METABOLISMO DEL ARN

La expresión de la información genética requiere generalmente la síntesis de una molécula de ARN. La mayoría de
ARN desempeñan sus funciones en forma de cadena sencilla. Estas cadenas se pliegan sobre sí mismas y poseen el
potencial para una diversidad estructural mucho más amplia que la observada en el ADN.

El ARN es la única macromolécula conocida que tiene a la vez funciones en el almacenamiento y la transmisión de
la información y en la catálisis.

Durante la transcripción, un sistema enzimático convierte la información genética de un segmento de ADN en una
cadena de ARN con una secuencia de bases complementaria. Existen tres clases principales de ARN. Los ARN
mensajeros (m ARN), los ARN de transferencia (t ARN) que leen la información codificada en el m ARN y
transfieren el AA adecuado a la cadena polipeptídica en crecimiento durante la síntesis proteica. Las moléculas de
ARN ribosómico (r ARN) forman parte de los ribosomas, las complejas maquinarias celulares que sintetizan las
proteínas.

Sólo son trascritos genes o grupos de genes determinados y algunas regiones del genoma nunca son transcritas.
Secuencias reguladoras específicas indican el principio y el final de los segmentos de ADN que han de ser
transcritos y designan qué cadena del ADN se ha de utilizar como molde.

El conjunto de todas las moléculas de ARN producidas en una célula en unas condiciones determinadas se
denomina transcriptoma celular.

TRANSCRIPCIÓN
La transcripción consiste en la síntesis de ARN tomando como molde ADN y significa el paso de la información
contenida en el ADN hacia el ARN. La transferencia de la información del ADN hacia el ARN se realiza siguiendo las
reglas de complementaridad de las bases nitrogenadas y es semejante al proceso de transcripción de textos,
motivo por el que ha recibido este nombre. El ARN producto de la transcripción recibe el nombre de transcrito.

La transcripción se parece a la replicación en su mecanismo químico fundamental, la polaridad y la utilización de un

molde. Tiene fases de inicio, elongación y terminación. La transcripción difiere de la replicación en no requerir un
cebador y, generalmente, estar limitada a cortos segmentos de la molécula de ADN.

Proceso mediante el cual se copia la información contenida en la secuencia nucleotídica del ADN en una secuencia
de ARN.

TRANCRIPCIÓN vs REPLICACION

- Similitudes con la replicación:

 Polaridad
 Mecanismo químico
 Templado
 Fases de iniciación, elongación y terminación

- Diferencias con la replicación:

 No requiere cebador
 Sólo se utilizan regiones limitadas del ADN
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  Una sóla hebra sirve de templado.

El ARN es sintetizado por ARN polimerasas: La ARN polimerasa dependiente de ADN requiere, además de un
molde de ADN, los cuatro ribonucleósidos 5’-trifosfato (ATP, GTP, UTP y CTP) como precursores de las unidades
nucleotídicas del ARN, y también Mg2+. La proteína también une un Zn2+. La ARN polimerasa alarga una cadena de
ARN añadiendo ribonucleótidos al extremo 3’OH de la cadena de ARN, y sintetiza el ARN en la dirección 5’ 3’. La
reacción global es:

(NMP)n + NTP  (NMP)n+1 + PPi

ARN ARN
alargado

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Sólo se utiliza una de las dos hebras de ADN como molde. La hebra molde se copia en dirección 3’5’. Cada
nucleótido en el ARN recién formado se selecciona según las interacciones de apareamiento de bases. La geometría de
las bases también puede jugar un papel en la selección de las bases.

A diferencia de la ADN polimerasa, la ARN polimerasa no requiere un cebador para iniciar la síntesis. El inicio se
produce cuando la ARN polimerasa se une a secuencias específicas de ADN denominadas promotores. El grupo 5’-
trifosfato del primer residuo de una cadenas de nueva síntesis no es cortado para liberar PPi, sino que se mantiene
intacto durante toda la transcripción.

