ACS Biochemie-Studienvorbereitung

Download as docx, pdf, or txt
Download as docx, pdf, or txt
You are on page 1of 13

ACS-Studienvorbereitung

Die verschiedenen Techniken der DNA-Technologie kennen (Kapitel 9)


 Gel-Blotting ist eine Technik zur Visualisierung einer bestimmten Teilmenge von
Makromolekülen – Proteinen oder DNA- oder RNA-Fragmenten –, die zunächst in einer
komplexen Mischung vorhanden sind
 Die Schritte beim Gel-Blotting sind,
1. Trennung der Moleküle durch Elektrophorese. Dies geschieht in einem Gel, das es den
Molekülen ermöglicht, unter dem Einfluss eines elektrischen Feldes zu wandern
2. Die resultierende Elektrophorese wird dann mit einem Nitrozellulosefilter "getupft". Die
Moleküle haften fest am Filter und behalten ihre relative Position bei, wenn sie im
nächsten Schritt mit Flüssigkeit geflutet werden
3. Der Filter wird dann mit einer Lösung gebadet, die eine "Sonde" enthält
 Die Sonde kombiniert sich spezifisch mit den Zielmolekülen, also denjenigen, die
Sie suchen
 Die Sonde trägt ein Visualisierungsmittel (entweder einen radioaktiven oder
fluoreszierenden Marker)
 Das Verfahren zum Nachweis von DNA-Fragmenten, die eine bestimmte Sequenz enthalten, ist
wie folgt
1. DNA wird aus der Zelle extrahiert
2. Die DNA wird teilweise durch eine Restriktionsendonuklease – auch Restriktionsenzyme
genannt - verdaut, die DNA an bestimmten Sequenzen (Erkennungssequenzen oder
Restriktionsstellen) erkennen und spalten, um eine Reihe kleinerer Fragmente zu
erzeugen
3. Die erhaltenen DNA-Fragmente werden elektrophoretisch aufgetrennt und
anschließend zu einzelsträngigen Molekülen (ssDNA) denaturiert
4. Ohne ihre Positionen zu verändern, werden die getrennten Banden der ssDNA auf einen
Nitrozellulosefilter übertragen und einer radioaktiv markierten cDNA oder RNA
ausgesetzt
5. Wenn die Sonde komplementäre DNA-Sequenzen nachweist, bindet sie an diese
 Die verschiedenen Arten von Blots sind wie folgt:
Durch
Elektrophorese
Art des Blots Sonde
abgetrennte
Moleküle
Südlich ssDNA cDNA oder RNA
Nördlich denaturierte RNA RNA oder cDNA
Western Eiweiß Antikörper
http://users.rcn.com/jkimball.ma.ultranet/BiologyPages/G/GelBlotting.html
 Der Northern Blot ist eine Technik, die in der molekularbiologischen Forschung verwendet wird,
um die Genexpression durch den Nachweis von RNA (oder isolierter mRNA) in einer Probe zu
untersuchen
 Die Gelelektrophorese ist eine Technik zur Trennung von DNA-, RNA- oder Proteinmolekülen
unter Verwendung eines elektrischen Feldes, das an eine Gelmatrix angelegt wird
 Die Polymerase-Kettenreaktion (PCR) beinhaltet die Amplifizierung spezifischer DNA-Sequenzen
o Der Prozess beinhaltet die Amplifizierung der Anzahl der Kopien eines bestimmten DNA-
Segments
o Es ist eine Technik in der Molekularbiologie, um eine einzelne oder wenige Kopien eines
DNA-Stücks über mehrere Größenordnungen hinweg zu amplifizieren und Tausende bis
Millionen von Kopien einer bestimmten DNA-Sequenz zu erzeugen
o Das Verfahren beinhaltet und beruht auf thermischen Zyklen, die aus Zyklen des
wiederholten Erhitzens und Abkühlens der Reaktion für das DNA-Schmelzen und die
enzymatische Replikation der DNA bestehen. Primer (kurze DNA-Fragmente), die zur
Zielregion komplementäre Sequenzen zusammen mit einer DNA-Polymerase enthalten,
sind Schlüsselkomponenten, um eine selektive und wiederholte Amplifikation zu
ermöglichen
o Mit fortschreitender PCR wird die erzeugte DNA selbst als Template für die Replikation
verwendet, wodurch eine Kettenreaktion in Gang gesetzt wird, bei der das DNA-
Template exponentiell amplifiziert wird
1. DNA-Stränge werden durch Erhitzen getrennt
2. Die DNA-Stränge werden auf einen Überschuss an kurzen synthetischen DNA-
Primern geglüht, die die zu amplifizierende Region flankieren
3. Neue DNA wird durch Polymerisation synthetisiert

