4-Composés Azotés L2-USS

L2 Etudes Médicales & Pharmacie
Département de Chimie-Biochimie,
Biologie Cellulaire & Moléculaire
LES COMPOSÉS AZOTÉS

Dr NGUELE Jean – Calvin, Ph.D.
Maitre-Assistant CAMES
Copyright Dr NGUELE Jean-Calvin 2021

OBJECTIFS SPÉCIFIQUES
Décrire le Schéma général de la biosythèse
des bases pyrimidiques;
Décrire La synthèse de la thymine (son

précurseur: dUDP) et les deux traitements
inhibiteurs utilisés en thérapeutique (cancer);
Expliquer le schéma de régulation de la

biosynthèse des bases puriques;
Connaître le métabolisme de certaines

molécules azotées primordiales (Acides
aminés, Hème, etc) ;
Explorer le métabolisme des composés

azotés. Copyright Dr NGUELE Jean-Calvin 2021
LES COMPOSÉS AZOTÉS
PLAN
I. INTRODUCTION & GÉNÉRALITÉS
II. MÉTABOLISME DES BASES AZOTÉES
III. MÉTABOLISME DES AMINO-ACIDES
IV. MÉTABOLISME DE L’HÉMOGLOBINE ET DES

PORPHYRINES (HÈME)
V. EXPLORATION DU MÉTABOLISME DES

COMPOSÉS AZOTÉS
I. INTRODUCTION & GÉNERALITÉS
I.1. Origine de l’Azote des Composés organiques
L’atome d’azote (N) qui rentre dans la composition des acides

aminés et des nucléotides provient de l’azote atmosphérique
(N2).
L’atmosphère contient 78% de N2 inutilisable sous cette forme

par l’organisme vivant à l’exception des bactéries telles que les
cyanobactéries qui peuvent réduire N2 en NH3 (ammoniac).
C’est sous cette forme que l’azote pourra être assimilée par la
plupart des êtres vivants pour servir à la synthèse des molécules
azotées (acides amines, protéines, nucléotides, etc.).
L’excrétion d’urée par les animaux supérieurs et la putréfaction
des cadavres animaux et végétaux regarnissent le sol en azote
qui va a nouveau suivre les mêmes étapes de modification pour
le rendre assimilable pour les organismes vivants. Toutes ces
étapes décrivent le « Cycle de l’azote », résumé ci-dessous.
DÉTRITUS ORGANIQUES
N2
Bactéries (Cyanobactéries) DEGRADATION
NH3
URÉE
Nitromonas AZOTE ORGANIQUE ANIMAL
NO2-
Nitrobacter
INGESTION PAR LES ANIMAUX
NO3 -
DÉNITRIFICATION AZOTE ORGANIQUE VEGETAL

(MICROORGANISMES DU SOL)
Schématisation du Cycle de l’Azote.

II. MÉTABOLISME DES BASES AZOTÉES
 DEUX TYPES DE BASES AZOTÉES : PURIQUES ET
PYRIMIDIQUES
 3 BASES PYRIMIDIQUES : URACILE (ARN), CYTOSINE (ADN,
ARN) THYMINE (ADN)
 2 BASES PURIQUES : ADENINE (ADN,ARN), GUANINE (ADN,
ARN)
 NUCLÉOSIDES : BASES + SUCRE
 SUCRE
 RIBOSE : ARN
 DESOXYRIBOSE : ADN
 NUCLÉOTIDES : NUCLEOSIDE + ACIDE PHOSPHORIQUE

 LIAISON RICHE EN ENERGIE
 SYNTHESE DES BASES : UBIQUITAIRE ET CYTOPLASMIQUE
 ACIDE URIQUE : PRODUIT DU METABOLISME DES BASES
 PATHOLOGIES LIEES AUX BASES : URICEMIE
 URICÉMIE : C'EST LE TAUX D'ACIDE URIQUE DANS LE SANG
 GÉNOME : « EQUIREPRESENTATION » ET « EQUIBESOIN »

DES BASES PURIQUES ET PYRIMIDIQUES
 EQUIMOLARITE DES 2 TYPES DE BASE : EVITER LES ERREURS

LORS DE LA REPLICATION ET TRANSCRIPTION ET DONC LES
PATHOLOGIES

 EXISTENCE D’UN RECYCLAGE DES BASES PURIQUES POUR
EPARGNE D’ENERGIE
 LE METABOLISME DE CES BASES CONSOMME
BEAUCOUP D’ENERGIE
 ABSCENCE DE RECYCLAGE DES BASES PYRIMIDIQUES MAIS

EXISTENCE DES SYNTHÈSES « DE NOVO » CES BASES.
 EQUILIBRER L’ORGANISME EN BASES PYRIMIDIQUES ET

PURIQUES
 ROLE DES BASES DANS UNE CELLULE NORMALE AU REPOS

(ABSENCE DE DIVISION):
 ENERGETIQUE : ATP
 SIGNALISATION : AMP
 ACTIVITE TRANSCRIPTIONNELLE : SYNTHESE D’ARNs

POUR LA SYNTHESE D’ENZYMES
 DIVISION MAXIMALE DES CELLULES : ÉTAT
EMBRYONNAIRE, ENFANCE ET PENDANT LA CROISSANCE.
 ADULTE : DIVISION ENCORE TRÈS RÉGULIÈRE DE
CERTAINES CELLULES ( PEAU, MUQUEUSES DIGESTIVES, ET
CELLULES SANGUINES).
 SITUATION PATHOLOGIQUE « CANCERS » DIVISION
TOTALEMENT CHAOTIQUE DE CELLULES
 traitements par chimiothérapie : blocage du métabolisme des
bases avec arrêt de la réplication anarchique des cellules
cancéreuses mais aussi des cellules saines
 effets secondaires possibles : anomalies de la moelle
osseuse voire des problèmes cutanés
 RÉPLICATION DES AGENTS INFECTIEUX PARFOIS POSSIBLE

À L'INTÉRIEUR DE NOTRE ORGANISME ( INFECTION,
SEPTICÉMIE, VIRUS).
 nombre d'antibiotiques et d'antirétroviraux vont aussi cibler

les bases.
II.1. Anabolisme
BIOSYNTHESE DES NUCLEOTIDES PYRYMIDIQUES
2.1. Biosynthèse du carbamyl phosphate (étape préliminaire)
 Enzyme: Carbamyl phosphate synthétase II (≠Carbamyl

phosphate synthétase I de l’uréogénèse).
 Réaction cytoplasmique ubiquitaire.

 Activateurs : 5’PRPP (glucide); nucléotides puriques
(rétrocontrôle activateur pour la recherche de l’équilibre
pyrimidiques/puriques cellulaire.
 Inhibiteurs : excès de pyrimidiques ( ex UMP) rétrocontrôle

négatif.
 Synthèse du carbamyl phosphate est une étape limitante.

2.2. Biosynthèse du carbamylaspartate
 Enzyme : l’Aspartate transcarbamylase (enzyme

allostérique)
 Inhibiteur: CTP (cytosine tri phosphate) freine la réaction;
 Activateur: ATP (adénine tri phosphate);
 Maintien de l’équilibre pyrimidique/purique.