El híbrido de ARN-ADN se encuentra en esta región desenrollada. La estructura helicoidal del ADN obliga a una
rotación considerable de las hebras de las moléculas de ácido nucleico durante el movimiento de las burbujas de
transcripción. El movimiento de la ARN polimerasa genera ondas de vueltas superhelicoidales positivas por delante
de la burbuja de transcripción y de vueltas superhelicoidales negativas por detrás. En la célula, la acción de las
topoisomerasas alivia los problemas topológicos ocasionados por la transcripción.

La ARN polimerasa dependiente de ADN de E. Coli es una enzima compleja y de gran tamaño con cinco
subunidades núcleo (α2ββ’ω) y una sexta subunidad, perteneciente al grupo denominado σ. La subunidad σ se une
transitoriamente al núcleo de la ARN polimerasa y dirige la enzima hacia sitios específicos de unión en el ADN.
Existen varios tipos de ARN polimerasas según el tipo de subunidad σ.

Las ARN polimerasas carecen de un sitio activo con actividad exonucleasa 3’5’ correctora de pruebas
independiente y por ello la tasa de error en la transcripción es mayor que en la replicación del ADN cromosómico.
De un solo gen se producen muchas copias de ARN y todos son finalmente degradados y reemplazados. Muchas
ARN polimerasas, se detienen cuando se añade una base mal apareada durante la transcripción y pueden eliminar
nucleótidos mal apareados del extremo 3’ de un transcripto por inversión directa de la reacción de polimerización.

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 Burbuja de transcripción: las flechas rojas indican el sentido de la rotación del ADN para permitir este proceso. A
medida que el ADN se vuelve a enrollar, se desplaza el híbrido ARN-ADN y se expulsa la hebra de ARN. Un canal
de la proteína encauza nuevos nucleósidos trifosfato hacia el sitio activo de la polimerasa.

- Un sólo tipo de ARN polimerasa para todos los tipos de ARN

Holoenzima Polimerasa núcleo + subunidad σ

α2ββ’ωσ α2ββ’ω σ

La síntesis de ARN empieza en los promotores: la ARN polimerasa se une a secuencias específicas del ADN
denominadas promotores. Las secuencias de unión de las ARN polimerasas pueden ser muy variadas.

En E. coli, la ARN polimerasa se une a una región que se extiende desde unos 70pb antes del sitio de inicio de la
transcripción hasta unos 30 pb más allá. Los pares de bases del ADN que corresponden al principio de la molécula
de ARN reciben nº positivos y los que preceden al sitio de inicio del ARN nº negativos. La clase más común de
promotores bacterianos ha puesto de manifiesta similitudes en dos cortas secuencias centradas alrededor de las
posiciones -10 y -35 reconocidos por la ARN polimerasa holoenzima que contiene σ 70. Las secuencias no son
idénticas en todos los promotores bacterianos, pero los nucleótidos que se encuentran con mucha más frecuencia
que otros en cada posición forman una secuencia consenso. La secuencia consenso en el entorno a la región -10 es
(5’)TATAAT(3’); la secuencia consenso en la región -35 es (5’)TTGACA(3’). Un tercer elemento de reconocimiento
rico en AT, denominado elemento UP (promotor corriente arriba), se encuentra entre las posiciones -40 y -60 en los
promotores de algunos genes. La subunidad α de la ARN polimerasa se une al elemento UP. La eficacia de la unión
y de inicio de la transcripción en un promotor por la ARN polimerasa que contiene σ70 depende en un buena
medida de estas secuencias.

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Típicos promotores de E. coli reconocidos por la holoenzima de la ARN polimerasa que contiene σ70

Los cambios en la secuencia consenso también afectan la eficiencia de la unión de la ARN polimerasa y el inicio de
la transcripción.

