Les biomarqueurs, outils de reconstitution des

conditions de dépôt dans des systèmes endoréiques (Les

sebkhas de Moknine et Mahdia) et de traçage de la
pollution (Les embouchures du golfe de Tunis).
Raja Chairi

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Raja Chairi. Les biomarqueurs, outils de reconstitution des conditions de dépôt dans des systèmes
endoréiques (Les sebkhas de Moknine et Mahdia) et de traçage de la pollution (Les embouchures du
golfe de Tunis).. Sciences de la Terre. Université de Tunis El Manar, 2021. �tel-03208274�

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 Université Tunis el Manar
Faculté des Sciences
Mathématiques, Physiques et Naturelles de Tunis

Habilitation
Universitaire

En Géologie
présentée par Dr. Raja CHAIRI
Maître Assistante
CERTE. Laboratoire de Géoressources

Rapport de synthèse

Titre: Les biomarqueurs, outils de reconstitution des

conditions de dépôt dans des systèmes endoréiques
(Les sebkhas de Moknine et Mahdia) et de traçage de la
pollution (Les embouchures du golfe de Tunis).

Soutenue le 09 janvier 2021 devant le jury composé de :

GUEDDARI Moncef Professeur FST Univ. Tunis el Manar Président
MEDHIOUB Mounir Professeur FSS Univ. Sfax Rapporteur
Cedria Smartek Rapporteur
MLAYAH Ammar Maître de conférences CERTE
Univ. Carthage
SOUSSI Mohamed Professeur FST Univ. Tunis el Manar Examinateur
MABROUK El ASMI Amina Maître de conférences FST Univ .Tunis el Manar Examinatrice

Année Universitaire 2020-2021

 Table des matières
Remerciements
Note au lecteur
Préambule 1
1. Parcours 1
2. Évolution et maturité 2
3. Présentation du projet de recherche 2
4. Cadre des travaux 2
5. Problématique et objectfis 5
6. Plan de la synthèse 7
Théme 1 : les biomarqueurs outil de reconstitution des conditions de dépôt
I- Archives sédimentaires 9
Zones humides et Convention Ramsar 9
I.1- Les sebkhas 9
1. Notion de sebkha 9
2. Formation des sebkhas du Sahel 10
3. Géographie et Géologie de la zone Moknine-Mahdia 11
4. Étude des systèmes côtiers de la Tunisie 13
4.1. A la recherche d’un indice marin 15
4.2. Immersions sur le terrain et échantillonnages 15
4.3. Le proxy sédimentaire, techniques d’analyse 16
5. Origine et mise en place des sédiments de la sebkha de Moknine 17
5.1. Faciès carbonaté 19
5.2. Faciès organique 20
5.3. Evolution de la sebkha de Moknine 21
6. Géomorphologie, dynamique et évolution des systèmes conjugués de Mahdia 22
6.1. Distribution des sédiments dans le temps 23
6.2. Dynamique de l’environnement sédimentaire 24
6.3. Origine des sédiments 25
7. Datation des dépôts des bassins évaporatoires étudiés 26
8. Climat des écosystèmes du Sahel 28
I.2. Les embouchures du golfe de Tunis 30
1. Les apports détritiques 32
2. Les apports organiques 33
II- Les biomarqueurs indicateurs pour retracer l’histoire 36
1. Interface eau/sédiment 36
1. Extraction des lipides simple et complexe 37
2. Des biolipides en géolipides : indicateurs pour retracer l’histoire 38
3. Domaine d’applications des biomarqueurs moléculaires 40
3.1. Etude des lipides simples 42
 3.2. Les conditions paléo-environnementales à travers les biomarqueurs 43
3.3. Les n-alcanes dans les systèmes hypersalins du Sahel 43
3.4. Les n-alcanes dans les embouchures du golfe de Tunis 55
3.5. Isoprénoïdes 56
3.6. Composés non résolus : UCM 57
4. Reconstitution paléoclimatique au moyen des n-alcanes 58
5. Triterpanes 62
5.1. Triterpènes pentacyclique : Hopanes 62
5.2. Les stéranes 67
5.3. Terpanes tricycliques 68
Thème 2 : Les biomarqueurs indicateurs de traçage de la pollution
I. Alkylbenzènes 72
1. Les alkylbenzènes dans la sebkha de Moknine 73
2. Origine des alkylbenzènes 75
3. Les isoprényl alkylbenzènes 76
4. Conditions environnementales 77
II. Les HydrocarburesAromatiques Polycycliques 78
1. HAP dans les embouchures du golfe de Tunis 79
2. Lien entre la matière organique et les micropolluants organiques dans les sédiments de
l’embouchure de l’oued Méliane 80
2.1. Fraction aromatique et les POP’s 80
2.2. Distinction des sources pétrogéniques et pyrolytiques 81
Conclusion Générale 83
Perspectives 87
Références Bibliographiques 89
 Liste des figures
Figure 1. Evolution de la matière organique au cours des cycles biologique et géologique du carbone p.3
(d'aprèsTegelaar 1989 in Jeanneau 2007)
Figure 2. Impact de l'anthropisation du cycle de carbone sur les enveloppes superficielles (D'après p.7
Jeanneau 2007).
Figure I.1. Site d'étude : les sebkhas de la zone Moknine-Mahdia (Moknine, Gotaia et Eliane). p.12
(Extrait de la carte topographique Moknine 1/250 000).
Figure I.2.Carte de la géologie de la zone Moknine-Mahdia (Extrait de la carte géologique de la Tunisie p.13
1/500000 d’après Ben Haj Ali et al., 1985)
Figure I.3. Carte de la géomorphologie de la zone Moknine-Mahdia (Chairi, 2009). p.15
Figure I.4. Zones humides étudiées p.14
Figure I.5. Localisation des carottes dans la sebkha Moknine (Chairi, 2005). p.15
Figure I.6. Distribution latérale des faciès dans la sebkha Moknine (D’après Chairi 2004, 2005). p.20
Figure I.7. Diagramme IH/Tmax. (I: origine algaire, II: Origine marine, III: origine terrestre, Chairi, 2005) p.21
Figure I.8. Modèle d'évolution du système évaporatoire de Moknine (Chairi, 2005). p.23
Figure I.9. Points d'échantillonnage dans les sebkhas de Mahdia (Chairi et Abdeljaoued ,2019). p.24
(Gotaia et Eliane) et les oueds (Rejelchiba et Chiba).
Figure I.10. Diffractogramme des RX des minéraux non argileux d’un sédiment brut (E1). p.26
(Systèmes conjugués de Mahdia, Chairi, 2010).
Figure I.11. Points d'échantillonnage dans les embouchures du Golfe de Tunis. (Extrait de la carte p.32
topographique 1/250 000 Tunis)
Figure I.12. Courbes cumulatives (Golfe de Tunis, Mahmoud, 2018). p.34
Figure I.13. Variations des composés potentiels (S2) et oxygénés (S3) en fonction du COT (Mahmoud, p.36
2018).
Figure II.1. Représentation schématique de la répartition des marqueurs moléculaires. (D’après Jeanneau, p.42
2007)
Figure II.2. Localisation des carottes dans le système évaporatoire de Moknine (Chairi et al., 2010). p.46
Figure II.3. Sédimentologie et distribution des n-alcanes dans les faciès sableux (A) p.48
sableux / limoneux (B) et limoneux /argileux (C) de la carotte SM16. (Chairi et al., 2010).
Figure II.4. Sédimentologie et distribution des n-alcanes dans les sédiments de surface (A) et les sédiments p.51
profonds (B) du profil SM12, (Chairi et al., 2010).
Figure II.5. Sédimentologie et distribution des n-alcanes dans les sédiments de surface (A), p.52
les sédiments profonds (B) du profil SM9 et du tapis de cyanobactérie (Chairi et al., 2010).
Figure II.6. Sédimentologie et distribution des n-alcanes dans le tapis de cyanobactéries (A) p.53
et dans les faciès limoneux / argileux (B) et limoneux / sableux (C) du profil SM8 (Chairi et al., 2010).
Figure II.7. Sédimentologie et distribution des n-alcanes dans le tapis de cyanobactéries (A) et dans les p.55
faciès limono-sableux (B) et sablo-limoneux (C) du profil SM11 (Chairi et al.,2010).
Figure II.8. Chromatogrammes des n-alcanes des sédiments aux embouchures des oueds El Bey et Abid p.57
(Mahmoud, 2018).
Figure II.9. Chromatogrammes des hydrocarbures aliphatiques des sections des carottes SM8 et SM11 et p.59
du tapis de cyanobactéries (Chairi et al., 2010).
Figure II.10. Transformation des hopanes dans les sédiments (Peters et Moldowan, 1993) p.64
Figure II.11. Principaux squelettes des triterpènes pentacycliques utilisés en tant que biomarqueurs (Peters p.65
et Moldowan, 1993).
Figure II.12. Structures des hopanoïds, cholestérol et squalène (Peters et Moldowan, 1993). p.67
Figure II.13. Structure d’un stérane et son précurseur biologique (Baudin, 2020). p.68
Figure II.14. Structure des terpanes tricycliques d’après Peters et Moldowan, 1993. p.70
Figure II. 15. chromatogramme des terpanestricycliques et hopanes (Chairi, 2018). p.71
Figure II.16. Fragmentogramme (ion 191) des triterpanes dans les embouchures de oued Méliane (Saidi, p.72
2019) et oued El Bey (Mahmoud, 2018).
Figure III.1. Fragmentogrammes (ion 91) des alkylbenzènes linéaires dans le secteur nord-ouest de la p.76
sebkha de Moknine (Chairi et al., 2010).
Figure III.2. Les isomères de l'alkylbenzène linéaire en C19 détectés dans les sédiments de la sebkha de p.78
Moknine (Chairi et al., 2010).
 Figure III.3. Représentation des 16 HAP prioritaires retenus par L’US-EPA. p.80
Figure III.4. Répartition des HAP par classes d'aromacité exprimée en % de la concentration totale en p.81
HAP dans les sédiments des embouchures méditerranéennes (golfe de Tunis ; Chairi et al., 2019a).
Figure III.5. Corrélation entre la somme des 16 HAP et la fraction aromatique (Chairi et al., 2019a). p.82

Liste des tableaux

Tableau 1 : Paramètres et index de la pyrolyse Rock Eval (Mahmoud, 2018). p.35
Tableau 2 : Paramètres et indices de la fraction organique des sédiments de surface de la sebkha p.62
Moknine. Organic carbon and hydrocarbon parameters in surface sediments from Mokninesebkha
(Chairi, 2018).

Liste des abréviations

ACL: the average chain length

CO: carbone organique ou COT: carbone organique total

CPI: carbonpreference index/indice de préférence au carbone

GC-MS/CG-SM: chromatographie en phase gazeuse couplée à la spectrométrie de masse

HAP: hydrocarbures aromatiques polycycliques

HBIs : highly Branched isoprenoids /les composés isoprénoïdiques hautement ramifiés

HMW: high molecular weight

IH: index d’hydrogène

LMW: low molecular weight

MIS: marine isotope stage

MMW : middel molecular weight

MOE: matière organique extractible

MON: matière organique naturelle

NAR: natural n-alkane ratio

POPs: polluants organiques persistants

RE: pyrolyse Rock-Eval

S1: hydrocarbures libres

S2: hydrocarbures potentiels

S3: composés oxygénés

Tmax : température maximale

TMD: terrigenous marine discriminant

 Remerciements
J’ai rencontré dans mon chemin de recherche des gens admirables. Ces quelques lignes sont
l’occasion de leur témoigner de mon respect et de mon affection.
Je voudrais commencer par remercier les Professeurs Mounir MEDHOUIB et Ammar MLAYAH
d’avoir accepté de rapporter mes travaux de recherche et de leur patience. Mes remerciements vont
également aux Professeurs : Moncef GUEDDARI, Mohamed SOUSSI et Amina MABROUK El Asmi
d’avoir participé au jury et évalué ce travail.
Je voudrais rendre hommage à ceux qui ont déclenché l’étincelle en m’orientant vers la géologie de
l’environnement et les milieux limniques mes Professeurs : Sassi Sassi, Moncef Gueddari et à ceux qui ont
attisé ma curiosité pour la géochimie organique et la sédimentologie : Pr. Habib Bélayouni et Pr. Saadi
Abdeljaoued. Durant quelques années, j’ai partagé cette formation avec mes amis : Rim Ben Hamouda,
Monia Bouhlel, Didier, Isabelle, Souhir Jabballah, Salah Zaouch, Fadhel, Najoua Bey…
Je n’oublierai jamais l’aide et le soutien de mes amis et collègues de la FST : Dr. Boutheina Farhat,
Dr. Salah Bouden, Dr. Zohra et Aslam Jallouli et Dr. Fathia Ayari et Dr. Samia Ferjani qu’ils trouvent ici
toute ma reconnaissance.
Je tiens également à profiter de cette occasion pour exprimer toute ma reconnaissance aux Pr.
Claude Largeau et Pr. Sylvie Derenne qui m’ont accueillie dans leur laboratoire et l’agence universitaire de
la francophonie, en m’offrant le cadre idéal pour réaliser dans de bonnes conditions une recherche de qualité.
Je remercie Joëlle Templier de m’avoir initié à la GC-MS, Isabelle Daniau, Nicolas et Odile Largeau pour
les moments agréables que nous avons passés ensemble et Georges Koepfler qui m’a fait connaître tous les
monuments de Paris.
Un grand merci aux ami(e)s et collègues du département de géologie de la FST : Pr. Aicha Sassi,
Pr. Ali Zair, Pr. Fadhila Darragi et Dr. Abdelaziz Sebei, ceux qui nous ont quitté : Pr. Tarek Echebel et Pr.
Tahar Boughattas ; du département des sciences de la terre de la FSS: Dr. Zaineb Gargouri, Dr. Leila Jribi,
Dr. Imen Megdiche, Pr. Mounir Medhioub et Pr. Chedly Abbas et du laboratoire de Géoressources du
CERTE : Dr. Samia Khadhar, Dr. Abir Marzougui, Dr. Faten Jarraya, Dr. Rihab Gallala, Dr.Ahlem Amri,
Dr.Sonia Gannouni, Dr. Hajer Azaiz, Drs. Samah et Fathi laacheal, Pr. Himden Ben Youssef, Pr. Mourad
Bedir, Pr. Hakim Gabtni et Pr Ammar Mlayah.
Je remercie vivement les responsables du master GRDD Pr. Fraj Chabani, Pr. Abdallah Ben
Mammou et Pr. Mohamed Ghanmi qui ont cru en moi et m’ont fait participer à la formation et l’encadrement
des étudiants en master.
Un grand merci également à Moncef Saidi Directeur d’exploration à l’ETAP et Anis Belhaj Amor
ingénieur à l’ETAP pour avoir accepté de collaborer dans les masters et à Lotfi lamti d’avoir eu la patience
de réaliser les cartes des sites d’étude et leurs bassins versants avec ArcGIS.
Je tiens à remercier l’équipe de Géoressources du Cedria Smartek pour leur aide en particulier
Chourouk Dachraoui, Rim Azibi pour la réalisation de la carte géologique, Moncef, Majid et Bilel.
Durant quelques années, j’ai aussi eu la chance d’apprendre de mes étudiants à travers les projets de fin
d’études et les masters, en espérant leur avoir, un peu, parfois, transmis la flamme.

Je tiens aussi à adresser mes remerciements à toute ma famille.

Je dédie ce travail à l’honneur de mon défunt père.

 Note au lecteur

Mon dossier d’Habilitation Universitaire se décompose en deux documents complémentaires.

Ce mémoire présente mes apports au domaine de recherche des biomarqueurs dans les zones
humides, les environnements évaporatoires (Sebkhas) et les embouchures. Il commence par un
synopsis présentant mon parcours ainsi que l’édification et la maturation du projet de recherche
traité.

Ce mémoire est accompagné de mon rapport d’activités depuis le début de ma carrière : curriculum
vitae, expériences professionnelles, activités pédagogiques et de recherche, missions
d’encadrement, d’évaluation et d’animation, projet de recherche et enfin mes publications classées
par catégories.
 Préambule

En résumé de ce document, je souhaite présenter mon parcours au travers des missions successives
que j’ai menées et au regard de la construction et de la maturation du projet de recherche que je
mène.

1. Parcours
Après avoir obtenu ma Maîtrise en Sciences Naturelles en 1994 de l’Université Tunis El Manar à
la Faculté des Sciences de Tunis (FST), j'ai entamé mes travaux de recherche au Département de
Géologie (FST) où j’ai étudié la Géologie Appliquée à l'Environnement en première année de DEA
et rejoindre l'équipe de Ressources Minérales et Environnement en deuxième année de DEA.

J'étais initiée à la recherche par les deux Professeurs H. Bélayouni pour la géochimie organique et
S. Abdeljaoued pour la sédimentologie au cours de la réalisation du mémoire de DEA que j'ai
obtenu avec la mention Très Bien en 1997. Ce mémoire était le début de l'étude de la matière
organique dans la sebkha de Moknine. C'est un système hypersalin très particulier car, il est un
assemblage de microsystèmes. Cette étude est approfondie par les travaux de ma thèse que j'ai
commencés en 1998 sous la direction du Professeur H. Bélayouni et qui étaient focalisés sur la
matière organique associée aux sédiments de surface et profond afin d'une reconstitution du
système de Moknine. Ces travaux m'ont permis de réussir avec succès mon Doctorat en Géologie
que j'ai obtenue en 2004 avec la mention très honorable.

En 2006 mon projet de recherche post doctoral était retenu et accordé par l'Agence Universitaire
de la Francophonie (AUF), grâce auquel j'ai travaillé avec l'équipe de Chimie Bio-organique et
Organique Physique sous la direction de C. Largeau et S. Derenne, les biomarqueurs dans les
systèmes hypersalins. J’étais la première candidate à réussir à obtenir ce stage postdoctoral en
Afrique du Nord.

En 2007 un deuxième stage avec la même équipe était subventionné par l’Institut Français de
Coopération (IFC) afin d’analyser les biomarqueurs dans le système conjugué de Mahdia.

1
 2. Évolution et maturité
Mes activités professionnelles ont débuté en 1992 en tant qu'enseignante au secondaire ensuite
comme expert avec des organisations internationales (OSS et CAR/ASP) puis en qualité de
chercheur avec l'Institut National de Recherche Scientifique de Tunis (INRST). En 2001 j'ai eu la
chance de commencer ma carrière d'enseignant-chercheur après avoir été choisie comme assistante
contractuelle à l'université de Tunis el Manar et être parmi le corps enseignant du département de
Géologie de la Faculté des Sciences de Tunis. Ce contrat m'a permis d'assurer l'enseignement des
travaux pratiques de la géochimie organique.

J’ai intégré le corps enseignant du département des Sciences de la terre à la Faculté des Sciences
de Sfax suite au concours d'assistanat en 2005 et je suis promue au grade de Maître assistant après
un concours interne en 2008.

En 2009, j'ai obtenu une permutation au Laboratoire de Géoressources du Centre de Recherche et

des Technologies des eaux de Borj Cedria où j'y suis actuellement. Ce parcours était interrompu
par une mise en disponibilité en 2011 pour des raisons familiales et ce durant cinq ans.

3. Présentation du projet de recherche

Le rapport des travaux de recherche présenté dans ce dossier est le bilan d'une série de travaux
réalisés sur les systèmes endoréiques (sebkhas) qui s'inscrivent dans la continuité des travaux de la
thèse et d’autres que j’ai développé au cours des missions d’encadrement sur les zones humides.

Ces travaux sont orientés préférentiellement sur la "géochimie organique des sebkhas", à
différentes échelles spatiales et temporelles en premier lieu et sur les zones humides d’une façon
générale en adoptant des techniques d’analyses plus performantes car les composants de la matière
organique sont complexes et difficiles à appréhender.

Ce projet englobe à la fois, des recherches fondamentales sur la dynamique sédimentaire organique
et détritique et des recherches appliquées, notamment à la gestion des évolutions de ces milieux et
des risques de pollution en se basant sur une caractérisation des biomarqueurs.

4. Cadre des travaux

Du fait de la qualité de leur enregistrement et de leur rôle de support direct des associations
végétales et des activités humaines, les sédiments constituent des archives naturelles

2
particulièrement adaptées aux études visant des reconstitutions paléo-environnementales, c’est ce
que j’ai réalisé dans mes travaux de thèse et que j’ai développé ensuite dans mes travaux de
recherche postdoctoral.

Les travaux que j’ai menés sur les archives sédimentaires des sebkhas, dans lesquels sont analysées,
les sources de sédiments organiques et détritiques ont autorisé un examen de ces sédiments et leur
répartition verticale et latérale. Cela m’a permis de dégager un modèle d'évolution de la sebkha de
Moknine. Cependant, cette évolution était limitée dans le temps à l'échelle actuelle au dernier
millénaire. Bien qu'aucun faciès organique ou détritique n'ait permis de diagnostiquer l'histoire de
ces systèmes au cours de l'Holocène, une hypothèse probable est que les systèmes du Sahel de la
Tunisie Moknine, Gotaia et Eliane sont des systèmes continentaux depuis le Pléistocène.

Figure1 . Evolution de la matière organique au cours des cycles biologique

et géologique du carbone (d'aprèsTegelaar 1989 in Jeanneau 2007).

La fraction organique analysée dans les différents systèmes de mes travaux de recherche n’est
qu’un assemblage de deux productions. Dans un bassin lacustre, elle rassemble une production
endogène correspondant à la matière organique naturelle (MON) produite à l’intérieur du bassin ;
et une production allogène provenant du bassin-versant par le biais de l’érosion (Fig. 1). Cette
fraction organique est un mélange de composés essentiellement formés par du carbone, de
l’hydrogène et d’autres éléments O, N et le S.

3
Au cours de mes travaux de thèse j’ai étudié la matière organique associée aux sédiments de la
sebkha de Moknine dans le but de la caractériser et décrypter cet assemblage de fraction biogène
et terrigène. La MON était étudiée par différentes techniques (pyrolyse rock eval, chromatographie
en phase gazeuse et coulométrie) qui fournissent d’une façon rapide, des informations sur le
contenu organique des sédiments, la nature, la sources et l’état de maturation de celle-ci.

Dans ces travaux, je me suis intéressée en partie aux lipides. Ce sont les composés organiques les
plus étudiés comparés aux composés humiques, humine et kérogène. Ces lipides ou hydrocarbures
sont dits, des constituants organiques sédimentaires d’origine autochtone, lorsqu’ils dérivent
d’organismes lacustres, soit directement, soit après être marqués par quelques transformations
diagénétiques durant leur sédimentation. Ils peuvent être aussi allochtone, provenant du bassin
versant par érosion, qu’ils soient dégradés par des micro-organismes des sols, voire même
provenant du remaniement d’anciens sédiments érodés sur le bassin (Cranwell, 1982 ; Di-Giovanni
et al., 2002 ; Graz et al., 2010, Pu et al, 2020). Les lipides peuvent être libres ou liés et sont
considérés comme des indicateurs d’origine d’après leur structure, leur abondance relative ou leur
composition isotopique (Arts et al., 2009, Alfonso et al., 2015, Arbi et al., 2018, Carizo et al.,
2019 ; Baudin, 2020). Ils sont moins sensibles à la dégradation microbienne que d’autres
composants de la matière organique (Meyers et Ishiwatari, 1993 ; Meyers et Teranes, 2002).
Cependant, dès leur intégration à la colonne d’eau, ils peuvent être soumis à des phénomènes de
diagenèse conduisant à la perte de nombreux composés surtout à chaînes courtes et dégradés. La
stabilité des lipides est variable selon la famille considérée, les lipides liés présentant une plus
grande stabilité que les lipides libres (Cranwell, 1981). La transformation des lipides d’origine
biologique ou "biolipides" conduit à la formation de "géolipides" (Eglinton, 1969).

Le type et la concentration des lipides varient en fonction de la fraction granulométrique concernée.

