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    Genomas Modelo

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    Zulia Soto
    Este documento describe la organización y comparación de genomas de organismos modelo eucariontes y procariotas. Discute temas como el tamaño y complejidad de genomas, la presencia de intrones, repeticiones y operones en diferentes organismos, así como las diferencias en empaquetamiento de ADN entre eucariontes y procariotas. Finalmente, realiza una breve comparación del genoma humano con la levadura para ilustrar estas diferencias a nivel genómico.

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    Genomas Modelo

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    Este documento describe la organización y comparación de genomas de organismos modelo eucariontes y procariotas. Discute temas como el tamaño y complejidad de genomas, la presencia de intrones, repeticiones y operones en diferentes organismos, así como las diferencias en empaquetamiento de ADN entre eucariontes y procariotas. Finalmente, realiza una breve comparación del genoma humano con la levadura para ilustrar estas diferencias a nivel genómico.

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    Este documento describe la organización y comparación de genomas de organismos modelo eucariontes y procariotas. Discute temas como el tamaño y complejidad de genomas, la presencia de intrones, repeticiones y operones en diferentes organismos, así como las diferencias en empaquetamiento de ADN entre eucariontes y procariotas. Finalmente, realiza una breve comparación del genoma humano con la levadura para ilustrar estas diferencias a nivel genómico.

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    Este documento describe la organización y comparación de genomas de organismos modelo eucariontes y procariotas. Discute temas como el tamaño y complejidad de genomas, la presencia de intrones, repeticiones y operones en diferentes organismos, así como las diferencias en empaquetamiento de ADN entre eucariontes y procariotas. Finalmente, realiza una breve comparación del genoma humano con la levadura para ilustrar estas diferencias a nivel genómico.

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    GENOMAS MODELO

    • Dado el avance en el proyecto del genoma humano


    se logró secuenciar diversos organismos que
    actualmente se usan como modelos.
    • C. elegans
    • Drosophila melanogaster
    • Arabidopsis thaliana
    • Plasmodium faciparum
    • E. Coli
    • Los organismos los podemos dividir
    • Eucariontes→ Endomembranas, mitocondrias y
    cloroplastos. Se incluyen animales, plantas, hongos y
    protozoarios.
    • Procariontes→ no presentan compartimentos internos.
    • Bacterias- Gram (+/-), cianobacterias
    • Arqueas- Condiciones extremas. Hipoxia, Temperaturas
    altas, etc.
    GENOMAS EUCARIONTES
    Organización genómica eucarionte
    • El tamaño del genoma varía del organismo
    • Pequeño- > Mb
    • Mayor <100,000 Mb

    • Se espera que el tamaño del genoma este asociado al nivel


    de complejidad del organismo. Sin embargo, no se
    encuentra una asociación directa.
    • La paradoja del valor C( C-value paradox)- No existe
    correlación entre el tamaño del genoma y el número de
    genes entre eucariontes
    Comparación del
    genoma eucarionte
    • Segmento de 50 kb del
    segmento que codifica para el
    receptor de células T-B.
    • Si comparamos a la levadura.
    • *El genoma de la levadura
    muestra más genes que el
    humano
    • * Pocas regiones
    Comparación del
    genoma eucarionte
    • *El genoma de la levadura
    muestra más genes que el
    humano
    • El cromosoma III codifica para
    RNAt y proteínas
    • * Pocas regiones discontinuas
    • El genoma de la levadura solo
    presenta 239 intrones
    • El humano presenta 300,000
    • *Se presentan pocas regiones de
    repetidos
    • LTR- Ty2
    • El total del repetidos del genoma
    es 3.4%
    • Humano 44%
    C-Value Paradox
    No existe un incremento del
    tamaño del genoma con respecto a
    la complejidad del organismo.
    GENOMAS
    PROCARIONTES
    • EL genoma procarionte carece en su
    mayoría de espacios entre los genes
    • -thrA,thrB,thrC
    • Operon – Serie de genes adyacentes
    en el genoma bacteriano que son
    transcritos al mismo tiempo bajo el
    mismo promotor y regulación
    • No hay presencia de intrones – Todo
    el genoma bacteriano es continuo.
    • No existe un semejante a las
    estructuras de repetidos en tándem
    como en los eucariontes.
    • * Posen secuencia de Inserción (IS1)
    • Son regiones transposables que
    permiten la inserción o transferencia
    de genoma entre organismos.
    Secuencias de Inserción (IS1)
    • Son regiones o elementos transposables en la bacteria
    • Esta región codifica genes para transposasas que permiten la movilización e
    inserción
    • Tamaño 768 bp hasta 5 kb
    • La primera se encuentro en el operan galactosa de E.Coli
    Genoma procarionte
    • DNA circular
    • Presenta 1 solo cromosoma
    • DNA extracromosomico
    • Lineal e independiente
    • Circular

    • El genoma de Borrelia burgdorferi B31 es un


    cromosoma lineal de 9112 kb→ 853 genes
    • + 17/18 genes lineares y circulares que agregan
    430 gees
    GENOMA EUCARIONTE
    Empaquetamiento de
    ADN
    • Cada especie tiene su propio
    numero de cromosomas
    • Los genes se encuentran
    segmentados
    • Se encuentra Ploidismo
    • Haploide (1n)
    • Diploide (2n)
    • Poliproide (>3n)
    Empaquetamiento de
    ADN
    • Cada especie tiene su propio
    numero de cromosomas
    • Los genes se encuentran
    segmentados
    • Se encuentra Ploidismo
    • Haploide (1n)
    • Diploide (2n)
    • Poliproide (>3n)

    • Humano presenta células


    somáticas 2n= 46 cromosomas
    • Se encuentran diversa
    disposición de los centrómeros
    • Telocentric
    • Acrocentric
    • Metacentric

    • Telomero: Region final del


    corosomoma
    • Histonas

    • DNA da 1.6 vueltas al complejo (~147 pb)


    • Formación de Nucleosoma

    • Región entre dos nucleosomas “espaciador” (~200) Región no protegida por las histonas

    • Histona H1 estabiliza el complejo


    Cromosomas
    Tinción
    Giemsa
    Clasificación por
    dominios

    • La identificación de
    secuencias de
    aminoácidos permite
    identificar regiones
    conservadas entre
    proteínas, intuyendo la
    funcionalidad de la
    misma.
    Grb7 SH2 domain structure and interactions with a cyclic
    10.1186/1472-6807-7-58 peptide inhibitor of cancer cell migration and proliferation
    Comparación del catalogo genético entre
    diversos organismos

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