In Horticulture - Es
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en horticultura
Traducido de: In Horticulture
Chuansheng Mei
en horticultura
Chuansheng Mei
Original Paper
Abstracto
El Departamento de Energía de los EE. UU. ha centrado sus esfuerzos de investigación en
convertir el pasto aguja en una materia prima bioenergética, ayudando a compensar el uso de
combustibles fósiles no renovables y hacer que los EE. UU. sean más independientes
energéticamente. Se ha demostrado que los endófitos bacterianos, que residen dentro de los
tejidos de las plantas, aumentan el rendimiento y la resistencia al estrés en varias plantas. El
objetivo principal de esta disertación fue explorar el uso de endófitos para mejorar los
rendimientos de biomasa de pasto varilla en tierras no aptas para cultivos alimentarios y
comprender mejor los mecanismos subyacentes de la interacción plantendofitos. La
integración de esta investigación en la educación K-12 STEM para aumentar el interés en las
ciencias de las plantas y crear la próxima generación de científicos con la motivación de
ayudar a resolver los desafíos que enfrenta la sociedad en el siglo XXI fue el objetivo del
componente de divulgación de este proyecto. El capítulo uno demuestra la capacidad de la
cepa PsJN de Burkholderia phytofirmans para colonizar el pasto varilla y promover el
crecimiento de las plantas en condiciones in vitro (aproximadamente un 50 % más altas) y en
condiciones de cámara de crecimiento e invernadero (48,6 % más de rendimiento de
biomasa). Los objetivos del Capítulo dos fueron determinar el establecimiento de rodales en
el campo con diferentes niveles de nutrientes. La bacterización con PsJN benefició
positivamente el crecimiento y el desarrollo de las plántulas de switchgrass en el campo con
un contenido de nutrientes bajo y alto. Se registró una estimulación altamente significativa
(p<0,001) del crecimiento de raíces y brotes, la formación de raíces laterales y el número de
hijos en suelos con baja fertilidad. La bacterización con PsJN también mejoró la acumulación
de biomasa durante las dos temporadas de crecimiento tanto en suelos pobres (p<0,001)
como ricos (p<0,05), lo que indica el potencial para el uso de PsJN en un sistema de
producción de materia prima de pasto aguja de bajos insumos. El capítulo tres describe las
diferencias en los patrones de expresión génica tras la bacterición, entre el cv. Alamo, y un cv
que no responde. Cueva-en-Roca. Utilizando microarrays EST y PCR cuantitativa, se
identificaron genes regulados hacia arriba y hacia abajo en ambos cultivares. Uno de los
genes clave identificados fue un miembro de la clase tau, la glutatión S-transferasa (GST). Se
TRADUCCIÓN 2
sabe que las enzimas GST están involucradas en las respuestas de las plantas al estrés.
Mediante el uso de técnicas de sobreexpresión y knockout/knockdown, demostramos que
GST probablemente esté involucrado en la promoción del crecimiento temprano de plantas
inducida por la bacterización en switchgrass. El capítulo cuatro describe el potencial para la
utilización de DEDICACIÓN beneficiosa Dedico esta disertación a mis padres
Lista de Figuras
Lista de
Las interacciones beneficiosas entre plantas y microbios, un campo de estudio que
generó mucho interés en las últimas dos décadas, ofrecen nuevas soluciones para mejorar
TRADUCCIÓN 3
Tanto los microorganismos bacterianos como los hongos forman una simbiosis antigua
y mutuamente beneficiosa con las plantas, y los hongos micorrízicos en particular están
asociados con la colonización inicial de la tierra por parte de las plantas (Ryan et al., 2008;
Wang y Qiu, 2006). Un campo de cultivo de plantas representa una comunidad compleja de
microbios, que interactúan, compiten y, a menudo, ayudan a promover el crecimiento de las
plantas y la resistencia al estrés. En general, las interacciones beneficiosas entre plantas y
microbios promueven el crecimiento de las plantas a través de la producción de hormonas
vegetales, como la auxina, lo que ayuda en la resistencia al estrés abiótico, incluida la sequía
y la salinidad, la producción de compuestos antimicrobianos contra los patógenos de las
plantas y la adquisición de nutrientes como la fijación de nitrógeno atmosférico y
solubilización del fósforo en el suelo (Revisado en . Estas interacciones son intrincadas y
multifacéticas, a menudo dependen del tiempo de desarrollo, el genotipo, las condiciones
ambientales y las comunidades nativas del suelo. Aunque el pasto varilla se ha estudiado
intensamente, solo se han publicado unos pocos artículos centrados en los endófitos en
switchgrass y su influencia en la promoción del crecimiento Juntos, los microorganismos
benéficos podrían tener el potencial de ayudar en el desarrollo de un sistema de producción
de switchgrass sostenible y de bajos insumos (Nowak et al., 2011) y ofrecer una forma
práctica de mejorar el crecimiento y las enfermedades de las plantas resistencia.
2012). Estos endófitos pueden encontrarse colonizando tejidos por encima y/o por debajo
del suelo (Rodríguez et al., 2009). Recientemente,
Sin embargo, no todos los endófitos son capaces de colonizar las partes aéreas de las
plantas. Esto puede reflejar la incapacidad de algunos para adaptarse y sobrevivir a los
diferentes nichos representados por los tejidos y órganos aéreos (Compant et al., 2010). En
switchgrass, los títulos de la cepa PsJN de B. phytofirmans fueron más altos en la raíz que en
las hojas 7 días después de la inoculación de las raíces. A los 14 días después de la
inoculación, los títulos fueron más altos en las hojas y las vainas que en las raíces, lo que
indica una translocación a estos tejidos. En general, se informa que los títulos de endófitos
bacterianos en los tejidos aéreos de las plantas son más bajos que en la raíz (Rosenbleuth y
Martínez-Romero, 2006; además, se puede observar una gran cantidad de variación en estos
tejidos. informaron que se podría encontrar PsJN en solo 10-60% de los tallos de
inflorescencia de uva y bayas de uva después de la inoculación inicial de las raíces. Estos se
localizaron en los vasos del xilema, y solo se observaron una o pocas células. Estos
resultados indicaron aún más la importancia del xilema para la propagación sistémica de
endófitos. , permitiéndoles llegar hasta los tejidos reproductivos.
Sin embargo, esta propagación fue muy lenta, tardando 5 semanas en llegar a los tejidos
de la inflorescencia. Los títulos muy bajos de PsJN que terminaron en estos tejidos se
TRADUCCIÓN 6
Los endófitos fúngicos se encuentran más comúnmente viviendo en los tejidos de las
plantas sobre el suelo y ocasionalmente en las raíces (Saikkonen et al., 1998). Las plantas
infectadas con hongos endófitos obtienen promoción del crecimiento, tolerancia al estrés,
eficiencia en el uso del agua y protección contra herbívoros vertebrados y nematodos de las
raíces (Rodriguez et al., 2008;Rodriguez et al., 2009;Schardl et al., 2004). Durante la
interacción, los endófitos obtienen refugio, nutrición y diseminación a través de los
propágulos de las plantas hospederas (Schardl et al., 2004). Al igual que los endófitos
bacterianos, los endófitos fúngicos también promueven el crecimiento de la planta
hospedante, como un mayor crecimiento de las raíces y pelos radiculares más largos
(Malinowski et al., 1999), lo que puede contribuir a una mayor absorción de nutrientes. Por
ejemplo, la biomasa de raíces y brotes de álamo, maíz, tabaco, bacopa, artemisia y perejil se
duplicó en comparación con sus respectivos controles después de cuatro semanas de
inoculación con Piriformospora indica (Varma et al., 1999).
Los hongos endófitos del género Neotyphodium (una forma asexual de Epichloë spp.)
han sido bien estudiados por sus asociaciones simbióticas con diferentes especies de
gramíneas, especialmente la familia Pooideae, que incluye muchas especies importantes de
gramíneas forrajeras y césped (Clay, 1990; Schardl et al. al., 2004; Sugawara, 2011). A través
de esta simbiosis, los pastos han exhibido un mayor crecimiento,
con endófito Balansia benningsiana no mostraron ninguna ventaja sobre las plantas de
control durante el estrés por sequía, pero la infección con endófito ayudó a que las hojas
volvieran a crecer rápidamente durante la recuperación (Ren y Clay, 2009).
Los suelos cultivados se están volviendo más salinos debido al uso excesivo de
fertilizantes, el uso de aguas residuales de áreas urbanas y periurbanas y el drenaje agrícola,
así como los procesos de desertificación (Bashan et al., 2010). Las bacterias promotoras del
crecimiento vegetal ofrecen el potencial para reducir el impacto de este estrés. Por ejemplo,
las plantas de pepino inoculadas con Paecilomyces formosus mostraron una mayor longitud
de los brotes en comparación con las plantas no inoculadas en condiciones de alta salinidad
(Khan et al., 2012). En estudios con Salicornia brachiata, la especie de planta más tolerante a
la sal entre Salicornia spp., Brachybacterium saurashtrense y Pseudomonas sp. los endófitos
bacterianos aumentaron significativamente el crecimiento de las plantas en condiciones de
estrés salino. La inoculación de las bacterias Pseudomonas putida y P. pseudialcaligens
aumentó el crecimiento de las plantas de garbanzos en condiciones salinas en experimentos
en macetas (Patel et al., 2012).
maximum) inoculadas con Pantoea spp. Jp3-3 exhibió un alivio significativo del efecto
negativo causado por el estrés del cobre 300 μM (Huo et al., 2012).
Pseudomonas syringae, oídio y mancha foliar angular, y aumentó el peso fresco de las
plantas de melón inoculadas en comparación con los controles no inoculados (García-
Gutiérrez et al., 2012). En plantas de tomate, se probó el biocontrol de Bacillus subtillis S499
para determinar el antagonismo contra Fusarium spp. al tratar las semillas con un polvo
formulado que contenía diferentes concentraciones de esporas viables de B. subtillis S499, y
los resultados mostraron que todos los tratamientos redujeron significativamente la
gravedad de la enfermedad hasta en un 65-70 % en comparación con las plantas de control
(semillas no inoculadas) (Nihorimbere et al., 2010).
http://hayandforage.com/biofuels/rust-resistent-switchgrass-research-goal-0323). En el
futuro, puede ser posible identificar endófitos que produzcan compuestos antifúngicos para
ayudar a compensar las pérdidas causadas por el estrés biótico.
Las citoquininas son una amplia gama de compuestos que, al igual que otras hormonas
vegetales, están involucradas en muchas actividades del crecimiento y desarrollo de las
plantas. Como grupo, se ha demostrado que regulan la división celular, la latencia y la
germinación de las semillas, la senescencia, la formación de nuevos brotes y la expansión de
las hojas. También juegan un papel en el control del desarrollo de los órganos de la planta,
mediando las respuestas a varios factores extrínsecos y la respuesta al estrés biótico y
abiótico (revisado en Spichal, 2012). Los investigadores han demostrado que ciertas
bacterias endófitas pueden producir citoquininas y promover el crecimiento de raíces
laterales (Senthilkumar et al., 2009). La zeatina, una hormona promotora del crecimiento
vegetal nativa, perteneciente a la familia de las citoquininas, se ha encontrado en niveles
significativamente más altos en las bacterias beneficiosas B. subtilis y P. putida (Sgroy et al.,
TRADUCCIÓN 13
2009).
Las giberelinas son hormonas promotoras del crecimiento vegetal nativas. Muchos
endófitos que promueven el crecimiento de las plantas también producen giberelinas para
mejorar el crecimiento de las plantas hospedantes (Fernando et al., 2010; Joo et al., 2009).