Ainsi, une décroissance de la taille des particules minérales est censée s’accompagner d’une perte
en variété et concentration, s’expliquant par une dégradation microbienne plus poussée résultant
d’un temps de sédimentation plus long des particules fines (Meyers et Ishiwatari, 1993).
Cependant, les argiles supportent relativement plus de n-alcanes et d’acides gras, du fait de leurs
fortes capacités d’adsorption (Meyers et Ishiwatari, 1993). Certains lipides sont résistants à long
terme à la dégradation, comme en témoigne par exemple l’existence de gisements pétroliers dont

4
la maturation s’effectue selon une échelle de temps géologique, ou la présence de biomarqueurs
dans des sédiments paléozoïques (Armstroff et al., 2006 ; Romero-Sarmiento et al., 2011).

5. Problématique et objectfis
Les reconstitutions environnementales au moyen des biomarqueurs est jusqu’à présent restreinte à
un témoignage de la participation des végétaux supérieurs à la matière organique sédimentaire.
Cependant, la diversité de ces composés dans les échantillons géologiques récents suggère la
possibilité d'établir un lien plus intime entre la molécule isolée du sédiment et l'organisme dont elle
est issue. Toutefois, il est resté difficile de définir des indicateurs précis de leurs sources, des
conditions environnementales, ou des processus dont ils témoignent.

Serait-il possible de répondre à cette question à travers l’étude des biomarqueurs dans des
matrices qui dérivent de deux zones humides d’hydrodynamisme différents (les systèmes
endoréiques du Sahel (Moknine-Mahdia) et les embouchures du golfe de Tunis) et de trouver des
indicateurs univoques afin de retracer l’histoire ou le « paléoenvironnement » ainsi que le lien
entre un géolipide et sa source (biolipide).

Pour y répondre, ma démarche était d’extraire la MO dans des matrices différentes de zones
humides et d’isoler les composés organiques qui contiennent suffisamment d'informations pour
être reliées à un taxon restreint de précurseurs biologiques et de retracer l’histoire à travers leur
origine. Parmi ces biomarqueurs, mes travaux postérieurs avec l’équipe de Chimie Bio-organique
et Organique Physique ont été appuyés sur les n-alcanes en premier lieu, les hopnaes, les stéranes,
les tricycliques terpanes et les alkylbenzènes en second lieu dans des systèmes évaporatoires.
L’objectif de ces travaux est de suivre les distributions des hydrocarbures aliphatiques dans les
sédiments récents, tester la façon dont les lipides sont conservés et améliorer la compréhension des
sources, du transport, de la préservation des biomarqueurs et des mécanismes de transformations
dans les zones humides ainsi que l’implication pour toutes les reconstructions paléo-
environnementales qui emploient des hydrocarbures de marqueurs aliphatiques.

Le deuxième objectif de mes travaux était de contempler l’interaction de la matière organique

naturelle et les polluants organiques dans les zones humides qui prennent une place centrale dans
la reconstitution paléogéographique et environnementale des côtes de la méditerranée en Tunisie.
La convention de Ramsar (traité international du 2 février 1971) fait preuve de l’intérêt de ces
zones et leur valeur économique, culturelle et scientifique et leurs dépôts sédimentaire représentent
5
une cible de choix pour l’étude des biomarqueurs lipidiques d’origine naturelle ou indicateurs de
la pollution.

Les archives sédimentaires sont affectées par les composantes naturelles (climat, végétation, relief
et lithologie) des processus d’érosion, transport et sédimentation. Néanmoins, une autre
composante s’ajoute ; c’est l’anthropisation. Les activités humaines intenses suite à
l’industrialisation ont singularisé une époque géologique de l’Holocène par l’impact prégnant de
celle-ci sur les processus géologiques d’où l’apparition de l’Anthropocène. L’Anthropocène
nouvelle époque géologique de l’Holocène est validée par la commission internationale de
stratigraphie (ICS) qui considère son début vers 1950. Au cours de cette nouvelle époque
géologique, les activités anthropiques ont progressivement exercé une influence croissante sur
l’environnement qui initialement n’était dominé que par des facteurs climatiques naturels. Celle-ci
s’est fortement renforcée depuis les révolutions agricole et industrielle de ces derniers siècles.
Aujourd’hui, la planète est profondément transformée et très largement influencée par les activités
humaines (Fig. 2).

Figure 2. Impact de l'anthropisation du cycle de carbone

sur les enveloppes superficielles (D'après Jeanneau 2007).

Les sédiments des zones humides se prêtent particulièrement bien à l’étude de cette évolution ainsi
que le milieu environnant.

6
6. Plan de la synthèse
1. Dans ce mémoire j’ai abordé deux thèmes sur les biomarqueurs en tenant compte de mes
activités scientifiques et des objectifs des projets réalisés. Dans le premier thème, il s’agit
des biomarqueurs comme outils de reconstitution paléo-environnementale. Ce dernier est
subdivisé en deux sections complémentaires (archive sédimentaire et biomarqueurs
indicateurs pour retracer l’histoire). Le deuxième thème abordera les biomarqueurs comme
traceurs de la pollution et de l’anthropisation (Intercation matière organique naturelle et
polluants organiques persistants) et sera présenté dans la troisième section.
La synthèse de ma démarche de recherche et les principaux résultats acquis en matière de
géochimie organique environnementale des zones humides seront articulés comme suit :
- Première section s’articule sur les travaux qui ont porté sur le proxy sédimentaire afin de
caractériser la matrice et les faciès qui rentrent dans sa constitution minérale et organique.
Dans cette partie j’aborderai l’archive sédimentaire dans les sebkhas et aux embouchures
des oueds. Pour retracer l’histoire du système, les phénomènes qu’un sédiment a pu subir,
le régime des apports, mettre en relation le faciès minéral et organique, tirer un modèle
d’évolution pour les bassins évaporatoires de la zone Moknine-Mahdia et comparer les
systèmes de cette zone aux autres sebkhas de la Tunisie pour tirer des conclusions sur la
datation des dépôts et le climat de la zone d’étude.

- Deuxième section concerne les biomarqueurs et leur application en géologie pour une
reconstitution paléoenvironnementale à partir des conclusions sur l’origine, les processus
de transformation et l’évolution de la matière organique. En premier lieu seront relatés les
n-alcanes et leurs apports en informations sur l'activité biologique passée et les processus
hydrologiques enregistrés. Ensuite, les hopanes qui à travers leur configuration (αβ)
permettront de livrer des indications sur le stade diagénétique et l’évolution de la MO.
Subséquemment, seront présentés les stéranes qui avec leur grande variété de structures,
sont les biomarqueurs, les plus appréciés, pour l’étude des environnements de dépôt. Enfin,
les tricycliques terpanes qui sont plus résistants à l’altération bactérienne et de bons
indicateurs d'origine algaire ou bactérienne.

- Troisième section contemplera l’étude menée sur les alkylbenzènes dans la sebkha de
Moknine et les hydrocarbures aromatiques polycycliques (HAP) suivis dans les deltas du

7
 golfe de Tunis afin de suivre l’anthropisation dans ces zones humides. Les alkylbenzènes,
très peu étudiés, très peu connus et généralement attribués à une anthropisation. Les
biomarqueurs HAP sont considérés comme polluants organiques dont 16 HAP sont pris
pour des polluants organiques persistants. Ces derniers sont considérés ainsi, car ils
vérifient quatre grandes propriétés(i) toxicité : l’exposition à ces substances peut avoir des
effets nocifs ; (ii) persistance : la dégradation des POPsest lente dans les différents milieux
; (iii) transport longue-distance : des concentrations non négligeables de ces polluants se
retrouvent très loin de leurs sources d’émissions ; et (iv) bioaccumulation : les POPs ont
tendance à s’accumuler tout au long de la chaîne alimentaire.

Enfin, je donnerai des éléments d’activités en phase d’exécution et quelques pistes de projet de
recherche pour l’avenir.

8
 Théme 1 : les biomarqueurs outil de reconstitution
des conditions de dépôt

I- Archives sédimentaires

Zones humides et Convention Ramsar

Il est à noter que les zones humides sont les seuls milieux à faire l’objet d’une convention
internationale, la convention de Ramsar. Elle est un traité intergouvernemental adopté le 02 Février
1971 dans la ville iranienne de RAMSAR, sur les bords de la mer Caspienne et entré en vigueur en
1975 (en Tunisie :24 mars 1981). Il s’agit du premier traité intergouvernemental mondial moderne
sur la conservation et l’utilisation rationnelle des ressources naturelles (F.A.O ,1971). Elle définit
les zones humides comme : « des étendues de marais, de fagnes, de tourbières ou d’eaux naturelles
ou artificielles, permanentes ou temporaires, où l’eau est stagnante ou courante, douce, saumâtre
ou salée, y compris des étendues d’eau marine dont la profondeur à marée basse n’excède pas six
mètres ».

I.1- Les sebkhas

1. Notion de sebkha
Mon premier travail sur les sebkhas a débuté en 1996 sur la sebkha de Moknine dans le cadre de
mes travaux du diplôme des études approfondies et a été développé ensuite dans mes travaux de
thèse et mon travail postdoctoral.

Une sebkha est ce que c’est un bassin fermé rempli d’eau salée, est ce que c’est une zone humide
momentanément inondée ou bien c’est la mer qui a laissé ses traces sur le continent ?

Je vais commencer par définir le terme de sebkha selon les pays et ensuite la mettre dans le cadre
de mes travaux.

Une sebkha est une dépression temporairement occupée par un lac, en général salé et où se déposent
des évaporites. Les eaux proviennent du ruissellement, mais aussi des nappes phréatiques (Foucault
et Raoult, 2001). Plusieurs appellations à ce type d'environnement hypersalin évaporatoire ou
évaporitique : sebkha, garâa (Afrique du Nord), kewir (Iran), playa, salar ou salina (Amérique) et

9
takyr (Asie centrale). En Europe on note la présence d'environnements équivalents à la sebkha tel
la mine de sel au nord-ouest de Mulhouse (Moussa, 2000).

Les sebkhas sont considérées comme les plus grandes zones humides du bassin méditerranéen dont
les plus importantes se trouvent en Afrique du Nord (Grosse, 1969 ; Sassi, 1969, Perthuisot, 1975,
1977). La pluie torrentielle subite suivie par un ruissellement rapide dans les paysages quasi
désertiques entraîne parfois la formation de vastes étendues d'eau dans des dépressions
continentales (Perthuisot, 1977). L'évaporation étant huit fois supérieure aux précipitations, l'eau
ne reste jamais très longtemps, et il est fréquent que ces systèmes s'assèchent complètement entre
les orages, qui ne se produisent qu'une fois par an (Grosse, 1969 ; Sassi, 1969, Perthuisot, 1975,
1977 ; Busson et Perthuisot, 1977 ; Chairi, 2005).

Le littoral tunisien comporte plusieurs environnements hypersalins de tailles et de caractéristiques

physiques et écologiques variées (Sassi, 1969, Perhtuisot, 1975, Mansouri, 1979 ; Carbonel et
Pujos, 1982 ; Lachenal, 1989 ; Chairi, 2005, Lakhadar et al., 2006 ; Gargouri ben Ayed et al., 2007
; Zaara-Ben Mosbah et al., 2010 ; Zaibi et al., 2011, Chairi et Abdeljaoued, 2019). L'étude de ces
environnements hypersalins a commencé fin 1960 sur les systèmes évaporitiques du Cap Bon et
du Sud-Est tunisien (Sassi, 1969 ; Perthuisot, 1975, Busson et Perthuisot, 1977). Les actions sur
les systèmes du Sahel ont débuté avec les travaux de Kamoun (1981) sur la sebkha de Moknine.

2. Formation des sebkhas du Sahel

Les sebkhas objets de mes travaux se localisent dans le Sahel méridional (Fig.I.1) qui est formé par
une alternance de collines et de plaines (Kamoun, 1981). Les altitudes sont partout faibles et ne
dépassent pas 180m. Parmi les ensembles de collines, dont les plus imposants sont ceux des
Zéramedine-Beni Hassen et de Boumerdès-El Jem. Dans les plaines les plus étendues de Ksour
Essef Mahdia et de Moknine, les altitudes sont plus faibles et les secteurs déprimés de ces unités
topographiques sont occupés par des sebkhas dont les fonds sont en dessous du niveau de la mer
(Fig.I.1) : -9m à sebkha Moknine et -4m à sebkha Gotaia à l'Ouest de Mahdia (Bedir et Zargouni,
1986, Chairi, 2005, Brahim, 2015, Chairi et Abdeljaoued, 2019).

Les pentes sont douces sur les versants des collines, faibles ou nulles dans les plaines. Les accidents
tectoniques sont à l'origine de ces écosystèmes lagunaires et dépressions endoréiques. En effet, les
bassins losangiques formés au Tyrrhénien, sont la résultante de la réactivation des failles anciennes

10
bordières au graben de Mahdia en décrochements distensifs est-ouest et N160. L'affaissement plus
important des failles permet l'installation des quatre sebkhas de Mahdia : Gotaïa, Eliane, Kassesse,
Ben Rayad (Amari et Bédir, 1989).

Figure I.1. Site d'étude : les sebkhas de la zone Moknine-Mahdia (Moknine, Gotaia et Eliane).
(Extrait de la carte topographique Moknine 1/250 000).

3. Géographie et Géologie de la zone Moknine-Mahdia

La région du Sahel en Tunisie centrale est soumise à un climat méditerranéen littoral de type aride
à semi-aride, caractérisé par des étés chauds et secs et des hivers doux et humides. La pluviométrie
moyenne annuelle de 300 millimètres est soumise à deux types d'actions climatiques opposés : le
climat méditerranéen tempéré sur les côtes est et le climat aride sec à l'Ouest.
Les zones du Centre et du Sud des gouvernorats de Monastir et Mahdia sont soumises à l’effet des
vents dominants soufflant du Nord-Est et de l’Est couramment appelés « Chergui ». Les vents du
Sud et de l’Ouest sont beaucoup moins fréquents et sont souvent chauds et secs marquant la saison
estivale et entraînant une hausse considérable des températures pouvant dépasser 40°C.
La géologie de Moknine est caractérisée par des formations variées allant du miocène au
quaternaire récent (Kamoun, 1981) générant différents types de milieux (Fig.I.2). A Mahdia, la

11
géologie est caractérisée par des dépôts de couches épaisses datant du quaternaire (Paskoff et
Sanlaville, 1976, 1980, 1983) qui ont subi une série de plis anticlinaux et synclinaux.
Les sols sont variés et surtout à potentiel agronomique indéniable. Il s’agit de sols à caractère léger
dans leur majorité, drainant, favorables presque à tout type de culture et s’apprêtent bien à
l’aménagement.
La géomorphologie de la région est marquée par une diversité de paysages morphologiques
(continent, du littoral, des côtes, des sebkhas) (Fig. I.3). Les Sebkhas collectent les eaux de
ruissellement par écoulement endoréique. Cet écoulement est au moyen des oueds à caractère sec
à cause d’un déficit hydrique énorme d'environ 2 Mm3 /an, traduit par un écart étendu entre
l’évaporation et les apports pluviométriques. Les eaux dérivant des zones à l'ouest sont
partiellement accumulées dans ces dépressions. Le reste est infiltré pour alimenter les nombreuses
nappes souterraines qui sont à l'origine du développement d'une agriculture irriguée. Les réserves
hydrogéologiques sont peu renouvelables et le niveau piézométrique a connu un abaissement
important.

Figure I.2.Carte de la géologie de la zone Moknine-Mahdia

(Extrait de la carte géologique de la Tunisie 1/500000 d’après Ben Haj Ali et al., 1985)

12
 Figure I.3. (A) Carte de la géomorphologie de la zone Moknine-Mahdia (Chairi, 2009) et (B) Schéma
sutructural du Sahel de Moknine Mahdia (Kamoun, 1981).

La diversité de la géomorphologie offre un potentiel naturel et écologique de valeur à la région

mais elle n’est pas épargnée à des problèmes environnementaux. Ainsi, l’érosion naturelle et
anthropique des côtes, l’élévation du niveau de la mer, l’intrusion marine, la mobilité des dunes
littorales, sont les principaux problèmes de cette région.

4. Étude des systèmes côtiers de la Tunisie

Deux articles ont été publiés dans des revues à comité de lecture afin de divulguer les principaux
résultats du proxy sédimentaire dans les zones humides étudiées (Fig. I.4) ainsi que des
communications orales et projets de recherche :

13
 Figure I.4.Zones humides étudiées.

Chairi R. 2005. Etude du remplissage sédimentaire d’un système hypersalin de la Tunisie orientale au cours
du quaternaire récent : la sebkha de Moknine. Quaternaire 16, (2), septembre 2005, 107-117
Chairi R., Abdeljaoued S., 2019.Etude de la géomorphologie dynamique des systèmes évaporatoires
conjugués de Mahdia : Gotaia et Eliane. Tunisie orientale. Géomorphologie.
Chairi R., 2018. La sebkha de Moknine : sédimentologie et géochimie organique. Édition université
européenne. Collection OMN.UNIV.EUROP. 184p
Chairi R. 2010. Organic and mineral sedimentary deposits in the evaporators’ environments of the Sahel of
Tunisia (Mahdia): the Baghdadi swamp and the conjugated sebkha of Gotaia and Eliane. 8th
SwissGeoscience Meeting 2010 Fribourg.
Chairi R. 2009. Etude sédimentologique des environnements évaporatoires de Gotaia et Eliane. Mahdia.
Congrés ASF. Rennes Octobre 2009 France.
Chairi R. 2004. Organic matter deposited in surface sediments from an evaporator system of oriental
Tunisia: The MoknineSebkha. 1st international Congres GREMDA Mars 2004 Egypt.
Chairi R. et Belayouni H. 2003. Etude de la dynamique des sédiments superficiels de la sebkha de Moknine.
3ème Congrès International Environnement et Identité en Méditerranée : Pour une méditerranée durable. 10-
13 décembre Hammamet Tunisie.
Chairi R. et Belayouni H. 2001. Résultats préliminaires de l'étude de la matière organique dans les sédiments
récents de la sebkha de Moknine. 36èmecongrès de la CIESM. Monaco 24-28 septembre France

14
4.1. A la recherche d’un indice marin
La zone côtière de la Tunisie, la plus favorable, pour l’étude de la transgression holocène est la
zone méridionale qui est restée relativement stable sans activités tectoniques significatives pendant
au moins les 130 000 dernières années. On a voulu à travers les études en thèse et les travaux
ultérieurs voir si nous pouvons trouver un indice marin décrivant l’évolution de la sebkha de
Moknine et sa séparation de la Méditerranée.

Une question m’a toujours préoccupée :

La sebkha a-t-elle subi une transgression marine au cours de l’Holocène ? Ou bien depuis le
Pléistocène la sebkha de Moknine appartient-elle à un système endoréique et n’a-t-elle connu que
l’effet du continent ?

Afin de répondre à cette question, il a fallu aller sur le terrain, prélever des échantillons pour les
étudier au laboratoire. Plusieurs immersions sur terrain ont été opérées et que je vais décrire dans
le paragraphe immersion et échantillonnage.

4.2. Immersions sur le terrain et échantillonnages

Les missions dans les zones d’étude ont été réalisées à différentes périodes (1996-2007) dans les
sebkhas du Sahel et en 2017 dans les zones humides du golfe de Tunis.

La première immersion sur le terrain était effectuée en septembre 1996 dans la zone orientale de la
sebkha de Moknine car c’est la zone la plus proche de la mer. En effet, 4km sépare cette zone de
la Méditerranée. Pour ce faire, je suis partie en équipe composée uniquement de huit étudiants en
DEA et en thèse ! D’autres missions ont été réalisées en août 1997 avec les professeurs Belayouni
H. et Abdeljaoued S., en 1999 avec mes amis de l’unité de pédologie et géochimie organique, en
2007 avec l’association de Mahdia et des membres de ma famille et en 2017 avec mes étudiantes.

La première mission était la plus mémorable car c’était ma première aventure dans la plus
mystérieuse des sebkhas de la Tunisie, entre joie et peur nous avons passé des moments agréables
avec les habitants tout autour de la sebkha qui avaient un espoir que cette sebkha devient une zone
propre.

15
L’échantillonnage des sédiments en profondeur n’était pas facile à concevoir. Afin de réaliser des
profils sédimentaires il y avait deux choix soit exécuter un profil sur terrain comme les pédologues
ou bien prélever des carottes que j’ai préféré à réaliser. En absence de carottier et de budget pour
réaliser des carottes profondes, j’ai confectionné un système de manchette par un forgeron pour
faire un carottier manuel qui était composé d’un système de manchette, un tube en PVC (2m de
longueur et de Ø= 75mm), un bouchon et un marteau.

Au cours de ces missions et grâce à ce carottier manuel j’ai exécuté 19 carottes dans la sebkha de
Moknine, 4 carottes dans le système conjugué de Mahdia, deux dans les oueds de Rejel Chiba et
Chibat et 5 carottes dans les embouchures du golfe de Tunis. Des sédiments de surface sont
également collectés dans des sacs et des barquettes en aluminium préalablement placés au four à
240ºC pendant 8h. Ces derniers sont transportés dans des glacières au laboratoire. Les sédiments
récoltés sont stockés en chambre froide ensuite maintenus au congélateur jusqu’à analyse. Au
laboratoire, les sédiments sont prélevés par séquences de dépôt distinctes par leurs faciès, couleur
et présence de débris de faune ou de flore. Les figures illustrant les points de prélèvement seront
présentées dans les paragraphes qui suivent.

4.3. Le proxy sédimentaire, techniques d’analyse

Dans les travaux que je vous présente, les analyses sédimentologiques ont été effectuées sur les
sédiments de profondeur et de surface dont l’objectif de bien caractériser les faciès des dépôts
récents aussi bien la fraction fine que la fraction grossière. Les subdivisions de la fraction sableuse
sont obtenues par tamisage à sec dans les travaux de thèse et par granulométrie laser dans ma
recherche postdoctorale et dans les projets de recherche à l'égard d’encadrement. Les résultats
obtenus par les deux méthodes sont exprimés sous forme de courbes cumulatives semi-
logarithmique (Rivière, 1977) permettant le calcul des indices granulométriques (Mz, Ski et σ) et
des paramètres (Folk et Ward, 1957 ; Rivière, 1977 et Chamley, 1988, 2000). Les analyses
microgranulométriques ont été effectuées à l’aide d’un Sédigraph 5000D sur les échantillons riches
en fraction fine (> 40 %) au cours de la thèse et par granulométrie laser dans les travaux postérieurs.

Les minéraux peuvent être soit d’origine détritique soit d’origine authigène, pour cela j’ai adopté
des analyses pour les caractériser et estimer les taux dans les matrices des zones humides étudiées.
Ainsi, les carbonates ont été déterminés par calcimètrie à l’aide d’un calcimètre de Bernard. Enfin,
les phyllites et les minéraux non argileux sont déterminés par diffractométrie aux rayons X. Toutes

16
ces analyses ont été effectuées au laboratoire de Ressources Minérales et Environnement (RME)
de la faculté des sciences de Tunis (FST) et au laboratoire de Géoressource du CERTE (Cedria
Smartek).

Le faciès organique était analysé par pyrolyse Rock-Eval (RE.IV) au laboratoire de Géochimie
Organique de la FST (Univ. Tunis el Manar) et sur un RE 6 au laboratoire de Géochimie Organique
de l’ETAP. RE est une méthode conventionnelle en géoscience pétrolière, développée pour évaluer
le potentiel d'hydrocarbures de roches sédimentaires (Espitalié et al., 1977, 1985a, 1985b, Lafargue
et al., 1998, Behar et al., 2001) a été de plus en plus utilisée pour étudier la composition organique
des sols et des sédiments (Di-Giovanni et al., 1998 ; Disnar et al., 2003, Sebag et al., 2006, Chairi
et al., 2010, Sebag et al. 2018), les sédiments d'eau douce et salée modernes (Sanei et al., 2005,
Chairi et al., 2010) et les sédiments marins côtiers modernes (Liebezeit et Wiesner, 1990 ;
Marchand et al., 2008).

