TEMA 5.

NUCLEOTIDOS Y ÁCIDOS NUCLEICOS

DEFINICIONES
El ácido desoxirribonucleico (ADN) y el ácido ribonucleíco (ARN) son moléculas
catenarias de elevado peso molecular que actúan en el almacenamiento y en la
transferencia de la información genética
Los nucleotidos son la unidades estructurales de loa ácidos nucleicos

FUNCIONES DE LOS NUCLEÓTIDOS

a) Unidades estructurales de los Ácidos Nucleicos
b) Transportadores de energía química en el metabolismo (ATP)
c) Coenzimas (NAD+, FAD que transportan e- en reacciones redox)
d) Moléculas señalizadoras (cAMP)
e) Transportadores de sillares en procesos de biosíntesis
COMPOSICIÓN DE LOS NUCLEÓTIDOS
1) Una base nitrogenada
2) Un monosacárido de 5 Carbonos (pentosa)
3) Acido fosfórico (1, 2 o 3 moléculas)
 COMPOSICIÓN DE LOS NUCLEÓTIDOS

Observese la numeración de los átomos del azúcar y la base

BASES NITROGENADAS Compuestos heterocíclicos aromáticos

ADN y ARN ADN y ARN

ADN y ARN ADN ARN

PROPIEDADES DE LAS BASES NITROGENADAS
1) No existen en forma libre en la célula
2) Las pirimidínicas son planas debido a su acusado carácter aromático y las
purínicas tienen un ligero plegamiento
3) Hidrofóbicas y relativamente insolubles en agua. Solubles en ácidos y bases
4) Los átomos de N del anillo débilmente básicos (pK=9-10) y no se encuentran
protonados a pH=7,0
5) Diferentes tipos de interacciones entre ellas (puentes de hidrógeno y atracciones
hidrofóbicas)
6) Las bases absorben luz en la región del ultravioleta próximo (rango 260-280 nm)
debido a los dobles enlaces conjugados
7) Presentan Tautomería ceto-enólica

Absorción molar M-1 cm-1

Ejemplo con Uracilo

Longitud de onda, nm
NUCLEÓSIDOS

Son N-glucósidos de bases nitrogenadas

NOMENCLATURA: Prefijo base nitrogenada + ina

ESTRUCTURA
Azúcar D-ribosa (Ribonucleósidos) ó 2’-D-desoxirribosa (Desoxirribonucleósidos)

Se numeran los átomos del azucar 1’, 2’, 3’, 4’ y 5’ para distinguir de las bases

El enlace -N-glucosídico se establece entre el –OH del C1’ del azúcar y el N1 ó N9 de

las bases pirimidínicas ó purínicas (1’1) ó (1’9) hidrolizable con nucleosidasas
específicas ó con ácidos concentrados

PROPIEDADES
Más solubles en agua que las bases de las que proceden

No presentan carga eléctrica a pH fisiológico

Precursores de Ácidos Nucleicos y se encuentran en mínima cantidad en la célula

 NUCLEÓTIDOS

DEFINICIÓN
Esteres fosfóricos de nucleósidos (uno, dos ó tres fosfatos)

TIPOS
Ribonucleótidos
AZUCAR
Desoxirribonucleótidos

Nucleósido-monofosfato
Nº de FOSFATOS Nucleósido-difosfato
Nucleósido-trifosfato

Los más comunes con grupos fosfato en posición 5’

Los grupos fosfato de los di y trifosfato se designan según su

proximidad al azúcar, como ,  y 
Composición y estructura de un nucleósido* trifosfato

Enlace anhídrido

Enlace éster

  

Enlace -N-
glucosídico

Adenosina trifosfato (ATP)

*Los desoxinucleósidos trifosfato son idénticos sin el OH 2` de la D-ribosa

NUCLEOSIDOS NUCLEOTIDOS

Adenosina
Adenosina 5’-monofosfato (AMP)
Enlace β-N-Glicosídico

Guanosina Guanosina 5’-monofosfato (GMP)

Citidina Citidina 5’-monofosfato (CMP)

