AMINOACIZI

PEPTIDE

PROTEINE
 AMINOACIZI
In funcie de structura chimic:
1. aminoacizi monoamino-monocarboxilici
2. aminoacizi monoamino-dicarboxilici i derivai
3. aminoacizi diamino-monocarboxilici i derivai
4. hidroxiaminoacizi
5. tioaminoacizi
6. aminoacizi heterociclici

In funcie de polaritatea catenei:

1. aminoacizi nepolari (hidrofobi) - contin radicali alifatici: Gly, Ala, Val, Leu, Ile, Pro;
radicali aromatici: Phe, Trp; grup cu sulf : Met
2. aminoacizi polari cu catene neutre (neionizabile) contin grupe polare/nucleofile
OH, -SH, -CONH2: Ser, Thr, Tyr, Cys, Asn, Gln, (Gly)
3. aminoacizi polari cu sarcini electrice (cu grupe ionizabile):
- aminoacizii bazici (catene ncrcate pozitiv): Lys, Arg, His
-aminoacizi acizi (catene cu sarcin negativ): Asp, Glu, (Tyr, Cys)
- Aminoacizi esentiali nu pot fi biosintetizati (cei notati cu rosu)
 Polaritatea R determina structura si
configuratia spatiala a biomoleculelor proteice
si implicit activitatea acestora

deoarece
- conformatia unei peptide/proteine
depinde de interactiunile intra- si
intermoleculare stabilite intre R

- structura tridimensionala a majoritatii

peptidelor depinde de tendinta catenelor
polare si ionice de a se hidrata si a celor
nepolare de a se agrega efect hidrofob
A
M
I
N
O
A
C
I
Z
I
 Structura aminoacizilor; punct izoelectric

COOH
H+ +
_ H3N C H B
COO
+ R
H3N C H _
_ COO
R HO
H2N C H C
A
R

Valoarea intermediar a pH-ului la care aminoacidul se afl majoritar sub

form de amfion (nu are sarcin electric net), iar concentraia cationilor
este egal cu cea a anionilor = punct izoelectric (pI)
* La pI aminoacizii sunt insolubili, precipitnd

Grupele ionizabile NH3+ si COOH, grupele acide/bazice din catenele laterale

au pKa specifice:
pK1(-COOH) : 2-2.4
pK2(-NH3+) : 8.7-10.7
pKR au valori specifice grupei funcionale
 Determinarea pI al unui aminoacid: se titreaz o soluie puternic
acid a acestuia cu o baz tare grupele ionizabile, total protonate,
vor ceda protonii n ordinea descresctoare a aciditii lor:
K1 _
+ H3N+ CH COO + H3O+
H3N CH COOH + H2O
Pt.un acid
R R monoamino-
_ K2 _
+ + monocarboxilic
H3N CH COO + H2O H2N CH COO + H3O
R R

pI se calculeaz ca media aritmetic a pK-urilor corespunztoare

reaciilor de ionizare ce implic specia neutr (media aritmetic a pK
corespunztoare reaciilor de trecere de la cation la amfion i apoi la
anion)
aminoacizii monoamino-monocarboxilici: pI = (pK1 + pK2)
aminoacizii dicarboxilici (Asp, Glu): pI = (pK1 + pKR)
aminoacizii bazici (Lys, Arg, His): pI = (pKR + pK2).

pI = (pKi + pKj)
 Stereochimia aminoacizilor

- toti aminoacizii naturali apartin seriei L

CHO COOH COOH

HO C H H2N C H H2N C H
CH2OH CH2OH CH2R
L-Glicerinaldehida L-Serina L--aminoacid

COOH
H2 N C H
CH2R
 Aminoaciziil sunt molecule optic active
 Aminoacizi din proteine

Structura pK1 pK2

Aminoacid Simbol pKR
(COOH) (NH2)

Aminoacizi cu radicali alifatici

_
CH2 COO
Glicina Gly + NH 2.4 9.8
3
_
CH3 CH COO
Alanina Ala + NH 2.4 9.9
3

CH3 _
Valina* Val CH CH COO 2.2 9.7
CH3 + NH
3

CH3 _
Leucina* Leu CH CH2 CH COO 2.3 9.7
CH3 +
NH3

_
Izoleucina* Ile CH3 CH2 CH CH COO 2.3 9.8
+
CH3 NH3
 pK1 pK2
Aminoacid Simbol Structura pKR
(COOH) (NH2)

Aminoacizi cu grupe hidroxil

_
Serina Ser HO CH2 CH COO 2.2 9.2 13
+
NH3
_
Treonina* Thr H3C CH CH COO 2.1 9.1 13
+
OH NH3