5. Origine et mise en place des sédiments de la sebkha de Moknine

Au niveau de cette synthèse, j’ai choisi 8 carottes (SM13, SM14, SM15, SM3, SM16, SM17, SM18
et SM6, Fig. I.5) bien réparties de l’Ouest vers l’Est et du Sud vers le Nord afin de présenter
l’évolution dans le temps et dans l’espace du bassin évaporatoire de Moknine dans le récent (Chairi,
2005).

Le matériel de remplissage de la sebkha comprend toutes les subdivisions granulométriques allant

des sables aux argiles montrant l’origine détritique de ce dernier. Les couches traversées dénotent
toutes d’un dépôt effectué dans un environnement continental (lacustre). Les niveaux n’ont montré
aucun indice faunistique ou lithologique permettant l’attribution d’un caractère de dépôt
franchement marin.

17
 Figure I.5. Localisation des carottes dans la sebkha Moknine (Chairi, 2005).

En effet, la présence d’une faune caractérisée essentiellement par des gastéropodes de milieu
continental : Rumina decollata, Helicellaidia, Eobaniavermiculata, Helicellavariabilis, confirme et
appuie, cette observation (Chairi, 2004). Par ailleurs, la dalle villafranchienne à l’Est forme une
barrière séparant la sebkha de la mer et la protège de la dynamique marine (Chairi, 2004, 2005 et
Chairi et Abdeljaoued, 2019).

Le mode de remplissage de la sebkha s’est effectué d’une manière concentrique (Fig.I.6). Le

comblement est net dans les espaces les plus externes. Ce mode de remplissage centripète est dû à
l’existence de plusieurs directions des apports détritiques. Il témoignerait également d’une
physiographie particulière du bassin, constitué par un domaine central profond et un domaine

18
périphérique de moins en moins profond. Ceci est exprimé par la distribution zonée des matériaux
détritiques de remplissage des sommets des carottes et des sédiments de surface. La croûte de sel
existant dans les carottes les plus internes est un indice supplémentaire confirmant ce mode de
remplissage centripète. Le niveau argileux basal reflète plutôt un épisode antérieur lorsque le bassin
était recouvert en totalité d’eau et possédait une superficie plus grande.

Figure I.6. Distribution latérale des faciès dans la sebkha Moknine

(D’après Chairi 2004, 2005).

La distribution granocroissante des faciès indique la présence de dépôts de comblement dans une
dépression continentale où l’énergie hydrodynamique a progressivement augmenté avec le temps.
La distribution du quartz retrace cet aspect progradant et la présence de deux unités de dépôt. Son
importance diminue avec la profondeur et l’évolution spatiale présente un gradient décroissant des
teneurs en ce minéral vers la partie la plus interne. La sédimentation dans ce système est attribuée
aux dépôts de courant se produisant par excès de charge. Elle montre une variation dans les dépôts
de surface et de subsurface qui peut s’expliquer par : (i) une concentration des cours d’eau
préférentiellement dans la partie occidentale, (ii) une variation dans la topographie de la bordure,
(iii) et enfin, une variation dans le degré d’énergie des eaux.

5.1. Faciès carbonaté

La périphérie est caractérisée par des teneurs en CaCO3 relativement faibles (4 à 17 %). Dans les
sédiments à faciès mixte, les teneurs en carbonate ne dépassent pas 24 %. Vers le centre, elles

19
varient de 2 à 20 %. L’évolution verticale en CaCO3 montre dans toutes les carottes prélevées une
diminution en profondeur. Les valeurs généralement faibles dénotent une origine chimique par
évaporation et/ou biogénique par décomposition des gastéropodes. Cependant, les taux
relativement élevés indiquent l’existence d’un apport exogène. En effet, parmi les formations qui
bordent la sebkha, une épaisse croûte calcaire à Hélicidés datée du Villafranchien (Paskoff et
Sanlaville, 1983 et Amari et Bedir, 1989) et qui par érosion serait à l’origine d’un enrichissement
de la sebkha en carbonates.

5.2. Faciès organique

Les richesses globales en carbone organique (CO) dans les sédiments d’une carotte, sont
généralement en fonction de sa position dans la sebkha. A la périphérie, les carottes (SM13 et
SM16) se distinguent par des niveaux pauvres en CO. Les teneurs restent en dessous de 0,5 %,
alors qu’au centre, les carottes (SM3, SM6, SM15 et SM18) montrent une richesse relative avec
des taux arrivant à 0,80 %. La couche argileuse profonde affiche une augmentation des teneurs en
CO au passage des sables vers les argiles. Les valeurs de l’index d’hydrogène (IH) sont très faibles
à la périphérie (IH <110 mg d’HCg/CO) et élevées vers le centre. Les premières correspondent à
MO résiduelle et terrestre. Les quantités élevées (IH>110 d’HCg/COT) s’attribuent à une origine
lacustre (Fig. I.7).

Figure I.7. Diagramme IH/Tmax.

(I: origine algaire, II: Origine marine, III: origine terrestre, Chairi, 2005)

20
5.3. Evolution de la sebkha de Moknine
Le modèle de Moknine révèle des dépôts détritiques reflétant l’influence continentale, comme c’est
le cas des sebkhas de Kelbia et Sijoumi (Khediri, 2006 ; Chouari, 2013). Toutefois la sebkha de
Moknine est plus proche de la Méditerranée et une communication avec la mer a dû exister dans le
passé. La passe semble avoir été située au Sud par l’intermédiaire des deux petites dépressions
Eliane et Gotaia, sebkhas communiquant avec le système de Moknine par l’oued Rejel Chiba
(Fig.I.5). Cependant aucun indice marin n’est signalé dans la colonne étudiée, qui puisse renseigner
sur la période de l’isolement de la sebkha de la mer, comme c’est le cas des sebkhas côtières de
Tunisie : Boujmal, Ariana, Bou Zid où les dépôts ont enregistré l’influence marine ainsi que la
régression et la fermeture du bassin (Lakhder et al. 2006, Zaara-Ben Mosbah et al., 2010, Farhat et
Ben Mammou, 2010). L’étude accomplie a permis la reconstitution de la sebkha en prenant en
compte la variation du niveau d’eau dans le bassin et le déplacement du faciès fin et de MO associée
(Fig.I.8). D’après, le mode de sédimentation calme, la rareté des averses et l’écoulement peu
abondant durant l’année dans la région de Moknine (300 mm/an), la chronologie de la séquence
sédimentaire du système est de l’ordre de 2000 ans.

Le modèle d’évolution peut être réparti sur trois intervalles : (t0, t1 et t2).

Au temps t0 : La sebkha plus étendue vers l’Ouest est couverte d’eau et les dépôts sont de texture
argileuse. Les apports organiques sont variés ; une part est livrée par le continent et une autre est
produite dans la tranche d’eau épaisse. Le transport vertical de MO est effectué dans un corps d’eau
stratifié à l’abri de l’oxygène. La stratification est due à la présence d’une eau sursalée et d’une eau
douce. Le cheminement des apports organiques dans la tranche d’eau sursalée et anoxique
s’effectue à la suite des arrivées successives d’eaux douces, provoquant une désaturation
momentanée du milieu. Cette dilution est suivie immédiatement d’une reconcentration des sels afin
de protéger de l’oxydation les particules organiques par reconstitution d’un nouveau système
stratifié.

21
 Figure I.8. Modèle d'évolution du système évaporatoire de Moknine (Chairi, 2005).

Au temps t1 : L’apport des sables par le réseau hydrographique très abondant dans la partie ouest
s’accompagne par une migration du faciès organique vers la zone orientale. Ainsi, le phénomène
décrit au temps t0 sera restreint sur la zone d’accumulation d’eau et le milieu de dépôt des argiles.

Au temps t2 : Seule la partie orientale est immergée. Elle est caractérisée par une accumulation de
MO essentiellement détritique. Le stock organique est bien préservé dans un milieu à tendance
anoxique. La tranche d’eau peu épaisse aujourd’hui ne permet pas une stratification des eaux.
Cependant l’évaporation totale et l’édification d’une pellicule très épaisse d’halite en saison chaude
soustrait MO d’une oxydation et favorise sa préservation.

6. Géomorphologie, dynamique et évolution des systèmes conjugués de Mahdia

L’étude de la géomorphologie dynamique des dépressions évaporatoires de Gotaia et Eliane était
basée sur la sédimentologie, la minéralogie et la morphologie. La géomorphologie définira
l’ensemble des unités morpho-structurales visibles dans les sebkhas afin de comprendre l’évolution
récente de ces deux dépressions. La sédimentologie et la minéralogie délimiteront les zones de
dépôts en fonction de la répartition granulométrique (sable, limons et argiles) et la nature des
minéraux. Cette répartition tient compte à la fois de la nature des apports et du dynamisme du

22
milieu. Six profils sont étudiés (Fig.I.9), RCh dans oued Rejel Chiba, OC dans oued Chiba, G1 et
G2 dans sebkha de Gotaia, et E1 et E2 dans la sebkha d’Eliane.

Figure I.9. Points d'échantillonnage dans les sebkhas de Mahdia (Chairi et Abdeljaoued ,2019).
(Gotaia et Eliane) et les oueds (Rejelchiba et Chiba)

6.1. Distribution des sédiments dans le temps

La reconstruction paléogéographique des bassins d’Eliane et Gotaia à travers la répartition verticale
des sédiments déposés montre la présence de séquences sédimentaires distinctes de la bordure vers
le centre de ces systèmes (Chairi, 2009 ; Chairi et Abdeljaoued, 2019). Les dépôts à l’amont et en
aval de l’oued Rejel Chiba (Rch) sont caractérisés par des sables fins au bord et une vase argileuse
dans le lit de l’oued (Chairi, 2004). Le profil de la carotte (Rch) montre une répartition comparable
à celles de la zone médiane de la sebkha de Moknine (Chairi, 2004, 2005) et la zone périphérique
de la sebkha de Gotaia. La sebkha d’Eliane est caractérisée par une séquence argilo-sableuse à la
périphérie et deux séquences au centre formées par un dépôt d’argile (50 cm) suivi par un dépôt
granocroissant de même épaisseur, constitué d’un niveau argileux (20 cm) et d’un niveau sableux
(30 cm). Les colonnes sédimentaires de la sebkha de Gotaia montrent les mêmes types de faciès
granulométriques mais avec une distribution nette à travers le temps et l’espace. La bordure de la
sebkha présente un remplissage de deux séquences. La première d’épaisseur environ 50 cm formée

23
par une argile-sableuse et la deuxième composée d’un niveau argileux et un niveau sableux
rappelant la séquence basale au centre de la sebkha d’Eliane. Le centre est occupé par une colonne
de deux séquences dont la distribution de taille des grains est inverse. La première de 20 cm
d’épaisseur est granocroissante (A‑S) et la deuxième de 80 cm d’épaisseur est granodécroissante
(AS‑A).

Les répartitions spatiale et temporelle rappellent la colonne sédimentaire de la sebkha de Moknine

où des séquences granocroissante et granodécroissante se répartissent de la périphérie au centre de
ce bassin (Chairi, 2005). Le niveau sableux à la base des carottes E2, G1 et G2 montre que le
système à un temps t0 était le siège de même type de dépôt constitué par des faciès sableux.
L’enrichissement en fraction fine et le passage vers des sables-argileux, argile-sableuse et argiles
expriment une phase d’envasement du système conjugué de Gotaia et Eliane. L’évolution des
bassins dans le temps (t1) est une période de comblement (Chairi, 2010, Chairi et Abdeljaoued,
2019).

6.2. Dynamique de l’environnement sédimentaire

La répartition spatiale des différents faciès est régie essentiellement par la dynamique des courants
de transport. La répartition granulométrique des sédiments dans le profil est le reflet de la
topographie et du degré local de l’énergie des courants d’eau. En effet, l’environnement
bioclimatique de type semi-aride, conditionne fortement l’action des vents dominants, de direction
nord‑ouest, dans l’alimentation de la couverture sédimentaire des sebkhas d’Eliane et Gotaia par
des sédiments fins du bassin versant. Ce matériel allochtone est redistribué dans le milieu
évaporatoire par la dynamique propre de ces systèmes. Le vecteur essentiel des apports est le
ruissellement sur les formations avoisinantes dans la sebkha d’Eliane. Pendant la période sèche,
l’ombilic de la sebkha s’assèche et le vent fait la déflation à partir du fond vers les bordures. A la
périphérie du système Gotaia et dans oued Chiba, le faciès parabolique à dominance sableuse
caractérise un milieu agité et indique une hétérogénéité de ces sables. Il correspond à des sédiments
déposés par excès de charge et caractérise des sables triés au cours d’un transport dans un milieu à
forte énergie (Chairi et Abdeljaoued, 2019).

A la périphérie de la sebkha d’Eliane, le faciès ultra parabolique indique que la fraction fine
excédentaire de caractère hyperbolique correspond à des remaniements de sédiments très fins,
suraccumulation, piégeage ou à des actions pédologiques. Les sédiments correspondent à des

24
suspensions uniformes au sens de Passega (1957), déposées par décantation en eaux calmes
correspondant à des milieux limniques. Au centre de la sebkha d’Eliane et dans l’oued Rejel Chiba,
le faciès logarithmique à sub-logarithmique, à dominance argileuse exprime un dépôt des
sédiments par excès de charge lors de la diminution de la vitesse de transport. Le faciès
hyperbolique à dominance silto‑argileuse au centre de la sebkha de Gotaia traduit des milieux
calmes ou des zones protégées. Les sédiments sont déposés par décantation de «suspensions
uniformes » dans un milieu calme où l’hydrodynamique est assez lente pour les remettre en
suspension.

6.3. Origine des sédiments

Le quartz est le minéral le plus important (Fig.I.10). Ce dernier est charrié par les oueds à partir du
bassin versant reflétant un détritisme. L’exoscopie révèle une forme émoussée luisante des grains
de quartz, indiquant un transport par l’eau (Chairi, 2005, 2009, 2010). Dans la région du Sahel, les
affleurements sont rares ce qui en rend difficile l’étude. Cependant les formations reconnues
d’après les études de Kamoun (1981) et Amari et Bedir (1988) sont d’âge miocène et
plio‑quaternaire et sont formées par des argiles, sable, argiles‑sableux et sables-argileux qui sont à
l’origine des alluvions dans les dépressions du Sahel.

Figure I.10. Diffractogramme des RX des minéraux non argileux d’un sédiment brut (E1).
(Systèmes conjugués de Mahdia, Chairi,2010).

La calcite a une origine authigène par précipitation et (ou) à partir de la faune présente
essentiellement sous forme de coquilles de gastéropodes terrestres (Fig.I.10,) et une origine

25
terrigène à partir des formations carbonatées du bassin versant des formations Réjiche et Douira
(Kamoun, 1981).

Le gypse est un minéral authigène (Fig.I.10). Il prend naissance dans les sédiments des sebkhas de
Gotaia et Eliane. Il est présent sous forme de cristaux lamellaires ou en roses de sable dans l’oued
Rejel Chiba (Chairi, 2004 ; Chairi et Abdeljaoued, 2019). Ces cristaux sont d’origine diagenétique.
Ils sont produits par précipitation suite à l’évaporation totale des eaux interstitielles remontées par
capillarité. Ce phénomène est déjà remarqué dans la sebkha de Moknine (Chairi, 2005) et la sebkha
de Sidi el Hani (Essefi et al., 2014) située à l’Ouest de la sebkha de Moknine. Elle est distante de
54 km de celle-ci et elle est issue du même accident tectonique (Amari et Bedir, 1988). Les eaux à
l’embouchure de l’oued Rejel Chiba sont plus chargées en sel permettant le dépôt d’une couche
d’halite à la surface (Chairi, 2004). Par ailleurs, la teneur en halite diminue de la surface vers le
fond. Cette diminution peut être interprétée de deux manières : soit la concentration des eaux n’était
pas suffisamment élevée pour alimenter une précipitation abondante d’halite lors du dépôt des
sédiments, soit une dissolution ultérieure a fait baisser le taux de ce minéral. Les argilites sont
d’origine détritique. Elles dérivent du bassin versant et se déposent par suspension gradée dans ces
systèmes calmes.

7. Datation des dépôts des bassins évaporatoires étudiés

Les dépôts de l’Holocène, dans le Sud de la Tunisie, sont soit enfouis dans les sebkhas ou
apparaissent de manière discontinue sur la frange côtière du golfe de Gabès, à la frontière
tunisienne de la Libye et à travers le littoral entier de Djerba (Paskoff et Sanlaville, 1983 ; Jedoui
et al., 1998 ; Lakhdhar et al., 2006). Des études aussi menées à l’Est et dans le golfe de Tunis ont
mis en évidence cette transgression holocène.

Au Sud-Est de la Tunisie, l’étude des éolianites par Frébourg et al. (2010) de la formation Sidi
Salem dans la localité de Lella Mariem (Zarzis, golfe de Gabès) a montré que la couche de grains
plus grossière qui coupait la crête éolienne de Sidi Salem était très probablement déposée dans des
conditions subaquatiques, pendant un événement exceptionnel. En raison du manque de datation
fiable, cet événement peut être soit une tempête exceptionnellement ou un tsunami si la période
s’étend de 7 000 à 6 500 ans BP (Frébourg et al., 2010). Cependant, si l’âge s’étend de 8 000 à 7
600 ans BP, un mégatsunami est l’hypothèse la plus convaincante pour la couche de grains plus
grossiers dans la formation Sidi Salem à Lella Meriem malgré le caractère exceptionnel de cet

26
événement. Ce dernier pourrait être lié au méga-tsunami déclenché par l’effondrement du Valle del
Bove du volcan de l’Etna, en s’appuyant sur son âge et les données émanant de Pareschi et al.
(2006). Dans ce cas, cette couche à haute énergie serait la première décrite : dépôt sous‑régional
de cet événement. En raison de leur proximité spatiale avec le rivage, les éolianites peuvent
enregistrer des phénomènes catastrophiques et représentent des archives précieuses pour les côtes.
Les travaux menés par Zaara ben Mosbah et al. (2010) sur l’évolution biosédimentaire du dépôt
quaternaire de la sebkha de l’Ariana, montrent que la sebkha de l’Ariana a subi deux épisodes un
daté environ 200000 ans et correspondant au MIS 7 (Marine isotope stage 7) et un autre plus récent
(8000 ans BP) daté holocène. Aucun dépôt pouvant être attribué au Tyrrhénien (MIS 5) n’a été
reconnu dans la lagune et un hiatus sédimentaire important semble devoir être envisagé entre
190000 ans et 8000 ans BP expliqué par un niveau supérieur de la mer lors du MIS 5. Peut-être
l’hypothèse du méga tsunami est-elle la réponse à cette lacune ? Cependant ce tsunami semble être
local. En effet, des dépôts marins d’âge tyrrhénien existent au-dessus du niveau actuel sur le littoral
de la péninsule du Cap Bon (Bonvallot et Paskoff, 1983 ; Chakroun et al., 2009) et au Sahel
tunisien.

Le long de la côte tunisienne, les lignes de paléorivages contemporains à des altitudes différentes
résultent de mouvements verticaux de différentes ampleurs (Bouaziz et al, 2003). En effet, les
dépôts oolithiques à strombes correspondant à l’unité carbonatée (équivalent à l’unité Réjiche) sont
à des altitudes différentes : au Nord +7 à +10 m aux environs de Bizerte, +7 à +13 m au Cap Bon
(golfe de Hammamet) (Paskoff et Sanlaville, 1983), et +13 à +32 m en marge du Sahel tunisien
(Mahmoudi, 1988), +3 et +6 m au Sud (Jedoui et al., 2002). En Méditerranée, les paléoplages à
Strombes, contemporaines de l’unité carbonatée Réjiche, sont datées sur des coraux par la méthode
Th/U d’environ 125 ka, correspondent au Dernier Interglaciaire (MIS 5) (Hearty et al, 2007). En
Méditerranée, leur altitude varie d’une région à une autre : +52 à +157 m sur les côtes de Calabre
(Dumas et al., 2006), +100 m dans le bassin de Corinthe en Grèce. Cette altitude demeure
cependant assez constante dans les régions sans mouvements verticaux importants : +4 à +5 m en
Corse, où elles sont datées de 130 000 ans (Zibrowius, 1993), +5 à +7 m le long du littoral
méridional de la péninsule de Sorrente en Italie, pour un âge de 120 000 ans et +1,5 à +5 m en
Sardaigne. Ces données sont très comparables aux altitudes des plateformes coralliennes (environ
+6 m) du dernier interglaciaire, retrouvées dans de nombreuses régions du monde réputées par leur
stabilité tectonique (Chen et al., 2013).Tenant compte de l’altitude du cordon tyrrhénien et du méga

27
tsunami causé par la Valle del Bove de l’Etna, il semble que ce phénomène était plus prononcé
dans les golfes de la Tunisie et que l’altitude des cordons tyrrhéniens a joué peut être un rôle
d’obstacle dans le Sahel tunisien. Si cette hypothèse est incontestable, la sebkha de Moknine et les
systèmes de Gotaia et Eliane seront considérés être des dépressions continentales depuis le
Tyrrhénien, si non les déôpts holocènes sont plus profonds et des coupes dans des puits autour de
ces bassins sont indispensables pour le prouvé.

8. Climat des écosystèmes du Sahel

Les marges désertiques et les écosystèmes arides du Nord de l’Afrique sont des zones de transition
hautement sensibles aux variations des paramètres climatiques et aux impacts anthropiques. Nous
avons cherché à retracer le climat de la région du Pléistocène à l’Holocène à l’aide des travaux
palynologiques menés en Tunisie orientale et méridionale et qui ont contribué à l’étude des rôles
respectifs des facteurs anthropiques et climatiques dans les changements des écosystèmes semi-
arides et arides. Les études palynologiques menées par Mahmoudi (1986) sur le Tyrrhénien en
Tunisie orientale montrent que ces dépôts correspondent à un épisode climatique chaud et peu
humide. Les stratifications obliques présentes dans les faciès éoliens indiquent que les vents
dominants soufflaient du Nord vers le Sud. Ceci est prouvé par les études menées par Le Guern et
Davaud (2005) sur les éolianites des faciès tyrrhéniens de la côte orientale tunisienne. Les auteurs
montrent que les couches à Strombus bubonius dans les coupes étudiées indiquent que cette période
tyrrhénienne, qui correspond à la période interglaciaire Riss‑Würm, était un épisode climatique
chaud. Tous les dépôts éoliens observés sur la côte orientale tunisienne se sont donc déposés en
période de réchauffement et de haut niveau marin, comme l’attestent les altitudes actuelles
auxquelles affleurent les faciès subtidaux. Cette configuration interglaciaire et la présence
importante de traces végétales fossiles amènent à penser que le climat devait être humide. Les
précipitations météoriques pourraient donc être à l’origine de la réorganisation des orientations des
particules.

Les études menées dans la plaine côtière de la Jeffara sur les dépôts de l’Holocène moyen et
supérieur de la sebkha Boujmel (Sud‑Est tunisien) et celles sur les Rammadiyat de sebkha Halk el
Menjel (Jaouedi et al., 2015) évoquent un paysage ouvert à caractère steppique, marqué par l’aridité
et un apport anthropique intentionnel d’essences végétales sur le site, en particulier les Poacées
sauvages.

28
D’après Essefi et al. (2014), l’archive sédimentaire de la sebkha Sidi el Hani montre le passage
d’un climat humide vers 7 000 ans BP à un climat aride vers 5 000 ans BP. Le remplissage
sédimentaire des bassins du Sahel : Moknine, Gotaia et Eliane sur 1 ka concorde bien avec un
climat semi-aride. Les Sebkhas Moknine, Gotaia et Eliane sont des plans d’eau continentale, ne
recevant que les eaux pluviales. Nous n’avons aucun indice de quelle manière le régime
hydrologique de ces sebkhas a évolué durant le Pléistocène supérieur et l’Holocène. Cependant un
contexte d’aridification climatique permet de comprendre la genèse de la lunette qui accompagne
aujourd’hui les bordures de la sebkha d’Eliane. En fait, la formation de cette lunette aurait été
favorisée par l’exposition prolongée et répétée de la surface de la sebkha à la déflation éolienne
sous un climat à saison sèche assez longue. L’existence de cette lunette sur la bordure sud‑est est
due au vent dominant du nord-ouest à qui on doit la formation des lunettes qui occupent souvent
les bordures sud-est des sebkhas continentales en Tunisie.

