Évaluation in Vitro de La Sensibilité de Bactéries
Évaluation in Vitro de La Sensibilité de Bactéries
Évaluation in Vitro de La Sensibilité de Bactéries
INTRODUCTION
INTRODUCTION
bactries peuvent acqurir rsistance aux antibiotiques par modification capital gntique mutation, acquisition de plasmides, acquisition de transposons
INTRODUCTION
INTRODUCTION
L'ANTIBIOGRAMME
Principe
dterminer la Concentration Minimale Inhibitrice (CMI) d'une souche bactrienne vis--vis des divers antibiotiques. Dfinition (O.M.S.) o CMI = plus faible concentration d'antibiotique capable de provoquer une inhibition complte de la croissance d'une bactrie donne, apprciable l' il nu, aprs une priode d'incubation donne.
o
L'ANTIBIOGRAMME
Dfinition :
o o
Dtermination sensibilit d'une bactrie aux antibiotiques Examen quotidien de laboratoire, en particulier hospitalier, pas toujours ncessaire
L'ANTIBIOGRAMME
L'ANTIBIOGRAMME
Mthodes de dilution
En milieu liquide
o
CMI est indique par le tube qui contient la plus faible concentration d'antibiotique et o aucune croissance n'est visible
L'ANTIBIOGRAMME
Mthodes de dilution
L'ANTIBIOGRAMME
Mthodes de dilution
L'ANTIBIOGRAMME
Mthodes de dilution
L'ANTIBIOGRAMME
Mthodes de diffusion : antibiogramme standard
L'ANTIBIOGRAMME
Mthodes de diffusion : antibiogramme standard
L'ANTIBIOGRAMME
Mthodes de diffusion : antibiogramme standard
d'inhibition circulaires correspondant une absence de culture Technique parfaitement standardise, diamtres des zones d'inhibition dpendent uniquement de la sensibilit du germe
L'ANTIBIOGRAMME
Mthodes de diffusion : antibiogramme standard
diamtres des zones d'inhibition et les log2 des CMI mesures par les techniques de dilution = Droites de concordance ou droites de rgression En thorie, les mesures des diamtres des zones d'inhibition et leurs reports sur les courbes de concordance donnent les valeurs des CMI en g/mL
Courbe de concordance
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Mthodes de diffusion : antibiogramme standard
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Mthodes de diffusion : antibiogramme standard
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Mthodes de diffusion : antibiogramme standard
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Mthodes de diffusion : antibiogramme standard
L'paisseur de la glose va
conditionner la concentration de la source d'antibiotique et elle doit tre de 4 mm.
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Mthodes de diffusion : antibiogramme standard
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Mthodes de diffusion : antibiogramme standard
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Mthodes de diffusion : antibiogramme standard
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Mthodes de diffusion : antibiogramme standard
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Mthodes de diffusion : antibiogramme standard
L'ANTIBIOGRAMME
Mthodes de diffusion : antibiogramme standard
L'ANTIBIOGRAMME
Mthodes de diffusion : antibiogramme standard
Pseudomonas aeruginosa : ATCC 27853 (= CIP 76.110) Staphylococcus aureus subsp. aureus : ATCC 25923 (= CIP 76.25) Escherichia coli : ATCC 25922 (= CIP 76.24)
Rsultats de lantibiogramme
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Mthodes de diffusion : antibiogramme standard
antibiogramme Pas des courbes de concordance mais bandelettes de lecture sur lesquelles sont reportes les diamtres correspondant aux concentrations critiques.
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Mthodes de diffusion : antibiogramme standard
grande quantit d'antibiotique actif que l'on peut obtenir dans le srum et les tissus la suite d'un traitement effectu la posologie habituelle Concentration critique infrieure = plus faible concentration humorale et tissulaire d'antibiotique actif
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Mthodes de diffusion : antibiogramme standard
Rsultats : Principe de la lecture d'un antibiogramme Tableau des concentrations catgorisation clinique.
o
CMI infrieure la concentration critique infrieure, la souche est qualifie de sensible. CMI suprieure la concentration critique suprieure, la souche est qualifie de rsistante. CMI comprise entre les deux concentrations critiques, la souche est dite de sensibilit intermdiaire.