Por ejemplo, un aislado de Penicillium citrinum, IR-3-3 de la flora de las dunas de arena,
produjo giberelinas fisiológicamente más activas y estimuló el crecimiento de plántulas de
arroz Waito-c y Atriplex gemelinii. Los niveles de GA3 también fueron altos en las bacterias
asociadas a plantas Lysinibacillus fusiformis, Achromobacter xylosoxidans, Brevibacterium
halotolerans y Bacillus licheniformis (Sgroy et al. 2009).
Se piensa comúnmente que el etileno, una molécula orgánica simple (CH 2 =CH 2 ), es
una hormona inhibidora del crecimiento. Típicamente se produce cuando las plantas están
expuestas a estrés ambiental, reprimiendo el crecimiento y desarrollo de la planta hasta que
el estrés desaparece o los niveles de etileno disminuyen (Gamalero et al., 2012). El etileno
inhibe el alargamiento del tallo, promueve la hinchazón lateral de los tallos y hace que los
tallos pierdan su sensibilidad a la estimulación gravitrófica (revisado en Glick, 2005).
El ácido abscísico (ABA) está involucrado en las respuestas al estrés ambiental como el
calor, el agua y la sal, y también lo producen los endófitos. Las cepas bacterianas endófitas
SF2, SF3 y SF4 aisladas de girasoles (Helianthus annuus) tenían la capacidad de producir
TRADUCCIÓN 14
ABA y ácido jasmónico (JA), que aumentaron en condiciones de sequía (Forchetti et al.,
2007), lo que implica que estos endófitos mejoran la tolerancia al estrés de plantas
hospederas. Dos cepas de Azospirillum brasilensis, utilizadas con éxito para aumentar el
rendimiento de maíz y trigo en condiciones de campo, fueron capaces de producir diferentes
reguladores del crecimiento de las plantas, como IAA, GA3, zeatina y ABA (Perrig et al., 2007),
destacando la capacidad de endófitos para conferir múltiples mecanismos de promoción del
crecimiento.
atmosférico. Los autores también señalaron que los agricultores en Brasil han observado
algunas variedades de caña de azúcar cultivadas en los campos durante décadas, incluso
hasta un siglo sin mostrar ninguna disminución en la reserva de N del suelo o el rendimiento,
a pesar del déficit de suministro de nitrógeno. El arroz también ha sido estudiado en el
contexto de su relación con Burkholderia spp. En un experimento de campo, el 31 % del
nitrógeno vegetal se derivó de BNF, y la inoculación resultó en un aumento de hasta un 69 %
en la biomasa en comparación con el control no inoculado.
Los investigadores también encontraron que las plántulas de arroz inoculadas con
Burkholderia vietnamiensis aumentaron el rendimiento en un 5,6 a 12,16 %, y el 42 % del
nitrógeno encontrado en las plantas inoculadas provino de la fijación de nitrógeno
atmosférico. Además del arroz, se encontró que Burkholderia se encontraba entre los
aislados fijadores de nitrógeno más comunes de las plantas de maíz cultivadas en México, y
se informó que muchos eran especies nuevas (Estrada et al., 2002). Estos hallazgos
respaldan el uso de endófitos fijadores de nitrógeno de vida libre en un esfuerzo por reducir el
uso de fertilizantes nitrogenados sintéticos y ofrecen esperanza en la creación de sistemas
de producción agrícola de alto rendimiento y bajos insumos.
Biocontrol de patógenos
Otro mecanismo de promoción del crecimiento vegetal por endófitos es el biocontrol de
patógenos.
Los endófitos han desarrollado una amplia gama de mecanismos de control biológico
que incluyen la producción de antibióticos, tanto antifúngicos como antibacterianos, la
secreción de sideróforos y la producción de enzimas (revisado por Compant et al., 2005b).
Juntas, estas propiedades de control biológico permiten que los endófitos superen a los
patógenos por su nicho y limiten los daños causados por los fitopatógenos, además de
proteger a su planta huésped, lo que resulta en una mayor supervivencia y crecimiento.
Burkholderia MP-1 produce al menos cuatro compuestos antifúngicos que incluyen ácido
fenilacético, ácido hidrocinámico, ácido 4-hidroxifenilacético y éster metílico de 4-
hidroxifenilacetato. El pequeño tamaño de los genes que codifican agentes antibacterianos y
el número relativamente pequeño de genes en bacterias y hongos pueden permitir que los
genes que codifican agentes antibióticos se transformen en varios endófitos promotores del
crecimiento.
Secreción de sideróforos
El hierro, uno de los minerales más abundantes del planeta, no está fácilmente
disponible para las bacterias porque su forma más común, el hierro férrico (Fe+3), es solo
ligeramente soluble y está estrechamente unido a muchas partículas en el suelo. Para
recolectar el hierro necesario para el crecimiento, las bacterias y los hongos secretan
compuestos de bajo peso molecular llamados sideróforos. Los sideróforos bacterianos
generalmente actúan para inhibir hongos patógenos como resultado de que sus sideróforos
tienen más afinidad por el hierro que los sideróforos fúngicos (Ordentlich et al., 1988). Al
igual que muchos mecanismos de acción en bacterias y hongos, los factores ambientales
como el pH y los niveles de nutrientes, incluido el hierro, pueden afectar la síntesis de
sideróforos. Se ha confirmado la secreción de sideróforos en varios taxones bacterianos,
incluidos Bacillus, Pseudomonas, Rhodococcus, Serratia, Obesumbacterium y Lysinibacillus
(Czajkowski et al., 2012), así como en los actinomicetos fúngicos endofitos (Nimnoi et al.,
2010).
Los genes que codifican sideróforos pueden ser más difíciles de introducir en otros
endófitos que promueven el crecimiento de las plantas, ya que los estudios han demostrado
que están ubicados en múltiples loci (Osullivan et al., 1990) y tienen mecanismos de control
TRADUCCIÓN 17
Además, aunque los estudios con endófitos y otros microorganismos promotores del
crecimiento vegetal en laboratorios han sido alentadores, también ha habido informes de una
disminución general en el rendimiento del laboratorio al campo). Al igual que con cualquier
ecosistema, las variables de las condiciones de campo y las poblaciones microbianas
nativas deberán abordarse para maximizar los efectos beneficiosos de las bacterias y los
TRADUCCIÓN 18
hongos. Por lo tanto, la selección de endófitos que tengan un amplio espectro de promoción
del crecimiento que continúe a lo largo de la vida de la planta será otro tema para la
aplicación de endófitos.
Las respuestas específicas del genotipo de las plantas huésped a los endófitos también
son una gran barrera en la aplicación.
phytofirmans cepa PsJN, tiene un efecto beneficioso en muchas especies, como la papa,
el tomate y la uva. Sin embargo, PsJN también es específico de genotipo. En switchgrass,
PsJN promovió el crecimiento del cultivar de tierras bajas Alamo pero no del cultivar de
tierras altas Cave-in-Rock.
Desde 1999, se han registrado más de 15 nuevas patentes para endófitos microbianos).
El mercado mundial de inoculantes microbianos está experimentando una tasa de
crecimiento anual de aproximadamente el 10%. 2,3 y Chuansheng Mei 1,2,3 (Publicado en
2012 en Biotechnology for Biofuels 5:37). *Contribuciones de los autores: SK y SL realizaron
experimentos y redactaron el manuscrito.
Abstracto
Switchgrass es uno de los candidatos de cultivos bioenergéticos más prometedores para
los EE. UU. Da un rendimiento de biomasa relativamente alto y puede crecer en tierras
marginales. Sin embargo, el rendimiento de la biomasa varía de un año a otro y de un lugar a
otro. Es imperativo desarrollar un sistema de materia prima de pasto varilla sostenible y de
bajos insumos. Una de las formas más prácticas y factibles de aumentar el rendimiento de la
biomasa es utilizar endófitos beneficiosos. Demostramos que uno de los endófitos
bacterianos promotores del crecimiento vegetal más estudiados, Burkholderia phytofirmans
cepa PsJN, es capaz de colonizar y promover significativamente el crecimiento de
switchgrass cv. Álamo en condiciones in vitro, cámara de crecimiento e invernadero. En
varios experimentos in vitro, el peso fresco promedio de las plantas inoculadas con PsJN fue
aproximadamente un 50 % mayor que el de las plantas no inoculadas. Cuando se cultivaron
plántulas de un mes de edad en una cámara de crecimiento durante 30 días, las plantas de
Álamo inoculadas con PsJN tenían una biomasa de brotes y raíces significativamente mayor
en comparación con los controles. El rendimiento de biomasa (peso seco) promediado a
partir de cinco experimentos fue un 54,1 % mayor en el tratamiento inoculado en
TRADUCCIÓN 20
Introducción
La creciente preocupación por los suministros de energía extranjeros, las emisiones
globales de gases de efecto invernadero y la necesidad de un desarrollo económico rural ha
impulsado el interés en la producción sostenible de biomasa como materia prima para la
bioenergía y los bioproductos. Se ha sugerido que para 2025, la demanda mundial de energía
probablemente aumentará en más del 50 % (Erahin et al., 2011).
Varias materias primas, como los pastos rizomatosos perennes, pueden proporcionar
fuentes de biomasa lignocelulósica, sirviendo como nuevas fuentes de crecimiento de
cultivos e ingresos para los agricultores regionales.
Una de las materias primas más prometedoras capaz de contribuir a la realización de los
objetivos de energía renovable de EE. UU. es el pasto perenne común, el pasto aguja
(Panicum virgatum L.). Esta gramínea de pradera nativa, que consta de un germoplasma
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diverso (McLaughlin y Kszos, 2005), puede crecer en tierras marginales con bajos aportes de
agua y agroquímicos (Hill et al., 2006), de modo que su cultivo no compite con los cultivos
alimentarios por tierra. Debido a su gran sistema de raíces y su rápido rebrote, el pasto varilla
tiene otros efectos ambientales positivos, incluida la prevención de la escorrentía superficial
y la erosión del suelo, el secuestro de carbono y la provisión de un hábitat para la vida
silvestre (Humphreys, 1999). Las tierras cultivadas con pasto varilla también tuvieron mucho
depósitos de carbono orgánico total en el suelo más altos que las tierras cultivadas con
cultivos anuales, como el maíz y el trigo (McLaughlin et al., 2002; Liebig et al., 2005).
bacteriano promotor del crecimiento vegetal muy eficaz, con una amplia gama de huéspedes
que incluye papas, tomates y vides (Lazarovits y Nowak, 1996; Conn et al., 1997; Barka et al.,
2000; Nowak et al., 2003; Wang et al., 2006). Además, recientemente se ha secuenciado su
genoma, lo que proporciona los recursos genómicos necesarios para desarrollar una
comprensión de los mecanismos asociados con la capacidad de este endófito para
promover el crecimiento de las plantas. PsJN produce un alto nivel de ACC desaminasa,
mejora la tolerancia al estrés por frío y calor de la planta huésped (Bensalim et al., 1998),
mejora el manejo del agua y la resistencia de la planta a los patógenos. En este estudio,
reportamos la promoción del crecimiento de switchgrass cv. Alamo de Burkholderia
phytofirmans cepa PsJN en condiciones in vitro, cámara de crecimiento e invernadero. Hasta
donde sabemos, este es el primer informe que detalla la interacción switchgrass-PsJN.
