TEMA 12: METABOLISMO Y ENZIMAS

1. CARACTERÍSTICAS
Reacción metabólica: tiene lugar entre biomoléculas presentes en un organismo vivo.
Existen unas características generales aplicables a todas ellas, que permiten clarificar los
procesos:
● Actúan secuencialmente originándose rutas metabólicas constituidas por ellas. El
producto final de una constituye la molécula de partida de la siguiente. Son variadas,
ramificándose y conectándose unas con otras. Estas conexiones causan la variedad y
perfección de los procesos químicos biológicos.
● Rutas convergentes y divergentes. Convergentes: se obtiene el mismo producto final
desde distintas moléculas de partida. Divergentes: una única molécula origina
diferentes productos. Una misma molécula puede formar parte de una ruta
convergente y otra divergente.
● Algunas son comunes en la mayoría de organismos. las empleadas para obtención de
energía o síntesis de los grandes grupos de moléculas. Lo que apoya hipótesis de
origen único de seres vivos.
También hay otras específicas de distintas células u organismos que explican la
variedad funcional de seres vivos. Como la síntesis de una determinada hormona o
posibilidad de metabolizar un nutriente específico.
● Clasificación.
○ Catabólicas: degradativas, se pasa de moléculas más complejas a otras más
sencillas; finalidad básica es obtención de energía.
○ Anabólicas: constructivas, síntesis de nuevas moléculas; necesario aporte
energético.
● Todas son catalizadas por enzimas. Enzimas: elemento fundamental en metabolismo,
de su grado de actividad depende la realización de reacciones metabólicas. Para cada
reacción existe una enzima diferente. Falta de determinada enzima provoca un defecto
en una ruta metabólica- imposibilidad de sintetizar o utilizar cierto nutriente.
Organismos con deficiencias enzimáticas son útiles en investigación de rutas
metabólicas.

2. ENZIMAS
Proteínas biocatalizadoras (catalizadoras biológicas) de reacciones metabólicas. De su grado
de actividad dependen el tipo y velocidad de las reacciones entre compuestos biológicos y de
los procesos vitales derivados de ellas.
Pueden estar formadas sólo por cadenas polipeptídicas o contener otro grupo no proteico.
Si sólo consta de parte proteica, esta se encarga de fijar específicamente las moléculas que
reaccionan (sustrato) y realizar la reacción sobre ellas. Para ello existen regiones de la cadena
polipeptídica cuyos aminoácidos se unen a sustratos (centro activo) y otras que interaccionan
con estos para la reacción.
En el caso de contener además otro grupo no proteico (más común):

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 ● Parte proteica: apoenzima. encargada de proporcionar estructura espacial específica
que permite unión a sustratos.
● Parte no proteica: grupo prostético cuando su unión a la apoenzima es permanente y
cofactor cuando no (habitual). componentes enzimáticos que llevan a cabo la
reacción, la catálisis.
2.1 LAS VITAMINAS
Tienen una enorme importancia en los procesos metabólicos como coenzimas. Su carencia
impide la adecuada acción de las enzimas y puede producir alteraciones metabólicas.
Son moléculas muy lábiles: pueden ser alteradas fácilmente, su destrucción puede ser
provocada por: calor, cambios de pH, el oxígeno del aire, la luz.
Animales no son capaces de sintetizarlas, deben obtener las de alimentos vegetales, aunque
algunos productos animales crudos son fuente de vitaminas (las tienen acumuladas). Son
nutrientes esenciales como los ácidos grasos y algunos aminoácidos. Las necesidades diarias
son muy pequeñas.
Las necesidades de algunas vitaminas puede satisfacerse con ingestión de provitaminas,
moléculas que tras un cambio químico producido en el organismo originan la vitamina activa.
Hipovitaminosis. déficit de vitaminas, puede generar trastornos y enfermedades carenciales.
Hipervitaminosis. consumo excesivo de vitaminas, menos frecuente, puede aparecer en
personas que ingieren preparados farmacéuticos con dosis muy altas de vitaminas.
NOMENCLATURA DE LAS VITAMINAS
Antiguamente se denominaban según la enfermedad que producía su carencia.
Posteriormente se utilizaron letras y en la actualidad se va imponiendo su nombre químico.
Clasificación de las vitaminas
Composición química es variada pero se clasifican en dos grupos según su solubilidad en
agua.
● Liposolubles. lipídicas, insolubles en agua. Se acumulan en el hígado y otros lugares
con tejido adiposo.
○ A o retinol:
■ antioxidante, participa en el ciclo visual de células fotorreceptores de
la retina, interviene en mantenimiento tejidos epiteliales.
■ alteraciones epiteliales, opacidad y engrosamiento de la córnea,
ceguera nocturna.
○ D o calciferol:
■ mineralización de los huesos, absorción Ca2+ y P en intestino
■ raquitismo y osteomalacia
○ E o tocoferol:
■ antioxidante
■ esterilidad en algunos animales (no ser humano)
○ K o naftoquinona:
■ síntesis de protrombina, necesaria para coagulación sanguínea.
■ hemorragias

