Resumen Lehninger Nucleótidos y Ácidos Nucleicos
Resumen Lehninger Nucleótidos y Ácidos Nucleicos
Resumen Lehninger Nucleótidos y Ácidos Nucleicos
RNA ribosómico (rRNA): son componentes de los ribosomas, llevan a cabo la síntesis de
proteínas
RNA mensajero (mRNA): actúan de intermediarios, transportando la información genética
desde un o unos pocos genes hasta el ribosoma donde se sintetizan las proteínas
correspondientes.
RNA de transferencia (tRNA): son moléculas adaptadas que traducen con fidelidad la
información contenida en el mRNA a secuencias específicas de aminoácidos,
Hay otras moléculas de RNA que desempeñan otras funciones
Los nucleótidos y Ácidos nucleicos están formados por bases y pentosas características
Los nucleótidos sucesivos de los ácidos nucleicos están unidos por enlaces fosfodiéster
Los nucléotidos sucesivos del DNA y del RNA están unidos covalentemente por puentes de
grupo fosfato
Los grupos fosfato 5´de un nucleótido están unidos al grupo 3’ del nucleótido siguiente,
mediante un enlace fosfodiéster
Los esqueletos de ácidos nucleicos consisten en alternados de fosfato y pentosa
Las bases pueden considerarse como grupos laterales unidos al esqueleto a intervalos
regulares
Los esqueletos del DNA y RNA son hidrofílicos, los grupos OH de los residuos de azúcar
forman enlaces de hidrógeno con el agua.
Los grupos fosfato con un Pka cercano a 0, se encuentran ionizados o cargados
negativamente a PH 7 y las cargas negativas se encuentran neutralizadas por interacciones
iónicas con cargas positivas de proteínas, iones metálicos o poliaminas
todos los enlaces fosfodiéster tienen la misma orientación a lo largo de la cadena, cada ANco
tiene una polaridad específica y extremos 3’5’ diferenciados
El extremo 5’ carece de nucleótido en posición 5, mientras que el extremo 3’ carece de
nucleótido en posición 3
La orientación 5’ a 3’ se refiere a los extremos de la cadena, no a la orientación de los enlaces
fosfodiéster
El esqueleto covalente del DNa y RNA experimenta un lenta hidrólisis no enzimática de los
enlaces fosfodiéster
el DNA y RNA in vitro se hidroliza con rapidez en 2’ del RNA (ausentes en DNA)
Los primeros productos de la acción del álcali sobre RNA son nucleótidos 2’y3’-monofosfato
cíclicos, que se hidrolizan rápidamente por una mezcla de 2’-3’-nucleósidos monofosfato
Las propiedades de las bases de los nucleótidos influyen en la estructura tridimensional de los
AN’s
Las piridinas y purinas libres son compuestos débilmente básicos y por ello se denominan
bases
Las purinas y pirimidinas presentes en el DNA y RNA son moléculas aromáticas y tiene
efectos en la estructura, distribución electrónica y capacidad de absorción de luz
La deslocalización de los e- entre los átomos del anillo confiere carácter de doble enlace
parcial
Las pirimidinas son planas y las purinas casi planas, con una ligera deformación
Las bases purínicas y pirimidínicas pueden existir en dos o más formas tauroméricas según
su PH
Las bases son hidrofóbicas e insolublesen agua a PH celular
A PH alcalino o ácido las bases adquieren cargas y aumenta su solubilidad
Las interacciones hidrofóbicas de apilamiento se sitúan paralelamente a los anillos de dos
o más bases, que ayuda a minimizar el contacto de las bases con el agua y ayuda a la
estabilización de la estructura 3D de los ácidos nucleicos
El apilamiento también involucra interacciones de van der Waals y dipolo-dipolo
Los grupos funcionales de las bases son los grupos carbonilo y los áromos del N del anillo y
los grupos amino exocíclicos
La formación de enlaces de hidrógeno en los que participan los grupos amino y carbonilo
constituyen el tipo principal de interacción entre cadenas complementarias de AN’s
Los patrones de enlaces de hidrógeno más frecuentes fueron definidos por James Watson
y Francis Crick en 1953
A la A se le une T o U y la G se une con la C, son los pares de bases
Este apareamiento permite la duplicación de la información genética
El DNA es una molécula flexible, tiene rotación de varios enlaces y fluctuaciones térmicas
La rotación se da alrededor de varios tipos de enlaces de cadena azúcar –fosfato
(fosfodesoxirribosa)
Las fluctuaciones térmicas pueden provocar la curvatura, el estiramiento y el
desapareamiento (fusión) de las hebras
Las variaciones estructurales no tienen ningún efecto sobre las propiedades fundamentales
del DNA: la complementarierdad, las hebras antiparalelas, el requerimiento de los pares de
base A-T, doble enlace y G-C triple enlace
Se producen curvaturas, estiramientos, desampareamiento (Fusión de hebras)
Debido a impedimentos estéricos las purinas están limitadas a conformaciones estables
respecto a la desoxirb que se denominan syn y anti
Las pirimidinas están limitadas a la conformación anti, a causa de la interferencia estérica
entre el azúcar y el oxígeno en C2
Forma B: es la estructura de Watson y Crick, es la más estable y es el punto de referencia
estándar en los estudios del DNA
Formas A y Z: son variantes caracterizadas en estructuras cristalinas
Forma A: predomina en disoluciones pobres en agua, la hélice es más gruesa, tiene 11 pb
por vuelta en lugar de 10,5 del B-DNA, los pb no son tan perpendiculares al eje de la hélice.