Den genetischen Aspekt der Biochemie kennen


 Ein Triplett-Codon in einer Nukleinsäuresequenz spezifiziert normalerweise eine einzelne
Aminosäure
 Der genetische Code definiert eine Zuordnung zwischen Trinukleotidsequenzen, sogenannten
Codons, und Aminosäuren
 DNA (Desoxyribonukleinsäure) ist eine Nukleinsäure, die die genetischen Anweisungen enthält,
die bei der Entwicklung und Funktion aller bekannten lebenden Organismen und einiger Viren
verwendet werden
o Die Hauptrolle von DNA-Molekülen ist die langfristige Speicherung von Informationen
o DNA besteht aus zwei langen Polymeren aus einfachen Einheiten, den sogenannten
Nukleotiden, mit Rückgrat aus Zuckern und Phosphatgruppen, die durch Esterbindungen
verbunden sind
o Die beiden Stränge verlaufen gegenläufig zueinander und sind daher antiparallel
o An jeden Zucker ist eine von vier Arten von Molekülen gebunden, die als Basen
bezeichnet werden
o Es ist die Reihenfolge dieser vier Basen entlang des Backbones, die Informationen
kodiert
o Diese Information wird anhand des genetischen Codes gelesen, der die Reihenfolge der
Aminosäuren innerhalb von Proteinen angibt
 RNA (Ribonukleinsäure) ist eine biologisch wichtige Art von Molekül, das aus einer langen Kette
von Nukleotideinheiten besteht
o Jede Nukleotideinheit besteht aus einer stickstoffhaltigen Base, einem Ribosezucker und
einem Phosphat
o RNA wird von DNA durch Enzyme, die RNA-Polymerasen genannt werden, transkribiert
und in der Regel von anderen Enzymen weiterverarbeitet
o RNA ist von zentraler Bedeutung für die Proteinsynthese
 Unterschiede zwischen RNA und DNA
o RNA ist in der Regel einzelsträngig, während DNA in der Regel doppelsträngig ist
 RNA eine viel kürzere Kette von Nukleotiden
o RNA-Nukleotide enthalten Ribose, während DNA Desoxyribose enthält (eine Art Ribose,
der ein Sauerstoffatom fehlt)
 Diese Hydroxylgruppen machen RNA weniger stabil als DNA, da sie anfälliger für
Hydrolyse ist
o RNA hat die Base Uracil, während DNA die Base Thymin hat
 Die komplementäre Base zu Adenin ist nicht Thymin, da es DNA ist, sondern
Uracil, eine unmethylierte Form von Thymin
 Ribosomale RNAs (rRNAs) sind Bestandteile von Ribosomen, den Komplexen, die die Synthese
von Proteinen durchführen
 Messenger-RNAs (mRNAs) sind Vermittler, die genetische Informationen von einem oder
wenigen Genen zu einem Ribosom führen, wo die entsprechenden Proteine synthetisiert
werden können
 Transfer-RNAs (tRNAs) sind Adaptermoleküle, die die Informationen in der mRNA getreu in eine
bestimmte Aminosäuresequenz übersetzen

