JOURNAL READING

EPIDEMIOLOGI, PENYEBAB, MANIFESTASI DAN DIAGNOSIS KLINIS,

PENCEGAHAN DAN PENGENDALIAN PENYAKIT CORONAVIRUS (COVID-19)
SELAMA PERIODE AWAL WABAH: TINJAUAN LINGKUP

Oleh:

Silvia Handika Anggraeni G991902052

Sekar Ayu Kusumoning G991906030
Tegar Umaroh G991906031
Wisnu Skunda Mahendra G991906032
Aisyah Farah Putri G992003009
Hilya Syifa Hanina G992003071
Kristina Fianiyanti G992003088
Maria Jessica Yaputri G992003096

Pembimbing:

dr. Dewi Pratiwi, Sp. THT-KL(K), M. Kes

KEPANITERAAN KLINIK ILMU TELINGA HIDUNG TENGGOROK - KEPALA

LEHER FAKULTAS KEDOKTERAN UNS/ RS UNS
SURAKARTA
2020
 Epidemiology, causes, clinical manifestation and diagnosis, prevention and control of
coronavirus disease (COVID-19) during the early outbreak period: a scoping review
Sasmita Poudel Adhikari1, Sha Meng1, Yu-Ju Wu1, Yu-Ping Mao2, Rui-Xue Ye1, Qing-Zhi
Wang1, Chang Sun1, Sean Sylvia3, Scott Rozelle4, Hein Raat5 and Huan Zhou1
BMC Infectious Disease of Poverty. 2020; 9(1):29

TELAAH KRITIS

Deskripsi Umum

1. Desain : Tinjauan lingkup, descriptive study design

2. Subjek : 65 artikel penelitian
3. Judul : Tepat, lugas, dan eksplisit
4. Penulis : Tertulis jelas
5. Abstrak : Jelas, merangkum isi penelitian

Analisis PICO

1. Problem :
Masalah yang diangkat dalam jurnal tinjauan ini adalah adanya virus baru yang
menyebabkan wabah penyakit pernapasan diawali di Wuhan, Provinsi Hubei, Cina
dan secara cepat menyebar ke berbagai negara.
2. Intervention :
Tidak ada intervensi dalam jurnal tinjauan ini.
3. Comparison :
Jurnal tinjauan ini tidak memiliki pembanding.
4. Outcome :
Hasil dari penelitian ini bertujuan memberikan informasi untuk penelitian di masa
depan terkait dengan topik ini dan dapat mendukung pengambilan keputusan oleh
pemerintah tentang strategi untuk menangani keadaan darurat kesehatan masyarakat
ini di tingkat masyarakat, nasional, dan internasional.
Analisis V-I-A

1. Validity :
Jurnal tinjauan ini merupakan studi deskriptif tentang epidemiologi, penyebab,
manifestasi dan diagnosis klinis, pencegahan dan pengendalian penyakit coronavirus
(COVID-19).
2. Importance :
Jurnal tinjauan ini bertujuan untuk membahas dan memahami lebih dalam
epidemiologi, penyebab, diagnosis klinis, pencegahan, dan pengendalian coronavirus
(COVID-19).
3. Applicability :
Jurnal tinjauan ini dapat digunakan sebagai acuan dalam memberikan informasi bagi
komunitas riset, pembuat kebijakan, dan profesional kesehatan untuk menyesuaikan
dan/atau menghasilkan penelitian, kebijakan, dan praktik baru mengenai coronavirus
(COVID-19).

Epidemiologi, penyebab, manifestasi dan diagnosis klinis, pencegahan dan pengendalian

penyakit coronavirus (COVID-19) selama periode awal wabah: tinjauan lingkup
Diterjemahkan dari
Epidemiology, causes, clinical manifestation and diagnosis, prevention and control of
coronavirus disease (COVID-19) during the early outbreak period: a scoping review
Sasmita Poudel Adhikari1, Sha Meng1, Yu-Ju Wu1, Yu-Ping Mao2, Rui-Xue Ye1, Qing-Zhi
Wang1, Chang Sun1, Sean Sylvia3, Scott Rozelle4, Hein Raat5 and Huan Zhou1
BMC Infectious Disease of Poverty. 2020; 9(1):29

Abstrak
Latar belakang: Penyakit coronavirus (COVID-19) telah diidentifikasi sebagai penyebab
wabah penyakit pernapasan di Wuhan, Provinsi Hubei, Cina mulai Desember 2019. Per 31
Januari 2020, epidemi ini telah menyebar ke 19 negara dengan 11.791 kasus yang
dikonfirmasi, termasuk 213 kematian. Organisasi Kesehatan Dunia telah mendeklarasikannya
sebagai Darurat Kesehatan Publik Internasional.
Metode: Tinjauan lingkup dilakukan mengikuti kerangka kerja metodologi yang disarankan
oleh Arksey dan O'Malley. Dalam ulasan pelingkupan ini, 65 artikel penelitian yang
diterbitkan sebelum 31 Januari 2020 dianalisis dan dibahas untuk lebih memahami
epidemiologi, penyebab, diagnosis klinis, pencegahan dan pengendalian virus ini. Domain
penelitian, tanggal publikasi, bahasa jurnal, afiliasi penulis, dan karakteristik metodologis
dimasukkan dalam analisis. Semua temuan dan pernyataan dalam tinjauan ini berhubungan
dengan wabah didasarkan pada informasi yang dipublikasikan sebagaimana tercantum dalam
referensi.
Hasil: Sebagian besar publikasi ditulis menggunakan bahasa Inggris (89,2%). Proporsi
terbesar artikel yang diterbitkan terkait dengan penyebab (38,5%) dan mayoritas (67,7%)
diterbitkan oleh para sarjana Cina. Artikel penelitian awalnya berfokus pada penyebab, tetapi
seiring waktu ada peningkatan artikel yang terkait dengan pencegahan dan pengendalian.
Penelitian sejauh ini telah menunjukkan bahwa asal mula virus ini terkait dengan pasar
makanan laut di Wuhan, tetapi asosiasi terhadap hewan tertentu belum dikonfirmasi. Gejala
yang dilaporkan termasuk demam, batuk, kelelahan, pneumonia, sakit kepala, diare,
hemoptisis, dan dispnea. Tindakan pencegahan seperti masker, praktik kebersihan tangan,
menghindari kontak publik, deteksi kasus, pelacakan kontak, dan karantina telah dibahas
sebagai cara untuk mengurangi penularan. Sampai saat ini, tidak ada pengobatan antivirus
khusus yang terbukti efektif; karenanya, orang yang terinfeksi utamanya mengandalkan
pengobatan simtomatik dan perawatan suportif.
Kesimpulan: Terdapat lonjakan cepat dalam penelitian dalam menanggapi wabah COVID-
19. Selama periode awal ini, penelitian yang diterbitkan terutama mengeksplorasi
epidemiologi, penyebab, manifestasi klinis dan diagnosis, serta pencegahan dan pengendalian
virus corona baru. Meskipun studi ini relevan untuk mengendalikan keadaan darurat publik
saat ini, diperlukan penelitian yang lebih berkualitas untuk menyediakan cara yang valid dan
andal untuk mengelola jenis darurat kesehatan masyarakat ini baik dalam jangka pendek
maupun jangka panjang.
Kata kunci: COVID-19, Epidemiologi, Penyebab, Pencegahan dan kontrol, Tinjauan