2.3. Biosynthèse de l’acide dihydroorotique
 Enzyme : dihydroorotase

2.4. Biosynthèse de l’orotate (acide orotique)
 Enzyme : Déhydroorotique déshydrogénase
 Réaction : déshydrogénation de l’acide déhydroorotique en

présence de NAD+ (cofacteur);
 Lieu : mitochondrie;
 Orotate : « double liaison 5-6 » embryon des bases pyrimidiques

sur lequel va venir se greffer le sucre.
2.5. Formation du nucléotide
2.5.1. Formation du PRPP (5’phosphoribosyl-1-Pyrophosphate)
La Phosphoribosylpyrophosphate synthétase transfère un
pyrophosphate sur le ribose-5P issue de la voie des pentoses (voie génératrice
des cofacteurs des anabolismes NADP+, NADPH,H+).
La phosphoribosylpyrophosphate synthétase est une enzyme

allostérique à deux domaines régulée par les deux produits finaux
(purines et pyrimidines). S'il y’a suffisamment de nucléosides dans la
cellule, la réaction est inhibée « rétrocontrôle négatif ».
2.5.2. Formation de l’Orotidine 5’-monophosphate (OMP)
 L’Orotate PRPP transférase greffe le phospho rybosyl sur l'orotate

pour former l'OMP ou acide orotidylique (orotidine 5'-monophosphate).
APPLICATIONS MÉDICALES
o Oroticacidurie est une maladie génétique qui a pour conséquence un
déficit en bases pyrimidiques. Elle est observée lorsqu’il y’a de déficits
génétiques sur le gène codant pour l’Orotate PRPP transférase.
o Le déficit en bases pyrimidiques va activer la carbamyl P synthétase, avec

emballement métabolique et hyperproduction majeure d'acide orotique.
o L’acide orotique surproduit est fugace; il sera éliminé par l’organisme.

DANS QUOI ÉLIMINE-T-ON L'ACIDE OROTIQUE?
Rappels: on élimine nos déchets dans deux substances : les

urines et les selles.
Dans les urines on élimine les substances hydrophiles ou

polaires, et dans les selles les substances apolaires ou lipophiles.
Réponse: l'acide orotique est polaire, éliminé dans les urines.

La grande quantité d'acide orotique dans les urines primaires
après avoir traversé le filtre rénal (alors qu'il est normalement
absent) va s'agglutiner, et donner ce que l'on appelle les
calculs (lithiases, urinaire ou urétérale) qui bouchent les
uretères.
Symptome: la colique néphrétique.

Dans les selles: la substance lipophile passe par le foie et le
conduit cholédoque, puis dans le duodénum. Quand des calculs
de substances lipophiles se forment, cela donne des coliques
hépatiques.
NB: la colique néphrétique est frénétique. Quand la voie
urinaire est bouchée, l'urine engorge le rein. Cela fait très mal.
Le patient se retourne tout le temps à cause de sa souffrance
d'où frénétique car il n'y a pas de position antalgique ( on soigne
avec des antalgiques).
Par contre la colique hépatique est pathétique car le patient,

avec son calcul dans sa vésicule biliaire, va trouver une position
antalgique et ne plus en bouger (d'où le nom de pathétique).
Chez l'enfant la colique néphrétique est due à une maladie de

surcharge (différente de chez l'adulte qui peut être de cause
pléthorique), maladie héréditaire du métabolisme.
2.6. Décarboxylation irréversible de l'acide orotidylique : Synthèse
de Uridine mono phosphate
L'OMP est décarboxylé et donne l'uridylate (UMP = Uridine 5P ou acide

uridylique).
UMP va être phosporylé deux fois par des kinases non spécifiques et devient
l'UMP puis l'UTP.
Remarque : L’uracile ayant pré-existé avant les autres base, cela signifie que
les formes de vie l'ont été sous forme d'ARN et non pas d'ADN. Il y a donc
une primauté de l'ARN sur l'ADN.
2.7. Formation de la cytosine
 UTP par amination en C6 à partir de la glutamine va donner la CTP

(cytidine triphosphate)
 Enzyme : CTP synthétase.

Schéma général

PPi

2.8. Biosynthèse de la thymidine
 Synthèse du désoxyribose (sucre de la thymine) par réduction des
ribonucléotides en désoxyribonucléotides (réduction du ribose en 2')
grâce au complexe Thiorédoxine réductase ou Ribonucléotide
réductase (Ex: UDP devient dUDP).
 Transfère sur l’uracile d’une une fonction méthyle (CH3) à partir

d’un donneur de méthyl le THF ( Tétrahydrofolate)
 Remarque:
o Le système des donneurs de méthyles : méthionine, les folates et la

vitamine B12.
o Le système de passage du ribose au désoxyribose n'est pas spécifique

et est commun à toutes les bases puriques et pyrimidiques.

APPLICATION EN CANCÉROLOGIE
S'il y a un processus de cancérisation (une cellule adulte non programmée

pour se répliquer se met à se diviser de façon anarchique, à l'infini, sans
contrôle cellulaire auquel elle échappe) il y a un besoin important de
bases thymine pour ses activités réplicatives.
Il est donc évident que deux des plus grands traitements chimiothérapiques,
utilisés de manière non ciblée, non spécifique : le méthotrexate et le
fluorouracile bloquent la synthèse de thymine.
Le méthotrexate inhibe la dihydrofolate réductase alors que le fluorouracile
inhibe la thymidylate synthase.
Toutes les cellules seront touchées : en priorité les cellules cancéreuses qui
utilisent beaucoup thymine mais aussi les cellules physiologiquement saines
qui se répliquent souvent comme les cellules de la moelle osseuse et la peau
(effets secondaires avec une toxicité dermatologique et hématologique).
Le fluorouracile est un analogue chimique de l'uracile qui prend la place de

l'UDP, cet analogue n'est pas incorporable et va bloquer l'enzyme par
compétition.
2.9. Erreur innée du métabolisme des pyrimidines
Le métabolisme des bases est donc très important en pathologie (en

hématologie notamment).
L'oroticacidurie ( maladie autosomique récessive) se développe à

cause d'un déficit en Orotate phosophoribosyltransférase et
en Orotidylate décarboxylase: l'acide orotique s'accumule dans
les urines en cristaux d'orotate et donne la colique néphrétique.
Le traitement chez l'enfant c'est de bypasser ce barrage et de donner

le produit en aval du barrage: c'est-à-dire de l'uridine et de la
cytidine par l'alimentation. Il y aura moins d'accumulation
d'orotate.
En aval de la réaction, il y a une carence en thymine et uracile :

cela peut donner une anémie mégalobastique.

