Informa Fosfatasa
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Abstract
The principal objective in this practice is to analyze the behavior of the enzyme, acid
phosphatase, by varying different conditions and factors such as optimal time, optimal pH,
optimal temperature, concentration of substrate and enzyme, taking into account enzymatic
kinetics and different models. Also the behavior is analysed in presence of a mixed inhibitor
justifying the results obtained by means of linear models and the values of Km and Vmax.
Introducción
Las reacciones metabólicas son necesarias para que los seres vivos cumplan sus funciones
biológicas, son aquellas que ocurren en condiciones muy particulares y cuando se presenta
una ausencia de un catalizador no se generan productos a la velocidad requerida. Las
proteínas han evolucionado como catalizadores biológicos conociéndose con el nombre de
enzimas las cuales son encargadas de aumentar la velocidad de las reacciones químicas en los
seres vivos mediante la disminución de la energía de activación de los reactantes. (Joyce,
1960 )
La cinética enzimática estudia la velocidad de las reacciones catalizadas por enzimas las
cuales son moléculas proteicas que tienen la capacidad de catalizar reacciones químicas, por
su naturaleza proteica son inestables y se desnaturalizan. La actividad de la enzima se afecta
por factores como la concentración de sustrato, cofactores, coenzimas, enzimas, la
temperatura, la presencia de inhibidores, el pH del medio, donde su medida se debe realizar
en condiciones óptimas de dichos factores. Estos estudios proporcionan información de la
especificidad de la enzima y del mecanismo de la reacción catalítica (Cinética Enzimática,
2010).
(2)
(3)
(4)
También se pueden estimar siguiendo el modelo de Eadie y Hofstee mediante la gráfica de
velocidad de reacción Vs coeficiente entre dicha velocidad y la [S] se obtiene una recta cuya
intersección con el eje y es directamente el valor de Vmáx y cuya pendiente es -Km.
(Barman, 1985)
(5)
Para esta práctica de laboratorio es necesario analizar acertadamente la velocidad de reacción
de la fosfatasa ácida extraída de la muestra bajo diferentes condiciones mediante el cálculo de
los parámetros cinéticos como la constante de Michaelis-Menten y la velocidad máxima a
partir de los datos con y sin inhibición. Asimismo, es necesario justificar de manera correcta
los factores experimentales que afectan directamente las características cinéticas de la enzima
para finalmente interpretar los resultados obtenidos con los conceptos de cinética enzimática
y compararlos con los resultados esperados y con los reales mediante la literatura.
Metodología
Se realizaron las soluciones descritas en la tabla 1 (ver anexos 1). Se agitaron bien los
tubos y se dejaron en reposo y se dejaron en reposo por 3 minutos, se adicionaron 0,5
ml de la solución de ácido ascórbico a cada tubo. Posteriormente se agitaron los tubos
y se dejaron en reposo por 10 minutos. Al desarrollarse el color se determinó la
absorbancia a 660 nm.
En todos los casos se preparó la mezcla de reacción como se indica en la tabla 2 (ver
anexos 2). Se agitó bien y se dejó reposar por 3 minutos, después se adicionan 0,5 ml
de ácido ascórbico. Se agitó nuevamente y se dejó en reposo por 10 minutos para leer
la absorbancia a 660 nm. Estos valores se emplearon para la elaboración de la curva
de calibración.
Se prepararon las reacciones de la tabla 3 (ver anexos 3). Se agitó bien y se incubó a
temperatura ambiente, sin embargo el blanco de buffer (BB) y el blanco de sustrato
(BS) se dejaron reaccionar por 30 minutos. En este tiempo se tomaron muestras de 1
ml de blanco enzima (BE) y del tiempo de reacción (TR) a diferentes tiempos, (2, 5,
10, 15, 20, 30 minutos) y estas se recibieron en tubos que contenían 1 ml de ácido
tricloroacético al 10%, se agitó y se centrifugó a 4000 rpm durante 3 min. Pasado el
tiempo (30 min de incubación) se tomaron alícuotas de 1 ml y se llevaron ácido
tricloroacético al 10% incluyendo las de BB y BS. Se determinó la cantidad de
fosfato producido en el sobrenadante ajustando el 100% de T con el tubo BB,
siguiendo el procedimiento A1.
