Organización, Replicación, Reparación Del Dna

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ORGANIZACIÓN, DUPLICACIÓN Y

REPARACIÓN DEL DNA.


PRESENTACIONES DE DNA y
constituyentes químicos.
Estructura química de un
nucleótido, base química del DNA

fosfato
purina

ribosa

fosfato
Fosfatofosfato
ORGANIZACIÓN DEL DNA

• El DNA está recubierto con proteínas, que da lugar a la


formación de la cromatina.
• La información genética puede transmitirse por una
replicación exacta, o ser intercambiada por diversos
procesos: entrecruzamiento, recombinación,
transposición y conversión, que aseguran la adaptabilidad
y la diversidad del organismo. Cuando estos procesos se
alteran causan enfermedades.
• La replicación sigue ambas direcciones, mediante varias
enzimas, mediante las reglas de Watson y Crick.
• Las mutaciones se deben a cambios en la secuencia de
bases de DNA, durante la replicación, movimiento o
reparación defectuosa del DNA.
Las mutaciones…..
• Constituyen cambios en la secuencia de bases del DNA,
por resultado de duplicación defectuosa, del movimiento
o reparación del DNA.
• Una mutación en la célula germinal se transmitirá a los
descendientes.
• Diversos factores aumentan la incidencia de las
mutaciones: virus, sustancias químicas, luz U.V,
radiación ionizante
• La mayor parte de los tumores cancerosos, son efectos
combinados de la transmisión vertical, horizontal.
DNA Y CROMOSOMAS La cromatina es el material
Cromosómico extraído de
Los núcleos celulares.
• Es una hélice de doble
cadena presente en la
cromatina de cada uno de
los cromosomas.
• Tiene una longitud, miles
de veces superior al
diámetro del núcleo
celular.
• Está asociado con
histonas: nucleosomas.
CROMATINA

• Corresponde a las moléculas de DNA de doble


cadena muy largas y de una masa similar a las
histonas.
• Así mismo a moléculas ácidas que son enzimas
de replicación: topoisomerasas, RNA polimerasas
y una pequeña cantidad de RNA.
• Las histonas condensan el DNA.
• Las partículas esféricas densas de la cromatina
se conocen como nucleosomas-
Funciones de las histonas

• Activan o desactivan la transcripción de los


genes.
• Ensamblado cromosómico durante la replicación
del DNA.
• Condensación de los cromosomas durante el
ciclo de replicación.
• Reparación del DNA.
• El enrrollamiento del DNA en las histonas, da
lugar a los nucleosomas.
• Las histonas son: HI, H2A, H2B, H3, H4
NUCLEOSOMAS: Tiene 146 pares de bases
dispuestos en giros supe-helicoidales, en
contacto con una -histona -octamérica.

Su ensamble está mediado por una proteína, la


nucleoplasmina, otorgando un ambiente iónico.
Estructura de una fibra de cromatina: fibrilla
y fibra de cromatina.
Regiones de la cromatina:

• La cromatina que contiene genes activos,


es una región activa. El DNA en esta zona
contiene cerca de 100 000 bases, son
sensibles a la digestión de DNA-asa I.
• La cromatina de las regiones no activas
está empacada de manera densa, es la
hetero-cromatina.
Organización del DNA…

• El DNA se organiza en cromosomas.


• Durante la metafase, los cromosomas
tienen un par de cromátidas hermanas
idénticas, conectadas mediante un
centrómero, una región rica en A-T, se
une a varias proteínas (cinetocoro), es el
sitio de unión para el uso mitótico
Organización del DNA en los cromosomas:
El cromosoma tiene cromátidas hermanas, centrómero.

Los telómeros son ricos en secuencias TG, se


extienden por varias kilo-bases.
La telomerasa es responsable de la síntesis y de
mantener su respectiva longitud.
El acortamiento del telómero se vincula con una
transformación maligna y el envejecimiento, la
telomerasa es el blanco de sustancias quimio-
terapeúticas contra el cáncer.
130 pares de bases
En cada cromátida está el DNA de doble cadena.

