Transcripción y Biosintesis Del Arn

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TRANSCRIPCIÓN

EXPRESIÓN INFORMACIÓN GENÉTICA

La expresión de la información consta de 2 procesos:

• Transcripción: Síntesis de ARN a partir del ADN molde


• Traducción: Síntesis de proteínas a partir de un patrón de ARNm

GENOMA: Conjunto completo de la información genética de


un organismo.

TRANSCRIPTOMA: Conjunto completo de ARNs presentes en


una célula, tejido u organismo.

PROTEOMA: Conjunto completo de proteínas presentes en


una célula, tejido u órgano.

BIOSINTESIS DE ARN
(CELULAS PROCARIOTAS)
CONVENCIONES

La transcripción consiste en la síntesis de una molécula de ARN cuya secuencia de bases


será complementaria a la de una hebra de ADN.

La hebra del ADN que se transcribe se llama hebra (-), hebra molde o hebra sin sentido
mientras que la hebra que no se transcribe se llama hebra (+), hebra codificante o hebra con
sentido.

El producto inmediato de la transcripción se llama transcrito primario.

Se define como punto de inicio de la transcripción al par de bases del ADN que es
complementario al primer nucleótido incorporado al ARN. Se le designa como posición +1.

Las secuencias anteriores al punto de inicio se dice que están corriente arriba (upstream),
y las que están corriente abajo (downstream).

Las secuencias de nucleótidos se escriben


en dirección 5´→ 3´.
ARN POLIMERASA CATALIZA LA BIOSINTESIS DE ARN

Un esquema de la reacción general seria:

Los requerimientos de la ARN polimerasa son:

• Una cadena “molde” de ADN de la que toma instrucciones


• Mg2+ (o Mn2+) y cuatro NTP (ATP, CTP, UTP, GTP)
• Cataliza la elongación de la cadena en dirección 5´→ 3´
• La RNA polimerasa no necesita un extremo 3´-OH “cebador” para iniciar la síntesis
ni revisa el producto final después de cada ciclo catalítico (no tiene actividad
exonucleasa)

LA ARN POLIMERASA DE E. COLI

• La holoenzima esta formada por 5 cadenas


polipeptídicas α, β, β´, σ, ω.
• El complejo α2, β, β´, ω constituye el núcleo de la
enzima.
• Dos subunidades α actúan como centros de
asociación del complejo y unión a proteínas
reguladoras.
• La subunidad β une NTPs y es la principal subunidad catalítica.
• La subunidad β´ es la responsable de la unión al ADN.
• La subunidad σ dirige la enzima al promotor para iniciar la síntesis. Existe una
familia de proteínas σ.
• La subunidad ω parece que tiene una función estabilizadora.

LA QUÍMICA DE LA TRANSCRIPCIÓN

Es similar a la química de la replicación. El ataque nucleofílico de un hidroxilo libre en


3´sobre el átomo de fosforo mas interno de un NTP, promueve la formación del enlace
fosfodiéster con la salida de pirofosfato.
LA SÍNTESIS DE ARN EMPIEZA EN “EL PROMOTOR”

Para iniciar la transcripción , la ARN polimerasa se une a secuencias especificas de ADN


llamadas promotores, que tienen algunos elementos comunes:

• En E. coli, el promotor abarcar desde -70 a +30 aprox.


• Una secuencia (TATAAT) muy conservada, que se centra en -10.
• Una secuencia (TTGACA) centrada en -35.
• Una región espaciadora de 16-18 nt entre las dos anteriores.

REQUERIMENTOS PARA LA TRANSCRIPCIÓN

Unidad de transcripción de ADN con promotor y terminador

• PROMOTOR: Secuencia especifica de tamaño variable


o En ella se encuentran dos consensos a ~ -35 y -10 pb con respecto al sitio
de inicio.

ARN polimerasa

• Complejos de cinco tipos de polipéptidos: α, β,


β´, σ, ω
o Factor σ reconoce el sitio de inicio
permite la unión a la cadena molde.
o α2, β, β´ y ω forman el núcleo de la
enzima que cataliza la biosíntesis de
RNA.
o No tiene actividad nucleasa (no puede
corregir errores)

Nucleótidos activados y Mg2+

• CTP, GTP, ATP, UTP


MECANISMO DE TRANSCRIPCIÓN: INICIACIÓN

1. LA HOLOENZIMA α2, β, β´, σ Y ω RECONOCE AL PROMOTOR DE UNA


UNIDAD DE TRANSCRIPCION Y SE UNE

El reconocimiento se debe al factor σ. Existen distintos factores σ para distintos


tipos de promotores.

2. APERTURA DE PROMOTOR

Desenrollamiento y separación de las


cadenas de ADN en la zona de inicio.