Wissen, was Okazaki-Fragmente sind


 Okazaki-Fragmente sind relativ kurze DNA-Fragmente (ohne RNA-Primer am 5’ -Terminus), die
während DNA-Fragmenten auf dem nacheilenden Strang erzeugt werden
o Wenn der nacheilende Strang auf dem ursprünglichen Strang repliziert wird, muss das
5’-3’ -Muster verwendet werden; somit tritt eine kleine Diskontinuität auf und ein
Okazaki-Fragment bildet sich
o Diese Fragmente werden von der Replikationsmaschine zu einem kontinuierlichen DNA-
Strang und damit zu einer vollständigen Tochter-DNA-Helix verarbeitet
o Bei der Synthese komplementärer DNA-Stränge liest der entstehende führende Strang
immer 3’ bis 5’. Der antiparallele Komplementstrang, der entstehende nacheilende
Strang, liest 5’ bis 3’
 Da die ursprünglichen DNA-Stränge antiparallel sind und aufgrund der 5 '-3' -
Polarität der DNA-Polymerasen nur ein kontinuierlicher neuer Strang am 3’ -
Ende des führenden Strangs synthetisiert werden kann, muss der andere Strang
diskontinuierlich in die entgegengesetzte Richtung wachsen
 In Bezug auf den nacheilenden Strang ist das Ergebnis der diskontinuierlichen
Replikation dieses Strangs die Produktion einer Reihe kurzer DNA-Abschnitte,
die Okazaki-Fragmente genannt werden
 Jedes Okazaki-Fragment wird in der Nähe der Replikationsgabel an einem durch
eine Primase erzeugten RNA-Primer initiiert und durch DNA-Polymerase III
verlängert

Konservativ versus semikonservativ


 Die DNA-Replikation ist semikonservativ
o Jeder DNA-Strang dient als Vorlage für die Synthese eines neuen Strangs und produziert
zwei neue DNA-Moleküle mit jeweils einem neuen Strang und einem alten Strang
o Die halbkonservative Replikation würde zwei Kopien erzeugen, die jeweils einen der
ursprünglichen Stränge und einen neuen Strang enthielten
o Eine konservative Replikation würde die beiden ursprünglichen Template-DNA-Stränge
in einer Doppelhelix zusammenlassen und eine Kopie erzeugen, die aus zwei neuen
Strängen besteht, die alle neuen DNA-Basenpaare enthalten
Wissen über Enzyme und restriktive Enzyme
 Enzyme sind Proteine, die chemische Reaktionen katalysieren (erhöhen)
o Bei enzymatischen Reaktionen werden die Moleküle zu Beginn des Prozesses als
Substrate bezeichnet, und das Enzym wandelt sie in verschiedene Moleküle um, die als
Produkte bezeichnet werden
o Enzyme wirken als Katalysator und wirken, indem sie die Aktivierungsenergie für eine
Reaktion senken und so die Geschwindigkeit der Reaktion erhöhen
o Enzymaktivität kann durch andere Moleküle beeinflusst werden
 Inhibitoren sind Moleküle, die die Enzymaktivität verringern, Aktivatoren sind
Moleküle, die die Enzymaktivität erhöhen
 Medikamente und Gifte sind Enzyminhibitoren
 Die Aktivität wird durch Temperatur, chemische Umgebung und die
Substratkonzentration beeinflusst
o Enzyme sind sehr spezifisch, welche Reaktionen sie katalysieren, und die Substrate, die
an diesen Reaktionen beteiligt sind
 Komplementäre Größe, Ladung und hydrophile/hydrophobe Eigenschaften von
Enzymen und Substraten sind für diese Spezifität verantwortlich
 Cofaktoren sind Bestandteile von Enzymen, die einige Enzyme benötigen. Diese Nicht-Protein-
Moleküle sind für die Aktivität an einige Enzyme gebunden
 Coenzyme sind kleine organische Moleküle, die chemische Gruppen von einem Enzym zum
anderen transportieren
 Restriktionsenzyme oder Restriktionsendonuklease ist ein Enzym, das doppelsträngige oder
einzelne DNA an spezifischen Erkennungsnukleotidsequenzen schneidet, die als
Restriktionsstellen bekannt sind

Wissen über Hybridisierung


 DNA-Hybridisierung ist die Entnahme von zwei DNA-Proben, die verglichen werden sollen. Sie
werden durch Erhitzen vollständig denaturiert. Wenn dann zwei Lösungen gemischt und
langsam abgekühlt werden, assoziieren sich DNA-Stränge jeder Probe mit ihrem normalen
komplementären Partner und tempern, um Duplexe zu bilden. Wenn die beiden DNAs eine
signifikante Sequenzähnlichkeit aufweisen, neigen sie auch dazu, partielle Duplexe oder Hybride
miteinander zu bilden. Je größer die Sequenzähnlichkeit zwischen den beiden DNAs ist, desto
größer ist die Anzahl der gebildeten Hybride
Proteine und ihre Wechselwirkungen kennen
 Proteine sind organische Verbindungen aus Aminosäuren, die in einer linearen Kette
angeordnet und in eine kugelförmige Form gefaltet sind
 Die Aminosäuren in einem Polymer sind durch die Peptidbindungen zwischen den Carboxyl- und
Aminogruppen benachbarter Aminosäurereste miteinander verbunden
 Die Sequenz von Aminosäuren in einem Protein wird durch die Sequenz eines Gens definiert,
das im genetischen Code
 Protein-Protein-Wechselwirkungen beinhalten nicht nur die direkte Kontaktassoziation von
Proteinmolekülen, sondern auch langreichweitige Wechselwirkungen durch das Elektrolyt,
wässriges Lösungsmedium, das benachbarte hydratisierte Proteine umgibt
o Die Wechselwirkungen zwischen Proteinen sind für die meisten biologischen Funktionen
wichtig