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En primer lugar, la polimerasa, dirigida por su factor σ unido, se une al promotor y forma sucesivamente un
complejo cerrado (en el que el ADN unido está intacto) y un complejo abierto (en el que el ADN unido está intacto
pero parcialmente desenrollado cerca de la secuencia -10). En segundo lugar, empieza la transcripción, que va
acompañada por un cambio de conformación que transforma el complejo en la forma propia de la elongación. La
subunidad σ se disocia al azar cuando la polimerasa entra en la fase de elongación de la transcripción. La proteína
NusA se une a la ARN polimerasa implicada en la elongación en competencia con la subunidad σ. E. coli tiene otras
calses de promotores a los que se unen holoenzimas de la ARN polimerasa por medio de subunidades σ diferentes.
La utilización de diferentes subunidades σ permite a la célula coordinar la expresión de conjuntos de genes
implicados en importantes cambios de la fisiología celular.

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Inicio y elongación de la transcripción de la ARN polimerasa de E. coli.

La transcripción está regulada a diferentes niveles: la transcripción de cada gen está regulada cuidadosamente
para suministrar los productos génicos en las proporciones requeridas. La unión de la polimerasa y las etapas de
inicio de la transcripción son objeto de regulación preferente.

La unión de proteínas a secuencias próximas o lejanas del promotor puede tanto activar la transcripción al facilitar
la unión de la ARN polimerasa como reprimir la transcripción al bloquear la actividad de la polimerasa. En E. coli
una proteína que activa la transcripción es la proteína receptora dependiente de cAMP (CRP), que aumenta la
transcripción de genes que codifican las enzimas cuando las células se cultivan en ausencia de glucosa. Los
represeores son proteínas que bloquean la síntesis de ARN en genes específicos.

Elongación en E. Coli: se va formando un dúplex ADN-ARN de 12bp (aproximadamente una vuelta de hélice). El
dúplex es muy inestable y la cadena de ARN se va separando de la de ADN a medida que la ARN polimerasa avanza.

A medida que el dúplex se deshace las dos cadenas de ADN vuelven a reestablecer la doble hélice.

El ADN debe ir desenrolándose por delante de la burbuja y enrollándose por detrás. Catalizado por la
topoisomerasa II (ADN girasa).

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La terminación de la síntesis de ARN está señalizada por secuencias específicas: la síntesis de ARN es procesiva,
porque si una ARN polimerasa libera un transcrito prematuramente no puede reanudar la síntesis del mismo ARN y
debe empezar de nuevo. E. coli posee al menos dos clases de señales de terminación: una clase actúa mediante un
factor proteico denominado ρ (rho), mientras que la otra es independiente de ρ.

La clase independiente de ρ tiene dos características distintivas. La primera es una región cuyo transcrito de ARN

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tiene secuencias autocomplementarias, que permiten la formación de una estructura en horquilla centrada 15 a 20
nucleótidos antes del final proyectado de la hebra de ARN. El segundo rasgo es una serie de tres residuos de A en la
hebra molde que se transcriben a residuos de U cerca del extremo 3’ de la horquilla. La formación de la estructura
en horquilla en el ARN disocia varios pares de bases A-U en el híbrido de ARN-ADN y puede desorganizar
importantes interacciones entre el ARN y la ARN polimerasa, facilitando de este modo la disociación del transcrito.

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Modelo de la terminación de la transcripción independiente de ρ en E. coli.

Los terminadores dependientes de ρ carecen de la secuencia de residuos de A repetidos en la hebra molde, pero a
menudo contienen una secuencia rica en CA denominada elemento rut. La proteína ρ se une al ADN en sitios de
unión específicos y migra en dirección 5’3’ hasta encontrar el complejo de transcripción detenido. Una vez allí,
contribuye a facilitar la liberación del transcrito de ARN. La proteína ρ posee actividad ARN-ADN helicasa
dependiente de ATP, que promueve la translocación de la proteína a lo largo del ADN.

- El hecho determinante para que termine la transcripción es que la ARN polimerasa se detenga
 Se detiene la formación de enlaces fosfodiéster
 Se separa el híbrido de ARN-ADN
 Se re-enrolla el ADN y se libera la ARN polimerasa.

