Etude Théorique de La Génétique de La Maladie D'alzheimer
Etude Théorique de La Génétique de La Maladie D'alzheimer
Etude Théorique de La Génétique de La Maladie D'alzheimer
Intitulé :
Jury d’évaluation :
Année universitaire
2021 - 2022
1
Remerciements
Grâce à Dieu et grâce à mes efforts, j'ai terminé ce humble travail, que je dédie
à mes chers parents ,que nulle dédicace ne puisse exprimer mes sincères
sentiments, pour leur patience illimitée, leur encouragement, et leur aide, en
témoignage de mon profond amour et respect pour leurs grands sacrifices. Que
dieu leur procure bonne santé et longue vie.
et spécifiquement à mon mari, qui a été un bon compagnon et soutien dans cette
vie. Que Dieu vous protège
Benhedhoud Aya
Dédicace
Khatat raounak
Dédicace
My great teacher and messenger, Mohammed (May Allah bless and grant him),
who taught us the purpose of life,
My great parents and, who never stop giving of themselves in countless ways.
Who dedicated his life for me, he always guided and encourage me in my
studies.
My beloved brothers Dr Khaled and his wife Dr warda and her kids .Dr Youcef
and Anoir the Architect and his wife Ms.Narrimane to my big sis Nawel and her
kids;
My friends who encourage and support me, special my dear friend boutheina
and rawnak
All the people in my life who touch my heart, I dedicate this project.
HADDAD Soumia
Table de matières
Table des matières
Introduction………..……………………….…………………………………………………1
2. Épidémiologie ……………………….………………………………………….……….3
5.5 Âge………………………………………………………..……………….…......37
5.6 Sexe………………………………………………………….…………....……..37
5.7 Ethnie……………………………………………………..………………..……38
Conclusion……………………………………………………………………………………62
Résumé.....................................................................................................................................63
Abstract....................................................................................................................................64
ﻣﻠﺨﺺ.........................................................................................................................................65
Références Bibliographiques……………………………………………………………..…66
Liste des abréviations
Aa : Acide aminé
Aβ :Amyloïd bêta
ABCA7 :ATP binding cassette subfamily A member 7
AD :Alzheimer's disease
ApoE :Apolipoprotein E
APP :Amyloïd Precursor Protein
APT1 :Acyl Protein Thioesterase
Figure 9 :Aβ42 induit l’endocytose des récepteurs NMDA et réduit leur densité à la
synapse………………………………………………………………………………….….…..18
Figure 11 : Évolution des zones affectées par la dégénérescence neuro fibrillaire dans la
maladie d’Alzheimer…………………………………………………………………….….….21
Figure 12: Évolution de l’atrophie du cerveau des patients atteints de maladie d’Alzheimer….
Figure 23 :Schéma non exhaustif de voies impliquées dans la maladie d’Alzheimer et de miRs
associés …………………………………………………………………………..………......52
Introduction
La maladie d’Alzheimer (MA) est une affection dégénérative du cerveau qui associe des
troubles prédominant de la mémoire, des troubles cognitive et/ou du comportement ayant un
retentissement sur la vie quotidienne des patients. Cette démence dont l’étiologie n’est pas
encore connue, est associe a des lésions histologiques caractéristiques qui la définissent : les
plaques sénile (pathologie Ab) et les dégénérescences neuro fibrillaires (pathologie tau)
[1].les mécanismes de cette affection dont les lésions se développent longtemps a bas bruit,
impliquent une cascade complexe d’événements. L’ide émerge que ces deux lésions
fréquentes au cours du vieillissement ont un effet synergique et provoquent un processus
dégénératif qui porte atteinte, progressivement mais inexorablement, aux fonctions
supérieures au sein des aires corticales associatives et en particulier a la mémoire, au
jugement et aux fonctions intellectuelles[2] L’étiologie de la maladie non encore élucidée,
semblant dépendre a la fois de facteurs génétiques et environnementaux.
Les formes familiales mono géniques sont exceptionnelles (< 1 % des cas) et caractérisées par
un début précoce (avant 60 ans) [3] . La grande majorité des cas de MA sont des formes
sporadiques pour lesquelles plusieurs facteurs de risque ont été établis : l’âge étant le
principal, avec une incidence qui double par tranche d’âge de cinq ans au-delà ` de 65 ans[4] .
Des facteurs de susceptibilité génétique ont été identifiés tels que l’allèle le e4 du gène
codant pour l’Apo lipoprotéine E (Apo E e4). Les facteurs de risque vasculaire : hypertension
artérielle, hypercholestérolémie et le diabète, sont associes a une augmentation du risque de
déclin cognitif. A l’inverse, un niveau d’éducation élevé ´, une consommation modérée
d’alcool, un régime alimentaire de type méditerranée en, la pratique d’une activité physique
régulière (comme la marche), la richesse du réseau social et des activités de loisirs pourraient
avoir un effet protecteur .
Dans notre étude nous discutons les aspects génétiques de la maladie d’Alzheimer et les
différents facteurs génétique de la maladie ainsi les techniques utilisés [5,6] .
1
Chapitre 1
Généralités sur la maladie d’Alzheimer
Généralités sur la maladie d’Alzheimer
1. Histoire et définition
À l’époque, la MA était encore restreinte aux cas de démences de type précoce (avant
65 ans), alors que les troubles démentiels des personnes âgées étaient classés parmi les
pathologies de type vasculaire ou considérés comme des conséquences naturelles du
2
Généralités sur la maladie d’Alzheimer
vieillissement. Ce n’est qu’en 1980, que les cas tardifs de démences furent retirés des causes
normales du vieillissement pour être regroupés avec les cas précoces de la MA. Dès lors, les
découvertes scientifiques sur cette pathologie ont connu un fort essor, avec l’identification de
marqueurs pathologiques.
Aujourd’hui, la MA peut se définir comme une démence d’origine neurodégénérative,
c’est-à-dire due à une perte progressive et irréversible de cellules nerveuses. Une démence est
une détérioration de plusieurs fonctions cognitives induisant une perte d’autonomie et des
troubles comportementaux. Les patients atteints de MA présentent également un trouble
précoce et évolutif de la mémoire épisodique, qui est la mémoire des événements et des faits
personnellement vécus dans un contexte spatio-temporel donné. L’encodage, le stockage et la
récupération de cette mémoire sont atteints [9].
2. Épidémiologie
En 2000, la MA et les démences associées furent classées à la 14ème place des causes de
mortalité chez l’homme à travers le monde. En 2016, elles ont atteint la 5ème position. Ces
chiffres risquent malheureusement de doubler d’ici 2030 si rien n’est fait (selon l’Organisation
mondial de la santé). C’est plus de 45 millions d’individus dans le monde, dont 564 000
personnes au Canada (CIUSSS centre-Ouest-de-l ’Ile-de-Montréal), qui sont diagnostiquées
pour la MA. Sa prévalence augmente avec l’âge : 0,8% chez les individus âgés de 65 ans ou
moins, 6% pour ceux âgés de 75 ans et 25% pour ceux ayant 85 ans ou plus, d’après l’agence
de la santé publique du Canada. Les femmes sont d’ailleurs plus souvent atteintes (près de deux
tiers des américains atteints de la MA sont des femmes) que les hommes probablement dû à
leur plus grande espérance de vie[11].
3
Généralités sur la maladie d’Alzheimer
La maladie existe pourtant avant 65, et même avant 60 ans ; si, individuellement, une maladie
survenant précocement est tragique, ces démences précoces représentent en revanche une faible
proportion de cas. Pour ces cas plus jeunes, les problèmes posés sont différents de ceux
rencontrés pour les cas plus âgés, et nous ne disposons pas de données épidémiologiques
vraiment fiables. Des estimations réalisées par le groupe Eurodem (réunissant les données de
plusieurs études de cohortes européennes) en 1991 donnaient une prévalence de démence de
0,5 % chez les femmes et 1,6 % chez les hommes entre 60 et 64 ans, et de 0,1 % chez les
femmes et 0,2 % chez les hommes avant 60 ans [12], soit une estimation de 32 000 personnes
de moins de 65 ans présentant une démence en 2004, en France. Ces démences précoces sont le
plus souvent diagnostiquées et médicalisées, même si l’on peut supposer que le délai est parfois
long (ce qui n’est pas le cas des démences plus tardives), en raison de la rareté de survenue
dans cette tranche d’âge. Pour ces cas précoces, le problème principal est le manque de
structures adaptées pour prendre en charge ces sujets relativement jeunes [13].