Cada una de las 23 cromátidas puede contener


1.3x108 nucleótidos en una molécula de DNA.
Regiones de codificación:

• Las regiones de codificación del DNA, cuyos


transcritos aparecen en el citoplasma como
moléculas de mRNA, son interrumpidas en el
genoma por grandes secuencias intermedias de
DNA no codificante.
• Las secuencias modificantes de un mRNA,
queson removidos para formar mRNA maduro.
• Las secuencias codificantes están interrumpidas
por las secuencias no codificantes (intrones). Las
regiones de codificación: exones.
DNA y secuencias:
La secuencias pueden ser únicas o no repetitivas, consiste
en una sola copia de genes que codifican para las
proteínas. Más de la mitad del DNA son de este tipo de
secuencias.

El DNA y sus secuencia repetitiva consisten en secuencias


que varían en el número de copias desde dos hasta 107
copias por célula. En el hígado y en el riñón se expresa
entre 10 000 y 15 000 genes. Corresponde al 20 a 30%
del genoma. Estas son moderamente repetitivas,
altamente repetitivas.
Secuencias altamente repetitivas:

• Tienen 5 a 500 pares de bases, repetidas


muchas veces, se encuentran en el centrómero y
telómeros del cromosoma. Están en 1 a 10
millones de copias por genoma haploide.
• Las secuencias moderamente repetitivas tienen
menos de 106 copias por genoma, están
intercaladas entre secuencias únicas, se
transcriben por polimerasa II.
Secuencias moderadamente repetitivas……

• Se clasifican en: secuencias repetidas


intercaladas grandes: LINE; secuencias repetidas
intercaladas cortas: SINE
• Ambas surgen de una transposición, mediante
transcriptasa reversa, que transcribe un molde
de RNA a DNA.
• Las secuencias repetitivas microsatelitales
existen en forma dispersa y agrupada, con 2 a 6
pares de bases repetidas.
ALTERACIÓN Y REORDENAMIENTO DEL
MATERIAL GENÉTICO

Una alteración en la secuencia de las bases de purina, pirimidina


en un gen, debida a un cambio: una eliminación o una inserción
de una o más bases, puede resultar en un producto genético
anormal, que generalmente es una proteína, por tanto es una
mutación.
El reordenamiento del material genético se realiza de diferentes
formas:
1.- La recombinación de los cromosomas es una forma de
reordenamiento del material genético, a través de un intercambio
de información genética exacta entre los cromosomas homólogos
o similares, principalmente durante la meiosis celular mediante
una alineación casi exacta, se produce un proceso de cruce.
Proceso de entrecruzamiento:

Alineación de
cromosomas
homólogos.

Entrecruzamiento

Reordenamiento
Material genético
Hemoglobina Lepore anti-Lepore

Entrecruzamiento desigual
entre los cromosomas
Otras características:

• Un cromosoma puede recibir menor


material genético: una deleción. El otro
par de cromosoma recibe más material
genético: inserción o duplicación.
• Un entrecruzamiento desigual sucede en
la hemoglobina Lepore y anti-Lepore
• Sucede un intercambio desigual de
información.
La integración cromosómica ocurre con
algunos virus:

Algunos virus bacterianos, pueden


recombinarse con el DNA de un
huésped bacteriano, de tal manera que
se incorpora en forma lineal, que es una
forma de recombinación.

A, B, C, genoma
del bacteriófago

1, 2, genomas
del huésped.

Recombinación de la
Información.
2.-Transposición, produce genes
procesados.

• Elementos pequeños del DNA, que no son virus,


se transponen al entrar o salir del genoma del
huésped, afectando las secuencias vecinas del
DNA, se nombran como DNA saltador, es el caso
de los retrovirus.
• Los retrovirus tienen capacidad para moverse
dentro y fuera del genoma humano.
3.- La conversión génica produce nuevos
arreglos:

Este mecanismo puede inducir cambios rápidos en


el material genético.
Secuencia similares en los cromosomas homólogos
y no homólogos pueden emparejarse y eliminar
cualquier secuencia diferente entre ellos.
Conduce a una reparación accidental, de
secuencias homogéneas de DNA repetitivo.
SÍNTESIS Y DUPLICACIÓN DEL DNA

• Facilita la provisión de una progenie con la


información genética de los padres.
• Se cuenta con las experiencias en E. Coli,
que involucra a 30 proteínas diferentes.
(Komberg). Participa la DNA polimerasa I,
que requiere de trifosfato de los cuatro
desoxirribonucleótidos, cuya reacción sea
la polimerización.
El ciclo celular: La fase sintética, está
relacionada con la fase S, durante la
mitosis:
Replicación..