L'anémie peut être mégaloblastique ou macrocytaire: les
globules rouges seront grands et un petit peu immatures (ils sortent
de la moelle osseuse avant leur maturation complète). C'est
l'anémie du sujet plutôt âgé qui manque de vitamine B12 et de
folates. Anémie par manque de donneurs de méthyles.(voie
des pyrimidines).
On apprécie le caractère mégaloblastique ou microcytaire de
l'anémie en regardant le VGM (volume globulaire moyen)
L'anémie peut être aussi microcytaire : les globules rouges seront
petits. Elle est due aux carences en fer. Le fer sert à fabriquer
l'hème qui est le composant central de l'hémoglobine.
Un sujet peut être anémié parce que sa moelle osseuse est
déficiente: on parle d'anémie arégénérative. Inversement, si la
moelle osseuse arrive à compenser en fabriquant plus de globules
rouges, on parle d'anémie régénérative.
On apprécie le caractère (a)régénératif en analysant le taux de
réticulocytes. Si le taux est élévé, l'anémie est régénérative.
BIOSYNTHESE DES NUCLEOTIDES PURIQUES
La synthèse des bases puriques est différente de celle des bases pyrimidiques.
Contrairement aux bases pyrimidiques ou lors de la synthèse, le PRPP vient se
greffer sur l’OMP; les bases puriques se fabriquent directement à
partir du PRPP
3.1. Synthèse de l’IMP

Elle se déroule en 10 étapes
 Etape 1: Le groupement amine de la glutamine se fixe sur le PRPP pour

donner 5'Phosphoribosylamine
o Enzyme : PRPP glutamyl aminotransférase « PAT » ou 5P-
RibosylPyrophosphate-glutamyl-amino-transférase. Enzyme
allostérique très régulée de façon stricte par rétroinhibition cumulative par
AMP, GMP et IMP (pas d’activation par les bases pyrimidines).
 Etapes suivantes : une cascade de synthèses aboutissant à la formation du

précurseur l'IMP (inosine monophosphate ou acide inosinique ou
inositate); équivalent de l'OMP.
Voie de l’adénylosuccinate synthase
IMP AMP
IMP Voie de l’IMP déshydrogénase GMP
XMP(xanthylate)
Remarque: La synthèse des pyrimidines est activée par les purines, mais
l'inverse n'est pas vrai. Copyright Dr NGUELE Jean-Calvin 2021
3.2. De l’IMP à AMP par amination en C6
 IMP entre dans la voie de synthèse de l’Adénylosuccinate à partir d'aspartate et
d'énergie (GTP), réaction catalysée par l’Adénylosuccinate synthase. Puis, une
coupure de la chaîne latérale de l'aspartate par l’Adénylosuccinate lyase libérant
le fumarate (intermédiaire du cycle de Krebs) va produire l'AMP.
 Régulations
1. Si l'adénylate est présent en excès, il freine l’Adénylosuccinatesynthase. L'IMP
se retrouve en excès, et il va alors fabriquer de la guanine (respect de l’équilibre
existant entre les A et les G).
2. Re-passage possible l'AMP en IMP grâce à l'AMP désaminase « régulation en
intrabranche » . L'IMP ainsi régénéré va privilégier la voie du GMP. L'AMP
désaminase est activée par l'ATP.
BIOSYNTHESE DES NUCLEOTIDES PURIQUES: IMP A AMP

3.3. De l’IMP à l’acide guanylique (GMP) par amination en C2
 L'IMP est oxydé en xanthylate (XMP) par l'IMP déshydrogénase. Le
XMP va fixer la fonction amine de la glutamine grâce à la GMP synthétase
pour donner le GMP.
 Régulation : Si GMP est en excès, il exerce une fonction retro-inhibitrice sur
sa propre formation en inactivant l'IMP déshydrogénase.

3.4. Régulation de la biosynthèse des nucléotides puriques
Une régulation très fine des purines par la cellule existe.
1ère régulation, terminale:
 régulation croisée chez les purines :
- S'il y a trop de Guanine mono, di et tri phosphate, cela va accélérer la

formation d'AMP en activant l'adénylosuccinate synthase et freiner sa
propre synthèse en inhibant l'IMP déshydrogénase.
- Si la voie AMP est prédominante, cela active la formation du

xanthylate, active l'AMP désaminase (pour la formation de l’IMP) et
active la guanosine monophosphate synthétase avec synthèse de
Guanylate. Il existe aussi une rétro-inhibition de l'adénylosuccinate
synthase.

Le deuxième niveau de régulation, globale:
S'il y a trop de Guanine ou d’ Adénine, on observe une inhibition de la
synthèse des purines en freinant l'activité de la PRPP glutamyl
aminotransférase et de la PRPP synthase, ceci toujours pour
conserver cet équilibre entre purines et pyrimidines, un excès de purines
active la synthèse de pyrimidines.

3.5. Recyclage des bases et nucléosides puriques
 La récupération des nucléosides puriques
Elle est négligeable, elle concerne uniquement l’adénoside et la désoxy-

adénosine grâce à l’adénosine kinase.
En revanche l’adénosine kinase dans les tissus périphériques assure la

fonction très importante de resynthèse de l’AMP à partir de l’adénosine
qui leur est adressée par le foie.
 Réactions de recyclage des bases puriques
Le principal recyclage des bases puriques se fait à partir de deux enzymes
clés dont la dérégulation provoque des pathologies :
– l'APRT (Adénine-P Ribosyl Transférase) qui transforme l'adénine en

adénosine et non en AMP.
– l'HGPRT (Hypoxanthine-Guanine Phosporibosyl Transférase) qui

transforme la guanine en GMP et l'hypoxanthine en IMP.

 Remarques:
 Les bases pyrimidiques ne sont pas recyclées. Les besoins étant

identiques dans la cellule, la synthèse « de novo » des pyrimidines
est très supérieure à celle des purines.
 Le recyclage des puriques est très intense dans les tissus à fort
renouvellement comme la moelle osseuse, la peau et le foie
(hépatocytes). Ce recyclage permet une économie d'énergie très
importante: la biosynthèse de l'AMP consomme 7 liaisons riches en
énergie et 8 pour le GMP, alors que le recyclage n'en consomme que 2.
Le ratio est quatre fois plus petit lors du recyclage comparé à la
synthèse en terme d'apports énergétiques à fournir.

II.2. Catabolisme des Acides Nucléiques et Nucléotides
CATABOLISME DES ACIDES NUCLEIQUES
Remarque : Ces catabolismes sont non spécifiques mais communs

aux purines et pyrimidines).
CATABOLISME ET RECUPERATION DES NUCLEOTIDES
PURIQUES
 Elle est essentiellement hépatique