El surco ancho es más profundo y el estrecho más superficial, la cristalización se da por
deshidratación, ángulo de 20°, 1 vuelta 28A
Forma Z: tiene rotación L, 12 pb por vuelta, la estructura es más delgada y alargada, tiene
plegamiento en zig-zag. Las purinas adoptan conformación syn, alternado con pirimidinas
anti. El surco mayor es apenas perceptible, el menor es ancho y profundo
Las purinas y pirimidinas, junto con los nucleótidos de los que forman parte, experimentan
una serie de alteraciones espontáneas de su estructura covalente
Estas reacciones son muy lentas, pero son significativas a causa de la baja tolerancia de las
células a alteraciones genéticas
Mutaciones: alteraciones en la estructura del DNA que dan lugar a cambios permanentes
en la información genética codificada por la molécula
Hay relación entre las mutaciones y los procesos de cáncer y envejecimiento
Desapuranación
Reacción importante en los Desoxirbn, es la hidrólisis del enlace N-B-glucosídico entre la
base y la pentosa, que produce una lesión denominada AP (apurínico, apirimidínico) o
abásico
Ocurre más fácil en las purinas que en las pirimidinas
En el DNA, se pierde una de cada 105 purinas cada 24 h en condiciones celulares típicas
(10.000 por célula de mamífero).
En RNA es mucho más lenta y no se considera fisiológicamente significativa
En laboratorio se puede acelerar la pérdida de purina por tratamientos con ácidos diluido
La incubación del DNA a pH 3 provoca la eliminación selectiva de las bases purínicas y
produce un derivado denominado ácido apurínico.
La luz UV y las radiaciones ionizantes son responsables del 10% de lesiones en la estructura del DNA
causada por agentes medioambientales
El DNA también puede sufrir daños por reactivos químicos, introducidos al medio ambiente
por actividad industrial
No son peligrosos en sí, pero producen daños por su metabolización por las células
Hay dos principalmente
1. Agentes desnaminantes, ácido nitroso (HNO2) o compuestos que dan lugar a la
formación metabólica de ácido nitroso o nitritos, que acelera la desaminación de
las bases
2. Agentes alquilantes
El bisulfito tiene efectos similares a los nitritos
Se usan como conservantes en los alimentos, para evitar el crecimiento de bacterias tóxicas
Su utilización no aumenta el riesgo de cáncer
Los agentes alquilantes alteran ciertas bases del DNA
Dimetilsulfato, puede metilar a la G y dar lugar a la O6-metilguaniana y no se aparea con C
La causa principal de las alteraciones mutagénicas son los procesos oxidativos
peróxido de hidrógeno, radicales de hidroxilo y radicales de superóxido (productos
secundarios del metabolismo aeróbico)
Los radicales de hidroxilo son los responsables de la mayor parte de las lesiones oxidativas
del DNA
Las células poseen un sistema de defensa para destruir las especies de oxígeno reactivas,
como las catalasas y la superóxido dismutasa, pero una fracción pasa las defensas celulares
Producen lesiones como la oxidación de la desoxirb y de las bases, hasta la rotura de las
hebras
un buen número de cofactores enzimáticos llevan a cabo una amplia gama de funciones
químicas con adenosina, no tienen relación estructural entre ellos, además de tener A
En ninguno de los cofactores la posición de la A de la molécula participa directamente en
una función primaria, pero si se elimina l A, el resultado da una reducción de su actividad
La eliminación del nucleótido de A en 3’-fosfoadenosina difosfato, del acetoacetil CoA,
reduce su reactividad como sustrato de la B-cetoacetil-CoA transferasa un 106
La A tiene relación con la energía de unión entre el enzima y el sustrato o cofactor, que
interviene en la catálisis, como en la estabilización del complejo ES inical
NAS y FAD
las células responden a su entorno exterior captando señales hormonales y de otro tipo
La interacción de señales químicas extracelulares (Primeros mensajeros) con receptores de
la superficie celular, promuevan la producción de segundos mensajeros en el interior de la
célula y provocan cambios adaptativos en el interior de la célula
El segundo mensajero es a menudo un nucleótido, uno de los más comunes es la
adenosina3’,5’-monofosfato cíclico (AMP cíclico o cAMP) que se forma apartir del ATP en
una reacción catalizada por adenil ciclasa
AMP tien funciones reguladoras en todas las células que no pertenecen al reino vegetal
El nucleótido guanosina 3’,5’-monofosfato cíclico (cGMP) se encuentra en muchas células
ppGpp se produce en bacterias como respuesta a la disminución de la síntesis proteica
provocada por el agotamiento del medio de cultivo, inhibe la síntesis de rRNA y tRNA
Código genético