Materiales y métodos
Materiales vegetales
Pasto varilla (Panicum virgatum L.) cvs. Las semillas de Álamo y Cave-in-Rock se
compraron de Warner Brothers Seed Co. (Lawton, OK), y el Dr. Bingyu Zhao (Departamento de
Horticultura - Virginia Tech, Blacksburg, VA) proporcionó amablemente otras semillas de
pasto varilla. Las semillas de switchgrass se esterilizaron superficialmente mediante
tratamiento con etanol al 70 % durante 2 min, se enjuagaron 3 veces con agua destilada, se
descascararon durante 30 min con H2SO4 al 60 % con agitación, se lavaron 3 veces con
agua destilada, se esterilizaron con hipoclorito de sodio 0,4 M (50 % solución de lejía
comercial que contiene hipoclorito de sodio al 6 %) que contiene Triton 100 al 0,1 % durante
30 min, seguido de enjuague 5X con agua destilada, desionizada y estéril (ddH2O).
Colonización de PsJN
Las plantas inoculadas con PsJN-GFP se examinaron con un microscopio
estereoscópico fluorescente (Modelo SZX-ILLD2-100; Olympus, Tokio, Japón) equipado con
un filtro GFP (BP460-490, Olympus, Tokio, Japón) y el escáner confocal de escaneo láser
Zeiss 510. microscopio (LSCM) (Carl Zeiss, Inc., Thornwood, NY) para observar la
colonización.
Para los bioensayos, el control y las plantas inoculadas con PsJN-GFP se esterilizaron
superficialmente con hipoclorito de sodio 0,032 M durante 1 min, luego se lavaron 4X con
agua destilada estéril. Cincuenta µl del lavado final se sembraron en medio KB sólido para
confirmar la eficacia de la esterilización superficial. A continuación, se separaron las partes
de la raíz, la hoja y la vaina, se pesaron cada una y se molieron con mortero en 1 ml de agua
destilada estéril. A continuación, los homogeneizados se centrifugaron a 2000 rpm durante 3
min y el sobrenadante se diluyó en serie con agua destilada. Cincuenta µl de muestras de las
soluciones diluidas en serie se esparcieron en medio KB sólido. Las placas se incubaron
durante 3 días a 28 °C en la oscuridad y se determinó el número de colonias positivas para
TRADUCCIÓN 24
Resultados
inoculadas con PsJN) se transfirió a un piso con 72 cavidades llenas de tierra y se cultivó en
una cámara de crecimiento a temperaturas de 28/22°C día/noche con un período de luz de
16 h durante un mes. Las plantas inoculadas con PsJN mostraron aumentos de crecimiento
significativos en comparación con las plantas de control en cuanto a la longitud de los brotes
y los pesos fresco/seco (Figura 1.3). Los experimentos de la cámara de crecimiento se
repitieron 5 veces, y los datos promedio de 5 experimentos mostraron una promoción
significativa del crecimiento por parte de PsJN, con un 46,3 % y un 54,1 % de aumento en el
peso fresco y el peso seco, respectivamente. El aumento de peso seco total (54,1%) por
PsJN fue mayor que el aumento de peso fresco total (46,3%), lo que indica que las plantas
inoculadas con PsJN acumularon más biomasa.
Discusión
En el presente estudio, demostramos la capacidad de B. phytofirmans PsJN para
colonizar y promover el crecimiento en switchgrass cv. Álamo. Tres días después de la
inoculación de PsJN, pudimos visualizar claramente la colonización de células bacterianas
dentro de las raíces bajo microscopía confocal. La población bacteriana dentro de las raíces
fue inicialmente mucho mayor que la de las hojas y las vainas, y el endófito bacteriano se
transmitió posteriormente verticalmente a las hojas superiores a través de la vaina de la hoja.
Estos resultados fueron similares a los reportados para vid y papa (Reiter et al., 2002), donde
el PsJN fue transportado a través del sistema vascular interior, desde los vasos del xilema de
TRADUCCIÓN 27
la raíz hasta las partes superiores de las plantas. Este es un primer paso crítico en la
interacción bacteria-planta endófita (Whipps, 2001). Se observó una importante promoción
del crecimiento del cv. Alamo por PsJN, tanto en condiciones in vitro como de suelo. Nuestro
estudio mostró que el peso fresco total y el peso seco total de las plantas inoculadas
aumentaron en un 45 % y un 55 % respectivamente en comparación con las plantas de
control no inoculadas cuando las plántulas inoculadas se cultivaron in vitro y luego se
transfirieron al suelo y se cultivaron en una cámara de crecimiento durante un mes. Se han
obtenido resultados similares en macetas de 4 galones bajo nuestras condiciones de
invernadero. Otros estudios han informado niveles de promoción del crecimiento por PsJN,
mostrando la vid un aumento de 6 veces en la biomasa total (Barka et al, 2006) y la patata
mostrando un aumento de aproximadamente 2 veces en la biomasa de raíces y tallo sobre
los controles. El mecanismo de crecimiento de las plantas por B.
Si bien nuestros estudios iniciales se realizaron con el cv. Alamo, probamos la utilidad de
PsJN como un endófito promotor del crecimiento con otros cultivares de switchgrass.
Nuestros resultados indicaron que existían efectos de genotipo específicos, con algunos
genotipos altamente sensibles a los efectos de promoción del crecimiento de PsJN, y otros
no. Otros efectos de genotipo similares han sido informados. Se informó que la respuesta de
la papa a PsJN implica alguna forma de control genético, ya que algunos cultivares de papa
muestran una respuesta beneficiosa al endófito, mientras que otros no (Bensalim et al, 1998;
Nowak et al., 1998; Nowak et al. , 2007). El fenotipo in vitro típico para un cultivar fuertemente
receptivo se caracterizó por un sistema radicular masivo y bien ramificado y después de las
primeras 3-4 semanas en cultivo, la plántula estaba más avanzada en su desarrollo que los
controles no bacteriizados. Los tallos eran más resistentes, con más depósitos de lignina
alrededor del sistema vascular, más pelos radiculares y más y más tricomas en las hojas
TRADUCCIÓN 28
(Nowak et al., 1998). También notamos que las plantas de switchgrass inoculadas con PsJN
tenían un desarrollo avanzado (datos no publicados). Estas mejoras no fueron evidentes para
los cultivares con poca respuesta. También observamos algunas de estas diferencias
fenotípicas entre cultivares de switchgrass sensibles a PsJN y no sensibles. Un trabajo
adicional que ilustra el control genético de la respuesta beneficiosa al endófito usó líneas
monoploides derivadas del cultivo de anteras de un clon diploide adaptado de Solanum
phureja, BARD 1-3 (Nowak et al., 2007). El donante de antera diploide, BARD 1-3, exhibió una
respuesta de bacterización comparable a Red Pontiac, mientras que las líneas monoploides
exhibieron una respuesta a PsJN que va de favorable a desfavorable a neutral.
Los estudios de papa/PsJN han sido los más caracterizados y se han llevado a cabo con
material propagado clonalmente a través de secciones nodales, en los que una sola
inoculación es suficiente para iniciar la colonización a través del tejido del xilema,
extendiéndose finalmente a las hojas superiores.
Los niveles bacterianos deben alcanzar un umbral de población dentro de la planta antes
de que sean efectivos con una relación directa entre la mejora del crecimiento de las
plántulas y la colonización de PsJN tanto en las superficies interiores como exteriores
(Nowak et al., 2007). Este estudio sienta las bases para desarrollar un sistema de producción
de materia prima de pasto varilla sostenible y de bajos insumos en tierras marginales
utilizando este y otros endófitos bacterianos beneficiosos.
Resultados obtenidos con pasto varilla cv. La promoción del crecimiento de Álamo por B.
phytofirmans PsJN en diferentes condiciones, particularmente en condiciones subóptimas,
indica que podríamos aplicar el endófito bacteriano beneficioso en el manejo práctico del
pasto varilla para ayudar al establecimiento del pasto varilla en el primer año y en el
desarrollo de una materia prima sostenible y de bajos insumos. sistema de producción. En el
futuro, los mecanismos de promoción del crecimiento deben dilucidarse con biología
molecular y genómica funcional. Nuestros resultados muestran que la cepa PsJN de B.
phytofirmans promueve significativamente el pasto varilla cv. Crecimiento de Álamo bajo
diferentes condiciones, especialmente en las primeras etapas de crecimiento que producen
macollos más tempranos, lo que puede beneficiar el establecimiento del pasto varilla en el
primer año. Además, PsJN podría estimular significativamente Switchgrass cv. Crecimiento
de Álamo en condiciones subóptimas, lo que indica el uso del endófito bacteriano
beneficioso para impulsar el crecimiento del pasto varilla en tierras marginales y para
desarrollar un sistema de producción de materia prima sostenible y de bajos insumos. Las
plántulas se inocularon con PsJN y se cultivaron in vitro durante un mes, luego se
TRADUCCIÓN 29
Figuras y Tablas
Introducción
Los combustibles fósiles han impulsado la economía mundial desde el comienzo de la
revolución industrial.
varilla en tierras marginales sin competencia por suelos fértiles utilizados para cultivos
alimentarios también puede beneficiar potencialmente a los productores agrícolas. Sur y
Centro
Los endófitos son microorganismos naturales del suelo que pueden penetrar las raíces
de las plantas y trasladarse a los órganos de la superficie y, tras la colonización, afectan el
crecimiento, la salud y la productividad de las plantas (Revisado en Welbaum et al., 2004;.
En pasto varilla cv. Se demostró que Alamo, PsJN aumentó el peso fresco en un 57, 46 y
37 % en condiciones in vitro, de cámara de crecimiento e invernadero, respectivamente. En el
campo, sin embargo, la gran abundancia y diversidad de bacterias nativas del suelo pueden
superar a los microorganismos introducidos y disminuir las ganancias que a menudo se
observan en el laboratorio.
TRADUCCIÓN 31
Materiales y métodos
lavar las raíces de las plantas con agua del grifo. Se determinaron los pesos frescos y
las plantas se dejaron secar en una habitación con control de humedad durante 3 semanas.
Luego se registraron los pesos secos de raíces y brotes, y se realizó un análisis estadístico
utilizando la prueba t de Student. La cosecha final del segundo año se realizó el 04/12/2013
después de que las plantas estuvieran inactivas. Catorce pares de plantas se cosecharon al
azar de la parcela 1 y 12 pares de plantas de la parcela 2 al azar. Las plantas latentes se
TRADUCCIÓN 32
Se recogieron las plantas enteras y se lavaron las raíces. Los pesos frescos y secos de
raíces y brotes se determinaron como se describe anteriormente. Se determinó el número de
raíces seminales y se contaron las raíces laterales en cada raíz seminal hasta 3 cm desde la
parte superior.
Fotosíntesis
TRADUCCIÓN 33
Resultados
Prueba de campo de Lynchburg en suelo con alto contenido de nutrientes
Etapa de crecimiento
TRADUCCIÓN 34
Las etapas de crecimiento acelerado del pasto varilla sobre el suelo se registraron
durante dos experimentos para determinar si se produjo un crecimiento acelerado en plantas
bactericidas con PsJN a los 2,5 meses de crecimiento (Figura 2.13). Durante la prueba de
promoción del crecimiento en macetas con suelo de campo, se midió el estado de
crecimiento por el número de hojas formadas y la madurez de la hoja nueva según el método
de Sanderson (1992). Durante la prueba, se registraron avances significativos (p<0,001) en
las etapas de crecimiento en plantas bactericidas con PsJN con casi una nueva hoja entera
formándose en el tratamiento con PsJN. Se repitió el estudio para confirmar los resultados.
