6 - Metabolitos Primarios y Secundarios

Metabolitos primarios y
secundarios
Metabolitos Primarios y
Secundarios
Sustrato de
Sustrato de crecimiento
crecimiento
Células Metabolito
Primario
Células Metabolito
Primario
Metabolito
Las células y el metabolito se producen Secundario
más o menos simultáneamente
Después de producidas las células y el
metabolito primario, las células
convierten el metabolito primario en uno
secundario
Características de los metabolitos
primarios
• Esenciales para la estructura y funciones biológicas
• Están directamente asociados a crecimiento y

reproducción
•Moléculas generalmente sencillas.
•Son casi idénticos en todos los organismos.
•Son más baratos y sencillos de producir.
•Poca “actividad biológica”

1. Componentes esenciales de microorganismos:
proteínas, ácidos nucleicos, polisacáridos, ácidos
grasos (insaturados), esteroles.
2. Derivados del metabolismo intermedio: azúcares

(fructosa, ribosa), ácidos orgánicos (ácido láctico,
cítrico, acético, succínico, fumárico), alcoholes
(xilitol, etanol, butanol), aminoácidos (Lys, Glu, Trp,
Phe), vitaminas (B2, B12), nucleótidos,
saborizantes (ácidos inocínico y guanílico),
polisacáridos y poliésteres de reserva.
Características de los
metabolitos secundarios
• Específicos de un grupo de organismos
• Moléculas complejas
• No esenciales para el crecimiento
• Dependiente de las condiciones de crecimiento

• Producidos como grupo de estructuras
relacionadas:
– Una cepa de Streptomyces produce 32
antibióticos distintos del tipo antraciclina
• Puede obtenerse una superproducción

espectacular
•Son muy variados y su estructura es fuertemente
dependiente de la especie y variedad utilizada para su
producción.
•Se generan en condiciones particulares y son más

valiosos y complicados de producir, alto contenido de
“actividad biológica”
• Generalmente son productos especiales (alto precio).
Funcionan en los organismos que los producen
como:
• 1. Armas contra otros microorganismos (antibióticos,

toxinas, inhibidores enzimáticos, pesticidas)
• 2. Factores de crecimiento (hormonas)
• 3. Ionóforos
• 4. Agentes de interacción microbiana
• 5. Efectores externos
Productos microbianos
• Metabolitos primarios y secundarios
Relaciones entre metabolismo
primario y secundario
• Tetraciclina: 72 pasos
• Eritromicina: 25 pasos
• Vías que se desprenden
del metabolismo primario
• Compuestos producidos
en la vías principales del
metabolismo
Relaciones entre metabolitos
primarios y secundarios
Pentosa (C5) Ácido kójico
Metabolitos secundarios
Glucosa (C6) Sacáridos
Glucósidos
aromáticos Tetrosa (C4)
Aminoaácidos aromáticos Sikimato (C7) Triosa (C3) Serina (C3N) Glicocola (C3N)
CO2 C1-pool
Policétidos (nC2) Alanina (C3N)
CO2 Piruvato (C3) Valina (C5N)
CO2
Malonato (C3) Acetato (C2) Mevalonato (C6) Pirofosfato de isopentenilo ( C5)

Ácidos grasos (nC2) CO2
Terpenos/Esteroides (nC5)
Metabolitos
secundarios
Oxalacetato (C4) Citrato (C6)
Metabolitos CO2
secundarios CO2
a-cetoglutarato (C5)
Ácido glutámico (C5N)

Vía metabólica primaria para la síntesis de
aminoácidos y metabolitos secundarios
Glucosa
Eritrosa Fosfoenol-piruvato
Metabolito
primario
3-Desoli-7-fosfo
D-arabinoheptulosonato Metabolito
secundario
Ansamicina
Rifamicina Ácido shikímico
Piocianina
Candicidina Ácido
Nistatina Ácido corísmico Triptófano
antranílico
Cloranfenicol
Actinomicina
Nocardicina Ácido prefénico
Polimixina Fenilalanina Tirosina Novobiocina

