08 Enzimas y Metabolismo Celular

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ENZIMAS

METABOLISMO CELULAR
Algunos conceptos…
Cuando un sistema absorbe calor se dice que el proceso es
ENDOTÉRMICO.
Cuando un sistema libera calor se dice que el proceso es EXOTÉRMICO.

Un proceso es ENDERGÓNICO si requiere el aporte de energía útil


desde el entorno.
Un proceso es EXERGÓNICO si libera energía útil al entorno.

Sistemas: aislado – cerrado – abierto.


Leyes de la termodinámica
1  La energía no puede ser creada ni destruida, si bien puede
convertirse de una forma a otra.
2  Todo cambio energético se produce desde estados de mayor
energía a menor energía. Esto trae como consecuencia que los procesos que se
producen de manera espontánea aumenten la entropía. (esto siempre y cuando el
proceso no requiera energía externa, es decir, sea termodinámicamente favorecido
y, por consiguiente, será irreversible a menos que se aporte energía externa)
3  Todo sistema tiende a aumentar su entropía. Cuanto más ordenado es
un sistema mayor cantidad de energía requiere para mantener dicho orden. [La
entropía de un sistema disminuye al descender la temperatura llegando a tener
valor 0 en el 0 absoluto]
Bioenergética
Las leyes de la Termodinámica se aplican también a los sistemas
vivientes:
1° ley: la energía total del sistema y su entorno permanece constante.
2° ley: los procesos químicos y físicos tienden a aumentar la entropía
del sistema más su entorno.

La energía que la célula toma de su entorno se acumula en forma de


energía química, trabajo osmótico o trabajo mecánico.

La célula es un sistema químico isotérmico y constituye un sistema


abierto.
La energía química de las células
La energía química es aquella contenida en los enlaces que unen a los
átomos al constituir moléculas.
Teniendo en cuenta el tipo de energía que obtiene de su entorno, se
pueden clasificar básicamente en dos grandes grupos:
1) Células autótrofas fotosintéticas
2) Células heterótrofas
Si bien estos dos grupos difieren en la forma de tomar energía de su
entorno, ambos la acumulan en forma de energía química en un
compuesto denominado ATP.
ATP
Actúa como transportador de energía química en las células de todas
las especies vivientes.
Su estructura corresponde a la desarrollada en la clase de ácidos
nucleicos.
METABOLISMO CELULAR
Conjunto de reacciones bioquímicas que ocurren en el interior
de la célula.
Abarca los siguientes procesos:
1- Obtención de energía química del entorno (moléculas orgánicas o energía solar)
2- Conversión de los principios nutritivos exógenos en precursores de
sus macromoléculas
3- Ensamblaje de estos precursores en componentes de la célula
4- Formación y degradación de biomoléculas
Catabolismo
El catabolismo constituye la fase de degradación, en la cual las
moléculas complejas y relativamente grandes que obtiene la célula de
su entorno y tiene reservadas, son degradadas a otras más sencillas.
Esta degradación le extrae la energía contenida en sus enlaces, que
será utilizada para los distintos trabajos celulares y conservada en
forma de ATP, a partir de la fosforilación del ADP. Es decir, los procesos
catabólicos siempre están acompañados de liberación de energía.
Anabolismo
El anabolismo constituye la fase constructiva o biosintética del
metabolismo, en la cual se produce la biosíntesis de todos los
componentes moleculares de la célula a partir de precursores sencillos.
Al partir de moléculas sencillas y formar moléculas complejas, en los
procesos anabólicos se deben formar nuevos enlaces químicos que
requieren energía. El ATP es el encargado de aportar esta energía el los
procesos biosintéticos de la célula.
En conclusión…
Conceptualmente hablamos de cuatro tipos de procesos:
1- Aquellos que liberan energía o exergónicos
2- Aquellos que consumen energía o endergónicos
3- Aquellos que degradan moléculas complejas o catabólicos
4- Aquellos que sintetizan moléculas complejas o anabólicos
Podemos asociarlos y concluir también que
- Los procesos catabólicos con exergónicos
- Los procesos anabólicos son endergónicos

 El ATP conecta todas las reacciones del metabolismo celular a modo de


intermediario energéticos.
ENZIMAS
Estructura: las enzimas tienen en su mayoría una composición
proteica, aunque también hay moléculas de ARN, conocidas
como ribozimas, con capacidad catalítica.