La Figura 2.14 representa los resultados de un estudio de maceta de 2,5 meses en un
invernadero con temperatura controlada para determinar los efectos de la inoculación de
PsJN en el crecimiento de las raíces. Las plantas se cultivaron en mezcla para macetas
Miracle-Gro®. Se observaron aumentos significativos (p<0,001) en el peso de las raíces
frescas y secas, así como en la longitud de las raíces. Estos resultados confirmaron estudios
anteriores que también demostraron aumentos significativos en el peso y la longitud de las
raíces. Para estudiar más a fondo la morfología de las raíces, se contó el número de raíces
seminales en PsJN y las plantas de control, así como el número de raíces laterales por cm en
las raíces seminales, se estimó contando las raíces laterales en una porción de 3 cm de una
raíz seminal seleccionada al azar y dividiendo por 3. La Figura 2.15 ilustra estos hallazgos
junto con fotos como referencia. Las plantas bactericidas con PsJN produjeron
significativamente más raíces seminales (p<0,001) y las raíces seminales produjeron
significativamente más raíces laterales por cm en comparación con las plantas de control
(p<0,001). Juntos, estos resultados indican que el pasto varilla bactericido con PsJN puede
tener una mayor capacidad para acumular humedad y nutrientes.
Tasas de fotosíntesis
Las tasas de fotosíntesis se midieron en plantas control y bactericidas con PsJN en
macetas con suelo de campo y en el campo (Figura 2.16). Si bien las tasas no fueron
significativamente diferentes, las tasas de fotosíntesis fueron más altas en PsJN en los
cuatro experimentos en comparación con los controles.
Discusión
Los cambios en los patrones globales de temperatura y suministro de agua combinados
con la disminución de los suministros de combustibles fósiles no renovables han despertado
el interés en el pasto varilla, una planta perenne nativa de estación cálida capaz de crecer con
pocos insumos, como un cultivo bioenergético potencial para compensar el uso de
TRADUCCIÓN 35
combustibles fósiles en un manera sostenible. Los estudios han demostrado que las
bacterias que residen en los tejidos internos de las plantas sin causar daño aparente,
conocidas como endófitos, tienen la capacidad de promover el crecimiento de una serie de
cultivos energéticos de gramíneas (Boddey, 1995; Flinn, 2010), incluido el pasto varilla Gagne-
Bourgue et al., 2012; Xia et al., 2013). Switchgrass se divide taxonómicamente en dos
ecotipos: tolerantes al frío de tierras altas, que son de baja estatura y producen menor
biomasa, y cultivares de tierras bajas, que se encuentran en áreas húmedas más templadas y
son mayores productores de biomasa (Vogel, 2004). Tierra baja cv. Alamo es un candidato
principal para la producción de bioenergía en el sureste de los EE. UU. debido a su alta
producción de biomasa (Bouton, 2002). Sin embargo, el establecimiento del pasto aguja,
como el de la mayoría de las plantas perennes de estación cálida, es un desafío principal
durante los dos primeros años debido a la latencia de las semillas y la competencia de
malezas (Moser y Vogel, 1995). Por lo tanto, es fundamental mejorar el establecimiento del
pasto varilla durante los dos primeros años para lograr un desarrollo y una economía
saludables en general (Parish y Fikes, 2005).
Se ha demostrado que los endófitos bacterianos naturales, aislados del pasto aguja que
crece en el campo, promueven el crecimiento del pasto aguja (Gagne-Bourgue et al., 2012; Xia
et al., 2013). Se demostró que el endófito bacteriano beneficioso bien estudiado, Burkholderia
phytofirmans cepa PsJN, aislado de raíces de cebolla, aumenta el crecimiento y el desarrollo
de macollos de switchgrass cv. Alamo en cámara de crecimiento e invernadero), pero no fue
investigado en campo. El objetivo de este estudio fue explorar los efectos de la bacterización
de la cepa PsJN de Burkholderia phytofirmans en el pasto varilla cv. Plántulas de Álamo
durante los primeros dos años de crecimiento en el campo, incluido el impacto en el número
de macollos y la biomasa aérea y subterránea en dos condiciones de suelo; uno estaba en un
campo con tierra de primera y el otro estaba en un antiguo campo de tabaco común en el sur
de Virginia. En los dos sitios, la biomasa aérea general fue significativamente mayor a mitad
de temporada, durante el crecimiento vegetativo y antes de la extracción de semillas y en el
segundo año de crecimiento (p<0,05).
Los efectos más altos de la bacterización con PsJN para el peso fresco y seco se
TRADUCCIÓN 36
Tanto en suelo de primera calidad como en suelo de una antigua granja de tabaco, el
número de macollos aumentó significativamente incluso cuando las plantas se trasplantaron
en diferentes momentos y en diferentes lugares.
Los datos del experimento de la maceta con suelo de campo respaldan esta hipótesis, ya
que la etapa de crecimiento avanzó en las plantas bactericidas con PsJN (Figura 2.13). Para
confirmar los hallazgos en el campo con respecto al crecimiento de las raíces y para explorar
más a fondo los efectos de la bacterición con PsJN en el desarrollo de las raíces, se inició un
estudio de 2,5 meses en macetas con mezcla para macetas Miracle-Gro ® en el invernadero
(Figura 2.15). Este estudio indicó que la bacterización con PsJN aumentó significativamente
el peso de la raíz (p<0.001) como se encontró en la prueba de campo. La morfología de la
raíz también cambió, ya que las plantas bactericidas con PsJN tenían más raíces seminales y
más ramas de raíces laterales por cm en comparación con los controles, lo que respalda los
hallazgos anteriores de una mayor ramificación lateral de las raíces en Arabidopsis (Poupin
et al., 2013). Estos datos indican que PsJN no solo aumenta el tamaño de la raíz, sino que
también cambia la morfología para permitir que la planta penetre en el suelo de manera más
completa para obtener un mejor acceso a los nutrientes y al agua a través del aumento de las
raíces laterales y el aumento del número de raíces seminales. Estos cambios morfológicos
podrían ayudar a la planta a tolerar la sequía en comparación con los controles, un efecto que
se ha demostrado que ocurre en el maíz inoculado con PsJN (Naveed et al., 2013). Se ha
informado sobre la promoción del crecimiento de raíces en otras plantas con el uso de
bacterias que producen sustancias similares a IAA (Glick, 1995). De manera similar, se
demostró un aumento del peso seco de la raíz en estudios de invernadero con maíz por
bacterias que producen compuestos similares a IAA (Mehnaz y Lazarovits, 2006).
Recientemente, se informó que un mayor desarrollo de raíces contribuye a un mayor número
de brotes en el campo en switchgrass inoculado con una mezcla de endófitos (Ker et al.,
2012).
agricultura sostenible. 3 Resumen de los pesos secos de las dos cosechas de pasto varilla en
Lynchburg. Las plantas se dejaron secar durante 2 semanas a 70°F antes de medir el peso
(**p<0,01, *p<0,05). Las mediciones se registraron el 17/06/2013. Diez pares de plantas
fueron excavadas por completo; las raíces se lavaron y se dejaron secar, y luego se separó y
etiquetó la parte aérea. Se tomaron pesos frescos dentro de las 8 horas y las plantas se
secaron a 28°C durante dos semanas. El análisis estadístico se realizó utilizando una prueba
T de Student pareada (**p<0,01, *p<0,05). Figura 2.9 Cosecha de mitad de temporada del
segundo año de la parcela 2 de Walden Farm. Se cosecharon diez pares de plantas de
switchgrass el 28/06/2013. Diez pares de plantas fueron excavadas por completo; las raíces
se lavaron y se dejaron secar, y luego se separó y etiquetó la parte aérea. Se tomaron pesos
frescos dentro de las 8 horas y las plantas se secaron a 28°C durante dos semanas. El
análisis estadístico se realizó utilizando la prueba t de Student (**p<0,01, *p<0,05).
Figuras y Tablas
Figura 2.10
Walden Farm, parcela 1, cosecha de fin de temporada del segundo año. Se cosecharon
14 pares de plantas de switchgrass el 04/12/2013. Las plantas fueron excavadas por
completo; las raíces se lavaron y se dejaron secar, y luego se separó y etiquetó la parte aérea.
Los pesos secos se registraron después de que las plantas se secaron durante dos semanas.
El análisis estadístico se realizó mediante la prueba t de Student (***p<0,001). Se cosecharon
12 pares de plantas de switchgrass el 04/12/2013. Las plantas fueron excavadas por
completo; las raíces se lavaron y se dejaron secar, y luego se separó y etiquetó la parte aérea.
Los pesos secos se registraron después de que las plantas se secaron durante dos semanas.
El análisis estadístico se realizó mediante la prueba t de Student (***p<0,001). 16 Mediciones
de tasas de fotosíntesis. Experimento A, n=10, plantas de 3 meses, sembradas en macetas
con suelo de campo en un invernadero: Experimento B, n=10, plantas de 3 meses, sembradas
en suelo de primera calidad USDA: Experimento C, n=10, 5 meses plantas viejas, sembradas
en suelo de primera calidad del USDA: Experimento D, n=20, plantas de 3 meses de edad,
sembradas en suelo de primera calidad del USDA. Los experimentos se realizaron con el
estudiante graduado Bingxue Wang.
Abstracto
Los mecanismos moleculares que subyacen a las interacciones entre los endófitos
bacterianos promotores del crecimiento y sus plantas huésped durante la colonización y el
crecimiento temprano no se conocen bien. Para identificar los determinantes moleculares de
estas interacciones, responde cv. Álamo y cv no responde.
TRADUCCIÓN 39
Juntos, estos resultados indican que la enzima GST probablemente esté involucrada en
la colonización temprana y la promoción del crecimiento en cv. Álamo.
Introducción
Los endófitos bacterianos residen en los tejidos vegetales durante todo o parte de su
ciclo de vida y no causan daño aparente (Wilson, 1995). Estos diminutos organismos están
muy extendidos ya que se estima que cada especie de planta tiene al menos un endófito
asociado (Strobel et al., 2004), y son diversos, perteneciendo a múltiples clases de bacterias
(Rosenblueth y Martinez-Romero, 2006).
Además, una sola especie de planta puede albergar una variedad de endófitos. Por
ejemplo, se demostró, a través de estudios basados en cultivos, que los tejidos de plantas de
trigo sobre el suelo estaban ocupados por 88 especies bacterianas que representan 37
géneros. La investigación ha revelado que las interacciones entre la planta huésped y sus
endófitos son diversas y multifacéticas, a menudo.
Funcionalmente, las GST son una clase antigua de proteínas catalíticas y de unión, a
menudo asociadas con la tolerancia al estrés e inducidas por una amplia variedad de
estreses bióticos y abióticos. Los GST también tienen la capacidad de desintoxicar
herbicidas, contaminantes y toxinas, a menudo en concierto con la reacción de estrés de la
planta (revisado por Frova, 2003) al catalizar la adición nucleófila de glutatión (GSH) a una
variedad de moléculas, orientándolas así hacia las vacuolas. para la destrucción (Armstrong,
1997). Las glutatión-S-transferasas (GST) vegetales también están involucradas en la
señalización inducida por el estrés, y su expresión génica puede ser sensible al estrés (Loyall
et al., 2000). En las plantas, hay seis clases distintas reconocidas (phi, tau, theta, zeta,
lambda y dehidroascorbato reductasa), muchas similares a las que se encuentran en otros
TRADUCCIÓN 40
organismos, y dos, phi y tau, se encuentran solo en las plantas (Dixon et al. , 2002). Los
genes de diferentes isoformas de la familia tau GST también pueden expresarse de manera
constituyente o inducirse solo en respuesta al estrés (Lo Piero et al., 2009). Si bien la mayoría
de las GST de plantas pertenecen a las clases tau y phi, la identidad de secuencia puede ser
inferior al 50 % dentro de una clase y, sorprendentemente, inferior al 25 % entre clases, a
pesar del reconocimiento de que la estructura de la proteína se conserva (Dixon et al., 2002).
