Resumo IBQ 2
Resumo IBQ 2
Resumo IBQ 2
Proteína
As proteínas são polímeros de aminoácidos
Existem 20 aminoácidos comun
Com estes 20 aminoácidos, os organismos produzem
• Enzima
• Hormona
• Anticorpo
• Fibras musculare
• Antibiótico
• Veneno
A luz produzida pelo pirilampo, resulta da reação da luciferina e a ATP catalisada pela luciferase
Hemoglobina, proteína responsável pelo transporte de O2 nos eritrócitos
Queratina é o componente estrutural dos chifres do rinoceronte
Aminoácid
Estrutura geral: ácido carboxilico com amina primária (-NH3- ; grupo amino) no carbono α
Excepção: prolina tem uma amina secundária (-NH2- ; grupo imino) no carbono α .
o
Glicin
• Possui um único protão na sua cadeia latera
• A glicina é o aminoácido mais simples
• É uma molécula simétric
Aminoácidos - Isometri
Ao carbono α estão ligados 4 grupos substituições diferentes:
(o carbono α é um carbono assimétrico
• Grupo carboxílic
• Grupo amin
• Grupo R (ou cadeia lateral
• Um átomo de hidrogéni
Com excepção da glicina (R=H) todos os outros aminoácidos são opticamente activos
Os esteroisómeros são designados por D e L
Na natureza os aminoácidos são encontrados essencialmente na forma L
Esterioisomeria em aminoácidos
Alanina - 2 enantiómeros
Aminoácido
Os aminoácidos comuns (20 aa) -> constituintes de proteínas, codi cados por, pelo menos, um
codão
• Aminoácidos essenciais, o ser humano não os consegue sintetizar, mas são essenciais para o
seu funcionamento. Têm que ser incluídos na alimentação
- Isoleucin
- Histidin
-Leucin
- Lisin • Glicina (Gly ou G) • Metionina (Met ou M)
• Isoleucina (Ile ou I)
- Fenilalanin
- Treonin
• Serina (Ser ou S) • Asparagina (Asn ou N)
fi
.
fi
:
fi
fi
fi
:
fi
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fi
)
Aminoácidos derivados
4-hidroxiprolina e 5-hidroxilisina , ambos se
encontram no colagéneo (proteína fibrosa dos
tecidos conjuntivos).
Modificações pós-transcripcionais
Envolvem normalmente aminoácidos não-polares:
Aminas biogénicas
Resultam de descarboxilação de alguns aminoácidos
Forma zwiteriónica
Os aminoácidos em solução aquosa podem existir na forma de um avião dipolar, também
designada por forma zwiteriónica.
Ião dipolar, molécula globalmente neutra mas que possui grupos
carregados positivamente e negativamente.
“Zwitter” - “hybrid”, “hermaphrodite”
Ponto isoeléctrico, pI
O valor do pH em que se obtém apenas a espécie com
carga zero é designado por ponto isoeléctrico - pI.
• Características do pI:\Carga global nula
• Solubilidade minima porque é apolar
• Mobilidade, sob ação de um campo eléctrico, nula
Slide 37
1. I 4. II 7. III 10. V
2. II 5. IV 8. III 11. II
3. IV 6. II, IV 9. III
Carga formal
pI = (9,17 + 6) / 2 = 7,6
3ª espécie neutra
Péptidos e Proteínas
Lei de Lambert-Beer
Se uma solução na faixa de 435-480nm, que corresponde à radiação azul, a sua cor (cor
complementar) será o amarelo; a sensação visual do amarelo será dada pelo conjunto de
todos os outros componentes da luz branca, que não foram absorvidos.
A absorção da luz é tanto maior quanto mais for concentrada for a solução por ela
atravessada.
De um modo geral as cuietés usadas têm 1cm de percurso ótico, para facilitar cálculos.
Na zona do visível podem ser de plástico ou de vidro, mas na zona de UV têm que ser de
quartzo.
Slide 17
Péptido
a) os 4 átomos dos grupos envolvidos na ligação péptidica
(em vermelho) estão num mesmo plano.