 Cas de l’IMP
 Retrait du phosphate de l'IMP par une 5'-nucléotidase non
spécifique pour donner un nucléoside : l'inosine.
 Dégradation de l'inosine avec retrait du ribose par des enzymes non

spécifiques les purines nucléosides phosphorylases (PNP) pour obtenir
l'hypoxanthine.
 Transformation de l'hypoxanthine d’abord en xanthine puis en
acide urique par la xanthine oxydase « enzyme à deux
actions successives d'oxydation »
 Cas du GMP
 Le GMP va être catabolisé en guanosine par la 5'nucléotidase,
puis la guanosine va être transformée en guanine après retrait du
ribose par la PNP.
 La guanine est ensuite désaminée en xanthine par une guanase
puis subit l’oxydation menant à l'acide urique.
 La Guanine peut être recyclée en GMP et l'hypoxanthine en IMP grâce à
l'HGPRTase qui va remettre le sucre sur les bases.
Remarque: 90 % de ce catabolisme est recyclé par l'HGPRTase. Si cette
enzyme est touchée, cela donne le syndrôme de Lesch-Nyhan chez l’enfant.
 Cas du L’AMP
 L'AMP va donner l'adénosine par la 5'nucléosidase, puis l'adénine par
la PNP (purines nucléosides phosphorylase). Cependant, l‘homme ne
possédant pas d'adénase (cul de sac métabolique) l'adénine ne peut se
cataboliser en hypoxanthine.
 L'APRTase (dont l'activité est faible) et l'adénosine kinase vont faire

repasser l'adénine en AMP.
 L'adénosine désaminase (ADA) peut faire passer l'adénosine en

inosine.
Remarque 1: L'ADA est très limitante, sa mutation chez l’homme entraine
des problèmes majeurs dans des tissus qui se répliquent énormément (moelle
osseuse: globules blancs, lymphocytes). Les enfants qui ont un déficit en ADA
souffrent notamment d'infections: la fabrication de globules blancs est
insuffisante. Copyright Dr NGUELE Jean-Calvin 2021
Chez l ’Homme, le catabolisme complet des bases puriques mène à
l’acide urique par actions successives : 5’nucléotidase, Purine
nucléoside phosphorylase (PNP), Xanthine oxydase;
catabolisme essentiellement hépatocytaire, rénal et accessoirement
intestinal.
NB: absence d’adénase (alors qu’il existe une guanase), ce qui rend
l’adénosine désaminase (ADA) très limitante.
La xanthine et l'hypoxanthine issues de la dégradation du GMP et de

l'AMP, quittent les tissus périphériques en direction de la circulation
sanguine, du foie, des reins et de l'intestin. En revanche adénine et
guanine ne sont pas exportées.
Au niveau hépatique, l’hypoxanthine, sous l ’effet de l’HGPRTase,
redonne l’IMP, puis l’AMP, puis l’adénosine qui est exportable vers
les tissus périphériques.

CATABOLISME DES BASES PURIQUES

Une surproduction d’acide urique est liée soit à:
Un HYPERCATABOLISME des bases puriques.
Un déficit de HGPRT (Hypoxanthine Guanine

Phosphorybosyl Transferase).
P.S.: HGPRT = Enzyme qui recycle l’acide urique pour la synthèse d’acides nucléiques
SURPRODUCTION D’ACIDE URIQUE
Entraîne sa précipitation dans le sang et la formation de cristaux

qui vont se déposer dans le gros orteil (tophus) = GOUTTE.
Ces cristaux peuvent également se déposer dans les reins et provoquer
des CALCULS RENAUX.
INSUFFISANCE RÉNALE
SURPRODUCTION D’ACIDE URIQUE
HOMME ♂ FEMME ♀ ENFANT ♀/♂
URICÉMIE (en μmol/L) 180 – 420 150 – 360 60 – 210
URICATURIE/URICURIE (mmol/L) 2.4 – 4.8 1.8 – 3.6 1.2 – 2.6
ANTÉCÉDENTS FAMILIAUX
Dès la puberté, le taux d’Acide urique des hommes est naturellement plus
élevé que celui des femme.
Les personnes âgées, accumulation de l’acide urique dans l’organisme due

à une mauvaise filtration de sang, etc.
PRÉCAUTION: limiter la consommation d’alcool, de gibier, de

! fruits de mer et abats de viandes  riches en purines.
APPROCHE THÉRAPEUTIQUE: EXEMPLE DE TRAITEMENT DE LA GOUTTE
Allopurinol = Analogue structural de l’hypoxanthine, inhibe la synthèse
de l’A.U par inhibition de la xanthine oxydase.
La maladie est améliorée par la prise d’ALLOPURINOL, un analogue

structural de l’HYPOXANTHINE qui, par conséquent, est un
INHIBITEUR SPÉCIFIQUE de la XANTHINE OXYDASE.
O
N
HN
N N
H
ALLOPURINOL
XANTHINE OXYDASE
XANTHINE ACIDE URIQUE
FAD FADH2
H2O2 O2
H2O Copyright Dr NGUELE Jean-Calvin 2021

III- MÉTABOLISME DES ACIDES AMINÉS
Le métabolisme des acides aminés répond à deux

objectifs
 Maintenir le pool des acides aminés (AA non

stockés)
 Assurer le renouvellement des protéines

Il existe deux groupes d’acides aminés selon qu'ils peuvent être
synthétisés ou non par l’organisme humain.
 AA indispensables ou essentiels 8/20: non

synthétisables apport alimentaire.
 AA non indispensables ou non essentiels 10/20:

synthétisables par voies métaboliques.
 AA sémi-indispensables 2/20: synthétisés en faibles

quantités chez les Nourrissons, apport exogène nécessaire.

AA INDISPENSABLES AA NON INDISPENSABLES
Tryptophane Aspartate
Lysine Glutamate
Méthionine Asparagine
Phénylalanine Glutamine
Valine Sérine
Thréonine Tyrosine
Leucine Cystéine
Isoleucine Alanine
Histidine* Proline
Arginine* Glycine
* AA SEMI INDISPENSABLES Copyright Dr NGUELE Jean-Calvin 2021

Il existe un moyen mnémotechnique très connu pour retenir les
acides aminés indispensables sous la forme d’une phrase. Les
termes entre parenthèses concernent les acides aminés semi-
essentiels.
(Hystérique), le très lyrique Tristan fait vachement

méditer Yseult (en Argentine).
Remarque 1: Les termes entre parenthèses concernent les

acides aminés semi-essentiels.
Remarque 2: parmi les acides aminés indispensables il existe
ceux dont la synthèse, même partielle est impossible (lysine et
thréonine), et ceux pour lesquels seule la copule carbonée ne
peut être synthétisée, la réversibilité des processus de
transamination permettant leur synthèse si les acides α
cétoniques correspondants sont fournis.
RAPPELS SUR LE RÔLE DES ACIDES AMINÉS ET PROTÉINES
 Acides aminés
 Synthèse des protéines
 Précurseurs de nombreuses molécules appelées AMINES

BIOGÈNES « neurotransmetteurs, Hormones….. »
 Fourniture d’énergie par production d’intermédiaire du cycle de

Krebs
 Protéines
 Catalysent les réactions métaboliques (enzymes)
 Structure et maintient de l’organisme « collagène, élastine »
 Canaux membranaires
 Transporteurs de substance dans le sang Hb (O2)

LE PROBLÈME DE L’AZOTE
 Catabolisme : NH2 est transformé en NH3

(ammoniac) très toxique
 Foie : NH3 est transformé en urée « cycle de l’urée »
Détoxification des cellules et du sang

III.1. Métabolisme de l’Azote
PROTÉOLYSE
3.1.1. Les protéines alimentaires
Ces protéines trop grosses pour traverser la paroi intestinale

sont hydrolysées progressivement lors de la digestion qui
débute dans l’estomac pour se terminer dans l’intestin.
Les acides aminés sont libérés sous l’action des enzymes

protéolytiques et absorbés dans l’intestin grêle.