Las GST más comunes en las plantas son citosólicas y pueden representar hasta el 2% de las
proteínas solubles (Scalla y Rulet, 2002). Genéticamente, se ha demostrado que las GST de
las plantas aumentan en respuesta a los factores de nodulación secretados por
Sinorhizobium meliloti (anteriormente Rhizobium meliloti) durante la colonización de la
leguminosa Medicago truncatula (Ramu et al., 2002).
Las complejas interacciones entre un endófito y su huésped pueden ser muy específicas,
incluso a nivel del genotipo del huésped. La especificidad del genotipo se ha documentado en
las interacciones entre la cepa PsJN de Burkholderia phytofirmans y diferentes genotipos de
patata (Conn et al., 1997; Frommel et al., 1993), tomate y pasto varilla. En
Materiales y métodos
(M519, Phytotech Labs, Shawnee Mission, KS) con 3% de maltosa (RPI Inc.) y Phytagel al
0,3% (Phytotech labs) pH 5,8. Las plántulas se cultivaron en contenedores GA-7 Magenta a 25
°C (fotoperíodo de 16 h, luz fluorescente a 67 µmol m-2 s-1).
aislamiento de ARN
Tanto las plántulas de Alamo como las de Cave-in-Rock se inocularon y cultivaron como
se describe anteriormente, y los tejidos se recolectaron a los 0,5, 2, 4 y 8 días con controles
inoculados con tampón PBS solo y recolectados a los 0 días. Se usaron tres réplicas
biológicas para cada punto de tiempo. Los tejidos se congelaron inmediatamente en
nitrógeno líquido y se almacenaron a -80ºC hasta su uso. El ARN total se extrajo utilizando el
minikit Qiagen RNeasy Plant siguiendo las instrucciones del fabricante (Chatsworth, CA).
Análisis de micromatrices
El ARN purificado (500 ng) se amplificó y marcó utilizando el kit IVT Express (Affymetrix,
Santa Clara, CA). Los chips de micromatrices se hibridaron, lavaron y tiñeron siguiendo las
recomendaciones del fabricante. La normalización de datos se llevó a cabo utilizando el
promedio robusto de múltiples matrices (RMA) (Irizarry et al., 2003). El chip de microarrays
EST switchgrass de la plataforma Affymetrix fue desarrollado por BESC (el Centro de
Ciencias de Bioenergía del DOE, Zhang et al., 2013). Este chip contiene más de 100.000
conjuntos de sondas para genes putativos. Los genes expresados diferencialmente entre los
grupos de muestra se seleccionaron mediante el análisis asociativo descrito por Dozmorov y
Centola (2003) utilizando un valor de corte de expresión de 2 y un valor p corregido de
Bonferroni de 4,0659E-07, que se deriva de 0,05/N donde N es el número de sonda
establecida en el chip que para el chip switchgrass es 122,972. Para cada grupo de muestras,
las muestras tratadas se compararon con las muestras de control no tratadas para
seleccionar genes significativos. La relación generada al comparar el tratamiento inoculado
con PsJN con el control se sometió al Log2 de la relación y luego se trazó en el software
MapMan (Usadel et al., 2005) para la visualización de las rutas metabólicas. Además, se
utilizó PageMan (Usadel et al., 2006) para mostrar genes regulados hacia arriba y hacia abajo
significativos. La herramienta de diagrama de Venn generó el número de genes totales, o
genes únicos que estaban regulados hacia arriba o hacia abajo en las vías específicas en el
umbral de ± 1.0 del software MapMan. Las sondas de pasto varilla seleccionadas se
anotaron utilizando los identificadores de mapa "Oryza sativa, OSA_AFFY_150909"
descargados del sitio web de MapMan (mapman.gabipd.org).
verificación qPCR
TRADUCCIÓN 42
tenía sitios de enzimas BamH I y Kpn I y el fragmento más corto contenía sitios de enzimas
BamH I y Sal I (Tabla 3.1). Después de lo cual, los fragmentos más largos y más cortos se
amplificaron por PCR con los cebadores anteriores, respectivamente. Luego, el fragmento
más corto se clonó en el plásmido p1300S con las enzimas BamH I y Sal I, seguido de la
clonación del fragmento más largo en p1300S más el fragmento más corto con las enzimas
BamHI y Kpn I.
ensayo GST
Tanto el ARNi transgénico bactericido (PsJN) como el tratado con tampón (CK) y las
líneas de sobreexpresión se analizaron para determinar la actividad de GST en los días 0, 2 y
7 después del tratamiento utilizando el kit de ensayo de actividad colorimétrica GST (KT-204,
Kamiya Biomedical Company, Seattle, EE. WA, EE. UU.). Los tejidos se trituraron con un motor
y una maja con 2 ml de tampón GST por gramo de tejido. A continuación, las muestras se
centrifugaron a 10 000 g, 4 °C durante 15 min, y el sobrenadante se retiró y se colocó en un
tubo nuevo. El ensayo se realizó en placas de 96 pocillos por duplicado, según el protocolo
del fabricante. La absorbancia se midió a 340 nm a los 0, 5, 10, 15 y 20 minutos después del
inicio de la reacción. Se trazaron los valores de absorbancia y se determinó la pendiente
(velocidad) para la parte lineal de la curva (ΔA340). La actividad de GST se calculó utilizando
el coeficiente de extinción de GS-DNB a 340 nm 0,0096 µM-1 cm-1. Este valor ha sido
ajustado para la longitud del camino de la solución del pozo (0,262 cm) con un volumen de
0,1 mL). La concentración de proteína se determinó utilizando el ensayo de proteínas Bio-Rad
usando BSA como estándar.
Resultados
entre Alamo inoculado con PsJN y Cave-in-Rock. Entre estos genes, se seleccionó la
glutatión S-transferasa (GST) para realizar más estudios funcionales utilizando técnicas de
sobreexpresión y eliminación/desactivación de ARNi (Figura 3.1). Estos datos indican que la
expresión de GST está regulada al alza en el cv. Alamo a los 0,5 días y continuó aumentando
en los niveles de expresión a los 2 y 4 días, y permaneció alto a los 8 días después de la
bacterición. En contraste, la expresión de GST en switchgrass cv. Cave-in-Rock no se reguló
después de la bacterición con PsJN. A continuación, se exploró el gen GST utilizando la
alineación Blast (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/) que reveló la coincidencia más cercana con
la proteína GST en el maíz (Zea mays) de la subfamilia tau, específica de las plantas (Figura
3.2a y b), y se diseñaron cebadores para estudios posteriores (Tabla 3.1).
en comparación con las plantas de control. líneas y líneas de plantas transformadas con un
vector p1300S vacío. En general, las tendencias son similares a los datos de expresión
génica encontrados en el análisis de microarrays y qPCR. El primer punto de tiempo en el día
dos fue más bajo en general que el siguiente punto de tiempo en el día 7 después de la
bacterición. Finalmente, el último punto de tiempo medido en el día 14 fue similar al día 7, lo
que indica que la actividad se había estabilizado. Curiosamente, la actividad de la enzima
GST en las líneas RNAi #2 y 3 fue mayor que las plantas transgénicas de control p1300S y
las plantas con sobreexpresión, que fueron similares al control.
con todas las líneas probadas excepto una mostrando un mayor crecimiento en
comparación con el control en las mismas líneas transgénicas. Las plantas de la línea 26
crecieron significativamente más que p1300S después de la inoculación con PsJN.
Discusión
Las GST de clase Tau, una de las GST específicas de plantas más prominentes, juegan
un papel importante en las respuestas de estrés a una variedad de desafíos tanto endógenos
como exógenos, incluido el ataque de patógenos, heridas y estrés oxidativo y de temperatura
(revisado en Frova, 2003). La clase de enzimas en general responde a diversos desafíos
bióticos y abióticos, y existe una característica común importante, la generación de especies
de oxígeno activo (Revisado en Marrs, 1996). Esto está respaldado por los hallazgos de que
TRADUCCIÓN 48
las GST de las plantas también tienen actividad de peroxidasa dependiente de GSH, están
ampliamente distribuidas entre las plantas y se encuentran en cada tejido examinado y en
cada etapa del desarrollo de la planta (Cummings et al., 1999). Durante la colonización
endófita de la planta huésped, se ha demostrado que algunas de estas mismas vías están
involucradas en la colonización exitosa y/o el reconocimiento de patógenos (Ramu et al.,
2002). Sin embargo, los mecanismos moleculares que regulan la expresión de GST en las
plantas aún se desconocen en gran medida (revisado en Frova, 2003). Debido a estos
factores, el gen GST que se demostró que estaba regulado al alza en el pasto varilla cv. Se
seleccionó Álamo durante la colonización y durante las primeras etapas de la promoción del
crecimiento para una mayor caracterización. Con base en las alineaciones (Figura 3.2b), la
enzima tau GST parece ser una enzima dimérica donde el dominio N-terminal de una
subunidad es adyacente al dominio N-terminal de su pareja, y los dímeros de clase tau son
hidrofílicos (Armstrong, 1997).
Los datos de la PCR en tiempo real fueron similares a los hallazgos de los microarrays
(Figura 3.3). Juntos, este informe indica que GST puede estar involucrado en la colonización
exitosa y la promoción del crecimiento temprano de una manera específica de genotipo en
switchgrass cv. Álamo en comparación con el cv. Cueva-en-Roca. Cuando se crearon plantas
transgénicas que sobreexpresaban (Figura 3.8) y disminuían la expresión (Figura 3.7) y
posteriormente se bacterizaron con PsJN, se observó un rango de actividad de GST tanto en
la sobreexpresión como en las líneas de ARNi, lo que indica que las plantas pueden estar
compensando cualquiera de los cambios en la expresión génica. ya que los cambios
artificiales en la expresión génica pueden provocar efectos secundarios pronunciados en el
genoma (Teng et al., 2013). Para probar si la sobreexpresión o las líneas transgénicas de
ARNi mostraban cambios en la promoción del crecimiento mediante la bacterición con PsJN,
las tres líneas transgénicas de ARNi y las cuatro líneas de sobreexpresión se bacterizaron, se
cultivaron durante un mes y se determinó el peso fresco (Figura 3.12 y 3.13,
respectivamente). Las plantas transformadas con un vector vacío también se probaron con
PsJN y demostraron las respuestas normales de promoción del crecimiento que se observan
típicamente con la bacterización con PsJN. Las líneas de ARNi generalmente demostraron
pérdida de capacidad en la promoción del crecimiento por parte de PsJN en comparación
con las plantas transgénicas p1300S de control. Las dos líneas de sobreexpresión con los
niveles más altos de expresión (n.º 33 y n.º 26) se desempeñaron de manera similar o
superaron a los controles, respectivamente. La línea 26 fue significativamente más grande
después de la bacterización con PsJN (p<0,01) en comparación con los controles de la línea
26 o los controles p1300S que también se habían bactericido.