PH, pI, pK kennen


 pH (Potential für Wasserstoffionenkonzentration) ist ein Maß für die Säure oder Basizität einer
Lösung
 pI (isoelektrischer Punkt, isoelektrischer pH-Wert) ist der charakteristische pH-Wert, bei dem
die elektrische Nettoladung 0 beträgt
 pK (Säure-Dissoziationskonstante) ist ein quantitatives Maß für die Stärke einer Säure in
Lösung. Es ist die Gleichgewichtskonstante für eine chemische Reaktion, die als Dissoziation im
Rahmen von Säure-Base-Reaktionen bekannt ist

Hämoglobin versus Myoglobin


 Hämoglobin ist das sauerstofftragende Protein der Erythrozyten (rote Blutkörperchen)
o Die Sauerstofftransportkapazität ist abhängig von vier Eisenionen
 Myoglobin ist ein sauerstoffbindendes Protein im Muskelgewebe
 Es ist der Hämanteil des Eisens, der sowohl den roten Blutkörperchen als auch den roten
Muskeln ihre Farbe verleiht
 Im Blut ist es das Hämoglobin, das Eisen enthält, und in Muskelzellen enthält das Myoglobin das
Eisen
 Rote Blutkörperchen enthalten Hämoglobin, nicht Myoglobin, und so ist es Hämoglobin, das den
roten Blutkörperchen ihre Farbe verleiht

Intermolekulare Kräfte kennen


 Intermolekulare Kräfte sind Kräfte, die zwischen stabilen Molekülen oder zwischen
funktionellen Gruppen von Makromolekülen wirken
o beinhaltet momentane Anziehungskräfte zwischen Molekülen, zweiatomigen freien
Elementen und einzelnen Atomen
o diese Kräfte, insbesondere Londoner Dispersionskräfte, Dipol-Dipol-Wechselwirkungen
und Wasserstoffbrückenbindungen, sind deutlich schwächer als ionische oder kovalente
Bindungen, haben aber immer noch eine spürbare chemische Wirkung
o intermolekulare Kräfte sind auf Unterschiede in der Ladungsdichte in Molekülen
zurückzuführen

Wissen über Aminosäureseitenketten


 Aminosäuren sind Moleküle, die eine Amingruppe, eine Carbonsäuregruppe und eine
Seitenkette enthalten, die zwischen verschiedenen Aminosäuren variiert
o Diese Seitenketten können in der Größe von nur einem Wasserstoffatom in Glycin über
eine Methylgruppe in Alanin bis hin zu einer großen heterocyclischen Gruppe in
Tryptophan variieren
o Aminosäuren werden in der Regel nach den Eigenschaften ihrer Seitenketten in vier
Gruppen eingeteilt
 Die Seitenkette kann eine Aminosäure zu einer schwachen Säure oder einer
schwachen Base machen und ein Hydrophil, wenn die Seitenkette polar ist, oder
ein Hydrophob, wenn sie unpolar ist

