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ESPECIAL PROTISTOLOGÍA

SEM@FORO NUM. 64 | DICIEMBRE 2017

Ecología microbiana de ambientes extremos


Ángeles Aguilera1*, Elena González-Toril1, Esther Santofimia2,
Enrique López-Pamo2, Virginia Souza3, María Altamirano4 [email protected]

1
Centro de Astrobiología (INTA-CSIC), Ctra Ajalvir Km4, Torrejón Ardoz, 28850 Madrid. 2Instituto Geológico y Minero de España (IGME). Ríos Rosas, 23, 28003, Madrid.
3
Instituto Estructura de la Materia (CSIC), Serrano 113, 28006 Madrid. 4Universidad de Málaga. Facultad de Ciencias. Teatinos s/n, 29071 Málaga.

El grupo de Ecología Microbiana, (i) Estudios Hidrogeoquímicos: estu- ta, a diferencia de lo que ocurre en la
desde hace más de 10 años, agrupa diamos la evolución espacio-temporal mayoría de ambientes extremos. A pesar
investigadores de cuatro instituciones de las aguas ácidas al incorporarse de las diferentes condiciones ambienta-
con el objeto de aglutinar intereses y a la red fluvial, tanto la evolución oxi- les y fisicoquímicas que presentan estos
conocimientos complementarios en un dativa como por dilución, demostrando la ecosistemas, existen especies eucariotas
mismo marco general, el del estudio de rápida cinética de la oxidación del Fe(II) comunes a todos ellos lo que nos hace
ecosistemas extremos, fundamentalmen- y su alta relación con variables como presuponer la existencia de un compo-
te, ambientes ácidos extremos. La unión pH, T, O 2 disuelto, actividad bacteriana nente genético común que les permiten
de investigadores de áreas tan diversas y concentración de hierro. Hemos reali- sobrevivir bajo condiciones de extrema
como la geología, microbiología o la zado un extenso estudio de la FPI como acidez. Asimismo, hemos descrito la
biología molecular proporciona al grupo áreas generadoras de drenajes ácidos comunidad procariota asociada a los bio-
un enfoque multidisciplinar que permite y su relación con parámetros climáti- films eucariotas para comprender mejor
aunar trabajos de investigación básica cos. Hemos trabajado en tratamientos las posibles asociaciones. Nuestros estu-
muy ligados a objetivos puramente apli- pasivos para remediar aguas mineras dios ultraestructurales demuestran una
cados. Los organismos extremófilos ayu- contaminadas caracterizando los preci- disposición ordenada de los organismos
dan a responder preguntas fundamenta- pitados como herramienta esencial para en capas, separadas entre sí por láminas
les tales como: cuáles son los límites de entender los procesos de eliminación de de EPS en las que se disponen las bac-
la vida, el establecimiento y evolución de metales, aportando mejoras a uno de los terias. Nuestros estudios voltamétricos
los sistemas de transducción de energía, pocos tratamientos pasivos en España. indican que la concentración de metales
el origen de los ciclos de los elementos De manera novedosa se han estudiado aumenta en la superficie y que son com-
en la naturaleza, todos ellos relacionados los procesos hidrogeobioquímicos que se parables con las que aparecen en el agua.
con la vida en nuestro planeta y la posi- dan en la columna de agua de los lagos
bilidad de encontrarla en otros sistemas mineros y su variación química y esta- (iii) Estudios relacionados con
planetarios. cional en profundidad, analizándose las Mecanismos de adaptación a ambien-
fases minerales que precipitan, las cuales tes ácidos: Publicamos los primeros
Este grupo, coordinado por la Dra. son capaces de capturar metales pesados transcriptomas y proteómas de organis-
Aguilera, trabaja en el estudio de diversos del medio. Asimismo,hemos trabajado en mos eucariotas acidófilos, estudiando la
aspectos de las comunidades microbianas casi todos los lagos ácidos mineros de respuesta a metales pesados de especies
acidófilas, centrándose fundamentalmen- la FPI, demostrando que cada lago es un fotosintéticas (Chlamyhdomonas aci-
te en los organismos eucariotas que los sistema único. dophila, Dunaliella acidophila y Euglena
habitan, siendo uno de los grupos pio- mutabilis) mediante técnicas de secuen-
neros en el estudio de la biodiversidad y (ii) Estudios relacionados con Bio- ciación masiva y proteómica. Estos traba-
los mecanismos de adaptación de estas diversidad: Somos uno de los grupos jos sugieren que los microorganismos
comunidades a las condiciones ambien- pioneros en abordar estudios en organis- analizados presentan un alto nivel de
tales. Actualmente tenemos un sólido mos eucariotas acidófilos, siendo los pri- estrés en su ambiente natural que los
conocimiento sobre la ecología microbia- meros en describir de manera exhaustiva obliga a reorganizar parte de su meta-
na en drenajes ácidos, fundamentalmente su biodiversidad así como los modelos bolismo fotosintético y energético. En
asociados a la Faja Pirítica Ibérica (FPI), geomicrobiológicos que los incluyeran el caso de Chlamydomonas encontramos
aunque también hemos trabajado en otros en diversos ambientes extremos ácidos una enzima fitoquelatin sintasa sobreex-
ambientes ácidos fríos como la Antártida, extremos. Hemos demostrado que presada en presencia metales no descrita
la Cordillera Blanca en Perú, y ambientes estos ecosistemas extremos pre- anteriormente en este género de microal-
ácidos hidrotermales como Argentina o sentan una biodiversidad eucariota gas. Un detallado análisis filogenético ha
Islandia. Nuestras principales aportacio- superior en número de especies y revelado evidencias de múltiples eventos
nes al conocimiento en este campo son: biomasa a la biodiversidad procario- de transferencia génica horizontal de bac-