Las células eucariotas tienen tres tipos de ARN polimerasas nucleares: los eucariotas tienen tres ARN polimerasas,
I, II y III, que son complejos distintos, pero con algunas subunidades en común.

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La ARN polimerasa I es responsable de las síntesis de un solo tipo de ARN, un transcrito denominado ARN
prerribosómico (pre-rARN). La secuencia de los promotores de Pol I varía mucho de una especie a otra. La función
principal de la ARN polimerasa II es la síntesis de mARN y de algunos ARN especializados. Muchos promotores
reconocidos por la Pol II tienen algunas características comunes, entre las que se encuentra la caja TATA cerca del
par de bases -30 y una secuencia Inr (iniciador) cerca del inicio de transcripción del ARN en +1.

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La ARN polimerasa III produce ARNt, el ARNr 5S y algunos otros ARN especializados de pequeño tamaño. Algunas
de las secuencias requeridas para el inicio regulado de la transcripción por la Pol III están localizadas dentro del
propio gen, mientras que otras se encuentran en localizaciones más convencionales corriente arriba del sitio de
inicio del ARN.

La ARN polimerasa II requiere otros muchos factores proteicos para su actividad: la Pol II es una gran enzima con
12 subunidades. La subunidad mayor (RBP1) muestra un alto grado de homología con la subunidad β’ de la ARN
polimerasa bacteriana. Otra subunidad (RBP2) es estructuralmente similar a la subunidad β bacteriana y otras dos

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(RBP3 y RBP11) muestran alguna homología estructural con las dos subunidades α bacterianas.

La subunidad mayor de la Pol II también tiene una propiedad poco usual, una cola carboxilo-terminal, consistente
en una secuencia consenso de siete AA repetida múltiples veces. Este dominio carboxilo-terminal (CTD) está
separado del cuerpo principal de la enzima por una secuencia de unión no estructurada. El CTD tiene muchas e
importantes funciones en la Pol II.

La ARN polimerasa II requiere otras numerosas proteínas, denominadas factores de trascripción. Los factores de
transcripción generales (TFII), requeridos en todos los promotores de la Pol II, están muy conservados en todos los
eucariotas, para la formación de un complejo activo, distintos para cada fase. El proceso de transcripción por la Pol
II comprende varias fases –ensamblaje, inicio, elongación, terminación- cada una asociada a proteínas específicas.

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Transcripción en lo promotores de ARN polimerasa II: dentro del complejo cerrado el ADN es desenrollado en la
región lnr por la actividad hellicasa de TFIIH y tal vez TFIIE, que crean el complejo abierto. El dominio carboxilo-
terminal de la subunidad mayor de la Pol II es fosforilado por TFIIH y entonces la polimerasa abandona el
promotor y empieza la transcripción. La elongación está acompañada de la liberación de muchos factores de
transcripción y también es ponteciada por factores de elongación. Después de la terminación, la Pol II es liberada,
desfosforilada y reciclada.

 Ensamblaje de la ARN polimerasa y los factores de transcripción en un promotor: la formación de un

complejo cerrado comienza cuando la proteína de unión a TAT (TBP) se une. El factor de transcripción TFIIB
se une a su vez a la TBP y también al ADN a ambos lados de la TBP. La unión de TFIIA puede estabilizar el
complejo TFIIB-TBP con el ADN y puede ser importante en los promotores que no son de consenso. El
complejo formado por TFIIF y Pol II se une a continuación al complejo de TFIIB-TBP. TFIIF contribuye a
dirigir a la Pol III hacia sus promotores. Finalmente, se unen TFIIE y TFIIH para completar el complejo
cerrado. TFIIH tiene actividad ADN helicasa, que promueve el desenrollamiento del ADN en el sitio de inicio
del ARN, creándose así el complejo abierto.