29
 I.2. Les embouchures du golfe de Tunis
De par sa position charnière entre les bassins occidental et oriental de la Méditerranée, le golfe de
Tunis occupe une place majeure, non seulement en ce qui concerne l’écosystème marin du nord de
la Tunisie, mais, aussi, et surtout, en ce qui concerne l’ensemble de la Méditerranée. Les données
bibliographiques traitant de façon spécifique la zone du golfe de Tunis sont peu nombreuses et
relativement anciennes. Les données portant sur la baie de Tunis sont beaucoup plus nombreuses
souvent réactualisées mais elles restent, dans leur majorité, très sectorielles. C’est un écosystème
ébranlé par plusieurs facteurs dont les quatre stations d’épuration relevant de L'O.N.A.S. et les
rejets urbains et industriels dans le milieu naturel et les zones humides qui seront véhiculés vers la
mer.

La qualité des eaux et des sédiments de surface du golfe de Tunis est influencée par les apports
d’eau et de sédiments par les principaux cours d’eau qui y débouchent. Ces apports peuvent être
classés en deux modèles : Des apports directs par les cours d’eau pérennes : oueds Majerda,
Méliane et Abid et le canal Khalij ou Khlij et des apports indirects par les eaux de l’oued El Bey
parvenant indirectement au golfe via la sebkha de Slimane.

Dans cette partie je présenterai brièvement les oueds qui débouchent dans le golfe de Tunis,
l’emplacement des échantillons étudiés (Fig.I.11) et les caractéristiques des faciès sédimentaires et
organiques à travers des études menées dans le cadre d’un projet de recherche national du CERTE
et qui ont fait l’objet de trois masters et deux communications affichées.

Oued Majerda ou bien Macharas ou Bagradas tel qu’il était nommé à l’antiquité constitue l'artère
principale du réseau hydrographique de la Tunisie ; est une source d’apport d’éléments nutritifs
dans les eaux et d’éléments métalliques dans les sédiments en suspension (Arif, 2012). Son bassin
versant est de l’ordre de 23 500 km2 dont 7 600 km2 sont situés en Algérie (Fig.I.11) et comprend,
en Tunisie, cinq principaux affluents sur sa rive gauche oued Béjà, oued Kessab et sur sa rive droite
oued Siliana, oued Tessa et oued Mellègue.Les apports solides de la Majerda dans le golfe de Tunis
seraient actuellement de 2.2 millions de tonnes (Ben Mammou et Louati 2017).

Le canal Khlij : Le bassin de la basse vallée de la Medjerda (d’une superficie de 336 km²) est
composé essentiellement du cours inférieur de l’oued Majerda (oued el Hessiane dévié par le canal
30
Khlji, Fig.I.11). Il est utilisé pour véhiculer les eaux lâchées du barrage de Sidi Salem et El Aroussia
vers les périmètres irrigués jusqu’à son exutoire au niveau du golfe de Tunis et les eaux usées
épurées des stations d’épuration de Tunis nord.

Figure I.11. Points d'échantillonnage dans les embouchures du Golfe de Tunis.

(Extrait de la carte topographique 1/250 000 Tunis)

Oued Méliane s'écoule au Nord-Est de la Tunisie sur une distance de 160 kilomètres, ce qui en fait
le deuxième plus long cours d'eau pérenne du pays après la Majerda (Fig.I.11). Ces eaux sont
chargées en éléments nutritifs et en matière organique dissoute ou solide. Celles-ci sont de trois
types : les eaux pluviales du bassin versant, les eaux épurées des stations d’épuration de l’ONAS
et les eaux usées brutes (Ben Charrada, 1997). Il draine un apport annuel moyen de 26,47 Mm3,
soit un apport solide de 926 394 T/an qui représente 35% de la totalité des apports évacués vers le
golfe de Tunis (Ben Mammou et Louati 2017).

Oued El Bey, cours d’eau principal de la plaine de Grombalia est considéré comme le cours d’eau
dominant dans la région de Nabeul (Fig.I.11). Son affluant oued Ejjorf a deux affluents oued
Jaboudi et oued Nianou qui sont des cours d’eau à écoulement discontinu.

31
Oued Abid a un bassin versant de dimension réduite, présente une forme relativement compacte
avec une superficie de 85Km² et une altitude moyenne de 326 m. Le principal cours d’eau a une
largeur de 16m (Fig.I.11).

1. Les apports détritiques

Les apports détritiques vers la méditerranée dans le golfe de Tunis au moyen des réseaux
hydrographiques qu’y débouchent sont formés par des sédiments quartzeux fortement carbonatés
(CaCO3> 40%) au Nord-Est du golfe et légèrement au Sud (CaCO3< 20%). Ces apports sont plus
fins, à granulométrie uniforme et enrichis en fraction ultrafine (< 2µm) dans les embouchures de
Majerda alors qu’ils sont moyens à granulométrie variée et pauvres en fraction ultrafine dans oued
El Bey. Les compartiments sédimentaires sont caractérisés par les dépôts de type « suspension
gradée » qui renvoient à des matériaux classés, transportés par des courants de fond qui donnent
une sédimentation typique dans les chenaux fluviatiles. Dans le delta de Majerda et dans les
embouchures de Méliane, et El Bey, les courbes cumulatives (Fig.I.12) sont dans l’ensemble
sigmoïdes, ce qui indiquerait une accumulation d’origine fluviale, avec des sables dont un peu plus
de la moitié est constituée de grains respectivement 0.250mm, 0.275mm et 0.225mm de diamètre.
Cela suggère que l’écoulement peut être faible au vu de la platitude du relief et de la couverture du
sol. En aval, d’oued Abid et dans le niveau superficiel d’oued El Bey les sédiments n’ont pas connu
la même dynamique. Les courbes cumulatives sont plutôt logarithmiques, suggérant une absence
de tri. Ainsi, la sédimentation est déterminée par plusieurs dynamiques : les courbes logarithmiques
à sub-logarithmiques suggèrent une quasi-absence de tri dominante. Cependant les cas de
classement obtenus dans les autres profils indiquent une sédimentation alternant les processus
fluviaux et les processus à caractère brutal. En revanche, la courbe sub-parabolique à oued El Bey
où prédominent des éléments fins, est le résultat d’un phénomène de décantation dans la lagune de
Slimane (Fig.I.12).

32
 Figure I.12. Courbes
Figure 2.10. cumulatives (Golfe de Tunis,
Courbes cumulatives (golfeMahmoud,
de Tunis) 2018).
2. Les apports organiques

Le Carbone organique total (COT) varie de 1,3 à 8,23% (Tab.1) aux embouchures
méditerranéennes. Les valeurs les plus élevées sont mesurées à l’embouchure d’oued El Bey (COT
: 8,23%) et les plus faibles valeurs caractérisent les dépôts sédimentaires de l’embouchure actuelle
d’oued Majerda (COT : 1,13%). Dans les différents profils les taux de COT sont élevés dans les
horizons de surface et diminuent en profondeur montrant une oxydation et dégradation de la MO
en profondeur.

33
 Tableau 1 : Paramètres et index de la pyrolyse Rock Eval (O. : oued, COT : %, Cmin : %, S1 et S2 : mg
d’HC/gséd, S3 : mg de CO2/gséd, IH : mg d’HC/gCOT, IO : mg de CO2/gCOT, TpS2 : °C, Mahmoud, 2018)
Sites Echantillons COT Cmin S1 S2 S3 TpS2 IH IO
O. Maj.1 S1 1,22 4,93 0,01 1,01 3,25 468 83 266
O. Maj. n1 2,63 4,90 0,01 3,54 3,64 465 135 138
O.Majerda1

O. Maj. n2 1,24 5,26 0,00 0,50 2,36 466 40 190

O. Maj. n3 1,47 4,68 0,01 0,47 1,38 473 32 94
O. Maj.2 S1 1,18 6,35 0,05 2,37 3,35 443 79 284
O. Maj.2 n1 1,13 5,45 0,02 1,69 3,12 468 60 276
O.Majerda2

O. Maj.2 n2 1,60 5,96 0,06 1,25 2,60 468 81 163

O. Maj.2 n3 1,24 5,58 0,08 1,23 2,91 469 213 235
Canal Khlij CKh 2,87 4,41 0,04 6,14 4,46 455 214 155
O. Mél. s1 4,48 4,35 0,09 6,54 7,22 446 270 161
O. Mél. s2 7,02 6,16 0,62 18,30 8,00 456 235 114
O. Méliane

O. Mél. n1 5,32 5,43 0,18 8,43 8,44 465 376 159

O. Mél. n2 4,48 4,35 0,15 6,30 9,10 466 300 203
O. el B. S1 5,74 2,72 0,12 3,50 5,00 453 262 87
O. el B.n1 8,23 4,80 0,15 18,64 10,79 466 241 131
O. El Bey O. el B.n2 6,41 5,46 0,07 6,94 8,48 466 219 132
O. el B.n3 4,96 6,70 0,04 2,98 6,98 468 142 141
O. el B.n4 4,15 5,86 0,02 2,01 5,73 465 103 138
O. Ab. S2 3,31 1,94 0,03 2,31 6,07 453 183 183
O. Ab. S3 5,74 4,28 0,11 6,70 9,17 462 197 160
O. Ab.n1 4,45 0,91 0,02 2,30 8,46 460 190 190
O. Ab.n2 4,21 1,75 0,01 2,14 6,22 462 117 148
O. Abid

O. Ab.n3 4,00 2,00 0,01 2,21 8,00 466 115 200

Les hydrocarbures libres (S1) ne dépassent pas 0.08mg d’HC/g séd dans l’ancienne et l’actuelle
embouchure de la Majerda et dans le canal Khlij. S1 est très élevé dans l’embouchure d’oued
Méliane (0,62 mg d’HC/g séd), varie entre 0.02 et 0.15mg d’HC/g séd dans oued El Bey et enfin
dans oued Abid S1 est généralement faible. Les sédiments superficiels sont plus riches en
hydrocarbures libres (Tab.1). Les hydrocarbures potentiels (S2) sont plus abondants que les
hydrocarbures libres. Les valeurs varient de 0,47 à 18,62 mg d’HC/g séd. S2 est répartie sur trois
domaines dans le graphique (S2/COT).

34
Les composés oxygénés (S3) sont distribués en trois plages distinctes (Fig.I.13 et Tab.1) dont les
valeurs se répartissent respectivement entre : 0-4 ; 4-8 et 8-12 mg d’HC/gCO2. Les échantillons
des embouchures de la Majerda sont concentrés dans le domaine 1, les sédiments d’oued Abid et
canal Khlij dans le domaine 2 et enfin dans le domaine 3 se regroupent les échantillons des oueds
Méliane et El Bey. Cette répartition en domaine reflète une composition différente du stock
organique hérité du bassin versant d’une part et des apports autochtones d’autre part ainsi que
l’influence des eaux usées chargées en matière organique dans les embouchures de Méliane et El
Bey.

Figure I.13. Variations des composés potentiels (S2)

et oxygénés (S3) en fonction du COT (Mahmoud, 2018).

35
 II- Les biomarqueurs indicateurs pour retracer l’histoire

La vision de la première partie de ce document était focalisée sur les domaines de dépôt en
déterminant les archives sédimentaires pour ce faire le proxy sédimentaire était étudié au moyen
des analyses classiques pour une détermination du faciès détritique néanmoins on a fait appel à une
technique très performante la pyrolyse RE pour préciser les propriétés du faciès organique. Dans
cette partie nous allons passer du faciès organique à la molécule organique. Le proxy géochimique
a nécessité l’emploi de méthodes et appareils plus performants. Pour ce faire, j’ai travaillé avec
l’équipe de Bio-Géochimie et Chimie Organique (Paris VI). Ce travail était sélectionné afin de
faire partie de l’article qui a porté sur les cas d’étude utilisant la technique GCMS en Afrique
(Sichilongo et al., 2012).

1. Interface eau/sédiment
Comme il a été démontré dans la partie archive sédimentaire, les sédiments jouent un rôle important
dans le cycle du carbone en stockant une fraction organique considérable produite par la biosphère
(Anderson et al., 2013 ; Wang et al., 2013, Arbi et al., 2018, Carrizo et al., 2019). Ils sont aussi le
lieu de la dégradation de cette MO, sa minéralisation et la régénération des nutriments (Xu et al.,
2015). Les études menées par Muri et al. (2013) et celle de Xu et al., (2015) ont montré que la MO
d’origine phytoplanctonique est plus facilement dégradable que la MO d’origine terrestre. Ceci est
probablement le résultat de la disponibilité accrue d'azote (N) et de phosphore (P) dans la
prolifération des phytoplanctons et qui par conséquent augmentera l'efficacité du recyclage des
éléments nutritifs.

Ainsi, la détermination de la composition, de l'origine et de la distribution de la MO des sédiments

lacustres est nécessaire afin de comprendre les cycles biogéochimiques pour le carbone et les
nutriments et concevoir des stratégies de gestion environnementale pour les systèmes lacustres
(Prartono et Wolff, 1998 ; Chairi, 2004, Kumar Das et al., 2009 ; Carreira et al., 2011 ; El hasinia
et al., 2019).

Les travaux de ma thèse de Doctorat étaient focalisés sur cette thématique dans la partie consacrée
aux sédiments de surface où j’ai précisé la nature, le type d’apport organique et les interactions
eaux/sédiments. L’étude menée en 2005 a montré, qu’à l’interface eau/sédiment dans la zone
septentrionale de la sebkha de Moknine, les eaux sont riches en azote et en phosphore et la MO

36
dissoute et celle sédimentée sont essentiellement d’origine bactérienne et phytoplanctonique. Le
taux de la chlorophylle(a) très élevé (Chairi, 2005) dans cette zone a dépassé les concentrations
attribuées par Wetzel en 1983 et le seuil de vigilance qui est de 200 µg/l.

1. Extraction des lipides simple et complexe

Les lipides sont des composés de la MO sédimentée insolubles dans l’eau mais solubles en milieu
organique (Cranwell, 1978). Ils jouent un rôle déterminant sur les propriétés physico-chimiques et
biologiques des environnements. Particulièrement abondants en milieu acide, ils peuvent
représenter jusqu'à 30% du carbone organique. Ils ont une origine principalement végétale et
bactérienne et peuvent également résulter de la biotransformation de résidus végétaux par les
microorganismes. Les lipides simples, directement analysables, sont constitués de très nombreux
composés, en particulier d’hydrocarbures (linéaires, ramifiés, cycliques ou aromatiques), d’esters
(cérides et stérides), de cétones (méthylcétones et cétones stéroïdiques), d’alcools (aliphatiques et
triterpéniques), de stérols, d’acides aliphatiques monocarboxyliques, dicarboxyliques, de
cétoacides, d’hydroxyacides, voire de divers acides aromatiques (Cranwell, 1978 ; Ishiwatari et al.,
2013, 2014). Les lipides complexes sont des molécules relativement peu solubles et de poids
moléculaire plus élevé que les lipides simples et devant être dégradés (chimiquement ou
thermiquement) en fin d'analyse. Cette fraction complexe peut représenter jusqu’à 60 % de l’extrait
lipidique total.

Dans mes travaux j’ai extrait cette fraction lipidique appelée matière organique extractible (MOE)
par différentes méthodes : extraction rapide, au moyen d’un soxhlet (LGO/FST, LGO/ETAP et
BioEMCo/ENSCP)1 et à l’aide d’un dispositif d’extraction (LGR/CERTE)2. Rappelant que les
sédiments sujets de cette extraction étaient immédiatement emballés dans une feuille d'aluminium
et étaient conservés congelés jusqu'à l'analyse. Les sédiments ont été soumis au tamisage humide
pour éliminer les débris grossiers ; la fraction <63µm a été séchée à 40 °C et utilisée pour
l'extraction et la purification par gravimétrie des lipides. Les tapis de cyanobactéries sus-jacent

1
LGO/FST : Laboratoire Géochimie Organique FST, LGO/ETAP : Laboratoire Géochimie Organique ETAP
BioEMCo/ENSCP : laboratoire Chimie Bio.Organique et Organique physique/Ecole Nationale Supérieure de Chimie
de Paris
2
LGR/CERTE : Laboratoire de Géoressources/CERTE

37
dans les carottes SM8, SM9 et SM11 ont été soigneusement séparés des sédiments sous-jacents et
également séchés à 40 ºC.

Dans les sédiments de la sebkha de Moknine, la teneur en MOE varie de 8 à 41en % COT (Chairi
et al., 2010). Dans la zone de Mahdia, cette teneur en MOE est entre 6 et 23% (Chairi, 2010). Dans
les embouchures du golfe de Tunis, MOE est estimée entre 1 et 10% (Chairi et al., 2019a). La
purification de cette fraction lipidique au moyen des colonnes de silice, silice/alumine ou bien par
SPE (C18) dans toutes les zones humides étudiées a donné un taux élevé des NSO compounds,
révélant ainsi l’abondance de l’apport terrigène et/ou une MO lignifiée (Chairi et al., 2010).

2. Des biolipides en géolipides : indicateurs pour retracer l’histoire

Les lipides sont aussi nommés biomarqueurs et sont largement utilisés comme des outils pour
évaluer l'origine et la distribution de la MO dans les sédiments de l'écosystème aquatique. Ils sont
spécifiques à la source et plus résistants à la dégradation bactérienne que beaucoup d'autres
composés biologiques (Pinturier-Geiss et al., 2002 ; Hu et al., 2009 ; Lammers et al., 2013). Par
rapport aux proxies géochimiques telles que l'abondance relative du carbone organique total et
l'azote total, les biomarqueurs peuvent fournir des informations détaillées sur l’origine de la MO
sédimentée (Hu et al., 2009 ; Xing et al., 2011 ; Ishiwatari et al., 2013 ; Pu et al., 2020). Il est
largement admis que les lipides à chaîne courte (n-alcanes C15-C20 et n-alcanols en C16-C20)
dans les sédiments indiquent une origine algaire (et/ou des bactéries photosynthétiques), alors que
les lipides à longue chaîne (n-alcanes C27-C33 et n-alcanols C24-C32) proviennent de plantes
supérieures (Meyers, 1997). Les n-alcanes de la chaîne moyenne (C21-C25) peuvent indiquer une
MO issue à partir de macrophytes aquatiques submergées et flottantes (Meyers et Ishiwatari, 1993
; Ficken et al., 2000). Les composés isoprénoïdiques hautement ramifiés (HBI), en particulier
C25HBI, peuvent indiquer l'apport de la MO à partir de diatomées (Volkman et al., 1997).

Ces biomarqueurs sont définis comme "composés organiques pouvant retracer les processus
géologiques et environnementaux" (Simoneit, 2005). Sous cette appellation sont regroupées
différentes catégories de composés, dont les lipides constituent une part importante (Meyers et
Teranes, 2002). Appelés "fossiles chimiques" (Eglinton et Calvin, 1967), ces molécules se
caractérisent par leur source biologique avérée, et qui reste évidente lorsqu’elles sont détectées
dans un substrat externe à l’organisme-source (sol, sédiment…), même après une dégradation
partielle (Meyers et Teranes, 2002). Les lipides s’avérant notablement résistants à la biodégradation

38
(Cranwell, 1984 ; Meyers et Ishiwatari, 1993 ; Meyers et Teranes, 2002), ils sont considérés de
bons indicateurs pour retracer l’histoire et les conditions de leur stockage dans le substrat dans
lequel ils sont archivés. Les différentes transformations subies par les lipides durant leur archivage
conduisent des "biolipides" synthétisés dans l’organisme vivant à des "géolipides" retrouvés dans
l’environnement. Les géolipides des environnements sédimentaires étudiés seront développés dans
les paragraphes qui suivent et on fait l’objet d’articles/publications signalés ci-dessous :

Chairi R., Derenne S., Abdeljaoued S., Largeau C., 2010. Sediment cores representative of the
contrasting environments in the salt flats of the Moknine continental sabkha (Eastern Tunisia):
sedimentology, bulk features of organic matter, alkane sources and alteration. Organic
geochemistry. 41(2010) 637-652.
Chairi R., 2018. Biomarkers on Sediments in a Highly Saline Aquatic Eco-system: Case of the
Moknine Continental Sebkha (Eastern Tunisia): Journal of Coastal Zone Management.
ENVIRONS-CI-17-376.
Chairi R., Derenne S., Largeau C. 2010. Alkylbenzene origin in recent sediments from the
hypersaline environment of Mokninesebkha. Tunisia. Rapport 39èmeCongrès de la CIESM. Venise
Mai 2010.
Chairi R., Largeau C., Derenne S. and Abdeljaoued S. 2006. Hydrocarbons studies in surface
sediments and surface water of an evaporator system: the Moknine sebkha. Acted of 4th
International Conference on Marine Waste Water Disposal and Marine Environment
2006(MWWD). Antalya, Nov. 6-10, 2006. 1-4p
Chairi R.et Belayouni H., 2006. Etude de la géochimie organique des sédiments de la zone
septentrionale d’un environnement évaporatoire de la Tunisie orientale : la sebkha de Moknine.
Impact des rejets de la station d’épuration. Revue Méditerranéenne de l’Environnement 1, 49-62.

39
 3. Domaine d’applications des biomarqueurs moléculaires
L’étude de composés indicateurs des milieux s’est largement développée depuis les années 1950-
1960, au cours desquelles ont été développés des outils analytiques tels que la chromatographie en
phase gazeuse couplée à la spectrométrie de masse (CG-SM, ou GC-MS en anglais) qui permet de
séparer, à l’échelle moléculaire, les composés issus d’un mélange de composés complexe et
d’accéder ainsi à leur identification (Evershed, 2008). Ainsi, aux composés linéaires ubiquistes (n-
alcanes, n-alcools, acides n-alcanoïques), dont la distribution permet de distinguer les plantes
vasculaires et non-vasculaires, s’opposent les composés cycliques dont la spécificité est plus
marquée. Dans cette catégorie sont classés les triterpénoïdes qui, par le rôle important qu’ils
semblent jouer dans les membranes cellulaires, sont présents dans tous les organismes vivants
(Simoneit, 1986 ; Ourisson, 1990). Bien qu’ils soient sujets à dégradation (Jacob 2003), les
terpénoïdes conservent leur squelette de base lorsqu’ils sont altérés, laissant ainsi la possibilité de
lever le voile sur leur origine (Peters & Moldowan, 1993 ; Ohkouch et al., 1997 ; Otto et Wilde,
2001 ; Simoneit, 2005, Ishiwatari et al., 2013, 2014, Walter et al, 2017).

La spécificité d’un composé s’exprime par sa valeur taxonomique : plus il est typique, plus il fournit
des renseignements en termes de classification. Selon Cronquist (1977), parmi les triterpénoïdes,
les triterpènes pentacycliques se livreraient à une même logique évolutive que les métabolites
secondaires sécrétés par les plantes (tannins, iridioïdes, alcaloïdes, bétalaïnes, flavonoïdes, …),
considérés comme étant les composés les plus indiqués pour des études chimiotaxonomiques
(Mannheimer,1999 et Jacob, 2003). Ainsi, la délicatesse de l’information apportée par les lipides
dépend de la famille de composés considérée (Fig.II.1).

Les intérêts et les applications des biomarqueurs sont nombreux, et touchent à des domaines variés.
Les premières utilisations des outils de géochimie organique ont été vouées à la recherche et la
caractérisation des énergies fossiles. Développées dès le début du 20éme siècle, elles ont concerné
l’étude des sources, de la maturité, des migrations et des indices d’altération du pétrole (Tissot et
Welte, 1984 ; Peters et Moldowan, 1993, Walter et al., 2017), mais aussi l’étude des sources de
charbon (Simoneit, 2005 ; Kvenvolden, 2008). Les utilisations, de l’outil moléculaire, se sont
ensuite diversifiées dès les années 1960 (Kvenvolden, 2008).

