Clase 2 Metabolismo - JS - 2020
Clase 2 Metabolismo - JS - 2020
Clase 2 Metabolismo - JS - 2020
de los procariotas
Microbiología e Inmunología
2020
Dr. Javier Santos
El O2 se libera en la atmósfera
El Fe2+ se oxida a Fe3+
Metabolismo fototrófico
El resultado es similar al obtenido a través
de la respiración
-Cadena de electrones
-Generación de una fuerza
protón-motriz (gradiente
de protones)
-Su uso para impulsar la
síntesis de ATP.
-Generación de NADH
(poder reductor para
Biosíntesis
Algunos fotótrofos usan
La mayoría de los fotótrofos
compuestos orgánicos
utilizan energía conservada en ATP
-Fotofosforilación para la asimilación de CO2 como
fuente de carbono para la
-Poder reductor biosíntesis.
El proceso de fotosíntesis
/ Gemmatimonadetes
- La fotosíntesis
bacteriana y la
fototrofía están
distribuidas en siete
grupos.
- Hay diferencias en la
complejidad a nivel
molecular.
Science 311, 1283 (2006) Natl Acad Sci U S A. 2014 May 27;111(21):7795-800
Distribución de la fotosíntesis en Archaea
Halobacterium
salinarum
Bacteriorodopsina
El proceso requiere de la absorción de fotones por parte de pigmentos
Chlamydomonas (alga
verde)
Vs.
Rhodopseudomonas palustris
(bacteria púrpura, Metabolismo para la
Alphaproteobacteria) ¡¡Importante!! biosíntesis de
525 y 475 nm: carotenoides bacterioclorofilas.
Espectros de absorción de pigmentos bacterianos
Eficiencia en la captación
de luz.
Aprovechamiento del
espectro.
La energía
capturada por los
carotenoides es
transferida a la
bacterioclorofila
En fotótrofos
anoxigénicos
Membranas fotosintéticas de proteobacterias (alfa)
(bacterias púrpuras no del azufre)
Phaeospirillum molischianum
Vía de transferencia de energía proteobacterias (alfa)
(bacterias púrpuras no del azufre)
(anoxigénicas)
LHI en naranja
El centro de
Detalle de Antena LHII
reacción en
azul
Fotosistema II
LHII en verde
Rhodobacter sphaeroides
Condiciones de crecimiento:
-Fotótrofas anaeróbicas
(fotoheterótrofas y fotoautótrofas)
-Fermentación y la respiración
aerobia y anaerobia. Estructura del complejo antena
Vía de transferencia de energía en proteobacterias (gamma)
Centro de
reacción
Periplasma
Citoplasma
Mejores dadores de
Características generales del proceso fotosintético electrones
mV RC II (ex)
-570
+1260 RC II (basal)
Mejores aceptores de
-320 mV (NADP+ / NADPH) electrones
Absorción y transferencia de energía por resonancia
¿Qué ocurre
en la antena?
17
El proceso de absorción y la separación de cargas fotoinducida
La densidad electrónica se
redistribuye desde las regiones
en azul hacia las regiones en
rojo (una región con un
faltante en azul y y otra, la roja,
con mayor densidad que en el
estado basal)
Si existe un aceptor de
electrones, el electrón es
transferido, generando
una carga positiva neta
en la clorofila y una carga
negativa en el aceptor.
El complejo fotosintético
maximiza la separación
de cargas fotoinducida y
minimiza el retorno del
electrón al estado basal
Un donor de electrones
garantiza que D+ vuelva
su estado de neutralidad
D+ es muy oxidante
(tiende a reducirse)
19
Características generales del proceso fotosintético
El tiempo de vida de los estados excitados es de nano-
-La energía electrónica de los estados segundos.
excitados debe convertirse rápido en
Las reacciones químicas en las células ocurren en escalas de
una forma de energia mas “durable”. tiempo bien distintas.