Aminoacizi cu sulf

_
Cisteina Cys HS CH2 CH COO 1.9 10.8 8.3
+
NH3
_
Metionina* Met CH3 S (CH2)2 CH COO 2.1 9.3
+
NH3
 Structura
pK1 pK2
Aminoacid Simbol pKR
Aminoacizi dicarboxilici (COOH) (NH2)
si derivati

_ _
OOC CH2 CH COO
Acid Asp 2.0 9.9 3.9
+ NH
aspartic 3

_
H2N C CH2 CH COO 2.1 8.8
Asparagina Asn
O + NH
3

_ _
Acid OOC CH2 CH2 CH COO 2.1 9.5 4.1
Glu
glutamic + NH
3
_
H2N C CH2 CH2 CH COO
Glutamina Gln + NH 2.2 9.1
O 3
 pK1 pK2
Aminoacid Simbol Structura pKR
(COOH) (NH2)

Aminoacizi bazici

_
Arginina Arg HN CH2 CH2 CH2 CH COO 1.8 9.0 12.5
+ +
C NH2 NH3
NH2

+ _ 2.2 9.2 10.8

Lizina* Lys H3N (CH2)4 CH COO
+
NH3
_
CH2 CH COO
Histidina* His + 1.8 9.2 6.0
+ NH3
HN NH
 pK1 pK2
Aminoacid Simbol Structura pKR
(COOH) (NH2)

Aminoacizi cu nuclee aromatice

Fenil- _
Phe CH2 CH COO 2.2 9.2
alanina* +
NH3
_
Tirozina Tyr HO CH2 CH COO 2.2 9.1 10.1
+
NH3
_
CH2 CH COO
+
NH3
Triptofan* Trp N
2.4 9.4
H

Imino-acizi

_
+ COO
Prolina Pro N 2.0 10.6
H H
Proprietile aminoacizilor
a) decarboxilarea (aminoacid decarboxilaze) => amine biogene
Arginina ciclul ureei H2N(CH2)3CHCOOH H2N(CH2)4NH2
- CO2
NH2
ornitina putresceina
Lizina _ CO NH2 (CH2)5 NH2
2
cadaverina

b) deaminarea oxidativ (L-aminoacid oxidaze/FMN)

_ _
COO L-aminoacid COO COOH
+ oxidaza + H2O
H3N C H H2N C C O + NH3
R1 FMN FMNH2 R1 R1

c) transaminarea
_
(aminotransferaze = transaminaze)
_ _
COO COOH COO COO
+ transaminaze +
H3N C H + C O C O + H3N C H
R1 R2 R1 R2
Alanina + a-cetoglutarat GTP
piruvat + glutamat
GTP = glutamat pituvat transaminaza
 d) esterificarea protejarea COOH in sinteza peptidica
-COOH -COOR

e) acilarea grupei NH2 protejarea sau blocarea NH2

-NH2 -NHCOR O

OH

f) reducerea grupei COOH cu hidruri complexe (LiBH4) OH

-COOH -CH2OH ninhidrina O

g) reacia grupei NH2 cu aldehide in mecanismele enzimatice

-NH2 + R-CH=O -N=CH-R + H2O

h) reacia de recunoatere cu ninhidrin => compusi colorati albastru-

violet sau galben (prolina si hidroxiprolina)

i) reacia de dozare cu acidul azotos pt.dozarea grupelor NH2 libere din

peptide/proteine
_
HCl +
H2N CH COOH + HONO Cl [N N CH COOH ] HO CH COOH + N2
R R R
( NaNO2 + HCl) sare de diazoniu instabila
 j) activitate biologic: acidul -aminobutiric (GABA, derivat de acid
glutamic) i dopamina (derivat al tirosinei) - neurotransmitori; histamina
(rezultata prin decarboxilarea histidinei) - mediator local al reaciilor
alergice; tiroxina (derivat de tirosin) - hormon tiroidian; glutationul (Glu-
Cys-Gly) protejeaz celula de atacurile oxidative, de aciunea toxic a
xenobioticelor i a radiaiilor

_
OOC CH2 CH2 HO CH2 N
+
+H N CH CH2 CH2 NH3
3 2 CH2 N
HO H
NH2
GABA Dopamina Histamina

I I _ legatura izopeptidica
COO NH3+ Cys
HO O CH2 CH CH CH2 CH2 C NH CH CH2 SH
_ _
H3N + COO Glu O O C NH CH2 COO
I I
Gly
Tiroxina Glutation
Rspndire
n organism