TD Janvier 2023
TD Janvier 2023
TD Janvier 2023
Travaux dirigés
Prs. DEHBI. H & TAZZITE.A
Année Universitaire 2022-2023
Exercices
Format FASTA:
• Format de fichier le plus répandu
• Très simple
• Pratique
Séquence du gène invA de Salmonella typhimurium
format FASTA
Séquence
cible à
amplifier
(300pb)
Choisissez des amorces adéquates
Amorces déduites des séquences en amont et en aval
Que pensez vous de la séquence ces amorces?
Pour trouver la séquence reverse , on peut
utiliser:
https://www.bioinformatics.org/sms/rev_comp.html
http://reverse-complement.com
Amorce gauche
5’-TTATCGCCACGTTC
GGGCAA-3
Amorce droite
5’-CCGCCAATAAAGTT
CACAAA-3’
Tm???
Tm
• Amorce gauche: 62°C
• Amorce droite: 52 °C
Légende
>>>>>> Amorce gauche
<<<<<< Amorce droite