Uridina Uridina 5’-monofosfato (UMP)

 NOMENCLATURA DE LOS NUCLEOTIDOS Y DE LOS ACIDOS NUCLEICOS

Si el fosfato está en posición diferente de 5’ es necesario especificarlo

CARACTERÍSTICAS Y PROPIEDADES DE NUCLEÓTIDOS
1) Aparecen en forma libre en todas las células

2) Son productos de hidrólisis de Acidos Nucleicos con nucleasas

3) La base y el azúcar están en planos que forman ángulo recto. 4 de los 5 átomos
del anillo de furano de las pentosas están en el mismo plano

4) Ácidos fuertes (pKs fosfórico 1,0 y 6,2) con dos cargas negativas a pH=7,0. Forman
complejos con cationes bivalentes, (Mg2+ y Ca2+)

5) Fuerte absorción a 260 nm

6) Se pueden separar por técnicas que separen por carga (electroforesis etc.)

7) El enlace éster es bastante estable a hidrólisis ácida y es atacado por nucleotidasas.

Todos los demás enlaces son sensibles a ácidos

8) Existen otros nucleótidos con el (los) fosfato(s) en posición distinta de 5’, con
otras bases nitrogenadas como nicotinamida y flavina y algo mas en la estructura
Ejemplo de nucleótido con algo mas en su estructura

ADP

Acido pantoténico P~P

Adenina

Coenzima A (CoA o CoASH)

Ribosa-P

Transporta grupos acilo en el metabolismo

DINUCLEOTIDOS enlace fosfodiester
Unión covalente de dos nucleótidos
anhídrido
NMP AMP

Ribosa
5’ 5’

FORMA REDUCIDA

Ribosa Adenina

Nicotinamida

FORMA OXIDADA
DINUCLEOTIDOS

5’ 5’
FMN ribosa

AMP

Flavina

Dinucleótido de flavina y adenina reducido

(FADH2)
 POLINUCLEÓTIDOS
Unión de varios nucleótidos mediante puentes fosfodiester

TIPOS
Por nº de residuos
• (2) Dinucleótido
• (3) Trinucleótido OLIGONUCLEOTIDO
• (10) ------------------
• (N) Polinucleótido

Por tipo de azúcar

• Poli-desoxirribonucleótidos  ADN (Ácido desoxirribonucleico)
• Poli-ribonucleótidos  ARN (Ácido ribonucleíco)

ENZIMAS NUCLEASAS
Por sustrato
1) Desoxirribonucleasas: específicas de ADN
2) Ribonucleasas: específicas de ARN

Por posición de corte

a) Endo: hidrolizan enlaces entre 2 nucleótidos internos.
b) Exo: hidrolizan nucleótidos terminales, empezando por cualquiera de los dos
extremos 5’3’ ó 3’5’
 CARACTERISTICAS DE LOS POLINUCLEÓTIDOS

5’ terminal 1) Cadenas lineales de nucleótidos, sin ramificar

2) Enlaces fosfodiester 5’3’

A
3) El esqueleto covalente es polar con alternancia de
grupos fosfato y pentosa

4) Grupos fosfato cargados negativamente que

Enlace Fos-
fodiester
posibilita su unión con Mg2+ y proteínas básicas

5) Las bases nitrogenadas (hidrofóbicas) laterales

C
6) Dos extremos 5’ y 3’. La secuencia de bases se
suele escribir 5’3’

7) Los enlaces del esqueleto se hidrólizan mediante

enzimas (nucleasas) ó métodos químicos

T 8) El ARN se hidroliza en medio alcalino (grupo OH del

3’ terminal 2' directamente implicado)
 Acido Ribonucleíco (ARN)
Tres tipos:

1) ARNm = ARN mensajero, portador del mensaje

genético para la síntesis proteínas

2) ARNt = ARN de transferencia, transporta

aminoácidos a los ribosomas en la síntesis
de proteínas

3) ARNr = ARN ribosómico, componente de los

ribosomas

En células eucarióticas ARNhn (heterogéneo

nuclear) y ARNsn (small nuclear)

Bases A, U, G y C y β-D-Ribofuranosa
 ADN ARN
Ácido Desoxirribonucleico

Moléculas de Polidesoxirribonucleótidos

Bases: A, T, G y C

Azúcar: β-D-Dexosiribofuranosa

Generalmente es el material genético. La

secuencia precisa de bases transporta la
información genética

Genoma: Todo el ADN de un organismo

Gen: Segmento ADN que contiene

información para síntesis de un producto
biológico funcional (ARN o proteína)

Generalmente dos hebras (ADN dúplex).

