UNIVERSITÉ D. devoir2.ENS - Pentose.phos
UNIVERSITÉ D. devoir2.ENS - Pentose.phos
UNIVERSITÉ D. devoir2.ENS - Pentose.phos
NOM : THOMAS
PRENOM : Robens
NIVEAU : L2, Chimie
SECTION : Sciences Naturelles/ Chimie
CHARGE DE COURS : Junior ANTOINE
SUJET :
- Beta oxydation
- Cycles des pentoses phosphates
- Glycogenese
- Glycogenolyse
- Neoglycogenese
L'un des buts du métabolisme des lipides (voir schéma) est de produire l'énergie par béta oxydation des
acides gras provenant de la lipolyse des lipides ou de la nourriture.
La béta oxydation des acides gras et sa régulation peuvent être résumées par le schéma suivant:
Le catabolisme des acides gras a été élucidé par des expériences de marquage d'éléménts. Ainsi Lynen a
découvert le mécanisme du catabolisme des acides gras dit 'béta oxydation' qui consiste à la scission
deux par deux atomes de carbone d'un acide gras en commençant par la partie carboxyle.
Le catabolisme des acides gras se déroule dans les mitochondries(contrairement à leur biosynthèse, se
déroulant dans le cytoplasme). Leur transport du cytoplasme s'effectue sous forme combinée (comme
ester de carnitine, par exemple).
Après leur libération par lipolyse dans le cytoplasme, Le catabolisme des acides gras est réalisé dans les
mitochondries, sur leurs formes métaboliques actives, les acyl-coenzyme A. L'activation des acides gras
se déroule en deux phases; 1/ Formation des acyls CoA et 2/ Transfert des acyls CoA du cytoplasme vers
la matrice de la mitochondrie.
- Formation de l'Acyl-CoA: catalysée par une thiokinase, l'acyl-CoA synthétase au niveau de la membrane
mitochondriale externe.
R-COOH + ATP + HSCoA <----> R-CO-SCoA + AMP + PP (enzyme: thiokinase)
L'activation est effectuée dans la membrane mitochondriale externe. Leur dégradation (oxydation) se
déroule dans la matrice mitochondriale (voir schéma).
Les acyls CoA à chaîne courte pénétrent facilement dans la matrice mitochondriale. La membrane
mitochondriale interne est imperméable aux acyls Co à chaînes longues (12 C-18C). Les groupements
acyls traversent cette membrane sous forme d'acyl-carnitine.
Dans la matrice, la scission d'un chaînon dicarboné à partir de l'extrémité carboxylique de l'acyl CoA est
réalisée en 4 étapes: 1/ Déshydrogénation des carbones alpha et béta (oxydation par FAD), 2/ Addition
d'une molécule d'eau (hydratation), 3/ Deuxième déshydrogénation (oxydation par NAD) et 4/ Thiolyse
(coupure par CoA). Cette dernière conduit à un acyl CoA à (n-2) carbones et libération d'un acétyl-CoA..
Remarque: les étapes 1, 2 et 3 sont très similaires à celles du cycle de Krebs allant du succinate à
l'oxaloacétate (Succinate -> Fumarate -> Malate -> Oxaloacétate).
Les acétyl-CoA produits par l'oxydation des acides gras entrent dans le cycle de Krebs. Les FADH2 et les
NADH produits sont oxydés par la chaîne mitochondriale de transport des électrons pour permettre la
production d'ATP.
3/ Hélice de Lynen
Chaque tour de spire de l'hélice conduit à la perte d'un acétyl-CoA et de 4 atomes d'hydrogène.
Bilan énergétique: (14 + 21 + 96) - 2 = 129 ATP libérées par oxydation d'une molécule d'acide palmitique.
* L'oxydation d'une molécule d'acétyl-CoA par le cycle de Krebs donne 1 ATP + 3 NADH + 1 FADH2.
LA VOIE DES PENTOSES PHOSPHATES
La voie des pentoses phosphates (VPP) (voie du phosphogluconate) ou Shunt des hexoses mono
phosphate ( voie de FRANK DICKENS et BERNARD HORECKER) est une autre voie métabolique du glucose
dont le substrat est le glucose 6 phosphate (G6P). Contrairement à la glycolyse, cette voie ne produit ni
ATP ni NADH mais permet de générer du :
Il y a une différence très importante entre le NADPH et le NADH. Sur le plan chimique c'est un
groupement phosphate supplémentaire sur l'OH porté par le carbone 2 de l'adénosine.
Par contre le NADH est oxydé par la chaine respiratoire et a pour but de former de l'ATP, le NADPH lui va
servir de donneur d'électron pour un certain nombre de réactions de biosynthèse réductrices .
La VPP est ubiquitaire de localisation cytoplasmique. Elle se déroule au niveau de toutes les cellules
aboutissant à la formation du NADPH2 et des pentoses phosphates.
Elle est particulièrement active dans les globules rouges où elle est surtout utile pour la fabrication du
NADPH. Ce dernier permet la réduction du glutathion oxydé : un tri peptide ayant un rôle antioxydant .