4
Généralités sur la maladie d’Alzheimer
5
Généralités sur la maladie d’Alzheimer
statistiques adaptés, permettant de prendre en compte les différents biais rencontrés dans les
études de cohorte pour l’estimation de l’incidence. Les résultats sont présentés dans la Figure
3[17].
H F H F H F H F
< 75 - - - - 13.7 10.4 - -
6
Généralités sur la maladie d’Alzheimer
HOMME FEMME
denc
e%
Inci
AGE (année)
Dans le monde Plus de 35,6 millions de personnes sont touchées par la maladie
d’Alzheimer. Chaque année, on dénombre 7,7 millions de nouveaux cas. Selon les prévisions
de l’Organisation Mondiale de la Santé (OMS), le nombre de malades devrait presque doubler
tous les 20 ans.
Actuellement, selon le World Alzheimer Report 2015, près de 35 millions de personnes sont
atteintes de maladie d’Alzheimer dans le monde[19].
Des prévisions indiquent que ce nombre devrait presque doubler tous les 20 ans. En
conséquence, le coût social et économique de la maladie va également s’accroître, à moins que
7
Généralités sur la maladie d’Alzheimer
3 . Clinique de la maladie
démence. Pour aider les soignants, des recommandations européennes ont été mises en place.
Elles reposent sur l’évaluation de 6 domaines centrés sur l’évaluation des fonctions cognitives
(Tableau V) effectuée à l’aide de tests quantitatifs adaptés à chacun de ces items. Par exemple,
l’efficience cognitive globale peut être quantifiable grâce au Mini Mental State Examination
(MMSE)[24].
Ce diagnostic clinique doit être complété par des examens biologiques recherchant des
marqueurs de la MA[22].
Le test MMS dure 15 minutes et comprend une série de trente questions réparties en
six catégories. Elles vont permettre d’évaluer les capacités cognitives de la personne âgée et
ainsi déterminer si elle est atteinte de la maladie d’Alzheimer[23].
Cette première catégorie tend à évaluer la mémoire épisodique du senior, autrement dit
celle qui permet de se repérer dans l’espace et dans le temps. Le senior doit répondre à
différentes questions telles « quelle est la date complète d’aujourd’hui ? », « dans quelle ville
sommes-nous ? » ou encore « dans quelle région se situe notre département ? ».
9
Généralités sur la maladie d’Alzheimer
Cette troisième étape du test MMS consiste à évaluer la mémoire sémantique, celle
que nous acquérons par le savoir scolaire, les expériences de vie et notre parcours
professionnel. Pour cela, le médecin invite la personne âgée à faire du calcul mental. En
partant de 100, le senior doit être capable de retirer 7 à chaque fois.
Cette cinquième étape du test MMS permet d’évaluer la mémoire à long terme du
senior. Le médecin chargé de l’examen montre plusieurs objets au patient. Ce dernier doit les
nommer avec précision. À ce stade de l’examen, il n’est pas rare que le patient confonde le
crayon et le style, ou encore la montre et le bracelet.
10
Généralités sur la maladie d’Alzheimer
a ainsi définit le stade de l’Alzheimer pré -clinique, où les individus présentent un statut cognitif
normal mais des bio marqueurs typiques de la maladies d’Alzheimer[23]. Le NIA-AA propose
trois stades d’évolution dans l’Alzheimer préclinique (figure 5) .
Stade 1 : le patient présente une accumulation du peptide amyloïde, ou amyloïdose, détectable
en imagerie PET.
Stade 2 : l’amyloïdose s’aggrave et s’accompagne d’une neuro dégénération, détectable en IRM.
Il y a une atrophie des lobes temporo-médians et des cortex para limbiques et temporo-pariétaux.
Stade 3 : l’amyloïdose et la neuro dégénération s’aggravent et s’accompagnent de légers
troubles cognitifs qui restent cependant insuffisants pour diagnostiquer une MCI[25].
Ces trois stades de l’Alzheimer préclinique ont particulièrement été mis en évidence
dans le cortexentorhinal [26] . Cette structure de la formation hippocampique (Figure5) est
associée aux stades précoces de la maladie. En effet, plusieurs études ont montré une atteinte
du cortex entorhinal chez des patients souffrant de MCI amnésique ayant évolué en MA[27].
11
Généralités sur la maladie d’Alzheimer
La MA est une pathologie évolutive caractérisée par un déclin cognitif qui suit
l’évolution de l’atteinte neuropathologies, notamment les dégénérescences neuro fibrillaires.
On peut différencier deux grands stades cliniques: le Trouble Cognitif Léger ou Mild Cognitive
Impairement(MCI), et le stade démentiel de la MA [28] .
Le MCI est un stade symptomatique pré-démentiel qui peut concerner tout type de
démence. Il s’agit d’un stade où le patient présente des atteintes cognitives sans que celles-ci
soient suffisamment importantes pour impacter les activités quotidiennes. Ainsi, tout comme le
diagnostic de démence, le diagnostic de MCI repose sur des échelles quantitatives permettant
d’évaluer ces atteintes. Le MCI a été catégorisé en trois types, selon le domaine cognitif
impacté. Ces catégories permettent de poser un pronostic sur le type de démence sur lequel le
MCI peut aboutir. Il est cependant important de noter qu’il ne s’agit que d’un pronostic
probabiliste [29].
Le MCI amnésique : Il se définit par une atteinte isolée de la mémoire, et progresse
habituellement vers une MA.
Le MCI multi domaines : il se définit par un déficit léger dans plusieurs domaines, la
mémoire n’étant pas nécessairement impactée. Il peut évoluer vers une MA ou une autre forme
de démence.
Le MCI single non Memory Domain : Il se définit par une atteinte isolée d’un domaine
cognitif autre que la mémoire. Il n’est pas susceptible d’évoluer vers une MA mais plutôt, en
fonction du domaine atteint, vers une démence fronto-temporale ou une aphasie progressive
primaire[29].
jeu l’une ou l’autre de ces deux structures. Il a ainsi été montré que la séparation de pattern, une
capacité dépendante du gyrus denté, était atteinte chez les individus vieillissants. Ceci serait
due à une perte d’inter neurones[32].
13
Chapitre 2
Physiopathologie d’Alzheimer
Physiopathologie d’Alzheimer
14
Physiopathologie d’Alzheimer
1.2 Peptide Aβ
15
Physiopathologie d’Alzheimer
16
Physiopathologie d’Alzheimer
Des études in vitro ont montré que les fibrilles d’Aβ induisaient une dystrophie
neuritique et une perte neuronale sur des cultures de neurones de rat, de manière cohérente
avec les lésions observées chez les patients[37]. Plus récemment, il a également été montré
que les formes oligomériques avaient un effet toxique sur la fonction synaptique. Cette
neurotoxicité des formes insolubles et solubles d’Aβ proviendraient principalement de
l’accumulation du peptide qui activerait deux mécanismes délétères pour les neurones:
l’inflammation et le stress oxydant [38].
Aβ et inflammation
.
Aβ et stress oxydant
17
Physiopathologie d’Alzheimer
Plusieurs études tendent à montrer un effet délétère des oligomères solubles d’Aβ sur le
fonctionnement synaptique (figure 9). Une stimulation répétée d’une synapse telle que la
collatérale de Schaffer, la synapse reliant les régions CA3 et CA1 de l’hippocampe, peut
induire un mécanisme appelé Potentialisation à long terme (LTP) : une activation prolongée
de la synapse. Le processus de mémorisation est dépendant de l’existence de ce processus de
LTP. Il a été montré chez le rongeurque les oligomères solubles d’Aβ pouvaient perturber la
formation de la LTP et ainsi de la mémoire [41]
Figure 9 :Aβ42 induit l’endocytose des récepteurs NMDA et réduit leur densité à la
synapse[41]
18
Physiopathologie d’Alzheimer
dans les axones. Leur fonction est en partie régulée par leur état de phosphorylation(figure 9)
[42].
La DNF est désignée par la flèche noire. La plaque ovale située à droite de la DNF est
une PS. Technique de marquage Bielschowsky à imprégnation d’argent.