40
 Figure II.1. Représentation schématique de la répartition des marqueurs moléculaires.
(D’après Jeanneau, 2007)

Parmi les applications les plus largement répandues, l’étude des biomarqueurs présents dans les
archives sédimentaires comme notre cas d’étude qui s’intéresse à ces fossiles moléculaires dans
différentes zones humides. Je commencerai par l’étude des lipides linéaires dans les sédiments qui
permet d’estimer la proportion des apports terrestres en comparaison aux apports autochtones, à
l’aide de marqueurs de végétaux supérieurs, de l’activité microbienne et algaire et qui sera détaillé
dans le paragraphe concernant les n-alcanes. De plus, en déterminant des assemblages-types de
différents environnements, il est possible d’accéder aux conditions paléoenvironnementales
(Cranwell, 1981, 1982, 1984 ; Meyers, 2003 ; Simoneit, 2005, Chairi et al., 2010, Shanina et al.,
2018 ; Tewari et al., 2018 ; Pu et al., 2020)

La caractérisation de la pollution et la contamination de l’eau, de l’air et du sol passent aussi par

l’analyse des biomarqueurs, une fois de plus pour en tracer les sources mais également pour
souligner les éventuelles réactions, le transport et le devenir des composés. Parmi ces
contaminations, il est possible de tracer les apports anthropiques d’espèces chimiques organiques
et synthétiques, dont 70 000 sont utilisées à ce jour et dont le nombre augmente d’environ 1000 par
an (Simoneit, 1977, 2005, Colombo et al., 2005). Dans cette synthèse ce traçage sera basé sur
l’étude des hydrocarbures aromatiques mono et polycycliques.

Les biomarqueurs se voient aussi être l’objet de toutes les attentions dans les études archéologiques,
de par la variété d’informations qu’ils peuvent apporter. Ils peuvent attester des pratiques agricoles

41
passées ou délimiter des zones d’activités anthropiques (Jacob et al., 2008 ; Hjulström et Isakkson,
2009, Pu et al., 2020), préciser les organismes responsables de contaminations fécales (Bull et al.,
2002) indiquer le contenu de poteries culinaires anciennes (Evershed et al., 2004 ; Evershed, 2008),
la composition des substances d’embaumement (Buckley et al., 2004) ou de cosmétiques anciens
(Evershed et al., 2004). Les études isotopiques les complètent, en permettant la détermination des
régimes alimentaires (Evershed, 2008). Enfin, l’utilisation des biomarqueurs s’ouvre au domaine
de la cosmochimie organique, notamment pour les travaux visant à détecter l’existence d’une forme
de vie passée sur Mars (Simoneit, 2004) ou encore aux études judiciaires (Bull et al., 2009,
Finkelman et al., 2017). Dans cette synthèse, on se limitera à l’étude des biomarqueurs en se basant
sur les domaines d’application de la géochimie organique environnementale,
paléoenvironnemetale et la géochimie des hydrocarbures. La fraction lipidique dans les zones
étudiées était généralement subordonnée et parfois abondante. On est allé à décrypter les messages
de cette fraction pour détailler nos résultats et retracer l’histoire de la sebkha de Moknine, trouver
l’indice marin enfoui dans les systèmes de Moknine-Mahdia, décrypter les informations livrées sur
leurs sources, les précurseurs, les conditions du milieu et tracer l’action anthropogénique dans les
embouchures de la Méditerranée de même que l’interaction entre MON et les polluants organiques.

3.1. Etude des lipides simples

Cette étude rentre dans le cadre des travaux postdoctoral avec l’école de chimie de Paris VI au sein
du laboratoire Chimie Bio.Organique et Organique physique. Elle intéresse pareillement les
travaux des masters de Mahmoud N. (2018), Saidi H. (2019) et Triki A. (2020) menés au Centre
de Recherche et Technologies des Eaux (CerdiaSmartek) au sein du laboratoire de Géoressources
dans le cadre du PNR.

Au cours de mes travaux en thèse, j’ai étudié les hydrocarbures aliphatiques qui sont une classe
importante de biomarqueurs lipidiques et qui comprennent des chaînes de carbone saturées et
insaturées à chaînes linéaires et ramifiées. Les n-alcanes étaient analysés par chromatographie en
phase gazeuse. Ils dérivent des organismes terrestres et aquatiques. Leur structure basée sur des
liaisons C-H, les rend relativement résistants à la dégradation ce qui leur permet d’être stockés
pendant des milliers voir des millions d’années dans des bassins de sédimentation (Eglinton et
Logan, 1991 ; Pedentchouk et al., 2006 ; Pu et al., 2020) dont les concentrations dépendent de la

42
source biologique (Eglinton et Hamilton, 1967 ; Cranwell et al., 1987 ; Grimalt et Albaigés, 1987
; Meyers, 1997 ; Ficken et al., 2000).

3.2. Les conditions paléo-environnementales à travers les biomarqueurs

Les n-alcanes donnent des informations précieuses sur l'activité biologique passée et enregistrent
les processus hydrologiques qui peuvent être liés à la variation climatique.

Ces biomarqueurs ont été largement utilisés pour reconstruire les conditions paléo-
environnementales à partir d'une variété d'archives géochimiques organiques. En particulier, les
études sur les hydrocarbures aliphatiques dans les sédiments lacustres ont largement contribué à la
reconstruction paléoclimatique continentale (Eglinton et Eglinton, 2008 ; Pu et al., 2010 ;
Castañeda et Schouten, 2011 ; Nelson et al., 2013 ; Garcin et al., 2014 ; Zhang et al., 2004 ; Wang
et al., 2014, 2015). En général, les distributions de longueur de la chaîne d'hydrocarbures
biogéniques sont indicatives du biota qui les a produits. Les n-alcanes à haut poids moléculaire
(High molecular weight HMW : C29-C33), avec une forte prédominance du nombre de carbone
impair, proviennent généralement de plantes vasculaires terrestres (Eglinton et Hamilton, 1967 ;
Poynter et al., 1989 ; Rieley et al., 1991). Les n-alcanes de poids moléculaire moyen (middel
molecular weight MMW : C21-C27), avec une légère prédominance impaire, proviennent
généralement de macrophytes aquatiques, mais peuvent également provenir de plantes terrestres
(Poynter et Eglinton, 1990 ; Viso et al., 1993 ; Ficken et al., 2000). Les n-alcanes de faible poids
moléculaire (low molecular weight LMW : C15-C19), avec une forte prédominance impaire, sont
principalement produits par des algues et des bactéries (Han et Calvin, 1969 ; Cranwell et al., 1987,
Chairi, 2004, 2005). Ainsi, les conclusions sur l'origine et la livraison des hydrocarbures dans les
séquences de dépôts lacustres peuvent généralement être déduites de leurs caractéristiques de
longueur de chaîne. Néanmoins, l'identification des sources d'hydrocarbures aliphatiques dans les
sédiments peut parfois être un sujet compliqué et controversé. Différents chercheurs ont souvent
des opinions différentes, en particulier dans les écosystèmes lacustres dans lesquels la matière
organique a potentiellement de multiples sources (Meyers, 2003 ; Chairi et al., 2010 ; Liu et Liu,
2016).

3.3. Les n-alcanes dans les systèmes hypersalins du Sahel

L’étude des sources et des processus de dépôt d'hydrocarbures aliphatiques dans les sédiments
lacustres est manifestement importante pour améliorer leurs interprétations paléo-limnologiques.

43
Pour cette étude, nous retournons à des sebkhas du Sahel de la Tunisie (Moknine, Gotaia et Eliane)
dans lesquelles nous avons déjà étudié l'histoire du dépôt d'hydrocarbures aliphatiques au cours du
dernier millénaire (Chairi et al., 2010, Chairi, 2010, Chairi et al., 2019a). Notre objectif était
d'établir les schémas de distribution des hydrocarbures aliphatiques dans les sources potentielles et
de comparer ces données aux distributions d'hydrocarbures dans les sédiments de surface et en
subsurface des systèmes hypersalins et de tester ainsi la façon dont les hydrocarbures aliphatiques
sont conservés dans ces systèmes. En comparant leurs schémas de distribution, nous espérons
améliorer la compréhension des sources, des transports et de la préservation des hydrocarbures
aliphatiques dans un modèle hypersalin. De plus, notre étude a des implications pour toutes les
reconstructions paléo-environnementales qui emploient des hydrocarbures de marqueurs
aliphatiques dans les systèmes lacustres.

Les huit carottes qui ont été prélevées dans la sebkha de Moknine (SM8, SM9, SM10, SM11,
SM12, SM16, SM17 et SM18) figurent dans l’illustration (Fig.II.2). Celles des sebkhas de Gotaia
et Eliane et des oueds Rejel Chiba et oued Chiba dans la figure II. 7 et celles des embouchures du
golfe de Tunis dans la figure II.9.

La fraction des hydrocarbures aliphatiques a été analysée en utilisant le Chromatographe en phase

gazeuse (série HP 5880A) pour la détection des composants de celle-ci et par GC-MS (GC
Technologie 6890 N, Agilent 5973 Spectromètre de masse) étant donné que c’est une technique
plus performante et puissante largement utilisée dans la précision des composés chimiques qui au-
delà de la simple détection permet de qualifier et quantifier les composants même s’ils sont en
trace. La GC-MS est présentée comme étant la référence absolue des analyses dans certains
domaines.

44
 Figure II.2. Localisation des carottes
dans le système évaporatoire de Moknine (Chairi et al., 2010).

a- Le transect sud-ouest de la sebkha de Moknine

Des différences éminentes sont relevées dans la distribution des n-alcanes pour la carotte SM16
parmi les trois faciès détritiques (sable, silt-sableux et argile-silteuse). Les n-alcanes des sections
supérieures formées par le faciès sableux montrent une distribution bimodale avec des maximums
d'intensité comparable à C18 – C19 et à C25. La distribution des n-alcanes <C22 ne montre aucune
prédominance de nombre impair ou pair de carbone. Une telle répartition indique une origine
bactérienne. Il a été considéré, dans un nombre d'études, que la dégradation microbienne est
associée à une baisse marquée (voire une disparition) de la prédominance impaire dans les n-
alcanes qui se produisent dans les organismes de source primaire (Quénéa et al., 2006). Les
bactéries produisent généralement des n-alcanes à chaîne courte (<C22) et sans prédominance
marquée (Cranwell et al., 1987 ; Fourçans et al., 2004 ; Fang et al., 2006). La plupart des
microalgues produisent des n-alcanes impairs à chaîne courte avec des maximums à C15, C17 ou

45
C19 et peu ou pas de composés (> C23) (Clark et Blumer, 1967 ; Gelpi et al., 1970 ; Cranwell et
al., 1987 ; Meyers et Ishiwatari, 1993 ; Wilsona et al., 2001).

En conséquence, la distribution des composés <C22 dans le faciès sableux peut refléter la synthèse
de «novo» alcanes issus des bactéries, ainsi qu’une dégradation bactérienne des hydrocarbures
possiblement hérités des microalgues.

Les n-alcanes à chaine longue (C23 à C33) avec un maximum généralement à C27, C29 ou C31
sont typiques pour les cires épicuticulaires, alors que, les alcanes <C20 sont pratiquement absents
dans ces cires (Eglinton et Hamilton, 1967 ; Meyers et Ishiwatari, 1993 ; Chikaraishi et Naraoka,
2003). Cette prédominance impaire/paire prononcée se reflète dans des valeurs élevées,
généralement de 5 à 10, pour le « Carbon Preference Index (CPI) » calculé selon Bray et Evans
(1961). La longue chaîne, C24–C33, n-alcanes dans les niveaux sableux de la carotte SM16
exprime une prédominance des C à nombre impair issus des plantes supérieures et une dégradation
bactérienne faible. Cette répartition est similaire à la résistance des n-alcanes à la dégradation
microbienne et à une chaîne à nombre de carbone croissant (Johnson et Calder, 1973 ; Meyers et
Ishiwatari, 1993 ; Sun et Wakeham, 1994 ; Sillman et al.,1996).
La zone où SM16 a été collectée se caractérise par une végétation de faible densité formée de plante
halophyte de Salicorne arabica. Une étude récente des plantes et des sédiments des marais salants
de Maine (USA) a montré la production, par Salicorne Europa, de n-alcanes ayant les
caractéristiques typiques des hydrocarbures de plantes supérieures, avec un maximum à C25
(Tanner et al., 2007). De plus, ces composés peuvent apporter une contribution majeure aux
hydrocarbures aliphatiques dans ces sédiments de marais salants, même lorsque S. Europa est une
espèce subordonnée (Tanner et al., 2007). En conséquence, la longue chaîne, principalement des
n-alcanes de nombre impair maximisant à C25 dans la section de surface et les autres sections du
faciès sableux de SM16 correspondrait principalement à des hydrocarbures originaires de Salicorne
arabica. La répartition des n-alcanes dans le faciès silto-sableux de SM16 est bimodale et rappelle
celle discutée ci-dessus pour le faciès sableux. Cependant, (i) l’abondance relative des n-alcanes à
chaine longue par rapport aux composés <C22 est faible et (ii) la prédominance de l’imparité est
moins prononcée dans la gamme C24 – C33 (CPI : 1,4 contre 2,1). Cette disparité reflète une baisse
relative des n-alcanes dérivés de cires végétales supérieures et une dégradation bactérienne plus
forte de ces composés. Le faciès argilo-limoneux de la base de la carotte SM16 montre une

46
distribution unimodale avec un maximum dans la gamme C17-C19 et une répartition centrée entre
C15 et C21, sans prédominance d’imparité. La répartition des n-alcanes <C22 est similaire à celle
des sections sus-jacentes et indique, comme discuté précédemment, une contribution des
hydrocarbures bactériens. La contribution des n-alcanes des cires des plantes supérieures et la
dégradation par les bactéries se dégagent par la présence modeste de composés > C22 avec une
faible prédominance impaire / paire dans la gamme C27 – C31 (Fig. II.3). Les résultats obtenus
pour les différentes sections de SM17 et SM18 sont examinés ci-dessous et comparés aux
observations précédentes pour SM16.

Figure II.3. Sédimentologie et distribution des n-alcanes dans les faciès sableux (A)
sableux / limoneux (B) et limoneux /argileux (C) de la carotte SM16. (Chairi et al., 2010).
Le faciès silto-sableux au sommet de SM17, est comparable à celui au milieu de SM16. Ce faciès
reflète le dépôt dans une zone intermédiaire recevant un matériau détritique relativement grossier.
Il s'agit de la position actuelle de la carotte SM17 et de la position de SM16 lorsque le comblement

47
progressif de la sebkha était moins marqué. Des distributions bimodales très proches des n-alcanes
ont été observées dans ces sections de SM16 et SM17 (Fig.II .3. B) et les composants à longue
chaîne présentent la même valeur de CPI (environ 1,4 dans la gamme C24 – C33).

Le faciès le plus fin, c'est-à-dire le faciès argilo-limoneux à la base des trois carottes et le faciès
limoneux au sommet de SM18 résultent d'un dépôt en position distale, avec un apport prédominant
de matériel détritique fin. Cela correspond à la position actuelle de SM18 et à la position passée de
SM16 et SM17, c'est-à-dire, au moment où la sebkha était plus large. Les n-alcanes présentent une
distribution unimodale similaire pour toutes les sections centrales correspondantes (Fig.II.3 C).
Une telle distribution reflète une contribution majeure des alcanes d'origine bactérienne. Il existe
également une contribution substantielle des n-alcanes dérivés de cires végétales supérieures, en
particulier dans les sections basales de SM17. En accord avec leur résistance relativement élevée,
ces hydrocarbures à longue chaîne ont subi une dégradation bactérienne modérée et présentent des
CPI d'environ 1,8 dans la gamme C24 – C33.

Dans l'ensemble, les observations ci-dessus pour les carottes SM16, SM17 et SM18 indiquent que
la distribution des n-alcanes est corrélée avec le faciès sédimentaire dans ce transect. La diminution
de la taille des particules semble être principalement associée à une diminution de la contribution
relative des n-alcanes à longue chaîne des cires végétales supérieures par rapport aux n-alcanes
bactériens.

b- Transect nord-ouest et influence du rejet d'eau traitée

La carotte SM12 est caractérisée par un faciès argilo-limoneux homogène et des distributions de
n-alcanes similaires tout le long du profil sédimentaire, comme le montrent les figures II.4A et
II.4B pour les sections de 10–18 et 90–100 cm. Les n-alcanes dans ce profil présentent des
distributions à peu près unimodales, avec un maximum dans la gamme C16–C20. Il y a également
une contribution substantielle de composés à longue chaîne de carbone de C22–C25 et une
prédominance des impaires dans la gamme C27–C31. Le profil de SM12, comme SM18, se trouve
en position centrale et les deux zones présentent les mêmes caractéristiques générales (inondées
temporairement, couvertes d’halite en été et rétention d’eau interstitielle). Cependant, en raison de
la topographie, la zone SM12 est légèrement plus profonde que SM18 et le faciès argileux le plus
fin se trouve tout le long du profil. Quelques similitudes dans la distribution des n-alcanes étaient
observées entre SM12 et SM18 (Chairi et al., 2010), néanmoins il existe trois différences: pour

48
SM12 (i), le maximum s'étend sur une gamme un peu plus large (C16–C20 au lieu de C17–C19),
indiquant des différences dans l'apport d'hydrocarbures bactériens, (ii) des pics relativement
intenses se produisent pour n-C22 et n-C24 et les composants pairs prédominent dans la gamme
C21–C24 [la prédominance paire dans certains extraits de sédiments de n-alcanes à chaîne
moyenne (Grimalt et Albaigès, 1987) est communément attribuée à l'activité microbienne, bien que
son origine ne soit pas clairement établie] et (iii) il y a une abondance relative plus élevée de n-
alcanes > C22, reflétant une plus grande contribution de composés de cires des végétaux supérieurs,
y compris un pic intense pour le n-C22. Cette dernière caractéristique peut refléter certaines
différences dans les sources d'hydrocarbures à chaîne longue à partir des cires.

La carotte SM10 correspond aux mêmes caractéristiques environnementales générales que SM12,
à l'exception d'une position un peu moins distale et d'une profondeur légèrement inférieure en
dessous du niveau de la mer ; d'où la présence d'un faciès silto-sableux au sommet et un faciès
limono-argileux à la base. Aucune différence significative n'est apparente pour la distribution des
n-alcanes entre ces deux faciès dans les différentes sections de SM10, à l'exception de l'abondance
relative de C24. Les mêmes distributions, à peu près, unimodales et les mêmes caractéristiques
générales sont observées par rapport à SM12, mais la prédominance égale dans la gamme C21–
C24 est plus prononcée.

Le sommet du profil SM9 correspond à une boue sableuse de 15cm d'épaisseur issue des apports
de la station d'épuration, depuis sa mise en service, sur le bord nord-ouest de la sebkha en 1983.
Elle se caractérise par une distribution des n-alcanes nettement différente des sections sableuses
sous-jacentes (Fig.II.5).

49
 Figure II.4. Sédimentologie et distribution des n-alcanes dans les sédiments
de surface (A) et les sédiments profonds (B) du profil SM12 (Chairi et al., 2010).

Cette distribution reflète les caractéristiques actuelles de la zone où la carotte a été collectée à
savoir : (i) l'influence de l'eau rejetée par la station d'épuration qui inonde en permanence la zone
SM9 et (ii) la présence d'un tapis de cyanobactéries dense de 3 cm d'épaisseur. L'extrait lipidique
total de ce tapis représente 14% du COT et la fraction hydrocarbonée aliphatique représente 10%
de l'extrait. Des études antérieures sur les alcanes dans un certain nombre de cultures de laboratoire
de cyanobactéries et dans des tapis microbiens à dominance de cyanobactéries provenant de
différents environnements ont montré la présence des n-alcanes à chaîne courte dans la gamme
C16–C22, avec des maximums à C17 (dans la plupart des cas) ou C20 (Shiea et al., 1990 ;
Matsumoto et al., 1993 ; Jungblut et al., 2009). Des méthyl-alcanes à chaîne courte ont également
été fréquemment détectés dans de tels tapis, en particulier les hexadécanes et les heptadécanes à
chaîne moyenne (Shiea et al., 1990 ; Matsumoto et al., 1993 ; Kenig et al., 2002 ; Fourçans et al.,
2004).
50
 Figure II.5. Sédimentologie et distribution des n-alcanes dans les sédiments de surface (A),
les sédiments profonds (B) du profil SM9 et du tapis de cyanobactérie (Chairi et al., 2010).

Certaines espèces de cyanobactéries peuvent générer un mélange très simple d'alcanes, parfois
presque exclusivement composé d'un seul produit comme le n-heptadécane (Winters et al., 1969).
Cependant, les tapis de cyanobactéries correspondent à des communautés microbiennes complexes
qui comprennent, en plus des cyanobactéries, un certain nombre de bactéries de différents types
(photosynthétiques, chimiotrophes et hétérotrophes). En conséquence, comme observé ici, les
alcanes dans les extraits de tapis de cyanobactéries présentent généralement une distribution plutôt
complexe. En effet, le tapis de cyanobactéries sus-jacent le profil SM9 présentait une distribution
bimodale des n-alcanes (Fig.II.6) avec un maximum à C17 et un maximum dans une gamme plus
large de C22-C27. Les alcanes méthylés dans l'extrait du tapis de cyanobactéries sont
principalement représentés par deux pics mineurs correspondant au méthyl hexadécane et au
méthyl heptadécane. Les n-alcanes dans la vase au sommet du profil présentent une distribution à
peu près trimodale. Le maximum entre C16 et C20, sans prédominance impaire ou même
significative, reflète les contributions de bactéries et cyanobactéries (Jungblut et al., 2009). Pour

51
les composés > C20, la distribution complexe est probablement le résultat des contributions des
alcanes des plantes supérieures ainsi qu'une dégradation bactérienne modérée pour ces composés
à longue chaîne. Les sections sous-jacentes de SM9 montrent une distribution proche de celle du
SM10 bien que SM9 se caractérise par des faciès différents (Chairi, 2005).
c- Zone orientale marécageuse
Les sédiments dans la zone orientale marécageuse où SM8 était collectée, sont également
recouverts d'un tapis de cyanobactéries (Chairi, 2004, 2005) épais. Les lipides totaux de ce tapis
représentent 17% du COT et la fraction hydrocarbonée aliphatique 11% de l'extrait. Les
hydrocarbures dans le tapis de cyanobactéries recouvrant SM8 montrent une distribution
unimodale de C20–C32, sans prédominance impaire avec un maximum à C23–C25 (Fig.II.6). Les
composés les plus courts, dans la gamme C15-C18, montrent une prédominance des n-alcanes
impair C15 et C17.

Figure II.6. Sédimentologie et distribution des n-alcanes dans le tapis de cyanobactéries (A)
et dans les faciès limoneux / argileux (B) et limoneux / sableux (C) du profil SM8 (Chairi et al., 2010).

52
Comparés à SM9, les alcanes méthylés ne sont que des composés mineurs de la fraction alcane du
tapis en SM8. Toutes les sections du profil SM8 montrent une distribution de C17 à C33 sans
prédominance ni maximum impair ou pair à C23–C25 (Fig. II.6 B et C). Une telle distribution
indique que les hydrocarbures du tapis de cyanobactéries prédominent visiblement sur les
composés issus des végétaux supérieurs. Cependant, une dégradation microbienne des alcanes à
chaîne la plus courte hérités du tapis, c'est-à-dire les plus sensibles à la dégradation, est observée
dans la gamme C15–C18. Il y a une végétation relativement dense de plantes supérieures dans la
zone où SM8 a été collectée. Néanmoins, les alcanes à longue chaîne éventuellement dérivés de
ces plantes sont nettement dominés par les hydrocarbures issus des cyanobactéries et aucune
prédominance impaire/paire n'est présente dans la gamme C27-C33. Dans SM8, la même
distribution est observée dans tout le profil. En effet, les conditions environnementales n'ont pas
changé de façon significative ; cette zone marécageuse est inondée en permanence, n'est pas
affectée par l'envasement et ne reçoit pas directement de matériel détritique des oueds,
contrairement aux zones occidentales de la sebkha.

d- La zone nord-ouest influencée par l’oued Soltane

L'analyse du tapis de cyanobactéries recouvrant le profil SM11 a montré une teneur totale en lipides
de 13% de COT avec des hydrocarbures aliphatiques représentant 23% de l'extrait lipidique. La
fraction hydrocarbonée présente un pic intense pour le n-heptadécène (même intensité que le n-
heptadécane). Une telle caractéristique a été observée dans certains tapis de cyanobactéries (Boon
et de Leeuw, 1987 ; Dembitsky et al., 2001 ; Rontani et Volkman, 2005) bien que les alcènes soient
souvent présents en abondance beaucoup plus faible que les alcanes (Pearson et al., 2007), comme
observé dans la présente étude pour les tapis SM9 et SM8. La distribution des n-alcanes dans le
tapis de cyanobactéries au sommet de SM11 (Fig. II.7 A) est caractérisée par deux différences
marquées par rapport au tapis du profil SM8 (Fig.II.7 A) : (i) le maximum en C23– C25 est
beaucoup moins prononcé par rapport aux composés plus courts et (ii) ces derniers présentent, en
plus de C15 et C17, un pic intense pour C16.

