L1SV - Examen ECUE3 – Biologie Moléculaire

Session 1 – Janvier 2020 - Tout document interdit

NOM : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Calculatrices programmables interdites

Prénom : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Répondre directement
N° Etudiant : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . sur la copie

Exercice I : Mots Croisés (6 pts)  0.5 pt par mot

Horizontal
2. Enzyme responsable de la synthèse de l’amorce ARN lors de la réplication - PRIMASE
5. Base azotée purique ne contenant pas de fonction cétone - ADENINE
6. Elément mobile du génome - TRANSPOSON
7. Elément ajouté en 5’ d’un ARNm lors de sa maturation - COIFFE
9. Perte de la structure tridimensionnelle d’une double hélice d’ADN - DENATURATION
10. Se dit de la terminaison Rho-indépendante de la transcription chez les procaryotes –
INTRINSEQUE ?
11. Manipulation visant à séparer des fragments d’ADN en fonction de leurs tailles -
ELECTROPHORESE
12. Se dit des régions localisées entre deux séquences codantes d’un ARNm
procaryote INTERCISTRONIQUE

Vertical
1. Substitution d’une base purique par une base pyrimidique - TRANSVERSION
3. Se dit de la propagation de l’œil de réplication dans les deux sens – BIDIRECTIONNELLE
4. Enzyme spécialisée dans l’enroulement du chromosome bactérien- Gyrase

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8. Région de l’ADN génomique située en amont d’un gène permettant le recrutement d’une ARN
polymérase - PROMOTEUR

Exercice II :
Cocher directement la case correspondant aux réponses justes (7 pts)
1pt si réponse juste, 0 si réponse fausse, et si réponse juste + fausse (alors 0 Pt)

1. Identifiez les propositions justes

a. L’adénine contient une fonction amine
b. La cytosine contient une ou plusieurs fonctions cétone
c. L’adénine contient une ou plusieurs fonctions cétone
d. L’adénine contient une fonction méthyle
e. La guanine ne contient pas de fonction cétone
⃝ a/b ⃝ b/c ⃝ c/d ⃝ d/e ⃝ a/c ⃝ a/d ⃝ a/e ⃝ b/d ⃝ b/e ⃝ c/e

2. Identifiez les propositions justes

a. Un nucléoside contient une base azotée, un sucre et un groupement phosphate
b. Un nucléotide peut contenir une base purique
c. Une base pyrimidique est reliée à un groupement phosphate grâce à une liaison
glycosidique
d. Un nucléotide est chargé négativement
e. Une base peut contenir un sucre de type ribose
⃝ a/b ⃝ b/c ⃝ c/d ⃝ d/e ⃝ a/c ⃝ a/d ⃝ a/e ⃝ b/d ⃝ b/e ⃝ c/e

3. Quel est le brin complémentaire de la séquence d’ADN suivante : 5’ GCTCATA 3’

⃝ 5’ GCTCATA 3’ ⃝ 5’ CGAGTAT 3’ ⃝ 5’ TATGAGC 3’

4. Quelle est la séquence de l’ARN issu de la transcription de la portion de double hélice

suivante sachant que le brin codant est le brin inférieur :
5’ A C T G C T A 3’
3’ T G A C G A T 5’

⃝ TGACGAT
5’ 3’ ⃝ 5’UAGCAGU3’
⃝ ACTGCTA
5’ 3’ ⃝ 5’ACUGCUA3’
⃝ UCTGCTU
5’ 3’ ⃝ 5’UGACGAU3’

5. Identifiez les propositions justes :

a. La transcription des ARNm procaryotes a lieu dans le noyau
b. La traduction des ARNm procaryotes a lieu dans le cytoplasme des cellules
c. La réparation des mutations liées à la réplication se fait principalement grâce à
l’intervention du système mutHLS chez les procaryotes
d. Le recrutement de l’ARN polymérase dépend du recrutement des facteurs
généraux de la transcription chez les eucaryotes
e. Il n’y a qu’une origine de réplication par chromosome chez les organismes
eucaryotes
⃝ a/b ⃝ b/c ⃝ c/d ⃝ d/e ⃝ a/c ⃝ a/d ⃝ a/e ⃝ b/d ⃝ b/e ⃝ c/e

6. Identifiez les propositions justes :

a. La transcription des ARNt dépend de l’ARN polymérase II chez les eucaryotes

2
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b. Le diamètre de la double hélice ADN de type B est constant quel que soit
l’organisme considéré
c. L’expérience réalisée par Hershey et Chase utilise des pneumocoques de type S
(smooth) et R (rough)
d. Une adénosine est un nucléoside contenant un ribose et une adénine
e. La température de fusion d’un ADN bicaténaire dépend exclusivement du nombre
de nucléotides qui le constitue
⃝ a/b ⃝ b/c ⃝ c/d ⃝ d/e ⃝ a/c ⃝ a/d ⃝ a/e ⃝ b/d ⃝ b/e ⃝ c/e