Latar Belakang
Coronavirus termasuk dalam keluarga virus yang mungkin menyebabkan berbagai
gejala seperti pneumonia, demam, kesulitan bernafas, dan infeksi paru-paru1. Virus-virus ini
umumnya terdapat pada hewan di seluruh dunia, dan sangat sedikit kasus yang berefek pada
manusia. Organisasi Kesehatan Dunia (WHO) menggunakan istilah novel coronavirus 2019
untuk merujuk ke coronavirus yang mempengaruhi pernapasan bagian bawah saluran pasien
dengan pneumonia di Wuhan, Cina pada 29 Desember 2019 2-4. WHO mengumumkan nama
resmi novel coronavirus 2019 adalah penyakit coronavirus (COVID-19)4. Dan nama tersebut
menjadi referensi hingga saat ini untuk virus yang menyerang pernafasan akut yang parah
atau sindrom coronavirus 2 (SARS-CoV-2). Dulu dilaporkan bahwa sekelompok pasien
dengan pneumonia dengan penyebab yang tidak diketahui terkait dengan Pasar Makanan
Laut setempat, Huanan Selatan di Wuhan, Provinsi Hubei, Cina pada bulan Desember 20195.
Menanggapi wabah tersebut, Pusat Pengendalian dan Pencegahan Penyakit Cina
(CDC Cina) mengirim tim tanggap cepat untuk menemani otoritas kesehatan provinsi Hubei
dan kota Wuhan untuk melakukan penyelidikan epidemiologis dan etiologis. WHO
mengkonfirmasi bahwa wabah epidemi coronavirus dikaitkan dengan Pasar Makanan Laut,
Huanan Selatan, tetapi tidak diidentifikasi hewan spesifik penyebabnya 6. Para ilmuwan
segera mulai meneliti sumber virus corona baru, dan genom pertama COVID-19
dipublikasikan oleh tim peneliti yang dipimpin oleh Yong-Zhen Zhang, pada 10 Januari
20207. Dalam 1 bulan, virus ini menyebar dengan cepat ke seluruh Cina selama Tahun Baru
Cina - periode dimana tingkat mobilitas manusia yang tinggi di antara orang-orang Cina.
Meskipun masih terlalu dini untuk memprediksi populasi yang rentan, pola awal telah
menunjukkan tren yang mirip dengan Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS) dan
Middle East Respiratory Syndrome (MERS) coronavirus. Kerentanan tampaknya terkait
dengan usia, jenis kelamin biologis, dan kondisi kesehatan lainnya 8. COVID-19 sekarang
telah dinyatakan sebagai Darurat Kesehatan Publik Internasional oleh WHO9.
Mengingat penyebaran virus corona baru dan dampaknya terhadap kesehatan
manusia, komunitas penelitian telah merespon dengan cepat terhadap virus baru dan banyak
artikel penelitian pendahuluan telah diterbitkan tentang epidemi ini. Jurnal ini berisi tinjauan
lingkup untuk merangkum dan menganalisis secara kritis semua artikel ilmiah yang
diterbitkan mengenai coronavirus baru pada Januari 2020. Ulasan ini bertujuan untuk
memberikan bukti temuan awal tentang epidemiologi, penyebab, diagnosis klinis, serta
pencegahan dan pengendalian COVID- 19 terkait dengan waktu, lokasi, dan sumber
publikasi. Tinjauan ini dapat memberikan informasi yang bermakna untuk penelitian di masa
depan terkait dengan topik ini dan dapat mendukung pengambilan keputusan oleh pemerintah
tentang strategi untuk menangani keadaan darurat kesehatan masyarakat ini di tingkat
masyarakat, nasional, dan internasional.

Metode
Desain studi
 Peninjauan ruang lingkup dilakukan dengan mengikuti metodologi kerangka kerja
yang disarankan oleh Arksey dan O'Malley10. Terdapat lima langkah, diantaranya : a)
mengidentifikasi tujuan penelitian yang jelas dan strategi pencarian, b) mengidentifikasi
artikel penelitian yang relevan, c) pemilihan artikel penelitian, d) ekstraksi dan pemetaan
data, dan e) meringkas, mendiskusikan, menganalisis, dan melaporkan hasilnya.

Strategi pencarian literatur

Literatur untuk ulasan ini diidentifikasi dengan mencari basis data online berikut:
bioRxiv, medRxiv, ChemRxiv, Google Cendekia, PubMed, serta CNKI dan Data WanFang
(dua basis data utama untuk penelitian biomedis di Cina). Basis data online ini mengandung
arsip dari kebanyakan jurnal biomedis berbahasa Inggris dan China. Selain itu, beberapa
jurnal yang diterbitkan secara online oleh Komisi Kesehatan Nasional Republik Rakyat Cina,
Pusat Pencegahan dan Pengendalian Penyakit Cina, dan WHO dimasukkan dalam analisis.
Pencarian publikasi ilmiah dilakukan dari tanggal 1 Januari hingga 31 Januari 2020, dengan
menggunakan kata kunci penvarian 'nCoV', 'coronavirus novel 2019', '2019-nCoV',
'coronavirus novel', 'Pneumonia', '新型 冠状 病' (Cina), '新型 肺炎' (Cina), dan '新 冠 病毒'
(Cina). Semua publikasi ilmiah yang relevan yang ditulis dalam bahasa Inggris atau China
dalam ulasan dimasukkan dalam analisis. Sedangkan komentar, laporan, dan artikel berita
non-ilmiah dikeluarkan dari analisis.

Identifikasi dan pemilihan studi yang relevan

Dua peneliti (YW dan SPA) secara independen mencari literatur. Kemudian kedua set
literatur dibandingkan. Kesepakatan tentang kriteria inklusi atau eksklusi literatur
diselesaikan melalui diskusi atau, jika perlu, dengan memasukkan peneliti ketiga (HZ) untuk
membuat keputusan akhir. Artikel duplikat dihilangkan. Dan hasil ahirnya adalah 65
publikasi akademik yang unik dimasukkan dalam analisis ini.

Ekstraksi data dari studi terpilih

Setelah artikel dipilih, data diekstraksi dan dicatat dalam excel spreadsheet. Data yang
diekstraksi adalah tanggal publikasi, bahasa publikasi, judul artikel, nama jurnal, negara
penulis dan afiliasi, desain penelitian, target dari studi, ukuran sampel, pengaturan penelitian,
instrumen pengumpulan data, domain penelitian, dan temuan kunci.
 Literatur bahasa Inggris
diidentifikasi melalui penelitian
Literatur bahasa Cina
basis data
Identifikasi
diidentifikasi melalui penelitian
bioRvix(n=26)
basis data
medRvix(n=4)
CNKI(n=8)
ChemRvix(n=1)
Wanfang(n=6)
Google scholar(n=67)
Pubmed(n=28)
Penyaringan

Catatan setelah duplikat dihapus (n=135)

Catatan yang tersisa setelah Artikel yang dikecualikan karena

penyaringan judul dan abstrak teks lengkap tidak dapat diakses
(n=135) (n=16)
Kelayakan

Artikel teks lengkap yang

Artikel teks lengkap yang dinilai
dikecualikan (komentar, laporan,
untuk kelayakan (n=119)
dan artikel berita) (n=54)
Inklusi

Studi inklusi (n=65)

Gamb.1 PRISMA Diagram alur untuk proses peninjauan ruang lingkup

Merangkum temuan
Berdasarkan tujuan penelitian utama, artikel diklasifikasikan ke dalam salah satu dari
empat domain penelitian berikut: epidemiologi, penyebab, manifestasi klinis, dan diagnosis,
atau pencegahan dan kontrol.
a. Epidemiologi : mencakup studi tentang distribusi epidemi (kapan, di mana, siapa)
b. Penyebab : termasuk studi tentang virologi, patogenesis, dan pola penularan
c. Manifestasi dan diagnosis klinis : mencakup studi tentang fitur klinis (tanda dan
gejala) dan diagnosis
d. Pencegahan dan kontrol : mencakup studi tentang pencegahan, kontrol, dan
pengobatan).
 Gamb.2 Domain penelitian dari artikel penelitian
yang diterbitkan