Regulación del metabolismo
primario
• Inducción por sustrato
• Represión e inhibición feedback
• Represión por catabolitos
• Regulación por ATP
• Regulación es un proceso dinámico

dependiente de la concentración de las
moléculas efectoras.
Inducción por sustrato
• Enzimas constitutivas: concentración
independiente de la presencia del sustrato
– [] =síntesis/destrucción
• Enzimas inducibles: se producen cuando

el sustrato o análogos están presentes.
– Una enzima o grupo
– Depende de la concentración de sustrato
Regulación feedback
• Represión a nivel genético para controlar
la síntesis de la enzima o grupo.
• Inhibición actúa a nivel molecular para

controlar la actividad de la enzima.
• Regulación feedback depende de la

concentración del producto.
Regulación de la producción
• Represor
Represor Inactivo
Arginina
Represor activo
argC argB argH
Promotor
Regulación por retroalimentacion
Regulación catabólica
• Sustratos de uso rápido
• Fuentes de C
• Fuentes de N
• Depende de la proporción a la cual se

metabolicen los catabolitos e involucra la
concentración y el estado energético de la
célula.
Regulación por ATP
• No muy clara
• Relacionada con la energía de

activación de las enzimas que
intervienen en la reacción.
Regulación en metabolitos
secundarios
Regulación feedback
• Acumulación del MS: inhibición e inducción
• Metabolitos primarios precursores se regulan así

mismos inhibiendo la síntesis de MS.
• Metabolitos primarios en una vía ramificada

puede disminuir o inhibir el flujo en la otra vía
inhibiendo un paso común
Represión por catabolitos
• La síntesis de la enzima se reprime por la
presencia de sustratos de rápido consumo
para crecimiento.
• Fuentes de C y/o N.
• Relacionada con la proporción a la cual

los catabolitos son metabolizados. (ξ y [])
Represión por C
• Glucosa y otras fuentes de C de
metabolismo rápido inhiben la producción
neomicina, bacitracina, penicilina,
prodigiosina, cefalosporina.
• S. antibioticus: actinomicina
Glucosa y galactosa
• Otras ftes de C con los mismos efectos:

citrato
Represión catabolica
• Fuentes de carbono, no deben añadirse
en exceso
• Pequeños incrementos
• Diferentes fuentes de C
Represión del metabolismo secundario por componentes del medio
Componente del medio Metabolito secudario reprimido
Glucosa Penicilina
Glucosa Actinomicina
Glucosa Neomicina
Glucosa Estroptomicina
Fosfato Candicidina
Fosfato Estreptomicina
Fosfato Tetraciclina
Fuentes de nitrógeno Penicilina
Represión por Nitrogeno y Fosfato
• Disminuyen severamente la producción de
antibióticos
• P: inhibe la transcripción de genes
• Omura: metal que se une a P y lo libera

lentamente.
Presencia de iones
• Streptomyces aureofaciens produce
tetraciclina cuando el medio carece de Fe.
• Zinc, Hierro, Magnesio, Manganeso, Cloro,

Calcio, Cobalto, Cobre, Molibdeno
Regulación por ATP
• Carga energética
• Relación entre la inhibición o la activación

de una reacción. Energía de activación
para que se de una reacción en una vía
metabólica.
Regulación por ATP
• Reacciones enzimáticas involucran la
transferencia de energía.
• Activación o inhibición de enzimas por los

niveles de ATP, ADP y AMP en la célula.
• Altas cargas energéticas inhiben unas

enzimas y activan otras.
Regulación por ATP
• Relacionado con la regulación por P
• Producción de tetraciclina comienza

cuando disminuyen los niveles de P.
• Altas cargas energéticas inhiben

producción de algunos metabolitos
secundarios: tetraciclina, vancomicina,
neomicina…
Otros ej. de efectos del metabolismo
primario en el secundario
• Triptofano induce la ergolina en Claviceps

– Precursor y como inductor de enzimas
– Se agrega durante la fase de crecimiento
• Metionina induce Cefalosporina