53
 Figure II.7. Sédimentologie et distribution des n-alcanes dans le tapis de cyanobactéries (A) et dans les
faciès limono-sableux (B) et sablo-limoneux (C) du profil SM11 (Chairi et al.,2010).

De plus, contrairement au profil SM8, les hydrocarbures du tapis ne sont pas prédominants dans
les alcanes des sédiments sous-jacents. En conséquence, dans le profil SM11, les hydrocarbures
générés in situ à partir du tapis de cyanobactéries apportent une contribution relativement mineure
à la fraction alcane. En fait, les n-alcanes dans les sections supérieures du profil SM11, c'est-à-dire
dans les faciès limono-sableux, présentent une distribution unimodale avec un maximum à C18–
C20 et une certaine prédominance impaire/paire pour les composés à chaîne longue C25 – C31
(Fig.II. 7B). Cette distribution reflète une contribution majeure des alcanes d'origine bactérienne,
ainsi qu'une contribution substantielle des hydrocarbures cireux modérément dégradés des plantes
supérieures. Ces derniers résultent de détritus rejetés par l’oued Soltane qui influencent directement
la zone SM11 et des Phragmites poussant dans la zone. Cependant, l'ancienne source devrait
prédominer puisque les alcanes produits par les phragmites présentent des maximums en C27 et
C29 (Ogura et al., 1990 ; Ficken et al., 1998), alors que, ces deux composés ne sont pas
particulièrement abondants ici. Les n-alcanes dans le faciès sablo-limoneux à la base du profil

54
SM11 présentent une distribution bimodale (maximum à C25 et à C18) avec une prédominance
paire/impaire dans les longues chaînes (Fig.II.9 C). La comparaison avec les faciès silto-sableux
sus-jacents montre globalement le même type de sources pour les n-alcanes. Cependant, deux
différences quantitatives marquées apparaissent : les composés à longue chaîne présentent une
abondance relative beaucoup plus élevée et une prédominance impaire / paire plus prononcée (CPI
2.1 au lieu de 1,75 dans la gamme C24-C31). Ces caractéristiques indiquent une plus grande
contribution des n-alcanes des cires végétales supérieures et un degré moindre de dégradation
bactérienne pour ces hydrocarbures dans les faciès sablo-limoneux. Comme discuté ci-dessus, ce
faciès s'est déposé lorsque la sebkha était plus large et que la zone SM11 n'était probablement pas
exclusivement influencée par les apports de l'Oued Soltane.

3.4. Les n-alcanes dans les embouchures du golfe de Tunis

Deux modes de distribution différente des n-alcanes sont remarqués dans les chromatogrammes
des lipides d’oued El Bey et oued Abid. Une distribution unimodale avec un maximum en C18 et
une répartition centrée entre C15 et C21, sans prédominance d’imparité dans la figure (II.8 a)
d’oued El Bey. La répartition des n-alcanes <C22 reflète une contribution des hydrocarbures
d’origine bactérienne. La contribution des n-alcanes des cires des plantes supérieures et la
dégradation par les bactéries sont exprimées par la présence modeste de composés > C22 avec une
faible prédominance impaire/paire dans la gamme C27 – C31 (Fig.II.8 a).

Dans la figure (II.8.b), les n-alcanes >C22 sont plus abondants et l’imparité est plus prononcée.
Les n-alcanes à chaine longue (C23 à C40) avec un maximum généralement à C29, C31 ou C33
sont typiques pour les cires épicuticulaires, (Eglinton et Hamilton, 1967 ; Meyers et Ishiwatari,
1993 ; Chikaraishi et Naraoka, 2003). La longue chaîne, C23 – C40, n-alcanes dans les sédiments
sableux d’oued Abid exprime une prédominance des C à nombre impair issus des plantes
supérieures et une dégradation bactérienne faible. Les n alcanes <C22 sont typiques dans leur
distribution que dans le cas d’oued El Bey et rappelle la distribution d’origine bactérienne trouvée
dans les sédiments de la sebkha de Moknine (Chairi et al., 2010).

55
 Figure II.8. Chromatogrammes des n-alcanes des sédiments
aux embouchures des oueds El Bey et Abid (Mahmoud, 2018).

3.5. Isoprénoïdes
L’abondance relative d'isoprénoïdes peut servir d'indicateurs de certains précurseurs biologiques.
En effet, les isoprénoïdes C25 régulier et C30 irrégulier ont été attribués à des archéobactéries
(Logan et al., 2001). Cependant on ignore encore la provenance biologique de séries pseudo-
homologues de 5-méthylalcanes ayant un nombre pair de carbone, 3-méthylalcanes et 2-
méthylalcanes (Logan et al. 2001, Mycke et al., 1988). Des lipides bactériens cireux avec des
ramifications méthyliques similaires ont été signalés par une bactérie thermophile (Pond et al.,
1986). Cependant, il est tout à fait possible que ces molécules soient des artéfacts anthropiques car
une troisième série majeure d'alcanes ramifiés, plus tard identifiés comme 5,5-diéthylalcanes
(Kenig et al., 2005 ; Logan et al., 2001) se sont récemment révélés être dérivés de plastiques de
polyéthylène souvent utilisés comme sacs d'échantillons (Brocks et al., 2008).

56
Les paramètres ou les rapports déterminés à partir des abondances de n-alcanes et d'isoprénoïdes
peuvent également être utilisés pour donner des informations sur le paléo-environnement au
moment du dépôt de matière organique. Les isoprénoïdes dérivés de la chaîne latérale phytyle, par
exemple la chlorophylle peut refléter l'état d'oxydoréduction des environnements. Le pristane étant
le produit d'un processus de décarboxylation en milieu aérobie, le rapport pristane/phytane (rapport
Pr/Ph) dans les environnements oxydants est généralement>1 et dans les environnements
réducteurs <1 (Powell et McKirdy, 1973 ; Hunt, 1996). Les rapports Pr/Ph très faibles mesurés
dans la sebkha de Moknine ont été attribués à un paléoenvironnement réducteur et hypersalin
(Chairi, 2004 et Chairi et al., 2010). Des tendances similaires dans les rapports Pr /Ph ont été
rapportées pour les sebkhas Gotaia et Eliane (Chairi, 2010) attribuées à des conditions réductrices
parallèlement à une salinité accrue des eaux.

Le rapport Pr/Ph est de 1.12 à l’embouchure des oueds Majerda et Abid où règnent des conditions
oxydantes dans un sédiment sableux. Le rapport Pr/Ph passe à 0.52, dans l’embouchure des oueds
El Bey et Méliane et au canal Khlij, reflète des conditions plutôt réductrices dans une vase sableuse.

Le squalane et le docosane C22 sont détectés dans la sebkha de Moknine cependant ils sont absents
dans les sebkhas de Goatai et Eliane et dans les embouchures du golfe de Tunis.

3.6. Composés non résolus : UCM

La fraction hydrocarbonée saturée et insaturée non aromatique est dominée par les n-alcanes. Une
contribution minimale des isoprénoïdes (phytane et pristane) est observée dans la série des alcanes
ramifiés. La distribution des n-alcanes illustrée dans la figure (II.9) des trois sections des carottes
SM8 et SM11, des tapis de cyanobactéries et l’embouchure d’oued Méliane (Fig.II.8. a) montre un
«hump» significatif des composés non résolus (UCM). Ce dernier, généralement est le symbole
d’une contamination par des produits pétroliers. Cette hypothèse sera confirmée ou non par l’étude
des stéranes et hopanes dans le paragraphe «6. Triterpanes ».

57
Figure II.9. Chromatogrammes des hydrocarbures aliphatiques des sections des carottes SM8 et SM11 et
du tapis de cyanobactéries (Chairi et al., 2010).

La zone orientale immergée de la sebkha de Moknine où SM8 est collectée, est loin de toute
pression anthropique environnementale. Par conséquent, les UCM dans les échantillons SM8
refléteraient plutôt la complexité de la communauté microbienne. Comprenant en plus des
cyanobactéries, un certain nombre d’autres bactéries dans les tapis de cyanobactéries et qui sont
responsables de la dégradation intense de la matière organique telle qu’observée dans les sédiments
(par exemple Venkatesan et Kaplan, 1982), les sols (Quénéa et al., 2004) et les expériences de
dégradation de MO en laboratoire (da Cruz et al., 2008).

4. Reconstitution paléoclimatique au moyen des n-alcanes

Les n-alcanes sédimentaires dérivant des cires des plantes supérieures ont été utilisés pour
reconstituer les variations passées de la paléoclimatologie et des enregistrements de la paléo-
végétation par certains auteurs (Litwin et al., 2013 ; Jia et al., 2015). La cire de feuilles de plantes
supérieures peut être facilement transportée sur de longues distances, son contenu ou son
accumulation indique une variation paléoclimatique (Hughen et al., 2004, Zhang et al., 2006). Les
variations de la végétation dans certaines régions sont fortement influencées par les variations
climatiques et les gradients topographiques, car de nombreuses plantes terrestres sont fortement
liées à la température et à l'humidité des environnements spécifiques. De nombreuses études ont
montré que les changements de végétation sont directement associés à des changements dans les
conditions climatiques locales (Takahara et al., 2010 ; Lim et al., 2013 ; Li et al., 2016, Pu et al.,
2020). Cette étroite association entre les changements climatiques et les changements de végétation

58
a peut-être eu un effet global (Litwin et al., 2013, Pu et al., 2020) et peut-être même eu un impact
sur la vie humaine pendant la période anthropocène (Alley et al., 2003,).

Une période caractérisée par «une influence de l'être humain sur la biosphère qui a atteint un tel
niveau qu'elle est devenue une «force géologique» majeure capable de marquer la lithosphère».

Les changements de paléo-végétation ont été suivis et interprétés en termes de variation

paléoclimatique à l'aide de différents proxies organiques, comme l’isotope de carbone de la matière
organique (δC13org), des n-alcanes et leur isotope de carbone (δC13ALK) dans divers
environnements (Zhang et al., 2004 ; Zech et al., 2012). D’autres auteurs ont utilisé des index plus
faciles à déterminer et moins coûteux, cependant, il reste à discuter de tels paramètres. Les n-
alcanes LMW sont plus enclins à la dégradation que leurs analogues HMW (Meyers et Ishiwatari,
1993), ce qui nécessite des processus analytiques plus performants pour des faibles concentrations
de LMW. Toutefois, En raison de l'intérêt croissant pour l'utilisation des n-alcanes LMW pour la
reconstitution des paléoclimats, il est essentiel que des méthodes analytiques soient disponibles, ce
qui entraîne une récupération efficace et une quantification précise.

En outre, les distributions d'hydrocarbures aliphatiques sédimentaires peuvent être utilisées pour
dériver une variété d'indices moléculaires, y compris l'indice de préférence au carbone (CPI), la
longueur moyenne de la chaîne (ACL), la proportion de composants aquatiques (PAQ) et le rapport
entre les homologues non saturés et saturés, qui sont des approximations particulièrement utiles
pour des paramètres paléo-environnementaux spécifiques (Meyers, 2003 ; Ouyang et Coll., 2015).
Un élément commun, à pratiquement toutes les études, est qu'ils sont basés sur l'hypothèse générale
que les n-alcanes sont suffisamment résistants aux altérations postérieures à la déposition pour
servir de proxies paléo-environnementaux fiables. Cette hypothèse a été bien traitée sur les zones
émergée et immergée de la sebkha de Moknine (Chairi, 2018) où à travers 18 stations dans ce
bassin nous avons dégagé une idée sur le climat de la région du sahel de la Tunisie.

Les résultats sont illustrés sur le tableau 2 et les index choisis ont été calculés en se référant aux
formules ci-dessous.

59
L’indice ACL est utilisé comme un indicateur pour les changements de la végétation et d’un climat
plus chaud car les plantes produisent des n-alcanes à chaine longue (HMW) dans ce climat. L'ACL
est très utile dans l'identification des changements environnementaux d'un écosystème particulaire
(Jeng, 2006). L’ACL des lipides végétaux conservés dans divers sédiments (lac, océan, sol ...) a
été largement adopté pour reconstituer les changements passés du climat et de l'environnement à
la fin du Quaternaire (Bai et al., 2009 ; Zhou et al., 2010 ; Huang et al., 2014, Wang et al., 2015,
Chairi, 2018).

60
 Tableau 2 : Paramètres et indices de la fraction organique des sédiments de surface de la sebkha Moknine.
Organic carbon and hydrocarbon parameters in surface sediments from Moknine sebkha (Chairi, 2018).

references OC EOM%OC F1(mg/kg) CPI ACL TAR NAR LMW/HMW TMD Pr/Ph nC17/nC29 C29/C30 C27/C29
ssmk1 0,91 22 1370 1,63 28,55 0,11 0,7 0,9 0,79 1,73 4,21 1,21 0,87
ssmk2 1,22 26 1430 1,45 28,5 0,15 0,75 0,9 0,83 1,5 4,53 1,05 0,84
ssmk3 1,95 21 1470 1,46 28,45 0,12 0,71 0,9 0,79 1,7 3,75 0,98 0,82
ssmk4 1,52 23 1450 1,45 27,54 0,11 0,72 0,87 0,79 1,53 2,75 0,94 0,75
ssmk5 2,19 16 786 1,18 27,25 0,11 0,75 0,89 0,79 1,62 3,85 1,08 0,66
ssmk6 1,62 14 1900 1,39 28,1 0,24 0,71 0,89 0,9 1,45 5,3 0,76 0,66
ssmk7 4,90 19 2670 1,71 27,21 0,29 0,78 1,13 0,35 1,71 3,52 0,11 0,70
ssmk8 1,74 18 1630 1,59 27,15 0,27 0,8 1,1 0,75 0,71 1,94 0,97 0,78
ssmk9 1,13 19 1610 2,47 27,18 0,27 0,79 1,2 0,8 0,89 1,9 1,15 0,82
ssmk10 1,48 2 3700 3,69 28,55 0,29 0,78 1,05 0,69 0,38 1,83 0,98 0,87
ssmk11 0,50 6 2170 3,11 28,65 8,5 0,87 0,28 3,8 0,50 0,66 0,21 0,25
ssmk12 0,47 5 1150 3,65 28,45 9,11 0,9 0,3 4,2 0,50 0,45 0,15 0,37
ssmk13 0,52 4 1040 2,40 28,52 9,2 0,83 0,35 4,2 0,4 0,48 0,25 0,48
ssmk14 0,60 12 800 3,28 28,48 8,5 0,8 0,28 3,8 0,38 0,52 0,6 0,18
ssmk15 0,46 12 1090 3,45 28,6 9,4 0,9 0,32 4,3 0,25 0,2 0,11 0,15
ssmk16 0,74 8 910 4,00 28,65 8,45 0,82 0,15 3,8 0,32 0,23 0,18 0,38
ssmk17 0,86 12 1300 3,51 28,5 7,25 0,75 0,12 3 0,30 0,28 0,45 0,24
ssmk18 0,99 6 790 3,24 28,52 9,75 0,92 0,2 5 0,20 0,34 0,6 0,41

[OC: total organic carbon, EOM: total extract hydrocarbon, F1: aliphatic hydrocarbon fraction, CPI: Carbon preference index,
TMD: Terrigenous Marine Discriminant, NAR: Natural n-alkane ratio, ACL, LMW/HMW, Pr: pristane, Ph: Phytane, C29/C30
hopane, C27/C29 steranes, nC17/nC29 alkanes]

Dans la zone émergée, le rapport NAR est proche de 1, l’index CPI varie de 3 à 4, l’index ACL est
d'environ 28,5 et le rapport TMD varie entre 3 et 5. Tous les indices indiquent une contribution des
composants végétaux supérieurs et une dégradation bactérienne modérée (tab.1). Les échantillons
prélevés à proximité de la station d'épuration au Nord de la sebkha sont caractérisés par ces valeurs
d'indice (CPI : 1,18-1,79, NAR : 0,7-0,78, TMD : 0,7-0,9, ACL : 27,21-28,55), ce qui correspond
à la contribution majeure des hydrocarbures aliphatiques issus des cyanobactéries. Au Nord-Ouest,
(CPI : 1,71, ACL : 27,21, TMD : 0,35, NAR : 0,78), dans la zone marécageuse (CPI : 1,05, ACL :
27,3, TMD : 0,3, NAR : 0,75) et au centre, les données des indices prouvent que la zone immergée
est dominée par la biomasse originelle de la sebkha (cyanobactéries et bactéries).

CPI et ACL sont tous deux obtenus à l'aide des données sur les n-alcanes dérivées de plantes
supérieures. Par conséquent, la corrélation entre ces deux index devrait être positive (Jeng, 2006).
Les valeurs du coefficient de de corrélation entre les valeurs CPI et ACL montre qu'il n'y a pas de

61
corrélation entre CPI et ACL (r = 0,023 dans la zone émergée et 0,25 dans la zone submergée) ; ce
qui peut être attribué au fait que CPI et ACL ne provenaient pas de la même source de plantes
supérieures. Il a été également noté que lorsque deux (ou plus) n-alcanes caractérisés par des
valeurs d’indice différentes ACL ou de CPI, leurs valeurs de rapport varient généralement de
manière non linéaire et disproportionnée (Jeng, 2006).

Tous les indices calculés prouvent l'origine mixte de la matière organique sédimentée dans la
sebkha de Moknine. L'indice ACL indique qu'environ 150 ans (1 mm / an de dépôt de sédiments
dans la sebkha), le climat est aride dans cette région.

5. Triterpanes
5.1. Triterpènes pentacyclique : Hopanes
Les terpénoïdes renferment une diversité de structures dont les petites molécules sont le menthol
ou les biopolymères comme le caoutchouc et dérivent à partir d'une molécule de base commune à
l'ensemble des organismes vivants : l'isopentényle pyrophosphate (H2C=C(CH3) -CH2-CH2-OP2O63).
Les triterpènes pentacycliques, sont des molécules composées de trois motifs terpéniques (soit six
motifs isopréniques) agencés, soit en cinq cycles à six carbones, soit en quatre cycles à six carbones
et un cycle à cinq carbones (Fig.II.10). Les hopanoïdes proviennent principalement du
bactériohopanetétrol qui joue le rôle de renforçateur membranaire dans les organismes procaryotes
(Rohmer, 1993 ; Ishiwatari et al., 2014). Les hopanoïdes contenant une série allant de C22 à C30
indiquent une activité microbienne (Ishiwatari et al., 2014).

62
 Figure II.10. Transformation des hopanes dans les sédiments (Peters et Moldowan, 1993).

- Les hopanes dans les sédiments de la sebkha de Moknine

On a noté la présence du squalane dans les HBI (Highly Branched Isoprenoid) des sédiments de
surface et de subsurface du système hypersalin de Moknine (Chairi 2004, 2005). Par conséquent,
le précurseur des hopanes est présent dans les sédiments ce qui donne un indice que ces hopanes
peuvent être issus d’une transformation diagénétique précoce ou prédiagenèse dans les systèmes
évaporatoires étudiés (Fig.II.11). De plus, si les triterpanes dans le bassin de Moknine indiquaient
une pollution par des produits pétroliers, ils seraient alors montrés par le diagramme de wapels
(nC17/Pr et nC18/Ph) où les échantillons étaient répartis loin de la zone de pollution dans ce
diagramme (Chairi, 2004 et Chairi et al., 2006).

63
 Figure II.11. Structures des hopanoïds, cholestérol et squalène (Peters et Moldowan, 1993).

Les chromatogrammes de masse m/z 191 des fractions d'hydrocarbures saturés de tous les
échantillons analysés ont montré des abondances modérées de pentacycliques. Les groupes des
hopanes trouvés ont un modèle de C29-C34, centré sur le C30 avec un gradient croissant qui se
remarque dans la répartition de ces composés de la périphérie vers le centre du système. La
ramification est plus importante avec le gradient de salinité. Dans les sédiments de surface et les
sédiments de la zone médiane, on a noté la présence aussi des composés de C27 et C28. Ces
hopanoïdes sont des biomarqueurs importants pour indiquer la matière organique dérivée des
bactéries (Ourisson et al., 1979). Leur composition et leur répartition sont similaires dans la plupart
des échantillons et se composent principalement de C27 à C34.

Les isomères 17,21ß (H)-hopanes dans les zones émergée et submergée sont abondants avec un
maximum en C29 et C30 (Chairi, 2018). La configuration17α (H), 21β (H) trishomohopane
(C33H58) est détectée uniquement dans les échantillons prélevés dans la partie de la zone
immergée contaminée par des eaux usées traitées et non traitées (Chairi, 2018). La présence
d'isomères 17(),21() a déjà été observée dans des sols non pollués et dans des tourbes acides
(Ries- Kautt et Albrecht, 1989 ; Schwoerer, 1998). Plusieurs hypothèses peuvent être envisagées
pour expliquer leur présence. L'isomérisation des biohopanes bactériens peut ne pas être spécifique
aux sédiments anciens mais peut intervenir rapidement si les conditions sont favorables, par des

64
processus abiotiques d'isomérisation éventuellement catalysés par la matière minérale appelés
encore prédiagenèse. Il est également possible que les isomères de
configuration17(),21() soient naturels, issus de certaines souches bactériennes spécifiques.

Dans la plupart des échantillons analysés, l'abondance relative de C29 hopane est généralement
inférieure à celle de C30 hopane, avec des rapports C29/C30 allant de 0,11 à 0,6 dans la zone
émergée et de 0,11 à 1,21 dans la zone immergée. Ce faible rapport peut s'expliquer par des sources
organiques mixtes (Moldowan et al., 1985). La prédominance du C30 hopane est souvent associée
aux sédiments argileux (Gürgey 1999), ce qui est en accord avec le faciès sédimentaire de la sebkha
de Moknine. D’ailleurs, C29 est plus abondant sur la bordure et C30 dans le centre de la sebkha.

Dans l'enregistrement sédimentaire, le suivi des triterpènes pentacycliques hérités de végétaux

supérieurs a d’abord connu une première application en termes de recherche de marqueurs
stratigraphiques dans le domaine pétrolier. Ceci a notamment été le cas pour l’oléanane (Fig.II.12)
qui permettait de dater les séries contenant cette molécule ou ses dérivés d'une période plus récente
que le Crétacé Supérieur (Moldowan et al., 1994). Des travaux plus récents ont démontré que des
molécules dérivant de l'oléanane étaient en fait enregistrées jusqu'au Permien. Leur occurrence
dans les sédiments de cette période peut témoigner d'un ancêtre des angiospermes (Gigantoptéridé)
ayant déjà la faculté de synthétiser l'oléanane (Moldowan et al., 2001). L'oléanane est alors un
important biomarqueur dérivé des plantes terrestres (Peters et al., 2005, Chairi 2010, 2018) et il a
été identifié dans les échantillons prélevés en périphérie et témoigne que les lipides dérivent d’une
matière organique terrigène dans les sédiments des zones étudiées (Fig.II.11).