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 ● Hidrosolubles. solubles en agua. No se acumulan en tejidos grasos.
○ B1 o tiamina
■ como pirofosfao de tiamina es coenzima de enzimas descarboxiladas
■ polineuritis y otros trastornos del sistema nervioso.
○ B2 o riboflavina
■ origina coenzimas FMN y FAD- participan en reacciones metabólicas
oxidación-reducción.
■ lesiones cutáneas, bucales y labiales.
○ B3 o nicotinamida
■ origina coenzimas NAD+ y NADP+- participan en reacciones
metabólicas oxidación-reducción.
■ pelagra (dermatitis, diarrea, demencia).
○ B5 o ácido pantoténico
■ forma parte coenzima A- transporta grupos acilo.
■ fatiga y alteración de coordinación muscular.
○ B6 o piridoxina
■ como fosfato de piridoxal es coenzima de enzimas transaminasas.
■ trastornos sistema nervioso
○ B8 o biotina
■ coenzima de enzimas carboxilasas.
■ alteraciones musculares
○ B9 o ácido fólico
■ como ácido tetrahidrofólico participa en reacciones sístesis bases
nitrogenadas.
■ anemia
○ B12 o cianocobalamina
■ como desoxiadenosil cobalamina interviene en reacciones de
metabolismo proteínas y ácidos nucleicos.
■ anemia
○ C o ácido ascórbico:
■ participa en reacciones de hidroxilación
■ escorbuto (hemorragias digestivas, caída de dientes, mala cicatrización
heridas), aumento susceptibilidad a infecciones respiratorias.
2.2 PROPIEDADES DE LAS ENZIMAS
Por su carácter proteico, poseen mismas propiedades que proteínas.
Desnaturalización al ser sometidas a cambios de pH, variaciones de temperatura y elevadas
concentraciones salinas.
Alto grado de especificidad:
● En la selección de sustratos. grado de especificidad del sustrato normalmente elevado,
puede variar. Hay enzimas que muestran especificidad absoluta y sólo actúan sobre un
tipo concreto de sustrato, diferenciando estereoisómeros. Otras solo muestran
especificidad con el grupo funcional, como enzimas esterasas.
Salvo excepciones, monosacáridos en seres vivos son estereoisómeros D y
aminoácidos proteínas estereoisómeros L. Se debe a especificidad enzimas, sólo
catalizan reacciones sobre estos estereoisómeros.

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 Una molécula sólo puede ser metabolizada por un ser vivo si cuenta con la enzima
adecuada, si no es así, la molécula no tiene utilidad metabólica y es eliminada en el
curso evolutivo.
● En la reacción. para cada tipo de reacción química (aunque sea mismo sustrato) existe
una enzima diferente, una enzima cataliza una sola reacción química o un grupo de
reacciones relacionadas.
Al ser catalizadores, no se consumen durante la reacción, una misma molécula puede
actuar repetidamente, Las necesidades enzimáticas son muy bajas y cantidades pequeñas de
enzima pueden transformar grandes cantidades de sustrato.
Las enzimas se alteran y destruyen con el tiempo, existe una pérdida, una misma molécula
enzimática no actúa eternamente. Es necesaria una renovación periódica.
2.3 MECANISMO DE LAS REACCIONES ENZIMÁTICAS
Reacciones químicas se inician con rotura de ciertos enlaces entre átomos de las moléculas de
los reactivos, para formar nuevos enlaces que originan las moléculas de los productos.
Estado de transición o estado activado: estado en que los enlaces de reactivos están
debilitados o rotos, pero aún no se han formado los nuevos.
Energía de activación: cantidad de energía comunicada a los reactivos necesaria para
alcanzar el estado de transición y que la reacción tenga lugar.
Diferencia entre reacciones endotérmicas y exotérmicas: balance energético global del
proceso. Endotérmicas necesitan energía, exotérmicas la desprenden. Ambas necesitan
energía de activación.
Reacciones espontáneas. energía de activación es muy baja, se obtiene de la energía cinética
de las moléculas o de la luz que incide en el lugar de reacción.
Reacciones no espontáneas. energía muy alta, necesita la aplicación de calor.
Acción catalizadora de las enzimas: consiste en rebajas energía de activación para llegar
fácilmente a estado de transición. Sin presencia catalizador, no es posible alcanzar estado de
transición espontáneamente. Catalizadores realizan su acción favoreciendo aproximación de
moléculas de reactivos.
Todas las reacciones metabólicas, excepto excepciones, son catalizadas por enzimas.
ETAPAS DE LAS REACCIONES CATALIZADAS
Sustrato se encuentra con la enzima correspondiente.
1. Sustrato se une a apoenzima formando complejo enzima-sustrato (ES). unión se
caracteriza por alto grado de especificidad, se debe a estructura proteica de la
apoenzima, cuyo centro activo tiene una forma espacial característica en la que se
acopla el sustrato. Salientes y entrantes de una y otra deben encajar. Teoría de la
“llave-cerradura” 1890 por Emil Fischer considerada esencialmente correcta. En la
actualidad se ha probado que en algunas enzimas el centro activo modifica su forma
para adaptarse al sustrato, Teoría de “ajuste o acoplamiento inducido” 1958 por
Daniel E. Joshland Jr.

