Diversidad Microbiana

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Diversidad

Microbiana
Ivn Arvizu Hernndez.

Introduccin a la
Microbiologa

Importancia de los
microorganismos

Antigedad y amplitud de la vida


microbiana

La Era moderna de la
Microbiologa

rbol Evolutivo de la vida


Determinacin de las relaciones evolutivas (Filognia)
Carl Woese
Genes rRNA SSU, 16S (Bacteria y Archaea), 18S (Eukarya)

Tres Dominios

Diversidad Fisiolgica de los


microorganismos
Qumicos

Luz

Quimiotrofa

Fototrofa

Compuestos
Qumicos
(Glucosa, acetato, etc.)

Compuestos
Inorgnicos
(H2, H2S, Fe2+, NH4+, etc.)

Quimioorgantrofos

Quimiolottrofos

(Glucosa+O2

CO2+H2O)

ATP

(H2+O2

H2O)

ATP

Fottrofos
Luz

ATP

Condiciones ambientales extremas

Diversidad Metablica

Bacterias

Phylum Proteobacterias
Proteobacterias Fottrofas,
Quimiolittrofas y Metantrofas
Bacterias Rojas Fototrficas
Bacterias rojas del Azufre
Chromatium sp.

CO2+H2S

Rhodospirillum sp.

Bacterias Rojas no del Azufre


Crecen fototrficamente obteniendo el carbono de
fuentes orgnicas
Algunas tambin pueden crecer anaerbicamente sin
luz utilizando la fermentacin.

Bacterias Nitrificantes

Nitrosomonas sp.

Nitrobacter sp.

Fotoheterotrofa
Bacterias Oxidantes del Azufre y del Hierro

Thiobacillus sp.

Achromatium sp.

Beggiatoa sp.

Bacterias Oxidantes del Hidrgeno

H2 como donante de e-

O2 aceptor de e-

Metabolismo energtico la reaccin Knallgas


H2+1/2 O2

Ralstonia eutrophus

H2O

Mayora Auttrofos utilizando el ciclo de Calvin


para incorporar CO2
Alcaligenes sp.

Bacterias Metantrofas y Metiltrofas

Methylomonas sp.

Methylobacter sp.

Proteobacterias Quimioorgantrofas
Aerobias y Anaerobias Facultativas
Pseudomonas y pseudomonadceas

P. fluorescens

Zymomonas sp.

Xanthomonas sp.

Capacidad p/usar numerosos compuestos orgnicos


Como fuentes de carbono y energa (>100)

Azcares, c. Grasos, c. Dicarboxlicos, c. Tricarboxlicos


Alcoholes, polialcoholes, glicoles, aromticos, AA y aminas
Burkholderia sp.

Comp. Xenobiticos (Biorremediacin)

Bacterias del cido actico

Bacilos Gramnegativos aerobios


Oxidacin incompleta de alcoholes y azcares
Forman c. Actico a partir de etanol
Acetobacter sp.
Acetabacter= c. Actico hasta CO2

Gluconobacter sp.

Bacterias Fijadoras de Nitrgeno de vida libre


(Aerobias)
Nitrogenasa sensible a O2

Azotobacter sp.

Metabolismo estrictamente oxidativo


Reduccin de N2 hasta NH3
Azospirillum sp.

Enterobacterias

Bacilos Gramnegativos
Aerobios facultativos
No forman esporas
Fermentan azcares hasta varios
productos finales
Varias Patgenas

Salmonella enterica

Enterobacter sp.

Escherichia coli

Proteus
mirabilis

Vibrio, Alivibrio y Photobacterium

Vibrio

Marinos
Anaerobios facultativos
Fermentadores
Gramnegativos
Bioluminiscencia en presencia de
oxgeno
Luciferasa bacteriana

Photobacterium phosphoreum

Rickettsias
Parsitos intracelulares estrictos

Delta y Epsilonproteobacterias
Mixobacterias deslizantes

Gram Positivas
Gram positivas (Firmicutes) y
Actinobacterias
Gram positivas no formadoras
de endosporas
Gneros
clave:

Contenido de GC
Bacterias del cido lctico
Homofermentativas (c. Lctico)
Heterofermentativas

Staphylococcus
Micrococcus
Streptococcus
Lactobacillus
Sarcina
Listeria

Gram positivas formadoras de endosporas

B. subtilis
Clostridium sp.

Gram positivas Sin Pared Celular

Mycoplasma sp.

Spiroplasma sp.

Genomas pequeos
Especies parsitas
Resistencia a lisis osmtica (esteroles)
Protoplastos

Phylum Actinobacterias
Actinobacterias corineformes y bacterias del c.
Propionico
Corynebacterium, Arthrobacter
Actinobacterias: Mycobacterium
Alcohol cido resistentes

Actinobacterias filamentosas:
Streptomyces y
Actinomyces
Forman esporas
Antibiticos
Enzimas hidrolticas extracelulares
Hasta 50 fuentes de carbono distintas

Phylum Cianobacterias
Fottrofos oxignicos
Fijacin de nitrgeno en forma de
glutamina
Oscillatoria
Nostoc

Clamidias
Capacidad metablica reducida
Gneros: Chlamydia, Chlamydophila

Planctomyces
Bacterias pedunculadas
Hbitat marino y agua dulce

Phylum Verrucomicrobia
Prostecas
Aerobios y anaerobios facultativos
Fermentan diversos azcares
Ambientes marinos y agua dulce
Bosques tierras de cultivo

Phylum Falvobacteria
Aerobios estrictos hasta anaerobios estrictos
Fermentan azcares o protenas
Producen acetato y succinato
Hasta 1010 en intestino delgado humanos
Sintetizan esfingolpidos

Flavobacterium sp.

Grupo Cytophaga
Bacilos Gramnegativos
Agua, suelos
Degradan polisacridos (celulosa, agar,
quitina)
Gneros:
Cytophaga
Sporocytophaga

Bacterias Verdes del Azufre


Fottrofas anoxignicas
Anaerobias estrictas
H2S como donante de e-, lo oxidan hasta
S y SO4 este ultimo de deposita en el
medio extracelular

Phylum Spirochetes
Gramnegativas mviles
Enrrolladas en forma de espiral

Phylum Deinococci
Deinococcus radiodurans
Cocos Grampositivos
Suelo, partculas de polvo
Resistencia a radiacin UV y desecacin

Thermus aquaticus
Bacterias termfilas quimioorgantrofas
Aerobias
Catabolismo de azcares, AA, c. Orgnicos
Aislamiento de DNA polimerasa Taq (aplicacin en PCR)

Bacterias Verdes No del Azufre


Chloroflexus
Termfilos filamentosos
Fotohetertrofos

Bacterias Hipertermfilas
Thermotoga y Thermodesulfobacterium
Bacilo hipertermfilo (90C)
Gramnegativas, no esporuladas
Quimioorgantrofos anaerobios fermentativos
Cataboliza azcares y polmeros
Produce lactato, acetato, CO2 y H2
Thermodesulfobacterium, termfila, reductora de sulfatos

Aquifex

Quimiolittrofo
Utiliza H2, S, S2O3 como fuente de eO2 y NO3 como aceptores de e95C
Microaerfilos

Arqueas

Phylum Crenarchaeota
Hipertremfilos (>80C)
Quimiolittrofos-auttrofos
Tambin agua congelada

Phylum Euryarchaeota
Metangenos (Metanobacterium)
Halfilos (Halobacterium, Haloferax)

Integracin metablica

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