Biología II - Metabolismo - Catabolismo y Anabolismo
Biología II - Metabolismo - Catabolismo y Anabolismo
Biología II - Metabolismo - Catabolismo y Anabolismo
METABOLISMO Y ENZIMAS
1.-METABOLISMO
Es el conjunto de reacciones químicas que ocurren en las células.
Sus objetivos básicos son la degradación y la síntesis de biomoléculas:
1.1-RUTAS METABÓLICAS
Es una sucesión de reacciones químicas donde un sustrato inicial se transforma en unos
productos finales, a través de una serie de metabolitos intermediarios.
Ocurren en el interior de las células y están catalizadas por enzimas.
Hay una enzima diferente para cada reacción, la falta de una enzima determinada bloquea la
ruta impidiendo:
• La síntesis de un producto
• El uso de un nutriente
COMPOSICIÓN Y ESTRUCTURA
Las enzimas proteicas pueden ser:
• PROTEÍNAS ENZIMÁTICAS (- frecuentes): formadas solo por proteínas.
• HOLOENZIMAS (mayoría): formadas por:
o Parte proteica: APOENZIMA, presenta el centro activo, que es el sitio de unión a
los sustratos.
o Parte no proteica: componentes enzimáticos que llevan a cabo la reacción.
Pueden ser:
▪ GRUPO PROSTÉTICO: unido permanentemente al apoenzima
mediante enlaces covalentes.
▪ COFACTOR: la mayoría, unido temporalmente al apoenzima mediante:
• Un catión metálico
• COENZIMAS (vitaminas, NAD+, FAD+)
El CENTRO ACTIVO es un hueco tridimensional en la
superficie de la enzima al que se une el sustrato. Esta
recubierto por restos de aminoácidos.
La conformación del centro activo depende de la
estructura terciaria de la
enzima
2.1.-PROPIEDADES DE LAS ENZIMAS
Además de las propiedades de las proteínas, presentan otras propiedades:
• GRAN ACTIVIDAD CATALÍTICA: aceleran las reacciones químicas, disminuyendo
su energía de activación, sin alterar su equilibrio
• ALTO GRADO DE ESPECIFICIDAD (*), que puede ser:
o Absoluta: actúan sobre un único sustrato.
o De grupo: sobre un grupo de sustratos similares.
o De acción: actúan en una reacción determinada (oxidación)
• ACTÚAN A PH Y TEMPERATURA FISIOLÓGICOS: por encima de cierto valor se
desnaturalizan.
• NO SE CONSUMEN EN LA REACCIÓN: al terminar la reacción quedan libres para
actuar sobre otra molécula de sustrato.
• SU ACTIVIDAD SE PUEDE REGULAR: por medio de estímulos intracelulares o
extracelulares.
(*) ESPECIFICIDAD ENZIMÁTICA
Se debe a que la conformación tridimensional del centro activo de la enzima es
complementaria a la estructura de la molécula de sustrato.
Existen dos teorías para explicar la complementariedad.
• TEORÍA CLÁSICA “modelo de llave-cerradura” (Fischer): la enzima y el sustrato
encajan exactamente en el centro activo, pero no se cumple siempre.
• TEORÍA MODERNA “modelo del ajuste inducido” (Koshland): el centro activo tiene
cierto grado de complementariedad con el sustrato, adaptándose a él.
2.2.-MECANISMO DE ACCIÓN DE LAS ENZIMAS
𝐸 + 𝑆 ⇌ 𝐸𝑆 → 𝐸 + 𝑃
2.3.-CINÉTICA ENZIMÁTICA
Estudia la velocidad de las reacciones catalizadas por enzimas.
EL PH
Cada enzima tiene un pH óptimo para el cual su actividad es máxima; por encima o por debajo
de ese pH, la actividad disminuye hasta alcanzar el valor para desnaturalizarse, cesando su
actividad. Esto se debe a que los grupos funcionales de los radicales de los aminoácidos del
centro activo se ionizan, alterando su estructura, lo que dificulta o
impide la unión del sustrato.
El pH óptimo de una enzima depende del medio en el que actúa:
• Enzimas que actúan en el interior celular: pH 7
• En el jugo gástrico: pH 2
• La enzima pancreática: pH 9
LA TEMPERATURA (T)
Cada enzima tiene una T óptima para la cual su actividad es máxima.
