2 Parcial de Genã©tica
2 Parcial de Genã©tica
2 Parcial de Genã©tica
Transcripción
El Dogma Central del Biología Molecular: al conjunto de procesos que explican la forma en que
se expresa la información genética. Este comprende los procesos de replicación, transcripción
y traducción.
Tipos de ARN
• ARN ribosomal. Molécula de ARN que forma parte constitutiva de los cromosomas. Ciertos
tipos de ARN ribosomal poseen función catalítica en la formación de enlaces peptídicos en la
creciente cadena de aminoácidos.
• ARN de transferencia. Estas moléculas se encargan de capturar los aminoácidos libres del
citoplasma y llevarlos al ribosoma, de acuerdo a la secuencia de nucleótidos contenida en el
mRNA.
Eucariota Procariota
Subunidad menor 40s ,-33 Pro,ARNr 18s Subunidad menor 30s , 21 pro ,ARN16S
Subunidad mayor 60s, -60s Pro49 Subunidad Mayor 50s ,34 pro ARNr23s,5s
ARNr28s,5.8,5s
Ojo.
La transcripción
• Que no todos los genes se transcriben en todo momento. Se transcriben solo los genes que
se requieren en determinadas condiciones de crecimiento.
• La transcripción es un proceso que requiere una gran cantidad de energía, por lo tanto, es
estrictamente regulada.
La ARN polimerasa
• La ARN polimerasa es una enzima formada por dos subunidades alfa, una subunidad beta y
una beta prima y la subunidad omega. Esto se conoce como centro de la enzima.
La polimerasa eucariota
Factores de transcripción
• Solo cuando el factor de transcripción se une a la ARN Polimerasa, esta puede unirse al ADN
en lugares específicos denominados promotores.
• Los factores de transcripción son varios y se emplean según las condiciones de crecimiento o
estrés ambiental. El factor más común en E. coli y en la mayoría de las bacterias es el factor σ
70 que controla la transcripción de la mayoría de genes esenciales (house kiping genes).
• Sin embargo, existen otros factores de estrés ambiental como el σ s ( σ 32) el cual es el
encargado de la transcripción durante la fase estacionaria.
Secuencias de consenso
• Las secuencias de los promotores a los cuales se une el factor de transcripción no son
exactamente iguales, sin embargo, comparten regiones comunes en su secuencia. Estas
regiones comunes se denominan secuencia de consenso.
• Existen secuencias de consenso para para el promotor -35 y para el promotor -10. La
secuencia de consenso de los promotores -10 es TATAAT. La secuencia de consenso de la
región -35 es TTGACA.
Iniciación
• La ARN polimerasa, la enzima que sintetiza ARN, se une a regiones particulares del ADN
llamada promotores, ubicadas a una distancia de -35 y -10 bases antes de la región de inicio de
transcripción de los genes.
• Una vez unida al promotor, la enzima ARN polimerasa separa las hebras que componen el
ADN y lo desenrolla. Luego, se mueve a lo largo de la molécula, formando un bucle a medida
que se desplaza.
Elongación de la transcripción
• A 10 nucleótidos de distancia del promotor, los trifosfatos ribonucleótidos (rATP, rUTP, rGTP,
rCTP) se aliean de manera opuesta y complementaria al ADN abierto en el bucle de
transcripción.
• La enzima se mueve a lo largo del ADN sintetizando o alargando la molécula de ARN mensaje
durante su desplazamiento. Muchas moléculas de ARN polimerasa pueden en secuencia
transcribir el mismo gen. De esta manera se producen múltiples transcritos del mismo gen.
ARN polimerasa Vs ADN polimerasa
Terminación de la transcripción
• Una vez que la transcripción ha iniciado esta continua a lo largo del ADN, hasta que
encuentra una señal de terminación en el ADN. Esta señal no se encuentra necesariamente al
final de un gen. Ya que en bacterias hay varios genes que se transcriben juntos. En estos casos,
la señal de terminación se encuentra al final de estos.
Esta sección está formada por repeticiones invertidas, al transcribir esta región la ARN
polimerasa reduce su velocidad, por lo cual en el ARN recién sintetizado se forman enlaces
entre las bases GC de la cadena simple. Este cambio conformacional provoca que la ARN
polimerasa se separe del ADN. De igual forma próxima a esta región hay una zona rica en la
base Adenina, se ha hipotetizado que la uniónA-U entre el ARN y el ADN es menos estable
favoreciendo así la separación.
• Rho actúa como helicasa, por lo cual es dependiente de ATP, solo está activa en presencia de
ARN.
ARN ribosomal
• Este ARN se encuentra ubicado en la subunidad mayor del ribosoma procariota. Posee una
actividad catalítica, es decir, constituye la enzima peptidil transferasa, que se encarga de unir
los aminoácidos dentro de la proteína en el ribosoma.