 Modelo de la estructura del ADN (Watson y Crick 1953)
Evidencias previas

1) Reglas Chargaff (1940): equivalencia de bases nitrogenadas (nº de A=T y C=G)→

(A+G=T+C)

2) Tamaños de las bases y diámetro de la hélice (20 Å) solo permiten apareamientos del
tipo purina/pirimidina

3) Las disoluciones de ADN son de naturaleza viscosa → molécula larga y rígida

4) Al calentar se producen cambios de viscosidad sin rotura de enlaces covalentes

5) Por difracción de rayos X dos periodicidades a lo largo del eje. 1) Principal 3,4 Å y 2)
Secundaria 34 Å

6) El mecanismo de replicación de ADN es semiconservativo

 CARACTERÍSTICAS DEL MODELO DE ADN
eje
A) Dos cadenas polinucleotídicas helicoidales
5’ 3’ enrolladas alrededor de mismo eje (estructura 2ª),
formando doble hélice dextrógira (ADN duplex)

B) El enrollamiento es plectonémico (hay que

deshacer la hélice para separar cadenas)

C) Las cadenas son anti-paralelas 5’→ 3’ y 3’→5’

D) Modelo acorde con replicación semiconservativa

Nueva
banda

Nueva
banda
5’ 3’ Molécula de ADN parental

20 Å Moléculas de ADN hijas

 CARACTERÍSTICAS DEL MODELO DE ADN
E) El esqueleto covalente (desoxirribosa-fosfato)
al exterior de la hélice

F) las bases nitrogenadas al interior, apiladas en

planos perpendiculares al eje con distancias
de 3,4 Å y un giro de 36º (espira 10,5 N)

G) Las bases de distintas cadenas unidas por

puentes de hidrógeno e interacciones Azúcar
P
hidrofóbicas (A=T, C≡G)

H) La secuencia de bases de las dos cadenas es

complementaria
 CARACTERÍSTICAS DEL MODELO DE ADN
Doble ranura: una profunda (surco helicoidal o principal) y
otra poco profunda (surco menor) debido a la asimétrica de
la unión de bases al esqueleto

Poco
profunda

profunda

EL ADN es muy flexible, se puede curvar y estirar

El modelo propuesto aquí es la forma B del ADN, que es la mas estable de las posibles
In vivo existe la forma Z, que es un hélice levogira más estirada
 T
Plantas/flores

A
Aves

Mamíferos

Reptiles
M
Anfibios A
Peces óseos Ñ
Peces cartilaginos O
Equinodermos

Crustáceos D
Insectos
E
Moluscos

Gusanos
G
E
Hongos

N
Algas

Bacterias

Micoplasmas
O
Virus M
A
Contenido en bp (DNA)
S
 Propiedades del ADN
1) Superenrollamiento: Moléculas muy largas (4,6x106 bp E.coli y mucho mayores en
eucarióticos). Las proteínas (topoisomerasas) regulan el superenrollamiento
empaquetando el ADN y generando en el sitios de unión específicos

Cromosoma de E. coli

2) Desnaturalización
Desenrollamiento al azar y perdida de su conformación
Hélice
nativa (Estructura 2ª), que tiene lugar a:

A) pHs extremos

B) calor (más de 80ºC)

C) Agentes que rompan puentes de hidrógeno ó disminuyan Superenrollamiento

la constante dieléctrica del medio (alcoholes ó cetonas)

Proceso reversible (templado de ADN) y su velocidad depende del segmento apareado