Gamb.3 Tanggal publikasi artikel

penelitian

Afiliasi penulis digunakan untuk mengkategorikan jenis kolaborasi penelitian. Sebuah

publikasi dianggap berasal dari 'dalam Cina' ketika semua afiliasi penulis berasal dari Cina;
sebuah publikasi dianggap berasal dari 'luar China' ketika semua afiliasi berada di luar China;
sebuah publikasi dianggap berasal dari 'kolaborasi internasional' ketika setidaknya satu
affiliasi berasal dari Cina dan setidaknya satu berasal dari luar Cina. Domain penelitian,
tanggal penerbitan, bahasa jurnal, afiliasi penulis, serta karakteristik metodologi dianalisis
masing-masing. Semua temuan dan pernyataan mengenai wabah dalam tinjauan ini
didasarkan pada publikasi informasi sebagaimana tercantum dalam referensi.
Hasil dan Diskusi
Karakteristik studi yang dipublikasikan
Di antara 65 artikel penelitian yang termasuk dalam analisis, lebih dari 31 merupakan
penelitian prapublikasi, dan 34 diterbitkan dalam jurnal peer-review, termasuk The Lancet
dan The New England Journal of Medicine. Sebagian besar publikasi (n = 58, 89,2%) dalam
bahasa Inggris dan sisanya (n = 7, 10,8%) dalam bahasa Cina. Sekitar 75,9% publikasi bahasa
Inggris fokus pada epidemiologi dan penyebab, sementara 85,7% makalah Cina fokus pada
pencegahan dan kontrol (Tabel 1).

Tabel 1 Rincian domain penelitian berdasarkan bahasa pada Januari 2020

Domain penelitian Literatur Inggris Literatur Total
Cina
n % n % n %
19 32.8 0 0.0 19 29.2
25 43.1 0 0.0 25 38.5
8 13.8 1 14.3 9 13.8
6 10.3 6 85.7 12 18.5
58 89.2 7 10.8 65 100

Seperti yang ditunjukkan pada Gambar. 2, publikasi akademik didistribusikan di domain

penelitian berikut: epidemiologi, penyebab, manifestasi dan diagnosis klinis, serta
pencegahan dan kontrol. Bagian terbesar dari makalah (n = 25, 38,5%) terkait dengan
penyebab, diikuti oleh makalah tentang epidemiologi (n = 19, 29,2%), sedangkan 18,5%
memeriksa pencegahan dan kontrol dan 13,8% melaporkan manifestasi dan diagnosis klinis.
Awalnya, ada lebih banyak artikel penelitian yang berfokus pada penyebab wabah, namun
studi tentang pencegahan dan pengendalian secara bertahap meningkat dari waktu ke waktu
(Gambar 3). Sebagian besar artikel (n = 44, 67,7%) diterbitkan oleh para peneliti Cina
sedangkan 29,2% (n = 19) artikel berasal dari para peneliti di luar Cina. Sejumlah kecil (n =
2, 3,1%) didasarkan pada penelitian kolaboratif internasional oleh para peneliti dari berbagai
negara (Tabel 2).

Tabel 2 Rincian domain penelitian berdasarkan jenis kolaborasi pada Januari 2020
Domain Penelitian Dalam Cina Luar Cina Kolaborasi Internasional Total
n % n % n % n %
Epidemiologi 8 18.2 9 47.4 2 100 19 29.2
Penyebab 17 38.6 8 42.1 0 0.0 25 38.5
Manifestasi dan 8 18.2 1 5.3 0 0.0 9 13.8
diagnosis klinis
 Pencegahan dan 11 25.0 1 5.3 0 0.0 12 18.5
kontrol
Total 44 67.7 19 29.2 2 3.1 65 100

Kami juga menganalisis karakteristik metodologi publikasi dalam sampel akhir.

Mayoritas artikel didasarkan pada pemodelan matematika (44,6%) dan desain studi cross-
sectional (18,5%). Sekitar setengah dari studi termasuk populasi target (pasien, populasi
umum, dan petugas layanan kesehatan) (49,2%) dalam analisis mereka, diikuti oleh studi
yang berupaya mengidentifikasi spesies virus (struktur virus, urutan gen) (36,9%). Di antara
32 artikel dengan populasi sebagai target penelitian, 34,4% memiliki ukuran sampel kurang
dari 10, 31,3% dilakukan di rumah sakit, dan 50% menggunakan data sekunder. Kegiatan
pengendalian kualitas untuk pengumpulan data disebutkan dalam 56,3% dari studi populasi
(Tabel 3).

Tabel 3 Karakteristik metodologis artikel penelitian COVID-19 pada Januari 2020

Karakteristik Kategori n %
Desain studi (n = 65) Studi Cross-sectional 12 18.5
Model Matematika 29 44.6
Studi Molekular 10 15.4
Studi Diagnosis 2 3.1
Tinjauan 3 4.6
Studi Teoritis 9 13.9
Target Studi (n = 65) Populasi 32 49.2
Pasien 22 33.9
Populasi Umum 6 9.2
Tenaga Kesehatan 4 6.2
Spesies (struktur virus, gene 24 36.9
sequence)
Lain-lain 9 13.9
Studi berkaitan dengan
populasi (n = 32)
Besar Sampel 1–10 11 34.4
11–50 5 15.6
51–100 3 9.4
> 100 3 9.4
Tidak ditentukan 10 31.3
Tempat Studi Laboratorium 2 6.3
Rumah Sakit 10 31.3
Komunitas 0 0.0
Rumah Sakit dan Komunitas 0 0.0
Tidak ditentukan 20 62.5
Kuesioner 7 10.8
Instrumen pengumpulan dataa Koleksi spesimen biologis 1 3.1
Pemeriksaan fisik 0 0.0
 Sampel lingkungan 0 0.0
Catatan rumah sakit, medis, atau 14 43.7
paparan
Data Sekunder 16 50.0
Kegiatan kontrol kualitas Ditentukan dalam artikel 14 56.3
untuk pengumpulan data
Tidak ditentukan 18 43.8

Domain penelitian
Epidemiologi
Pada tanggal 29 Desember 2019, empat kasus pertama dari sindrom pernafasan akut
dengan etiologi yang tidak diketahui dilaporkan di Kota Wuhan, Provinsi Hubei, Cina di
antara orang-orang yang terkait dengan pasar makanan laut lokal ("wet market")2. Penelitian
sedang dilakukan untuk memahami lebih lanjut tentang penularan, keparahan, dan
karakteristik lain yang terkait dengan COVID-192. Tampaknya sebagian besar kasus awal
memiliki riwayat kontak dengan pasar makanan laut ini2,12,13,14. Segera, setelah sumber infeksi
sekunder ditemukan, yaitu penularan dari manusia ke manusia melalui kontak dekat. Ada
peningkatan orang yang terinfeksi tanpa riwayat pajanan terhadap satwa liar atau
mengunjungi Wuhan, dan beberapa kasus infeksi terdeteksi di kalangan profesional
medis2,14,15,16,17. Menjadi jelas bahwa infeksi COVID-19 terjadi melalui pajanan virus, dan
populasi dengan imunosupresan merupakan kelompok yang rentan. Beberapa penelitian telah
melaporkan distribusi usia pasien dewasa antara 25 dan 89 tahun. Sebagian besar pasien
dewasa berusia antara 35 dan 55 tahun14, dan ada lebih sedikit kasus yang teridentifikasi di
antara anak-anak dan bayi14, 18
. Sebuah studi tentang dinamika penularan awal virus
melaporkan usia rata-rata pasien adalah 59 tahun, berkisar antara 15 hingga 89 tahun, dengan
mayoritas (59%) adalah laki-laki2. Diprediksikan bahwa populasi yang paling berisiko
mungkin adalah orang-orang dengan fungsi kekebalan yang buruk seperti orang tua dan
mereka yang mengalami disfungsi ginjal dan hati2.
COVID-19 ditemukan memiliki tingkat transmisibilitas dan risiko pandemi yang lebih
tinggi daripada SARS-CoV, karena jumlah reproduksi efektif (R) COVID-19 diperkirakan
lebih tinggi daripada jumlah reproduksi efektif yang dilaporkan SARS pada tahap awal ini 15.
Studi COVID-19 yang berbeda memperkirakan kisaran reproduksi dasar (R0) berkisar antara
2,6 hingga 4,71 (Tabel 4). Durasi rata-rata inkubasi COVID-19 diperkirakan 4,8 ± 2,6, mulai
dari 2 hingga 11 hari15 dan 5,2 hari (interval kepercayaan 95%, 4,1 hingga 7) 2. Pedoman
terbaru dari otoritas kesehatan Tiongkok menyatakan durasi inkubasi rata-rata 7 hari, mulai
dari 2 hingga 14 hari 23. Tabel 4 merangkum temuan tentang indikator penting dari studi
epidemiologi ini.
Di Cina, 11.791 kasus dikonfirmasi dan 17.988 kasus dicurigai di 34 provinsi pada
24:00, 31 Januari 2020 (Gambar 4) 32. Studi menunjukkan bahwa penyebaran COVID-19
relatif cepat dan dilaporkan telah menyebar ke beberapa negara lain setelah penyebarannya di
Cina. Pada 31 Januari 2020, ada 213 kematian dilaporkan secara global33. Kasus yang
dikonfirmasi dilaporkan di 19 negara berikut di luar Tiongkok: Australia (9), Kanada (3),
Kamboja (1), Prancis (6), Finlandia (1), Jerman (5), India (1), Italia (Italia) 2), Jepang (14),
Nepal (1), Malaysia (8), Filipina (1), Republik Korea (11), Singapura (13), Sri Lanka (1),
Thailand (14), Amerika Amerika (6), Uni Emirat Arab (4) dan Vietnam (5) (Gambar 5)33.