3. UNIÓN DEL PRIMER NUCLEÓTIDO TRIOFOSFATO A LA RNA POLIMERASA

Suele ser ATP o GTP. Se une por apareamiento de bases a la hebra molde de
DNA.

PROCESO DE TRANSCRIPCIÓN: ELONGACIÓN

4. UNIÓN SUCESIVA DE LOS SIGUIENTES NUCLEÓTIDOS

Cada uno se une al 3´-OH libre del anterior


por enlace fosfodiéster. Se van seleccionando
por apareamiento especifico con la hebra de
ADN molde. Se forma una hélice dúplex híbrida
DNA/RNA de ~ 8 pb.

La región que contiene la RNA polimerasa y la hélice híbrida se llama burbuja de


transcripción.
5. AVANCE DE LA BURBUJA

El factor σ se libera y α2, β, β´ y ω continua


hasta la terminación. La hélice de ADN se va
desenrollando por delante y enrollando por
detrás.

Liberación de subunidad σ y elongación.

PROCESO DE TRANSCRIPCIÓN: TERMINACIÓN

6. LLEGADA A LA SEÑAL DE TERMINACIÓN EN LA HEBRA MOLDE

Región autocomplementaria rica en GC, seguida de zona rica de AT:

▪ Se forma una estructura en


horquilla en el RNA transcrito.
▪ La polimerasa se detiene y el
hibrido ADN/ARN se vuelve
inestable.
▪ La transcripción finaliza en los
residuos de U que siguen a la
horquilla.

Terminación dependiente del factor ρ (en algunos casos)

▪ Actividad ADN/ARN helicasa, dependiente de ATP, que disocia el


complejo de transcripción.

7. DISOCIACIÓN

Disociación del hibrido ADN/ARN

Fusión y enrollamiento del ADN abierto

Desprendimiento de la ARN polimerasa


RESUMEN PROCESO TRANSCRIPCIÓN

TRANSCRIPCIÓN
(Células eucariotas)
TRANSCRIPCION EN EUCARIOTAS

Tiene lugar en el núcleo (cromatina)

Existen 3 tipos de ARN polimerasas (cada una reconoce un tipo de promotor)

• ARN Polimerasa I: Sintetiza precursores de los ARNr


• ARN Polimerasa II: Sintetizar precursores del ARNm
• ARN Polimerasa III: Sintetizar precursores de los ARNt

Promotores complejos y secuencias potenciadoras

• Caja TATA entre -30 y -100


• Otras secuencias (caja CAAT, caja GC)

Son necesarios los “factores de transcripción”

• Se une a los promotores y secuencias potenciadoras


• Guían la unión de la polimerasa

COMPLEJO DE TRANSCRIPCIÓN

1. Antes de que la ARN polimerasa se una a un promotor eucariótico es necesario que un


conjunto de proteínas, llamadas factores de transcripción basales, se ensamblen en el
promotor. Este proceso empieza con la unión de los factores basales a la caja TATA. El
complejo de factores basales recluta a la ARN polimerasa formando un complejo activo
capaz de iniciar la transcripción.

2. Para regular la velocidad de transcripción son necesarios dos tipos de proteínas


auxiliares: las activadoras y las coactivadoras. Las activadoras son proteínas reguladoras
que se unen a secuencias intensificadoras y aumentan la velocidad de transcripción. Las
coactivadoras son proteínas que conectan a las activadoras con el complejo de factores
basales permitiendo la regulación de la velocidad de transcripción. Múltiples secuencias
intensificadoras unen diversos activadores y proporciones respuestas variables a señales
distintas.

3. Cuando una proteína “represora” se une a una secuencia “silenciadora” que está
próxima a una secuencia intensificadora, entonces se impide la unión de la proteína
activadora correspondiente, lo que se refleja en una reducción de la velocidad de
transcripción.

INICIACIÓN

La ARN Polimerasa II, por si misma, es incapaz de


reconocer las secuencias promotoras e iniciar la
transcripción. Para hacerlo necesita unirse a los factores de
transcripción generales.

TFIID (TBP) es esencial para la formación del complejo


abierto.

La helicasa TFIIH lo transforma en complejo abierto.

Por último, la fosforilación del dominio CTD terminal de


la ARN Polimerasa II, permite el inicio de la síntesis y la
entrada en la fase de elongación.

ELONGACIÓN

Se va formando un dúplex hibrido ADN-ARN de 8-12 pb.


El dúplex es muy inestable por lo que la cadena de ARN se
va separando de la de ADN a medida que progresa la
polimerización.
El desarrollo de la doble hélice de ADN procede a la
polimerasa, mientras que tras la burbuja de
transcripción la doble hélice se restablece.

