Scribd Logo
Importer

Bienvenue sur Scribd !

  • 210 vues

    Bio 322 B

    Transféré par

    Mourad Djeeraf

    Droits d'auteur :

    Attribution Non-Commercial (BY-NC)
    Téléchargez comme PDF, TXT ou lisez en ligne sur Scribd

    Bio 322 B

    Transféré par

    Mourad Djeeraf
    210 vues4 pages

    Titre original

    bio322b

    Copyright

    © Attribution Non-Commercial (BY-NC)

    Formats disponibles

    PDF, TXT ou lisez en ligne sur Scribd

    Avez-vous trouvé ce document utile ?

    Ce contenu est-il inapproprié ?

    Droits d'auteur :

    Attribution Non-Commercial (BY-NC)
    Téléchargez comme PDF, TXT ou lisez en ligne sur Scribd
    Télécharger au format pdf ou txt
    210 vues4 pages

    Bio 322 B

    Transféré par

    Mourad Djeeraf

    Droits d'auteur :

    Attribution Non-Commercial (BY-NC)
    Téléchargez comme PDF, TXT ou lisez en ligne sur Scribd
    Télécharger au format pdf ou txt
    Vous êtes sur la page 1sur 4

    ECOLE DE BIOLOGIE INDUSTRIELLE

    Enzymologie & cinétique chimique

    Nom: Enzymologie Fondamentale

    Domaine Discipline Niveau d'approfondissement N° d'ordre Ecole Maître


    d'Oeuvre
    Biologie Biochimie 3 1 EBI

    Identifiant: BIO322B

    Année obligatoire: 2

    Crédits EC TS : 4

    Statut: Obligatoire

    Objectifs: L’étude des mécanismes de la cinétique chimique et de la catalyse seront abordés dans
    la première partie de ce module en préalable à l’étude de la catalyse enzymatique. L’étude de la catalyse
    enzymatique est abordée à partir d’une approche thermochimique et cinétique. Le modèle classique de Michaelis
    Mentel est démontré à partir de la notion de fonction de saturation. Ensuite sont présentées les grandeurs
    cinétiques caractéristiques du catalyseur biologique : KM, VM, kcat, KI. Ce cours axé sur l’approche cinétique,
    doit donner à l’étudiant les outils nécessaires à l’étude du génie enzymatique (Génie de la réaction biochimique
    – PRO401B).
    La troisième partie du cours est consacrée à l’étude des mécanismes réactionnels de la catalyse enzymatique.
    L’approche mécanistique permet de démontrer la très grande spécificité du catalyseur biologique par rapport au
    catalyseur chimique. Cette étude passe par une étape de définition de la notion de site actif (théorique et
    pratique), ensuite sont présentés quelques mécanismes classiques en enzymologie.
    Au terme de cette étude, l’étudiant doit être capable de pouvoir établir la relation entre l’aspect cinétique et
    mécanistique de la catalyse enzymatique.
    Enfin en dernière partie de ce cours quelques aspects de l’enzymologie appliquée seront abordés notamment
    l’analyse enzymatique et ses développements.

    Prérequis: connaissances de base en biochimie et chimie générale

    Domaines connexes: Biochimie métabolique (BIO322B), Chimie Organique (CHM223B), Biologie


    Moléculaire (BIO261B et BIO361B), Génie de la réaction biochimique (PRO401B)

    Préalables à: Immunologie (BIO372B), Toxicologie générale (BIO381B), Génie de la Réaction Biochimique


    (PRO401B).

    Télécharger l'organisation du cours

    Homepage du cours d’enzymologie : http://bioinfo.ebi-edu.com/cours

    PLAN DU COURS

    Séance 1 : Cinétique chimique

    Séance 2 : Cinétique chimique

    Séance 3 : Cinétique chimique

    Séance 4 et 5: I. Introduction à l'étude de l'enzymologie

    I.1. Vocabulaire
    I.2. Visualisation tridimensionnelle
    I.3. Propriétés générales des enzymes

    Ecole de Biologie Industrielle Catalogue de cours BIO322B


    I.4.L'activité de certaines enzymes est régulée
    I.5.Les enzymes transforment les différentes formes d'énergies
    I.6.Les enzymes n'altèrent pas l'équilibre de la réaction chimique catalysée
    I.7.Les enzymes abaissent les énergies d'activation des réactions qu'elles catalysent
    I.8 La formation d'au moins un complexe enzyme-substrat est l'étape caractéristique
    de la catalyse enzymatique
    I.9.Classification systèmatique et nomenclature

    Liens internet liés à la séance :

    Home Page RASMOL


    http://www.umass.edu/microbio/rasmol/index.html

    Protein data bank


    http://www.rcsb.org/pdb/

    Structure des protéines enzymatiques :


    http://www.clunet.edu/BioDev/omm/aa/aa.html
    http://webhost.bridgew.edu/fgorga/proteins/default.html

    Séance 6: II. Approche thermodynamique


    II.1. L’énergie libre
    II.2. La théorie de l’état de transition
    II.3 L’efficacité catalytique des enzymes
    II.4. Mise en évidence du complexe ES, équation de Scatchard
    II.5. La fonction de saturation
    Liens liés à la séance 6,
    http://users.swing.be/chimiecinetique/index1.html
    http://www.biochimie.univ-montp2.fr/licence/enzymo/citfor.htm