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 La unión es reversible pues una parte del complejo ES se disocia, debido a esa
reversibilidad esta etapa es la más lenta.

La unión de los radicales de aminoácidos del centro activo al sustrato consigue

debilitar sus enlaces, lo que provoca cambios energéticos que permite alcanzar
fácilmente el estado de transición.
2. Coenzima lleva a cabo la reacción y se obtiene el producto final (P). Etapa muy rápida
e irreversible. Si no existen cofactores, la acción catalítica la realizan algunos
aminoácidos del propio centro activo.

3. El producto se libera en el centro activo y la apoenzima queda libre para volver a

unirse a nuevas moléculas de sustrato. Coenzima puede liberarse intacta o quedando
modificada.

3. CINÉTICA ENZIMÁTICA
La representación gráfica de la cinética se suele hacer de la velocidad con que aparece el
producto en función de la concentración del sustrato inicial para una cantidad constante de
enzima.
Al aumentar la concentración de sustrato, también aumenta la velocidad de la reacción, ya
que habiendo una cantidad constante de enzima, a mayor número de moléculas de sustrato,
más moléculas de producto aparecerán. Pero existe una velocidad máxima a la que aunque la
concentración de sustrato siga aumentando, no varía. Esto es debido a la inexistencia de
enzima libre, pues están todas ocupadas por moléculas de sustrato formando complejos ES.
Según se forman las moléculas de producto, las enzimas se liberan y pueden aceptar nuevas
moléculas de sustrato.
En la reacción enzimática, la etapa limitante (la más lenta), corresponde a la unión del
sustrato al centro activo para formar el complejo ES, proceso reversible. Existe una constante
de equilibrio (ke) para esta etapa.

Esta constante se calcula conociendo la concentración de enzima libre y la que forma el

complejo ES, valores que no se pueden establecer directamente. Pero cuando la velocidad de
reacción es la mitad de la máxima, el número de moléculas libre es igual al de ocupadas. En
este caso, la constante de equilibrio se simplifica y queda:

La constante obtenida de esta manera se llama de Michaelis-Menten o KM, se define como la

concentración de sustrato para la cual la reacción alcanza la velocidad semi-máxima (mitad
de vel. máxima). Es característica de cada enzima y cuanto menor sea, mayor afinidad tendrá
la enzima por el sustrato, se alcanza antes la velocidad semi-máxima.

4. FACTORES QUE INFLUYEN EN LA VELOCIDAD DE LAS

REACCIONES ENZIMÁTICAS
Las reacciones catalizadas por enzimas no se producen siempre a la misma velocidad. Entre
los factores que modifican la velocidad destacan:

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LA CONCENTRACIÓN DEL SUSTRATO
Al aumentar la concentración de sustrato existen más centros activos ocupados y la velocidad
aumenta hasta no quedar centros activos libres, cuando el aumento de la concentración de
sustrato no supone un aumento de la velocidad de la reacción.
EL pH
Cada enzima tiene un pH óptimo de actuación. Valores por encima o debajo de este valor
óptimo provocan un descenso de la velocidad enzimática, debido a cambios en la carga
eléctrica de los radicales de los aminoácidos que constituyen el centro activo. Por debajo de
un pH mínimo y por encima de uno máximo, se produce la desnaturalización de la enzima y
su actividad se anula.
Así puede aparecer o desaparecer enlaces, por fuerzas electrostáticas que alteren la estructura
espacial del centro activo o su unión al sustrato. También cambian las cargas eléctricas en el
sustrato. El acoplamiento del sustrato del centro activo se verá dificultado y la velocidad
disminuirá.
LA TEMPERATURA
Existe una temperatura óptima en la que la actividad enzimática es máxima. Las temperaturas
inferiores al valor óptimo provocan una disminución de la vibración molecular que hace más
lento el proceso, y temperaturas superiores pueden provocar la desnaturalización de la enzima
y la pérdida total de su funcionalidad.

5. MECANISMOS PARA AUMENTAR LA EFICACIA ENZIMÁTICA

Procesos metabólicos en seres vivos se componen generalmente de unas secuencias de
reacciones encadenadas que constituyen las rutas metabólicas, el producto final de una
reacción es el sustrato de la siguiente.
Estas rutas pueden ser largas, con un tiempo elevado. Para que las reacciones se produzcan de
forma óptima, existen mecanismos para aumentar la eficacia de la acción enzimática.
COMPARTIMENTACIÓN CELULAR
Enzimas implicadas se localizan en estructuras membranosas (orgánulos celulares) del
citoplasma celular, donde se encuentran en mayor concentración que dispersas.
Así se asegura la consecución del proceso y el mantenimiento de condiciones ambientales de
pH, concentración de iones... adecuadas para actividad enzimática. Esta es la ventaja de la
presencia de orgánulos citoplasmáticos en células eucariotas.
REACCIONES EN CASCADA
Si producto de una reacción enzimática actúa como enzima de otra reacción, cuyo producto
es la enzima de una nueva reacción y sucesivamente, la eficacia de la actividad enzimática es
mayor, ya que el número de moléculas obtenidas aumenta en cada paso de forma
considerable.
Reacciones en cascada son características de procesos que tienen que realizarse en un tiempo
muy breve: coagulación sanguínea.
COMPLEJOS MULTIENZIMÁTICOS
Agrupación de enzimas que producen reacciones consecutivas de una ruta metabólica en un
complejo único permite realizar el proceso completo con gran rapidez, nada más obtener el
producto, este puede actuar como sustrato de una reacción nueva al estar en contacto con la
enzima correspondiente, lo que favorece su acceso inmediato al centro activo de la enzima.

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Piruvato-deshidrogenasa: carboxila, oxida y activa el ácido pirúvico para formar acetil-CoA,
que ingresará en ciclo de Krebs.
EXISTENCIA DE ISOZIMAS
A veces aparecen moléculas enzimáticas (isozimas) que, aun teniendo la misma acción
catalítica, poseen KM diferentes, lo que hace que su velocidad sea distinta. Se localizan en
orgánulos donde se precisa una determinada velocidad.

6. REGULACIÓN DE LA ACTIVIDAD ENZIMÁTICA

Se lleva a cabo a nivel enzimático. Por un lado regulando la velocidad de actuación de las
enzimas y por otro, regulando la síntesis enzimática.
Las reacciones enzimáticas constituyen la clave de la actividad vital de la célula. Esta
actividad varía, pudiendo interesar aumentar la síntesis de un determinado producto o
degradar un sustrato que aparece, por lo que se aumentará la actividad de las enzimas
implicadas en los procesos. Además, una vez conseguida la cantidad precisa del producto, la
actividad enzimática disminuye o se anula.
Las necesidades celulares son cambiantes y por ello la velocidad de las reacciones
enzimáticas varía con ellas. La regulación de la actividad enzimática cumple el principio de
economía celular por el que sólo permanecen activas las enzimas precisas, evitando la
fabricación innecesaria de productos que puede tener efectos negativos.
Los cambios de pH y temperatura influyen en la velocidad de las reacciones pero no se
utilizan para regularlas ya que deben ser constantes.
6.1 ACTIVACIÓN ENZIMÁTICA
Presencia de activadores permite que enzimas se mantengan inactivas y después se activen.
La unión del activador hace que el centro activo adquiera la estructura adecuada para el
acoplamiento. Ejemplos: algunos cationes Mg2+ y Ca2+.
Activadores también pueden ser moléculas orgánicas o el propio sustrato. Este último: si no
hay sustrato, no es necesaria la actividad de la enzima correspondiente; si lo hay, se produce
la activación para que ese sustrato lleve a cabo la reacción. El sustrato activa su propia
metabolización.
6.2 INHIBICIÓN ENZIMÁTICA
Sustancias que disminuyen o anulan la actividad de una enzima. Proceso inverso a activación.
Enzima activa, disminuye su velocidad o deja de actuar cuando aparece un inhibidor, puede
ser un ión, molécula orgánica o el producto final (frecuente). Este último: inhibición
feedback o retroinhibición, cuando ya no se necesita más cantidad de producto la enzima se
inhibe con señal del producto.
INHIBICIÓN IRREVERSIBLE
El inhibidor “veneno metabólico” se une covalentemente a la enzima, alterando su
estructura e inutilizándola de manera permanente.
INHIBICIÓN REVERSIBLE (más común)
Enzima vuelve a tener actividad una vez eliminada la sustancia inhibidora. La unión del
inhibidor con la enzima se realiza por enlaces no covalentes (iónicos o enl. de H, más
débiles).