Kennen die Techniken der Proteintrennung


 Säulenchromatographie nutzt Unterschiede in Proteinladung, Größe, Bindungsaffinität und
anderen Eigenschaften
 Kationenaustauschchromatographie weist die feste Matrix negativ geladene Gruppen auf. In
der mobilen Phase wandern Proteine mit einer positiven Nettoladung langsam durch die Matrix
als solche mit einer negativen Nettoladung, weil die Migration der ersteren durch
Wechselwirkung mit der stationären Phase mehr verzögert wird
 Die Größenausschlusschromatographie trennt Proteine nach Größe. Bei dieser Methode treten
große Proteine früher aus der Säule als kleine – ein etwas kontraintuitives Ergebnis
o Die feste Phase besteht aus Perlen mit künstlichen Poren oder Hohlräumen einer
bestimmten Größe
o Große Proteine können nicht in die Hohlräume gelangen und nehmen daher einen
kurzen und schnellen Weg durch die Säule, um die Perlen herum
o Kleine Proteine dringen in die Hohlräume ein und wandern langsamer durch die Säule
 Die Affinitätschromatographie basiert auf der Bindungsaffinität eines Proteins. Die Perlen in der
Säule haben eine kovalent gebundene chemische Gruppe. Ein Protein mit Affinität für diese
bestimmte chemische Gruppe bindet an die Perlen in der Säule und seine Migration wird
dadurch verzögert
 HLPC (High Performance Liquid Chromatography) verwendet Hochdruckpumpen, die die
Bewegung der Proteinmoleküle die Säule hinunter beschleunigen, sowie qualitativ
hochwertigere chromatographische Materialien, die der Druckkraft des unter Druck stehenden
Flusses standhalten können
o HLPC kann die diffusionale Ausbreitung von Proteinbanden begrenzen und so die
Auflösung stark verbessern

Wissen über die NMR


 Die Kernspinresonanz (NMR) ist ein Verfahren zur Bestimmung der dreidimensionalen
Strukturen von Makromolekülen
o Es ist die Eigenschaft, die magnetische Kerne in einem Magnetfeld haben, das
elektromagnetische Impulse oder Impulse anlegt, die dazu führen, dass die Kerne
Energie aus dem EM-Impuls absorbieren und diese Energie wieder abstrahlen
o Die zurückgestrahlte Energie hat eine bestimmte Resonanzfrequenz, die von der Stärke
des Magnetfeldes und anderen Faktoren abhängt

Wissen über das Massenspektrometer


 Massenspektrometrie ist eine analytische Technik zur Bestimmung der elementaren
Zusammensetzung einer Probe oder eines Moleküls
o Das MS-Prinzip besteht darin, chemische Verbindungen zu ionisieren, um geladene
Moleküle oder Molekülfragmente zu erzeugen, und deren Masse-Ladungs-Verhältnisse
zu messen

RÖNTGENKRIS
 Röntgenkristallographie ist eine Methode zur Bestimmung der Anordnung von Atomen
innerhalb eines Kristalls, bei der ein Röntgenstrahl auf einen Kristall trifft und in viele bestimmte
Richtungen beugt
o Aus den Winkeln und Intensitäten dieser gebeugten Strahlen kann ein Kristallograph ein
dreidimensionales Bild der Dichte von Elektronen innerhalb des Kristalls erzeugen
o Aus dieser Elektronendichte lassen sich die mittleren Positionen der Atome im Kristall
bestimmen, sowie deren chemische Bindungen, deren Störung und diverse weitere
Informationen

Schicksal von Pyruvat


 Pyruvat ist ein Molekül, das eine wichtige Schnittstelle in mehreren Stoffwechselwegen ist
o Es kann aus Glukose durch Glykolyse hergestellt werden, versorgt lebende Zellen im
Zitronensäurekreislauf mit Energie und kann auch durch Glukoneogenese in
Kohlenhydrate, durch Acetyl-CoA in Fettsäuren oder Energie, in die Aminosäure Alanin
und in Ethanol umgewandelt werden

Wissen, was anaerobe und aerobe Bedingungen sind


 Anaerobe Bedingungen sind praktisch sauerstofffrei, und an diese Umgebungen angepasste
Mikroorganismen erhalten Energie durch Übertragung von Elektronen auf Nitrat (Bildung von
N2), Sulfat (Bildung von H2S) oder CO2 (Bildung von CH4)
 Aerobe Bedingungen haben eine reichliche Sauerstoffversorgung, und einige ansässige
Organismen beziehen Energie aus der Übertragung von Elektronen von Brennstoffmolekülen auf
Sauerstoff