19
Physiopathologie d’Alzheimer
Figure 11 : Évolution des zones affectées par la dégénérescence neuro fibrillaire dans la
maladie d’Alzheimer[45]
Comme pour les PS, les DNF s’étendent séquentiellement aux différentes structures du
cerveau, mais cette séquence est différente. Les premières structures atteintes sont les cortex
tran-sentorhinal (stade 1) et entorhinal (stade 2). L’atteinte évolue ensuite vers l’hippocampe
(stade 3) et le cortex temporal (stade 4, 5 et 6). Le cortex polymodal (stade 7), l’aire de Broca
(stade 8) et les aires uni modales (stade 9) sont ensuite touchées. Au dernier stade, toutes les
régions du cerveau sont affectées par les DNFs (stade 10)
20
Physiopathologie d’Alzheimer
21
Physiopathologie d’Alzheimer
régions du cortex (temporo pariétal, cingulaire postérieur et antérieur, pécunes, et frontal) sont
atteintes.
2. Génétique de la maladie
22
Physiopathologie d’Alzheimer
APP, (environ 15% des cas FPMA-AD) situé sur le chromosome 21q21.3 chez
l’Homme. Environ 50 mutations sur le gène de l’APP ont été répertoriées (Alzheimer Disease
and Fronto temporal Dementia Mutation databse) dont la plupart altèrent la protéolyse de
l’APP et donc la quantité d’Aβ produite. Certaines mutations peuvent modifier la coupure
effectuée par la β-sécrétase, telles que D7H, E682K ou K16N. Ces mutations entraînent une
augmentation de la quantité d’Aβ40 et d’Aβ42. D’autres mutations, comme T714I, V715M
ou encore V715A, sont retrouvées sur le site de coupure de la γ-sécrétase entraînant une
augmentation du ratio Aβ42/Aβ40[57]. La mutation V717I, quant à elle, va affecter le site de
coupure de la β- et de la γ-sécrétase augmentant la production d’Aβ38 et d’Aβ42[58]. Mais
des mutations récessives sont également identifiées, telle que E693Delta qui induit une
résistance à la dégradation protéolytique et favorise l’accumulation d’Aβ105. La mutation
A673V est également une mutation récessive mais, de manière étonnante, à l’état
hétérozygote elle serait anti-amyloïdogénique, alors qu’à l’état homozygote elle aurait un
effet plutôt pro-amyloïdogénique[59]. De plus, si l’adénosine 673 (A673) est remplacée, non
pas par de la valine (A673V), mais par de la thymine (A673T), cette APP mutée aurait un
effet protecteur vis-à-vis de la MA, en diminuant d’environ 40% la production d’Aβ. Enfin,
des duplications du gène de l’APP ont aussi été associées aux formes familiales des FPMA,
avec une pénétrance quasi complète à l’âge de 65 ans[51,52].
PSEN1, (environ 80% des cas FPMA-AD) située sur le chromosome 14q24.2 chez
l’homme. Les patients porteurs d’une mutation sur le gène de la Psen1 ont des symptômes
plus précocement (vers 43 ans) que ceux porteur d’une mutation APP (vers 51 ans) ou PSEN2
(vers 57 ans) [51]. Certains patients montrent même une pathologie vraiment très précoce
(vers 35 ans). À ce jour, plus de 200 mutations ont été rapportées (Alzheimer Disease ans
Fronto temporal Dementia Mutation Data base) dont la majorité sont situées sur les exons 5 à
8 du gène de la PSEN1 et augmentent le ratio Aβ42/Aβ40. L’augmentation de ce ratio
suggère qu’il y a une hausse de la forme pro-fibrille d’Aβ dans le cerveau[52,53].
PSEN2, (environ 5% des cas de FPMA-AD) situé sur le chromosome 1q42.13 chez
l’homme. Les mutations sur la PSEN2 sont bien plus rares et ne sont pas toutes causales pour
la MA. En effet, « seulement » 17 mutations sur les 45 répertoriées (Alzheimer Disease and
Fronto temporal Dementia Mutation Data base; Alz forum) seraient causales. Dix autres
mutations ne seraient pas pathologiques. Quant aux dernières mutations, leurs implications
23
Physiopathologie d’Alzheimer
sont encore à l’étude. La plupart de ses mutations pathologiques élèvent le ratio d’Aβ42/40
telles que T122P, N141I et M239V [54].
Ces trois gènes mutés conduisent généralement à des formes amnésiques typiques de
la MA. Cependant, elles ne représentent qu’une faible portion des FPMA (5-10%). Plus de
50% des formes mendéliennes et la majorité des formes sporadiques sont encore sans causes
identifiées. Des mutations sur TYROBP (TYRO protein tyrosine kinase binding protein) et
NOTCH3 (Notchreceptor 3) pourraient être des facteurs de risque pour les FPMA mais des
études sur des cohortes plus larges sont encore nécessaires pour mieux définir leurs
contributions[54,55].
24
Physiopathologie d’Alzheimer
Les études de GWAS pointent trois voies de signalisation majeures comme étant
impliquées dans la physiopathologie de la MA : le métabolisme des lipides, la régulation du
système immunitaire, et le système endos mal de recyclage des vésicules, pour BIN1,
PICALM et CD2AP. Les gènes ApoE et ABCA7 codent pour des protéines impliquées dans
le métabolisme des lipides. Tout comme ApoE, ABCA7 est impliquée dans le transport et le
métabolisme des lipides. Elle est particulièrement exprimée dans les neurones et les cellules
micro gliales. Les souris invalidées pour ce gène présentent des troubles de la mémoire et leur
croisement avec les modèles APP/PS1 induit une augmentation de 40 la quantité de PS. CR1
et CD33 codent respectivement pour des protéines impliquées dans l’activation microgliale
induite par l’accumulation d’Aβ et la phagocytose du peptide par les cellules microgliales .
BIN1, PICALM et SORL1 codent pour des protéines impliquées dans le système
endolysosomal. La protéine SORL1, exprimée dans les neurones, serait directement impliquée
dans le trafic de l’APP. Les souris invalidées pour ce gène présentent une plus grande quantité
de peptide Aβ dans le cerveau . De même, la protéine PICALM aurait un rôle dans la
régulation du peptide via l’endocytose de l’enzyme γ-secrétase[82].
26
Chapitre 3
Les facteurs génétiques
Les facteurs génétiques
Il s`agit de formes à baptême dépôt, lieu 65 ans, des mutations ont été caractérisées.
Entre 1991 et 1995, des gènes responsables des formes familiales d`Alzheimer ont été identifiés
par duplication positionnel et par la examen de gène candidat.
Il s`agit du gène APP sur le chromosome 21laquelle les mutations concernent 15% (un peu
mieux désormais, depuis le risque en cliché en 2006 par l`association de Dominique Campion,
d`un Lanière là-dedans lequel la xérographie du adressage APP et l`appâte dépôt de la émail
revers angiopathie pour 5 familles françaises) de l`quintette des formes mono géniques, des
gènes présénile 1 (PS1 sur le chromosome 14)et présénile 2 (PS2 sur le chromosome 1) qui
représentent 20 à 60 % des formes mono géniques. Les mutations sont à pénétrance complète, ce
qui signifie que les porteurs développent implacablement la émail tout alentour de 55 ans en
moyenne [84].
Ce gène code pour une protéine transmembranaire, la forme la plus longue contient 770
acides aminés, dont la jonction de la membrane et du domaine extracellulaire, une séquence
correspondant au peptide Aβ[85]est contenue. La maturité de l'APP peut suivre plusieurs
chemins, et ils conduisent à la sécrétion d'anticorps du peptide amyloïde[86].
27
Les facteurs génétiques
Aβ40
Aβ42
Enfin, il est important de noter que la décompression de type -sécrétasse qui libère un
fragment en plus du peptide A β intracellulaire qui peut réguler certains gènes[88].
Les mutations génétiques découvertes depuis 1991 [89] pourraient être détecté dans
certaines familles atteintes de la MA précoce.
Ces mutations affectent principalement deux régions du gène APP. Le premier site
implique les codons 715/717, le deuxième site est le codon 670/671 et cette double mutation,
présente dans unifamiliale connue sous le nom de mutation "suédoise". Cela est au niveau de la
séquence, les deux sites de mutations correspondent à deux protéines situées aux deux
extrémités d'un peptide Aβ [90].