Función: actúan como catalizadores biológicos aumentando la


velocidad de ciertas reacciones químicas e intervienen en la
interconversión de distintos tipos de energía.
Energía de activación
Es la energía necesaria para que se inicie una reacción química
(ya sea perteneciente a un proceso endergónico o
exergónico).

Las enzimas disminuyen la energía de activación.


Los catalizadores aceleran las reacciones químicas al disminuir
la energía de activación y logran acelerar más de un millón de
veces dichas reacciones en los sistemas biológicos.

Aquellas moléculas sobre las que actúan las enzimas se llaman


sustratos y las que resultan de dicha reacción se llaman
productos.

S1 + S2 = P1 + P2
Clases
Se utiliza un sistema para nombrar a las enzimas que las divide en 6
clases principales según la reacción que catalizan:
1  óxido-reductasas
2  transferasas
3  hidrolasas
4  liasas
5  isomerasas
6  ligasas
Propiedades de las Enzimas

1  son eficiente en pequeñas cantidades

2  se recuperan luego de la reacción

3  no alteran el equilibrio de las reacciones que catalizan.


Factores que afectan la actividad enzimática
Al ser de naturaleza proteica, la actividad enzimática se ve
afectada por factores ambientales como el pH o la
temperatura. Hay también factores celulares que afectan su
actividad (activación/inhibición) como además la cantidad de
enzima presente en la célula, a través de la regulación de la
expresión genética (inducción/represión).
Clasificación
1) SIMPLES: la parte proteica sola posee actividad catalítica.

APOENZIMA: parte proteica


2) CONJUGADAS
HOLOENZIMA COFACTOR ENZIMÁTICO: parte no proteica
El cofactor enzimático puede ser:
a) Ión inorgánico: Mg++, Mn++, Zn++, Cu++, Na+, Cl-, etc
b) Coenzima: son moléculas orgánicas pequeñas: NAD, FAD, NADP, CoA
En los casos donde la coenzima está fuertemente unida a la parte proteica se las
denomina GRUPOS PROSTÉTICOS.
Una vez unida la apoenzima a su correspondiente cofactor se obtiene la forma
activa que recibe el nombre de HOLOENZIMA.
Enzima - Sustrato
El primer paso en el proceso catalítico es la unión entre la enzima y el
sustrato. La región de aminoácidos de la enzima que interacciona con el
sustrato se llama sitio activo y es allí donde se produce el proceso
catalítico.
Las uniones que se forman entre las enzimas y los sustratos son
débiles. Existen dos modelos que describen esta interacción:
1. Modelo de llave-cerradura
2. Modelo de ajuste inducido
Se han encontrado ejemplos para ambos modelos.
Cinética enzimática
La cinética enzimática estudia la velocidad de las reacciones catalizadas
por enzimas.
Factores que afectan la cinética enzimática
La velocidad de las reacciones químicas catalizadas por las enzimas
puede ser afectada por distintos factores: concentración del sustrato,
concentración de la enzima, temperatura, pH, además de la presencia
de inhibidores.

Iremos analizando cada una de estas variables por separado.


Concentración del Sustrato
Frente a una determinada cantidad de enzima, se observa que a bajas
concentraciones de sustrato, la velocidad aumenta de modo
proporcional al aumento de la concentración del sustrato; pero cuando
la concentración del sustrato es alta, tiende a alcanzarse una velocidad
máxima, que solo podrá ser aumentada aumentando la concentración
de la enzima.
Michaelis y Menten
Estos investigadores propusieron un modelo para explicar la cinética
enzimática. Las enzimas que responde a este modelo, pasaron a
llamarse enzimas michaelianas. Ellos postulan que a altas
concentraciones de sustrato, todos los sitios activos de las enzimas
están ocupados y por lo tanto la velocidad alcanza un máximo. A ese
estado lo llamaron SATURACIÓN.
La constante o coeficiente de velocidad denominada k caracteriza la
afinidad de la enzima (E) por el sustrato (S). Es una constante de
proporcionalidad entre la velocidad de reacción y la concentración de
los reactivos.
Km
La constante Km es el valor de la concentración de S para el cual la
velocidad V alcanza un valor igual a la mitad de su valor máximo Vmax.
Km
Cuando una enzima tiene afinidad por más de un sustrato, el Km
permite indicar sobre cuál de ellos tendrá mayor afinidad y actuará en
forma preferencial.