L'ANTIBIOGRAMME
Mthodes de diffusion : antibiogramme standard
L'ANTIBIOGRAMME
Mthodes de diffusion : antibiogramme standard
antibiogramme Expression des rsultats Rsultats quantitatifs (CMI en g/mL) = le plus souvent interprts par les laboratoires en terme de possibilit thrapeutique. Cette interprtation consiste comparer les valeurs des CMI avec les concentrations critiques tablies pour chaque antibiotique.
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Mthodes de diffusion : antibiogramme standard
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Mthodes de diffusion : antibiogramme standard
antibiogramme Critres bactriologiques o bass sur les distributions des CMI des populations bactriennes des diffrentes espces et possdant ou non des caractres de rsistance acquise biochimiquement et gntiquement identifis
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Mthodes de diffusion : antibiogramme standard
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antibiogramme Critres pharmacocintiques o posologies normales et maximales et selon les diffrentes voies d'administration o tudes pharmacocintiques informations sur l'absorption, la distribution, la biotransformation et l'limination des antibiotiques
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Mthodes de diffusion : antibiogramme standard
antibiogramme Critres cliniques o permettent de moduler les donnes pharmacologiques Un individu infect par une bactrie dont les CMI sont connues est-il ou non guri par un traitement qui semblait bien adapt compte tenu des rsultats obtenus in vitro ?
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Mthodes de diffusion : antibiogramme standard
antibiogramme Critres cliniques o permettent de moduler les donnes pharmacologiques les donnes reliant les CMI aux rsultats thrapeutiques ont largement contribu la validit de l'antibiogramme (Sirot)
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Mthodes de diffusion : antibiogramme standard
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Mthodes de diffusion : antibiogramme standard
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antibiogramme SENSIBLE : o Souches S : probabilit de succs thrapeutique forte dans le cas dun traitement par voie systmique avec la posologie recommande o Effet thrapeutique +++ : traitement dose habituelle par voie gnrale
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Mthodes de diffusion : antibiogramme standard
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antibiogramme INTERMEDIAIRE o Souches I : succs thrapeutique imprvisible o Ensemble htrogne pour lequel la seule valeur de la CMI n'est pas prdictive
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Mthodes de diffusion : antibiogramme standard
L'antibiogramme n'est pas ncessaire si prise en compte du spectre clinique des antibiotiques (SCA). , donc pour deux classes thrapeutique: habituellement sensibles et modrment sensibles
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antibiogramme SCA bas sur : o c, C, o donnes pharmacocintiques, o spectre naturel de l'antibiotique (CMI modales, CMI 50%, CMI 90%) o rsultats cliniques
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Mthodes de diffusion : antibiogramme standard
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Mthodes de diffusion : antibiogramme standard
HABITUELLEMENT SENSIBLE
o
Spectre naturel de l'antibiotique Pourcentage de souches rsistantes ne dpasse pas 10% Le mdecin peut choisir cet antibiotique pour une infection peu svre et L'antibiogramme n'est pas ncessaire
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Mthodes de diffusion : antibiogramme standard
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antibiogramme MODEREMENT SENSIBLE o naturellement peu sensibles l'antibiotique o mais pas de rsistance acquise (CMI 50% comprises entre c et C) o Le traitement impose de fortes doses o ou infection de localisation particulire avec des concentrations trs leves de l'antibiotique
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Mthodes de diffusion : antibiogramme standard