Tabel 4. Indikator epidemiologis utama pada artikel penelitian COVID-19 pada Januari 2020
Indikator Deskripsi
Usia pasien  Kasus antara usia 25 sampai 29 tahun, dengan kebanyakan pasien
antara usia 35 sampai 55 tahun dan sedikit kasus pada anak-anak dan
bayi [14]
 Median usia pasien adalah 59 tahun, dengan rentang 51 sampai 89
[2]
 Rerata usia pasien adalah 55,5 tahun; distribusi usia: ≤ 39: 10%; 40-
49: 22%; 50-59: 30%; 60-69: 22%; ≥ 70: 16% [19]
 Rentang usia pasien adalah 2 sampai 72 tahun [20]
Jenis kelamin  Kebanyakan pasien adalah laki-laki [20]
pasien  59% laki-laki [2]
 68% laki-laki [19]
Usia kematian  Median usia kematian adalah 75 (dengan rentang antara 48 sampai
89 tahun) [21]
Riwayat paparan  Pasar makanan laut Huanan di Wuhan [19, 22]
 Penduduk Wuhan atau pengunjung kota Wuhan [20]
Waktu inkubasi  4,8 ± 2,6 hari (2-11 hari) [15]
 5,2 hari (4,1-7 hari) [2]
 Rerata 7 hari (2-14 hari) [23]
 Rerata 10 hari [22]
 5-6 hari [24]
 Rerata 6,4 hari (5,6-7,7 hari) [20]
Basic reproduction  2,6 (rentang tidak pasti: 1,5 sampai 3,5) [25]
(R0)  3,8 (95% CI: 3,6-4,0) [26]
 2,2 (1,4-3,8) [27]
 4,71 (4,50-4,92) [24]
 2,68 (95% CI: 2,47-2,86) [28]
Populasi rentan  Lansia [21]
 Orang dengan gangguan fungsi imun [2]
 Orang dengan komorbiditas kronis [2, 15, 19, 21]
 Riwayat operasi sebelum masuk RS [21]
 Orang dalam pengobatan imunosupresif jangka Panjang [19]
 Tingkat kematian  3% (antara 29 Desember 2019 sampai 23 Januari 2020) [15]
 2,3% (sampai 28 Januari 2020) [29]
 2,8% (sampai 25 Januari 2020) [21]
 2,9% (sampai 25 Januari 2020) [30]
 11% (sampai 25 Januari 2020) [19]
 3,1% (sampai 24 Januari 2020) [31]

Gamb.4 Distribusi kasus COVID-19 di Cina

Penyebab
Virologi dan Patogenesis
Coronavirus adalah virus RNA beruntai tunggal yang bersifat zoonosis dan
menyebabkan gejala awal dari yang mirip dengan flu biasa hingga gejala pernapasan, enterik,
hati, dan neurologis yang lebih parah5,34. Selain SARS-CoV-2, ada enam coronavirus yang
diketahui pada manusia: HCoV-229E, HCoV-OC43, SARS-CoV, HCoV-NL63, HCoV-
HKU1, dan MERS-CoV2,23,35,36. Coronavirus telah menyebabkan dua pandemi skala besar
dalam dua dekade terakhir: SARS37 dan MERS12,38.
 Untuk mendeteksi sumber infeksi COVID-19, peneliti CDC Cina mengumpulkan 585
sampel lingkungan dari Pasar Makanan Laut Huanan di Wuhan, Provinsi Hubei, Cina pada 1
Januari dan 12 Januari 2020. Mereka mendeteksi 33 sampel yang mengandung SARS-CoV-2
dan mengindikasikan bahwa virus tersebut berasal dari hewan liar yang dijual di pasar 39.
Kemudian, peneliti menggunakan sampel cairan paru-paru, darah, dan usap tenggorokan dari
15 pasien untuk melakukan tes laboratorium. Tes laboratorium ini menemukan bahwa urutan
asam nukleat spesifik virus dalam sampel berbeda dari spesies manusia yang dikenal sebagai
virus coronavirus. Hasil laboratorium juga menunjukkan bahwa SARS-CoV-2 mirip dengan
beberapa gen beta (β) coronavirus yang diidentifikasi dalam kelelawar 12,18,40, yang terletak di
kelompok SARV yang mirip SARS / SARS12.
Dalam meneliti virus ini, peneliti mengobservasi cairan lavage bronchoalveolar dan
isolat yang dikultur, para peneliti melibatkan sembilan pasien rawat inap di Wuhan dengan
pneumonia virus dan negatif pada patogen pernapasan umum. Hasil sequencing ini
menunjukkan bahwa SARS-CoV-2 lebih luas dari SARS-CoV (dengan sekitar 79% identitas
sequence) dan MERS-CoV (dengan sekitar 50% identitas sequence) dibandingkan dengan
dua coronavirus seperti SARS yang berasal dari turunan kelelawar bat-SL-CoVZC45
(dengan identitas sequence 87,9%) dan bat-SL-CoVZXC21 (dengan identitas sequence
87,2%)41. Studi juga melaporkan bahwa protein S COVID-19 mendukung interaksi yang kuat
dengan molekul ACE2 manusia meskipun terdapat perbedaan urutannya dengan yang ada
pada SARS-CoV12,42.