65
 Figure II.12. Principaux squelettes des triterpènes pentacycliques utilisés en tant que biomarqueurs
(Peters et Moldowan, 1993).
Mais auusi l’oléanane, triterpanepentacyclique est originaire d'angiospermes comme Zygophylum
Album et Salicornia Arabica qui sont sont abondants à la périphérie des sebkhas de Moknine,
Gotaia et Eliane. En effet, le 18α (H)-Oleanane est le bioindicateur ou fossile moléculaire idéal
pour suivre la lignée des angiospermes en raison de sa présence relative et de sa concentration
relative (aussi appelée indice d'oléanane) dans les sédiments du Crétacé et du Tertiaire (Peters et
al., 2005, Walter al., 2017).

- Les terpanes dans les embouchures des oueds Méliane et El Bey

Les biomarqueurs indicateurs d’une pollution d’origine pétrogénique sont présents dans les
échantillons de l’embouchure de l’oued Méliane et oued El Bey. On a noté la présence de terpanes
(tetracyclicterpanes and pentacyclictriterpanes (C21 à C35) et était prouvée par l’indice ∑Ter/ Tm
+ C29 +C30 faible, qui indique l’abondance des hopanes issus d’une catagenèse. De surcroit,
l’'abondance de C30 hopane par rapport à C29 appuie la présence d’une pollution par des produits
pétroliers dans ces sédiments.

Les homohopanes possèdent la configuration naturelle 22R alors que la configuration 22S possède
une stabilité thermodynamique légèrement plus élevée. La configuration naturelle des hopanoïdes
bactériens est 17β(H), 21β(H), 22R, alors que leur maturation au cours de la diagenèse conduit à
la formation des isomères thermodynamiquement plus stables 17α(H), 21β(H) et 17β(H), 21α(H)
(Van Dorsselaer et al., 1977 ; Ourisson et al., 1979). Ces isomères sont donc caractéristiques de

66
sédiments anciens ayant atteint un degré de maturité élevé. La configuration du carbone 22 peut
également être modifiée, ce qui se traduit par des mélanges d'épimères 22R et 22S (Ries-Kautt et
Albrecht, 1989) pour les composés de plus de 29 atomes de carbone ce qui était remarqué dans les
sédiments des embouchures de Méliane et El Bey. Cependant, nous avons aussi trouvé des hopanes
d’origine biologique mais en pourcentage plus faible, tel que, le diploptène (D : C30H50) issu des
membranes plasmiques des procaryotes, et le gammacéranne (G C30H52m Fig.3.11) généralement
associé à une origine bactérienne (Damste et al., 1995, Chairi, 2018).

5.2. Les stéranes

À partir des tritérpénoïdes découle un autre groupe de lipides qui sont les Stéroïdes. "Le terme
stéroïde est employé pour désigner toutes les substances structurellement apparentées aux stérols
et acides biliaires dans la mesure où ils possèdent le système cyclique du perhydro-1,2-
cyclopentanophenanthrène". Les stéroïdes peuvent être regroupés selon leur fonction sous quatre
grandes catégories : les constituants membranaires, les acides et sels biliaires, la vitamine D et ses
précurseurs et enfin les hormones (Nes et McKean, 1977 ; Banthorpe, 1994 ; Yeagle, 1985 ; Baudin
2020). Les stéranes sont issus de la transformation au cours de la diagenèse des stérols présents
dans les membranes lipidiques d’un grand nombre de végétaux supérieurs et d’algues (Volkman,
2003, 2005 ; Finck, 2003, Ishiwatari et al., 2013 ; Baudin, 2020). Ils présentent une grande variété
de structures (Fig.II.13), reflétant la diversité des stéroïdes existants, ce qui fait de cette famille de
biomarqueurs, l’une des plus appréciées pour l’étude des environnements de dépôt et de
corrélations huile/huile et huile/roche-mère (Seifert, 1977 ; Volkman, 1986 ; Peters et Moldowan,
1993 ; Baudin 2020).

Figure II.13. Structure d’un stérane et son précurseur biologique (Baudin, 2020).

67
L’abondance de stéranes à chaîne courte dépend de l’origine de la matière organique (Ishiwatari et
al., 2013). Ils semblent particulièrement abondants dans les environnements carbonatés (Mello et
al., 1988 ; Requejo et al., 1994) et hypersalins (ten Haven et al., 1985).

- Les stéranes dans les zones humides étudiées

Systèmes évaporatoires :
Des stéranes réguliers en C27, C28 et C29 sont détectés dans les sédiments des systèmes
évaporatoires étudiés (Chairi, 2010 et Chairi, 2018). Les sédiments de surface sont plus riches en
C27 et ses dérivés méthylés. On note ainsi le cholestane -ββC27, le methylcholestane-ββC28 et le
ethylcholestane - ββC29. Les sédiments déposés au centre de ces systèmes renferment plus de C29
et le rapport C27/C29 est <1 indiquant une abondance du caractère terrestre ou des plantes
supérieures lignifiées. Le C27 abondant au Nord et à l’Est de la sebkha de Moknine et dans la saline
de Baghdadi, est associé à une abondance d’une contribution phytoplanctonique. La présence de
C28 indique plutôt l’existence d’algue d’origine lacustre. Cependant pour le C29, Volkman en
1986 note que certains organismes marins sont à l’origine du stérane en C29 réguliers et Nichols
et al., en 1990 ont montré qu’une large quantité d’un stérol en C29 est produite par des diatomées
suite au bloom printanier dans les eaux antarctiques.

Embouchures du golfe de Tunis :

Les analyses GC-MS des stéranes réalisées au laboratoire de géochimie organique à l’ETAP ont
révélé la prédominance de stéranes réguliers en C27 à C30 avec une abondance en C27 et C29 et
un rapport C27/C29 de l’ordre de 0.97 en moyenne dans les échantillons des embouchures (Méliane
et El Bey) du golfe de Tunis. D’après Logan et al., (1997), les stéranes réguliers ne manifestant
qu'une légère abondance des stéranes en C27 ou en C29, sont généralement caractéristiques des
huiles d’origine marine. La présence de ces stéranes montre que les sédiments des embouchures de
Méliane et El Bey sont pollués par des dérivés de pétrole qui proviennent des rejets non traités dans
ces oueds et/ou des rejets des stations d’épurations !...

5.3. Terpanes tricycliques

Les terpanes tricycliques sont reconnus dans des séries géologiques la première fois par Anders et
Robinson en 1971 à l’aide de la spectrométrie de masse où des composés en C25 sont détectés dans
les schistes bitumineux de Green River. Depuis, les terpanes tricycliques ont été trouvés dans un
certain nombre d'extraits de sédiments et de pétrole (Seifert and Moldowan 1979 ; Aquino Neto et

68
al., 1983, 1986 ; Zumberge, 1983 ; Heissler et al., 1984), avec une série s'étendant de C19 à C25
(Moldowan al., 1983). Ils sont considérés être utiles dans les études de corrélation en pétrole ainsi
que les huiles biodégradées (Seifert and Moldowan, 1979 ; Zumberge, 1983, 1987). Leurs
structures ont été suggérées par Ekweozor et Strausz (1982) sur la base de données
spectroscopiques et simultanément prouvées par synthèse (Aquino Neto et al., 1982 ; Heissler et
al., 1984 ; Chicarelli et al., 1988).

Figure II.14. Structure des terpanes tricycliques d’après Peters et Moldowan, 1993.

Les terpanes tricycliques (Fig.II.14) ont été identifiés au début dans la gamme C19-C30 (Aquino
Neto et al., 1983, Heissler et al., 1984), mais cette série peut s’étendre jusqu'à C45 d’après
Moldowan et al., (1983). Un autre aspect intéressant de cette famille d'hydrocarbures est que,
contrairement à d'autres biomarqueurs communs, ils sont peu caractérisés dans les sédiments
récents et anciens (Baudin, 2020). Récemment, la caractérisation des terpanes tricycliques dans les
extraits tasmanites a montré qu'ils constituent les principaux constituants de la fraction
hydrocarbonée des échantillons de Tasmanie (Aquino Neto et al., 1989 ; Simoneit et al., 1986,
1990 ; Volkman et al., 1990). La relation entre tasmanites et une plus grande abondance de terpanes
tricycliques a été soutenue par des analyses d'échantillons alaskiens et brésiliens (Aquino Neto et
al., 1989).

- Les terpanes tricycliques dans les systèmes étudiés

Les triterpanes sont aussi présents dans les échantillons prélevés dans les sebkhas (Chairi et al.,
2010 ; Chairi, 2018) et les embouchures du golfe de Tunis (Méliane et El Bey). Leur distribution
s’étend entre C18 et C35 (Fig.II.15) dans les sebkhas. Dans les embouchures de Méliane et El Bey
une série de terpanes tricycliques dont le nombre de carbone varie de C21 à C29 ont été relevés sur

69
les fragmentogrammes de masse m/z 191 (Fig.II.16). Ils sont maintenant connus pour être
omniprésents comme les hopanes dans les sédiments (Seifert et Moldowan, 1979 ; Aquino
Zumberge, 1983 ; Ishiwatari et al., 2013) et sont utilisés comme biomarqueurs à faible maturité
(Aquino Neto et al., 1986), dans les études de corrélation des hydrocarbures (Seifert et Moldowan,
1979 ; Zumberge, 1983, 1987), ainsi que dans les corrélations stratigraphiques.

Figure II. 15. chromatogramme des terpanestricycliques et hopanes (Chairi, 2018).

La présence de ces biomarqueurs (Fig.II.15 et 16) dans les sédiments de milieux différents (sebkha
et embouchures) montre qu’ils sont ubiquistes et suggère une origine bactérienne ou algaire.
Cependant, la nature des organismes dont dériveraient les précurseurs biologiques de cette famille
de composés n’a pas été, jusqu’à présent, établie avec certitude. Ils peuvent résulter d'une
cyclisation encore inconnue de polyprénols dans des microorganismes. Probablement, ils peuvent
être issus d’une cyclisation d’isoprénoïdes acycliques réguliers en tricyclohexaprénol par un
processus enzymatique (Ourisson et al., 1982 ; Aquino Neto et al., 1983), qui seraient réduits en
terpanes tricycliques au cours de la diagenèse.

Dans la reconstitution paléoenvironnementale, l’abondance des terpanes tricycliques C22 prouve

que les huiles sont plus matures et qu’elles proviennent principalement des roches carbonatées
(Wapels and Machitara, 1991 ; van Grass, 1990) et les terpanes tricycliques C21, C23 à C28
indiquent plutôt que les huiles dérivent de la matière organique terrestre (Peters et al., 2005, Walter
et al., 2017). Dans les sédiments étudiés on a noté la présence de C23 qui un indicateur d'une
matière organique immature et une abondance de C25 dans la sebkha d’Eliane et C18 pour la
70
sebkha de Gotaia. La présence des tricycliques terpanes suggère un environnement hypersalin ainsi
qu'une origine microbienne et algaire des précurseurs des triterpanes (Chairi, 2010, Ishiwatari et
al., 2013). Les terpanes tricycliques dont le nombre de carbone varie de 19 à 45 ont été identifiés
dans les sédiments et pétroles (Aquino Neto et al., 1982, Moldowan et al., 1983, Heissler et al.,
1984, Ishiwatari et al., 2013). Leur origine biologique la plus satisfaisante soit une source
microbienne (Heissler et al., 1984).

Figure II.16. Fragmentogramme (ion 191) des triterpanes dans les embouchures
de oued Méliane (Saidi, 2019) et oued El Bey (Mahmoud, 2018).

71
 Thème 2 : Les biomarqueurs indicateurs
de traçage de la pollution

I. Alkylbenzènes
L'analyse des n-alkylbenzènes a fait l'objet d'une attention particulière car ces composés
aromatiques substitués à chaîne droite ne semblent pas avoir de précurseurs logiques dans les
organismes vivants, contrairement aux alkylcyclohexanes et aux alkylbenzènes à chaînes latérales
isoprénoïdes qui eux dérivent des caroténoïdes (Hall et Douglas 1983, Summons et Powell, 1987,
Magam et al., 2009 ; Liu et al. 2013 ; Martin et al., 2014 ; Alkhadher et al., 2015, 2020). Gallegos
(1981) a trouvé des séries homologues d'alkylbenzènes à longue chaîne dans les produits de
pyrolyse de trois charbons. Williams et al., (1988) ont trouvé les mêmes alkylbenzènes à des
concentrations relativement élevées dans les pétroles bruts de West Texas Midland et du Michigan.

Des biomarqueurs monoaromatiques linéaires ont été décrits dans la fraction soluble des
échantillons géologiques dans des paléoenvironnements carbonatés-évaporitiques avec une
réduction abondante des sulfates, comme les pétroles bruts d'Espagne (Albaigés et al., 1986,
Grimalt et al, 1991) et du Guatemala (Connan et al., 1986). Des squelettes linéaires d'alkylbenzène
(LAB) et d'alcénylbenzène ont également été décrits dans la fraction de pyrolysat de kérogènes de
type III (Sinninghe Damste' et al., 1992). Des Iso- et anteiso-alkylbenzènes ont été décrits dans un
bassin salin par Sinninghe Damste' et al., (1993).

Une série d'alkylbenzènes ramifiés a été identifiée au cours des études sur les lipides neutres de
Thermoplasma et de Sulfolobus (Holzer et al., 1979). Tous les composés se sont avérés être des
alkylbenzènes monosubstitués avec des pics de base à m / z = 91, à l'exception de l'isomère para,
dont le fragment majeur à m / z = 105. Les points de ramification des chaînes latérales alkyliques
peuvent être déterminés à partir du modèle spectral de masse, puisque le clivage se produit
préférentiellement à des positions adjacentes à un groupe méthyle.

Les caroténoïdes sont des pigments qui sont des composants omniprésents de la biosphère, présents
dans les plantes continentales et dans les algues et les bactéries (Liaaen-Jensen, 1978, Liaaen-
Jensen et al., 1982, Summons et Powell, 1987). Ces composés ont été trouvés dans des sédiments
anciens et récents provenant de différents environnements (Schwendinger et Erdman, 1963, Anders

72
et Robinson, 1971, Jiang et Fowler, 1986), à la fois lacustres et marins et seront à l’origine des
alkylbenzènes/alkyltriméthylbenzènes (Sinninghe Damsté, 1993, Motteran et al., 2017).

Les LAB peuvent provenir de sources de pollution comme les eaux usées traitées (Ishiwatari et al.,
1983, Vivian, 1986, Takada et Eganhouse, 1998, Eganhouse, 2004, Isobe et al., 2004, Corada-
Fernández et al., 2018). Ils constituent l'ingrédient principal dans la fabrication des alkylbenzène
sulfonates linéaires (LAS), qui sont utilisés comme tensioactifs anioniques dans les formules
commerciales pour les détergents ménagers (Ishiwatari et al., 1983, Takada et al., 1992, 1994,
Eganhouse, 2004, Mungray et Kumar, 2009, Corada-Fernández et al., 2018).

1. Les alkylbenzènes dans la sebkha de Moknine

J’ai isolé les hydrocarbures aromatiques par gravimétrie dans mes travaux de thèse pour obtenir
des informations sur les origines et les mécanismes de transformation de la matière organique dans
le système évaporatoire de Moknine. Dans mes travaux postérieurs, j’ai identifié les différents
composés et isomères afin de trouver des indicateurs de pollution (par le pétrole et/ou par les eaux
usées), un indicateur de l'environnement hypersalin ainsi que les mécanismes de transformation
rapide de la matière organique dans les sédiments récents. La fraction aromatique des échantillons
prélevés dans le secteur nord-ouest de la sebkha de Moknine est composée d’alkylbenzènes. Ces
composants sont largement répandus dans les fractions d'hydrocarbures aromatiques.

Une distribution similaire des alkylbenzènes est déterminée dans différents profils du Nord de la
sebkha de Moknine. Un certain nombre de séries homologues avec des chaînes latérales n-alkyl
ont été identifiées. La concentration et la distribution des hydrocarbures aromatiques sous forme
d’alkylbenzène linéaire (LAB) sont variées dans ce système. La concentration élevée dans SM9
indique un rejet intensif des eaux usées dans le bassin de Moknine. Les rejets directs des eaux usées
non traitées dans l'oued Soltane sont la principale source d’augmentation de la concentration des
LAB au Nord de la sebkha (SM11). Les faibles concentrations, au Nord-Est (SM8) en partie
médiane (SM10) et au centre (SM12) sont l’expression d’une origine biogénique des LAB
(cyanobactéries, halophiles). La distribution de LAB est contrôlée par l'intensité des apports d'eaux
usées et le transport latéral et la dilution des particules.

Les chromatogrammes ont montré la présence de séries homologues de n-alkylbenzènes allant dans
la plupart des échantillons de C18 à C22 et parfois, des pics de C23 à C31. La quantité
d'alkylbenzènes diminue progressivement dans la gamme C23-C31 (Fig. III.1.). Cette distribution
73
s'explique par la faible diversité biologique dans les milieux hypersalins (Evans et Kirland, 1988).
La sebkha de Moknine sous l’effet de l’évaporation totale de ses eaux en saison chaude ne
développe que les cyanobactéries et certaines algues (Chairi, 2005, 2006, 2010), quant aux plantes
halophiles sont plus abondantes en périphérie à l’Est et à l’Ouest de ce système.

Le pic de base à m/z 91 dans les spectres de masse indique que le noyau benzénique n'est substitué
que par une longue chaîne latérale alkyle qui peut être ramifiée en fonction du temps de rétention
des composants.

Figure III.1. Fragmentogrammes (ion 91) des alkylbenzènes linéaires

dans le secteur nord-ouest de la sebkha de Moknine (Chairi et al., 2010).

74
Les n-alkylbenzènes ont des longues chaînes alkyles dans la gamme de C12 à C25 avec un
maximum à C13. Tous les échantillons sont dominés par des alkylbenzènes linéaires que l'on pense
être formés par cyclisation et aromatisation de précurseurs possédant des squelettes à chaines
linéaires. Ils sont substitués à différentes positions (1, 3, 4, 5, 6 et 7) et proviennent, ou sont des
lipides transformés par diagenèse (Fig.III.2).

2. Origine des alkylbenzènes

En général, il est admis que les acides gras dérivés d'organismes biologiques sont probablement
des précurseurs de l'alkylbenzène dans les sédiments par des réactions bien connues de
déshydratation sédimentaire et de cyclisation (Ostroukhov et al., 1983, Sinninghe Damsté et al.,
1992, Hartmann et al., 2000). Un autre mécanisme pour la formation d'hydrocarbures
alkylaromatiques est décrit par Williams et al. (1988) à partir d'expériences de composés modèles
impliquant l'alkylation de composés monoaromatiques et cyclohexylés avec des alcools primaires
à longue chaîne. Byers et Erdman (1983) ont montré qu'une dégradation à basse température du β-
caroténoïdes conduit à la production d'alkylbenzènes et d'alkylnaphtalènes de bas poids
moléculaire. Enfin, d’après Connan et al., (1986), une concentration anormale de
pentadécylbenzène a été le résultat d’une contribution d'une source biologique spécifique dans les
faciès carbonate-anhydrites d'un environnement de sebkha. Dans le cas de la sebkha de Moknine ;
la zone polluée qui a reçu des eaux usées traitées (SM9) et non traitées (SM11) montre la même
distribution d'alkylbenzène dans les sédiments plus profonds mais les sédiments de surface sont
caractérisés par l'abondance de C19 et C20 qui composent la majeure partie des LAB. Dans les
sédiments de surface ces composés auront probablement une double origine. Une partie est issue
d’une source biogénique et une autre partie provient des détergents riches en LAS et transformées
en LAB. En effet, dans des conditions de réduction les LAS se transforment en LAB (Matthijs et
al., 1999 ; Mungray et al., 2009). De nombreuses études ont été menées pour déterminer la
concentration des LAS dans les eaux des systèmes après évacuation des effluents traités (McAvoy
et al., 1993, Trehy et al., 1996, Mungrayet al., 2009). Les concentrations de LAS dans l'eau du
système dépendent du pourcentage d'élimination aux STEP, de la sorption, de la sédimentation des
solides et de la dégradation des cours d'eau (Takada et al., 1992, Mungray et al., 2009). Tous les
STEP aérobies éliminent environ 99% de LAS et finalement une très faible concentration de LAS
est déchargée dans le système (Moreno et al, 1994 ; Mogensen and Ahring, 2002). Cependant dans
le cas de Moknine, un enrichissement en LAB dans les sédiments de surface à la périphérie nord

75
est probablement dû aux rejets des eaux usées. Celles-ci ne s'accumulent que sur la périphérie,
n'atteignent pas la zone centrale de la sebkha et leur infiltration était limitée à la surface (25 cm).

Figure III.2. Les isomères de l'alkylbenzène linéaire en C19 détectés

dans les sédiments de la sebkha de Moknine (Chairi et al., 2010).

3. Les isoprényl alkylbenzènes

Les isoprényl alkylbenzènes sont également présents et sont plus abondants dans les sédiments au
centre de la sebkha que sur la périphérie. Deux composés de benzène isoprénoïdes sont identifiés
et caractérisés par un pic de base à 105 et 119 et des ions moléculaires correspondants à mz 260 et
274. Le premier est en C19 (1-méthyl-4-dodécylbenzène et 1-éthylundécylbenzène ou
3phényltridécane (Fig.III.2.) et le deuxième en C20 (1-méthyl-4-tridécylbenzène). Ces composés
pourraient être formés par cyclisation d'hydrocarbures substitués par des isoprénoïdes (Gorchs et
al., 2003). La salinité semble avoir exercé un effet significatif sur les distributions et les abondances
de ces composés. Les concentrations les plus élevées de benzènes isoprénoïdes se trouvent dans
les sédiments argileux déposés au centre qui sont associés à une forte concentration d'halite. Ce
minéral évaporitique constitue l’unique composant de surface dans le centre et la zone médiane où
il est présent à 100% mais précipite en petite quantité à la périphérie, où l’halite est d'environ 2%
dans SM9 et 9% dans SM8 (Chairi, 2004, 2005). Dans ce contexte, les archéobactéries halophiles

76
sont suggérées comme source de phytanylbenzène sédimentaire (Sinninghe Damsté et al., 1988 ;
Sinninghe Damsté et al., 1993). Elles n'ont probablement pas contribué de façon importante à
l'apport de matière organique sédimentée dans ce système hypersalin car le caractère terrestre du
stock organique et celui des cyanobactéries sont plus imposants (Chairi et al., 2010).

Le 1-méthyl-4-dodécylbenzène (C19) est plus abondant au centre et dans la zone moyenne que le
1-méthyl-4-tridécylbenzène (C20). L'alkylbenzène C20 a été décrit dans les schistes noirs (Vinks
et al., 1997) cependant le C19 n'est pas décrit par les auteurs dans une autre étude. L’origine des
alkylbenzènes contenant une chaîne isoprénoïdale est une réduction des quinones (Blumer, 1965).
Les quinones ont été largement observées dans les plantes supérieures, les algues, les
cyanobactéries, les archaebactéries et les levures (Grochs et al., 2003). Dans la sebkha de Moknine,
les alkylbenzène isoprénoides dérivent d'algues et/ou de cyanobactéries. En effet, en comparant la
position du groupe isoprényle au groupe méthyle dans le cycle aromatique ; il se dégage une
structure similaire des phytanyl benzènes et des quinones naturelles (Gorchs et al., 2003).

4. Conditions environnementales
La présence de phénylbenzène dans le système de Moknine est liée à des paléoenvironnements très
réducteurs. Les conditions réductrices se développent dans les sédiments de surface (25 cm) du
système évaporatoire de Moknine et se maintiennent dans les profils sédimentaires. Ces conditions
s’expliquent par le taux du soufre élémentaire omniprésent dans les fractions lipidiques (Chairi,
2004). Le soufre est présent à forte concentration dans les sédiments de surface, diminue avec la
profondeur et n'est pas détecté dans les sédiments profonds à la périphérie. La périphérie est
caractérisée par des dépôts de sable où des conditions oxiques sont développées (Chairi, 2005)
excepté le bord nord. Les conditions anoxiques développées dans cette zone peuvent s'expliquer
par l'enrichissement en argile et en matière organique provenant des bassins de la station
d’épuration. Au nord-est (SM8), les conditions anoxiques dans les sédiments périphériques sont
causées par les marécages. La fraction lipidique est en moyenne de 24% OC et dérivée de l'activité
des cyanobactéries. Celles-ci sont la source essentielle d'hydrocarbures aliphatiques et
d'alkylbenzènes dans le profil SM8 (Chairi et al.,2010).