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L'ANTIBIOGRAMME
antibiogramme INCONSTAMMENT SENSIBLE o Spectre naturel de l'antibiotique mais la frquence de rsistance acquise dpasse 10%. o Sensibilit imprvisible, donc l'antibiogramme est ncessaire. o Risque d'chec inacceptable
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Mthodes de diffusion : antibiogramme standard
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Mthodes de diffusion : antibiogramme standard
RESISTANTE
o
naturellement rsistante
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Mthodes de diffusion : antibiogramme standard
Rsultats : Principe de la lecture d'un antibiogramme rythromycine (macrolide) : o Espce habituellement sensible: S. pyogenes: CMI modale de 0,03 mg/l o Espce modrment sensibles: H. influenzae: CMI modale de 4 mg/l) o Espce inconstamment sensible: S. pneumoniae: CMI modale de 0,03 mg/l mais 30-40% de souches rsistantes en 2000 o Espce rsistante: E. coli: CMI modale de 32 64 mg/l : rsistance naturelle incompatible avec un traitement
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Mthodes de diffusion : antibiogramme standard
L'ANTIBIOGRAMME
Mthodes de diffusion : antibiogramme standard
Rsultats : Principe de la lecture d'un antibiogramme Lecture interprtative de lantibiogramme o Fonde sur la connaissance des phnotypes de rsistance. o But : transformer un rsultat catgoris "sensible" en un rsultat "intermdiaire" ou "rsistant" en raison d'un risque d'chec thrapeutique. o Ncessite : Une identification correcte de la souche Une mthode d'antibiogramme parfaitement standardise
L'ANTIBIOGRAMME
Mthodes de diffusion : antibiogramme standard
Rsultats : Principe de la lecture d'un antibiogramme Gnralisation des rsultats des antibiotiques non tests o Choix des antibiotiques tests repose identification du germe connaissance de sa rsistance naturelle site de l'infection o Connaissance des familles d'antibiotiques et des mcanismes de rsistance croise permet de ne faire figurer dans l'antibiogramme qu'un nombre restreint de molcules reprsentatives.
L'ANTIBIOGRAMME
Autres techniques de lantibiogramme
se raliser en milieu liquide en testant la sensibilit de la souche bactrienne vis--vis des concentrations critiques suprieures et infrieures des diffrents antibiotiques ou uniquement vis--vis des concentrations critiques infrieures.
L'ANTIBIOGRAMME
Autres techniques de lantibiogramme
la mthode de rfrence est difficilement utilisable en pratique quotidienne. La commercialisation d'une technique rapide et simple, le Etest (AB Biodisk), permet un laboratoire de diagnostic de mesurer la CMI.
L'ANTIBIOGRAMME
Autres techniques de lantibiogramme
L'ANTIBIOGRAMME
Limites de lantibiogramme
L'ANTIBIOGRAMME
Limites de lantibiogramme
L'ANTIBIOGRAMME
Limites de lantibiogramme
L'ANTIBIOGRAMME
Limites de lantibiogramme
L'ANTIBIOGRAMME
Limites de lantibiogramme
L'ANTIBIOGRAMME
Limites de lantibiogramme
L'ANTIBIOGRAMME
Limites de lantibiogramme
L'ANTIBIOGRAMME
Limites de lantibiogramme
L'ANTIBIOGRAMME
Limites de lantibiogramme
L'ANTIBIOGRAMME
Association dantibiotiques
Synergies ou antagonismes :
o o
L'ANTIBIOGRAMME
Association dantibiotiques
L'ANTIBIOGRAMME
Association dantibiotiques
bactricides peut produire un effet synergique Association de deux antibiotiques bactriostatiques donne gnralement un effet additif Association dun antibiotique bactricide et dun antibiotique bactriostatique peut donner un effet antagoniste.
L'ANTIBIOGRAMME
Association dantibiotiques
L'ANTIBIOGRAMME
Association dantibiotiques
L'ANTIBIOGRAMME
Association dantibiotiques
L'ANTIBIOGRAMME
Association dantibiotiques
L'ANTIBIOGRAMME
Association dantibiotiques
L'ANTIBIOGRAMME
Association dantibiotiques
Les associations trimthoprimesulfamide sont synergiques alors que ces deux antibiotiques sont bactriostatiques.
L'ANTIBIOGRAMME
Association dantibiotiques
Les associations macrolidechloramphnicol ou macrolidelincosamide ou macrolide-macrolide sont antagonistes alors que tous ces antibiotiques sont bactriostatiques.
