Les Principales Voies Du Métabolisme

27/03/2020 Les principales voies du métabolisme — Wikilivres
Les principales voies du métabolisme
Principales voies métaboliques.
Généralités
Devenir et utilisation des nutriments dans l'organisme

…
https://fr.m.wikibooks.org/wiki/Les_principales_voies_du_métabolisme 1/36
Devenir des nutriments après le repas

…
Les triglycérides :
Lieu de stockage : tissus adipeux selon 3 origines (acides gras, acides aminés et glucose)
Une fraction est oxydée dans tous les organes
Les acides aminés (A.A.) :

Source d'énergie pour le foie
Peuvent être transformés en acides gras et certains en glucose
Participation aux synthèses protéiques dans toutes les cellules
Le glucose :
Source d'énergie principale
Stockage dans le foie et les muscles
Transformation en triglycérides et stockage dans le tissus adipeux

Devenir des nutriments lors d'une période de jeûne (de courte durée)
…
Problème essentiel : maintenir la glycémie constante car le système nerveux ne peut utiliser que le glucose comme source d'énergie. Or le
glucose n'est plus absorbé au niveau du tube digestif (période de jeûne). Les sources de glucose sanguin sont au nombre de 4 : Glucose
hépatique et les 3 voies de la néoglucogenèse. Les Triglycérides sont la première source d"énergie utilisée en cas de jeûne. Si la période de
jeûne est de courte durée, les réserves de glycogène suffisent.
Si la période de jeûne est de longue durée, il se produira une protéolyse afin de transformer les acides aminés en glucose et tous les organes
(sauf le cerveau) utiliseront les acides gras comme source d'énergie afin d'épargner au maximum la glycémie.
Notions d'énergétique
…
Qu'est-ce que l'énergie ?

…
C'est la capacité à effectuer un travail. Toutefois, cette énergie existe sous deux formes : énergie cinétique (énergie de mouvement, eg : la pierre
qui tombe) ou énergie potentielle (énergie de position, eg : énergie contenue dans la pierre).
Les deux énergies sont inter-convertibles soit de façon spontanée (c'est la pierre qui tombe et qui passe de son niveau énergétique haut à son
niveau énergétique bas = réaction exergonique), soit de façon non spontanée (c'est la pierre qui remonte vers son niveau énergétique haut : il
faut pour se faire apporter de l'énergie à la pierre = réaction endergonique).
Toutefois, pour libérer l'énergie potentielle et transformer celle-ci en énergie cinétique il faut une énergie d'activation (eg : la clé que l'on tourne
dans la voiture démarre le moteur)
Unités énergétique : kJ (le kilojoule) Couplage énergétique : Les réactions endergoniques sont couplées à des réactions exergoniques.
Application avec le Glucose :

…
à corriger : fin de la réaction 38H2O + 38 ATP (il manque le 38 devant ATP)
Rendement de la réaction : (R=41,2%)
La molécule énergétique :
…
A = Adénosine (Adénine + Ribose)
T = Tri
P = Phosphate
A = Adénosine
D = Di
P = Phosphates
attention à la lecture de ce graphique : il n'y a que 2 liaisons à haut potentiel et non pas 4
Adénosine + Acide phosphorique (Pi) + 10,5 kJ ⇒ adénosine mono-phosphate + H2O
AMP + Pi + 30,5 kJ ⇒ ADP + H2O
ADP + Pi + 30,5 kJ ⇒ ATP + H2O
L'ATP (au niveau cellulaire) ne sert pas vraiment à stocker de l'énergie (dans la cellule on stocke l'énergie sous forme de glycogène) ; par contre
c'est une molécule de transfert énergétique : elle peut transporter l'énergie là où l'on en a besoin.
On a besoin de sous pour vivre. Le lieu de stockage est la banque (foie) qui stocke sous forme de lingots d'or (glycogène). Nous, on ne paye
pas en lingots mais en petites pièces (ATP). Nous dépensons en fonction de nos besoins. Nous avons besoin de ressources pour fournir l'argent
à la banque (petit-déjeuner, déjeuner…).
Les coenzymes
…
Le métabolisme énergétique (eg : réaction d'oxydation cellulaire du glucose : C6H12O6 + 6 O2 ⇒ 6 CO2 + 6 H2O) ne s'effectue pas en une seule
étape mais nécessite l'intervention de nombreuses réactions enzymatiques. Les principales étant des réactions de déshydrogénation et de
décarboxylation. Les deux réactions se font par le biais d'enzymes décarboxylases et déshydrogénases. Ces enzymes ne peuvent travailler
seules. Il leur faut l'aide de coenzymes.
Qu'est-ce qu'un coenzyme ? C'est une molécule qui aide l'enzyme à fonctionner.
NAD = Nicotinamide Adénine Dinucléotide
Nicotinamide : synthétisé par vitamine PP ou tryptophane = acide aminé essentiel
Adénine : base azotée
Dinucléotide : 2 riboses
sur le schéma : NAD (les deux en haut) et NADP (la réaction du bas)
Rappel :
…
Equation enzymatique : E+S⇒ES⇒E+P
Classes enzymatiques : oxydoréductases, transférases, hydrolases, lyases, isomérases, ligases
Certains enzymes ne travaillent qu'en présence d'une coenzyme.
Une coenzyme est une molécule organique spécifique thermostable et de faible poids moléculaire. L'ensemble enzyme & coenzyme constitue
l'holoenzyme (apoenzyme + coenzyme). La coenzyme peut être liée de façon covalente ou non à l'apoenzyme. Si la coenzyme est liée de façon
covalente on parlera de groupe prosthétique (eg : hémoglobine ⇒ le fer est le cofacteur, le coenzyme).
Les enzymes nécessitant des coenzymes sont :
Oxydoréductases
Transférases
Isomérases
Ligases
Les enzymes ne nécessitant pas de coenzymes sont :
Hydrolases
Lyases
La coenzyme est souvent envisagée comme cosubstrat de la réaction ou second substrat réactionnel :
Rôle des coenzymes comme réactifs de transfert de groupe

