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EPIDEMIOLOGIE
1/04/2009
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Plan du cours
I] Définitions
II] Les différents types d’enquêtes
épidémiologiques
III] Généralités sur les biais
IV] Interpréter un test statistique
I) Introduction et définitions
Epidémiologie
Épidémiologie = étude de la distribution des états de
santé et de leurs déterminants dans la population
5
Déterminants de santé
6
Définitions
Un facteur de risque (FDR) est un facteur dont la
présence ou l’absence augmente le risque absolu de
survenue de la maladie.
2 types :
- intrinsèques (endogènes) = âge, sexe, génétique…
- Extrinsèques (exogènes) = environnementaux ou
comportementaux.
7
Qui utilise l’épidémiologie ?
8
Les 3 grands types d’épidémiologie
9
II) Les différents types d’enquêtes
épidémiologiques
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Types d’enquêtes
Enquêtes épidémiologiques
Études de cohorte
Études cas-témoins
Études transversales
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A] Enquêtes avec intervention
1) Enquêtes évaluatives
évaluer l’efficacité d’une action de soins, d’une intervention de
santé publique
Études ici/ailleurs (mortalité, région dépistage + vs
région dépistage -)
Études avant/après (incidence M, avant vaccination
vs après vaccination)
2) Essais thérapeutiques
test efficacité d’un nouveau médicament versus groupe
placebo ou médicament de référence (groupe témoin)
Ex : essais randomisés en double aveugle
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B] Enquêtes descriptives
Objectifs
Déterminer la fréquence (prévalence, incidence) de maladies
dans le temps et l’espace
Déterminer la répartition (âge, sexe, catégories
socioprofessionnelles…) des maladies dans une population
pendant une période donnée
Formulation des hypothèses étiologiques (FDR, causes)
vérifiées par des enquêtes analytiques
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Types d’enquêtes
Enquêtes épidémiologiques
Études de cohorte
Études cas-témoins
Études transversales
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Prévalence « statique »
= Mesure relative qui rapporte le nombre de malades (anciens et
nouveaux cas) à un nombre de sujets.
M = Nombre de malades
N = Population totale étudiée
Prévalence
Exemple de la toxoplasmose :
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Incidence
Luc
Véronique
Prévalence 4/7
Valérie
P = TI x d
P = prévalence
TI = Taux d’incidence
d = durée de la maladie
1) On a vu que P = TI x d
P = 0.03
d = 54 mois soit 54/12 = 4.5 ans.
1) Généralités
3) Etudes cas-témoins
4) Etudes de cohorte
5) Etudes transversales
25
1) Généralités
Types d’enquêtes
Enquêtes épidémiologiques
Études de cohorte
Études cas-témoins
Études transversales
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Enquêtes prospectives, rétrospectives
Enquête de cohorte,
rétrospective
Exposition au
facteur de risque Maladie
Temps
28
29
Types d’enquêtes
Enquête cas-témoins:
Enquête de cohorte:
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2) Mesures d’association
Comment mesurer, quantifier l’association
entre une maladie et un facteur de risque?
2 questions :
question statistique et épidémiologique
( tester et quantifier la relation).
relation cause à effet (biais, fluctuation
d’échantillonnage…).
Mesures d’association
Odds ratio
Risque relatif
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Définitions
Un facteur de risque (FDR) est un facteur dont la
présence ou l’absence augmente le risque absolu de
survenue de la maladie.
2 types :
- intrinsèques (endogènes) = âge, sexe, génétique…
- Extrinsèques (exogènes) = environnementaux ou
comportementaux.
Niveau population
- Proportion de cas attribuables (PCA) =
risque attribuable.
L’exposition à un facteur E est-elle associée à
une augmentation du risque de maladie M?
OR = ad / bc
Exemples :
OR = 2.10 [1.26 - 3.51] le facteur étudié est un FDR de la maladie.
OR = 2.18 [0.89 - 5.34] le facteur étudié n’est pas un FDR de la
maladie.
OR = 0.63 [0.26 - 0.89] la facteur étudié est un facteur protecteur vis-à-
vis de la maladie.
Interprétation
RR<1
OR<1
Facteur de risque
0 1 ∞
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3) Etudes cas-témoins
47
Études cas témoins (rétrospective)
Témoins :
Malades
choix témoin +++
appariement
49
Quels sont les éléments qui font de l’étude une étude
cas-témoins ?
50
Calculer la valeur de l ’odds ratio.
Que signifie cette valeur ?
Tabagisme
Non-
7 61 68
fumeurs
51
Calculer la valeur de l ’odds ratio. Que signifie cette
valeur ?
OR = 9,08
52
Calculer la valeur de l ’odds ratio par nombre de cigarettes
fumées /jour. Interpréter.
Nombre de cigarettes
CAS TEMOINS
Consommées Odds ratio
(Nombre) (Nombre)
quotidiennement
0 7 61 1 (ref)
1-4 49 91 4,6
5 - 14 516 615 7,3
15 - 24 445 408 9,5
≥50 41 20 17,8
54
Biais de sélection
55
•Quelle est la représentativité ?
Mauvaise représentativité
---> résultats non extrapolables à l ’ensemble de la population
58
Avantages et inconvénients des études cas-témoins
Cas-témoins
59
Critères de causalité
Critères:
Relation temporelle: l’exposition précède la maladie.
Force de l’association (valeur du RR ou de l’odds ratio).
Présence d’un effet-dose.
Plausibilité biologique: existence d’un mécanisme d’action
souvent montré par expérimentations chez l’animal.
Cohérence avec les connaissances générales et les hypothèses.
Reproductibilité de l’association: plusieurs études dans des
populations et lieux différents.
