Microbiota

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Introducción a la

Microbiota Humana
Dr. en C. Moisés Ramos Solano

19 de mayo 2017
¿Microbiota o Microbioma?

MICROBIOTA MICROBIOMA

Bacterias Conjunto de
Hongos genes de la
Parásitos microbiota
¿Virus?
Publicaciones en PubMed Relacionadas con
Microbiota

Lagier et al, Front. Cell. Infect. Microbiol., 02 November 2012


¿Qué Es Un Ser
Humano?

Somos metaorganismos,
resultado de milenios de
coevolución con un gran numero
de microrganismos simbiontes
que viven en nuestro cuerpo
Ser Humano en el árbol
de la vida
• La evolución de todos los
organismos multicelulares
esta intimamente asociada a
los microorganismos

• ¿Sistema Inmune?

Homo sapiens hace 195,000 años


Microorganismos como enemigos

Edward Jenner
1796 Robert Koch
1883
Louis Pasteur
1864
Era de los antibióticos

Alexander Fleming
1928
1942 1943
1955 1957
Producción masiva de Aislamiento de
Tetraciclina patentada Nistatina patentada
penicilina Estreptomicina
Guerra contra los microorganismos
Efectos colaterales del uso de antibióticos

Se estima que un
niño de EUA llega a
los 20 años ha
recibido de 10 a 20
tratamientos de
antibióticos
Teoría de la higiene (inmunología)

Microbiota Microbiota
mas menos
compleja compleja

Wills-Karp et al, Nature Reviews Immunology 1, 69-75 (October 2001)


Leche materna y microbiota

Cabrera-Rubio et al, Am J Clin Nutr September 2012 vol. 96 no. 3 544-551


Leche materna, via de nacimiento y
microbiota

Cabrera-Rubio et al, Am J Clin Nutr September 2012 vol. 96 no. 3 544-551


Microbiota de la madre despues del
nacimiento y lactancia

Cabrera-Rubio et al, Am J Clin Nutr September 2012 vol. 96 no. 3 544-551


Inicio de esta relación benéfica de por vida

Albenberg and Wu, Gastroenterology 2014;146:1564–1572


Diferencias regionales en la microbiota

Yatsunenko et al, Nature 486, 222–227 (14 June 2012)


Diferentes poblaciones en diferentes sitios
anatómicos

Scheithauer et al, Molecular Metabolism 5 (2016) 759e770


Interacción de la microbiota con el hospedero

¿Sistema Inmune?

Albenberg and Wu, Gastroenterology 2014;146:1564–1572


Disbiosis

Round and Mazmanian, 9, 313-323 (May 2009)


Clostridium difficile
SIMBIOSIS

DISBIOSIS
Funciones generales de la microbiota
• Sintetizar y modificar vitaminas Metabolismo
• Prevenir la colonización por Obesidad
Resistencia a la Insulina
patógenos
• Eliminar bacterias extrañas al
ambiente humano
MICROBIOTA
• Estimular el crecimiento y
funcionamiento correcto de Inflamación Comportamiento
algunos tejidos Enfermedad Inflamatoria
Intestinal
Temperamento
Humor
• Estimular al sistema inmune Síndrome de Colon Irritable
Metabolismo
Transferencia de Microbiota
• No hay diferencia en la abundancia de
bacterias
• La composición de la microbiota de
los sujetos de estudio cambio hacia la
de los sujetos delgados
• La sensibilidad a la insulina mejoró a
las 6 semanas en pacientes con SM
después del TF

Vrieze et al, Gastroenterology 2012;143:913–916


Obesidad asociada al balance de Firmicutes y
Bacteroidetes
Phylum Bacteroidetes Phylum Firmicutes
Obesidad asociada al balance de Firmicutes y
Bacteroidetes
Síndrome de Intestino Irritable
• Alteraciones en la concentración de ácido biliar por la composición de la
microbiota, altera el volumen y la consistencia de las heces.

• La microbiota afecta los procesos de fermentación y producción de gases


en intestino

• La presencia de antibióticos, prebióticos y probióticos alteran los síntomas


clínicos de los síntomas del SII

• El eje Cerebro-Intestino se puede alterar por la composición de la


microbiota
Microbiota y el eje Cerebro-Intestino

Foster and Neufeld, Trends in Neurosciences May 2013, Vol. 36, No. 5
Microbiota y el eje Cerebro-Intestino

Foster and Neufeld, Trends in Neurosciences May 2013, Vol. 36, No. 5
¿Cómo se determina la composición de la
microbiota?

SECUENCIACIÓN
Lagier et al, Front. Cell. Infect. Microbiol., 02 November 2012
rRNA 16S

Conservado en procariontes y archea

En hongos se utilizan los ITS


(Internal Transcribed Spacer)
Secuenciación de Sanger - 1975

- Muy costosa
- Demasiado tiempo
- Demasiado tiempo hombre
Carrera a la secuenciación de organismos

• 1995: Primera bacteria secuenciada (Haemophilusinfluenzae)


• 2000: Drosophila melanogaster
• 2003: Genoma Humano… fue necesaria otra tecnología
Secuenciación de Siguiente Generación
Secuenciación de Siguiente Generación

Ventajas:
Construcción de una biblioteca de
información (seguridad)

No clonación bacteriana

Alto grado de paralelismo

Más resultados en menor tiempo


Datos, datos y mas datos…

• Genoma humano = 18,000 genes


6 mil millones de pares de bases

• Microbiota intestinal humana = 3.3 millones de genes


567 mil millones de pares de bases
Probióticos
• Son productos con organismos vivos que cuando se ingieren en
cantidades adecuadas confieren beneficios a la salud

• Bifidobacterias y Lactobacilos

• Sobreviven al estomago y duodeno


Cultivos vivos (comida)
• Primeros indicios de comidas preservadas por fermentación en China
(7000 años)

• Diversidad – Se han aislado hasta 200 microorganismos de una


porción de kimchi

• Coevolución
Lagier et al, Front. Cell. Infect. Microbiol., 02 November 2012
Scheithauer et al, Molecular Metabolism 5 (2016) 759e770
Preguntas que surgen…
• ¿Qué especies (~400 – 500) se podrían manipular para restablecer
una microbiota optima?
• ¿Qué tipo de microbiota encontramos en los mexicanos?
• ¿La composición de la microbiota del mexicano cambia de acuerdo a
la región?
• ¿Cómo se modifica la microbiota en los pacientes VIH+ mexicanos?
• ¿Qué hay de los hongos, parásitos y virus?

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