Pola transmisi
Terdapat banyak hewan peliharaan dan liar, termasuk unta, sapi, kucing, dan kelelawar,
yang dapat berfungsi sebagai inang bagi virus corona23. Sebelumnya dianggap bahwa,
coronavirus hewan tidak menyebar di antara manusia3. Namun, terdapat pengecualian, seperti
SARS dan MERS, yang sebagian besar menyebar melalui kontak dekat dengan orang yang
terinfeksi melalui droplet pernapasan dari batuk atau bersin. Sehubungan dengan COVID-19,
pasien awalnya dilaporkan memiliki beberapa hubungan dengan Pasar Makanan Laut Huanan
di Wuhan, Cina, yang menunjukkan bahwa infeksi ini disebabkan oleh penularan dari hewan
ke orang. Namun, kasus-kasus kemudian dilaporkan di antara staf medis dan lainnya tanpa
riwayat pajanan ke pasar itu atau mengunjungi Wuhan, yang dianggap sebagai indikasi
penularan dari manusia ke manusia2,4,15,16,17.
Pedoman terbaru dari otoritas kesehatan Tiongkok23,43 menjelaskan tiga rute transmisi
utama untuk COVID-19: 1) transmisi droplet, 2) transmisi kontak, dan 3) transmisi aerosol.
Penularan droplet dilaporkan terjadi ketika droplet pernafasan (seperti yang dihasilkan ketika
orang yang terinfeksi batuk atau bersin) dicerna atau dihirup oleh orang-orang di dekatnya
dalam jarak dekat; transmisi kontak dapat terjadi ketika subjek menyentuh permukaan atau
objek yang terkontaminasi virus dan kemudian menyentuh mulut, hidung, atau mata mereka;
dan transmisi aerosol dapat terjadi ketika droplet pernapasan bercampur ke udara,
membentuk aerosol dan dapat menyebabkan infeksi ketika menghirup aerosol dosis tinggi ke
dalam paru-paru di lingkungan yang relatif tertutup 23,43. Selain tiga rute ini, satu studi juga
menunjukkan sistem pencernaan sebagai rute transmisi potensial untuk infeksi COVID-19.
Karena pasien memiliki ketidaknyamanan abdomen dan gejala diare, para peneliti
menganalisis empat set data dengan transkripom sel tunggal dari sistem pencernaan dan
menemukan bahwa ACE2 sangat diekspresikan dalam enterocytes dari ileum dan kolon44.

Gamb.5 Distribusi global kasus COVID-19

Manifetasi dan diagnosis klinis

Manifestasi klinis yang lengkap belum diketahui secara pasti, dengan gejala yang
dilaporkan bervariasi dari ringan sampai parah, dengan beberapa kasus yang berakhir dengan
kematian3. Gejala yang paling banyak dilaporkan adalah demam, batuk, myalgia, fatigue,
pneumonia, dan dispneu komplikata, dengan gejala yang lebih sedikit dilaporkan yaitu sakit
kepala, diare, batuk darah, pilek, dan batuk berdahak3,16. Pasien dengan gejala ringan
dilaporkan sembuh setelah 1 minggu, sedangkan pasien dengan gejala berat dilaporkan
mengalami gagal nafas progresif akibat kerusakan alveolus dari virus yang dapat berakibat
kematian13. Kasus yang berakibat kematian dilaporkan terutama pada pasien usia pertengahan
dan lansia dengan penyakit komorbid (operasi tumor, sirosis hepatis, hipertensi, penyakit
jantung koroner, diabetes, dan penyakit Parkinson13. Panduan definisi kasus menyebutkan
adanya gejala berikut: demam, jumlah limfosit dan sel darah putih yang menurun, infiltrat
paru pada foto rontgen dada, dan tidak adanya respon terhadap antibiotik setelah 3 hari2.

Untuk pasien dengan suspek infeksi, prosedur-prosedur berikut dianjurkan untuk

diagnosis: real-time fluorescence (RT-PCR) untuk mendeteksi asam nukleat positif SARS-
CoV-2 pada dahak, swab tenggorok, dan sekret dari saluran nafas bawah13,14,43.

Pencegahan dan kontrol

Strategi pencegahan dan kontrol serta metode dilaporkan dalam tiga tingkat: nasional,
populasi terkait kasus, dan populasi awam. Pada tingkat nasional, Komisi Kesehatan Nasional
Republik Cina mengumumkan pengumuman no. 1 pada 20 Januari 2020, yang secara resmi
memasukkan COVID-19 ke dalam manajemen dari penyakit infeksius kelas B dan
memperbolehkan untuk menggunakan pencegahan dan kontrol kelas A45. Di bawah kebjiakan
ini, institusi kesehatan melaksanakan protokol perawatan isolasi dan observasi untuk
mencegah penyebaran COVID-19. Pada 22 Januari 2020, Komisi Kesehatan Nasional Cina
mempublikasikan panduan nasional untuk pencegahan dan kontrol COVID-19 untuk institusi
kesehatan dalam mencegah infeksi nosokomial46. Pada 28 Januari 2020, Komisi Kesehatan
Nasional Republik Cina membuat protokol pencegahan dan kontrol cepat untuk mencegah
penyebaran epidemi secara efektif dengan kebijakan isolasi dan desinfeksi skala besar pada
festival musim semi di Cina47. Strategi tingkat nasional juga telah dilaksanakan untuk daerah
rural (28 Januari 2020) dan populasi lansia (31 Januari 2020) 48, 49. Beberapa pendekatan
kesehatan masyarakat yang dapat mencegah atau memperlambat penyebaran COVID-19 juga
diterapkan, seperti isolasi kasus, identifikasi dan follow-up kontak, desinfeksi lingkungan,
dan penggunaan alat pelindung diri50.

Sampai saat ini belum ada pengobatan antivirus spesifik yang efektif melawan
COVID-19. Terkait dengan pasien yang terinfeksi COVID-19, terapi simptomatik dan
suportif direkomendasikan untuk diterapkan3,16. Terdapat 6 percobaan klinis yang terdaftar
pada International Clinical Trials Registry dan Chinese Clinical Trial Registry yang
mengevaluasi efikasi dan keamanan pengobatan dan prognosis COVID-1951,52. Beberapa
penelitian mengeksplorasi infeksi nosokomial dan kesehatan psikologis terkait COVID-19.
Beberapa tindakan telah direkomendasikan untuk mengurangi infeksi nosokomial, yaitu
penyuluhan kontrol dan pencegahan, isolasi, desinfeksi, dan proteksi dalam berbagai derajat
pada area terinfeksi, dan proteksi pada kasus terkonfirmasi 18,50,53. Terkait kesehatan
psikologis, beberapa intervensi psikologis pada kasus terkonfirmasi, kasus suspek, dan tenaga
kesehatan telah direkomendasikan18,54.

Untuk populasi awam, saat ini belum ada vaksin yang mencegah COVID-19.
Pencegahan terbaik saat ini adalah menghindari paparan virus 55. Pencegahan air-borne telah
didiskusikan dan diajukan untuk pencegahan. Kontrol dan pencegahan infeksi dapat
mengurangi risiko paparan, termasuk menggunakan masker, menutup mulut dan hidung saat
batuk atau bersin dengan tisu yang kemudian dibuang (atau menggunakan siku jika tidak ada
tisu); cuci tangan teratur dengan sabun atau desinfeksi dengan hand sanitizer dengan kadar
alkohol minimal 60% (jika tidak terdapat air maupun sabun); pencegahan kontak dengan
orang terinfeksi dan menjaga jarak sebisa mungkin; dan menghindari menyentuh mata,
hidung, dan mulut sebelum cuci tangan3.

WHO juga sudah mempublikasikan panduan detail penggunaan masker di komunitas,

saat perawatan di rumah, dan pada pelayanan kesehatan 56. Pada dokumen ini, tenaga
kesehatan direkomendasikan untuk menggunakan respirator partikel pada masker N95 atau
FFP2 saat menggunakan prosedur yang memproduksi aerosol dan menggunakan masker
medis saat melayani pasien suspek maupun terkonfirmasi. Berdasarkan panduan ini, individu
dengan gejala pernafasan disarankan untuk menggunakan masker di pelayanan kesehatan
maupun di rumah. Sementara itu, orang tanpa gejala pernafasan tidak perlu menggunakan
masker medis di ruang publik. Penggunaan dan pembuangan masker yang benar sangat
penting dalam mencegah tingkat penyebaran56.

Sebagai tambahan jurnal-jurnal penelitian yang sudah dipublikasi, CDC Cina

mempublikasikan sebuah panduan untuk meningkatkan kesadaran pencegahan dan kontrol
COVID-19 pada populasi awam. Intisari dari panduan itu meliputi penyebab COVID-19, cara
memilih dan menggunakan masker, cara mencuci tangan yang benar, pencegahan pada
lokasi-lokasi yang berbeda (rumah, transportasi publik, dan ruang publik), metode desinfeksi,
serta observasi kesehatan di rumah57. Sebagai tambahan pengetahuan medis untuk mengatasi
wabah COVID-19, panduan ini juga memberikan informasi untuk mencegah panik pada
populasi awam57.