La ségrégation de la maladie dans les familles est due à une substitution Val-Ile au codon
717 de l'APP, appelé mutation de Londres[91]Après avoir découvert la première mutation,
Plusieurs autres mutations ont été trouvées dans le gène APP, dans de nombreux foyers à
travers le monde.
28
Les facteurs génétiques
Le Début des manifestations cliniques familiales avec mutations génétiques de l'APP varie
entre 43 et 62 ans [92]représentant seulement 3% à 5% de tous les cas d'apparition précoce et
0,5 % de tous les cas de MA.
Des mutations dans le gène APP correspond à une mutation ponctuelle ou duplication du gène
APP. Toutes les mutations faux-sens sont responsables de la maladie d'Alzheimer à début
précoce (EOAD) Exons 16 et 17 près de l'un des trois sites de clivage.
Les mutations ont modifié la voie de clivage normale de différentes manières. La mutation des
codons 714-717 augmente la production d'A β42 qui forme des dépôts l'amyloïde est plus
sensible que l'Aβ40. la double mutation suédois K670 N / M671L affecte le clivage de la β-
sécrétase et augmente les niveaux d'βb40 et d'Aβ42 [93].
3. Gène de la préséniline
Dès 1992, des études de liaison génétique ont montré que l'un des locus principalement
impliqués dans la forme familiale AD d'apparition précoce sur le chromosome 14q24.3 [95].
Le gène correspondant n'est apparu qu'en 1995 qui a été déterminé par l'équipe St-George
Hyslop à Toronto[96].Ce gène appelée préséniline 1 (PS1), qui code pour une protéine
membranaire de 467 acides aminés contenant 7 à 9 domaines transmembranaires et une grande
boucle hydrophile. La protéine correspondante est essentiellement présente dans les neurones
Réticulum endoplasmique et au niveau de Golgi.
29
Les facteurs génétiques
La mutation est très largement distribué dans le cadre de lecture PS1 domaine
transmembranaire 2 (30 %) et le grand anneau hydrophile 6 (37,5 %) majorité. En fait la
mutation est située au niveau à proximité du domaine transmembranaire.
L’âge d'incidence moyenne des patients porteurs de mutations PS1 est de 45 ans, qui sont
variable selon les patients, ce qui peut indiquer que les effets biologiques des mutations sont plus
ou moins sévères[100].
30
Les facteurs génétiques
Le gène de la préséniline 2 (PS2) est situé sur les chromosomes 1 à la position q31.42.
Ce gène se caractérise par une haute homologie de séquence d'acides aminés avec le gène PS1
(67%). Il existe 13 mutations faux-sens s’est produites dans ce gène à ce jour décrit dans 22
familles[102].
31
Les facteurs génétiques
La préséniline 1 est impliquée dans divers processus biologiques. Plusieurs d'entre eux
fonction proposée après examen du phénotype acquis chez la souris l'allèle préséniline 1 est nul. La
protéine est impliquée dans Récepteurs tyrosine kinase. Sans PS1, le récepteur tyrosine kinase des
neutrophiles ne sont pas Entièrement glycosylé ou transporté vers la membrane plasmique[105]. Il en
est de même pour la Nicastrine, une protéine connue pour interagir avecPS1[106] En effet, PS1 est
nécessaire pour la glycosylation et la sialylation (en un peptide qui mûrit dans l'appareil de Golgi)
Important pour son transport vers la membrane plasmique[107]. En effet, la nicastrine mature sialylée
existe sous la forme d'un complexe Fragments N-terminaux et C-terminaux de PS1 au niveau trans-
Golgien et membrane plasmique[108] comme un complexe.
En plus elle joue un rôle dans la maturation et le transport de certaines protéines, PS1 a
également en réduisant la paire de neurones Apoptose après divers stimuli tels que le stress oxydatif
[120]. L'effet inverse se produit lorsque PS1 est surexprimé Muté en culture cellulaire ou chez la
souris. En effet, augmenter La sensibilité des cellules surexprimant le mutant PS1 à l'apoptose a été
observée par Induction de stress oxydatif ou exposition à des fragments insolubles de bêta-amyloïde
1-42 [109].
32
Les facteurs génétiques
Dans les neurones, PS1 peut jouer un rôle important dans le maintien de l'homéostasie
cellulaire[110], et Signe de l'examen périodique universel. ces deux éléments sont étroitement liés
au mécanisme de l'apoptose[111]. L’Augmentation des niveaux de calcium intracellulaire, régulés
par le réticulum endoplasmique, ou jouant un rôle important dans la perturbation synaptique et la
mort cellulaire développement de la maladie d'Alzheimer[112]. S'applique également à Altérations
de la voie de signalisation UPR[113]. Cette façon est Activé lorsque plusieurs protéines mal
repliées s'accumulent dans le réseau endoplasmique. Ire 1 est une protéine kinase
transmembranaire localisée dans le RE qui Médie l'UPR lorsque l'environnement du réticulum
endoplasmique [114] est perturbé. Les mutations PS1 liées à la maladie d'Alzheimer altèrent la
voie de signalisation UPR en perturbant la fonction Ire 1 [115].
Des cribles génomiques ont été réalisés pour identifier d'autres gènes de susceptibilité à cette
maladie.
33
Les facteurs génétiques
Une protéine de transport de lipide connu initialement pour son implication dans le
métabolisme du cholestérol et dans la genèse de certaines maladies cardiovasculaires a permis
d’effectuer des progrès considérables dans compréhension du développement des maladies
[118] .
Figure 15 : représentation schématique des trois iso formes de l’ApoE :E2 ,E 3et E4 [119]
34
Les facteurs génétiques
protecteur de l'allèle ε2[122-123] . . On estime que le gène APOE pourrait être associé à au
moins 20 % des cas d'Alzheimer [124-125].
5.5 Âge
5.6 Le Sexe
5.7 L'Ethnie
Les effets de l'allèle ε4 étaient les plus élevés chez les Japonais, mais étaient beaucoup
plus faibles dans les autres groupes raciaux et étaient même difficiles à observer chez les
Afro-Américains. Ces changements peuvent s'expliquer par l'héritage génétique et différents
facteurs environnementaux, qui ne sont pas bien documentés.[126-127]
35
Les facteurs génétiques
que l’allèle ε4 est essentiellement associé à des affections présentant une amyloïdogenèse
telles que les démences à corps de Lewy. À l’inverse, les maladies principalement
caractérisées par une dégénérescence neuro fibrillaire -par exemple la paralysie supra
nucléaire progressive ou les démences fronto-temporales ne sont pas associées à l’allèle
ε4.[126-127]
En fait, il ne fait aucun doute que l'APOE peut influencer la formation de dépôts
amyloïdes. L'argument le plus fort en faveur d'un gène précurseur de l'amyloïde humaine
muté au codon 717, une mutation qui cause la maladie d'Alzheimer familiale précoce, a été
récemment obtenu en utilisant des souris transgénique; ces souris ont alors la particularité de
former des plaques amyloïdes massives .[126-127]
Le nombre de dépôts amyloïdes est directement lié au nombre de copies du gène APOE
murin Chez ces souris âgées de 9 à 15 mois, l'APOE semble être nécessaire pour convertir les
dépôts amyloïdes diffus (thioflavine-S négatif) en dépôts fibrillaires plus matures (thioflavine-
S positif) et a observé une dégénérescence sévère des neurites. Il convient de noter que
l'expression spécifique des iso formes APOE4 a entraîné plus de dépôts fibrillaires (> 10 fois)
que celle d'APOE3. Il a été proposé que le peptide amyloïde, après s’être complexé à des
lipoprotéines contenant de l’APOE, serait éliminé par l’intermédiaire des récepteurs de
l’APOE et en particulier de la protéine LRP (low density related protein.[126-127]
Ainsi, ces résultats suggèrent que l'APOE murine affecte le développement de la maladie
d'Alzheimer en favorisant la conversion des peptides amyloïdes en fibrilles amyloïdes plus
toxiques. Les résultats obtenus dans ce modèle murin avec APOE humaine sont plus
complexes. [126-127]
36
Les facteurs génétiques
En fait, à mesure que le nombre de copies du gène APOE humain augmentait chez les
souris âgées de 9 mois, le nombre de dépôts amyloïdes diminuait. Seulement à 15 mois, les
résultats observés étaient similaires à ceux obtenus avec l'APOE de souris. Extraites des
différences de séquences primaires entre l'APOE humaine et murine, ces observations
suggèrent que l'APOE humaine pourrait être impliquée dans la dégradation du peptide
amyloïde. Cette hypothèse est étayée par le fait que les microglies immuno réactives APOE
sont situées au centre des plaques séniles.[126-127]
En effet, le complexe soluble APOE-Aβ ne présente pas la même stabilité s’il est
purifié à partir de tissu cérébral de malades ou de témoins : le complexe le plus stable est
retrouvé chez les témoins.[126-127]
De plus, ce complexe soluble est présent en quantité plus importante dans le cerveau
des témoins comparé à celui des malades. L’instabilité relative de la liaison de ces deux
molécules, associée à une augmentation de la concentration en peptide Aβ, pourrait alors
conduire à une accumulation de ce peptide, suffisante pour atteindre le point critique de
nucléation, étape initiale de la formation des dépôts Une fois cette étape réalisée, le peptide
Aβ polymérisé pourrait interagir avec le complexe APOE-Aβ et y être incorporé La plupart de
ces complexes participerait alors à la formation des fibrilles amyloïdes. Ainsi, la déficience du
système de dégradation du peptide A permettrait d’amorcer la formation des dépôts,
l’amyloïdogenèse étant ensuite facilitée par le complexe APOE-Aβ lui-même [128].