Elle est également très active au niveau des tissus où la biosynthèse des lipides est importante à l’instar
des glandes mammaires au cours de la lactation, la corticosurrénale et le foie. En effet, dans ces tissus le
NADPH est indispensable pour la synthèse des acides gras , le cholestérol , les hormones stéroïdes et les
sels biliaires.
En revanche, elle est très faible dans le muscle: le glucose est réservé à la production d’énergie.
Cette phase comporte trois réactions durant lesquelles, le G6P est transformé en ribulose 5-phosphate
avec production de deux NADPH et d'un CO2.
Une partie non oxydative comportant des réactions réversibles d'interconversion des
pentoses phosphates : réactions d'isomérisation et d'épimérisation (réactions 4 et 5).
Une partie non oxydative comportant des réactions de transcétolisation et de
transaldolisation (réactions 6, 7 et 8).
a) Réaction 4: Isomérisation (fig4)
Réaction réversible catalysée par une phosphopentose isomérase, la ribose-5-phosphate
isomérase transformant le ribulose 5-phosphate en ribose 5-phosphate.
b) Réaction 5 : Épimérisation (fig5)
Le segment non oxydatif se poursuit par une série de trois réactions de transcétolisation et
de transaldolisation conduisant au glycéraldéhyde 3-phosphate et au fructose-6-phosphate,
intermédiaires de la glycolyse (fig 3). La transcétolisation (réactions 6 et 8) correspond au
transfert d'un groupement à deuxcarbones grâce à l'interventions des transcétolases et la
transaldolisation (réaction 7), au transfert d'un groupement à trois carbones grâce à
l'interventions des transaldolases toujours d'un cétose sur un aldose.
c) Réaction 6 (fig 6)
Une transcétolase catalyse le transfert d’une unité dicarbonée du xylulose5-P sur le ribose5-P pour
former une molécule de glyceraldéhyde-3-P (GA3P) et une molécule de sédoheptulose-7-P (Su7P).
d) Réaction 7 (fig7)
Une transaldolase catalyse le transfert d’une unité à trois carbone du Su7P sur le GA3P pour former une
molécule de fructose-6-P (F6P) inter convertible en glucose-6-phosphate et une molécule d’ erythrose-4-
P.
e) Réaction 8 (fig8)
Une transcétolase catalyse le transfert d’une unité dicarbonée du xylulose5-P sur l'Erythrose 4-P pour
former une molécule de F6P inter convertible en G6P et une molécule de GA3P
III. LE BILAN DES INTERCONVERSIONS (fig9)
▪ Le G6P est à la fois le substrat de la voie des pentoses phosphates et de la glycolyse ; le choix relatif
entre ces deux voies dépend des exigences cellulaires ponctuelles en énergie métabolique (ATP) et en
précurseurs biosynthétiques (NADPH et ribose 5-phosphate).
▪ Alors que la glycolyse est ralentie lorsque la charge énergétique est élevée, la glucose 6-phosphate
déshydrogénase est inhibée par une concentration élevée de NADPH et par les intermédiaires de la
biosynthèse des acides gras.
LA GLYCOGENESE
La glycogenèse est le processus de synthèse du glycogène , dans lequel des molécules de glucose sont
ajoutées aux chaînes de glycogène pour le stockage. Ce processus est activé pendant les périodes de
repos suivant le cycle de Cori , dans le foie , et également activé par l' insuline en réponse à des niveaux
élevés de glucose .
L'une des principales formes de contrôle est la phosphorylation variée de la glycogène synthase et de la
glycogène phosphorylase. Ceci est régulé par des enzymes sous le contrôle de l'activité hormonale, elle-
même régulée par de nombreux facteurs. En tant que tel, il existe de nombreux effecteurs possibles par
rapport aux systèmes de régulation allostériques.
La glycogène phosphorylase est convertie de sa forme "b" moins active en une forme "a" active par
l'enzyme phosphorylase kinase. Cette dernière enzyme est elle-même activée par la protéine kinase A et
désactivée par la phosphoprotéine phosphatase-1.
La protéine kinase A elle-même est activée par l' hormone adrénaline. L'épinéphrine se lie à une
protéine réceptrice qui active l'adénylate cyclase. Cette dernière enzyme provoque la formation d' AMP
cyclique à partir d' ATP ; deux molécules d' AMP cyclique se lient à la sous-unité régulatrice de la
protéine kinase A, ce qui l'active permettant à la sous-unité catalytique de la protéine kinase A de se
dissocier de l'assemblage et de phosphoryler d'autres protéines.
Pour en revenir à la glycogène phosphorylase, la forme "b" moins active peut elle-même être activée
sans le changement de conformation. Le 5'AMP agit comme un activateur allostérique, tandis que l'ATP
est un inhibiteur, comme on l'a déjà vu avec le contrôle de la phosphofructokinase , aidant à modifier le
taux de flux en réponse à la demande d'énergie.