Kekuatan dan keterbatasan penelitian

Studi ini mengaplikasikan pencarian yang sistematis untuk mendapatkan artikel yang
relevan berdasarkan tujuan penelitian. Studi ini merangkum dasar-dasar ilmu,
mengindentifikasi kurangnya literatur, dan merekomendasikan bukti-bukti untuk langkah
penelitian selanjutnya mengenai COVID-19 sehingga bermanfaat untuk peneliti, pembuat
kebijakan, dan tenaga kesehatan dalam membuat penelitian baru, kebijakan, dan praktik
klinis. Studi ini hanya berfokus pada artikel berbahasa Inggris maupun Mandarin pada awal
pandemi. Walaupun studi ini tidak merefleksikan semua penelitian COVID-19 di seluruh
dunia, namun studi ini telah menyediakan bukti-bukti ilmiah untuk kontrol dan studi ke
depannya.

Kesimpulan
Studi ini menunjukkan gambaran holistik dari penelitian mengenai wabah COVID-19.
Pada periode awal pandemi, banyak studi hanya dipublikasikan mengenai epidemiologi,
penyebab, manifestasi klinis dan diagnosis, serta pencegahan dan kontrol COVID-19. Saat
ini, studi yang paling banyak adalah studi epidemiologi dan penyebab. Namun, jumlah
penelitian mengenai pencegahan dan kontrol saat ini mulai meningkat. Studi-studi ini
diperlukan untuk meminimalisir dampak dari wabah ini. Pemerintah telah mengaplikasikan
penelitian terbaru dalam pembuatan kebijakan publik pada tingkat komunitas, regional, dan
nasional untuk memperlambat dan mencegah penyebaran COVID-19. Kami
merekomendasikan bahwa komunitas ilmiah membuat penelitian yang lebih lanjut yang
memberikan cara mengatasi keadaan darurat pada kesehatan masyarakat dalam jangka
pendek maupun jangka panjang.

Informasi tambahan
Informasi tambahan menyertai makalah ini di https://doi.org/10. 1186 / s40249-020-00646-x.
Singkatan
ACE2: Angiotensin converting enzyme 2; CDC: Center for Disease Control; PPI: Pencegahan
dan pengendalian infeksi; MERS: Middle East Respiratory Syndrome; PRISMA: Preferred
Reporting Items for Systematic Reviews and Meta-Analyses; SARS: Severe Acute
Respiratory Syndrome; WHO: World Health Organization
Ucapan Terima Kasih
Terima kasih yang tulus kami sampaikan kepada semua ahli yang telah memberikan wawasan
untuk penulisan makalah ini.

Kontribusi penulis
SPA dan HZ merancang penelitian, memandu metodologi, dan menulis draf pertama; SM,
WY, QW, SC, RY bertanggung jawab untuk mencari artikel; WY, SPA, HZ bertanggung
jawab atas pemilihan basis data, strategi pencarian, penyaringan artikel terhadap kriteria
inklusi, dan memetakan data; QW, SM, SPA, dan HZ bertanggung jawab untuk analisis;
SPA, HZ, SS, YM, SR dan HR mengkaji, membahas, dan memodifikasi naskah secara kritis.
Semua penulis membaca dan menyetujui naskah akhir untuk publikasi.

Pendanaan
Penelitian ini didanai oleh China Medical Board (CMB-18-297).

Ketersediaan data dan materi

Dataset yang mendukung kesimpulan artikel ini dimasukkan sebagai tabel file tambahan.

Persetujuan etika dan persetujuan untuk berpartisipasi

Tak dapat diterapkan.

Persetujuan untuk publikasi

Tak dapat diterapkan.

Minat bersaing
Para penulis menyatakan bahwa mereka tidak memiliki kepentingan yang bersaing.

Rincian penulis
1
West China School of Public Health and West China Fourth Hospital, Sichuan University,
Chengdu, China. 2Department of Communication Studies, California State University, Long
Beach, CA 90802, USA. 3Health Policy and Management, University of North Carolina at
Chapel Hill, Chapel Hill, NC, USA. 4Freeman Spogli Institute for International Studies,
Stanford University, Stanford, CA, USA. 5Department of Public Health, Erasmus MC—
University Medical Center Rotterdam, 3000, CA, Rotterdam, The Netherlands

Diterima: 11 Februari 2020 Diterima: 5 Maret 2020 Publikasi online: 17 Maret 2020
 DAFTAR PUSTAKA