La actividad aumenta al aumentar la T, hasta alcanzar la T óptima.
Por encima de la T óptima, la enzima se desnaturaliza rápidamente y pierde su actividad.
ISOENZIMAS: enzimas con la misma acción catalítica pero distinta 𝐾𝑀 , y por tanto distinta
velocidad de reacción. (lactato-deshidrogenasa (LDH)).
La actividad enzimática se regula siguiendo el principio de economía celular: las enzimas solo
se sintetizan o se activan cuando se necesitan, evitando la fabricación y acumulación innecesaria
de productos.
TIPOS DE INHIBICIÓN
• IRREVERSIBLE: el inhibidor se une permanentemente al centro activo.
• REVERSIBLE: el inhibidor se une temporalmente a la enzima; una vez liberado, la
enzima recupera su actividad, pueden ser (según el sitio de unión):
o Competitiva
o No competitiva
o Acompetitiva
2.6.-ENZIMAS ALOSTÉRICAS
CARACTERÍSTICAS
• Regulas las rutas metabólicas de forma muy precisa. Suelen encontrarse:
o Al inicio de la ruta
o En los puntos de ramificación de una ruta
• Tienen estructura cuaternaria: están formadas por dos o más subunidades:
o Con un sitio alostérico diferente al sitio activo, para un modulador o efector
alostérico.
o Con un centro activo para la unión del sustrato
• Las subunidades presentan efecto cooperativo: cuando un modulador se une al sitio
alostérico de una subunidad, se modifica el centro activo de todas las demás
subunidades. Permite una regulación más rápida y con menor cantidad de
moduladores.
• Presentan dos conformaciones, dependiendo del modulador que se una:
o Modulador positivo (activador) la enzima se activa: FORMA O ESTADO R
o Modulador negativo (inhibidor) la enzima se inactiva: FORMA O ESTADO T
• No obedecen a la cinética de Michaelis-Menten.
Catabolismo
1.-CONCEPTOS
ENERGÍA LIBRE DE GIBBS
Para medir si una reacción química se produce espontáneamente o no, se usa la energía
libre de Gibbs (G). Varía dependiendo de la presión y la temperatura:
• ΔG<0 : espontánea
• ΔG=0 : equilibrio
• ΔG>0 : no espontánea
EL ATP
Es la moneda de intercambio de energía
en las células.
Su formación requiere energía y su
hidrólisis la desprende. Este ciclo es el
mecanismo de intercambio energético
más universal en los seres vivos.
• La energía liberada en las
reacciones del catabolismo se utiliza para unir el grupo fosfato al ADP y recuperar el
ATP. De esta forma, la energía se almacena temporalmente en este enlace.
• La energía liberada para los procesos anabólicos procede de la ruptura del enlace
que mantiene unido el fosfato terminal del ATP.
BIOENERGÉTICA
Las reacciones del anabolismo que no son espontáneas necesitan un aporte externo de energía.
Según el tipo de células, esta energía se consigue de forma diferente.
CÉLULAS AUTÓTROFAS
Absorben energía del medio externo utilizando procesos como:
• La fotosíntesis: por la que captan la energía de la luz solar.
• La quimiosíntesis: en la que aprovechan la energía química liberada en ciertas
reacciones químicas exergónicas.
En ambos casos, la almacenan en los enlaces químicos de moléculas llamadas
TRANSPORTADORES DE ENERGÍA, como el ATP.
Finalmente, la emplean para la biosíntesis de sus propias moléculas orgánicas, que pueden
sufrir un catabolismo posterior.
CÉLULAS HETERÓTROFAS
Se nutren de moléculas orgánicas sintetizadas por otros seres vivos.
El catabolismo o degradación de estos nutrientes libera energía que se almacena en los
TRANSPORTADORES DE ENERGÍA.
Esa energía se emplea para la biosíntesis, el movimiento...
2.-CATABOLISMO
Conjunto de reacciones de oxidación-reducción que degradan moléculas orgánicas complejas a
moléculas sencillas.
FINALIDAD
Liberar:
• Energía: se producen degradaciones oxidativas que liberan la energía química de
los enlaces rotos. La energía se almacena en forma de ATP.