Generación de moléculas
intermediarias
En los centros de
-Poder reductor: NADPH o NADH
reacción + cadena
Fotosíntesis de transorte -Energía: síntesis de ATP acoplada a
anoxigénica gradiente de protones
RC II
-El ciclo de quinonas
produce un bombeo
efectivo de H+
No cíclica
(de la cadena respiratoria)
RC II
NAD+/NADH
NAD+/NADH (-0.32V)
(-0.32V)
H2S
H2S
-Ferredoxina es
soluble y puede
+
Mejores
reducir al NAD+
FNR
Ferredoxina
Dominio de
unión al NADP+
Chlorobi
Chlorobaculum tepidum
(C) Los glicosil diacilgliceroles (rojo) tienen una alta afinidad por
los pigmentos incorporados y se particionan en su vecindad
Cianobacterias
Fotosíntesis oxigénica
El flujo de electrones en Mejores
fotótrofos oxigenicos procede a dadores de
través de dos centros distintos electrones
Cianobacterias en forma interconectada
phycoerythrin
phycocyanin
allophycocyanin
Es un heterodímero.
-Subunidades D1 and D2 (en rojo y
celeste).
-CP43 y CP47 son proteínas de
unión a clorofila, antenas (verde)
-Proteína que estabiliza al cluster
de manganeso (azul).
-Clorofilas (verde)
-Feofitinas (azul)
-Fe2+ (naranja)
-Quinonas QA y QB (rosa)
-Manganeso oxígeno y calcio en
violeta, rojo y amarillo
Cianobacterias
(Thermosynechococcus vulcanus) 32
-Se captan
protones en el
Fotosistema II
estroma. Estroma (-) 2 H+
-Se liberan
PQA e- e- PQB
protones en el Fe PQ + 2 H+
lumen e-
Pheo Pheo PQH2
e-
-Dos moléculas
Chl Chl
de agua se e- P680
oxidan a O2. Se ChlZD1
libera oxígeno
e- Chl Chl ChlZD2
TyrZ TyrD
Fotosíntesis
oxigénica
e-
O2+4H+ CaMnO4 Lumen o espacio tilacoide
D1 D2 (+)
PsbO h𝜈
2H2O
33
Fotosíntesis en bacterias
Fotosíntesis oxigénica
Fotosíntesis
anoxigénica
RC Tipo II
Fotosíntesis
anoxigénica Fotosistema I
RC Tipo I
Fotosistema II
34
Distribución de la fotosíntesis en Bacteria
Transferencia horizontal
Aceptan
electrones
Divergencia de la estructura y función del centro de reacción
Cada RC conserva un subconjunto de las funciones del
centro de reacción original:
Regulación de la
expresión
Regulación de la
expresión
dependiendo de
las condiciones
ambientales
(redox)
Retención de los
genes para centros
de tipo I y tipo II en
un solo genoma
Fotosíntesis anoxigénica vs. oxigénica:
versatilidad en cianobacterias
La reacción global
puede estar limitada
por un desbalance
en:
-Pool de quinonas
-Las Plastocianinas
-Citocromos
La cinética de PSII es
-NADP+
limitada por el pool
de quinonas
-Ajustan la estequiometria de
fotosistemas para maximizar la
utilización de la energía luminosa
disponible.
QH2 Q
Chlorobium
Distribución de la fotosíntesis en Archaea
Las haloarqueas
http://amser.org/index.php?P=AMSER--
Archaea Morphology, Physiology ,Biochemistry and ResourceFrame&resourceId=11279
Applications Book · April 2015
Archaea Morphology, Physiology ,Biochemistry and
Applications Book · April 2015
Bacteriorodopsina
Retinal:
Reacciona con la
luz produciendo
cambios
conformacionales
que derivan en un
gradiente de
protones a lo
largo de la
membrana que
les permite la
síntesis de ATP
(monómero) acoplando una
retinal ATPsintasa
Bacteriorodopsina
(2019) Science 365: 61-65 Estructura cuaternaria:
trímero
Cambios conformacionales de la Bacteriorodopsina
Representación de
algunos de los cambios
conformacionales en
bacteriorodopsina
asociados con el
movimiento de protones
en el foto ciclo.