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a) e)

b)

f)

c)

d)

Fig. 1. Algunos ejemplos de ambientes ácidos extremos. a) Áreas geotermales en la Península de Reykjanes (SW, Islandia), b) Dreaje ácido en Río Tinto (SW, España), c)
Drenaje ácido en el Parque Nacional de Huascarán National (Perú), d) Drenaje ácido en Bahía Almirantazgo (Islas Shetland, Antártida), e) Drenaje ácido en el río Pachacoto
(Parque Nacional Huascarán, Perú), f) Río Tinto en la zona del pueblo de Nerva (SW, España).

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terias a eucariotas dentro de esta familia presentan fenómenos de fotoinhibición, biotecnológicas. Estudios proteómicos
de genes en este acidófilo. El análisis de lo que las diferencia de otras especies nos han permitido encontrar nuevas
los genes expresados diferencialmente fotosintéticas, relacionadas más frecuen- proteínas, enzimas y metabolitos
en presencia de metales pone de relieve temente con procesos de fotosaturación. secundarios, que los microorganis-
una alta expresión constitutiva de genes mos utilizan en su respuesta a los
implicados en el estrés oxidativo, incluso (iv) Evaluación del potencial bio- cambios medioambientales, y que
en ausencia de metales pesados. En D. rremediador de ambientes conta- podrían tener interés biotecnológi-
acidophila se observó sobreexpresión de minados: hemos detectado que estos co. Entre las que se encuentran diversos
tránscritos relacionados con producción organismos acidófilos producen una pigmentos procedentes de microorganis-
de sustancias extrapoliméricas (EPSs) mayor cantidad de EPSs que juegan un mos psicrófilos y moléculas con actividad
que sugiere una respuesta de estrés del importante papel como mecanismos de antimicrobiana aisladas en organismos
retículo endoplásmico no descrita hasta protección frente a presencia de metales bentónicos antárticos.
este momento en microalgas. Destacar pesados. Producen más EPS que otras
que, el 26% de las proteínas analizadas especies de agua neutras (entre 130 a
no presentaban homología con ninguna 450 mg/gr peso seco), llegando a repre- BIBLIOGRAFÍA
otra proteína de las bases de datos, lo sentar entre el 15 y 40 % del peso total
Aguilera A, Manrubia SC, Gómez F, Rodriguez N,
que podría indicar la existencia de nuevas en seco del biofilm, producen más EPS
Amils R. (2006). Eukaryotic community distribu-
proteínas en estas especies. cuanto menor es el pH y cuanto mayor es tion and their relationship to water physicochemi-
la concentración de metales de la zona de cal parameters in an extreme acidic environment,
Hemos caracterizado por primera vez la donde son aislados. Hemos comprobado Río Tinto. Appl Environ Microbiol 72: 5325-30.
actividad fotosintética y productivi- que la cantidad y composición de EPSs no Cid C, Garcia L, Casado V, Amils R, Aguilera
A. (2010). Proteomic response of an acidophilic
dad primaria de las principales especies depende de la especie, si no de las con-
strain of Chlamydomonas sp. to natural metal-rich
acidófilas fototróficas. Estos análisis son diciones fisicoquímicas del agua que las water. Proteomics 10: 2026-36.
fundamentales a la hora de entender el rodea, evaluando de manera sistemática Souza V, Altamirano M, Amils R, Aguilera A.
papel que juegan este tipo de organis- el posible uso de estas EPSs en biorreme- (2011). Photosynthetic performance of photo-
mos en el ecosistema como productores diación de aguas contaminadas. trophic biofilms in extreme acidic environments.
Environ Microbiol 13: 2351-58.
primarios. Actualmente no existe ningún
González E, Santofimia E, López E, Cruz R, Pa-
estudio de este tipo en ambientes extre- (v) Estudios relacionados con lomino EJ, Aguilera A. (2015). Pyrosequencing
mos. Los resultados indican una gran microorganismos psicrófilos y su assessment of microbial community of Pastoruri
adaptación a condiciones de poca luz, potencial biotecnológico: Asimismo Glacier (PN Huascarán), a natural extreme acidic
lo cual creemos que tiene mucha rela- hemos trabajado en microorganismos environment. Microb Ecol 70:936-47.
Puente F, Olsson S, Gómez M, Souza V, Altami-
ción con el intenso color rojo del agua psicrófilos, centrándonos en su biodi-
rano M, Amils R, Parro, Aguilera A. (2016). So-
en la que habitan y que modifica en gran versidad, ecología, mecanismos molecu- lar radiation stress in natural acidophilic biofilms
medida la calidad de luz fotosintética que lares de adaptación a las temperaturas of Euglena mutabilis revealed by metatranscrip-
reciben. Todas las especies analizadas extremas y en sus posibles aplicaciones tomics and PAM fluorometry. Protist 167: 67-81.

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