• Poder reductor: cuando un compuesto se oxida libera protones que son aceptados
por moléculas transportadoras de hidrógenos, que se reducen:
o 𝑁𝐴𝐷+ + 2𝐻 + → 𝑁𝐴𝐷𝐻 + 𝐻+
o 𝑁𝐴𝐷𝑃+ + 𝐻+ → 𝑁𝐴𝐷𝑃𝐻
o 𝐹𝐴𝐷 + 2𝐻+ → 𝐹𝐴𝐷𝐻2
• Moléculas sencillas: precursore metabólicos (metabolitos).
La energía, el poder reductor y los metabolitos liberados durante el catabolismo serán
utilizados durante el anabolismo.
PROCESOS CATABOLICOS
• RESPIRACIÓN CELULAR: oxidación completa de una molécula orgánica hasta materia
inorgánica, con lo que se libera TODA la energía contenida en sus enlaces C-C
principalmente en forma de ATP. El aceptor final de los electrones es una molécula
inorgánica, la respiración puede ser:
o Aerobia: el aceptor final de los electrones es el oxígeno.
o Anaerobia: el aceptor final de los electrones es otra molécula inorgánica NO O2.
• FERMENTACIONES: oxidación parcial de una molécula orgánica a materia orgánica
sencilla, con la que se libera menos energía. El aceptor de los electrones es una
molécula orgánica.
SÍNTESIS DE ATP
La energía liberada en las reacciones de oxidorreducción se almacena en
forma de ATP. El ATP puede sintetizarse de dos formas:
• por FOSFORILACIÓN A NIVEL DE SUSTRATO: Una molécula que
posee un grupo fosfato lo cede al ADP en una reacción química.
• por FOSFORILACIÓN OXIDATIVA: Los electrones liberados en las
oxidaciones se dirigen a la cadena de transporte de electrones, donde
se libera energía, que es utilizada por la enzima ATP sintasa para
unir un grupo fosfato al ADP y producir ATP
TIPOS DE CATABOLISMO SEGÚN EL TIPOS DE COMPUESTOS SEGÚN EL
COMPUESTO ORGÁNICO DE PARTIDA ACEPTOR FINAL
FUENTES DE GLUCOSA
•NUTRIENTES de los alimentos de los que se nutren los organismos
heterótrofos.
•SÍNTESIS DE GLUCOSA a partir de materia inorgánica que llevan a
cabo los organismos autótrofos (fotosíntesis o quimiosíntesis).
•GLUCONEOGÉNESIS a partir de la transformación de otras moléculas
orgánicas (proceso inverso a la glucólisis). Es una ruta anabólica.
•GLUCOGENOLISIS (ruta catabólica), que es la hidrólisis de las
reservas de almidón o glucógeno.
OXIDACIÓN DE LA GLUCOSA
Las moléculas de glucosa se oxidan mediante reacciones en las que la energía se libera en
pequeñas cantidades y se almacena en moléculas de ATP. Las reacciones se agrupan en dos
fases:
1. La glucosa se oxida en una ruta llamada GLUCÓLISIS, en la que se obtiene energía en
forma de ATP y ácido pirúvico (piruvato).
2. Se produce la OXIDACIÓN DEL PIRUVATO. Esta oxidación es diferente según el tipo de
célula y las condiciones en las que se encuentre.
• REACCIÓN 2: ISOMERIZACIÓN
La glucosa-6-P se isomeriza a fructosa-6-P
• REACCIÓN 3: FOSFORILACIÓN
La fructosa-6-P se fosforila a fructosa-1,6-difosfato
Añade otro grupo fosfato, de la hidrólisis de otro ATP, es la segunda reacción de activación
SE CONSUME OTRO ATP (-1 ATP) ya se han consumido 2 ATP, uno por cada Pi (grupo
fosfato) añadido
La molécula está activada, lista para escindirse en 2 de 3C
• REACCIÓN 4: ESCISIÓN
La fructosa-1,6-difosfato se rompe dando lugar a 2 triosas:
o 1 gliceraldehido-3-P
o 1 dihidroxiacetona-P
• REACCIÓN 5: ISOMERIZACIÓN
La dihidroxiacetona-P se isomeriza a gliceraldehido-3-P
• REACCIÓN 8: ISOMERIZACIÓN
El 3-fosfoglicerato se isomeriza a 2-fosfoglicerato
• REACCIÓN 9: DESHIDRATACIÓN
El 2-fosfoglicerato libera una molécula de agua y se transforma en fosfoenolpiruvato
La respiración aerobia la realizan las eucariotas (mitocondria) y gran parte de los procariotas
(en el citoplasma).