Bioenergetics 4
Puntos importantes de esta clase:
-La fotosíntesis evolucionó en bacterias. Existe la fotosíntesis anoxigénica (lineal y también cíclica). Los
fotosistemas o centros de reacción tienen un ancestro común. Hay transferencia horizontal de genes.
-El proceso depende de grupos que cambian su tendencia a ceder electrones con la absorción de energía lumínica.
La eficiencia de los procesos se incrementa con otros pigmentos y sistemas antena capaces de transferir energía.
-Puede darse el flujo inverso de electrones hacia la reducción del NAD+ o de fumarato.
-En procesos cíclicos mediados por RCII es posible la incorporación de electrones provenientes de compuestos del
azufre o del hierro (luego provistos por el pool de quinonas en la membrana).
-Las cianobacterias son el único grupo (Philum) que presenta fotosíntesis oxigénica y está mediada por dos
fotosistemas. Sin embargo, son capaces de realizar fotosíntesis anoxigénica y fotosíntesis cíclica.
-En Archaea el mecanismo de aprovechamiento de la energía lumínica no depende de clorofilas sino de cambios
en la molécula de retinal (cis-trans) acoplados a cambios en estados de protonación de la ”bacteriorodopsina”.
Lynn Margulis
Estroma
H+
(pH 8)
Transporte de
electrones: QH2
Es un proceso oxigénico
H+ 62
Función del Fotosistema II
-Se captan Estroma (-) 2 H+
protones en el
estroma. PQA e- e- PQB
Fe PQ + 2 H+
e-
-Se liberan Pheo Pheo PQH2
protones en el
lumen e-
Chl Chl
e- P680
ChlZD1
-Dos moléculas e- Chl Chl ChlZD2
de agua se TyrZ TyrD
oxidan a O2. Se
libera oxígeno e-
Fotosíntesis
O2+4H+ CaMnO4 Lumen o espacio tilacoide
oxigénica D1 D2 (+)
PsbO h𝜈
2H2O
63
El complejo de evolución de oxígeno
H H
Ciclo catalítico comprende 4 O
OH
oxidaciones sucesivas y una H Mn3(4)
OH
etapa evolución del O2 H O Ca O Mn3(3)
O
Mn4(2)
O
O Mn4(1)
O 3(4)
OH2
O Mn
OH
O
La clave del funcionamiento es poder almacenar Ca Mn3(3)
O
estados intermedios de oxidación sin liberar especies Mn3(2)
O
reactivas de oxígeno radicalarias (OH*, O2*- etc.)
O Mn4(1)
(+)
espacio
tilacoide
Cys
His
Cu
Met
His
Plastocianina:
PDB ID: 1JXF
-La PC contiene cobre:
Cu2+ (estado oxidado)
Cu1+ (reducido)
-Es una proteína pequeña
(17kDa)
67
Estructura del fotosistema I
Es un supercomplejo de 14
2Fe-2S
10.6 Å subunidades
2Fe-2S -núcleo: subunidades pasA (83kDa)
y psaB (82kDa)
12.5 Å
-Par especial de moléculas de
2Fe-2S clorofila a (absorción max: 700nm).
PQ Quinona en centro A1
6.8Å
Clusteres 2Fe-2S coordindados por
ChlA residuos de Cys.
ChlA
-Ferredoxina que transfiere
electrones al NADP+ y lo reduce a
ChlA NADPH
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Función del fotosistema I
La absorción de
Estroma
radiación
electromagnética
(700nm)
Deriva en la
transferencia
electrónica desde
la plastocianina
Espacio tilacoide hacia la ferredoxina
69