L'épinéphrine active non seulement la glycogène phosphorylase, mais inhibe également la glycogène
synthase. Cela amplifie l'effet d'activation de la glycogène phosphorylase. Cette inhibition est obtenue
par un mécanisme similaire, car la protéine kinase A agit pour phosphoryler l'enzyme, ce qui réduit son
activité. C'est ce qu'on appelle le contrôle réciproque coordonné. Se référer à la glycolyse pour plus
d'informations sur la régulation de la glycogénèse.
La glycogenèse
LA GLYCOGENOLYSE
La glycogénolyse est une phase catabolique qui consiste à produire du glucose à partir du glycogène
lorsque l’organisme est en besoin énergétique ou en besoin de glucose.
• L’enzyme clé de cette voie est, le produit final est le glucose6P dans le muscle ou le glucose dans le
foie
La glycogène phosphorylase s’arrête de cliver les liaisons a-1,4 lorsqu’elle atteint un résidu terminal
situé à 4 résidus de la ramification.
• La structure résiduelle est appelée dextrine limite, résistant à l’action plus poussée de la
phosphorylase
1. Transférase : dès qu’une chaine branchée est suffisamment raccourcie elle transfert les 3
résidus glycosyls restants sur la chaine principale
2. Amylo α1-6 glucosidase: détache le résidu restant du point de branchement.
Isomérisation du glucose1P
Hydrolyse du glucose6P
La liaison ester phosphate du G6P est hydrolysée par la G6-phosphatase.
(n’existe pratiquement que dans les cellules hépatiques).
Le glucose libre formé peut alors sortir de l’hépatocyte et passer dans le sang.
BILAN DE LA GLYCOGENOLYSE
LA NEOGLUCOGENESE
DEFINITION
C’est la formation de sucres nouveaux (surtout glucides) à partir de molécules non glucidiques
(90% dans le foie). Toujours active. Lactate musculaire est le principal précurseur de la
néoglucogénèse.
INTERET
Glucose est une source d’énergie indispensables aux tissus glucodépendants (neurones,GR, …)
et comme précurseurs de certaines molécules biologiques.
BESOINS EN GLUCOSE
Couverts par 3 voies : alimentation, glycogénolyse hépatique, et la néoglucogénèse.
LES REACTIONS ENZYMATIQUES DE LA NEOGLUCOGENESE
Elle utilise le sens inverse des réactions de la glycolyse (du pyruvate au glucose), sauf pour les 3
Réactions irréversibles
Réaction 1 : glucokinase (réaction 1 de la glycolyse)
Réaction 2 :Phosphofructokinase (réaction 3 de la glycolyse)
Réaction 3 : pyruvate kinase (réaction 10 de la glycolyse) donc il faut contourner ces voies
3 portes d’entrée pour la néoglucogénèse :
- pyruvate (alanine, lactate , AA glucoformateurs)
- phosphoénolpyruvate (AA glucoformateurs)
- DHAP : (glycérol)
LES DEVIATIONS DE LA NEOGLUCOGENESE
1. DE PYRUVATE A PHOSPHOENOL PYRUVATE
Carboxylation du pyruvate (C3) en Oxalo�acétate = AOA (C4).Consommation d’1 ATP.
Comme il faut 2 pyruvate pour former 1 Glucose donc : (2 x 3 ATP) = 6 ATP consommés.
Comme la glycolyse produit 2 ATP donc le bilan global de la néoglucogénèse est de 4 ATP Consommées.
Possible un peu grâce à pyruvate→ lactate mais surtout méthhémoglobine (Fe3+)→ hemoglobine (Fe2+)
Surtout lors de régime hypoprotéique ou de diabète sucré, transamination de l’Alanine en pyruvate (enz
: ALanine amino Transférase = ALAT) ; l’alanine rejoint le foie ou elle est converti en pyruvate (cycle de
FELIG)
Le glycérol provient de l’hydrolyse des triglycérides (TG). Dans le foie et le rein, la glycérol kinase le
transforme en glycérol-3-Phosphate puis ensuite en DHAP et rejoindre enfin la néoglucogénèse.
1er SITE : 1- Pyruvate Acétyl CoA (pyruvate deshydroogénase) vers le cycle de KREBS
L’activité de la pyruvate déshydrogénase est inhibée par : Acétyl CoA, NADH + H+, ATP
La Fructose 1,6 biphosphatase est activée par le citrate et l’ATP (donc il faut stocker du glucose) et est
inhibée par le taux de Fructose 2,6 phosphate
BIBLIOGRAPHIE :
https://www.takween.com/metabolisme/acides-gras-beta-oxydation.html#google_vignette
https://www.youtube.com/watch?v=WX8sLclDyvw
https://www.clinisciences.com/lire/beta-oxydation-1145.html
https://facmed-univ-oran.dz/ressources/fichiers_produits/fichier_produit_2052.pdf
https://hmn.wiki/fr/Glycogenesis#google_vignette