37
Les facteurs génétiques
La découverte de la démence fronto temporale familiale causée par des mutations du gène
TAU a permis de mieux comprendre les mécanismes d'implication de la protéine tau dans la
dégénérescence neurofibrillaire [130] .
Des altérations de l'expression et de l'épissage de TAU sont également présentes dans
d'autres tauopathies comme la dystrophie myotonique de Steinert ou la démence front
temporale sans lésions histologiques, mais elles ne seront pas développées dans cette étude.
rôles respectifs dans l'induction de phénomènes dégénératifs ou leur propagation restent à
déterminer [131] .
La détermination de la relation entre Aβ et la pathologie tau apparaît actuellement
comme un enjeu clé dans la compréhension de l'étiologie de la maladie d'Alzheimer. Il est
difficile de déterminer la dynamique d'apparition des dépôts amyloïdes dans la maladie
d'Alzheimer. Selon Braak et Braak [132] ; trois stades peuvent être distingués selon la sévérité
de la surcharge amyloïde, mais il n'y a pas de consensus sur la distribution régionale et
laminaire de ces dépôts spécifiques à la maladie d'Alzheimer. Au lieu de cela, une série
d'occurrences spatio-temporelles dans le dégénéré neuro fibrillaire sont très caractéristiques
[133-134], avec seulement certaines zones corticales définies affectées au début de la maladie.
La pathologie tau localisée à la structure hippocampique peut être attribuée au vieillissement
cérébral « normal » ou à une pathologie tau tardive et sélective qui attaque cette région du
cerveau. La dégénérescence neuro fibrillaire suit une voie établie. L'atteinte du cortex
temporal est un phénomène précoce de la maladie avec des symptômes cliniques bénins. Il ne
s'agit donc pas d'un problème de vieillissement normal du cerveau
. L'analyse biochimique de 130 sujets non déments a identifié la séquence suivante : la
dégénérescence neuro fibrillaire commence dans l'hippocampe (via le cortex entorhinal, puis
l'entorhinum, puis l'hippocampe) et s'étend à son tour à la région temporale.
Dans les cas les plus sévères, il peut être retrouvé dans les aires sensorielles primaires
Ainsi, ces résultats confirment l'existence de sous-populations neuronales vulnérables et que
la pathologie tau progresse par une voie de connexion neuronale cortico-corticale. [135] sont
confirmé les résultats obtenus dans d'autres maladies tau, dans lesquelles la distribution
laminaire et régionale des agrégats tau varie selon la pathologie. Ces différences peuvent être
liées aux différentes vulnérabilités de sous-populations neuronales spécifiques, selon
l'étiologie et/ou le sous-type pathologique taupathies.
La dégénérescence neuro fibrillaire dans des sous-ensembles neuronaux spécifiques
dans la maladie d'Alzheimer peut être associée à un dysfonctionnement métabolique de l'APP
38
Les facteurs génétiques
(protéine précurseur de l'amyloïde), le précurseur du peptide Aβ, qui rend certains sous-
ensembles neuronaux [136] vulnérables ce dysfonctionnement de l'APP peut également
conduire à l'expansion de la pathologie tau dans les régions du cerveau [137] .
Il est difficile de saisir la synergie de la pathologie tau et Aβ. Deux études récentes
renforcent l'idée de cette synergie. Ils ont tous utilisé des souris transgéniques de protéine tau
humaine avec une plus grande dégénérescence neuro fibrillaire, suggérant que les peptides APP
ou Aβ mutés améliorent ce processus pathologique [139] .
Dans une autre étude, des peptides Aβ (1-42) agrégés ont été injectés directement dans
l'hippocampe de souris transgéniques P301L tau. Une dégénérescence neurofibrillaire accrue a
été observée dans certaines régions de projection de l'hippocampe, comme la mutation
amygdale [140],.
39
Les facteurs génétiques
40
Chapitre 4
Les techniques moléculaires
Les techniques moléculaires
La biologie moléculaire fait référence à l'étude des acides nucléiques, des acides
ribonucléiques (ARN) et des acides désoxyribonucléiques (ADN). Ces techniques reposent
principalement sur l'hybridation moléculaire, la réaction en chaîne par polymérase (PCR) et le
séquençage des acides nucléiques [141].
2. Variantes nucléotidique
Pour identifier les variantes nucléotidiques, différentes techniques ont été mises en œuvre.
40
Les techniques moléculaires
ensemble de positions pour une base particulière. L’analyse simultanée de 4 mélanges sur des
gels d'électrophorèse contenant un composé qui dénature l'ADN double brin et effectue, le
processus sous haute pression pour éviter la recombinaison des brins [141] .
Quant à la méthode Ci-dessus, les bandes sont révélées par autoradiographie et la
séquence est lue directement sur le gel. Il est également possible de marquer des
didésoxynucléotides au lieu d'amorces, ce qui permet de n'utiliser qu'un seul mélange au lieu
des quatre nécessaires dans un cas étiquetage primaire. La technologie Sanger est une
technologie implémentée dans le séquenceur automatique. Dans ce cas, le marquage se fait
par marquage fluorescent, différentes couleurs affichées après excitation laser [141].
Cependant, depuis 2007, il y eu Machines avec des débits 50 à 1 000 fois supérieurs. Ces
séquenceurs dits de "nouvelle génération" permettent de se débarrasser d'une certaine quantité
de biais de la méthode de Sanger. Par exemple, l'ADN à séquencer doit être cloné. Le
séquenceur "à haut débit" accélère considérablement l'analyse du génome et peut lire des
millions de séquences en parallèle [141] .
41
Les techniques moléculaires
Le séquençage à haut débit est puis utilisé pour savoir ce qui change entre la
génomique d'un échantillon par rapport à un échantillon de [141] .
Ces méthodes sont certainement le plus utilisé dans le domaine médical, dans le
séquençage et le séquençage de novo, la méta génomique a également été étudiée. Le but est
de trouver dans des mélanges complexes toutes les organisations qui le composent telles que
par exemple la flore intestinale 68, par conséquent, il est concevable que dans le séquençage
des sérums des patients permettront de déterminer quels agents pathogènes y sont présents et
lesquels sont à l'origine de la pathologie observée.
Le séquençage à haut débit est également utilisé pour une analyse fonctionnelle. Dans
ce cas, le plus important n'est pas de connaître la séquence d'ADN de l'échantillon, Le
séquençage à haut débit élimine les biais hybride, qui a une plus grande plage dynamique et la
résolution résultante est disponible pour une utilisation de base.
Par conséquent, ces outils peuvent être utilisés pour déterminer des molécules
thérapeutiques in vitro dans des cultures cellulaires, in vivo dans des modèles animaux ou lors
de tests clinique.