…
Eg : déshydrogénation ou transamination.
Équation globale : D-G+A ⇒ A-G+D
Coenzymes élémentaires
élément enzymes
Fe2+ / Fe3+ Cytochromes, peroxydases, catalases
Cu+ / Cu2+ Cytochrome oxydase, tyrosinase
Mg2+ Phosphotransférase
Mn2+ Arginase, enzyme à biotine
Zn2+ Alcool déshydrogénase, anhydrase carbonique
K+ Pyruvate kinase
Na+ Pompe sodium – potassium
Mo3+ / Mo6+ Xanthine oxydase, sulfite oxydase
Se Glutathion peroxydase
Cl- α-amylase, enzyme de conversion
Ni2+ Uréase
Ca2+ Phosphorylase kinase
Coenzymes organiques
Vitamine ou facteur de
Coenzyme et abréviation Principales fonctions
croissance apparente
COENZYMES DES OXYDOREDUCTASES
Nicotinamide-adénine-dinucléotide
(NAD)
I- Tryptophane, nicotinamide
Nicotinamide-adénine-dinucléotide-
phosphate (NADP)
Oxydoréduction (déshydrogénase, oxygénases, transporteurs
Flavine-mononuclétide (FMN)
II- Vitamine B2 ou riboflavine de la chaîne respiratoire)
Flavine-adénine-dinucléotide (FAD)
Groupement prosthétiques des

III-
cytochromes
IV- Coenzymes quinoniques (ubiquinones)
V- Tétrahydrobioptérine Aucun Hydroxylation Phe, Tyr, Trp
COENZYMES DES AUTRES CLASSES
Carboxylations, décarboxylations
1. Biotine 1. β-carboxylation
1. Biotine
I- 2. Vitamine B1 ou thiamine 2. décarboxylation d’acides α–cétoniques
2. Thiamine pyrophosphate (TPP)
3. Acide lipoïque 3. décarboxylation oxydative d'acides α-cétoniques
3. Acide lipoïque
II- Transferts de radicaux monocarbonés 1. Vitamine B12 (cobalamine) 1. Transfert de méthyle

(sauf carboxyle)
2. Méthionine 2. Transfert de méthyle
1. Méthylcobalamine
3. Acide folique 3. Transfert de tous les radicaux monocarbonés
2. S-adénosyl-méthionine
3. Tétrahydrofolate (THF)
Transfert d'acyle
III- Acide pantothénique
Coenzyme A (CoA-SH)
Nucléotides et dérivés
1. Adénosine triphosphate (ATP)

Phospho-adénosine-
1. Transfert d'énergie, P, PP et AMP
phosphosulfate (PAPS)
Transfert de sulfate
2. Uridine triphosphate (UTP)
IV- 2. Transfert d'oses
UDPGlc, UDPGal
3. Transfert d'énergie, de P
3. Guanosine triphosphate (GTP)
Transfert d'oses
GCPmannose
4. Transfert d'amines (choline, etc…)
4. Cytidine triphosphate (CTP)
CDPcholine
Métabolisme des amino-acides

