D 1.1 Replicación del ADN
D 1.1 Replicación del ADN
D 1.1 Replicación del ADN
Preguntas de orientación
• ¿Cómo se produce ADN nuevo?
D1.1.8 Funciones de la ADN primasa, la ADN polimerasa I, la ADN polimerasa III y la ADN ligasa en la
replicación
Se debe limitar al sistema procariótico.
Figura 2
D1.1.1 La replicación del ADN como producción de copias exactas de ADN con idénticas secuencias
de
La bases
replicación del ADN es el proceso mediante
el cual cada molécula de ADN se duplica y
forma una copia idéntica y ocurre durante la
fase S de la interfase, antes de la mitosis.
Cadena nueva
Cadena nueva
ADN original
Cadena original
El emparejamiento de bases complementarias asegura copias idénticas de ADN.
Las cadenas parentales actúan como
Adenina se empareja sólo con Timina
moldes para las nuevas cadenas
Citosina se empareja sólo con Guanina
complementarias.
Esto asegura que las nuevas moléculas de ADN sean
idénticas a la original – sin errores – de forma que la
secuencia de nucleótidos se conserva.
Esto es importante ya que la secuencia de bases del
ADN contiene la información genética del organismo.
Un error en el orden de las bases puede producir un
error en la expresión genética (síntesis de proteínas),
que podría ser perjudicial (incluso fatal) para la célula
o el organismo.
http://learn.genetics.utah.edu/content/molecules/builddna/
http://www.hhmi.org/biointeractive/dna-rep
lication-advanced-detail
Existen tres posibles modelos de replicación del ADN:
ADN original
Primera
replicación
Segunda
replicación
ADN original
ADN nuevo
Matthew Meselson y Franklin Stahl, 1958
D1.1.3 Función de la helicasa y la ADN polimerasa en la replicación del ADN
La helicasa desenrolla la doble hélice y separa las dos cadenas mediante la ruptura de los puentes de
hidrógeno.
Antes de que la replicación del ADN ocurra, las cadenas se deben separar. Este proceso lo realiza la
enzima helicasa y requiere ATP. La helicasa está formada por seis subunidades que forman un anillo
que se acopla y se desliza a lo largo de la molécula de ADN rompiendo los puentes de hidrógeno
entre las bases y haciendo que el ADN pierda su forma de doble hélice.
Helicasa 3’
Cadena original
ATP
Bases expuestas
ATP
Cadena original
Al avanzar la helicasa se rompen los puentes de 5’
hidrógeno y las hebras del ADN se separan (esta
especie de cremallera que avanza se denomina
horquilla de replicación)
ADN polimerasa
La ADN polimerasa une entre sí los nucleótidos para formar una nueva cadena, usando para ello la cadena
preexistente como una plantilla.
ADN polimerasa
(dos subunidades
enlazadas) Cadena original (molde)
3’
5’
Nuevas cadenas
complementarias
3’
5’
Cadena original (molde)
nucleótidos libres
Los nucleótidos libres son recogidos por la ADN polimerasa y enlazados covalentemente a la nueva cadena
por el emparejamiento de bases complementarias. Frente a un nucleótido con A coloca uno con T; frente a
un nucleótido con C coloca uno con G; y viceversa. A continuación se forma un enlace fosfodiéster entre el
fosfato 5’ del nuevo nucleótido con el carbono 3’ de la desoxirribosa del nucleótido anterior.
D1.1.6 Direccionalidad de las ADN polimerasas
La ADN polimerasa solo puede unir nucleótidos al extremo 3´.
Va sintetizando la nueva cadena en sentido 5´→3´
(=la nueva cadena va creciendo en sentido 5´→3´)
Velocidad de replicación: Replicación en procariotas
• La replicación del ADN puede durar unas pocas de
horas y en consecuencia limita la duración del ciclo
celular.
• Las bacterias pueden replicarlo rápidamente porque
contienen una pequeña cantidad de ADN circular.