Ces méthodes de séquençage à haut débit sont désormais disponibles atteint la maturité
technologique requise pour une adoption généralisée par les communautés scientifiques et
médicales. Ils conduisent à construire une plateforme de génomique à très haut débit, rendu
comme une collection de ressources. En France, France Génomique72 fédère les grandes
plateformes françaises de génomique et bioinformatique en donnant accès au réseau de la
plateforme telles que les plateformes nationales Endoscope et le Centre National de
Génotypage est affilié à l'Institut Génomique du CEA à Evry. Toutes ces plateformes utilisant
les nouvelles technologies de séquençage [141].
Lors que touts les cycles seront terminés, l'analyse bioinformatique permettra entrer la
séquence nucléotidique de chaque fragment présent sur la plaque, touts commentaire dans le
fichier FastQ.
Les différentes séquences obtenues ou "lues" sont appelées "Lire" et aligner les uns avec
les autres pour reconstruire la séquence globale de l'échantillon. Cet alignement peut se faire à
l'aide d'un logiciel tel que BWA (Burrows-Wheeler alignement). Outil et se termine par un
fichier BAM (Binar Alignements Map) [141] .
42
Les techniques moléculaires
Cette détection des variant peut s’effectuer via des logiciels tel que GATK (Génome
Analysés ToolKit) 259 fournissant un fichier VCF (Variant Call Format). Ces fichiers seront
ensuite utilisés pour annoter les variant identifiés.
Les variant peuvent être retrouvés sous forme homo- ou hétérozygote. Lorsque le
variant apparaît dans près de 100% des séquences alignées, c’est une mutation homozygote.
Lorsqu’il est retrouvé dans environ 50%, il s’agira d’une mutation hétérozygote.
Mais lorsque le variant est retrouvé dans un très faible pourcentage, il pourra s’agir de
mutation mosaïque, par exemple, mais l’erreur de séquençage n’est pas à écarter.
43
Les techniques moléculaires
La technologie SnaPshot est utilisée pour séquencer des nucléotides à des sites très
précis, ce dernier partage les principes de la méthode Sanger, sauf que seuls des ddTNPs
marqués sont ajoutés aux amorces, ce qui permet d'amplifier des régions d'intérêt, et d'obtenir
des fragments d'ADN d’une seule taille. La fluorescence enregistrée fournira des informations
sur la nature et l'intensité de fluorescence des nucléotides dans la séquence insérée. En le
comparant à un échantillon de référence, le pourcentage d'allèles mutants dans l'échantillon
analysé peut être connu [141].
44
Les techniques moléculaires
Seuls les ddNTPs sont ajoutés à la réaction d’amplification. Les brins d’ADN de même
taille vont donc s’amplifier que d’un seul nucléotide. Durant la migration, le fluorochrome est
lu et permet d’identifier le ddNTP qui s’est inséré dans la séquence. En fonction du niveau de
fluorescence émis, il est possible d’avoir une idée du pourcentage d’allèle muté dans
l’échantillon (Inspiré d’onlinebiologynotes.com).
CGH - consiste en une hybridation sur une puce à ADN Échantillons dessai et
échantillons de référence. Les deux types d’échantillons sont Étiquetez-les avec différents
colorants fluorescents pour les distinguer. Fragments Les deux échantillons hybrideront sur la
même puce à ADN, qui contient un large éventail de Gênes. Une fois hybridés, lintensité de la
fluorescence émise par les fragments informera En ce qui concerne la présence de gain dADN
ou de réplication (la fluorescence provient principalement de échantillon à tester),perte ou
délétion dADN (la fluorescence provient principalement échantillon de référence) ou
unequantité similaire dADN (fluorescence des échantillons de test et de référence) par rapport
à léchantillon de référence, pour un gène donné [141].
Le but est de déterminer si le patient présenter la région de son génome excès (gain :
plus de matière, par ex. 3 copies au lieu de 2) ou une perde(manquant : moins de matériel
génétique, perte de matériel chromosomique appelé variantes de CNV nombre d'exemplaires
sous-entendu "Copie ADN") .
45
Les techniques moléculaires
Alors la hauteur du pic de fluorescence est les amplicons de gènes stables sont rapportés
par rapport aux échantillons témoins (rarement muté).
Si la fluorescence de l'échantillon du patient est d'au moins 1/3 fois plus grand que le
témoin, ce qui indique la présence de doublons (3 ou plus, au lieu de deux), lorsque le pic de
fluorescence est réduit d'environ 50% par rapport au pic de témoin, cela indique que le
patient a une délétion (1 ou moins, au lieu de 2).
46
Les techniques moléculaires
Sept amplicons différents sont utilisés pour lier la région VNC située sur le
chromosome 21, le gène PCBD2 (Pterin-4 Alpha-Carbinolamine Dehydratase 2) est un gène
codant pour une protéine.Les maladies associées à PCBD2 comprennent le syndrome de
Noonan 9. Parmi ses voies connexes, on trouve la dégradation de la L-phénylalanine I
(aérobie). Les annotations Gene Ontology (GO) liées à ce gène incluent lactivité de la
phénylalanine 4- et lactivité de la 4-alpha-hydroxytétrahydrobioptérine déshydratase. Un
paralogue important de ce gène est PCBD1) . de l'amplicons de référence permet la
normalisation des pics de fluorescence entre deux échantillons. Les amplicons des gènes
C21orf42 et CYYR1(En association avec pct-1, régule le trafic des précurseurs de vésicules
synaptiques dans les motoneurones AD en favorisant le trafic antérograde vers laxone et en
empêchant le trafic dépendant de la dynéine vers la dendrite. Peut également réguler le trafic
des vésicules synaptiques dans les motoneurones DD et dans les interneurones RIA .Impliqué
dans la formation des synapses pendant le remodelage des motoneurones DD en
désassemblant les structures présynaptiques ventrales) ont un pic de fluorescence de même,
indiquant l'absence de VNC, d'autre part l'amplicons APP_E18 du gène GABPA, les pics de
fluorescence de APP_E17 et APP_E1 chez les patients sont 1/3 plus grands que chez les
témoins, indiquant que les patients ont des copies supplémentaires de ces parties du
génome[141] .
47
Les techniques moléculaires
La maladie d'Alzheimer ne fait pas exception, avec des miR classés Par exemple, les«
miR spécifique es à la maladie d'Alzheimer tels que miR- 29, miR-9, miR-15a, miR-181c,
miR-101, miR-106b, miR-146a et miR-107 par conséquent.
Une régulation fine altérée des miR peut être un facteur de risque pour plusieurs
maladies neuro dégénératives. Par conséquent, une dérégulation des voies de maturation miR
peut être associée à la MA. Les études se sont ensuite concentrées sur l'expression et le rôle de
miR spécifiques dans la MA. Certains miR agissent en production miR-29, miR-135b et miR-
107 peuvent réguler le gène BACE1, miR9 peut reconnaître le PSEN1 et miR-106a, miR-20
et miR-16 peuvent cibler le gène APP. La suppression du gène MIR-34A améliorerait la
fonction et elle est la composante cognitive cible directement de Tau : comme dans miR-132,
son absence conduit à une augmentation de la phosphorylation et à l'accumulation de Tau
tandis que une augmentation de ce miR réduit le métabolisme Tau mais les miR peuvent
également être impliqués dans la MA en raison de cibles indirectes
Enfin, Erk1 est principalement diminué dans l'hippocampe et le cortex. Par conséquent,
ce miR peut agir sur plusieurs facteurs de risque de la MA de manière région-dépendante.
Plusieurs miR semblent être capables de réguler plusieurs voies associées à la MA.
Cependant, les niveaux d'expression de certains miR se sont avérés modifiés dans la MA et
peuvent être spécifiques à une région
Une certaine diminution à partir des premiers stades de la MA, comme miR-107 son
expression était corrélée négativement avec le niveau de BACE1 et la densité de la plaque
Vieillissement et enchevêtrements neuro fibrillaires [141] .
48
Les techniques moléculaires
4.L'imagerie nucléaire :
L`imagerie atomique est une génie d'imagerie moléculaire lesquelles le bouffée repose
sur l'administration, le encombré et l'introversion de la limitation comme l'corps de molécules
marquées à l'aphrodisiaque d'isotopes radioactifs, rares d'une cible, d'une affermi ou d'un
processus palpable particulier. Il existe en imagerie atomique: la TEP (Tomographie par
Emission de Positons) et la TEMP (Tomographie par Emission Mono Photonique). L'emploi
de l'une ou l'étrangère accord seécho en affermi de l'isotope radioactif choisi [142] .