TRADUCCIÓN 49
Gran parte de los aumentos que impulsaron estas diferencias se debieron al crecimiento
de las raíces. Sin embargo, las líneas de sobreexpresión con niveles moderados de
sobreexpresión (#7 y #29) mostraron una disminución en la respuesta en comparación con
las plantas transgénicas p1300S de control. Juntos, este informe demuestra que la glutatión-
S-transferasa de la clase tau puede tener un efecto genotípico en la colonización temprana y
la promoción del crecimiento observada entre los cultivares de pasto varilla Alamo y Cave-in-
Rock. Se necesita más trabajo para aclarar estas observaciones. Estadísticamente
significativo (p<0,05)
Figuras y Tablas
Introducción
Si bien la Revolución Verde produjo aumentos significativos en la producción de plantas
en los últimos cincuenta años, basados en avances en el mejoramiento de cultivos para
sistemas de producción de altos insumos, se prestó poca atención al impacto del uso
excesivo de fertilizantes e irrigación en el medio ambiente (Rejesus y Hornbaker, 1999). Se
estima que entre el cincuenta y el sesenta por ciento de la aplicación de fertilizante
nitrogenado sintético en la superficie del suelo no es utilizada por las plantas objetivo, lo que
contamina el ecosistema circundante a través de la escorrentía superficial y la erosión en los
arroyos, lo que provoca zonas muertas eutróficas (Tonitto et al., 2006; Rejesus y Hornbaker,
1999) y a través de la desnitrificación, que contribuye a los efectos invernadero (Tilman et al.,
2002). Las plantas utilizan varias formas diferentes de nitrógeno, incluido el nitrato (NO 3 ), el
amonio (NH 4 ) y el nitrógeno orgánico (C-NH 2 ), pero no pueden romper el fuerte enlace
triple del N 2 atmosférico. De los aproximadamente 170 Tg (teragramos) de nitrógeno total
de las tierras agrícolas que se utilizan cada año, solo alrededor de 40 Tg provienen de la
fijación biológica de nitrógeno (FBN); el resto viene producido sintéticamente por el proceso
Haber-Bosch (revisado en Fields, 2004), minería de minerales (Erickson, 1983) y minería de
guano (Clark y Foster, 2009). Además, los precios de los fertilizantes nitrogenados están
vinculados a los precios de los productos básicos que probablemente provocaron un fuerte
aumento de los precios en 2007 (FAO, 2009) y el guano, que es muy apreciado en el mercado
de fertilizantes orgánicos, ha visto duplicarse recientemente los precios y es probable que los
suministros se reduzcan. agotarse en las próximas dos décadas (Clark y Foster, 2009). Cada
vez es más claro que las futuras prácticas agrícolas sostenibles deben reducir el uso de
fertilizantes nitrogenados sintéticos (Donner y Kucharik, 2008; Weekley et al, 2012) y
desarrollar sistemas de cultivo que integren mejor la fijación biológica de nitrógeno (BNF), el
principal proveedor de nitrógeno. en el ecosistema natural del mundo, debería ser un objetivo
principal (Roesch et al., 2008).
TRADUCCIÓN 50
Los procariotas son los únicos organismos que pueden fijar el nitrógeno atmosférico
(Markmann, 2009) y ponerlo a disposición de las plantas y pueden ser simbióticos, de vida
libre o asociativos, formando asociaciones casuales con las plantas (revisado en Welbaum et
al., 2004). ). Las bacterias fijadoras de nitrógeno endófitas asociativas, que residen en los
tejidos internos de las plantas, pueden mejorar el crecimiento de las plantas mediante el
suministro de cantidades pequeñas pero adecuadas de nitrógeno fijado directamente a la
planta (revisado en Welbaum et al., 2004). Mientras que las bacterias que forman nódulos en
una relación simbiótica con las plantas son las asociaciones fijadoras de nitrógeno más
estudiadas, el estudio de los endófitos fijadores de nitrógeno asociativos continúa cobrando
impulso (Riggs et al., 2002). Las bacterias fijadoras de nitrógeno también viven en asociación
con plantas en la rizósfera, donde intercambian nitrógeno fijado por compuestos de carbono
en los exudados de las raíces (revisado en Cocking, 2003).
Las nitrogenasas, las enzimas utilizadas por los procariotas para convertir el N 2
atmosférico en NH 3 , que pueden utilizar las plantas, son metaloenzimas complejas con
características estructurales y mecánicas altamente conservadas (revisadas en . La enzima
contiene dos componentes; el componente más pequeño, codificado por el El gen nifH,
conocido como proteína Fe, es un dímero y un donante de electrones dependiente de ATP, y
el componente más grande, codificado por nifDK, conocido como proteína MoFe, es un
heterotetrámero que contiene el sitio catalítico de la enzima (revisado por . Las secuencias
del operón de la enzima nitrogenasa están ubicadas en un grupo nif conservado e incluyen
más de 50 genes involucrados en su expresión, biosíntesis, maduración y ensamblaje
(Menard et al., 2007).
establecidos y transmitidos verticalmente para esta especie in vivo (Cankar et al., 2003). ).
Estas observaciones son consistentes con los hallazgos de las interacciones endófito-
huésped en general, ya que debido al metabolismo secundario y la morfología específicos,
las bacterias muestran un cierto grado de especificidad para cada especie de planta, incluso
diferentes genotipos dentro de la misma especie (Berg y Smalla, 2009). En un estudio más
amplio, el 15 % de las semillas esterilizadas superficialmente de plantas herbáceas, incluidas
la okra, la papaya, el rábano, la calabaza, el maíz, la cebada, el centeno y el trigo, y el 16 % de
las semillas de plantas leñosas produjeron bacterias cultivables (Mundt y Hinkle, 1976).
También se identificaron bacterias en el 30-40% de semillas de maíz y guisantes (Samish et
al., 1963) y semillas de café (Vega et al., 2005).
Hoagland premezclados (bio-World.com, Dublin Ohio) 1,9 g/l, fitogel 3 g/l y sulfato de
amonio. a 10 -375 mg/L, pH 5,8 en recipientes GA7 Magenta (Sigma-Aldrich)
bacterianos foliares, la pareja bacteriana no se pudo cultivar en absoluto, lo que sugiere que
los endosimbiontes pueden depender de su huésped para crecer (Lebard y Belin-Depoux,
2003).
Interacciones entre Burkholderia sp. y su huésped vegetal puede ser obligado, donde la
planta sufre mucho en su ausencia. Por ejemplo, los cultivos de tejido vegetal de Psychotria
que no contienen endófito de Burkholderia tenían hojas distorsionadas, retraso en el
crecimiento y no podían sobrevivir a largo plazo (Van Oevelen, 2003). También se ha
encontrado que Burkholderia forma nichos extendidos en hongos. Por ejemplo, el hongo
micorrícico arbuscular Gigaspora margarita tiene una población residente de hasta 250 000
Burkholderia spp. en el citoplasma de una sola célula fúngica (Ruiz-Lozano y Bonfante, 2000).
Una bacteria fijadora de nitrógeno estrechamente relacionada con Burkholderia (Bianciotto et
al., 1996) ha sido descubierta dentro de las esporas de Gigaspora margarita (Jargeat et al.,
2004), donde se estima que más de 20.000 individuos habitan cada espora (Bianciotto et al. .,
2004), lo que indica la importante capacidad evolutiva de transferirse verticalmente a la
siguiente generación y garantizar una interacción estable.
Burkholderia endófito de vida libre capaz de BNF puede colonizar órganos de plantas y
tejidos internos de una amplia gama de especies de plantas no leguminosas (Elliott et al.,
2007; Bontemps et al., 2010; Martinez-Aguilar, 2008). Se ha sugerido que los endófitos de
vida libre capaces de BNF se ubican en un ambiente más favorable en comparación con las
bacterias rizosféricas de vida libre porque son menos vulnerables a la competencia con las
bacterias nativas del suelo y están protegidos de varios estreses bióticos y abióticos
(Reinhold-Hurek y Hurek, 1998). El ambiente bajo en oxígeno creado en el tejido vegetal
también optimiza la actividad de la nitrogenasa, la enzima responsable del BNF. BNF de vida
libre Burkholderia spp. han sido identificados en tomate cultivado en campo (B. tropica y B.
xenovorans) y sorgo (Wong-Villarreal 2010) donde B. tropica se encontró casi
exclusivamente.
Incluso cepas dentro de especies como B. unamae exhibieron una diferencia de 20 veces
en la cantidad de N 2 fijada. En B. vietnamiensis G4, NtrB es parte de un sistema de dos
componentes, probablemente involucrado en la respuesta reguladora al estado de nitrógeno
y oxígeno (Mendard et al., 2007).
BNF en B. phytofirmans PsJN, una cepa con su genoma secuenciado que carece de la
capacidad de fijar nitrógeno.
Material vegetal
Se compraron semillas de pasto varilla (Panicum virgatum L.) del cultivar Alamo de
Warner Brothers Seed Co. (Lawton, OK).
Los cebadores se diseñaron para B. Phymatum STM 815 NifH: Cebador directo: 5'-
GGGTGTGATCCAAAGGCTGA-3', Cebador inverso: 5'-ATTCGTCAGGCGGTCAGTTC-3'.
Los oligonucleótidos fueron sintetizados por IDT. La PCR se llevó a cabo con alícuotas
de 5 ul de suspensión celular en condiciones de PCR; 25 ul: 50 pmol de cada cebador, DNTP
1,25 mM y ADN polimerasa Taq 2U. Ciclos de la siguiente manera: 1 ciclo a 95ºC por 7 min,
30 ciclos a 94ºC por 1 min, a 52ºC por 1 min, y a 65ºC por 8 min; 1 ciclo a 65ºC durante 16
min y un paso final a 4ºC. Se corrieron 10 ul de productos de PCR en un gel de agarosa al 1%,
se tiñeron con verde cibernético y se fotografiaron.
a 67 µmol m-2s-1) seguido de remojo en solución de PsJN (0,5 de OD600) durante 1 min.
de los tres Burkholderia con genomas secuenciados identificados para poseer el gen NifH, B.
phymatum STM 815 tenía el gen ubicado en un plásmido. Luego, este plásmido se exploró
más utilizando la característica del genoma anotado en la base de datos NCBI.
genes nifHDKEN que codifican el heterotetrámero de nitrogenasa (revisado por Dixon y Kahn,
2002). Con una longitud de 96 Kb, este operón es el doble de largo que otros reportados para
Burkholderia (Menard et al., 2008). El gen nifA, implicado en la regulación transcripcional de
la producción de nitrogenasa, se encuentra aguas arriba de los genes nif restantes y aguas
abajo de los genes nod implicados en la nodulación. El gen nifB está separado de nifA por al
menos 6 genes, una configuración similar a la disposición en B. tuberum pero difiere de la de
otras especies de Burkholderia. donde los genes están ubicados uno al lado del otro
(revisado en Gyaneshwar et al., 2011). Los genes nifEN también están separados por una
serie de genes de nifHDK que difieren de la disposición en otras bacterias fijadoras de
nitrógeno. Una duplicación aguas abajo de la región nifHDK incluye genes nifH, así como nifT
y nifZ, implicados en la biosíntesis, y también existe la maduración de la proteína FeMo. La
región también contiene el dominio de señalización PAS implicado en la detección del estado
del nitrógeno celular (Menard et al., 2008) y genes que codifican el sistema de transducción
sensorial de la proteína LuxR de dos componentes (Birck et al., 2002) que también se ha
implicado en la detección de quórum (Pappas et al., 2004).
Para determinar si el gen nifH, un gen necesario para la fijación de nitrógeno (Dixon y
Khan, 2002), estaba presente en la cepa PsJN de B. phytofirmans mediante cocultivo o
transformación, se diseñaron cebadores de PCR para nifH en B. phymatum STM 815 (
GenBank n.º CP001043.1). Genómica (Figura 4.14).
crecimiento, B.
phytofirmans cepa PsJN, PsJN+, B. phymatum STM 815 se probaron en tres niveles de
nitrógeno:
10 mg/l, 75 mg/l y 375 mg/l. (Figura 4.15) PsJN+, y ambos fueron significativamente
más altos en comparación con el control. Para confirmar estos efectos en mayor número, las
pruebas se repitieron en 75 mg/L y 375 mg/L con PsJN, PsJN+ y control (Figura 4.16) con
resultados similares. Se llevó a cabo una prueba final, similar al segundo experimento,
donde se midió la biomasa de raíces y brotes al mes con resultados similares (Figura
4.17).
