsie doivent être respectées.

 Réalisé avant toute antibiothérapie.

2- Transport :
 A température ambiante, le + rapidement possible au labo (<2h ).
 Milieux de transport: Pots stériles, Flacons d’hémoculture.

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3- Examen microscopique direct :
A l’état frais
Immobiles,asporulés parfois capsulés
Après coloration de Gram
 Cocci Gram+ de 0,5 à 1,5µm de diamètre
 Isolés ,ou groupés en diplocoque ou en amas
 Réaction inflammatoire: polynucléaires + ou – altérées

4- Isolement :
* Produits monomicrobiens : isolement facile en milieux non sélectifs
(Gélose au sang).
* Produits polymicrobiens: isolement en milieux sélectifs :
• Chapman : Milieu hypersalé à 75 g pour 1000 de NaCl
• Baird Parker au Tellurite de K+ : utilisé en bactériologie alimentaire;

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5- Culture:
 Colonies types: rondes, bombées, Ø≈ 1 mm .

 La +part des souches comportent des pigments dorés


non diffusibles dans le milieu.

 Sur milieu Chapman: S aureus donne des colonies pigmentées,


entourées d’une aréole jaune (fermente mannitol).

 Sur milieu Baird-Parker:


S.aureus forme : *colonies noires (réduction de tellurite )
*un halo clair (zone de protéolyse)
*suivi d’une opacification du halo (lipase).

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6- Identification du genre

 Catalase:
- Oxydoréductase: H2O2 à 3%+colonie formation
de bulles d’O2.
- Distingue parmi les CG+: les staphylocoques
(catalase+) et les streptocoques (catalase-).

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 Coagulase:
- Plasma de lapin ou de plasma
oxalaté 0,5ml) + souche à tester
- Incubation 4 h à 37°C : caillot
observé au fond de tube

Principal test caractérisant S. aureus: identification de 99% des


souches
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Désoxyribonucléase
thermostable:
+ chez S. aureus, S. schleiferi, S.
lugdunensis, S. intermedius, S. hyicus,
S. lutrae

PRINCIPE:
- Incubation 24h sur milieu contenant
de l'ADN,
on inonde la boîte avec de l‘HCl
dilué, qui précipite l'ADN non hydrolysé.
Les colonies productrices d'ADNase sont
entourées d'une zone transparente.
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 Fermentation du mannitol : sur milieu Chapman
+chez S auréus et S saprophyticus
-chez S épidermidis

Pour les SCN: on peut utiliser la novobiocine


 Disque à 5 µg

 Distingue 16 espèces ou sous espèces Résistant (S saprophyticus)

En pratique: 2 tests pour l’identification de S. aureus


 la détection de la coagulase +test d’agglutination
 toute discordance entre les 2 devra conduire à une
identification biochimique .

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7) Identification biochimique
Galeries biochimiques d’identification:
galerie API20 Staph

- Ces systèmes utilisent des tests


d’acidification ou d’assimilation des sucres
et des tests enzymatiques .

- Ils sont partiellement ou totalement


automatisés.

- Utilisées essentiellement pour


l’identification des SCN

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8- Identification par biologie moléculaire

 Identification des S. aureus atypique: kit


Accuprobe.

 Identification d’autres SCN.

 Épidémiologie moléculaire.

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9- Recherche de toxines :
 Test immunologiques .

 Agglutination passive latex: TSST1,

entérotoxines A, B, C, et D.
 ELISA .

10- Sérologie: recherche d’Anticorps .


Peu de valeur
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VI- Traitement
 Résistance aux antibiotiques fréquent
 Pénicillines M : traitement de référence

 Association : Pénicilline M + aminoside ou fluoroquinolone = une


stratégie classique pour le traitement des bactériémies ou des
infections graves à Staphylocoques sensibles à la Méthicilline.

 Les glycopeptides, la rifampicine, l’acide fusidique sont, par ordre


décroissant, les molécules qui restent le plus souvent actives sur ces
souches résistantes à la Méthicilline.
• Chirurgie: Drainage, Ablation du matériel étranger
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VII-Prévention
 Hygiène des mains: arme de base de la lutte contre les IN à Staphylocoque.
 Asepsie chirurgicale

 Recherche avec éradication de tout foyer staphylococcique.

 Traitement des portes d’entrée

 Isolement des patients porteurs de Staphylocoque multirésistants

 Prophylaxie des TIAC par la recherche systématique de porteurs fécaux des


staphylocoques.

 Rationalisation de l’antibiothérapie (limiter l’émergence des souches résistantes)

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