V- Vitamine B6 ou pyridoxine
Phosphate de pyridoxal (PAL)
Isomérisations
VI- Vitamine B12 (cobalamine)
Adénosylcobalamine
Le métabolisme des glucides
La glycogénogenèse
…
1. 1 glucokinase (= kinase : ajoute un acide phosphorique)
2. 2 phosphoglucomutase = mutase
3. 3 UDP glucophosphorylase
4. 5 Glycogénosynthase
5. 6 enzyme branchante
Glycogénolyse
…
Seul le Glc est capable de passer la membrane cytoplasmique, G1P ou G6P sont incapables de sortir de la cellule.
1. Phosphorylase
2. Phosphoglucomutase
3. Glucose phosphatase
La glucose phosphatase n'existe que dans le foie. Dans le muscle il y a aussi une réserve de glycogène.
La glycolyse
…
S'effectue dans toutes les cellules sauf les adipocytes (utilisent les acides gras) et le foie (utilise les acides aminés).
Cet ensemble de réactions s'effectue dans le cytosol.
Glycolyse s'effectuant en milieu ANAEROBIE ( absence d'oxygène) .
Devenir des 2 molécules de pyruvate

…
Deux devenir différents suivant la situation anaérobie (O2) ou aérobie (O2).
la voie de dégradation du glucose en

pyruvate est presque universelle
(animaux,végétaux et
microorganismes)
définition:la glycolyse est la séquence de réactions enzymatiques conduisant à la transformation, dans le cytosol,du glucose en pyruvate
stratégie chimique : phosphorylation du glycose et conversion d'intermédiaires phosphorylés en composés à haut potentiel de transfert de
groupements phosphate et transfert de groupements phosphate conduisant à la synthèse d'ATP.
La chaîne respiratoire
…
(régénération des co-enzymes réduits)
Les co-enzymes sont dans la matrice mitochondriale. La chaîne respiratoire va permettre de régénérer les co-enzymes réduits.
Ces réactions d'oxydoréduction s'effectuent au niveau de la membrane interne de la mitochondrie et à l'aide d'enzymes et de coenzymes à
savoir des enzymes de transport de protons (H+) du transporteur réduit (NAD ou FAD) du O2 et d'autre part des enzymes de couplage
énergétique le tout constitue la chaîne respiratoire.
But de la chaîne respiratoire : faire passer des protons et des électrons d'un potentiel le plus électronégatif vers un potentiel le plus
électropositif.
Les protons libérés dans l'espace inter membranaire par le CoEQ ressortent vers la matrice de la mitochondrie via un complexe F0/F1.
F0 = canal protéique à protons
F1 = complexe ATP/synthétase
Le transfert des 2 protons au travers de F0 permet de faire fonctionner F1 et donc de fabriquer une molécule d'ATP dans l'espace inter-
membranaire, H+ rencontre O2 qui le capte pour former de l'eau.
Cycle de Krebs
…
Dans la matrice de la mitochondrie
Métabolisme des acides aminés
Devenir des protéines alimentaires

…
Alimentation ⇒ protéines alimentaires (végétales et animales) ⇒ acides aminés (par l'action de protéases)
Acides aminés non-indispensables, indispensables (Tryptophane, Lysine, Leucine, Isoleucine, Valine, Thréonine, Méthionine, Phénylalanine),
acides aminés pseudo indispensables (Arginine, Histidine).
Le "turn-over" des protéines tissulaires est de 1 à 2% (par jour ? information lacunaire à ce niveau). C'est à dire que 1 à 2% des protéines
tissulaires sont dégradés en acides aminés. 75% des acides aminés obtenus servent à synthétiser d'autres protéines. Le reste est soit dégradé
sous forme de déchets (urée), soit on en fait des glucides ou des corps cétoniques. Ce qui signifie que la perte nette journalière en protéines est
de 30/40g. Pertes en azote de 5 à 7g/jour.
Il n'y a pas de stockage d'acides aminés.
Bilan de N : équilibre : entrées = sorties
Mais parfois ce bilan peut être positif Entrée > Sortie
(eg : femme enceinte, nourrisson, adolescent)
Ou bien peut être négatif Entrée < Sortie
(eg : personnes atteintes de maladies nutritionnelles ; anorexie, Kwashiorkor)
Catabolisme des acides aminés