 ENDOPEPTIDASES (PROTEASES ET PEPTIDASES)
o PEPSINE : synthèse muqueuse gastrique, clive

liaisons avec AA aromatiques, pH optimum 2,
action estomac et début intestin.
o TRYPSINE : secrétée par pancréas, poursuit le

travail de la pepsine dans le duodénum, clive
liaisons avec AA basiques, pH optimum ~ 8.
o CHYMOTRYPSINE : synthèse dans pancréas, clive

liaisons avec AA aromatiques, pH optimum ~ 8.

 EXOPEPTIDASE
o CARBOXYPEPTIDASES : hydrolysent la liaison
peptidique en C-terminal.
o AMINOPEPTIDASES : hydrolysent la liaison

peptidique en N-terminal.
3.1.2. Les protéines endogènes

o LYSOZYMES : organites riches en hydrolases, actifs
à pH acide, dégradent tous les types de protéines.
o COMPLEXE DU PROTÉASOME : dégrade

sélectivement les protéines combinées avec
l’ubiquitine.

3.1.3. Absorption des acides aminés libres et des dipeptides
Les dipeptides sont hydrolysés en AA dans le cytosol des cellules
intestinales. Les AA sont excrétés dans la veine porte et
acheminés vers le foie ou ils seront soit métabolisés, ou libérés
dans la circulation sanguine.

BIOSYNTHÈSE DES ACIDES AMINÉS
L’ammoniaque provenant de l’alimentation (NH3) est

directement incorporé dans une molécule intermédiaire du
Cycle de Krebs, l’α-cetoglutarate, pour donner le glutamate.
Celui-ci est ensuite utilisé pour synthétiser la glutamine.
Ces deux acides aminés (GLU et GLN) vont constituer

le réservoir d’azote qui sera utilisé pour la synthèse des
autres acides aminés (et même des nucléotides) par
des réactions de transamination.

Synthèse du Glutamate
O O
O NADH, H + +
NH4 NAD+ O
-O -O
O Glutamate Déshydrogénase O
O NH2
H2O Glutamate
Alpha-Cetoglutarate
Synthèse de la Glutamine
O O
O
C
-O P O ADP
HN+ C H
O O
3
O O
O
-O C
ADP CH2 Pi
O HN+
3 C H NH2
NH2 CH2 O
Glutamate C
2
HC
CH2 O
C O P O
Glutamine
HN O O
3
Gamma-Glutamyl-phosphate
QUELQUES EXEMPLES DE BIOSYNTHÈSE DES ACIDES
AMINÉS
Exemple 1:
La biosynthèse de l’Alanine (A) se fait à partir du pyruvate

provenant de la glycolyse comme squelette carboné et du
glutamate (donneur d’amine).
O O O O
C C
GLU α-CETOGLU
C O 2HN C H
Pyridoxal-P (PALP)
Alanine Amino-Transférase (ALAT)

HC
3 3HC
Pyruvate L-Alanine

Exemple 2:
De même, la synthèse de la Valine (V) et la Leucine (L)

nécessite la l’apport du squelette carboné du pyruvate.
Exemple 3:
Biosynthèse de l’Aspartate (D) et de l’Asparagine (N) est

catalysée par l’ASAT qui transfère le groupement NH3+ du
glutamate sur l’oxaloacetate (intermédiaire du Cycle de Krebs).
O O
O O
C
C
C O GLU α-CETOGLU 2HN C H
CH2 Pyridoxal-P (PALP) CH2

-OOC Aspartate Amino-Transférase (ASAT) -OOC
Oxaloacetate L-Aspartate (D)

De même, la synthèse de la Valine (V) et la Leucine (L)
nécessite l’apport du squelette carboné du pyruvate.
O O
C
O
2HN C H O
GLU
O
GLN
CH2 Aspartate Synthétase
H2N NH2
-OOC L-Asparagine (N)
L-Aspartate (D)

Exemple 4:
Biosynthèse de la Serine (S); Glycine (G) et Cystéine (C) :
Ces 3 acides aminés forment la « Famille Sérine » des acides
aminés. La sérine constitue le chef de file de cette série : elle est
synthétisée à partir du 3-phosphoglycéraldéhyde (intermédiaire
de la glycolyse). La glycine et la cystéine sont ensuite synthétisées
à partir de cette serine..
Exemple 5:
Les Acides Aminés de la Famille des Aromatiques: La
Phénylalanine (F), la Tyrosine (Y) et le Tryptophane (W)
sont synthétisés à partir des intermédiaires de la voie des
pentoses et du Cycle de Calvin (Erythrose-4-phosphate).

CATABOLISME GÉNÉRAL DES ACIDES AMINÉS

La dégradation des aminoacides comporte globalement deux
(2) étapes:
 La désamination : élimination dans le foie du groupement
amine sous forme de NH3 qui sera incorporé dans la molécule
d’urée
 Destinée du squelette carboné pour d’autres voies (recyclage

ou production d’énergie). Ce squelette carbone servira aussi
pour la « Synthèse de glucose de novo » ou néoglucogenèse)
en cas de jeûne prolongé (Cf. acides aminés
« GLUCOFORMATEURS ») ou pour donner des corps
cétoniques (Cf. acides aminés « CÉTOFORMATEURS »).
Tout se passe selon les schémas déclinés suivants…

Cas N°1: Carrefour Oxalo-Acétate
O O O O
C C
O
NH3 GLU
O HN C H C O
2 CYCLE de KREBS
O H2O α-CETOGLU
PALP
H2N NH2 Asparaginase CH2 ASAT CH2

NÉOGLUCOGÉNÈSE
L-Asparagine (N) -OOC -OOC
L-Aspartate (D) Oxaloacetate
Les deux aminoacides (N et D) sont donc dits « Glucogènes »

ou « Glucoformateurs ».

Cas N°2: Carrefour α-cétoglutarate
O
ARGININE O H2O NAD+ +
NH4 O CYCLE de
O -O KREBS
HISTIDINE
-O Glutamate Déshydrogénase
PROLINE
NADH, H+
O NÉOGLUCOGÉNÈSE
GLUTAMINE O O
NH2 Alpha-Cetoglutarate
Glutamate
Les cinq acides aminés ci-dessus concernés sont eux aussi

glucogènes.