Se realizaron las reacciones descritas en la tabla 4 (ver anexos 4) con los reactivos
específicos para esta prueba (ver anexos 4). Se mezcló de manera correcta y se agregó
enseguida la enzima a intervalos de 30 segundos, completando lo indicado en la tabla
4 (En la fila de enzima). De nuevo, se mezcló el contenido de cada tubo y se dejó
incubar por 10 minutos, al pasar este tiempo se le agregó a cada tubo 2 ml de ATA
10%, se mezcló y se centrifugó 4000 rpm durante 3 minutos. El precipitado se
descartó y en el sobrenadante se aplicó el procedimiento A1.
Se realizaron las reacciones descritas en la tabla 6 (ver anexos 6) con los reactivos
específicos para esta prueba (ver anexos 6), las temperaturas utilizadas para la prueba
se especifican en la tabla 5 (ver anexos 5). Se mezcló de manera correcta y se agregó
enseguida la enzima a intervalos de 30 segundos, completando lo indicado en la tabla
6 (En la fila de enzima). De manera seguida, se mezcló el contenido de cada tubo y se
dejó incubar por 10 minutos, al pasar este tiempo se le agregó a cada tubo 2 ml de
ATA 10%, se mezcló y se centrifugó 4000 rpm durante 3 minutos. El precipitado se
descartó y en el sobrenadante se aplicó el procedimiento A1.
Se realizaron las reacciones descritas en la tabla 7 (ver anexos 7) con los reactivos
específicos para esta prueba (ver anexos 7). Se mezcló de manera correcta y se agregó
enseguida la enzima a intervalos de 30 segundos, completando lo indicado en la tabla
7 (En la fila de enzima). De nuevo, se mezcló el contenido de cada tubo y se dejó
incubar por 10 minutos, al pasar este tiempo se le agregó a cada tubo 2 ml de ATA
10%, se mezcló y se centrifugó 4000 rpm durante 3 minutos. El precipitado se
descartó y en el sobrenadante se aplicó el procedimiento A1.
Efecto de la concentración de sustrato, determinación de la constante de
Michaelis (Km)
Se realizaron las reacciones descritas en la tabla 8 (ver anexos 8) con los reactivos
específicos para esta prueba (ver anexos 8). Se mezcló de manera correcta y se agregó
enseguida la enzima a intervalos de 30 segundos, completando lo indicado en la tabla
8 (En la fila de enzima). De nuevo, se mezcló el contenido de cada tubo y se dejó
incubar por 10 minutos, al pasar este tiempo se le agregó a cada tubo 2 ml de ATA
10%, se mezcló y se centrifugó 4000 rpm durante 3 minutos. El precipitado se
descartó y en el sobrenadante se aplicó el procedimiento A1.
Se realizaron las reacciones descritas en la tabla 9 (ver anexos 9) con los reactivos
específicos para esta prueba (ver anexos 9). Se mezcló de manera correcta y se agregó
enseguida la enzima a intervalos de 30 segundos, completando lo indicado en la tabla
9 (En la fila de enzima). De nuevo, se mezcló el contenido de cada tubo y se dejó
incubar por 10 minutos, al pasar este tiempo se le agregó a cada tubo 2 ml de ATA
10%, se mezcló y se centrifugó 4000 rpm durante 3 minutos. El precipitado se
descartó y en el sobrenadante se aplicó el procedimiento A1.
Resultados y cálculos
Análisis
La cinética enzimática es aquella que estudia la velocidad de las reacciones que son
catalizadas por enzimas ( Dua , 2019), sin embargo el comportamiento de estas se ve afectado
por diversos factores, tales como la temperatura, el pH, la presencia de inhibidores, la
concentración de sustrato, entre otras. (Rodriguez, 2020). En primer lugar es necesario aclarar
los datos expuestos en la tabla 1, de los cuales se realizó la curva de calibración que se
observa en la figura 1, donde se representaron los valores de concentración y absorbancia,
tomando la en la ordenada la absorbancia, mientras que en la abscisa la concentración molar.
La gráfica nos permitió determinar una ecuación de la recta, donde “Y” es la absorbancia,
“X” la concentración, es de esta manera como fue posible hallar en las diferentes pruebas la
concentración de las muestras. A su vez es posible asegurar que la curva contó desde un
principio con un valor de coeficiente de determinación aceptable, por lo cual no fue necesario
la eliminación de datos.