77
II. Les HydrocarburesAromatiques Polycycliques
"Délinquance environnementale" un terme qui commence à être utilisé pour montrer les risques de
la pollution par les polluants organiques persistants (POPs), tel que, les hydrocarbures aromatiques
polycycliques (HAP). Les HAP ont trouvé une place privilégiée dans la problématique de la
pollution de l'environnement. Ils font partie des Polluants Organiques Persistants (POPs), définis
par le protocole d’Aarhus (1998) et la convention de Stockholm (2001), deux traités internationaux
dont l’objectif commun était de limiter les émissions de ces molécules capables de s’accumuler
dans les différents compartiments de l’environnement et susceptibles d’être nocives ou toxiques
pour la santé humaine et les ressources naturelles. Depuis 2004, ces HAP font l’objet de
réglementations plus strictes et doivent être obligatoirement pris en compte dans la surveillance de
l’air (directive européenne 2004/107/CE) (JOUE, 2004). Les HAP sont une famille de molécules
constituées de carbone et d'hydrogène assemblés en cycles benzéniques fusionnés, chacun composé
de 5 ou 6 atomes de carbone pouvant être substitués. Dans l’environnement, les HAP composés de
2 à 7 noyaux aromatiques sont les plus présents et les plus mobiles (Neff, 1979, Latmir et al., 1999,
Golobocanin et al., 2004, Zhou et al., 2005 Mahler et Massei, 2007, Yunker et al., 2012, Baltrons
et al., 2018) dont le plus simple est le naphtalène. La formule des principaux HAP non substitués
classiquement étudiés est représentée sur la Figure III.3.

Figure III.3. Représentation des 16 HAP prioritaires retenus par L’US-EPA.

78
 1. HAP dans les embouchures du golfe de Tunis
Cette étude était dans le cadre du projet (Contrat Programme MESRS/CERTE) : Etude des
mécanismes de mobilité et transfert des polluants métalliques et organiques pour assurer
l'amélioration de la qualité et la protection des nappes phréatiques et des eaux de surface. Les
résultats obtenus dans les travaux du master de Mahmoud (2018) ont montré que les oueds El Bey
et Méliane sont des vecteurs de pollution vers la méditerranée et dans les eaux souterraines. En
effet, les concentrations les plus élevées des seize principaux HAP ont été mesurées dans les
sédiments de l'oued Méliane (1969 μg / kg), de l'oued el Bey (1835,6 μg / kg) et du canal Khlij
(1082,6) et les plus faibles dans l'échantillon de la nouvelle embouchure de l'oued Majerda
(189,8µg / kg). Les analyses ont montré que les HAP à 4 cycles (fluoranthène et pyrène)
constituaient une proportion plus importante des concentrations de HAP dans l'ancienne
embouchure de l'oued Majerda (76%) et dans l'oued Abid (46%). Les HAP à 5 cycles caractérisent
les échantillons des embouchures des oueds Méliane et Majerda (41% et 54%) et les HAP à 6
cycles (70%) dans oued El Bey (Fig.III.4.)3. Pour différencier les sources de HAP pétrogèniques
et pyrolytiques dans les sédiments, des rapports de diagnostic HAP ont été utilisés. Ces rapports
HAP ont indiqué des apports pétrogéniques dans les sédiments des embouchures des oueds El Bey
et Méliane et dans le canal Khlij et une source pyrolytique dans les sédiments des oueds Majerda
et Abid (Chairi et al, 2019a).

Figure III.4. Répartition des HAP par classes d'aromacité exprimée en % de la concentration totale en
HAP dans les sédiments des embouchures méditerranéennes (golfe de Tunis ; Chairi et al., 2019a).

3
O: oued, Maj1: ancienne embouchure de Majerda, Maj2: nouvelle embouchure de Majerda, Mél: Méliane, elB: El
Bey, Ab: Abid

79
 2. Lien entre la matière organique et les micropolluants organiques dans les
sédiments de l’embouchure de l’oued Méliane
Dans le cadre du même projet, j’ai encadré un deuxième master (Saidi, 2019) mais en limitant la
zone à l’estuaire de l'oued Méliane, l'un des plus grands oueds de la Tunisie afin de mieux
comprendre la nature des apports vers la méditerranée et suivre l'effet et l'impact des activités
socioéconomiques. L’analyse du milieu naturel du gouvernorat de Ben Arous, composante
importante du territoire de la région de Tunis, requiert la prise en compte des caractéristiques du
site régional plus large dont il fait partie. Ainsi, toute la région s’ouvre sur le golfe de Tunis, bordé
par des plages sablonneuses et rocheuses. La vallée de la Majerda au Nord et celle de l’oued
Méliane au Sud constituent des éléments déterminants du milieu naturel régional, baigné par un
climat méditerranéen semi-aride. Selon le rapport d’AEE H2020 en 2014, oued Méliane devient
une des priorités pour l’aménagement et la dépollution par suivi et contrôle de la qualité et la nature
des rejets industriels et domestiques.

2.1. Fraction aromatique et les POP’s

La fraction aromatique séparée par SPE (C18) au LGR (CERTE) a révélé des valeurs élevées de
cette fraction et une absence de corrélation avec les 16 HAP, indiquant l’hétérogénéité de celle-ci
(Fig. III.5). Les hydrocarbures aromatiques dans les sédiments de l’estuaire de Méliane est un
mélange d’hydrocarbures endogènes et d’autres exogènes. La fraction exogène était analysée,
qualifiée et quantifiée par l’analyse sur HPLC. Ces POP’s sont les hydrocarbures aromatiques
estimés par les 16 molécules les plus polluantes.

Figure III.5. Corrélation entre la somme des 16 HAP et la fraction aromatique (Chairi et al., 2019a).

80
 2.2. Distinction des sources pétrogéniques et pyrolytiques
Indice 1 : Pourcentage de HAP de faible poids moléculaire/HAP de fort poids moléculaire :
LMW/HMW

L’indice LMW/HMW correspondant au rapport des composés à faible poids moléculaire (2 et 3

cycles) par rapport aux composés à haut poids moléculaire (de 4 à 6 cycles) varie de 1 à 7. Ces
valeurs montrent que les sédiments de l'estuaire de Méliane sont contaminés par des HAP d'origine
pétrogénique. Les sources pétrolières sont caractérisées par la prédominance de HAP légers (LMW,
2 à 3 cycles). Une majorité de HAP de faible poids moléculaire est observée pour les carburants
(gasoil et super), les huiles lubrifiantes et les débris de pneus. Inversement, les HAP émanant des
sources pyrolytiques sont majoritairement composés de 4 cycles ou plus (HMW) (Rocher et
Moilleron, 2007, Merhaby et al., 2015 ; Vitali et al., 2019).

Indice 2 : Pourcentage des HAP marqueurs d’origine pyrolytique/HAP marqueurs d’origine

pétrolière

Les composés d’origine pétrogénique contiennent souvent des composés plus stables
thermodynamiquement, comme le naphtalène, le fluorène et le phénanthrène, tandis que le
fluoranthène et le pyrène sont des marqueurs de HAP d’origine pyrolytique (Doong et Lin, 2004,
Merhaby et al., 2019). La concentration de [fluoranthène + pyrène] est largement plus faible que
celle de [Naphtalène+ Phénanthrène+Fluorène] retrouvés dans les sédiments que cela soit à la
surface ou en profondeur. Ces résultats confirment que les HAP présents dans les sédiments de
l’embouchure de l'oued Méliane proviennent de sources pétrogéniques. La zone de Rades-
Mélianeest soumise à une forte contamination par les HAP principalement en raison de
l'urbanisation et du développement industriel de cette zone.

Indice 3 : [Anthracène]/[Phénanthrène+Anthracène]

Des rapports en Ant/Ant+Phe<1 dans les sédiments sont indicateurs principalement de

contamination d’origine pétrogènique, tandis que ceux ayant un rapport Ant/Ant+ Phe>1sont
typiques d’une contamination pyrolytique (Yang, 2000, Merhaby et al., 2019). Dans cette étude,
les rapports Ant/Phe+Ant, s’échelonnent de 0.2 à 0.7 ce qui indique que les HAP contaminant les
sédiments sont d’origine pétrogénique.
81
Indice 4 : [Fluoranthène]/[Fluoranthène+Pyrène]

L’indice Fluoranthène/(Fluoranthène+Pyrène) permet de distinguer les émissions des moteurs

essence (0,40) et diesels (0,60 à 0,70) (Kavouras et al., 2001, Feng et al., 2012 ; Wang et al., 2015).
Les rapports de Fl/Fl+Py obtenus s’échelonnent de 0,58 à 0,64, indiquant nettement une source de
contamination pyrolytique du sédiment. Ces valeurs indiquent une domination des émissions
provenant des moteurs diesels. La zone étudiée est caractérisée par une anthropisation massive.
Les sources des HAP sont alors multiples dont on note les émissions des moteurs des navires, les
équipements portuaires (par exemple treuils, chariots élévateurs), les activités de transport
maritime ou de navigation, les véhicules, les camions diesel (activités de transit) et des poussières
générées des activités de réhabilitation et de construction.

Indice5 : Indéno[1.2.3-cd)pyrène/( Indéno[1.2.3-cd)pyrène +Benzo[g.h.i]pérylène)

Selon (Kavouras et al., 2001), l’indice IPyr/(IPyr+BghiP) de 0,35 à 0,70 est marqueur de
contamination en HAP par des moteurs diesels. Les rapports IPyr/(IPyr+BghiP) observés dans cette
étude s’échelonnent de 0.51 à 1. La majorité des prélèvements montre des valeurs supérieures à
0.35, ce qui semble correspondre à une contamination des sédiments par les émissions des moteurs
diesels (Rocher et Moilleron, 2007, Merhaby et al., 2015 ; Vitali et al., 2019).

82
 Conclusion Générale

L’analyse des carottes sédimentaires s’est développée au cours de ces 30 dernières années dans les
zones humides en particulier les zones lacustres. Ces archives sédimentaires retraçent l'histoire
d’un bassin de sédimentation en fournissant une image intégrée des changements
environnementaux, climatiques et sociétaux. Elles ont permis également l’analyse rétrospective
des apports environnementaux en divers polluants, aujourd’hui mesurables, mais qui demeuraient
non quantifiables ou non considérés à certaines époques.
Dans le cas de la sebkha Moknine, les dépôts sont détritiques et ne reflètent que l’influence
continentale durant une chronologie de l’ordre de 2000 ans où le système a subi un rétrécissement
et comblement de sa zone occidentale.
Le modèle d’évolution du système conjugué de Mahdia à travers ses archives sédimentaires dévoile
le changement de sa forme et l’effet du forçage naturel. La morphologie actuelle n’est que le
résultat d’une phase de comblement local par un phénomène hydrologique qui a fait segmenter le
bassin losangique en deux sous bassins Eliane et Gotaia reliés actuellement par un chenal. Le
remplissage est typiquement continental et la répartition des sédiments en mode concentrique de la
périphérie vers le centre est caractéristique de plusieurs systèmes limniques en Tunisie tels que les
sebkhas de Moknine, Boujemal, Sidi el Hani.
Le système conjugué de Mahdia est en phase de comblement, mais changera-t’il suite à un
rétrécissement en un cours d’eau ?
Les niveaux de base de tous les profils de ce système ont montré l’existence d’un bassin unique
dans le passé comme dans le cas pour de la sebkha de Moknine. Cependant, l’absence de sel
démontre que les dépressions de Gotaia et Eliane n’ont pas atteint le stade évaporatoire au cours
de l’histoire de remplissage étudiée comme le cas de Moknine. Elles sont des dépressions de faible
étendue dans une phase caractérisée par l’abondance de gypse et de calcite, caractéristique des
systèmes subissant une influence marine. L’exutoire de ce système est la sebkha de Moknine par
l’intermédiaire de l’oued Rejel chiba. L’étude de ce système conjugué n’a pas dévoilé la présence
de la transgression holocène. Toutefois, une ressemblance se dégage entre les dépressions
endoréiques de Moknine, Gotaia, Eliane et Sidi el Hani. La sebkha de Sidi el Hani qui est située

83
dans une zone centrale a subi les mêmes accidents tectoniques que les sebkhas côtières du Sahel.
Le réceptacle sédimentaire de la sebkha Sidi el Hani est formé de sable, d’argile, de silt et de faciès
mixtes rappelant les dépôts des systèmes de Moknine, Gotaia et Eliane. La datation de ces dépôts,
basée sur des boîtes crâniennes provenant d’un site archéologique distant de 1 km de la sebkha, est
holocène (7 000 à 5 000 ans BP). Ces résultats soutiennent l’hypothèse que, la sebkha de Moknine
et le système conjugué de Gotaia et Eliane n’ont pas subi de transgression marine au cours de
l’Holocène ! Le climat était humide entre 7 000 à 6 000 ans BP ensuite aride entre 6 000 à 5 000
ans BP. Néanmoins, des profils plus profonds et une analyse du deltaC13 ainsi que d’autres
isotopes pourront répondre mieux à cette question.
Dans la sebkha de Moknine, la répartition des n-alcanes étudiés illustre les relations internes
complexes et variables de cet environnement contrasté, entre la nature des différents types de
sources (bactéries, cyanobactéries, microalgues et plantes supérieures), la composition de ces
sources (par exemple pour les plantes supérieures : halophyte S. Arabica, Phragmites et les débris
végétaux supérieurs rejetés par les oueds), l'importance de la dégradation bactérienne des n-alcanes
à partir de sources primaires et prouve que ce système est passé par trois phases de sédimentation.
La distribution des n-alcanes dans la phase argileuse correspondant à l’intervalle t0 dans le modèle
de l’évolution de la sebkha de Moknine et démontre que celle-ci était bien plus étendue vers l’Ouest
et que la séquence argileuse dans les profils périphériques correspond au centre de la sebkha de
Moknine au passé.
Dans les embouchures du golfe de Tunis, le milieu est plus complexe et plus dynamique mais le
caractère le plus prononcé des hydrocarbures aliphatiques montre que les sources sont des dérivés
de pétrole dans les zones (El Bey et Méliane) pour les C <22 et des microalgues dans l’embouchure
témoin (oued Abid). Les C>22 sont issu des cires végétales (posidonie, phragmites et les détritus…)
dans les embouchures du golfe de Tunis et ils sont très dégradés dans les embouchures de Méliane
et El Bey, où l’activité bactérienne est importante.
Les biomarqueurs ont été de solides outils pour étudier l’origine, la transformation et le transfert
de la matière organique dans les environnements étudiés. La composition des biomarqueurs
stéranes, terpanes et tricyclique terpanes corrèle fortement avec les environnements sédimentaires
des sédiments organiques, la source de matière organique et la prédiagenèse. Ces « fingerprint
informations » ou indicateurs présentent une bonne empreinte génétique dans les zones étudiées et
ont donné des informations sur les sources, les précurseurs biologiques et le caractère physico-

84
chimique des milieux de dépôt. Les composés stéroïdiens dans les sebkhas étudiés sont
principalement en C29 et C27, suivis de C28. Différents types de stéroïdes C27, C28 et C29 dans
différents organismes et dans des stades variables dans le même environnement sédimentaire
reflètent indubitablement l'environnement écologique, et peuvent être utilisés comme indicateurs
de l'environnement paléo-écologique et de la succession des espèces. Dans un sens commun, les
stéranes principalement en C27 et C28 dans les bassins évaporatoires dérivent des phytoplanctons
et les C29 stéranes proviennent principalement de plantes supérieures (Salicorne arabica et
phragmites). La connaissance de l’origine biologique des hopanes et des stéranes s'est
considérablement améliorée au cours de la dernière décennie en corrélant leur abondance relative
élevée comme preuve d'une activité microbienne significative tel le cas de la sebkha de Moknine.
Ils sont aussi considérés comme marqueurs de maturité et s’avèrent utiles pour authentifier la
présence de contamination dans les écosystèmes modernes. Dans les embouchures de Méliane et
El Bey où le rapport C27/C29 est proche de l’unité ce qui fait de ces composés des indicateurs de
pollution.
L’oléanane dérive des plantes supérieures et prouve l’origine terrestre des hydrocarbures voire des
sédiments organiques de ces systèmes. Le gammacérane, marqueur triterpénoïde de la série des
norhopanes et provenant de la déshydratation et l'hydrogénation de l'alcool de tétrahymène ; sa
présence en grande quantité est révélatrice de l’environnement hypersalin fortement réducteur au
cours du dépôt des sédiments organiques dans les bassins évaporatoires du Sahel.
Le trishomohopane 17α (H), 21β (H) (C33H58) était détectée dans la zone immergée contaminée
par des eaux usées traitées et des eaux usées non traitées et dans les embouchures de Méliane et El
Bey contaminées par des dérivés de pétrole. Ce fossile moléculaire peut-il prendre aussi son origine
dans des bactéries sulfato-reductrice. En effet, les sebkhas et les embouchures du golfe de Tunis
sont riches en soufre et les SRB (sulfate reduction Bacteria), ont joué un rôle important au passé
dans la formation de gisements de sulfures à basse température. Cependant, il n'y a actuellement
aucun hopane connu, ni aucune autre classe d'hydrocarbure, qui diagnostique des réducteurs de
sulfate, donc on ne sait pas quel groupe d'organismes a contribué à ces molécules.
Les biomarqueurs sont aussi un outil de reconstitution climatique et de l’environnement de dépôt
en se basant sur les indices (CPI, ACL…), les stéranes et les isoprénoïdes (Pr/Ph). L’analyse de
ces derniers dans les sédiments superficiels (25cm) révèle une tendance climatique aride et un

85
milieu de dépôt réducteur à l’interface eau/sédiment dans les systèmes évaporatoires et les
embouchures de Méliane et El Bey et oxydant dans les embouchures de Majerda et Adid.
Les facteurs naturels ayant agi sur les sociétés humaines, ont conduit ces dernières à leur tour
d’influencer les environnements naturels. C’est l’époque de l’anthropocène caractérisée par des
activités socioéconomiques intenses. Celles-ci sont suivies par l’intermédiaire des biomarqueurs
traceurs de pollution, les composés non résolus (UCM) et des hopanes au début et par l’étude des
alkylbenzènes dans les sebkhas du Sahel et les HAP dans le golfe de Tunis.
Les alkylbenzènes dérivent de la cyclisation et l'aromatisation des alcanes linéaires dans les parties
sans actions anthropiques alors que dans la partie nord-ouest ces composés dérivent des détergents
dans les eaux usées rejetées directement dans ces bassins. La présence d'isomères d'alkyle avec des
chaînes linéaires et ramifiées indique un environnement de dépôt fortement réducteur et appui les
résultats des n-alcanes et des stéranes.
Les HAP dans les embouchures de Méliane, El Bey et dans le canal Khlij sont issus des activités
socioéconomiques manifestées par les rejets des résidus d’origine pétrolière.

86
 Perspectives

Géochimie Organique Environnementale

Les biomarqueurs : de l’évolution vers la surveillance dans les milieux hypersalins ou
évaporatoires. Interactions environnement / climat / sociétés humaines
L’étude moléculaire des sédiments des sebkhas du sahel de la Tunisie (Moknine, Goatai et Eliane)
était un moyen pour tirer des conclusions sur l’origine, les processus de transformation et
l’évolution de la matière organique dans des systèmes hypersalins de milieu aride. Nos résultats
s’intègrent ainsi dans un domaine scientifique en émergence rapide : la géochimie organique
environnementale (Eganhouse, 2004).
Il est capital de prendre en compte la diversité des molécules des différentes matrices
environnementales de manière à étudier les processus contrôlant la dynamique de la matière
organique dans le système eau-sédiment/sol (bassin versant) -êtres vivants (plantes, animaux et
Homme) pour une meilleure description du niveau d’anthropisation d’une part et l’évolution de
certaines molécules source de biocarburant d’autre part.
Si mes travaux apportent certains éléments de compréhension sur la matière organique dans un
environnement hypersalin mes perspectives s’inscrivent dans la continuité de ces thématiques et
chercheront à approfondir ces connaissances suite à des études d'autres molécules tel que les
glycérols indicateurs de climat, les halogènes indicateurs de pollution humaine, les lipides des
plantes halophiles. Mes priorités de recherche se focaliseront essentiellement sur l'étude des
émergents dans les réseaux hydrographiques et l'impact socioéconomique.

1. Diagenèse et maturité dans les sédiments récents

De nombreuses études sédimentaires ont conduit à la définition de puissants paramètres
moléculaires permettant de mesurer la maturité de la matière organique au cours des temps
géologiques (Er Raoui et al., 2000 ; Cateau, 2015). Je propose d’étudier les matières organiques
en décomposition pour identifier des substances organiques dont les changements moléculaires ont
eu lieu sur des pas de temps plus courts (de l’heure à la centaine d’années). De tels paramètres
moléculaires s’avéreraient utiles pour mesurer et authentifier l’état de maturation des matières
organiques impliquées dans des processus divers tel que l’humification. Le concept de paramètre
moléculaire de maturité pourrait donc trouver des applications dans la plupart des domaines de la
recherche agronomique, à condition de maîtriser l’analyse fine des traces organiques.

87
2. Composition des sources d’hydrocarbures dans les sédiments
2.1. Cyanobactérie
Les associations de cyanobactéries actuelles dont font partie les tapis microbiens se rencontrent
dans des environnements très variés depuis les lacs salés et les sebkhas jusqu’aux sources thermales
chaudes (Boon et Leeuw, 1987, Rontani et Volkman, 2005 ; Chairi et al, 2010). Tous ces
environnements ont en commun des facteurs de milieu (température, salinité, luminosité) qui
tendent à inhiber toute autre forme de vie. C’est la capacité à l’adaptation à des conditions extrêmes
des associations de cyanobactéries qui leur permet de vivre dans ces environnements extrêmes. Ces
organismes procaryotes (dépourvus de noyau) n’accumulent pas de lipides de réserve, mais
produisent d’autres composés à haute valeur énergétique, tels du glycogène (un sucre complexe,
polymère du glucose), du polyhydroxybutyrate (un polyester naturel) et des alcanes (des
composants majeurs des carburants dérivés du pétrole).
Dans la sebkha de Moknine la répartition des n-alcanes dans les tapis de cyanobactéries est
comparable à celle du pétrole (Chairi et al.,2010, 2018). Il est intéressant de suivre les mécanismes
de transformation ou de diagenèse qui sont responsables de telle répartition des n-alcanes.
2.2. Plantes halophiles
En Tunisie les sebkhas sont abondantes et les sols de ces dernières sont tapissés par des plantes
halophiles. Ces plantes sont des sources d'hydrocarbures. Il sera important d'étudier la composition
de tels organismes pour servir de point de départ aux recherches sur la diagenèse et pour l’étude
des sources de la MO dans les sédiments.
3. Biomarqueur d’origine anthropique
De nombreuses molécules organiques contaminant actuellement les écosystèmes (POP, émergents,
médicaments…), on ignore les processus qui président à leur diffusion et il est souvent difficile de
préciser leur origine. Par exemple les halogènes tel que le fluor trouvé dans le sang de la population
de la région de Zaghouan ou bien et le cadmium concentré à des profondeurs au-delà de 30m dans
la mer au près du canal Khlij. Ces derniers sont probablement associés à des molécules organiques.
À cet égard, je propose d’étendre la recherche de ces molécules à l’ensemble des filières : eaux de
barrage, sols, plantes et engrais boues de stations d’épuration. Ces informations structurales
seraient avantageusement complétées par une analyse des isotopes (C13, H2, Cs…). Enfin, de
manière plus générale, l’étude moléculaire peut s’avérer un puissant moyen d’investigation des
sources, de la biodisponibilité et des mécanismes de transfert des micropolluants organiques.

88
 Références Bibliographiques

A
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