Se lleva a cabo en tres etapas:
• Descarboxilación oxidativa (matriz mitocondrial)
• Ciclo de Krebs o de los ácidos tricarboxílicos (matriz mitocondrial)
• Fosforilación oxidativa (membrana mitocondrial interna)
En la respiración aerobia, los electrones liberados se transfieren a las coenzimas NAD+ y FAD,
que posteriormente se cederán al oxígeno, que es el aceptor final.
1.-DESCARBOXILACIÓN OXIDATIVA
Conversión del Piruvato (3C) en Acetil-CoA (2C)
El piruvato se produce en el citoplasma, mediante la glucólisis, y debe entrar a la mitocondria a
través de permeasas específicas de las membranas mitocondriales.
1.-El grupo carboxilo del piruvato se libera en
forma de CO2 formando acetato.
2.-El acetato se una a la coenzima A formando
Acetil-CoA 3.-
Los H+ liberados reducen el NAD+ ->NADH
Por cada molécula de glucosa, el ciclo debe dar dos vueltas, pues en la glucólisis se forman 2
moléculas de piruvato que se transforman en 2 Acetil-CoA.
2 Acetil-CoA → 4 CO 2 + 6 NADH + 2 FADH 2 + 2 GTP
La energía necesaria para la síntesis de ATP se encuentra en los electrones de los NADH y
FADH 2 generados en las oxidaciones anteriores, que son cedidos a su aceptor final, el
oxígeno, a través de una cadena de transporte de electrones (o CADENA RESPIRATORIA)
LA FOSFORILACIÓN OXIDATIVA
La mayor concentración de protones en el espacio intermembranoso hace que los protones
vuelvan a la matriz a través del complejo ATPasa, a favor de gradiente electroquímico,
generando una “fuerza protón-motriz” que hace funcionar la ATPasa, formando 1 ATP por cada
3 protones que regresan a la matriz:
• 1 NADH → 3 ATP (se bombean 10 H + al espacio intermembranoso)
• 1 FADH 2 → 2 ATP (se bombean 6 H + al espacio intermembranoso)
LA FERMENTACIÓN LÁCTICA
• El piruvato, procedente de la glucólisis se reduce a lactato.
• El NADH se oxida regenerando el NAD+ necesario para que la glucólisis continúe.
NO SE PRODUCE ATP. El único rendimiento energético son los 2 ATP de la glucólisis.
Realizada por:
• Bacterias lácticas: como Lactobacillus, que producen queso, yogurt...
• Células del músculo esquelético cuando no reciben suficiente oxígeno.
LA FERMENTACIÓN ALCOHÓLICA
• El piruvato, procedente de la glucólisis se descarboxila a Acetaldehído y este se reduce
a etanol.
• El NADH se oxida regenerando el NAD+ necesario para que la glucólisis continúe.
NO SE PRODUCE ATP. El único rendimiento energético son los 2 ATP de la glucólisis.
4.-CATABOLISMO DE LÍPIDOS
Los triacilglicéridos constituyen las principales reservas energéticas. Son ésteres de glicerol y
tres ácidos grasos.
5.-CATABOLISMO DE PROTEÍNAS
Las proteínas no se degradan para obtener energía. El organismo sólo recurre a ellas en casos
de:
• Ayuno estricto
• Dietas hiperproteicas
• Necesidad de reciclas proteínas muy usadas
Su degradación se produce en 3 fases:
1. SEPARACIÓN DE LOS AMINOÁCIDOS mediante enzimas proteasas: pepsina, tripsina...
2. ELIMINACIÓN DEL GRUPO AMINO DE LOS AMINOÁCIDOS
3. OXIDACIÓN DE LA CADENA CARBONADA RESTANTE
Para crear estas moléculas hay que aportar al organismo energía y materia:
CLASIFICACIÓN DE LOS ORGANISMOS EN FUNCIÓN DE SU NUTRICIÓN
FOTÓTROFOS QUIMIÓTROFOS
(energía luminosa del Sol) (energía química de reacciones
redox)
AUTÓTROFOS (C de CO2) FOTOAUTÓTROFOS / QUIMIOAUTÓTROFOS /
LITÓTROFOS (C e H de FOTOLITÓTROFOS QUIMIOLITÓTROFOS
sustancias inorgánicas) Plantas, algas, cianobacterias... Bacterias quimiosintéticas del N,
ferrobacterias...