Por otro lado, es conocido que el pH del medio afecta directamente la actividad de la
enzima, ya que la gran mayoría de la enzimas son muy sensibles a cambios en este factor, ya
que un pequeño alejamiento, ya sea por encima o por debajo del pH óptimo generan un gran
impacto sobre la enzima (Urquijo,2020) ya que cambia la forma del ciclo activo, generando
que la enzima no pueda catalizar de manera correcta la reacción puesto que no se puede unir
al sustrato. Adicionalmente, los efectos el efecto del pH son de gran relevancia también por
ser capaz de desnaturar la enzima, es decir que la enzima pierde sus estructuras cuaternaria,
terciaria y secundaria al alterar el carácter iónico de los grupos amino y carboxilo de la
superficie proteica (Rodriguez,2019). Como se puede observar en la figura 3, el pH óptimo
de la enzima se encuentra entre 5 y 5,2 puesto que en estos dos puntos es posible observar la
mayor velocidad de reacción (0,018 mg/ ml min) , sin embargo se observa que a mayor pH
hay una decadencia de velocidad así como a pH bajos donde la velocidad contaba con valores
muy pequeños, sin embargo cabe resaltar que se trata de la enzima fosfatasa ácida por lo que
se espera que su pH óptimo se encuentre en un rango ácido. De manera adicional se observa
en la tabla ciertos valores negativos, la explicación matemática se basa en que al restarle a la
concentración antes de añadir ATA de las muestras, la concentración antes de añadir ATA
del BE (Blanco enzima) y BS (Blanco sustrato). Se presentan mayores valores de
concentración de BE y BS, por lo tanto, al generar la resta se presentan valores negativos, lo
cual siguiendo con la desnaturalización tiene bastante sentido ya que a valores tan alejados
del pH óptimo la actividad se debe observar bastante afectada, llegando al punto de observar
una velocidad negativa. Al comparar con la literatura, es posible hallar que el valor del pH
óptimo para la fosfatasa alcalina se encuentra entre 5 y 5,5 (Hernandez, 2001), es asi como el
valor obtenido es acertado ya que se encuentra dentro del rango, apoyando el comportamiento
expresado en la figura 3.
La temperatura es otro factor que afecta el poder catalítico, es decir, la actividad de la
enzima. En la mayoría de los casos la velocidad aumenta a medida que aumenta la
temperatura. Sin embargo, a temperaturas muy altas la enzima tiende a desnaturalizarse
donde, como se ha mencionado antes, la enzima pierde su forma y de esta manera deja de
trabajar perdiendo su actividad catalítica (Khan Academy, n.d.). Como se puede observar en
la figura 4, la temperatura óptima se encuentra a 37 ºC con una velocidad de 0,08435
mg/mLmin que es el punto más alto de la gráfica, en dicha temperatura se encuentra la
actividad catalítica máxima. La temperatura óptima varía mucho de acuerdo a la enzima que
se esté estudiando (Martínez Guerra, n.d). En la tabla 4 se puede observar un valor negativo
de velocidad a una temperatura de 0ºC, a nivel matemático esto se presentó por las mismas
razones explicadas anteriormente en el análisis de pH, ya que se realizó casi el mismo
procedimiento para el cálculo de la velocidad. Al comparar con la literatura, se encuentra que
dependiendo de las condiciones del medio la temperatura óptima varía entre 45-62 ºC (Guija,
2007), los valores teóricos y experimentales se acercan pero no están dentro del mismo rango,
esto se pudo haber presentado por diversos factores como el tiempo de reacción y los valores
de absorbancia tomados.
Los inhibidores son aquellas moléculas o iones que afectan la actividad o la afinidad
de una enzima, se encuentran de manera natural en las células para controlar la velocidad de
una reacción metabólica. La interacción entre un inhibidor y una enzima varía de acuerdo a la
naturaleza química del inhibidor y a la reacción que la enzima cataliza (Bennet,1973). En
cuanto al comportamiento de la enzima en presencia de inhibidor se puede ver en la figura 6
y la figura 7, cómo varía la velocidad de reacción sin inhibidor y con inhibidor. Al estar
presente el inhibidor la velocidad de cada muestra disminuye tal como se esperaba según el
fundamento teórico. En la muestra 1 sin inhibidor se presenta una velocidad de 0,0794
mg/mLmin y con inhibidor se obtiene una velocidad de 0,0433 mg/mLmin.