49
Les techniques moléculaires
L’émeute de ces familles marqueurs pendant l’empire est plaisante par comparaison
aux différents outils diagnostiques. La réalité du 18F-FDG est en effet estimée à
principalement de 90% et sa nuance à principalement de 70% . Les situations concernant les
performances du 99mTc-HMPAO sont principalement contrastés pour des performances
fonction de 74 à 92% pendant la joliesse de patients atteints de la MA de sujets sains par
coexistence à l'évaluation clinique [142] .
50
Les techniques moléculaires
51
Les techniques moléculaires
53
Les techniques moléculaires
5.Électrophorèse bidimensionnelle :
Lorsqu'il est existé des bandes protéiques très proches, on a un chevauchement. Par les
méthodes unidimensionnelles la résolution et bon pour moins de 50 protéines. Grâce à
l'électrophorèse bidimensionnelle, on combine deux modes de séparation différents. La résolution
peut être appliquée pour plus de 1000 protéines différentes[144].
54
Les techniques moléculaires
•DIMENSION 1
DIMENSION 2
Séparation en fonction de la taille des protéines : SDS-PAGE Le gel étroit de protéines
séparées par FIE est soumis à une SDS-PAGE dans une direction perpendiculaire[144].
La technique PCR consiste en une succession de cycles comprenant chacun une étape de
dénaturation de l'ADN, une étape d'hybridation de deux amorces spécifiques de la séquence à
amplifier, et une étape d'élongation de l'ADN par une ADN polymérase (figure 26).En théorie,
la production des produits d'amplification (amplicons) est exponentielle (production de 2n
molécules d'ADN après n cycles de PCR). En pratique, on atteint un plateau entre 30 et 40
cycles de PCR parceque certains éléments de la réaction deviennent limitants ou inhibiteurs
[165]. Il n'y a donc pas nécessairement proportionnalité entre la quantité d'amplicons produits à
l'issue de la PCR et la quantité d'ADN cible de départ, ce qui rend la quantification peu fiable
par PCR dite en point final [144].
séquence cible, à laquelle elle s'hybride pendant la phase d'hybridation, de même que les
amorces (figure27). Elle porte à son extrémité 5' une molécule fluorescente (fluorochrome) dite
« reporter », et à son extrémité 3' un deuxième fluorochrome dit « quencher ». Le « reporter »
est une molécule qui, après excitation par un faisceau laser, émet un signal de fluorescence à
une longueur d'onde spécifique qui est mesuré à la fin de chaque cycle de PCR. En absence
d'amplification, la sonde reste intacte, le fluorochrome « quencher » inhibe en grande partie la
fluorescence du « reporter », et seule une fluorescence résiduelle est émise [145]. En revanche,
s'il y a amplification, la sonde TaqMan est hydrolysée lors de l'étape d'élongation de l'ADN
(activité 5'-3' exonucléase de l'ADN polymérase, figure 16) [167, 168]. Le « reporter » est alors
libéré et sa fluorescence n'est plus inhibée par celle du « quencher ». Pour chaque échantillon,
l'émission de fluorescence enregistrée à la fin de chaque cycle de PCR permet de définir une
valeur de Ct (cycle threshold ou cycle seuil) correspondant au nombre de cycles de PCR à
partir duquel la valeur de l'intensité de fluorescence est significativement différente du bruit de
fond. La valeur du Ct est d'autant plus faible que le nombre initial de copies de la séquence
cible est grand : elle est inversement proportionnelle au logarithme du nombre initial de copies
de la séquence cible dans l'échantillon d'ADN [146].
6.3.Avantages de la PCR quantitative en temps réel :
Par rapport à la PCR en point final, la PCR quantitative en temps réel présente
plusieurs avantages. Le principal est que la détermination des Ct est effectuée à la même
intensité de fluorescence, pendant la phase exponentielle, ce qui permet une précision identique
pour une gamme dynamique de mesure qui s'étend jusqu'à six ordres de magnitude. Par
ailleurs, l'efficacité de la PCR quantitative en temps réel est d'autant meilleure que la taille des
amplicons est petite (50-150 pb). Cela permet d'amplifier l'ADN extrait de produits
transformés, qui est souvent dégradé (c'est-à-dire composé de fragments de petite taille). Enfin,
l'utilisation d'une sonde TaqMan en plus des deux amorces augmente fortement la spécificité
des amplicons générés. Les autres avantages de la PCR quantitative en temps réel sont sa
rapidité de mise en œuvre (elle ne nécessite pas l'utilisation de standards internes clonés comme
la PCR quantitative compétitive) et un risque nul de contaminations post-PCR du fait que les
tubes ne sont pas ouverts après amplification. Les risques de contamination pré-PCR par de
l'ADN étranger lors des étapes d'extraction et de purification de l'ADN et/ou de préparation des
réactions de PCR sont cependant les mêmes que pour la PCR en point final.
En revanche, la PCR quantitative en temps réel est très sensible à la présence
56
Les techniques moléculaires
Figure 25 : Principe de la PCR quantitative en temps réel avec sonde TaqMan [149]
57
Conclusion
Conclusion
Conclusion
La maladie d'Alzheimer est une maladie neuro dégénérative du système nerveux central
caractérisée par une détérioration persistante et progressive de la fonction cognitive associée à
des lésions neuro pathologiques, une plaque amyloïde et des enchevêtrements neuro fibrillaires.
La MA peut être divisé en deux sous-types différents. Une morphologie familiale
précoce partiellement causée par une mutation génétique particulière et une morphologie
tardive sporadique avec de multiples facteurs de risque contenant un polymorphisme génique
particulier.
La recherche génétique est basée sur le déterminisme MA multiple : c’est dû à une forme
précoce particulière. Les gènes suivent les lois classiques de Mendel, le rôle des facteurs de
risque génétiques (ApoE) n’est pas négligeable. Ces facteurs de risque ont une interaction avec
d'autres gènes qui n'ont pas encore été couvertes.
Les études génétique ont permis de rédiger la première ébauche d’une vue intégrée du
processus de la maladie connue sous le nom de "théorie" Cascade amyloïde".
Dans la formulation originale, c'est la théorie pensait que c'était le mouvement principal dans
MA l’accumulation d'Ab fibreux dans la plaque amyloïde inférieure est considéré comme un
facteur de risque qui peut varier d'une personne à l'autre, prendre en compte
Il existe deux sources importantes d'informations à préciser une gamme de
dysfonctionnements cellulaires et moléculaires caractérise la MA.
La première source provient des analyses caractéristiques moléculaires et spatio-temporelles
de deux types de lésions envahir progressivement le cortex cérébral du patient atteint de la
maladie d'Alzheimer, c'est-à-dire les plaques amyloïdes et la dégénérescence neurofibrilles.
La deuxième source vient de caractérisation et modélisation des mutations géniques
responsable des formes familiales autosomiques dominantes de la MA. Toutes ces données
peuvent présenter un schéma des principales étapes physiopathologiques de la MA, altérations
moléculaires dans les troubles cognitifs.
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Résumé
Résumé
Abstract
To date, three different genes have been identified as the cause of most inherited forms of
disease. A mutation or an abnormality in one of these genes can cause the development of the
disease before the age of 65. However, these mutations are rare. The hereditary form of the
disease would have an autosomal dominant transmission: Autosomal, because the gene in
question is not on the sex chromosome (neither X nor Y), therefore the disease affects both
sexes; Dominant: Only one copy of a gene must be mutated to develop the disease.
In fact, two copies of each gene exist in an individual, one from the mother and one from the
father. This means that the affected person has a 1 in 2 chance of spreading their disease each
time they conceive . Three pathogenic genes identified :
PSEN1 gene: Located on chromosome 14, it is necessary for the production of the protein
presenilin 1, the most frequently mutated gene in hereditary Alzheimer's disease.
APP gene: Located on chromosome 21, it is essential for the production of amyloid precursor
protein.
Genetic diagnosis of Alzheimer's disease: there are several techniques used to detect the
mutation that caused Alzheimer's disease: Sanger technique; high-start sequencing technique;
snapchot technique; QMPSF technique...