Los ARNs ribosomales se copian juntos en unsolo transcrito que debe ser separado.
La transcripción el ARN
1. El segmento que contiene el 16S RNA ribosomal y el que contiene el 23S RNA
ribosomal están flanqueados por repeticiones invertidas que se aparean formando una
estructura secundaria en formad e tallo en el ARN transcrito.
2. Esta estructura en forma de tallo es reconodia y cortada por la ARNs III. Esta enzima
pertenece al grupo de las ribonucleasas, proteínas encargadas de procesar y degradar
el ARN.
Esto, más la subsecuente fragmentación genera los 16S and 23S rRNA maduros.
• En contraste la mayoría del ARNm tiene una duración de vida promedio de 1-3 minutos. Es
decir, en este tiempo el 50 por ciento de estas moléculas ha sido degradado. Esto contrasta
con los eucariotas en los cuales la mayoría de los RNAm tienen una vida promedio de horas.
Transcripción en Archaea
• Las arqueas presentan más similitudes en su proceso de transcripción con los eucariotas que
con las bacterias. Sin embargo, el mecanismo de replicación de las arqueas es más simple.
• Tanto las secuencias de los promotores como la estructura y actividad de la RNA polimerasa
de arque recuerdan a los eucariotas. Mientras que la regulación de la transcripción es más
similar a las bacterias, quizás debido a su pequeño tamaño y a la carencia de núcleo.
Similitudes entre Archaea y Eukarya
• Las arqueas contienen una sola ARN polimerasa que es muy similar a la ARN polimerasa II de
los eucariotas. La ARN polimerasa de las
arqueas posee 8 unidades, mientras que la ARN polimerasa II de los eucariotas posee 12
unidades, en contraste con bacteria que posee 5 subunidades.
CAJAS TATA
• Las secuencias de reconocimientos más importante en estos dominios son las cajas TATA
compuesta de 6 a 8 pares de bases, localizada entre 18 y 27 nucleótidos antes del inicio de la
transcripción.
• A l caja TATA se une la proteína TBP y a la secuencia BRE se une la proteína TFB.
Terminación de la transcripción
Intrones en arqueas
• Al igual que en bacterias, las secuencias intercaladas en genes que codifican para proteínas
son raras en arqueas.
• Algunos genes que codifican para ARNt y ARNr en arqueas poseen intrones que deben ser
eliminados después de la transcripción para, sin embargo, su escisión no requiere un
explisosoma como en eucariotas, sino que está regulado por endonucleasas.
Mutaciones genéticas en procariotas
Una mutación es cualquier cambio que altera la información genética correspondiente a un
locus, pero que no es el resultado de la transferencia horizontal de genes.
Las mutaciones inducidas: Son el resultado de factores químicos o físicos, tales como como la
radiación o algunas sustancias capaces de alterar la estructura tridimensional del ADN o su
secuencia.
Estas ocurren como resultado de la tasa de error en la labor del ADN polimerasa, si bien es
cierto que la tasa de error es de 1 por 104 bases insertadas, esta puede ser incluso menor en la
realidad, debido al mecanismo de ‘lectura de prueba´, estudiado. Las mutaciones espontaneas
s pueden ser de varios tipos:
1. Mutaciones puntuales.
2. Mutaciones de pauta de lectura.
3. Grandes delecciones.
4. Inversiones.
5. Traslocaciones.
6. Duplicación Tandem.
Mutaciones puntuales
Esto ocurre porque se induce un error al sintetizar la nueva hebra, lo cual genera un cambio en
las generaciones siguientes.
Debido a que los átomos de hidrógeno son los que formaran puentes entre las bases
nitrogenadas de las cadenas complementarias, el ADN polimerasa las aparea erradamente.
Recordemos que el ADN contiene secuencias que no codifican para proteínas estas pueden
codificar para diferentes tipos de ARN o constituir secuencias de unión al ADN polimerasa u
otras proteínas regulatorias de la transcripción.
Si una mutación ocurriera en una secuencia destinada a ser reconocida por una proteína
reguladora, entonces la regulación se ve afectada, ya que la proteína no puede unirse a esta
secuencia.
Mutación silenciosa. El cambio de una base provoca que se incorpore un aminoácido con
características químicas similares y la proteína sigue siendo funcional.
Mutación sin sentido. Cuando la mutación puntual provoca que en lugar de un aminoácido se
genere un código de parada, en estos casos la síntesis de la proteína e interrumpe.
secuencia de la proteína.
Estas mutaciones pueden dar origen a proteínas inestables que conserven todavía algo de la
función y que sean sensibles a cambios de pH y temperatura.