Spécificité de l’association: l’exposition est présente chez tous les
malades (ou presque), et pour cette seule maladie.
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4) Etudes de cohorte
61
Études exposés / non exposés cohorte
prospective
Exposé : fumeur
Maladie Maladie
Maladie MaladieMaladie
1996 2006
Non exposé : non fumeur
• RR > 1 : FDR de
(proportion de malades chez les exposés) maladie
Calcul du RR = • RR=1 : pas d’effet
(proportion de malades chez les non exposés) • RR < 1 : facteur
protecteur
Types d’enquêtes
Enquêtes épidémiologiques
Études de cohorte
Études cas-témoins
Études transversales
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Enquêtes prospectives, rétrospectives
Enquête de cohorte,
rétrospective
Exposition au
facteur de risque Maladie
Temps
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Exemple
Les données de l’étude de cohorte furent obtenues à partir de
l’ensemble de la population des médecins inscrits au « British Medical
Register », résidant en Angleterre et au Pays de Galles en Octobre
1951.
Les informations concernant les habitudes tabagiques furent obtenues
par questionnaire.
Les informations concernant la survenue d’un cancer du poumon furent
obtenues à partir des certificats de décès et d’autres données de
mortalité accumulées au cours de la période de suivi.
65
Exemple
Des questionnaires furent envoyés par la poste en Octobre 1951 à 59 600
médecins, afin de les classer en 3 groupes :
1 – Fumeurs
2 – Anciens fumeurs
3 – Non-fumeurs.
Les non-fumeurs furent définis comme toute personne n’ayant jamais fumé
régulièrement plus d’une cigarette par jour au maximum pendant un an.
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Calculer et interpréter les incidences de cancer du poumon
et les risques relatifs pour chaque catégorie de fumeurs
TALBEAU 3
Nombre de
cigarettes Nombre de
Personnes
fumées cancers du
années
/jour poumon
0 3 42 800
1-14 22 38 600
15-24 54 38 900
> 25 57 25 100
Fumeurs
toutes 133 102 600
catégories
Nombre de
Taux pour
cigarettes Nombre de
Personnes 1 000
fumées cancers du Risque relatif
années personnes
/jour poumon
années
0 3 42 800 0,07 Réf.
Fumeurs
toutes 133 102 600 1,3 17,14
catégories
Effet dose. 68
Le tableau 4 concerne les relations entre la consommation de
cigarettes et la mortalité par cancer du poumon en tenant compte
de l’effet de l’arrêt du tabagisme:
69
Qu'est-ce que ces données suggèrent pour la pratique de
la santé publique et de la médecine préventive ?
70
Limite principale des études de cohorte
71
Les biais
Biais de sélection:
Biais de classement:
Facteur de confusion
72
Biais de confusion
3+ 2.0
73
Les biais
Tabac
Café IDM
Critères:
Relation temporelle: l’exposition précède la maladie.
Force de l’association (valeur du RR).
Présence d’un effet-dose.
Plausibilité biologique: existence d’un mécanisme d’action
souvent montré par expérimentations chez l’animal.
Cohérence avec les connaissances générales et les
hypothèses.
Consistance (reproductibilité) de l’association: plusieurs
études dans des populations et lieux différents.
Spécificité de l’association: l’exposition est présente chez
tous les malades (ou presque), et pour cette seule maladie.
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Avantages et inconvénients des études cas-témoins et des
études de cohorte (à partir des 2 exemples donnés dans cet
exercice).
Cas-témoins Cohortes
77
Comparaison cohorte/cas témoins
Cohorte Cas/témoins
Type prospectif rétrospectif
Coût Élevé ++++ Faible
Rapidité des résultats ------------- +
Longs, peu Rapides
reproductibles Reproductibles
Biais +- ++++++
Perdus de vue Témoins comparables au
cas : biais sélection
Mémorisation
(rétrospectif)
mesure
Calcul de prévalence
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Types d’enquêtes
Enquêtes épidémiologiques
Études de cohorte
Études cas-témoins
Études transversales
80
Enquête Nationale Périnatale en 2003
Enquête réalisée en octobre 2003
Totalité des naissances d’enfants nées vivants ou
mort nées survenues pendant une semaine
15378 enfants
Recueil de caractéristiques cliniques,
sociodémographiques, comportementales
81
Résultats de l’enquête
comparaison à l’enquête précédentes 1998
82
Résultat de l’enquête
recherche de facteur de risque
83
84
Exercice
Une enquête cas-témoins visant à étudier le lien entre la
survenue d’un cancer (M) et une exposition (E) est menée chez
300 cancéreux et 600 témoins.
Parmi les cancéreux, 25% ont été exposés.
Parmi les témoins, ils sont 17.5%.
interprétation?
Exercice 2
M+ M- Total
E+ 28 431 459
E- 31 1345 1376
M+ = SIDA
M- = Pas de SIDA
E+ = Relation sexuelles avec partenaire atteint SIDA
E- = Pas de relation sexuelles avec partenaire atteint SIDA
2/ Lorsque que la maladie est rare, RR peut être estimé par OR.
OR = (28x1345) / (431x31) = 2.82
IC étroit : précision +
Notion de biais
(ce qu’on observe) – (ce à quoi on s’attend s’il n’y a pas d’association)
variabilité naturelle
En gros, si
(ce qu’on observe) – (ce à quoi on s’attend) > 2 x variabilité
variabilité naturelle
3. Calculer le niveau de signification ou p =
probabilité d’observer une statistique de test au
moins aussi grande si H0 est vraie.
Toute décision statistique implique un risque d’erreur =
seuil de signification du test = alpha =risque de 1ère
espèce = risque de rejeter à tort H0