Cas N°3: Carrefour Succinyl-CoA
Trois aminoacides glucogènes (V, M et I) rejoignent le cycle de

Krebs par l’intermédiaire du succinyl-CoA. Mais, l’isoleucine
est en plus un acide aminé cétogène.
H2C COO-
H2C C ~ SCoA
VALINE CYCLE de KREBS

O
METHIONINE Succinyl-CoA
NÉOGLUCOGÉNÈSE
ISOLEUCINE
3 HC – CO~SCoA CORPS CETONIQUES
ACETYL-CoA

Cas N°4: Catabolisme de la Phénylalanine et de la Tyrosine
Une maladie métabolique, assez fréquente, est due à une

altération de cette voie métabolique.
HC COO-
O O
-OOC HC
OH Phénylalanine OH
NH2 HO
NH2 Fumarate
Hydroxylase CH3
Phenylalanine (Phe / F) Tyrosine (Tyr / Y)
C O
H2C COO-
Aceto-acetate
S’il y a un déficit en Phénylalanine Hydroxylase, cela

provoque une PHÉNYLCÉTONURIE. Normalement, la
tyrosine est ensuite transaminée, puis dégradée progressivement
en fumarate et acéto-acétate. Un déficit enzymatique dans les
dernières étapes provoque une alcaptonurie (affection
extrêmement rare). F et Y sont aussi bien glucogènes que
cétogènes. Copyright Dr NGUELE Jean-Calvin 2021
APPLICATIONS MÉDICALES: TEST DE GUTHRIE (PCU TEST)
La Phénylcétonurie (PCU) est une maladie rare (1/10 000). C’est une
affection héréditaire autosomale récessive due à un déficit en
Phénylalanine hydroxylase.
Phénylalanine
hydroxylase
Phénylalanine Tyrosine
Les nouveau-nés souffrant de PCU ne peuvent pas

réagir efficacement à des quantités normales de
phénylalanine:
 Excrétion urinaire de métabolites
anormaux;
 Enfant normal à la naissance (protection
maternelle);
 Encéphalopathie > à 3-4 mois (arriération
mentale).
Dépistage par mesure fluorométrique de la phénylalanine entre le 3 ème-5ème jour de vie, après
alimentation normale  TEST DE GUTHRIE (Taux normal ≤3mg/dL; si T>10mg/dL  chromato AA
sang et urines)

Le Le dépistage de la PCU doit être effectué
systématiquement à la naissance (Test de Guthrie).
La phénylalanine (F) est présente dans les aliments riches en

protéines (viande, poisson, fromage et œufs). Si un enfant
souffrant de PCU n’est pas traité, le niveau de F s’accumulera
dans son sang (HYPERPHÉNYLALANINÉMIE). Ceci peut
endommager le cerveau, ce qui entraînerait une
ARRIÉRATION MENTALE.
Le phényl-pyruvate se forme à partir de F par

désamination. Sa production va être augmentée du fait que la
conversion en tyrosine est bloquée et que la phénylalanine
s’accumule.
La concentration de phényl-pyruvate est élevée dans le plasma
et dans l’urine, d’où le nom de «PHÉNYLCÉTONURIE», car
le pyruvate est un aminoacide α-cétonique et l’acide phényl-
pyruvique est donc un acide phényl-cétonique.
Le phényl-pyruvate est alors dégradé en produits plus ou moins

toxiques. Ils empêchent spécialement la formation de la gaine
de myéline des oligodendrocytes, ce qui explique le retard du
développement psychomoteur de l’enfant atteint.
TRAITEMENT  Régime alimentaire spécial pauvre en

phénylalanine (jusqu’à 12 ans au moins). Cet âge correspond
à la période de l’arrêt de la myélinisation. L’enfant peut
alors avoir un développement physique et intellectuel
normal.
Cas N°5: Carrefour Pyruvate
Cinq (5) aminoacides sont transformés en pyruvate : l’Alanine

grâce à l’ALAT ; la Cystéine, après libération du soufre (qui se
transforme en sulfate SO42-) ; la Sérine, la Thréonine et la
Glycine.
CO2
ALANINE O O
CYSTEINE ACETYL-CoA
C
SERINE 3 HC – CO~SCoA CYCLE DE K>REBS
THREONINE C O
GLYCINE
HC
3
Pyruvate
A partir du pyruvate, du glucose peut être synthétisé par la voie

de la néoglucogenèse. L’aminoacide le plus important
qui génère du pyruvate est l’alanine, libérée en grande
quantité par le muscle dans la circulation sanguine, au cours du
jeûne, pour rejoindre le foie.
Aperçu général du catabolisme des acides aminés
DÉCARBOXYLATIONS
Produisent des amines biogènes vitales (histamine,
dopamine, sérotonine, mélatonine)
Enzymes = décarboxylases, cofacteur = phosphate
de pyridoxal

TRANSAMINATIONS
Permettent de transférer le groupement amine d’un AA

sur un alpha-cétoacide sans libération d’ammoniaque.
Enzymes = transaminases ou aminotransférases,

spécifiques à chaque AA.
cofacteur = phosphate de pyridoxal (dérivé de la

vitamine B6 pyridoxine).

SCHÉMA DE BASE D’UNE RÉACTION DE TRANSAMINATION
Acide a-aminé Acide a-cétonique

MÉCANISME RÉACTIONNEL D’UNE TRANSAMINATION : 2 ÉTAPES
1: Transfert du NH2 du 1er AA sur le PALP avec formation d’une

imine (C=N) = base de Schiff
2: Transfert par le PALP du NH 2 à un acide a-cétonique transformé
en AA

AA + PALP
Remarque: pratiquement tous les AA peuvent subir des transaminations et
peuvent être formé à partir de leur acide a-cétonique correspondant
AMINO TRANSFÉRASES MAJEURS
 L’Aspartate Amino-Transférase «ASAT» ou GOT

(Glutamate Oxaloacétate Transaminase)

L’alamine amino-transférase «ALAT» ou «GPT»
(Glutamate Pyruvate Transaminase)
Remarque: glutamate = point d’aboutissement d’un grand nombre

de transaminations à partir des autres acides aminés.
Ces enzymes (ALAT & ASAT) ont une importance dans le diagnostic de
certaines nécroses tissulaires à cause de leur abondance dans certains
tissus. Ce sont deux principales enzymes spécifiques du foie
dont le dosage permettra de procéder à l’exploration
fonctionnelle de cet organe noble). Copyright Dr NGUELE Jean-Calvin 2021
APPLICATION MÉDICALE : LE BILAN HÉPATIQUE
(DIAGNOSTIC DES LÉSIONS HÉPATIQUES)
Intérêt du dosage plasmatique des activités des

transaminases ALAT et ASAT.
Si cas de lésions hépatiques, augmentation de la

concentration plasmatique d’ALAT et ASAT et donc de leurs
activités.
Les différences de localisation des 2 enzymes ASAT (prédominance
mitochondrie) et ALAT (cytoplasme) permettent une certaine
évaluation de la gravité des lésions cellulaires.
Si augmentation d’ALAT plasmatique, mitochondries

encore épargnées;
Si augmentation d’ASAT plasmatique, les mitochondries

aussi lésées.
3.1.5. Désamination oxydative
 La désamination oxydative contrairement à la

transamination qui transfère le groupement a-aminé de l’AA,
va plutôt le libérer sous forme d’ammoniac libre, avec
formation du squelette alpha-céto acide correspondant. Elle
est plus active dans le foie et le rein.
 La désamination oxydative se fait en 2 étapes :
1ėre étape : déshydrogénation de l’AA→Iminoacide (base de

schiff);
2nde étape : hydrolyse de l’iminoacide → Ammoniac + a-

cétoacide.