En otras ocasiones las mutaciones pueden provocar cambios en la estructura secundaria y
terciaria de la proteína afectando el plegamiento de la proteína y su función.
Grandes deleciones
Inversiones
Duplicaciones tandem
Las duplicaciones tándem consisten en la repetición de la misma secuencia del gen una detrás
de la otra. Las repeticiones tándem, por lo general se producen cuando ocurren eventos de
recombinación en el cual se inserta una copia del nuevo gen.
Se piensan que las duplicaciones tándem pudieron jugar un importante papel en la evolución
de los procariotas, tomando en cuenta que una de las copias del gen podría mutar llegando a
alcanzar una función diferente a lo del gen original.
Se trata de la aparición de una copia de una zona de ADN a continuación de la localización del
original. Suelen deberse al emparejamiento y recombinación entre secuencias similares en dos
moléculas de ADN (en realidad, en este evento, de las dos moléculas de ADN, una se queda
con una duplicación mientras que la otra se queda con una delección).
Si el segmento duplicado es grande y lleva varios genes, no suele conducir a inactivación
génica (ya que, aunque en la juntura de la duplicación puede haber una mezcla de dos genes
truncados, sigue habiendo copias silvestres de dichos genes en el mutante).
Mutaciones insencionales
Inversión
Inserción
Duplicación
Delecion
Translocación
La reversibilidad de las mutaciones suele deberse a una segunda mutación que restaura el
fenotipo original.
La Supresión de una mutación ocurre cuando la 2ª mutación suprime los efectos de la 1ª pero
no restaura el genotipo original. Por lo tanto, tras la mutación supresora, la célula queda con
dos mutaciones. La supresión se clasifica a su vez en:
Supresión indirecta: no se corrige el producto del primer gen, pero la 2ª mutación anula
Se abre una nueva vía para la síntesis del producto afectado por la 1ª mutación.
El producto mutado de la 2ª mutación puede sustituir al producto de la primera.
Supresión directa: la 2ª mutación corrige el producto del primer gen mutado. Puede ser de
dos tipos principales:
Supresión intergénica extragénica: la mutación supresora afecta a otro gen, que suele ser uno
de los genes implicados en la maquinaria de traducción del ARNm: ARNt y proteínas
ribosómicas.
Son factores físicos o químicos capaces de producir mutación. Los más importante son:
1. La radiación ionizante.
2. Radiación UV.
3. Los análogos de bases.
4. Sustancias que alteran los nucleótidos.
5. Los intercaladores
La radiación ionizante
Los rayos X y los rayos Gamma son un tipo de radiación ionizante. Este tipo de radiación
recibe su nombre, ya que libera iones que interactúan con la molécula de ADN.
La radiación puede tener un efecto directo los enlaces covalentes entre la azúcar y los
grupos fosfatos en la estructura externa de la molécula causando ruptura física del cromosoma
y pérdida del control celular.
También pueden tener un efecto indirecto al generar radicales libres que provoquen daño en
Radiación UV
La radiación no ionizante como la UV causa dímeros, es decir uniones covalentes entre las
bases pirimidinas adyacentes en una misma hebra o cadena, haciendo imposible la formación
de puentes de hidrógeno y provoca deformación en la doble hélice. De igual forma interfiere
en la replicación.
Estas mutaciones son reversibles, ya que la célula procariota cuenta con un sistema de
reparación ante daños por UV.
Los dímeros producto de la UV se producen entre bases primidinas de una misma cadena, es
decir, T-T o C-T o C-C. E. coli cuenta con un sistema de reparación denominado sistema ABC al
estar compuesta por un conglomerado de proteínas, las cuales actúan como endonucleasas,
eliminando el dímero al producir la escisión del segmento dañado. Luego, la ADN polimerasa I
sintetiza los nucleótidos faltantes.
Mutágenos químicos
Existen diferentes sustancias químicas que pueden producir mutaciones, los tipos más
comunes son:
Análogos de nucleótidos. Son compuesto cuya estructura química similar a los nucleótidos.
Cuando los análogos de los nucleótidos están disponibles es posible que estos sean insertados
en la cadena en crecimiento. Este hecho puede inhibir al ADN polimerasa o de lo contrario,
producir apareamiento incorrecto.
Intercaladores
Los organismos con reproducción asexual pueden tener dos fuentes de variabilidad genética,
unas de ellas son las mutaciones, transferidas verticalmente a la descendencia y otra es la
transferencia horizontal de genes.
La transferencia de genes entre individuos no relacionados puede ocurrir por los siguientes
medios:
Decimos que dos fragmentos de ADN son homólogos si comparte una serie de bases en su
secuencia, por lo que se piensan que tienen orígenes y funciones similares.