Mthode acidimtrique Acidification : production d'acide pnicilloque ou cphalosporoque Dtection : changement coloration indicateur de pH (rouge de phnol ou pourpre de bromocrsol) Bandelettes ou des disques imprgns de pnicilline G ou de cphalosporine et d'un indicateur de pH
Mthode iodomtrique Acide pnicilloque rduit iode Dtection : dcoloration mlange iode - amidon.
Mthode chromognique Cphalosporine change de coloration aprs hydrolyse Dtection : nitrocfine, aprs action d'une bta-lactamase vire du jaune au rouge (disques de papier imprgns de nitrocfine)
preuves de bactricidie
o
Bactricidie : concentration minimale bactricide (CMB) CMB = plus faible concentration d'antibiotique capable de dtruire 99,99% d'un inoculum bactrien 99,99 % = choix arbitraire
milieu liquide (technique de macrodilution ou de microdilution) : o Milieu glos dpourvu d'antibiotique o Quantit dfinie de tous les tubes ne prsentant pas de croissance visible o Dnombrement bactries survivantes o Comparaison avec tube tmoin sans antibiotique
facteurs o Facteurs biologiques : Bactries persistantes : Les bactries persistantes, bactries en phase stationnaire ou en phase de multiplication lente, chappent l'action des antibiotiques actifs sur la biosynthse du peptidoglycane.
dpendent de 2 facteurs : o Facteurs biologiques : Bactries tolrantes chappent action ltale antibiotique alors que la croissance est inhibe et que la CMI n'est pas modifie. La tolrance : rapport CMB / CMI gal ou suprieur 32.
Srum (ou tout autre liquide organique) d'un malade recevant une antibiothrapie : pouvoir bactriostatique ou bactricide sur la souche responsable de l'infection Dilution maximale du srum capable d'inhiber la croissance du germe aprs 18 heures d'incubation= activit bactriostatique.
Dtermination pouvoirs
bactriostatique et bactricide du srum = examen de laboratoire permettant d'affirmer traitement correct
soit 45 60 minutes aprs une injection intramusculaire, 15 minutes aprs une injection intraveineuse, 90 minutes aprs une administration orale (ces temps ont t dfinis pour l'espce humaine)
bactriostatique et bactricide du srum Deux prlvements de srum sont ncessaires. o Second prlvement : au plus bas des concentrations sriques (valles) = juste avant une nouvelle administration d'antibiotique.
Conclusion
de validit ne doivent pas faire conclure l'inutilit de l'antibiogramme Les laboratoires doivent rendre, le plus rapidement possible, des rsultats plus explicites et plus slectifs (slectionner les antibiotiques utilisables sur le terrain, ne pas rendre des rsultats non adapts au cas clinique...)
Conclusion
Les cliniciens doivent interprter les rsultats Une indication de rsistance, doit inciter ne pas utiliser l'antibiotique Mais une indication de sensibilit doit
conduire une rflexion : l'antibiotique actif in vitro a-t-il une chance d'tre efficace in vivo compte tenu du contexte clinique ? L'antibiogramme n'est qu'un des lments permettant d'instaurer une antibiothrapie D'autres considrations cliniques, pharmacologiques, toxicologiques, financires... participent au choix du traitement.
Conclusion
A l'occasion de l'analyse
bactriologique, un dialogue doit s'instaurer entre le praticien et le responsable du laboratoire Trop souvent, l'un ou l'autre des deux participants attribue son interlocuteur des connaissances qu'il n'a pas obligatoirement
sp. l'exception de Streptococcus pneumoniae ) o Diamtre suprieur ou gal 14 mm pour la streptomycine ou la kanamycine, diamtre suprieur ou gal 17 mm pour la gentamicine : synergie possible avec les pnicillines en cas de sensibilit ces antibiotiques. o Diamtre infrieur 12 mm pour la streptomycine : la streptomycine ne peut tre utilise.