Regulierung der Glukoneogenese kennen


 Während die meisten Schritte in der Glukoneogenese das Gegenteil von denen der Glykolyse
sind, werden drei regulierte und stark exergonische Reaktionen durch kinetisch günstigere
Reaktionen ersetzt
o Hexokinase/Glucokinase, Phosphofructokinase und Pyruvatkinase Enzyme der Glykolyse
werden durch Glucose-6-Phosphat, Fructose-1,6-Biphosphatase und PEP-Carboxykinase
ersetzt
o Der Großteil der für die Glukoneogenese verantwortlichen Enzyme befindet sich im
Zytoplasma
o Die Geschwindigkeit der Glukoneogenese wird letztendlich durch die Wirkung eines
Schlüsselenzyms, der Fructose-1,6-Biphosphatase, gesteuert, die auch durch
Signaltransduktion durch cAMP und dessen Phosphorylierung reguliert wird
o Acetyl CoA und Citrat aktivieren Gluconeogenese-Enzyme (Pyruvat-Carboxylase bzw.
Fructose-1,6-Biphosphatase)
 Aufgrund der gegenseitigen Kontrolle des Zyklus haben Acetyl-CoA und Citrat
auch hemmende Rollen bei der Aktivität der Pyruvatkinase
Kennen Sie die Regulierung des Zitronensäurezyklus
 Die Regulation des TCA-Zyklus wird maßgeblich durch Substratverfügbarkeit und
Produkthemmung bestimmt
 NADH, ein Produkt aller Dehydrogenasen im TCA-Zyklus (Ausnahme: Succinat-Dehydrogenase)
hemmt Pyruvat-Dehydrogenase, Isocitrat-Dehydrogenase, α-Ketoglutarat-Dehydrogenase sowie
Citrat-Synthase
 Acetyl-CoA hemmt Pyruvat-Dehydrogenase
 Succinyl-CoA hemmt Succinyl-CoAsynthease und Citrat-Synthase
 ATP hemmt Citrat-Synthase und a-Ketoglutarat-Dehydrogenase
 Calcium wird als Regulator verwendet und aktiviert Pyruvatdehydrogenase,
Isocitratdehydrogenase und a-Ketoglutaratdehydrogenase
 Citrat wird zur Feedback-Hemmung verwendet, da es die Phosphofructokinase hemmt, ein
Enzym, das an der Glykolyse beteiligt ist und die Bildung von Fructose-1,6-biphosphat, einer
Vorstufe von Pyruvat, katalysiert

Regelung der Glykolyse kennen


 Die Glykolyse wird reguliert, indem bestimmte Schritte im Glykolyseweg verlangsamt oder
beschleunigt werden
o Dies wird durch Hemmung oder Aktivierung der beteiligten Enzyme erreicht
o Jeder Schritt mit einer freien Energie nahe 0 wird nicht reguliert
o Es wird angenommen, dass ein Schritt mit einer großen negativen Änderung der freien
Energie reguliert wird

Den Pyruvat-Dehydrogenase-Komplex kennen


 Der Pyruvat-Dehydrogenase-Komplex ist ein Komplex aus drei Enzymen, die Pyruvat durch
einen Prozess namens Pyruvat-Decarboxylierung in Acetyl-CoA umwandeln
o Acetyl-CoA kann dann im Zitronensäurezyklus zur Durchführung der Zellatmung
verwendet werden, und dieser Komplex verbindet den Glykolyse-Stoffwechselweg mit
dem Zitronensäurezyklus
 Pyruvat-Decarboxylierung wird auch als "Pyruvat-Dehydrogenase-Reaktion" bezeichnet, da sie
auch die Oxidation von Pyruvat beinhaltet

Signaltransduktion kennen
 Signaltransduktion ist die Umwandlung von Informationen in eine chemische Veränderung
o Das Signal repräsentiert Informationen, die von spezifischen Rezeptoren detektiert und
in eine zelluläre Antwort umgewandelt werden, die immer einen chemischen Prozess
beinhaltet

Sekundärbotschafter kennen
 Second Messenger sind Moleküle, die Signale von Rezeptoren auf der Zelloberfläche an
Zielmoleküle innerhalb der Zelle, im Zytoplasma oder im Zellkern weiterleiten
o Sie leiten die Signale von Hormonen, Wachstumsfaktoren und anderen weiter und
verursachen eine Art Veränderung der Aktivität der Zelle
o Sie verstärken die Stärke des Signals stark
o Sekundäre Botenstoffe sind Bestandteil von Signaltransduktionskaskaden