Si un fragmento de ADN foráneo presenta regiones homologas con genes propios del aceptor,
puede recombinarse con este dando origen a variaciones o incorporaciones que favorecen la
variabilidad genética.
Transformación
Las células que las poseen se denominan competentes, es decir, capaces de sufrir
transformación son ejemplo de células competentes las especies de Streptococuus,
Staphylococcus, Haemophilus, Neisseriay Bacillus.
Los bacteriófagos son entes replicables que se reproducen en el interior celular. Estas
estructuras son virus compuestos por ADN o ARN y una cápside o cápsula de proteína con
forma variada.
La cápside puede ser icosaédrico (cortico virus), filamentoso (fago M13) o enforma cabeza-cola
(fago T7).
Diversidad de fagos
Los fagos son específicos, es decir afectan a especies o grupos particulares. Son mucho más
abundantes que las propias células procariotas. Se estima que por cada célula procariota en
ecosistemas Acuáticos lo podemos encontrar
Dada su capacidad para integrar material genético tanto en el cromosoma como en plásmidos,
los fagos son útiles herramientas en ingeniería genética.
Asimismo, las ADN polimerasas de fagos han servido para la secuenciación de moléculas de
ADN.
Otra tecnología en pleno auge para la edición genética es CRISPR-Cas (“clustered regularly
interspaced short palindromic repeats”), lal cual está basada en el mecanismo de defensa de
bacterias contra bacteriófagos.
Fago Utilidad
Empleado en genética como control para la
Lambda λ cuantificación de ADN
T4 y T7 Empleado en biotecnología para
producir ADN recombinante
T2 Empleado en genética
como herramienta para
inserción de genes en
E. coli
ΦH5 y ΦA72 Extracción de enzimas Endo lisinas para la
eliminación de bacterias patógenas en
la industria agroalimentaria .
Bacteriofagos como herramientas en Biotecnología
Otro enfoque ha sido la aplicación de bacteriofagos como agente biopreservante para alargar
el tiempo de vida en productos alimenticios al matar bacterias responsables en la putrefacción
de los alimentos.
Los bacteriófagos pueden presentar dos tipos de comportamiento o ciclos. El ciclo lítico y el
ciclo lisogénico. Ambos ciclos juegan un papel en la THG en procariotas.
En la transducción son los virus bacteriofagos los que llevan un fragmento de ADN de la
bacteria donadora hasta el citoplasma de la receptora.
Transducción especializada
En este tipo de transducción solo los genes próximos al punto de inserción del bacteriófago
son transferidos, por eso solo genes específicos se mueven de esta forma.
Conjugación
Para conjugar tiene que existir contacto físico entre la bacteria donadora de ADN y la
receptora.
El episoma que hospeda al factor F puede existir como un plásmido independiente o integrarse
al genoma de la célula bacteriana. Existen diferentes nombres para los posibles estados:
Bacteria F+: posee un factor F como un plásmido independiente del genoma bacteriano. El
plásmido F únicamente contiene ADN del factor F.
Bacteria F' (F primo): están formadas por esciciones incorrectas del cromosoma, que resulta en
un plásmido F que contiene secuencias bacterianas próximas a donde el episoma F estaba
insertado.
Conjugación bacteriana
Las bacterias que lo poseen (F+) sintetizan 2 o 3 pili con los que contactan con bacterias
receptoras y se acercan a ellas. Es importante recordar que el plásmido se replica
independiente del cromosoma bacteriano.
El ADN bicatenario que compone el plásmido se separa y la transferencia inicia a la vez, que la
síntesis de la hebra complementaria.
Entonces el plásmido F se rompe por un lugar fijo (el origen de transferencia), y una de sus
cadenas pasa a través del puente citoplásmico creado por el pili, hasta el citoplasma de la
célula receptora.
Bacteria F+
En ambos citoplasmas se van sintetizando las cadenas complementarias de forma que al final
del proceso ambas bacterias poseen un plásmido F completo. Por tanto, la conjugación
convierte a la bacteria receptora (F-) a su vez en donadora (F+).
Es un replicón de doble cadena formado por 100 kbp (100,000 pares de bases). Fue elprimer
plásmido en ser descubierto. Posee dos orígenes de replicación.
El origen de replicación vegetativo (ori v). Promueve una replicación bidireccional (de ambas
cadenas) es el que favorece la replicación cuando no está ocurriendo conjugación. Un evento
de replicación vegetativos.
El origen de replicación T (ori T). Promueve la replicación unidireccional de una hebra durante
el proceso de conjugación.
Es frecuente que el vínculo entre ambas bacterias se rompa antes de que el plásmido haya
pasado completamente. Es por esto que la bacteria receptora no se transforma en un F+.