Les rsultats gentamicine sensible, tobramycine sensible et ntilmicine sensible doivent tre interprts comme intermdiaires (rsistance naturelle).
Ampicilline (Entrobactries)
Interprtation valable pour la Bacampicilline, la Mtampicilline et la Pivampicilline. Amoxycilline + acide clavulanique o L'observation d'un phnotype amoxicilline sensible et amoxycilline + acide clavulanique rsistant rvle une mauvaise conservation des disques d'antibiotique.
o
Ampicilline (Entrocoques)
o
La sensibilit des entrocoques aux pnicillines est apprcie l'aide d'un disque d'ampicilline charg 10 g. Pour Enterococcus faecalis, l'interprtation est valable pour la pnicilline G, l'amoxicilline, la pipracilline et l'imipnme. Le traitement des infections svres dues des souches de Enterococcus sp. ampicilline S/I ncessite des doses leves d'une pnicilline associe un aminoglycoside pour obtenir une activit bactricide.
Cfalotine (Entrobactries)
o
Clindamycine (anarobies)
o
La lecture doit tre effectue aprs 48 heures d'incubation car aprs 24 heures d'incubation les souches peuvent apparatre faussement sensibles.
Colistine
Rponse valable pour les autres polymyxines. Colistine (Proteus sp., Providencia sp., Serratia sp.) o Phnotype colistine sensible improbable : vrifier identification et antibiogramme
o
rythromycine (Entrocoques,
Staphylocoques, Streptocoques) o Rponse valable pour azithromycine, clarithromycine
Gentamicine (Staphylocoques)
o o
Interprtation valable pour la ntilmicine. Souches rsistantes la gentamicine = rsistantes l'ensemble des aminoglycosides sauf streptomycine
Kanamycine (Entrobactries)
Rponse valable pour la nomycine, la framyctine et la paromomycine. Kanamycine (Staphylocoques) o Interprtation valable pour la nomycine, la framyctine, la paromomycine, l'amikacine et l'ispamicine.
o
Mtronidazole (anarobies)
o
Rponse valable pour l'ornidazole. Certaines souches apparaissent faussement rsistantes si l'anarobiose n'est pas correcte.
Oxacilline (Staphylocoques)
o
Les souches rsistantes l'oxacilline (rsistance homogne ou rsistance htrogne) = rsistantes toutes les pnicillines (associes ou non un inhibiteur des btalactamases), cphalosporines carbapnmes, mme s'il existe une sensibilit apparente in vitro.
Oxacilline (Staphylocoques)
o
Les souches pnicillines rsistantes oxacilline sensibles sont sensibles aux associations pnicilline inhibiteur de bta-lactamase, aux cphalosporines et aux carbapnmes. Il n'est pas utile de tester ces molcules en routine.
Oxacilline (Staphylocoques)
o
Le test doit tre effectu dans des conditions permettant la dtection de la rsistance htrogne : milieu de Mueller-Hinton hypersal incub 37 C ou milieu de Mueller-Hinton incub 30 C. La rsistance htrogne se traduit par la prsence de microcolonies dans la zone d'inhibition.
Pnicilline G (Staphylocoques)
o
Rsistance la pnicilline G par production de pnicillinase : grosses colonies en bordure de la zone d'inhibition et ventuelle prsence de colonies "squatters" dans la zone d'inhibition
Pnicilline G (Staphylocoques)
o
Rponse "rsistant" est valable pour la pnicilline G et pour les autres pnicillines sensibles aux pnicillinases pnicilline V, aminopnicillines, carboxypnicillines, uridopnicillines
Pnicilline G (Staphylocoques)
o
Seule la pnicilline G doit tre teste Si diamtre correspond une souche sensible, absence de production de pnicillinase devrait tre recherche.
Ttracycline (Entrobactries,
Entrocoques, Pseudomonas aeruginosa, Staphylocoques, Streptocoques) o Rponse valable pour oxyttracycline et doxycycline.
Phnotype ttracycline sensible et minocycline rsistant = improbable donc vrifier identification et antibiogramme
Trimthoprime-sulfamthoxazole
o