• Los organismos eucariotas aceleran la replicación
del ADN al tener miles de horquillas de replicación a
lo largo de la molécula. http://goo.gl/7bA6F
Replicación en eucariotas
ADN
Horquillas de replicación
bidireccionales
http://click4biology.info/c4b/3/Chem3.4.htm
http://www.hhmi.org/biointeractive/media/DNAi_replication_vo1-lg.mov
• Síntesis de ADN: La ADN polimerasa necesita la presencia de
desoxirribonucleótidos-5’-trifosfato de adenina, timina, guanina
y citosina, iones Mg2+ y un fragmento de ADN del que se le ha
retirado un sector de una de las dos cadenas; la enzima es capaz
de, partiendo del extremo 3’ de la cadena interrumpida, unir
nucleótidos complementarios a la cadena que está entera. Puede
unir unos 1000 nucleótidos por minuto y permite la síntesis in
vitro de ADN a partir de otro ADN. Sin embargo, la ADN
polimerasa es incapaz de iniciar una cadena de novo; sólo
puede añadir nucleótidos al extremo 3’ de una cadena
preexistente, el llamado “cebador”.
Los nucleótidos que añade son complementarios a la otra cadena
(la hebra “patrón” o “molde”) sobre la que se desplaza en sentido
3’ 5’ de ésta.
Como la ADN polimerasa actúa añadiendo nucleótidos a un
extremo 3’ libre, la cadena de ADN sólo puede crecer en sentido
5’ 3’. Debido a ello, en una cadena de ADN, el nucleótido que
tiene el carbono 5’ libre se considera el primer nucleótido de la
misma, y el que tiene el carbono 3’ es el último nucleótido
añadido y al cual se le puede añadir otro.
En resumen, la ADN polimerasa “lee” la hebra molde en sentido 3’ 5’ y sintetiza
la cadena complementaria en sentido 5’ 3’. La nueva hebra sintetizada es así
antiparalela con respecto a la hebra patrón.
• La explicación tuvo lugar en 1968, cuando Reiji Okazaki descubrió unos fragmentos constituidos
por unos 50 nucleótidos de ARN y unos 1000 nucleótidos de ADN, que se denominaron
fragmentos de Okazaki. Estos fragmentos son sintetizados al principio por la ARN polimerasa y,
posteriormente, son continuados por la ADN polimerasa, en sentido 5’ 3’ sobre diferentes
regiones de la hebra patrón. Después, estos fragmentos pierden su porción de ARN, que se
sustituye por ADN y permanecen unidos entre sí constituyendo una única hebra de ADN que,
aparentemente, crece en sentido 3’ 5’.
D1.1.7 Diferencias entre la replicación en la cadena conductora y en la cadena discontinua
La replicación del ADN es continua en la cadena conductora o adelantada y discontinua en la cadena retardada.
Como las dos cadenas de la doble hélice del ADN están dispuestas de manera antiparalela (en sentidos opuestos) y las ADN
polimerasas sólo pueden añadir nucleótidos en un sentido, la síntesis tiene lugar de forma muy diferente en cada cadena:
• Una de las cadenas, la llamada cadena o hebra conductora o adelantada, se sintetiza de forma continua en el mismo
sentido en que se abre la horquilla de replicación y a medida que se va abriendo ésta, ya que el sentido en el que esta
cadena se está formando coincide con el sentido en el que las ADN polimerasas pueden añadir nucleótidos.
• La otra cadena, conocida como cadena o hebra discontinua o retardada, se sintetiza en fragmentos en sentido opuesto a la
horquilla: a medida que la horquilla de replicación va exponiendo más longitud de la cadena original, se van creando
nuevos fragmentos, que luego se unirán formando la cadena discontinua. Estos fragmentos se denominan fragmentos de
Okazaki.
La replicación comienza en sitios dentro de las moléculas de ADN llamados orígenes de replicación.
En los procariotas sólo hay un origen de replicación en la molécula de ADN mientras que en
eucariotas hay muchos orígenes en cada molécula de ADN.
La replicación se produce en ambos sentidos a partir de cada origen de replicación, formándose
una estructura que, al microscopio electrónico, aparece como una burbuja de replicación. La mitad
de cada burbuja de replicación se llama horquilla de replicación.
Durante la síntesis de ADN, en cada horquilla de replicación las ADN polimerasas añaden los
nuevos nucleótidos uniéndolos por el grupo fosfato al carbono 3’ del nucleótido que se encuentra
al final la cadena que se está formando. Por lo tanto, la replicación se produce en el sentido 5’ a 3’.
La síntesis de ambas hebras, la conductora y la retardada, se produce de
manera simultánea hasta que se termina totalmente la duplicación. Dado
que esta duplicación es bidireccional, cada una de las nuevas hebras se
sintetiza, en parte, de manera continua; y en parte, lo hace de manera
discontinua.
HEBRA RETARDADA
FRAGMENTOS DE OKAZAKI
Diferentes experimentos demostraron cómo es la síntesis de ADN: Síntesis de ADN in vivo.
• .
D1.1.8 Funciones de la ADN primasa, la ADN polimerasa I, la ADN polimerasa III y la ADN ligasa en
la replicación
En la replicación, intervienen una serie de proteínas, tanto enzimas como proteínas con diferentes funciones:
• La enzima helicasa desenrolla el ADN en la horquilla de replicación y la enzima topoisomerasa libera la tensión que se
crea por delante de la helicasa.
• Proteínas de unión a cadena simple (en inglés proteínas SSB) mantienen las cadenas separadas el tiempo suficiente
para que se pueda copiar la cadena original.
• El inicio de la replicación requiere un cebador de ARN, es decir, una molécula pequeña de ARN a partir de la cual se
empiecen a añadir desoxirribonucleótidos de ADN y pueda comenzar así la síntesis de ADN. En la cadena discontinua
hay varios cebadores, mientras que en la cadena conductora sólo hay uno. La enzima ADN primasa crea un cebador
(en inglés “primer”) de ARN en la cadena conductora y numerosos cebadores de ARN en la cadena discontinua. El
cebador de ARN es necesario para iniciar la actividad de la ADN polimerasa.
• La ADN polimerasa III es la principal polimerasa en la replicación, responsable de la unión covalente
de los nuevos desoxirribonucleótidos al extremo 3’ de la cadena que se está formando. Los
nucleótidos se ensamblan en dirección 5´-3´ .
• La ADN polimerasa I es una exonucleasa porque puede romper los enlaces entre los nucleótidos pero
también es una polimerasa porque puede unir nucleótidos. Esta ADN polimerasa I se mueve
eliminando los cebadores de ARN y sustituyéndolos por nucleótidos de ADN. Se separa cuando llega
al siguiente fragmento de Okazaki.
• La ADN ligasa forma enlaces para unir entre sí los fragmentos de la hebra discontinua.
Replicación del
cromosoma circular de
E.coli (MET, falso color)
D1.1.9 Corrección de errores en el ADN
A veces queda algún error sin corregir. Estos errores (mutaciones) son una fuente
importante de variabilidad genética, necesaria para la evolución de las especies.
PREGUNTAS BASADAS EN DATOS: DESCUBRIMIENTO DE LOS FRAGMENTOS DE OKAZAKI
D1.1.4 Reacción en cadena de la polimerasa y electroforesis en gel como herramientas para
amplificar y separar el ADN
La reacción en cadena de la polimerasa (PCR, “polymerase chain reaction”) o reacción de
amplificación del ADN es una técnica básica en biología molecular que permite duplicar en grandes
cantidades pequeños fragmentos aislados de ADN y obtener multitud de copias, con diversos fines:
Identificación de virus o bacterias en una persona enferma.
Diagnóstico de enfermedades hereditarias y mutaciones.
Pruebas de paternidad.
Termociclador
Pruebas forenses.
Análisis de pruebas paleontológicas y evolutivas.
Investigación científica y recombinación de ADN de distintas especies.
ADN.
Laboratorio virtual