 Inicio de la hebra de ARN y desalojo del promotor: el TFIIH tiene una función adicional durante la fase de
inicio. Una actividad quinasa de una de sus subunidades fosforila la Pol II en varios lugares del CTD. Otras
proteínas quinasas también fosforilan el CTD, principalmente en residuos Ser de la secuencia repetida del
CTD. Ello provoca un cambio conformacional en el complejo, que tiene como consecuencia el inicio de la
transcripción. El estado de fosforilación del CTD cambia a medida que progresa la transcripción. Los
cambios afectas a las interacciones entre el complejo de transcripción y otras proteínas y enzimas, de modo
que se fijan diferentes conjuntos de proteínas en el inicio que en fases posteriores.

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  Elongación, terminación y liberación: el TFIIF permanece asociado a la Pol II durante toda la elongación- la
actividad de la polimerasa está muy potenciada por proteínas denominadas factores de elongación. Los
factores de elongación suprimen las pausas durante la transcripción y también coordinan las interacciones
entre los complejos proteicos responsables de la maduración postranscripcional de los mARN. Cuando
termina la transcripción la Pol II se desfosforila y se recicla.

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 Regulación de la actividad de la ARN pol II: implica la interaccion de numerosas proteínas con el complejo
de preinicio. Algunas de estas proteínas reguladoras interaccionan con factores transcripción; otras con la
propia Pol II.

 Las diversas funciones de TFIIH: el TFIIH no sólo participa en la formación del complejo cerrado durante el
ensamblaje de un complejo de transcripción, sino que también algunas de sus subunidades son

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componentes esenciales del complejo separado de reparación por escisión de nucleótido.

MADURACIÓN DEL ARN

Gran parte de las moléculas de ARN son modificadas en mayor o menor medida después de su síntesis. Algunas de
las enzimas que catalizan estas reacciones están compuestas por ARN en lugar de proteína ribozimas.

Una molécula de ARN recién sintetizada se denomina transcrito primario.

El transcrito primario de un mARN eucariótico contiene las secuencias que corresponden a un gen. Los fragmentos
que interrumpen la región codificante del transcrito se denomina intrones y los segmentos codificantes se llaman
exones.

En un proceso denominado corte y empalme (splicing), los intrones se eliminan del transcrito primario y los exones
se unen para formar una secuencia continua que especifica un polipéptido funcional. Los mARN eucariotas también
se modifican en ambos extremos. Un residuo modificado, denominado casquete 5’, se añade al extremo 5’. El
extremo 3’ se corta y se le añaden unos 80 a 250 residuos de A para formar una cola de poliA. Los complejos
proteicos que llevan a cabo estos tres procesos están asociados unos a otros y con la CDT fosforilada de la Pol II. Un
mARN eucariota a medida que es sintetizado entra a formar parte de un complejo que consta de docenas de
proteínas. La composición del complejo cambia a medida que el transcrito es modificado, transportado al
citoplasma y entregado a los ribosomas para la traducción.

Los transcritos primarios de los tARN de los procariotas y eucariotas también se modifican por eliminación de
secuencias de cada extremo y en algunos casos por eliminación de intrones. Muchas bases y azúcares del tARN
también son modificadas.

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El destino final de todos los ARN es la degradación regulada y completa. La velocidad de recambio de los ARN es
fundamental para determinar su nivele estacionario y con qué velocidad cesa la expresión de un gen.

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Formación del transcrito primario y su modificación durante la maduración del mARN en una célula eucariota: el
casquete 5’ (rojo) se añade antes de que se complete la síntesis del transcrito primario. En naranja se muestra una
secuencia no codificante (intrón), a continuación del último exón. Todos los procesos estos tienen lugar en el
núcleo.

Los mARN eucariotas llevan un casquete en el extremo 5’: la mayoría de mARN eucariota tiene un casquete en 5’,
un residuo de 7-metilguanosina unido al residuo 5’-terminal del mARN. El casquete 5’ protege el mARN de las
ribonucleasas. El casquete también se une a un complejo proteico específico y participa en la unión del mARN al
ribosoma para iniciar la traducción.