Cuando una enzima tiene un valor muy pequeño de Km para un


determinado sustrato significa que con una concentración muy baja de
dicho sustrato se puede alcanzar la saturación de la enzima. Es decir,
que cuanto menor sea el Km, mayor será la afinidad de la enzima por el
sustrato y viceversa.
Temperatura
pH
Inhibición de la actividad enzimática
La inhibición de las enzimas puede ser de dos tipos:

Competitiva
1 – INHIBICIÓN REVERSIBLE
No Competitiva
2 – INHIBICIÓN IRREVERSIBLE
Inhibición Reversible
Existe una sustancia en el medio que actúa inhibiendo la actividad de la
enzima. A esa sustancia la llamaremos INHIBIDOR (I).

El inhibidor se fija a la enzima dando como resultado una pérdida


reversible de la actividad que puede ser analizada utilizando la relación
de Michaelis y Menten.

Existen dos tipos de inhibición reversible: competitiva y no competitiva,


las analizaremos por separado
Inhibición Competitiva

El inhibidor competitivo tiene una similitud estructural con el sustrato,


lo que le permite unirse reversiblemente al sitio activo de la enzima.
Cuando están presentes tanto el sustrato como el inhibidor, la enzima
puede unirse tanto a uno como al otro. Eventos que son mutuamente
excluyentes. La formación de complejos enzima-inhibidor reduce la
concentración de enzima disponible para unirse con el sustrato. Esto
determina una disminución en la velocidad de formación de producto:
disminuye la velocidad de la reacción.
Sin embargo, esta inhibición puede contrarrestarse aumentando la
cantidad del sustrato.
Inhibición Competitiva

¿Se modifica
Vmax con la
presencia de
inhibidor?

¿Se modifica Km
con la presencia
del inhibidor?
Inhibición No Competitiva

En este caso, el inhibidor se fija a la enzima en un sitio diferente que


el que se une el sustrato. Así, el sustrato puede unirse a la enzima,
pero esta no es capaz de catalizar la reacción.

Por lo tanto, este tipo de inhibición no puede revertirse aumentando


la concentración del sustrato.
Inhibición No Competitiva

¿Se modifica
Vmax con la
presencia de
inhibidor?

¿Se modifica Km
con la presencia
del inhibidor?
Inhibición Irreversible
Es provocada por una sustancia que produce un cambio
conformacional en la enzima, lo que resulta en una pérdida
definitiva de su actividad. En estos casos, la ecuación de
Michaelis y Menten resulta inaplicable.
Regulación de la actividad enzimática
Se diferencias tres niveles de regulación de las enzimas:

1. Regulación de la actividad catalítica (activación-inhibición)


2. Regulación de la síntesis de enzimas (inducción-represión)
3. Regulación de la degradación de las enzimas.
1. Regulación de la actividad catalítica
Consiste en regular la actividad de las enzimas ya sintetizadas lo cual
constituye un ahorro energético para el metabolismo celular.
Hay varios factores que influyen en este proceso:
Sistemas multienzimáticos  retroinhibición o inhibición por feed-back
Efectos alostéricos
Modificación covalente (reversible o irreversible: ZIMÓGENOS)
Compartimentalización
Isoenzimas (distintas variedades de una misma enzima con la misma
actividad catalítica: LDH,CPK)
Enzimas Alostéricas
Su desempeño biológico no puede explicarse según el modelo
michaeliano, por eso se estudian por separado. En este caso, la
velocidad de la reacción se representa con una curva sigmoidea.
La cinética es congruente con la presencia de dos o más subunidades
polipeptídicas: proteína oligomérica.
Efecto de cooperatividad respecto a la concentración del sustrato.
Otros moduladores (diferentes al sustrato):
- Modulador positivo (dim Km ó aum Vmax)
- Modulador negativo (aum Km ó dim Vmax)
Enzimas Alostéricas
Cuando el modulador es el sustrato el efecto es HOMOTRÓPICO;
Cuando el modulador es distinto del sustrato es HETEROTRÓPICO.
2. Regulación de la síntesis de la enzima
La síntesis puede se INDUCIDA por los mismo sustratos o REPRIMIDA
por sus productos durante el proceso de transcripción. El resultado
final es que las enzimas se sinteticen solo cuando son necesarias.

Este mecanismo de regulación es relativamente lento (comparado con


los anteriores)
3. Regulación de la degradación de la enzima
La presencia o ausencia de sustratos y cofactores puede alterar la
conformación de la enzima haciéndola más o menos susceptible de ser
degradada.

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