Sin embargo, los cambios porcentuales promedio con estos dos se probaron en 375
mg/L, o niveles adecuados de nitrógeno, fueron muy similares (Figura 4.19). Estos resultados
se demostraron en los tres experimentos realizados. Juntas, estas pruebas indican que
PsJN+ supera a PsJN solo cuando se cultiva en medios deficientes en nitrógeno. Este
beneficio se pierde cuando se suministra nitrógeno adecuado.
Perspectivas de futuro
En un esfuerzo por mejorar la agricultura sostenible en el futuro, los microorganismos
benéficos pueden ayudar a aumentar el rendimiento al mismo tiempo que disminuyen el uso
de fertilizantes y pesticidas químicos, cada uno de los cuales se sabe que tiene efectos
perjudiciales para el medio ambiente. Si bien la promoción del crecimiento utilizando estos
organismos ha sido bien documentada en el laboratorio, los experimentos de campo a
menudo demuestran resultados disminuidos o ninguna promoción del crecimiento. El inóculo
aplicado al suelo tampoco ha logrado promover el crecimiento de manera constante en la
medida necesaria. Este artículo destaca el potencial de utilizar microorganismos transferidos
verticalmente como una alternativa a los enfoques mencionados anteriormente, ya que el
inóculo aplicado externamente puede cambiar la composición del suelo (Conn y Franco,
2004), o no puede colonizar y promover el crecimiento de las plantas objetivo de manera
efectiva. . Por el contrario, la identificación de microorganismos que se transmiten fielmente
de forma vertical, generación tras generación, brinda la oportunidad de introducir efectos
estables y predecibles en el campo, independientemente de la población nativa del suelo.
Como el conocimiento de la transferencia vertical de bacterias es limitado, se debe
identificar un enfoque para identificar un organismo modelo, que se sabe que ocupa y se
transmite constantemente a la próxima generación. Se deben tener en cuenta otras
condiciones, como la composición del suelo, la temperatura, el genotipo de la planta y el
estrés, para garantizar la consistencia de la transmisión, incluso en condiciones adversas.
Una vez establecidas, las características beneficiosas podrían transferirse naturalmente a
través de la genómica lateral al organismo modelo y seguirse a lo largo de su ciclo de vida. El
fitomejoramiento y la genómica también se pueden emplear para identificar huéspedes con
compatibilidad genotípica con el endófito. Juntos, dicho sistema puede generar datos
valiosos para contribuir a la comprensión de este fenómeno poco estudiado. Además,
apuntar a bacterias particulares que comúnmente se transmiten verticalmente a la progenie
puede permitir la entrega de ciertos rasgos, como la fijación de nitrógeno atmosférico, de
manera consistente. Estos organismos endófitos pueden luego compartir estos rasgos en la
TRADUCCIÓN 69
Desde 1999, se han registrado más de 15 nuevas patentes para inoculantes microbianos
y el mercado mundial está experimentando una tasa de crecimiento anual de
aproximadamente el 10 %. El uso de inoculantes microbianos es una parte importante del
esfuerzo por disminuir el uso de fertilizantes químicos y satisfacer la demanda mundial de
cultivos agrícolas para alimentos, piensos y combustibles, que están aumentando a un ritmo
acelerado (Edgerton, 2009). Está claro que estos pequeños organismos contribuyen y pueden
utilizarse para ayudar a mantener o aumentar la productividad de las tierras de cultivo.
Figuras y Tablas
En el plásmido inductor de tumores (Ti) de Agrobacterium tumefaciens, el operón virB es
necesario para la transferencia de ADN a la planta huésped y los sistemas tra/trb son
necesarios para la transferencia conjugada del plásmido Ti entre células de Agrobacterium
(Wood et al. ., 2001 Escinde el ADN mediante una serie de cortes escalonados y los une
covalentemente al ADN a través de un residuo de tirosina catalítico al final de la alineación
(Kwon et al., 1997) Transposasa 1209 402 Necesario para la transposición eficiente de la
secuencia de inserción o transposón de ADN (Richter et al., 1998) Transcriptasa inversa 1512
503 Utiliza una plantilla de ARN para producir ADN para la integración en el genoma del
huésped y la explotación de una célula huésped Ocurre en una variedad de elementos
móviles, incluidos los retrotransposones, los intrones del grupo II y los msDNA bacterianos
(Green et al., 1986) Transposasa IS31/IS911
154
Consta de varios elementos de inserción y otras transposasas bacterianas y se ha
demostrado que media la oligomerización de los componentes de la transposasa en IS911
(Haren et al., 1999) Introducción La ciencia, la ingeniería y la tecnología tienen las claves para
abordar los grandes desafíos que enfrenta nuestra nación en el siglo XXI, incluida la escasez
proyectada de agua, alimentos y energía. Sin embargo, la mayoría de los ciudadanos
estadounidenses carecen de un conocimiento y una apreciación fundamentales de la
maravilla y la belleza de estos campos. Hace tiempo que se estableció la conexión entre
cada uno, con el reconocimiento de que todos han contribuido a los avances mutuos y todos
están vinculados casi a la perfección en la vida cotidiana (Wells, 2010; NAS, 2011). La
reforma educativa está impulsando la enseñanza y el aprendizaje de estas materias de
manera integrada con un enfoque en los procesos y prácticas. La Junta Nacional de Ciencias
(2007) establece claramente, en su memorándum del presidente, que la nación no está
satisfaciendo las necesidades de educación STEM de los estudiantes estadounidenses y
abordarlas es "absolutamente esencial para el éxito económico continuo de la nación y su
seguridad nacional". ".
TRADUCCIÓN 71
Las universidades, las agencias de subvenciones del gobierno, los museos, las
sociedades profesionales y las corporaciones están enfatizando que los científicos ayuden y
participen en la educación K-12 (Andrews, et al., 2004) y
las universidades están cambiando sus sistemas de recompensas para los profesores a
fin de fomentar la participación del público en su investigación (Lally et al., 2007).
Wells, 2010) y seguramente ayudará a preparar la fuerza laboral del mañana. Las
pruebas estandarizadas y otras medidas muestran que los estudiantes en aulas integradoras
superan a los estudiantes en aulas tradicionales (Hartzler, 2000;Drake, 2003;Fruger, 2002).
Además, la aplicación de estos conceptos desde el jardín de infantes hasta el grado 12,
donde los estudiantes participan activamente en el proceso y las prácticas científicas,
transversales a las disciplinas STEM, agregará profundidad a su comprensión de los
principios básicos de cada campo (NAS, 2011).
comprender el diseño y los sistemas. Los estudiantes pueden considerar los efectos
posteriores de la contaminación en los ecosistemas acuáticos, la biorremediación y los
instrumentos utilizados para probar diferentes parámetros. Los estudiantes también
comienzan a explorar los principios comerciales. Mientras los estudiantes participan en
ejercicios basados en diseño, se desarrollan muchas habilidades adicionales, fuera del
campo de STEM, incluidos los enfoques grupales para la resolución de problemas, una
habilidad importante para el éxito en el futuro. También desarrollan habilidades de
presentación y organización mientras comparten sus resultados. Al mismo tiempo,
desarrollan la escritura y habilidades analíticas más profundas, a menudo más difíciles de
cuantificar.
Las recomendaciones de A Framework for K-12 Science Education (NAS, 2011 p.17)
incluyen tres dimensiones importantes: 1) Prácticas científicas y de ingeniería; 2) conceptos
transversales que unifican el estudio de la ciencia y la ingeniería a través de su aplicación
común en todos los campos, y; 3) Ideas centrales en cuatro áreas disciplinarias: ciencias
físicas; Ciencias de la vida; ciencias de la tierra y del espacio; e ingeniería, tecnología y
aplicaciones de la ciencia. Además, el documento establece que "para apoyar el aprendizaje
significativo de los estudiantes en ciencias e ingeniería, las tres dimensiones deben
integrarse en los estándares, el plan de estudios, la instrucción y la evaluación".
involucrarlos con las preguntas fundamentales sobre el mundo y con cómo los científicos
han investigado y encontrado respuestas a esas preguntas. A lo largo de los grados K-12, los
estudiantes deben tener la oportunidad de llevar a cabo investigaciones científicas y
proyectos de diseño de ingeniería relacionados con las ideas centrales de la disciplina". (NAS,
2011 p.9). Es en este contexto que los científicos e ingenieros profesionales, tanto en la
industria como en la academia, deben ser llamados a hacer un esfuerzo concertado para
tener presencia en la educación K-12, ayudar a capacitar a los maestros, involucrar y explicar
a los estudiantes que la ciencia actual La comprensión del mundo es el resultado de cientos
de años de aplicación de la filosofía basada en el diseño.
En ninguna parte es más evidente la necesidad que en las ciencias (National Academy of
Sciences, 2006). En resumen, el público está reconociendo cada vez más que estas agencias
de financiación deberían dedicar más dólares de los contribuyentes a ayudar a mejorar la
educación K-12 (que además beneficia a los científicos participantes).
carrera. Diseñar un estudio de este tipo, controlar todas las variables con múltiples grupos de
control, inscribir a un gran número de participantes y hacer un seguimiento de los
participantes a lo largo de la escuela secundaria y la universidad y en sus carreras llevaría
muchos años y sería excesivamente costoso con pocas posibilidades de asignar influencia a
cualquier resultado determinado (Laursen et al., 2007). Si bien pocos estudios, si es que hay
alguno, cumplen con los requisitos anteriores debido a la gran cantidad de variables que se
encuentran a lo largo de la educación K-12, una revisión de un programa a largo plazo
impartido por la Universidad de Colorado y financiado por el Instituto Médico Howard
Hughes, demostró que un científico en el programa de divulgación en el aula tiene beneficios
para los estudiantes y maestros de K-12 y "Los maestros se benefician al aprender contenido
nuevo y nuevas formas de enseñarlo, y se sienten apoyados por la presencia de personas
interesadas de la universidad. Concluimos que, cuando están bien dirigidos y
cuidadosamente estructurados, los programas de científico en el aula pueden tener un
impacto positivo en el interés de los estudiantes por la ciencia y, por lo tanto, en su
entusiasmo por aprenderla". (Laursen et al., 2007, p.62).
Para hacer que los programas sean más fáciles de impartir, con una audiencia más
amplia, el uso de tecnología moderna puede ser útil. El programa de divulgación del Proyecto
BioEYES también es un programa exitoso a largo plazo que presenta un plan de estudios de
pez cebra de una semana de duración, apropiado para el grado, práctico y basado en la
investigación que permite los estudiantes se conviertan en el científico principal, mientras
que los maestros enseñan conjuntamente con científicos de nivel universitario a estudiantes
graduados en todo el país e internacionalmente (Shuda y Keams-Sixsmith, 2009). Los
investigadores encontraron que los estudiantes, en todos los grados, mostraron marcadas
mejoras en la percepción de la ciencia, la investigación científica y las carreras científicas.