Criterios
• Inducción del MS requiere la adición de la molécula
efectora antes de la síntesis
• El MP tenga un efecto estimulante separado de una

función de precursor
• Análogos del efector deberían ser capaces de

reemplazar la molécula en cuestión
• Debería observarse un incremento en las

concentraciones del metabolito efector o sus derivados
antes de la producción de las enzimas para MS
Funciones de los MS
Actividades:
• Actividad antibiótica
• Actividad en animales
– Toxicidad: Blanco son vías metabólicas primarias
comunes.
– Citotoxicidad: selectiva
– Actividad insecticida: patógenos
– Actividad nematicida
– Actividad farmacológica
– Actividad inmunológica
• Actividad en plantas
– Sustancias tóxicas producidas por
patógenos: herbicidas
– Promotores de crecimiento
• Inhibidores de enzimas
• Kinasa C y factores de agregación de
plaquetas
• Autorreguladores
• Surfactantes: lipopeptidos, lipoproteínas,
glicolipidos.
• Absorción de luz.
Evidencias para función
• Complejidad estructural
• Enzimas especificas
• Regulación: ambientes favorables,
estimulación
• Secreción del producto
• Tolerancia del productor
• Organización genética
Funciones globales
• Productos de desecho: no existe sistema
secretor. Control de la predación
• Productos detoxificantes
• Metabolitos “shunt”
• Productos de mantenimiento metabólico

Funciones individuales
Funciones intrínsecas
• Sustancias de reserva
• Precursores de componentes
estructurales
• Capturadores de minerales
• Señales de diferenciación
• Agentes morfogeneticos
Funciones individuales
Funciones extrínsecas
• Disuasión ecológica
• Agentes patogénicos
• Agentes de simbiosis
• Farmacológicos y otros
Biosíntesis
• Vías multipasos desde precursores hasta
metabolitos específicos
• Enzimas especificas algunas con una

amplia especificidad: familias
• Genes codificando para enzimas especificas
envueltas en la biosíntesis de MS están
localizadas en clusters en el cromosoma
bacteriano o en plásmidos.
• En organismos eucariotes en diferentes

cromosomas
• Existe ligamiento entre los genes de las vías

biosinteticas y los de resistencia

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Metabolitos primarios y

• Esenciales para la estructura y funciones biológicas

• Están directamente asociados a crecimiento y

•Son casi idénticos en todos los organismos.

•Son más baratos y sencillos de producir.

•Poca “actividad biológica”

2. Derivados del metabolismo intermedio: azúcares

• Específicos de un grupo de organismos

• No esenciales para el crecimiento

• Dependiente de las condiciones de crecimiento

• Puede obtenerse una superproducción

•Se generan en condiciones particulares y son más

• 1. Armas contra otros microorganismos (antibióticos,

Malonato (C3) Acetato (C2) Mevalonato (C6) Pirofosfato de isopentenilo ( C5)

Oxalacetato (C4) Citrato (C6)

Ácido glutámico (C5N)

Polimixina Fenilalanina Tirosina Novobiocina

• Regulación es un proceso dinámico

• Enzimas inducibles: se producen cuando

• Inhibición actúa a nivel molecular para

• Regulación feedback depende de la

• Sustratos de uso rápido

• Depende de la proporción a la cual se

• Relacionada con la energía de

• Metabolitos primarios precursores se regulan así

• Metabolitos primarios en una vía ramificada

• Relacionada con la proporción a la cual

• Otras ftes de C con los mismos efectos:

• P: inhibe la transcripción de genes

• Omura: metal que se une a P y lo libera

• Zinc, Hierro, Magnesio, Manganeso, Cloro,

• Relación entre la inhibición o la activación

• Activación o inhibición de enzimas por los

• Altas cargas energéticas inhiben unas

• Producción de tetraciclina comienza

• Altas cargas energéticas inhiben

• Triptofano induce la ergolina en Claviceps

• Metionina induce Cefalosporina

• El MP tenga un efecto estimulante separado de una

• Análogos del efector deberían ser capaces de

• Debería observarse un incremento en las

• Productos de mantenimiento metabólico

• Enzimas especificas algunas con una

• En organismos eucariotes en diferentes

• Existe ligamiento entre los genes de las vías

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