Conclusiones
En cuanto al pH óptimo, se tomaron los valores que se encontraban a una velocidad de 0,018
mg/ ml min, encontrándose el pH entre 5 y 5,3. Al comparar con la literatura se encontró que
el pH de esta enzima se encuentra entre 5 y 5,5 por lo tanto la prueba fue exitosa pues el
valor experimental se encuentra dentro del rango y además se justifican estos valores al
tratarse de la enzima fosfatasa ácida, cuyo nombre indica que se desempeña mejor en
entornos ácidos.
La temperatura óptima se encuentra a 37 ºC con una velocidad de 0,08435 mg/mLmin que es
el punto más alto de la gráfica. Al comparar con la literatura se encontró que la temperatura
de esta enzima varía entre 45-62 ºC, se puede observar que estos valores se acercan pero no
están dentro del mismo rango por diversos factores como el tiempo de reacción y los valores
de absorbancia tomados.
Por otro lado se pudo demostrar por medio de la figura 5 el comportamiento cinético de la
enzima ajustado al modelo de Michaelis-Menten expresado en la ecuación 3, donde se
expone que la concentración de enzima es directamente proporcional a la velocidad de
reacción.
Finalmente se determinó que el Km sin inhibidor es de 6,182 mientras que con inhibidor es
de 10,37. Para la velocidad máxima se determinó que sin inhibidor es de 0,142 mg/ ml min y
con inhibidor es de 0,112 mg/ ml min, por lo tanto se asocia el inhibidor con uno mixto
puesto que la velocidad disminuye, al igual que la afinidad al aumentar el valor de Km.
Bibliografía
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B – 4.0 0.5
Anexos 2
Anexos 3
Blanco
5.6 – 1.6 0.8
enzima
(BE)
Anexos 4
Tubo BB BS BE 1 2 3 4 5 6
Buffer 2.0 1.6 1.8 1.4 1.4 1.4 1.4 1.4 1.4
(ml)
pH del 5.3 5.3 5.3 3.0 4.0 5.0 5.3 5.6 6.2
buffer
Anexos 5
Temperatura, °C Medio
0 Agua – Hielo
18 Temperatura ambiente
37 Termostato
60 Termostato
98 Agua en ebullición
Anexos 6
Tubo BB BS BE 1 2 3 4 5
Buffer (ml) 1.4 1.4 1.4 1.4 1.4 1.4 1.4 1.4
Anexos 7
Tubo B BS BE 1 2 3 4 5
B
Anexos 8
Buffer
(ml) 1.4 1.4 1.4 1.4 1.4 1.4 1.4 1.4 1.4 1.4 1.4
Sustrato a
adicionar* – 0.4 – 0.4 0.4 0.4 0.4 0.4 0.4 0.4 0.8
(ml)
concen*
[S} mM – 5 – 5 10 20 40 60 80 100 100
Agua (ml)
1.0 0.6 0.8 0.4 0.4 0.4 0.4 0.4 0.4 0.4 –
Enzima (ml) – – 0.2 0.2 0.2 0.2 0.2 0.2 0.2 0.2 0.2
Anexos 9
Buffer: Solución de buffer de citrato, 0.1 M, pH 5.3
Sustrato: Solución de –glicerofosfato de sodio de diversas concentraciones en el rango
5–100 mM.
Enzima: Extracto enzimático crudo
Tiempo de reacción: 10 minutos
Temperatura: temperatura ambiente
Inhibidor: HgCl2 5 mg/ml
Buffer
(ml) 1.2 1.2 1.2 1.2 1.2 1.2 1.2 1.2 1.2 1.2 1.2
Sustrato a
adicionar* – 0.4 – 0.4 0.4 0.4 0.4 0.4 0.4 0.4 0.8
(ml)
concen*
[ S ] mM – 5 – 5 10 20 40 60 80 100 100
Agua (ml)
1.2 0.6 0.8 0.4 0.4 0.4 0.4 0.4 0.4 0.4 –
Inhibidor
(ml) – 0.2 0.2 0.2 0.2 0.2 0.2 0.2 0.2 0.2 0.2
Enzima (ml) – – 0.2 0.2 0.2 0.2 0.2 0.2 0.2 0.2 0.2