HETERÓTROFOS (C de
moléculas orgánicas QUIMIOHETERÓTROFOS /
sintetizadas por otros seres FOTOHETERÓTROFOS / QUIMIOORGANÓTROFOS
vivos) FOTOORGANÓTROFOS Muchas bacterias, algunos
Bacterias púrpuras no sulfúreas protistas, animales y hongos
ORGANÓTROFOS (H a partir
de moléculas orgánicas
complejas)
2.-EL ANABOLISMO
2.1. CARACTERÍSTICAS DE LOS PROCESOS ANABÓLICOS (contrarias a los
catabólicos)
• Son constructivos
• Las moléculas orgánicas se reducen y los coenzimas (NADH, NADPH, FADH2) se
oxidan
• Requieren aporte energético (hidrólisis del ATP)
3.-FOTOSÍNTESIS
Transforma la energía lumínica del Sol en energía química (ATP) y poder reductor (NADPH),
empleada para sintetizar moléculas orgánicas a partir de moléculas inorgánicas.
Lo llevan a cabo los organismos autótrofos:
• Medios acuáticos: algas y cianobacterias
• Medios terrestres: plantas
Es uno de los procesos más importantes que ocurren en la biosfera.
Los organismos fotosintéticos son la base de las cadenas tróficas:
• Transforman materia inorgánica en materia orgánica, a partir de la energía del Sol.
• La materia orgánica se usa por los organismos heterótrofos.
LOS FOTOSISTEMAS
Unidades formadas por pigmentos fotosintéticos y complejos proteicos.
Son los encargados de captar la energía luminosa y transformarla en energía química.
Los fotosistemas constan de:
• UN COMPLEJO ANTENA: en la periferia del fotosistema:
250-400 moléculas de PF, clorofila y pigmentos accesorios
Absorben la energía lumínica y la transfieren al centro de reacción
• UN CENTRO DE REACCIÓN: en el centro del fotosistema:
2 moléculas de clorofila A: transforman energía lumínica en energía química.
• UN DADOR Y UN ACEPTOR DE ELECTRONES
DOS FOTOSISTEMAS:
• FOTOSISTEMA I (PS I): en tilacoides no apilados. En el centro de
reacción hay 2 clorofilas A o P700
o Dador de electrones: plastocianina
o Aceptor de electrones: ferredoxina
• FOTOSISTEMA II (PS II): en tilacoides apilados (grana). En el centro de reacción hay
2 clorofilas A o P680
o Dador de electrones: agua
o Aceptor de electrones: plastoquinona
CICLO DE CALVIN
Es la formación de gliceraldehido-3-P a partir del
carbono del CO2.
A partir del G3P pueden sintetizarse otras moléculas
orgánicas como la glucosa.
Para formar una Glucosa a partir de CO2, son necesarios 2 G3P. El ciclo debe dar 6 vueltas
4.- QUIMIOSÍNTESIS
Es exclusiva de bacterias quimioautótrofas.
Es la nutrición autótrofa que consiste en la obtención de materia orgánica a partir de materia
inorgánica, utilizando ATP y NADH liberado en reacciones de oxidación de compuestos
inorgánicos.
5.-ANABOLISMO HETERÓTROFO
Es la síntesis de moléculas orgánicas complejas a partir de moléculas orgánicas más simples. Se
realiza en todas las células.
Ocurre en dos fases:
• Biosíntesis de monómeros
• Biosíntesis de polímeros
Muchas rutas del anabolismo heterótrofo son inversas a las correspondientes rutas catabólicas.
(*) GLUCONEOGÉNESIS:
Es un proceso inverso a la glucólisis excepto las reacciones irreversibles (1,3,10) que se salvan
por vías diferentes.
Es un proceso energéticamente desfavorable, ya que para fabricar 1 glucosa a partir de 2
piruvatos se consumen 6ATP. La glucólisis consume 2 ATP.