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Según el lugar de unión a la enzima:
Inhibición competitiva
El inhibidor se une al centro activo impidiendo la unión del sustrato. Existe una competencia
por ocupar el centro activo. El grado de inhibición depende de la proporción relativa entre
sustrato e inhibidor. Para que ocurra es necesario que su forma espacial tenga gran semejanza
con la del sustrato, por eso se les llama análogos metabólicos.
En la actualidad se sintetizan fármacos inhibidores de una enzima deseada. Actúan como
inhibidor competitivo y se pueden corregir patologías causadas por la acción de ciertas
enzimas. Sulfamidas: tratamiento de algunas infecciones bacterianas, compiten con ácido p-
aminobenzoico en la ruta de biosíntesis del ácido fólico (vitamina B9). Al no poder
sintetizarse la vitamina, la bacteria muere, ya que es necesaria para la formación de ácidos
nucleicos, imprescindibles para seres vivos.
Inhibición no competitiva
El inhibidor se coloca en una zona de la enzima distinta del centro activo. Esta unión
modifica la estructura de la enzima y dificulta el acoplamiento del sustrato. A veces, el
inhibidor se une al complejo ES una vez creado, e impide la formación del producto.
Para diferenciar los tipos de inhibidores reversibles, se observa las gráficas Lineweaver-
Burk. En la correspondiente a la competitiva, la enzima sin inhibidor y con él coinciden en el
eje Y, en la no competitiva coinciden en el eje X.
6.3 ALOSTERISMO
Sistema de regulación enzimática muy preciso. Las enzimas alostéricas catalizan algunas
reacciones importantes, como primer paso de ruta metabólica compuesta por varias
reacciones consecutivas o los puntos de ramificación de las rutas desde los que se pueden
seguir varios caminos.
Características:
● Formadas por varias subunidades: con estructura cuaternaria.
● Con varios centros de regulación: existen varios sitios para la unión de activadores e
inhibidores.
● Dos conformaciones distintas. Forma o estado R: afinidad por el sustrato es alta, se
estabiliza cuando centros reguladores tienen activadores. Forma o estado T: afinidad
es baja, se estabiliza cuando tienen unidos inhibidores.
● Efecto cooperativo entre subunidades: activación o inhibición de una provoca
mismo efecto en todas. Permite regulación más rápida y menor cantidad de
inhibidores o activadores.
● Cinética diferente a resto de enzimas. en gráfica velocidad de reacción frente
concentración sustrato: curva sigmoidea.

7. NOMENCLATURA Y CLASIFICACIÓN DE LAS ENZIMAS

Se conocen alrededor de 2.000 enzimas. Para nombrarlas se emplea un término por el sustrato
y el tipo de reacción catalizada, añadiendo la terminación -asa. La nomenclatura de la
Comisión Internacional de Enzimas es un código de cuatro números que hace referencia a la
clase incluida, la subclase, la subdivisión y la enzima concreta. Más precisa pero menos
cómoda. En enzimas digestivas se conserva su antigua denominación: pepsina o tripsina.
Según el tipo de reacción catalizada, se clasifican en:

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Oxidorreductasas
Función: reacciones de oxidación-reducción con pérdida y ganancia de e_.
Liasas
Función: adición de moléculas sencillas a dobles enlaces.
Transferasas
Función: transferencia de grupos funcionales entre moléculas.
Isomerasas
Función: transformación de un isómero en otro
Hidrolasas
Función: hidrólisis
Ligasas o sintasas
Función: unión de moléculas o grupo funcional a una molécula usando energía ATP.