El casquete 5’ se forma por condensación de una molécula de GTP con el trifosfato del extremo 5’ del transcrito. La
guanina es metilada posteriormente en N7 y a menudo se añaden grupos metilo adicionales en los 2’OH del primer
y segundo nucleótidos adyacentes al casquete. Los grupos metilo lo proceden de la S-adenosilmetionina. Las tres
enzimas responsables están asociadas al CTD de la ARN polimerasa II hasta que se sintetiza el casquete.

- Protege al ARNm de las ribonucleasas.

- Se une a un complejo proteico específico y participa en la unión del ARNm al ribosoma.
- Exportación al núcleo.

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Adición de la caperuza al ARNm

 La caperuza se forma durante la transcripción.

 Por condensación de GTP con el trifosfato del ARN.
 Luego se metila la guanina.

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Intrones y exones son transcritos del ADN al ARN: la gran mayoría de los genes de los vertebrados contienen
intrones. La presencia de intrones en eucariotas es variable. Los intrones también se encuentran en unos pocos
genes de bacterias y arqueobacterias. Los intrones del ADN son transcritos juntos con el resto del gen por las ARN
polimerasas. Los intrones del transcrito primario de ARN son cortados y los exones empalmados para formar un
ARN maduro y funcional. Los genes de los eucariotas superiores, incluidos los humanos, tienen generalmente
mucho más ADN en los intrones que en los exones.

El ARN cataliza el corte y empalme de los intrones: hay cuatro clases de intrones. Las dos primeras, denominadas
intrones del grupo I y II, difieren en los detalles de sus mecanismos de corte y empalme, pero comparten una
característica sorprendente: son autocatalíticas. Los intrones del grupo I se encuentran en algunos genes nucleares,
mitocondriales y de cloroplastos que codifican rARN, mARN y tARN. Los intrones del grupo II se encuentran
generalmente en los transcritos primarios de los mARN de mitocondrias y cloroplastos, en hongos, algas y plantas.
En ambos grupos, los mecanismos de corte y empalme incluyen dos reacciones de transesterificación, en las que un
trupo 2’- o 3’-hidroxilo de una ribosa realiza un ataque nucleofílico sobre un fósforo, formándose en cada paso un
nuevo enlace fosfodiéster a expensas del anterior.

La reacción de corte y empalme del grupo I requiere un nucleósido de guanina o un cofactor nucleotídico, el grupo
3’-hidroxilo de la guanosina se utiliza como nucleófilo en el primer paso de la ruta de corte y empalme. Formando
un enlace 3’,5’-fosfodiéster normal con el extremo 5’ del intrón. El 3’-hidroxilo del exón desplazado en este paso
actúa seguidamente como nucleófilo en una reacción similar en el extremo 3’ del intrón.

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 Mecanismo de corte y empalme de los intrones del grupo I: el nucleófilo del primer paso puede guanosina, GMP,
GDP o GTP. El intrón escindido es finalmente degradado.

En los intrones del grupo II el patrón de reacción es similar excepto para el nucleófilo del primer paso, que en este
caso es el grupo 2’OH de un residuo de A situado dentro del intrón.

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 Mecanismo de corte y empalme de los intrones del grupo II.