7. Identifiez les propositions justes :

a. Le génome humain a une forte densité génique et est constitué de chromosomes
linéaires
b. Les séquences répétées dispersées sont principalement présentes au niveau des
télomères des chromosomes eucaryotes
c. Une amorce ARN est essentielle à l’activité de l’ADN polymérase lors de la
réplication chez les procaryotes
d. La primase est l’enzyme responsable de la synthèse de l’amorce lors de la
transcription
e. Les fragments d’Okazaki sont exclusivement présents sur le brin retardé lors de la
réplication
⃝ a/b ⃝ b/c ⃝ c/d ⃝ d/e ⃝ a/c ⃝ a/d ⃝ a/e ⃝ b/d ⃝ b/e ⃝ c/e

Exercice III : (7 pts)

Partie I
Votre laboratoire de recherche a reçu 4 échantillons contenant chacun le génome de l’un des
virus suivant :
- le virus de la varicelle, virus à ADN double brin
- le Réovirus Piscine, virus à ARN double brin cause d’épidémies mortelles chez les
saumons d’élevage.
- le Coronavirus SARS-Cov2 virus à ARN simple brin responsable du Covid-19
- un Parvovirus, virus à ADN simple brin responsable du Typhus félin.
Le séquençage des échantillons a permis de déterminer la composition en bases azotés de
chacun des virus (voir tableau ci-dessous) :
A (%) T (%) G (%) C (%) U (%) Nom du Virus
Virus 1 21 0 29 29 21 Réovirus piscine
Virus 2 18 27 31 24 0 Parvovirus
Virus 3 16 16 34 34 0 Varicelle
Virus 4 21 0 26 36 17 SARS-Cov2

1 - Indiquez dans le tableau le nom de chacun des virus et justifiez ici votre réponse.
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . .
1 pt ? 0.5pts pour réponses tableau + 0.5points pour les 2 éléments de justification (type de
nucléotides + A=T, G=C pour double-brin ) . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . .. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . .
. . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

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L’échantillon du génome du virus de la Varicelle est dilué 50 fois puis une lecture de la densité
optique par spectrophotométrie indique une absorbance de 0,56.

2 – A quelle longueur d’onde est réalisée cette mesure ? 260nm – 0.5pts . . . . . . . . . . . . . . .

.. . .
3– Quelle est la concentration de l’échantillon reçu du génome de la varicelle sachant que le
Coefficient d’extinction molaire d’un ADN double brin est de 6200 M-1. cm-1
. . . . . .. . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
1 pts . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Echantillon dilué : c = A / e x l = 0.56 / 6200 * 1 = 9.03 x10-5 M. . . . .(soit 0,5 pour le calcul) . . .
. . Echantillon reçu = (9.03 x10-5) * 50 = 4.515 x 10-3 M = 4.515mM . .(soit 0,5 pour la dilution) .
. . . . . .. . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Partie II
1 – Quel est la longueur du polypeptide codé par l’ARNm dont la séquence est donnée ci-après
(justifiez votre réponse) :
5’A U C A A U G G A C C U U A C A G A A C A U A C C A U U C A C G C A G C A U G A A C G A A(n) 3’
1 pt. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . 11 AA . car 12 codons dans le cadre de lecture – le codon stop . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . .. . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. .. . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

2 - Le début de la séquence du polypeptide correspondant est Nter Meth – Asp – Leu – Thr - Glu…
Déterminez la séquence du codon et de l’anticodon utilisés ici pour l’incorporation de la leucine.

Séquence Codon : . 5’-CUU-3’. . . 0.5pts. . . . . . . . Séquence Anticodon : . .5’- AAG-3’ 0.5pts

. . . . Si pas d’orientation des brins alors 0 point . . . . . . . .

3 – Que représente A(n) mentionné sur la séquence de cet ARNm.

. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . .
Queue polyA. . . .1pts . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . . .. . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . .
4 - Comment est appelée la partie de l’ARNm qui précède ‘A(n)’
. . . . . .. . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
3’UTR / NT ?. . . . .0.5 pts . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
. . . .. . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . . .
. . . . . . . . . . .
5 – Suite à une mutation, la séquence de l’ARNm devient :
5’A U C A A U G G A C C U U A C A U A A C A U A C C A U U C A C G C A G C A U G A A C G A A(n) 3’
Indiquez la séquence du polypeptide nouvellement formé. Comment s’appelle cette mutation ?
. . . . . .. . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Mutation non-sens (insertion codon stop) : 0.5pts. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
Nter- Meth – Asp – Leu – Thr-Cter. . . . . . . 0.5pts . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .