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    Coproculture

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    Le document décrit le protocole d'analyse de selles sur plusieurs jours. Il inclut des examens macroscopiques et microscopiques initiaux, puis des ensemencements sur différents milieux de culture pour identifier d'éventuels pathogènes comme Salmonella, Shigella, Campylobacter ou Clostridium difficile. Les résultats sont lus après incubation puis des tests complémentaires peuvent être effectués.

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    JOUR 1 Analyse de selles

    Examen macroscopique consistance ; présence de glaires, pus, sang...


    Examens microscopiques
    État frais : recherche mobilité particulière, levures,
    Échantillon de selles parasites, globules rouges.
    Gram : recherche déséquilibre Gram+/Gram-
    Recherche d ’antigènes viraux Frottis bleu de méthylène : leucocytes.
    (sujets fragilisés, selles diarrhéiques,
    absence de leucocytes).
    Test Rotavirus | test Adénovirus. PCR-Multiplex : Salmonella,Shigella/E. coli (EIEC),
    Campylobacter jejuni/coli et E. coli (EHEC)
    Par envoi à laboratoire spécialisé. Résultat sous 24h.
    Culture maintenue pour identification et antibiogramme.

    Dilution selle Test d’agglutination


    dans tampon ENSEMENCEMENTS
    Milieux systématiquement ensemencés Milieux additionnels possibles
    Salmonella selon contexte, examens micro,
    Salmonella Shigella Salmonella Yersinia Campylobacter prescription... :
    BCP (Escherichia coli)
    Sabouraud + chloramphénicol (levures)
    Clostridium difficile ou
    chromID C.difficile(Clostridium difficile)
    TCBS ou chromID Vibrio (Vibrio cholerae)
    Enrichissement Hektoen* chromID*
    SM2
    Yersinia CIN Campylosel ou
    chromID CASA
    Chapman (Staphylococcus)
    Sélénite, Rappaport Cétrimide ou chromID P.aeruginosa (Pseudomonas)
    (microaérophile)

    JOUR 2
    Étude macroscopique : recherche de colonies suspectes Si présence en nombre élevé
    d ’un type de colonie ou contexte
    + -
    - + +
    + +
    Si absence de colonie Test uréase rapide
    suspecte sur Hektoen sur chaque colonie
    et SM-ID : isolement suspecte + témoin
    Proteus - 3h à 37°C
    Si orientation vers germe responsable : identification biochimique
    Uréase+ A partir de ou MALDI-TOF
    Salmonella chaque uréase et en fonction de la demande et du contexte réaliser un
    Shigella négative antibiogramme.

    Hektoen
    ou ChromID
    JOUR 3
    Recherche de colonies suspectes Lecture : identification + éventuel antibiogramme
    Rémi Moreda - Lycée Docteur Lacroix - Narbonne

    - + + sérotypage pour Salmonella, Shigella,


    Vibrio cholerae et Escherichia coli
    Absence de colonie Test uréase rapide
    suspecte
    Jour 3 Salmonella sur chaque colonie
    suspecte + témoin
    Shigella Proteus - 3h à 37°C

    Uréase+ A partir de
    Salmonella chaque uréase
    Shigella négative identification
    biochimique ou MALDI-TOF
    JOUR 4
    Lecture : identification + sérotypage
    Salmonella/Shigella

    * il existe un milieu chromID Salmonella/Hektoen composé de deux demi géloses

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