• La replicación puede ocurrir sólo en un molde de


DNA de una sola cadena (ccDNA).
• Existen mecanismos que identifican el sitio de
iniciación de la replicación para desenrrollar el
DNA de doble cadena (dcDNA) en esa región.
• El dcDNA debe reformar de manera precisa la
estructura de la cromatina incluyendo los
nucleosomas.
Pasos en la replicación del DNA

• Identificación de los orígenes de la replicación.


• Desenrrollamiento del dcDNA para proporcionar
un molde ccDNA.
• Formación de una horquilla de replicación.
• Inicio de la síntesis de DNA y elongación.
• Formación de burbujas de replicación en
segmentos de DNA recién sintetizados.
• Reconstitución de la estructura de la cromatina.
• Las enzimas que participan: Polimerasa,
helicasa, primasa
Origen de la replicación:

• Una asociación de proteínas, se unen a


secuencias específicas de dcDNA con una serie
de secuencias del DNA de repetición directa.
• La desnaturalización y desenrrollamiento de una
región de DNA rica en A-T.
• Se identifican las secuencias de replicación
autónoma (SRA), elemento de origen de
replicación (EOR), el complejo de origen de
replicación (COR).
Desenrrollamiento del DNA:

• La DNA helicasa inicia el desenrrollamiento


de DNA.
• Las proteínas de unión del DNA de una
sola cadena (SSB) estabilizan el complejo.,
contribuye al desenrrollamiento y una
replicación activa.
Formación de la horquilla de replicación:

• La horquilla de replicación consiste de cuatro


componentes que se forman de la siguiente
forma: DNA helicasa desenrrolla un segmento
corto de DNA dúplex progenitor. Una primasa
inicia la síntesis de RNA, para preparar la síntesis
de DNA. La DNA polomerasa inicia la síntesis de
la cadena hija naciente. Las SSB se unen a la
ccDNA e impiden el reanillamiento prematuro del
ccDNA a dcDNA.
Iniciación y elongación de la síntesis del
DNA.

1.Se requiere del cebado


Por un tramo corto de
RNA, de 10 a 200
nucleótidos.
1 Desprendimiento de
1 pirofosfato.
Apareamiento de bases.
Los segmentos de DNA
unidos a un RNA:
fragmentos de Okazaki.
Fragmentos de Okazaki:
Se sintetizan varios
fragmentos en
secuencia para formar
las horquillas de
replicación.

La helicasa actúa en la
cadena retardada para
desenrrollar el dcDNA
en dirección 5´a 3´
Formación de ampollas de replicación

Procede de orígenes múltiples


en un periodo de 9 horas.

Ocurre en ambas direcciones


a lo largo del cromosoma.

Ambas cadenas se replican


simultáneamente, que genera
una burbuja de replicación.
TIPOS DE DAÑO AL DNA

• El daño es causado por agentes


ambientales, físicos y químicos, se
clasifican en cuatro grupos:
1.- Alteración de una sola base.
2.- Alteración de dos bases
3.- Roturas en la cadena.
4.- Entrecruzamientos.
EL DNA DAÑADO SE REPARA POR ENZIMAS.

• La integridad de la información en las moléculas


de DNA es importante para la sobrevivencia de
las especies.
• Las especies han desarrollado mecanismos para
la reparación de daños en el DNA, ocurridos por
errores en la replicación a causa de las
agresiones ambientales.
• Los errores de replicación son las causas de
mutaciones.
• Los daños se corrigen por los siguientes
mecanismos:
1. Reparación del mal apareamiento de
bases

Problema: error
en una sola
copia: una sola
base o lazos de
2 a 5 bases sin
pares.

Solución:
Digestión por
exonucleasa y
reemplazo.
2.Reparación por escición de bases.

Problema: Daño
espontáneo, químico,
por radiación de una
sola base.

Solución: Eliminación
de la base por una N-
glucosilasa,
eliminación de azúcar
sin base, reemplazo.
3. Reparación de nucleótidos por escición.

Problema: Daño
espontáneo, químico
o por radiación a un
segmento de DNA.
Solución: Eliminación
y reemplazo de un
oligómero de unos 30
nucleótidos

Exicinucleasa

Polimerasa
4.- Reparación de la rotura en la
cadena doble.

Problema: Radiación ionizante,


quimioterapia, radicales libres,
oxidantes.

Solución: Sinapsis, desenrrollamiento,


alineación. Ligadura.

Ku: proteína de 70
subunidades.
PK: Proteincinasa.

DNA-Ligasa

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