 La désamination oxydative fait intervenir deux types
d’enzymes :
 La Glutamate Déshydrogénase (réaction

réversible)
 L’acide aminé oxydase (réaction irréversible)

a) Glutamate déshydrogénase

 La réaction de désamination oxydative impliquant la
Glutamate Déshydrogénase est réversible.
 La Glutamate Déshydrogénase intervient aussi bien dans

l’assimilation de l’ammoniac (voie de synthèse) que dans la
désamination oxydative (voie de dégradation).
 La Glutamate Déshydrogénase utilise préférentiellement

NADP+ dans l’assimilation de l’ammoniac et le NAD+ dans la
désamination oxydative.
 La Glutamate Déshydrogénase fait l’objet d’une régulation

allostérique, elle est inhibée par l’ATP et GTP et activée par
l’ADP et GDP.

b) Oxydases des acides aminés
L’oxydation des acides aminés par les oxydases est une voie
secondaire par rapport à celle de la transamination. Elle fait
intervenir comme groupements prosthétiques deux
flavonoïdes : FNM et FAD.

3.1.6. Devenir du squelette carboné (a-céto acide)
Les 20 acides aminés protéinogènes vont libérer chacun l’alpha-

céto acide (squelette carboné) correspondant après le départ
sous forme d’ammonium du groupe aminé. La dégradation des
20 squelettes carbonés conduit à la formation de 7 composés:
alpha-cétoglutarate, oxaloacétate, fumarate, acéto-
acétyl-CoA, succinyl-CoA, pyruvate et acétyl-CoA.
Ceux-ci entrer dans le métabolisme intermédiaire pour la

production de l’énergie ou pour la synthèse de glucides
ou de lipides. Suivant le devenir du squelette carboné, les
acides aminés sont classés en trois groupes.

LES ACIDES AMINÉS GLUCOFORMATEURS
«GLUCOGÉNIQUES»
La dégradation du squelette carboné va libérer le pyruvate ou
l’un des intermédiaires du cycle de Krebs suivants: a-
cétoglutarate, oxaloacétate, fumarate, succinyl-CoA.
Dans cette classe, on retrouve: sérine, alanine, cystéine,

glycine, thréonine (synthétiseurs du pyruvate),
asparagine, aspartate, glutamate, glutamine, proline,
arginine, histidine, méthionine, valine, (fournisseurs
d’intermédiaires du cycle du Krebs).

Les acides aminés cétogènes ou cétoformateurs
«cétoniques»
La dégradation du squelette carboné fournit l’acétyl-CoA ou

l’acéto-acétyl-CoA. Les acides aminés de ce groupe sont les
suivant : leucine, lysine.
Les acides aminés à la fois glucoformateurs et cétogènes

«AA mixtes »
Dans ce groupe on retrouve : tyrosine, phénylalanine,

tryptophane et isoleucine.

Remarque : Corps cétoniques
 Eliminables par les urines ou les poumons (cétone).
 Servir de source d’énergie pour certains organes (Cerveau,

Cœur).

LES VOIES D’ÉLIMINATION DE L’AZOTE
 80% sous forme d’urée (foie).
 Sels ammoniacaux (NH4+) et acide urique (rein).

3.1.7. Uréogenèse ou cycle de l’urée
 C’est la formation de l’urée (NH2CONH2) par le cycle de
l’urée;
 But : éviter la production d’ammoniaque toxique

pour l’organisme;
 Lieu : hépatocytes exclusivement;
 La séquence des réactions comporte une phase

mitochondriale et une phase cytoplasmique (synthèse
de l’urée entre mitochondrie et cytoplasme);
 Origine de l’azote : Glutamine (NH3) issu de toutes les

cellules de l’organisme.
Phase mitochondriale
Synthèse du carbamyl phosphate
GLUTAMINASE
GLUTAMINE NH3 + GLUTAMATE
(ou CO2)
Deux liaisons phosphates riches en énergie sont consommées.

Synthèse de la Citrulline
Exportation de la citrulline dans le cytoplasme.

Remarques:
L’Ornithine carbamyl transférase (OTC) n’est exprimée
que dans les hépatocytes (d’où la synthèse hépatique de
l’urée).
La carbamyl phosphate synthétase I (CPSI) = Enzyme

allostérique activée par la N-acétyl glutamate
(dérivée du glutamate).

Phase cytosolique
Synthèse de l’arginosuccinate
Origine de l’aspartate : Souvent réaction de transamination entre

Glutamate mitochondrial et oxaloacétate catalysée par ASAT.
Synthèse de l’arginine

Fumarate (isomérie Trans) →→→Malate
→→→Oxaloacétate
(intermédiaire du Cycle de Krebs ).
Oxaloacétate →→→ resynthèse de l’aspartate (étapes
communes avec le CK; différentes sources de l’oxalo-acétate)

Synthèse de l’urée et de l’ornithine

Arginase : Enzyme de la membrane du réticulum
Endoplasmique.
Ornithine : retourne dans la mitochondrie pour initier un

nouveau cycle.
Urée : passe dans la circulation sanguine → Rein →Elimination

dans les urines

Cycle de l’urée
CPSI = Carbamyl Phosphate Synthétase I ASS = Arginosuccinate Synthétase

OTC = Ornithine Carbamyl Transférase ASL = Arginosuccinate Lyase
Cycle de l’urée

L’ammoniogénèse (synthèse de l’ammoniaque)
Rein
GLUTAMINASE NH4+ + GLUTAMATE
GLUTAMINE
oNH4+ → → →urine
oGlutamate→ →circulation sanguine → → Foie

Ammomiogénèse

IV- MÉTABOLISME DE L’HÉMOGLOBINE ET
DES PORPHYRINES
Par seconde, environ 2,5 millions d’érythrocytes âgés sont

détruits. Leur hémoglobine est dégradée en pigments
biliaires. Cette dégradation s’effectue à deux (2) endroits:
 Elle commence dans le système phagocytaire

mononucléaire de la rate mais aussi du foie et de la moelle
osseuse;
 Elle se termine dans le foie.

IV.1. Catabolisme de des Porphyrines
L’hémoglobine, une foie libérée, se lie alors à
l’HAPTOGLOBINE (glycoprotéine de la fraction des α2-
globulines), sa protéine de transport. Elle convoie l’hémoglobine
jusqu’au système phagocytaire mononucléaire.
A ce niveau, l’hémoglobine se dissocie en globine et hème. La

globine est dégradée en acides aminés qui peuvent être réutilisés
pour d’autres biosynthèses.
De son coté, l’hème forme la BILIVERDINE (ouverture du

cycle grâce à l’Hème Oxygénase), puis la BILIRUBINE
(intervention de la Bilirubine Réductase) en présence de
cytochrome P450, d’O2 et de NADPH,H+.

La bilirubine étant peu hydrosoluble, elle est transportée dans le
plasma par l’albumine. Ainsi, le complexe albumine-bilirubine
est appelé « BILIRUBINE INDIRECTE ».
Dans les sinusoïdes hépatiques, le complexe se dissocie, la

bilirubine est captée à l’aide d’une ‘PROTÉINE CARRIER’
dans les hépatocytes.