    Séance 7 et 8 : III. Spécificité et efficacité de la catalyse enzymatique

    III.1. Les enzymes sont hautement spécifiques


    III.2. Le point de vue cinétique
    III.3. Mise en équation
    III.4. Signification physique des paramètres d'état stationnaire
    III.5. Equation générale
    III.6. Unités et linéarisations
    III.7. Cinétiques à deux substrats

    Liens liés à la séance 7


    Tutorial pour le tracé des données d'analyse cinétique de la réaction catalysée par une
    enzyme
    http://cti.itc.virginia.edu/%7Ecmg/Demo/contents.html

    Animation illustrant l'activité enzymatique


    http://bcs.whfreeman.com/thelifewire/content/chp06/0602001.html

    Séance 9 : Action des inhibiteurs sur l'activité enzymatIque


    Introduction
    Mode d'action des inhibiteurs
    Analyse cinétique des effets d'inhibition
    Considération sur les paramètres Kcat et Km
    Quelques exemples d'inhibiteurs

    Séance 10 : Quizz (cours et TD)

    Séance 11: Influence du pH sur l'activité enzymatique

    Ecole de Biologie Industrielle Catalogue de cours BIO322B


    Introduction, équation générale de la vitesse
    Analyse des résultats expérimentaux
    Influence de la température sur la vitesse des réactions enzymatiques
    Séance 12 et 13: Introduction à l'étude des mécanismes de la catalyse enzymatique
    Introduction
    Les voies réactionnelles de catalyse en milieux acqueux
    Catalyse générale acide-base
    Catalyse covalente
    Les enzymes et les différents mécanismes de catalyse
    Les facteurs de l'efficacité et de la spécificité enzymatique

    Tutoriel de différents mécanismes enzymatiques


    http://cti.itc.virginia.edu/%7Ecmg/Demo/mechanism/mech.html

    Séance 14 : Introduction au génie enzymatique


    Obtention des enzymes
    Analyse enzymatique
    Electrodes à enzymes, Biocapteurs,
    Réacteurs enzymatiques
    Séance 15: Devoir de synthèse

    TRAVAUX DIRIGES

    TD n° 1 : Cinétiques chimiques
    http://www.biochimie.univ-montp2.fr/licence/enzymo/citfor.htm
    http://users.swing.be/chimiecinetique/index1.html

    TD n° 2 : Cinétiques chimiques

    TD n° 3 : Cinétiques chimiques

    TD n°4 : Structure des protéines


    http://www.biochimie.univ-montp2.fr/prot_prot/interacag/html/index.htm

    TD n° 5, 6 : Cinétiques enzymatiques

    TD n° 7, 8 : Cinétiques à deux substrats, inhibitions

    TD n° 9 : Etude des sites actifs

    TD n° 10 : Effet du pH et de la température

    TD n° 11 : Etude de la chymotrypsine

    TD n° 12 : Analyse enzymatique
    http://www.novozymes.com/cgi-bin/bvisapi.dll/discover/discover.jsp?lang=fr
    http://www.activescience-gsk.com/miniweb/content/enzymes/whyare.cfm

    TRAVAUX PRATIQUES

    Quatre séances de 3 h consacrées à la détermination des grandeurs cinétiques et une séance de 3 h sur
    l’approche de l’étude d’un mécanisme réactionnel.
    On utilise pour cela des enzymes parfaitement caractérisées telles que la b galactosidase, phosphatase

    Ecole de Biologie Industrielle Catalogue de cours BIO322B


    alcaline ou alcool déhydrogénase. L’activité enzymatique est suivie soit par une méthode
    colorimétrique ou électrochimique.

    TP I : Détermination des paramètres cinétiques d’une enzyme (b galactosidase ou alcool


    déhydrogénase) par une méthode colorimétrique. Mise en évidence de la VM détermination du KM
    influence de la concentration en enzyme sur la VM.

    TP II : Etude de l’influence d’inhibiteurs compétitifs et non compétitifs sur l’activité enzymatique.


    Détermination graphique des constantes cinétiques caractéristiques des phénomènes observés.

    TP III : Etude de l’influence du pH et de la température sur l’activité enzymatique. Détermination


    expérimentale des groupements impliqués dans la catalyse enzymatique.

    BIBLIOGRAPHIE

    • La Biochimie de Lubert STRYER, L. STRYER Médecine-Sciences, Flammarion. Partie II chapitre


    7, 8, 9, 10. 1992.

    • Enzyme structure and mechanism second edition, A. FERSHT W. H. Freeman and Co 1985.

    • Enzyme assays, a pratical approach. R. EISENTHAL and J. DANSON IRL PRESS at Oxford
    University Press 1993.

    • Enzymes, J. PELMONT. Maloine. 1989.

    • Principes de l’analyse enzymatique. H. BERGMEYER

    Ecole de Biologie Industrielle Catalogue de cours BIO322B

    Vous aimerez peut-être aussi