La mayoría de los intrones no experimentan autocorte y empalme y no se designan por un nº de grupo. La tercera y
más numerosa clase de intrones se encuentra en los transcritos primarios del mARN nuclear. Se denominan
intrones de espliceosoma, porque su eliminación ocurre en el interior y por acción de un gran complejo proteico
denominado espliceosoma. En el espliceosoma, el corte y empalme tiene el mismo mecanismo de formación de
lazo de los intrones del grupo II. El espliceosoma está formado por complejos ARN-proteína especializados,
denominados pequeñas ribonucleoproteínas nucleares (snRNP). Cada snRNP contiene un ARN de 100 a 200
nucleótidos de un tipo denominado ARN nuclear pequeño (snARN). En los nucleótidos eucariotas se encuentran
cinco snARN (U1, U2, U4, U5 y U6)

Los intrones de espliceosoma tienen generalmente los dinucleótidos GU y AG en los extremos 5’ y 3’ que marcan el
sitio de corte y empalme. Las snRNP contribuyen al espliceosoma con 5 ARN y unas 50 proteínas, formando un
agregado supramolecular casi tan complejo como el ribosoma. Para el ensamblaje del complejo de corte y
empalme se requiere ATP, pero no parece que las reacciones de corte y empalme lo necesiten. Algunos intrones de
mARN son cortados y empalmados por un tipo menos común del complejo de corte y empalme, en el que las
snRNP con U1 y 2 son reemplazadas por snRNP que contienen U11 y U12. Mientras que los espliceosomas que
contienen U1 y U2 eliminar los intrones con secuencias terminales (5’)GU y AG(3’), los espliceosomas con U11 y
U12 eliminan una clase rara de intrones que tienen secuencias terminales (5’)AU y AC(3’) para marcar los sitios de
corte y empalme del intrón.

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Algunos componentes de la maquinaria de corte y empalme se encuentran unidos a la CTD de la ARN polimerasa II.

La cuarta clase de intrones, que se encuentra en ciertos tARN, se distingue de los intrones de los grupos I y II en que
el corte y empalme requiere ATP y una endonucleasa. La endonucleasa de corte y empalme corta los enlaces
fosfodiéster en ambos extremos del intrón y los dos exones se unen por un mecanismo similar al de la reacción de
la ADN ligasa.

Aunque los intrones de espliceosoma están aparentemente limitados a las eucariotas, las otras clases de intrones
no lo están.

Los ARNm eucariotas tienen una estructura característica en el extremo 3’: la mayor parte del mARN eucariota
tiene una serie de 80 a 250 residuos de A en el extremo 3’ que forman la cola de poli(A). Esta cola sirve de lugar de
unión para una o más proteínas específicas. También ayuda a proteger el mARN de la destrucción enzimática.

La cola de poli A es añadida en un proceso que consta de múltiples etapas. El transcrito se extiende más allá del
sitio donde debe añadirse la cola de poli(A) y a continuación es cortado en el sitio de adición del poli(A). El sitio del
mARN en donde se produce el corte y la adición de poli(A) está indicado por dos secuencias: la secuencia
(5’)AAUAAA(3’) y una secuencia peor definida, rica en residuos G y U. El corte genera el grupo 3’OH libre que
caracteriza el extremo final del mARN, al que se añaden inmediatamente los residuos de A por la poliadenilato
polimerasa, que cataliza la siguiente reacción:

ARN + nATP  ARN-(AMP)n + n PPi

Donde n = 80 a 250.

Adición de la cola de poli(A) al transcrito primario de ARN de las eucariotas.

La modificación diferencial del ARN puede dar lugar a múltiples productos a partir de un gen: algunos
transcritos de mARN eucariota producen un único mARN maduro y un único polipéptido; en cambio, otros
pueden ser modificados de más de una manera para producir diferentes mARN, y por lo tanto, diferentes

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 polipéptidos. La ruta favorecida en una célula determinada depende de los factores de modificación, proteínas
de unión al ARN que promueven una ruta determinada.

Los ARN ribosómicos y los tARN también son modificados: los ARN ribosómicos se forman a partir de
precursores más largos, denominados ARN prerribosómicos, o pre-rARN. Los ARN de transferencia igualmente
proceden de precursor más largos. Estos ARN también pueden contener diversos nucleósidos modificados.

Algunas de las bases modificadas de los rARN y tARN, producidas en reacciones postranscripción.