…
Désamination oxydative
…
Réaction de transamination
…
réaction de transfert de la fonction amine
Attention à gauche: le deuxième acide est un acide cétonique
Réaction de décarboxylation
…
Couplage désamination-transamination
…
Devenir de l'ammoniac
…
Cycle de l'urée : consomme 4 molécules d'ATP par molécule d'urée synthétisée
Cette voie est consommatrice d'ATP : l'organisme doit dépenser de l'énergie pour ce processus de détoxication.
Bilan énergétique : - 4 ATP / molécule d'urée synthétisée.
Le métabolisme des lipides
Acides Gras : entrent dans un cycle de β-oxydation au niveau de la matrice mitochondriale β-oxydation des acides gras (matrice
mitochondriale), les réactions se font en chaîne et on l'appelle "hélice de Lynen".
Bilan : pour un acide gras en C18 (18/2=9 ; 9-1=8; 8 tours d'hélice)
pour un C24 : 12-1= 197 ATP
eg : lorsque l'on mange une religieuse au chocolat et que l'on ne dépense pas ce sucre par un footing, le glucose ne se dirige pas vers le Cycle
de Krebs mais vers les Acides Gras. Il y a conservation d'un peu de sucre pour fabriquer du glycérol (glycérol + 3 acides gras = triglycéride).
La transformation du glucose en acides gras + glycérol = triglycéride s'appelle la lipogenèse (a lieu dans le foie et les tissus adipeux).

Les Principales Voies Du Métabolisme - Wikilivres

Transféré par

Droits d'auteur :

Formats disponibles

Les Principales Voies Du Métabolisme - Wikilivres

Transféré par

Informations du document

Titre original

Copyright

Formats disponibles

Partager ce document

Partager ou intégrer le document

Options de partage

Avez-vous trouvé ce document utile ?

Ce contenu est-il inapproprié ?

Droits d'auteur :

Formats disponibles

Les Principales Voies Du Métabolisme - Wikilivres

Transféré par

Droits d'auteur :

Formats disponibles

27/03/2020 Les principales voies du métabolisme — Wikilivres

Principales voies métaboliques.

Devenir et utilisation des nutriments dans l'organisme

Devenir des nutriments après le repas

Une fraction est oxydée dans tous les organes

Les acides aminés (A.A.) :

Peuvent être transformés en acides gras et certains en glucose

Participation aux synthèses protéiques dans toutes les cellules

Stockage dans le foie et les muscles

Transformation en triglycérides et stockage dans le tissus adipeux

Qu'est-ce que l'énergie ?

Application avec le Glucose :

à corriger : fin de la réaction 38H2O + 38 ATP (il manque le 38 devant ATP)

Rendement de la réaction : (R=41,2%)

Adénosine + Acide phosphorique (Pi) + 10,5 kJ ⇒ adénosine mono-phosphate + H2O

AMP + Pi + 30,5 kJ ⇒ ADP + H2O

ADP + Pi + 30,5 kJ ⇒ ATP + H2O

NAD = Nicotinamide Adénine Dinucléotide

Nicotinamide : synthétisé par vitamine PP ou tryptophane = acide aminé essentiel

Adénine : base azotée

Classes enzymatiques : oxydoréductases, transférases, hydrolases, lyases, isomérases, ligases

Certains enzymes ne travaillent qu'en présence d'une coenzyme.

Les enzymes nécessitant des coenzymes sont :

Les enzymes ne nécessitant pas de coenzymes sont :

Rôle des coenzymes comme réactifs de transfert de groupe

Équation globale : D-G+A ⇒ A-G+D

Fe2+ / Fe3+ Cytochromes, peroxydases, catalases

Cu+ / Cu2+ Cytochrome oxydase, tyrosinase

Mn2+ Arginase, enzyme à biotine

Zn2+ Alcool déshydrogénase, anhydrase carbonique

Na+ Pompe sodium – potassium

Mo3+ / Mo6+ Xanthine oxydase, sulfite oxydase

Cl- α-amylase, enzyme de conversion

Ca2+ Phosphorylase kinase

COENZYMES DES OXYDOREDUCTASES

Groupement prosthétiques des

IV- Coenzymes quinoniques (ubiquinones)

V- Tétrahydrobioptérine Aucun Hydroxylation Phe, Tyr, Trp

COENZYMES DES AUTRES CLASSES

II- Transferts de radicaux monocarbonés 1. Vitamine B12 (cobalamine) 1. Transfert de méthyle

Métabolisme des amino-acides

Le métabolisme des glucides

1. 1 glucokinase (= kinase : ajoute un acide phosphorique)

Cet ensemble de réactions s'effectue dans le cytosol.

Glycolyse s'effectuant en milieu ANAEROBIE ( absence d'oxygène) .

Devenir des 2 molécules de pyruvate

la voie de dégradation du glucose en

F0 = canal protéique à protons

Métabolisme des acides aminés

Devenir des protéines alimentaires

Il n'y a pas de stockage d'acides aminés.

Bilan de N : équilibre : entrées = sorties

Mais parfois ce bilan peut être positif Entrée > Sortie

(eg : femme enceinte, nourrisson, adolescent)

Ou bien peut être négatif Entrée < Sortie

(eg : personnes atteintes de maladies nutritionnelles ; anorexie, Kwashiorkor)

Catabolisme des acides aminés

Attention à gauche: le deuxième acide est un acide cétonique