Hidrólise selectiva: por ação de certas enzimas proteolíticas. A hidrólise ocorre nas
ligações peptídicas de aminoácidos específicos.
O brometo de cianogénio hidrólise apenas ligações peptídicas cujo carboxílico pertence a
um resíduo de metionina.
Enzimas proteolíticas:
• Tripsina - hidrolisa apenas as ligações peptídicas cujo grupo carboxílico pertence a
um resíduo de licita ou arginina.
• Quimiotripsina - hidrolisa apenas as ligações peptídicas cujo grupo carboxílico
pertence a um resíduo de fenilalanina, triptofano ou tirosina.
• Pepsina - hidrolisa apenas as ligações peptídicas cujo grupo amino um resíduo de
fenilalanina, triptofano ou tirosina.
• Termolisina - hidrolisa apenas as ligações peptídicas cujo grupo amino um resíduo de
leucina, soleucina ou valina.
Ligação dissulfureto
2 cisteínas -> Cistina
Há ligações dissulfureto intrapeptídicas e interpeptídicas.
pI = (4,25+9,7) / 2 = 6,975
PP 08 Slide 30-31
Proteínas conjugadas
Proteínas que além de aminoácidos contêm outros componentes químicos.
Grupo prostético - componente “não aminoácido” da proteína conjugada.
Ex. Hemoglobina tem Fe
Estrutura de proteínas
Desnaturação - mudança na estrutura da proteína que não causa mudanã na sequência
de aminoácidos.
As proteínas perdem a estrutura e a função quando desnaturadas.
• Estrutura primária
Sequência de aminoácidos. É o nível estrutural mais simples e mais importante, pois dele
deriva todo o arranjo espacial da molécula. É específica para cada proteína, sendo
geralmente determinada geneticamente.
• Estrutura secundária
A estrutura secundária de uma proteína corresponde a regiões localizadas de estrutura
ordenada estabilizadas por ligações de hidrogénio entre os grupos -NH e C=O da cadeia
principal e em que não participam ligações de hidrogénio envolvendo as cadeias laterais.
- Folha β
Nesta conformação as pontes de hidrogénio podem ser estabelecidas entre átomos de
uma mesma cadeia ou entre átomos de cadeias polipeptídicas diferentes.
Todos os resíduos de aminoácidos participam nas ligações de hidrogénio, formando uma
estrutura planar onde as cadeias laterais se encontram viradas para cima ou para baixo e
nunca interagem uma com as outras.
• Estrutura terciária
O arranjo tridimensional total de todos os átomos de uma proteína é chamado de
estrutura terciária.
Resulta do enrolamento da hélice α ou da folha β, sendo mantido por pontes de
hidrogénio e dissulfureto. Esta estrutura confere a actividade biológica às proteínas.
Factores que influenciam a estrutura terciária:
- Interações hidrofóbicas e hidrofílicas
- Pontes de hidrogénio
- Pontes dissulfureto ( a única ligação covalente)
- Ligações iónicas
• Estrutura quaternária
Algumas proteínas contêm duas ou mais cadeias polipeptídicas
distintas, ou subunidades que podem ser idênticas ou diferentes. O arranjo destas
subunidades proteicas em complexos tridimensionais constitui a estrutura quaternária.
Proteínas fibrosas
As cadeias polipeptídicas estão arranjadas em longos filamentos ou
folhas.
São formadas geralmente por um único tipo de estrutura secundária,
e a sua estrutura terciária é relativamente simples.
Proteínas globulares
Podem contem vários tipos de estruturas (hélice α, folha β e outros) dobradas em forma
esférica ou globular.
PP 08 Slide 48
Prião
São proteínas patogénicas com um “folding” anormal.
O prião infecioso é extremamente resistente à
temperatura, não desnaturando com facilidade.
O prião não tem nenhuma informação codificada em ácidos nucleicos, “replica-se” dentro
do hospedeiro forçando as proteínas normais a adoptar a nova estrutura, que se
depositam na forma de agregados filamentosos no tecido neuronal.