- ARN ribosómicos: en las bacterias, los rARN, 16S, 23S y 5S proceden de un único precursor 30S de unos 6500
nucleótidos. Durante la maduración se elimina ARN en ambos extremos del precursor 30S y segmentos entre
los rARN. Los rARN 16S y 23S contienen nucleósidos modificados. En E. coli, el rARN 16S contiene 11
modificaciones, una pseudouridina y diez nucleósidos metilado en la base o en el grupo 2’-OH o en ambos. En
las bacterias, cada modificación está generalmente catalizada por una enzima distinta. Las reacciones de
metilación utilizan S-adenosilmetionina como cofactor.

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 Maduración de transcritos de prARN en las bacterias

El genoma de E. coli codifica siete moléculas de pre-rARN. Todos estos genes tienen las regiones codificantes de
ARN esencialmente idénticas, pero difieren en los segmentos entre los genes. El segmento entre los genes de
rARN 16S y 23s generalmente codifica uno o dos tARN, originándose diferentes tARN de los diferentes
transcritos de pre-rARN. También se encuentran secuencias codificantes de tARN en el lado 3’ del rARN en
algunos transcritos precursores.

En eucariotas un transcrito de pre-rARN de 45S es sintetizado por la ARN polimerasa I y modificado en el

nucléolo para dar los rARN 18S, 28S y 5,8S característicos de los ribosomas eucarióticos. Algunos pre-rARN
también contienen intrones que se han de cortar y empalmar. El proceso comienza en el nucléolo, en grandes
complejos que se forman sobre el precursor de rARN a medida que es sintetizado por la Pol I. Cada complejo
contiene las ribonucleasas que cortan el precursor de rARN, las enzimas que modifican determinadas bases,
numerosos ARN nucleolares pequeños, o snoARN, que guían las modificaciones de los nucleósidos, y algunas
reacciones de corte y proteínas ribosómicas. La composición de los complejos puede variar a medida que los
ribosomas son ensamblados. Las modificaciones más comunes de los nucleósidos en los rARN eucariota son de
nuevo la conversión de la uridina en pseudouridina y la metilación de los nucleósidos dependiente de adoMet.
Estas reacciones son realizadas por complejos de proteínas y snoARN, o snoRNP, formados por un snoARN y
cuatro o cinco proteínas. Hay dos clases de snoARN. La caja H/ACA de las snoRNP está implicada en la
pseudouridilación, y la cada C/D de las snoRNP en las 2’-O-metilaciones.

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- ARN de transferencia: la mayoría de las células tienen entre 40 y 50 tARN diferentes y en las células eucariotas
hay múltiples copias de muchos de los genes de tARN. Los ARN de transferencia proceden de precursores más
largos por eliminación enzimática de nucleótidos de los extremos 5’ y 3’. Cuando dos o más tARN diferentes se
encuentran en el mismo trascrito primario, son separados por corte enzimático. La endonucleasa RNasa P,
elimina ARN del extremo 5’ de los tARN. La RNasa P es otro ejemplo de ARN catalítico. El extremo 3’ de los
tARN es modificado por una o más nucleasas.

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Maduración de los tARN en bacterias y eucariotas: remoción 5’, 3’ y a veces intrones. Modificación de bases
y
azúcares.

Los precursores del ARN de transferencias pueden ser sometidos a una ulterior modificación postranscripción.
El trinucleótido 3’-terminal CCA (3’), al que se unirá un AA durante la síntesis, no se encuentra en algunos
precursores de tARN bacterianos y en todos los eucariotas y es añadido durante la maduración. La adición corre
a cargo de la tARN nucleotidiltransferasa, enzima que une los tres ribunucleósidos trifosfato precursores en
sitios activos separados y cataliza la formación de los enlaces fosfodiéster para producir la secuencia CCA (3’).
La creación de esta secuencia definida de nucleótido es, por tanto, independiente de la presencia de un molde
de ADN o de ARN.

La etapa final de la maduración del tARN consiste en la modificación de algunas bases por metilación,
desaminación o reducción.

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