ÉTAPES DE LA DÉGRADATION L’HÈME LORS DU CATABOLISME DE
L’HÉMOGLOBINE ET SYNTHÈSE DE LA BILIRUBINE

Pour rendre la bilirubine plus hydrosoluble afin qu’elle puisse
être sécrétée dans la bile, la molécule de bilirubine est
« conjuguée » deux fois par l’acide glucuronique (active sous
forme de UDP-gucuronate).
La fixation du glucuronate se fait au niveau des deux fonctions

carboxyliques de la bilirubine.
Cette réaction catalysée dans le foie par une Glucuronyl-

transférase. Il se forme la bilirubine-diglucuronide. Cette
bilirubine conjuguée dans le foie est aussi appelée
« BILIRUBINE DIRECTE ».
On peut procéder à un dosage différentiel des deux

formes de la bilirubine afin d’orienter le diagnostic en
fonction de la cause pré-hépatique ou hépatique d’une
accumulation de la bilirubine.
La bilirubine libre est réduite en UROBILINOGÈNE et
STERCOBILINOGÈNE moins coloré.
Ces deux molécules sont oxydées en présence d’oxygène en

STERCOBILINE et UROBILINE qui ont une
COLORATION BRUNÂTRE, retrouvée dans les matières
fécales.

ICTÈRES OU JAUNISSE
Elle est caractérisée par une concentration de bilirubine dans le

plasma supérieure ou égale à 1mg/dL (bilirubine totale). La
bilirubine diffuse alors dans les tissus et les colore en « jaune ».
On peut reconnaitre l’ictère au niveau des sclérotiques (à partir
de 1,2 mg/dL). A plus forte concentration (> 2 mg/dL), la
peau devient jaune. Les causes d’une accumulation de bilirubine
peuvent être :
 Une destruction accrue de l’hémoglobine suite à une

hémolyse importante;
 Un métabolisme ralenti de la bilirubine dans le foie

(par exemple en cas de cirrhose hépatique);
 Une sécrétion de la bile perturbée (par exemple des

calculs biliaires).
Si l’on recherche la cause, une détermination de la bilirubine
directe et indirecte peut aider au diagnostic. Si la bilirubine
indirecte (non conjuguée) est augmentée, la cause est pré-
hépatique ou aussi intra-hépatique.
Par contre si la bilirubine directe (conjuguée) est augmentée, la

cause est post-hépatique (au niveau des voies biliaires) mais
peut être aussi intra-hépatique. En effet, même s’il existe une
lésion hépatique, la conjugaison peut tout de même s’effectuer.

V- EXPLORATION DU MÉTABOLISME DES COMPOSÉS AZOTÉS
BILAN RÉNAL
 Urée;
 Créatinine;
 Acide Urique.
BILAN HÉPATIQUE
 ALAT/GPT;
 ASAT/GOT;
 Gamma-GT.

CONTACT EMAIL POUR RÉCEPTIONNER LES COURS DE BIOCHIMIE EN PDF
[email protected]
Envoyer un email en indiquant:
NOMS et PRÉNOMS:
Etablissement:
Section/Classe:
Intitulé du (des) cours désiré(s):
117

4-Composés Azotés L2-USS

Transféré par

Droits d'auteur :

Formats disponibles

4-Composés Azotés L2-USS

Transféré par

Informations du document

Titre original

Copyright

Formats disponibles

Partager ce document

Partager ou intégrer le document

Options de partage

Avez-vous trouvé ce document utile ?

Ce contenu est-il inapproprié ?

Droits d'auteur :

Formats disponibles

4-Composés Azotés L2-USS

Transféré par

Droits d'auteur :

Formats disponibles

L2 Etudes Médicales & Pharmacie

LES COMPOSÉS AZOTÉS

Copyright Dr NGUELE Jean-Calvin 2021

Décrire La synthèse de la thymine (son

Expliquer le schéma de régulation de la

Connaître le métabolisme de certaines

Explorer le métabolisme des composés

II. MÉTABOLISME DES BASES AZOTÉES

III. MÉTABOLISME DES AMINO-ACIDES

IV. MÉTABOLISME DE L’HÉMOGLOBINE ET DES

V. EXPLORATION DU MÉTABOLISME DES

L’atome d’azote (N) qui rentre dans la composition des acides

L’atmosphère contient 78% de N2 inutilisable sous cette forme

DÉNITRIFICATION AZOTE ORGANIQUE VEGETAL

Schématisation du Cycle de l’Azote.

 NUCLÉOSIDES : BASES + SUCRE

 NUCLÉOTIDES : NUCLEOSIDE + ACIDE PHOSPHORIQUE

 ACIDE URIQUE : PRODUIT DU METABOLISME DES BASES

 PATHOLOGIES LIEES AUX BASES : URICEMIE

 URICÉMIE : C'EST LE TAUX D'ACIDE URIQUE DANS LE SANG

 GÉNOME : « EQUIREPRESENTATION » ET « EQUIBESOIN »

 EQUIMOLARITE DES 2 TYPES DE BASE : EVITER LES ERREURS

Copyright Dr NGUELE Jean-Calvin 2021

 ABSCENCE DE RECYCLAGE DES BASES PYRIMIDIQUES MAIS

 EQUILIBRER L’ORGANISME EN BASES PYRIMIDIQUES ET

 ROLE DES BASES DANS UNE CELLULE NORMALE AU REPOS

 ACTIVITE TRANSCRIPTIONNELLE : SYNTHESE D’ARNs

 RÉPLICATION DES AGENTS INFECTIEUX PARFOIS POSSIBLE

 nombre d'antibiotiques et d'antirétroviraux vont aussi cibler

BIOSYNTHESE DES NUCLEOTIDES PYRYMIDIQUES

2.1. Biosynthèse du carbamyl phosphate (étape préliminaire)

 Enzyme: Carbamyl phosphate synthétase II (≠Carbamyl

 Réaction cytoplasmique ubiquitaire.

Copyright Dr NGUELE Jean-Calvin 2021

 Inhibiteurs : excès de pyrimidiques ( ex UMP) rétrocontrôle

 Synthèse du carbamyl phosphate est une étape limitante.

Copyright Dr NGUELE Jean-Calvin 2021

 Enzyme : l’Aspartate transcarbamylase (enzyme

 Maintien de l’équilibre pyrimidique/purique.

Copyright Dr NGUELE Jean-Calvin 2021

 Enzyme : Déhydroorotique déshydrogénase

 Réaction : déshydrogénation de l’acide déhydroorotique en

 Orotate : « double liaison 5-6 » embryon des bases pyrimidiques

La phosphoribosylpyrophosphate synthétase est une enzyme

 L’Orotate PRPP transférase greffe le phospho rybosyl sur l'orotate

o Le déficit en bases pyrimidiques va activer la carbamyl P synthétase, avec

o L’acide orotique surproduit est fugace; il sera éliminé par l’organisme.

Rappels: on élimine nos déchets dans deux substances : les

Dans les urines on élimine les substances hydrophiles ou

Réponse: l'acide orotique est polaire, éliminé dans les urines.

Symptome: la colique néphrétique.

Par contre la colique hépatique est pathétique car le patient,

Chez l'enfant la colique néphrétique est due à une maladie de

L'OMP est décarboxylé et donne l'uridylate (UMP = Uridine 5P ou acide

 UTP par amination en C6 à partir de la glutamine va donner la CTP

Copyright Dr NGUELE Jean-Calvin 2021

Copyright Dr NGUELE Jean-Calvin 2021

Copyright Dr NGUELE Jean-Calvin 2021

 Transfère sur l’uracile d’une une fonction méthyle (CH3) à partir