1. WMHC. Wuhan Municipal Health and Health Commission’s Briefing on the Current
Pneumonia Epidemic Situation in Our City. 2020. http://wjw.wuhan.
gov.cn/front/web/showDetail/2019123108989. Accessed 1 Feb 2020.
2. Li Q, Guan X, Wu P, Wang X, Zhou L, Tong Y, et al. Early transmission dynamics in
Wuhan, China, of novel coronavirus-infected pneumonia. N Engl J Med. 2020.
https://doi.org/10.1056/NEJMoa2001316.
3. CDC. 2019 Novel coronavirus, Wuhan, China. 2020. https://www.cdc.gov/
coronavirus/2019-nCoV/summary.html. Accessed 1 Feb 2020.
4. WHO. Novel Coronavirus–China. 2020. https://www.who.int/csr/don/12- january-
2020-novel-coronavirus-china/en/. Accessed 1 Feb 2020.
5. Zhu N, Zhang D, Wang W, Li X, Yang B, Song J, et al. A novel coronavirus from
patients with pneumonia in China, 2019. N Engl J Med. 2020. https://
doi.org/10.1056/NEJMoa2001017.
6. WHO. Novel Coronavirus-Japan (ex-China). 2020. https://www.who.int/csr/ don/17-
january-2020-novel-coronavirus-japan-ex-china/en/. Accessed 1 Feb 2020.
7. Virological.org. Novel 2019 Coronavirus Genome 2020. http://virological.org/ t/novel-
2019-coronavirus-genome/319. Accessed 1 Feb 2020.
8. Fehr AR, Channappanavar R, Perlman S. Middle East respiratory syndrome: emergence
of a pathogenic human coronavirus. Annu Rev Med. 2017;68: 387–99.
9. WHO. Statement on the second meeting of the International Health Regulations (2005)
Emergency Committee regarding the outbreak of novel coronavirus (2019-nCoV).
2020. https://www.who.int/news-room/detail/30- 01-2020-statement-on-the-second-
meeting-of-the-international-health- regulations-(2005)-emergency-committee-
regarding-the-outbreak-of-novel- coronavirus-(2019-ncov). Accessed 1 Feb 2020.
10. Arksey H, O’Malley L. Scoping studies: towards a methodological framework. Int J
Soc Res Methodol. 2005;8:19–32.
11. Moher D, Liberati A, Tetzlaff J, Altman DG, The PRISMA Group. Preferred reporting
items for systematic reviews and meta-analyses: the PRISMA statement. PLoS Med.
2009;6 (e100097). https://doi.org/10.1371/journal. pmed.1000097.
12. Zhou P, Yang XL, Wang, XG, Hu B, Zhang L, Zhang W, et al. Discovery of a novel
coronavirus associated with the recent pneumonia outbreak in humans and its potential
bat origin. bioRxiv. 2020; doi: https://doi.org/10. 1101/2020.01.22.914952.
13. Li T, Wei C, Li W, Hongwei F, Shi J. Beijing Union Medical College Hospital on
"pneumonia of novel coronavirus infection" diagnosis and treatment proposal (V2.0).
Med J Peking Union Med Coll Hosp. 2020. http://kns.cnki.
net/kcms/detail/11.5882.r.20200130.1430.002.html. Accessed 2 Feb 2020.
14. Medical expert group of Tongji hospital. Quick guide to the diagnosis and treatment of
pneumonia for novel coronavirus infections (third edition). Herald Med. 2020.
http://kns.cnki.net/kcms/detail/42.1293.r.20200130.1803. 002.html. Accessed 2 Feb
2020.
15. Liu T, Hu J, Kang M, Lin L, Zhong H, Xiao J, et al. Transmission dynamics of 2019
novel coronavirus (2019-nCoV). 2020; doi: https://doi.org/10.1101/2020.
01.25.919787.
16. Huang C, Wang Y, Li X, Ren L, Zhao Jianping, Hu Y, et al. Clinical features of
patients infected with 2019 novel coronavirus in Wuhan, China. Lancet. 2020;
395:497–506. https://doi.org/10.1016/S0140–6736(20)30183–5.
17. Gralinski LE, Menachery VD. Return of the coronavirus: 2019-nCoV. Viruses.
2020;12:135.
18. Wang C, Wang X. Prevalence, nosocomial infection and psychological prevention of
novel coronavirus infection. Chin General Pract Nurs. 2020;18: 2–3.
19. Chen N, Zhou M, Dong X, Qu J, Gong F, Han Y, et al. Epidemiological and clinical
characteristics of 99 cases of 2019 novel coronavirus pneumonia in Wuhan, China: a
descriptive study. Lancet. 2020;395:507–13.
20. Backer JA, Klinkenberg D, Wallinga J. The incubation period of 2019-nCoV infections
among travellers from Wuhan. China Euro Surveill. 2020; https://
doi.org/10.2807/1560-7917.ES.2020.25.5.2000062.
21. Wang W, Tang J, Wei F. Updated understanding of the outbreak of 2019 novel
coronavirus (2019-nCoV) in Wuhan, China. J Med Virol. 2020;92:441–7.
22. Imai N, Dorigatti I, Cori A, Riley S, Ferguson, NM. Estimating the potential total
number of novel Coronavirus cases in Wuhan City, China. 2020.
https://www.imperial.ac.uk/media/imperial-college/medicine/sph/ide/gida-
fellowships/2019-nCoV-outbreak-report-17-01-2020.pdf. Accessed 31 Jan, 2020.
23. National Health Commission of People’s Republic of China. Prevent guideline of 2019-
nCoV. 2020. http://www.nhc.gov.cn/xcs/yqfkdt/202001/
bc661e49b5bc487dba182f5c49ac445b.shtml. Accessed 1 Feb 2020.
24. Shen M, Peng Z, Xiao Y, Zhang L. Modelling the epidemic trend of the 2019 novel
coronavirus outbreak in China. bioRxiv. 2020; https://doi.org/10.1101/
2020.01.23.916726.
25. Imai N, Cori A, Dorigatti I, Baguelin M, Donnelly CA, Riley S, et al. Report 3:
Transmissibility of 2019-nCoV. 2020. https://www.imperial.ac.uk/media/ imperial-
college/medicine/sph/ide/gida-fellowships/Imperial-2019-nCoV- transmissibility.pdf.
Accessed 31 Jan, 2020.
26. Read JM, Bridgen JRE, Cummings DAT, Ho A, Jewell CP. Novel coronavirus 2019-
nCoV: early estimation of epidemiological parameters and epidemic predictions.
medRxiv. 2020; doi: https://doi.org/10.1101/2020.01.23.20018549.
27. Riou J, Althaus CL. Pattern of early human-to-human transmission of Wuhan 2019
novel coronavirus (2019-nCoV), December 2019 to January 2020. Euro Surveill.
2020;25(4). https://doi.org/10.2807/1560-7917.ES.2020.25.4.2000058.
28. Wu JT, Leung K, Leung GM. Nowcasting and forecasting the potential domestic and
international spread of the 2019-nCoV outbreak originating in Wuhan, China: a
modelling study. Lancet. 2020; https://doi.org/10.1016/ S0140–6736(20)30260–9.
29. Ming WK, Huang J, Zhang CJ. Breaking down of healthcare system: mathematical
modelling for controlling the novel coronavirus (2019-nCoV) outbreak in Wuhan.
China bioRxiv. 2020. https://doi.org/10.1101/2020.01.27.922443.
30. Lai S, Bogoch II, Watts A, Khan K, Li Z, Tatem A. Preliminary risk analysis of 2019
novel coronavirus spread within and beyond China. 2020. https://
www.worldpop.org/resources/docs/china/WorldPop-coronavirus-spread-risk- analysis-
v1-25Jan.pdf. Accessed 31 Jan 2020.
31. Nishiura H, Jung SM, Linton NM, Kinoshita R, Yang Y, Hayashi K, et al. The extent of
transmission of novel coronavirus in Wuhan, China, 2020. J Clin Med. 2020;9:330.
32. National Health Commission of People’s Republic of China. An update on the
incidence of pneumonia with novel coronavirus infection as at 24:00 on 31 January
2020. http://www.nhc.gov.cn/xcs/yqfkdt/202002/84faf71e096446
fdb1ae44939ba5c528.shtml. Accessed 1 Feb 2020.
33. WHO. Novel Coronavirus (2019-nCoV) Situation Report–11. 2020. https://
www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/situation-reports/20200131- sitrep-11-
ncov.pdf?sfvrsn=de7c0f7_4. Accessed 1 Feb 2020.
34. WHO. Coronavirus. 2020. https://www.who.int/health-topics/coronavirus. Accessed 1
Feb 2020.
35. Su S, Wong G, Shi W, Liu J, Lai ACK, Zhou J, et al. Epidemiology, genetic
recombination, and pathogenesis of coronaviruses. Trend Microbiol. 2016; 24:490–502.
36. Chen Y, Liu Q, Guo D. Coronaviruses: genome structure, replication, and pathogenesis.
J Med Virol. 2020. https://doi.org/10.1002/jmv.25681.
37. Peiris JS, Guan Y, Yuen K. Severe acute respiratory syndrome. Nature Med.
2004;10:S88–97.
38. Zaki AM, Boheemen SV, Bestebroer TM, Osterhaus ADME, Fouchier RAM. Isolation
of a novel coronavirus from a man with pneumonia in Saudi Arabia. N Engl J Med.
2012;367:1814–20.
39. Chinese Center for Disease Control and Prevention. 585 environmental samples from
the South China Seafood Market in Wuhan, Hubei Province, China. 2020.
http://www.chinacdc.cn/yw_9324/202001/t20200127_211469. html. Accessed 1 Feb
2020.
40. Lu H, Tang CW, Tang Y. Outbreak of pneumonia of unknown etiology in Wuhan
China: the mystery and the miracle. J Medl Virol. 2020; doi: https://
doi.org/10.1002/jmv/25678.
41. Roujian L, Zhao X, Li J, Niu P, Yang B, Wu H, et al. Genomic characterisation and
epidemiology of 2019 novel coronavirus: implications for virus origins and receptor
binding. Lancet. 2020; https://doi.org/10.1016/S0140– 6736(20)30251–8.
42. Xu X, Chen P, Wang J, Feng J, Zhou H, Li X, et al. Evolution of the novel coronavirus
from the ongoing Wuhan outbreak and modeling of its spike protein for risk of human
transmission. Sci Chin Life Sci. 2020; https://doi. org/10.1007/s11427-020-1637-5.
43. National Health Commission of People’s Republic of China. Pneumonia diagnosis and
treatment of 2019-nCoV infection from Chinese NHC and CDC 2020. 2020.
http://www.nhc.gov.cn/xcs/zhengcwj/202001/4294563ed35
b43209b31739bd0785e67/files/7a9309111267475a99d4306962c8bf78.pdf. Accessed 1
Feb 2020.
44. Zhang H, Kang Z, Gong H, Xu D, Wang J, Li Z, et al. The digestive system is a
potential route of 2019-nCov infection: a bioinformatics analysis based on single-cell
transcriptomes. bioRxiv. 2020; doi: https://doi.org/10.1101/2020. 01.30.927806.
45. National Health Commission of People’s Republic of China. Pneumonia infected with
novel coronavirus is included in the management of legal infectious diseases. 2020.
http://www.nhc.gov.cn/jkj/s7915/202001/e4e2d5e6 f01147e0a8df3f6701d49f33.shtml.
Accessed 31 Jan 2020.
46. National Health Commission of People’s Republic of China. Notice on printing and
distributing the technical guide for prevention and control of novel coronavirus
infection in medical institutions (First Edition). 2020.
http://www.nhc.gov.cn/yzygj/s7659/202001/b91fdab7c304431eb082d6784
7d27e14.shtml. Accessed 31 Jan 2020.
47. National Health Commission of People’s Republic of China. Notice on printing and
distributing the work plan for prevention and control of pneumonia caused by novel
coronavirus infection in the near future. 2020.
http://www.nhc.gov.cn/tigs/s7848/202001/808bbf75e5ce415aa19f74 c78ddc653f.shtml.
Accessed 31 Jan 2020.
48. National Health Commission of People’s Republic of China. Notice on further
prevention and control of pneumonia caused by novel coronavirus infection in rural
areas. 2020. http://www.nhc.gov.cn/jkj/s3578/202001/f8d45
f6af1d24ef18151c1d91cf8a028.shtml. Accessed 31 Jan 2020.
49. National Health Commission of People’s Republic of China. Notice on prevention and
control of novel coronavirus infection pneumonia in the elderly people. 2020.
http://www.nhc.gov.cn/lljks/tggg/202001/96e82ba8a14
d41b283da990d39771493.shtml. Accessed 31 Jan 2020.
50. Wei Q, Ren Z. Disinfection measures for pneumonia foci infected by novel coronavirus
in 2019. Chin J Disinfect. 2020;37:59–62.
51. World Health Organization. International clinical trials registry platform. 2020.
https://apps.who.int/trialsearch/default.aspx. Accessed 23 Feb 2020.
52. Chinese Clinical Trial Registry. 2020. http://www.chictr.org.cn. Accessed 23 Feb 2020.
53. Bin C, Fang X, Chen H. Application effect of disaster vulnerability analysis in coping
with the transmission of new coronavirus in non-closed hematology ward. 2020.
http://kns.cnki.net/kcms/detail/14.1272.R.20200131.1909.002. html. Accessed 2 Feb
2020.
54. Xu M, Zhang Y. Investigation on the psychological status of the first batch of clinical
first-line support nurses to fight against pneumonia caused by novel coronavirus. Chin
Nurs Res. 2020;34:1–3.
55. Ou F, Wu H, Yang Y, Tan W, Zhang J, Gu J. Countermeasures for rapid spread of new
coronavirus pneumonia in Wuhan. Chin General Pract Nurs. 2020.
http://kns.cnki.net/kcms/detail/14.1349.R.20200131.1319.002.html. Accessed 2 Feb
2020.
56. WHO. Advice on the use of masks in the community, during home care and in health
care settings in the context of the novel coronavirus 2019- nCoV outbreak (Interim
guidance). 2020. WHO/nCov/IPC_Masks/2020. Accessed 3 Feb 2020.
57. National Health Commission of People’s Republic of China. Guidelines for public
protection against novel coronavirus infection. 2020. http://www.nhc.
gov.cn/jkj/s7915/202001/bc661e49b5bc487dba182f5c49ac445b.shtml. Accessed 31
Jan 2020.
 Perbedaan Tinjauan Lingkup dan Tinjauan Sistematis