Keywords: Alzheimer's disease, PSEN1 gene, PSEN2, APP gene, snapchot technique.
59
Résumé
ﻣﻠﺨﺺ
ﻣﺮض اﻟﺰھﺎﯾﻤﺮ ھﻮ ﻣﺮض ﺗﻨﻜﺴﻲ ﻋﺼﺒﻲ ﻓﻲ اﻟﺪﻣﺎغ ﯾﺘﺴﺒﺐ ﻓﻲ ﺣﺪوث ھﻔﻮات ﻓﻲ اﻟﺬاﻛﺮة ﺳﺮﯾﺮﯾًﺎ أو اﺿﻄﺮاﺑﺎت ﺳﻠﻮﻛﯿﺔ
أو ﺣﺘﻰ ﻣﻌﺮﻓﯿﺔ ﺗﺆﺛﺮ ﻋﻠﻰ اﻟﺤﯿﺎة اﻟﯿﻮﻣﯿﺔ ﻟﻸﺷﺨﺎص اﻟﻤﺼﺎﺑﯿﻦ .ﺗﻌﺘﺒﺮ ھﺬه اﻟﺤﺎﻟﺔ ﻣﺠﮭﻮﻟﺔ اﻟﺴﺒﺐ ﺣﺘﻰ اﻟﯿﻮم.
ﺣﺘﻰ اﻵن ،ﺗﻢ ﺗﺤﺪﯾﺪ ﺛﻼﺛﺔ ﺟﯿﻨﺎت ﻣﺨﺘﻠﻔﺔ ﻛﺴﺒﺐ ﻟﻤﻌﻈﻢ أﺷﻜﺎل اﻟﻤﺮض اﻟﻤﻮروﺛﺔ .ﯾﻤﻜﻦ أن ﺗﺘﺴﺒﺐ طﻔﺮة أو ﺷﺬوذ ﻓﻲ
أﺣﺪ ھﺬه اﻟﺠﯿﻨﺎت ﻓﻲ ﺗﻄﻮر اﻟﻤﺮض ﻗﺒﻞ ﺳﻦ .65وﻣﻊ ذﻟﻚ ،ﻓﺈن ھﺬه اﻟﻄﻔﺮات ﻧﺎدرة .اﻟﺸﻜﻞ اﻟﻮراﺛﻲ ﻟﻠﻤﺮض ﺳﯿﻜﻮن ﻟﮫ
وﺑﺎﻟﺘﺎﻟﻲ ﻓﺈن اﻟﻤﺮض Y) ،وﻻ Xاﻧﺘﻘﺎل ﺳﺎﺋﺪ وراﺛﻲ :ﺻﺒﻐﻲ ﺟﺴﺪي ،ﻷن اﻟﺠﯿﻦ اﻟﻤﻌﻨﻲ ﻟﯿﺲ ﻋﻠﻰ ﻛﺮوﻣﻮﺳﻮم اﻟﺠﻨﺲ )ﻻ
ﯾﺼﯿﺐ ﻛﻼ اﻟﺠﻨﺴﯿﻦ ؛ اﻟﻤﺴﯿﻄﺮ :ﯾﺠﺐ ﺗﺤﻮﯾﺮ ﻧﺴﺨﺔ واﺣﺪة ﻓﻘﻂ ﻣﻦ اﻟﺠﯿﻦ ﻟﺘﻄﻮﯾﺮ اﻟﻤﺮض.
ﻓﻲ اﻟﻮاﻗﻊ ،ﺗﻮﺟﺪ ﻧﺴﺨﺘﺎن ﻣﻦ ﻛﻞ ﺟﯿﻦ ﻓﻲ اﻟﻔﺮد ،واﺣﺪة ﻣﻦ اﻷم واﻷﺧﺮى ﻣﻦ اﻷب .ھﺬا ﯾﻌﻨﻲ أن اﻟﺸﺨﺺ اﻟﻤﺼﺎب ﻟﺪﯾﮫ
ﻓﺮﺻﺔ 1ﻣﻦ 2ﻟﻨﺸﺮ اﻟﻤﺮض ﻓﻲ ﻛﻞ ﻣﺮة ﯾﺘﺼﻮر ﻓﯿﮭﺎ ﺗﻢ ﺗﺤﺪﯾﺪ ﺛﻼﺛﺔ ﺟﯿﻨﺎت ﻣﻤﺮﺿﺔ.:
ﯾﺼﺎﺑﻮن ﺑﺎﻟﻤﺮض ﻗﺒﻞ PSEN1ﯾﻘﻊ ﻓﻲ اﻟﻜﺮوﻣﻮﺳﻮم ، 14وھﻮ ﺿﺮوري ﻹﻧﺘﺎج ﺑﺮوﺗﯿﻦ ﺑﺮﯾﺴﯿﻨﻠﯿﻦ PSEN1: ، 1ﺟﯿﻦ
ﺳﻦ
ﯾﻘﻊ ﻋﻠﻰ اﻟﻜﺮوﻣﻮﺳﻮم ، 21وھﻮ ﺿﺮوري ﻹﻧﺘﺎج ﺑﺮوﺗﯿﻦ طﻠﯿﻌﺔ اﻷﻣﯿﻠﻮﯾﺪ APP: . .ﺟﯿﻦ
ﺗﺆدي اﻟﻄﻔﺮات ﻓﻲ ھﺬه اﻟﺠﯿﻨﺎت اﻟﺜﻼﺛﺔ إﻟﻰ اﻹﻓﺮاط ﻓﻲ إﻧﺘﺎج ﺑﺒﺘﯿﺪات اﻷﻣﯿﻠﻮﯾﺪ ،ﻣﻤﺎ ﻗﺪ ﯾﺆدي إﻟﻰ اﻹﺻﺎﺑﺔ ﺑﺎﻷﻣﺮاض.
ﯾﻌﺪ ﺗﺤﺪﯾﺪ ھﺬه اﻟﺠﯿﻨﺎت وطﻔﺮاﺗﮭﺎ أﻣﺮ ًا ﺿﺮورﯾًﺎ ﻟﻔﮭﻢ آﻟﯿﺔ اﻟﻤﺮض.
اﻛﺘﺸﻒ اﻟﺒﺎﺣﺜﻮن أن ﻧﻮﻋ ًﺎ ﺟﺪﯾﺪ ًا ﻧﺎدر ًا ﻣﻦ اﻟﺨﺮف ،ﯾﺴﻤﻰ اﻋﺘﻼل ﺗﺎووﺑﺎﺛﻲ ﻓﺠﻮي ،ﻧﺎﺟﻢ ﻋﻦ طﻔﺮة ﻓﻲ ﺟﯿﻦ ﺑﺮوﺗﯿﻦ ﺗﺎو.
ھﺬا ،ﻋﻨﺪﻣﺎ ﯾﺘﺮاﻛﻢ ﻓﻲ أﺟﺰاء ﻣﻌﯿﻨﺔ ﻣﻦ اﻟﺪﻣﺎغ ،ﯾﻜﻮنﻣﺴﺆوﻻ ً ﻋﻦ ﻣﺮض اﻟﺰھﺎﯾﻤﺮ.
اﻟﺘﺸﺨﯿﺺ اﻟﺠﯿﻨﻲ ﻟﻤﺮض اﻟﺰھﺎﯾﻤﺮ :ھﻨﺎك ﻋﺪة ﺗﻘﻨﯿﺎت ﻻﻛﺘﺸﺎف اﻟﻄﻔﺮة ﻓﻲ أﺻﻞ ﻣﺮض اﻟﺰھﺎﯾﻤﺮ :ﺗﻘﻨﯿﺔ ﺳﺎﻧﺠﺮ .ﺗﻘﻨﯿﺔ
QMPSF ...ﺗﺴﻠﺴﻞ اﻟﺒﺪء اﻟﺴﺮﯾﻊ ؛ ﺗﻘﻨﯿﺔ ﻓﻮرﯾﺔ ﺗﻘﻨﯿﺔ
60
BENHEDHOUD Aya
….
Références
Année universitaire : 2021-2022 Présenté par : HADDAD Soumya
KHATAT Raounek
Étude théorique de la génétique de la maladie d’Alzheimer
Mots-clefs : Mots clés: Maladie d’Alzeimer, Gène PSEN1, PSEN2, Gène APP, la technique de snapchot.
61
Références
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