 Desnaturalización del ADN: Hipocromismo
Un ADN desnaturalizado es menos viscoso y mas denso, y presenta mayor absorción a
260 nm (efecto hipercrómico) por pérdida de interacciones electrónicas entre electrones
 de las bases nitrogenadas apiladas. Tanto mayor cuanto más A=T
Punto de fusión (Tm): Temperatura a la cual se deshace la mitad de la estructura
helicoidal que tiene lugar dentro de pequeños intervalos de temperatura. Los Tm son
característicos de las células y aumentan con el contenido de G≡C

Fracción desnat (-)

ΔGo (-) para desnat
calor
Frío
lentamente

ADN nativo ADN desnaturalizado Tm

temperatura

Absorbancia 260nm
desnaturalizado
absorbancia

nativo
nativo desnaturalizado

Tm
Longitud de onda temperatura
 Tamaño, Forma y Tipos de Material Genético
VIRUS

ADN ó ARN, de doble ó simple cadena, circular o lineal

Puede integrarse en la célula huesped (animal, vegetal, bacteria..) y replicarse

conjuntamente

Tamaños de los ADN y de las partículas virales de

algunos virus bacterianos (bacteriofagos)
Nº de pares de Longitud del Dimensiones de la
bases del ADN ADN viral (nm) partícula viral (nm)
MATERIAL GENETICO DE CÉLULA PROCARIÓTICA

Doble hélice
de ADN

ADN supe-
enrollado

• Sin extremos 5' y 3‘

• Superenrollado

• Sin histonas

• Plásmidos(Ingeniería Genética)

• Doble hebra circular y cerrada

MATERIAL GENETICO DE CÉLULA EUCARIÓTICA
• Cantidad de ADN por célula mucho mayor que en células procarióticas

• ADN nuclear, mitocondrial y cloroplástico

• El ADN en el núcleo esta condensado en fibras de cromatina

• El ADN en el núcleo formando cromosomas lineales (visibles en metafase)

• El nº cromosómico es fijo en un especie

Nº cromosómico

Mosca de la fruta 8
Maiz 20
Abeja 32
Hombre 46
Pollo 78
 Estructura de la cromatina en los nucleosomas
El ADN eucariótico es muy largo y por ello debe empaquetarse

Asociado a proteínas básicas (Histonas) que son de 5 tipos (H1, H2A, H2B, H3 y H4)

Dos moléculas de las 4 últimas forman un octámero con un segmento de ADN

enrollado alrededor (nucleosoma)

La fibra de cromatina está a su vez enrrollada en hélice (varios modelos propuestos)

Octámero de
histonas del
nucleosoma
Proteínas
no
Histona H1 histonas

ADN
de unión
20-140 pb
 Estructura de la cromatina
Dos
cromatidas
(10 vueltas
cada una)
Núcleo de histonas ADN de unión
del nucleosoma entre nucleosomas

Una vuelta
(30 rosetas)

Una roseta (6 Matriz

bucles) nuclear

Un bucle
(~75.000 pb)

Fibra de 30 nm

Cromatina en
forma de
“cuentas de
rosario”

ADN
 SECUENCIAS REPETIDAS
El ADN eucariótico tiene un alto % de secuencias repetidas

1) Altamente repetidas
Secuencias muy cortas (<10 pb) que se pueden repetir millones de veces y se
denominan ADN satélite. Próximas al centrómero y no se transcriben

2) Moderadamente repetidas (2 tipos)

a) Secuencias de 150 a 300 pb, no repetidas en tandem y repartidas por todo el genoma
Función reguladora. Orígenes de replicación para el ADN de humanos

b) De 100 a 1.000 copias repetidas en tandem. Llevan información para fabricar

histonas, tARNs y rARNs

3) Unicas ó repetidas muy pocas veces

En una sola copia ó formando familias multigénicas. Codifican para proteínas.
Pequeños fragmentos intercalados en estas secuencias no se traducen (intrones)
SECUENCIAS DE GENOMAS DE EUCARIOTAS

No repetidas
Moderada repetidas
Altam. repetidas

E.coli C.elegans D.melanogaster M.musculus X. laevis N.tabacum