Scoping Review atau tinjauan lingkup adalah pendekatan untuk mensintesis bukti baru
yang memiliki panduan atau literatur terbatas1. Definisi lainnya adalah suatu bentuk studi
yang membahas pertanyaan penelitian eksplorasi yang bertujuan untuk mengidentifikasi dan
memetakan bukti yang tersedia1,2.

Tinjauan ini berfungsi untuk menentukan ruang lingkup atau cakupan dari suatu literatur
tentang suatu topik dan memberikan indikasi yang jelas tentang volume literatur dan studi
yang tersedia serta tinjauan umum (luas atau terperinci). Tinjauan lingkup dapat digunakan
untuk memeriksa kejadian-kejadian yang masih belum jelas, sedangkan tinjauan sistematis
lebih menjawab pertanyaan yang lebih spesifik2. Tinjauan lingkup biasanya melibatkan enam
langkah1:

1. Identifikasi pertanyaan penelitian

2. Identifikasi studi yang relevan
3. Pilih studi untuk dimasukkan
4. Mengekstrak & memetakan data dari studi yang disertakan
5. Menyusun, meringkas & melaporkan hasil
6. Konsultasi dengan pemangku kepentingan.

Suatu topik dapat dijadikan tinjauan lingkup saat literatur yang tersedia belum ditinjau
secara komprehensif, atau menunjukkan sifat besar, kompleks, atau heterogen, sehingga tidak
dapat ditinjau lebih tepat menggunakan tinjauan sistematis. Sementara tinjauan sistematis
berfokus pada penelitian-penelitian yang telah tersedia yang relevan dengan pertanyaan
penelitian3.

Tinjauan sistematis adalah sebuah studi yang mengidentifikasi, menilai, dan

mensintesis semua bukti empiris yang memenuhi kriteria kelayakan yang telah ditentukan
sebelumnya untuk menjawab pertanyaan penelitian yang diberikan 1. Tinjauan sistematis
berfungsi untuk mengkonfirmasi atau membantah apakah praktik yang dilakukan saat ini
didasarkan pada bukti yang relevan, untuk menetapkan kualitas bukti itu, dan untuk
mengatasi ketidakpastian atau variasi dalam praktik yang mungkin terjadi2.
Perbedaan antara tinjauan lingkup dan tinjauan sistematis adalah sebagai berikut2:

Tinjauan lingkup Tinjauan sistematis

Pertanyaan Didefinisikan secara luas Sangat fokus
penelitian
Kriteria Dikembangkan pasca tahap Dikembangkan pada tahap
inklusi/eksklus seleksi studi protokol
i
Seleksi studi Semua jenis studi Jenis studi tertentu
Ekstraksi data "Bagan" data sesuai dengan isu- Mensintesis & mengumpulkan
isu utama, tema, dll. temuan
Indikasi 1. Mengidentifikasi jenis bukti 1. Menemukan bukti
yang tersedia di bidang yang internasional
diberikan 2. Mengkonfirmasi praktik saat
2. Mengklarifikasi ini/mengemukakan adanya
konsep/definisi utama dalam variasi/identifikasi praktik
literatur baru
3. Memeriksa bagaimana 3. Mengidentifikasi dan
penelitian dilakukan pada menginformasikan ke bidang
topik atau bidang tertentu tertentu untuk penelitian
4. Mengidentifikasi masa depan
karakteristik atau faktor 4. Mengidentifikasi dan
kunci yang terkait dengan menyelidiki hasil yang
suatu konsep bertentangan
5. Sebagai pendahulu untuk 5. Menghasilkan pernyataan
tinjauan sistematis untuk memandu pengambilan
6. Mengidentifikasi dan keputusan
menganalisis kesenjangan
pengetahuan

Daftar Pustaka
1. Unibersity of Toronto Libraries. Systematic & Scoping Reviews : Methodology Behind
the Search Strategies. 2020. https://guides.library.utoronto.ca/systematicreviews
2. Munn, Z., Peters, M., Stern, C., Tufanaru, C., McArthur, A., & Aromataris, E. (2018).
Systematic review or scoping review? Guidance for authors when choosing between a
systematic or scoping review approach. BMC medical research methodology, 18(1), 143.
https://doi.org/10.1186/s12874-018-0611-x
3. Tample University Libraries. Systematic Reviews & Other Review Types. 2020.
https://guides.temple.edu/systematicreviews