Die Funktion der Rezeptortyrosinkinase (RTK) kennen


 Rezeptortyrosinkinasen (RTK) sind die hochaffinen Zelloberflächenrezeptoren für viele
Polypeptid-Wachstumsfaktoren, Zytokine und Hormone
o Es hat sich gezeigt, dass sie nicht nur wichtige Regulatoren normaler zellulärer Prozesse
sind, sondern auch eine entscheidende Rolle bei der Entwicklung und dem Fortschreiten
vieler Krebsarten spielen

Den Pentosephosphat-Weg kennen


 Der Pentosephosphatweg führt zur Oxidation von Glucose-6-phosphat zu Pentosephosphaten
o Es ist ein Prozess, der NADPH und Pentosen erzeugt
o Es gibt zwei verschiedene Phasen auf dem Weg
 Die erste ist die oxidative Phase, in der NADPH erzeugt wird, und die zweite ist
die nicht-oxidative Synthese von 5-Kohlenstoffzuckern
 Dieser Weg ist eine Alternative zur Glykolyse
Erkennen Enzyme des Zitronensäurezyklus
 Siehe obiges Diagramm

Den Unterschied zwischen katabolen und anabolen Stoffwechselwegen kennen


 Katabolische Bahnen bauen organische Nährstoffe in einfache Endprodukte ab, um chemische
Energie zu extrahieren und in eine für die Zelle nützliche Form umzuwandeln
 Anabole Wege beginnen mit kleinen Vorläufermolekülen und wandeln sie in zunehmend
größere und komplexere um

Übergangszustandsanaloga kennen
 Übergangszustandsanaloga sind chemische Verbindungen mit einer chemischen Struktur, die
dem Übergangszustand eines Substratmoleküls in einer enzymkatalysierten chemischen
Reaktion ähnelt
o Übergangszustandsanaloga unterliegen keiner chemischen Reaktion und können als
Enzyminhibitoren wirken, indem sie ihr aktives Zentrum blockieren

Wissen über Serinproteasen


 Serinproteasen sind Proteasen (Enzyme, die Peptidbindungen in Proteinen schneiden), bei
denen eine der Aminosäuren am aktiven Zentrum Serin ist

Wissen, was Chymotrypsin ist


 Chymotrypsin ist ein Verdauungsenzym, das eine Proteolyse durchführen kann (gerichteter
Abbau/Verdauung von Proteinen durch zelluläre Enzyme, die Proteasen genannt werden, oder
durch intramolekulare Verdauung)
o Spaltet bevorzugt Peptidamidbindungen, wobei die Carboxylseite der Amidbindung ein
Tyrosin, Tryptophan oder Phenylalanin ist
 Sie enthalten einen aromatischen Ring in ihrer Seitenkette, der in eine
hydrophobe Tasche des Enzyms passt

Was ist eine Pufferlösung?


 Eine Pufferlösung ist eine wässrige Lösung, die aus einem Gemisch einer schwachen Säure und
ihrer konjugierten Base oder einer schwachen Base und ihrer konjugierten Säure besteht

Was ist Gleichgewicht?


 Wenn sich ein System im Gleichgewicht befindet, entspricht die Geschwindigkeit der
Produktbildung genau der Geschwindigkeit, mit der das Produkt in Edukt umgewandelt wird
o Es gibt keine Nettoänderung der Konzentration von Reaktanden und Produkten; ein
stationärer Zustand wird erreicht

Was ist Phosphorylierung?


 Phosphorylierung beinhaltet die Übertragung von Phosphorylgruppen
 Der Zweck dieser hat mit Konformationsänderung zu tun
 Phosphorylierung ist die Addition einer Phosphatgruppe an ein Protein oder ein anderes
organisches Molekül
o Phosphorylierung aktiviert oder deaktiviert viele Proteinenzyme

Was ist die Elektronentransportkette?


 Eine Elektronentransportkette koppelt eine chemische Reaktion zwischen einem
Elektronendonor (wie NADH) und einem Elektronenakzeptor (wie O2) an den Transfer von H-
Ionen durch eine Membran durch eine Reihe von vermittelnden biochemischen Reaktionen
o Die H-Ionen werden verwendet, um Adenosintriphosphat (ATP) zu produzieren, das
wichtigste Zwischenprodukt in lebenden Organismen, wenn sie sich über die Membran
zurückbewegen
o ETC werden zur Energiegewinnung aus Sonnenlicht (Photosynthese) und aus
Redoxreaktionen wie der Oxidation von Zuckern (Atmung) verwendet

You might also like