Los autores señalaron que el programa de 5 días “ofrece conexiones entre lo que se sabía y
lo que se va descubriendo”. Dado que el programa incluye un fuerte componente de
capacitación docente, los autores señalan que "Empoderar a los docentes para que aprendan
y realicen ciencias de forma independiente permite que muchos más estudiantes
experimenten el Proyecto BioEYES" (Shuda y Keams-Sixsmith, 2009). Este modelo de
"estudiante co-investigador" también es atractivo para los científicos porque se generan
datos que pueden ser útiles y es más probable que los estudiantes piensen fuera de la caja
en comparación con un científico que se ha centrado en el mismo problema durante años
con pocos aportes o ideas externas. inyectado en su investigación. A través de un enfoque
práctico de coinvestigador, los estudiantes deben aprender más sobre otros enfoques para
resolver problemas, como modelado, caracterización, basado en el descubrimiento y
reflexión, incluidas la crítica y la evaluación, todos los cuales no se enfatizaron en el pasado
(Schwarz et al., 2009). ;Abd-El-Khalick et al., 2004). Estos enfoques ilustran la importancia de
saber por qué la respuesta incorrecta es incorrecta puede ser más una experiencia de
aprendizaje que saber por qué la respuesta correcta es correcta. El científico también puede
explicar que practicar la ciencia es mucho más que el método científico típicamente
TRADUCCIÓN 77
A Framework for K-12 Science education señala en la página 280 que "si bien las
instituciones de ciencias o ingeniería pueden ayudar a las escuelas cercanas a brindar
experiencias de aprendizaje de alta calidad para sus estudiantes (p. ej., con expertos de la
industria que visitan el salón de clases, viajes de estudiantes a centros y acuarios,
participación docente en programas universitarios), el acceso a estos activos no puede
superar los efectos de la falta de equidad en los recursos escolares en todas las escuelas y,
de hecho, pueden reforzar esos efectos". Es importante destacar que los niños que ingresan
al jardín de infantes de todos los orígenes y niveles socioeconómicos son investigadores
naturales, observan cómo caen los objetos o crecen las plantas, tratando de comprender
cómo funciona el mundo de maneras sofisticadas, más de lo que alguna vez se reconoció
(NRC, 2007). Desafortunadamente, hay una ausencia casi total de educación científica en las
escuelas primarias con estudiantes que están en mayor riesgo académico, estudiantes que a
esta edad a menudo se sienten profundamente atraídos por el plan de estudios relacionado
con los mundos naturales y diseñados que proporcionan una base importante para el
aprendizaje de la ciencia. (CNR, 2009).
Los resultados de los programas que son administrados por un científico a los sistemas
escolares desfavorecidos no son prominentes en la literatura. Uno de estos estudios se
informó en 2007 e involucró a estudiantes de posgrado en ciencias que realizaron
actividades de extensión a corto plazo en ciencias para estudiantes de K-12 en escuelas con
más del 50 % de población minoritaria en Colorado (Laursen, et al., 2007).
Caso
Materiales y métodos
El primer plásmido de ADN aislado del participante, lo transformó en Agrobacterium y
luego lo inoculó en plantas de tabaco. Luego, los estudiantes observaron la proteína
fluorescente verde (GFP) expresada en células vegetales vivas. Las células vegetales
transformadas que expresan proteínas GFP luego se trataron con varios reactivos químicos y
los estudiantes observaron el cambio/movimiento de las proteínas GFP bajo microscopios.
En el laboratorio, los estudiantes aprendieron a usar un microscopio para observar proteínas
fluorescentes verdes expresadas en células vegetales vivas. Fuera del laboratorio, las
sesiones de conferencias cubrieron los principios de la microscopía, la clonación de genes, la
expresión génica transitoria, el cultivo de tejidos vegetales y la ingeniería genética con Gene
Gun y Agrobacterium. Para realizar estas tareas, los estudiantes trabajaron con herramientas
comunes en un laboratorio molecular, incluido pipeteo (Figura 5.1), electroforesis en gel
(Figura 5.2), cálculo de molaridad, microscopía (Figura 5.3) y aislamiento de ADN plasmídico.
Las encuestas, las anotaciones en el diario (Tabla 5.1) y las entrevistas se utilizaron
principalmente para recopilar datos sobre el interés de los estudiantes y el conocimiento del
contenido de la ciencia de las plantas antes y después del campamento. Se otorgó una beca
completa para alojamiento y comidas para traer a estudiantes de la zona económicamente
deprimida de Southside Virginia para participar en la investigación práctica y la experiencia
en el campus centrada en la ciencia molecular de las plantas. El Dr. Bingyu Zhao del
TRADUCCIÓN 81
Resultados y discusión
En total, 20 estudiantes de último año de secundaria en ascenso de Southside Virginia
económicamente deprimidos participaron en el campamento en 2012 y 2013. Los
estudiantes procedían de una variedad de escuelas, incluidas las escuelas públicas del
condado y de la ciudad y una academia privada cristiana y para niñas. Después de la
orientación y antes de que los estudiantes comenzaran el trabajo de laboratorio, se les
entregó un cuestionario cuantitativo con respuestas clasificadas del 1 al 5, según la
pregunta. Los estudiantes también recibieron diarios que se revisaron al final de la semana
para obtener datos cualitativos y comentarios. Durante el campamento, se hizo hincapié en
aumentar el interés en las carreras de ciencias de las plantas. Cuando se les preguntó antes
del campamento si los estudiantes estaban interesados específicamente en convertirse en
biólogos moleculares de plantas, solo se seleccionó un interés moderado para el grupo
(Figura 5.4), aunque un estudiante dijo que "ellos [los científicos de plantas] hacen mucho
más que mezclar compuestos y cultivar plantas, pueden interpretar sus investigaciones y
ayudar a mejorar la sociedad". Después del campamento, se detectó un ligero aumento en las
encuestas, aunque no significativo para el campamento 2013, posiblemente debido a la
menor cantidad de estudiantes participantes. También durante el campamento, se enfatizó la
TRADUCCIÓN 82
Este (el campamento) muestra que potencialmente podría haber carreras abiertas para
mí en el futuro relacionadas con la investigación práctica, original e interesante". Otro
estudiante registró: "Tengo curiosidad por saber qué depara el futuro para la biología de las
plantas". El campamento de 2013 todos calificaron esta pregunta con un 5 al final del
campamento, lo que indica que pensaban que había muchas oportunidades disponibles para
descubrimientos importantes en la ciencia de las plantas. La pregunta 3 evaluó el interés en
la ciencia molecular de las plantas antes y después del campamento (Figura 5.6). En ambos
campos, hubo un aumento en el interés y el resultado de cada campamento fue consistente
con el otro. El aumento más alto comparando antes y después de las encuestas del
campamento se logró con la pregunta 4 en el campamento de 2013, en la que los
estudiantes midieron su propio conocimiento de la ciencia molecular de las plantas (Figura
5.7) La Figura 5.8 combina las preguntas 5, 6 y 7. El 80 % de los estudiantes en 2012 y solo el
50 % de los estudiantes en 2013 respondieron que el campamento aumentó su interés en
seguir una carrera en ciencias moleculares de las plantas. interés en la biotecnología vegetal
y el 91% y 80 % respondieron que sí en 2012 y 2013 respectivamente. Un estudiante anotó en
su diario que "estaba fascinado de ver cómo la tecnología se desarrollaba a un ritmo tan
rápido". Finalmente, los estudiantes preguntaron si recomendarían el campamento a sus
compañeros, el 100% respondió que sí para ambos años. Es importante destacar que,
después del campamento, dos estudiantes buscaron más experiencia de laboratorio y ambos
trabajaron en el laboratorio el resto del verano.
Como la financiación del campamento era limitada, los métodos asequibles, como las
encuestas antes y después del campamento, generalmente solo pueden medir los cambios
de actitud. Si estos cambios son a largo plazo, permanentes o conducen a un cambio real, no
está dentro del alcance de este método de evaluación y tales evaluaciones "ideales" son
difíciles de administrar debido a una serie de razones. También es difícil determinar qué es lo
que realmente conduce a los cambios de actitud detectados porque las encuestas realizadas
al final de un campamento ocurren cuando los estudiantes están emocionados y pueden ser
más una medida de su disfrute del campamento y no una medida de si los objetivos
generales del campamento se cumplieron (Bogue, 2005).
De hecho, incluso los datos de encuestas que indican cambios de actitud pueden no ser
suficientes para establecer qué causó esos cambios (Lott, 2003),
conclusiones. Este proyecto también me mostró cuán importante puede ser un tamaño de
muestra grande, especialmente con plantas".
Ciencia vegetal: "Disfruté la ciencia vegetal. Las plantas no toman sus propias
decisiones, por lo que parece un campo más controlado. Las mesas hidropónicas
definitivamente hicieron que estudiar plantas fuera más fácil y divertido".
Conclusiones
Desde las noticias nacionales hasta las agencias de financiación de subvenciones, hay
informes que destacan y promueven la importancia de la educación STEM. Sin embargo,
aunque se presenta como una necesidad urgente para aumentar la enseñanza y el
aprendizaje de STEM en el aula, el sistema educativo K-12 de EE. UU. no tiende a moverse
rápidamente y los cambios abruptos pueden estar fuera de discusión. Las múltiples razones
que subyacen a la dificultad de cambio en el sistema incluyen; los maestros deben estar
preparados en la entrega de contenido STEM, se debe desarrollar un plan de estudios
acordado y se debe asignar tiempo durante el día escolar. Por otro lado, la promoción del
acrónimo STEM y la financiación de actividades relacionadas han pasado a la vanguardia de
la educación, pero las mejoras medibles en el enfoque integrador de la enseñanza y el
aprendizaje aún están en duda. La adopción de nuevos planes de estudios cobra impulso a
medida que se aprobó la Ley de mejora de la educación en ciencia, tecnología, ingeniería y
matemáticas de 2008 (Ley eSTEM, H.R. 6104) que instituye entidades gubernamentales
relacionadas con la educación STEM, un consorcio, una cámara de compensación para
difundir programas e ideas creativas. en la enseñanza y el aprendizaje, y quizás lo más
importante, los estándares de contenido para K-12 STEM. Además, la financiación y las
iniciativas a nivel local, estatal, federal y de fundaciones privadas respaldan el crecimiento y
el énfasis de la educación STEM y se alienta a los profesores universitarios a participar y
conectarse con la educación K-12.
breves con la ciencia, interactuar con científicos como modelos a seguir y aprender sobre
carreras científicas. y oportunidades para hacer una diferencia en el mundo. Juntas, estas
experiencias pueden contribuir más adelante a seguir una carrera en ciencias. Además, estos
programas pueden beneficiar más a los sistemas escolares de áreas económicamente
deprimidas, a menudo con menores recursos.
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Nitrogenase MoFe cofactor biosynthesis proteins (Aguilar et al., 1990) NifN 1350
NifX 417 138 Pathway for the synthesis of the Fe-Mo cofactor (Rangararj et al., 1998)
Essential for the maturation and assembly of nitrogenase (Lee et al., 1998) NifB 1608 535
Pathway for the synthesis of the Fe-Mo cofactor (Rangararj et al., 2001) hesB 399 132
Involved in Fe-S cluster biogenesis; expressed only under nitrogen fixation (Huang, 1999)
NifZ 423 140 Required for the maturation of the nitrogenase MoFe protein (Cotton et al.,
2009) NifT 219 72 Involved in biosynthesis of the FeMo cofactor (Stricker et al., 1997) NifH
882
Homo-dimer dinitrogenase reductase, or Fe protein (Fani et al., 2000) NifD 1464 487
Nitrogenase molybdenum-iron protein alpha chain (Zher et al., 2003) NifK 1560 519
Nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain (Zher et al., 2003) PAS 5430 1809 Signal
sensor domain for cell nitrogen status (Menard et al., 2004) LuxR 1275 423 1) Regulators
which belong to a two-component sensory transduction system (Birck, 2002)
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