Enzimas
• Todas as enzimas, com a excepção de um pequeno grupo de RNAs, sua proteínas que
têm como função acelerar reações químicas, sem alterar a constante de equilíbrio da
reação.
Ribozima = ácido ribonucleico + enzima
• Regulação da reação
A actividade enzimática é controlada não só pelo(s) substrato(s) e/ou produto(s), bem
como por outras substâncias. Os mecanismos de regulação enzimática incluem o controlo
alostérico (hemoglobina), modificação covalente da enzima e controlo da quantidade de
enzima sintetizada.
Nomenclatura das enzimas
As enzimas são classificadas com base nas reações que catalisam:
Nome do substrato + Sufixo ase:
Ex.:
Urease ≡ hidrólise da ureia
ATP + D-glucose -> ADP + D-glucose 6-fosfato hexocinase
Enzyme Commission Numbers (adoptado desde 1984) exemplo:
EC - enzyme commission
EC 3 - hidrolase
EC 3.4 hidrolase que actua sobre as ligações peptídicas
EC 3.4.11 actua sobre o grupo amino dos aminoácidos de um polipeptídeo EC 3.4.11.4
actua sobre o amino terminal de um tripeptídeo
Nomenclatura
Os hidrocarbonetos são as biomoléculas mais abundantes na Terra.
Hidratos de carbono ou sacarídeos: poli-hidroxialdeídos ou poli-
hidroxicetonas (ou derivados) ou polímeros que por hidrólise produzem os
anteriores.
A maioria dos hidratos de carbono têm a fórmula empírica (CH2O)n; alguns
também contêm N e P ou S.
Mono e polissacáridos
• Função
- Estruturais
ex: celulose (paredes das células vegetais) e quitina (exoesqueleto dos animais)
- Amazenamento, reserva
ex: amido (plantas) e glicogénio (animais)
- Componentes celulares
ex: peptidoglicanos (confere rigidez à parede celular), glicosaminoglicanos
(fundamentais na matriz celular)
• Classes
- Monossacáridos ou açúcares simples - uma só unidade (ex. D-Glucose)
- Dissacáridos - dois açúcares simples ligados por uma ligação covalente (glicosídica)
(ex. Sucrose)
- Oligossacáridos - cadeias curtas de unidades de monossacáridos. (3 a 20) ligados por
ligações glicosídicas
- Polissacáridos - normalmente centenas a milhares de monossacáridos ligados por
ligações glicosídicas (ex. Amido, Glicogénio, Celulose)
Sacárido = açúcar
Glucose
• Açúcar simples mais importante, resultando da metabolização de cadeias de H.C. mais
complexas;
• É transportado na corrente sanguínea.
• É a principal fonte de energia para os mamíferos (com excepção dos ruminantes)
Monossacáridos
• Classificação
- Natureza química do grupo carbonilo:
• Aldeído -> Aldose
• Cetona -> Cetose
- Número de átomos de carbono (sempre >= 3)
• 3 -> triose
• 4 -> tetrose
• 5 -> pentose
• 6 -> hexose
• etc
Monossacáridos - Trioses
Representação de Fischer:
• Ligações verticais estão atrás do plano
• Ligações horizontais estão acima do plano
• O grupo carbonil é o mais próximo possível do topo
Monossacáridos - Pentoses
Monossacáridos - Hexoses
Esterioisomeria em sacáridos
Epímeros
- 2 açúcares que diferem apenas na configuração de um carbono.
- OH que figuram à direita na projeção de Fischer, são representados para baixo no anel
- OH que figuram à esquerda são representados para cima
Ciclização da D-glucose
A ciclização dos açúcares não é catalisada por enzimas, ocorre
espontaneamente em solução.
Anómeros α e β
Aldose - carbono anomérico - carbono 1
Principais conformações
Isómero β ; Isómero α
Conformações (podem passar de uma conformação para outra sem quebra de ligações
covalentes):
- Conformação em cadeira e em barco (formas cíclicas dos
açúcares)