TERMINACIÓN

La ARN Polimerasa II progresa a lo largo del molde


sintetizando la nueva hebra de ARN hasta que encuentra un
obstáculo que a detenerse. La parada de la enzima es un
hecho determinante, que desencadena la terminación de la
transcripción.

La detención de la ARN polimerasa es provocada por la


formación de una estructura de horquilla en el ARN recién
sintetizado. Esta horquilla es propiciada por la presencia de
una secuencia palindrómica, autocomplementaria en la
cadena de ADN molde.

MODIFICACIONES POST-
TRANSCRIPCION: Maduración
(Eucariotas)
MADURACIÓN DE ARNt EN EUCARIOTAS

1. Corte en extremo 5´ por RNasa P (ribonucleoproteina con ARN catalitico)


2. Corte en extremo 3´ por exonucleasa RNasa D
3. Adición enzimática de la secuencia CCA para completar el extremo 3´
4. Simultáneamente está
teniendo lugar la modificación
de bases (ribotimidina,
pseudouridina, dihidrouridina,
Inosina, metilguanosina, etc.)
5. Eliminación de la secuencia
intercalada por reacciones de
corte y empalme.
Durante la transcripción el transcrito primario 45S se
incorpora a un complejo prerribosómico 90S en el que se
acoplan la maduración del ARN y el ensamblaje de otros
componentes del ribosoma.

El precursor 45S se metila y algunas bases son modificadas.

Los primeros cortes enzimáticos generan los pre-ARNs 18S


por un lado y 28S y 5´8S por otro lado. La incorporación gradual
de proteínas ribosómicas va dando forma a los complejos 40S y
60S.

Cortes nucleolíticos adicionales y el procedimiento


exonucleásico y la exportación al citoplasma conducen a las
formas de ARNs maduros.

El ARN 5S se procesa de forma independiente y se incorpora


al precomplejo 60S en el nucleolo.

PROCEDIMIENTO DEL ARNm EN EUCARIOTAS

En los pre-ARNm se modifican los extremos 5´ y 3´:

▪ En el extremo 5´ se añade 7-metilguanosina


y se metilan algunas ribosas (capucha 5´)
▪ En el extremo 3´ se añade una cola de poli(A)
de ≈ 250 residuos

Maduración de la secuencia codificante:

▪ Eliminación de intrones por corte y empalme


o Llevada a cabo por partículas
ribonucleoproteínas nucleares
pequeñas (snRNPs). Contienen ARN
catalítico (ribozimas)
o El conjunto ARNm + snRNPs se llama
ESPLICEOSOMA.
▪ Algunos ARNs son capaces de
automadurarse (ARN autocatalíticos)
LA CAPUCHA (Cap) EN 5´

ADICION DE LA COLA DE POLIADENILATO EN 3´

Los ARNm eucarióticos tienen una serie de unos 80 – 250


residuos de adenilato en el extremo 3´que forman la cola de
poli(A).

Esta cola es el lugar de unión de varias proteínas


específicas, por lo que se piensa que la función de la cola de
poli(A) es proteger al ARN de la degradación enzimática.

La cola de poli(A) es añadida en un proceso que consta de


varias etapas enzimáticas y requiere el conocimiento de
varias secuencias específicas que se encuentran en el ARN
transcrito primario.

Una actividad poli(A) polimerasa, que no requiere molde,


pero si un extremo 3´OH cebador es la responsable de la
reacción:

INTRONES DE ESPLICEOSOMA

Los ARNm transcritos primarios eucarióticos llevan intercalados entre las secuencias
informativas (exones), unos segmentos no informativos llamados intrones, que se eliminan
durante el proceso de maduración.

Los intrones de los ARNm comparten una serie de rasgos comunes que sirven para
identificarlos.

Los intrones se eliminan mediante un


proceso complejo que requiere la
actividad de un complejo especializado de ribonucleoproteínas llamado ESPLICEOSOMA (o
AYUSTOSOMA).

Reacciones de corte y empalme

La exactitud y precisión del Espliceosoma

PROCESAMIENTO DEL ARNm DE LA OVALBÚMINA

La maduración del ARNm de la ovalbúmina


requiere la eliminación de siete intrones y el
correcto empalme de otros siete exones por la
maquinaria del espliceosoma. Parte de esta
maquinaria está asociada a la ARN Polimerasa II,
por lo que parece probable que algunas etapas
de maduración del ARNm eucariotas ocurran mientras el ARNm está siendo
transcrito.
EL PROCEDIMIENTO DIFERENCIAL DEL ARNm DA LUGAR A MÚLTIPLES PRODUCTOS
GÉNETICOS

MADURACIÓN ALTERNATIVA DEL TRANSITO PRIMARIO DEL GEN DE LA


CALCITONINA

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