Clase 2 Bioelementos y Biomoleculas Metabolismo

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BIOLOGÍA GENERAL

CLASE 2: Bioelementos: Átomos de carbono y moléculas orgánicas,


carbohidratos, lípidos, proteínas, acido nucleicos
EAP INGENIERÍA AGROINDUSTRIAL
Dr. Yosef Avalos Ramírez
ORIGEN DE LA CÉLULA

El problema del origen de la vida es el problema del origen de la célula.


No se sabe cómo apareció la primera célula en la Tierra, pero se acepta
que su origen fue un fenómeno físico-químico. Esta visión llegó con las
propuestas de A.I. Oparin y J.B.S. Haldane en torno a los años 20 del
siglo XX (también fue sugerida por C. Darwin en una carta personal).
¿Qué es un ser vivo?
• Para investigar el origen de la vida deberíamos saber reconocer a un ser
vivo. Podemos decir que es un organismo que tiene la cualidad de la vida.
Pero ¿qué es la vida? Actualmente se tiende a no proponer una definición
sino a considerar a la vida como un conjunto de propiedades que debería
poseer un organismo para ser considerado como vivo. Se suelen incluir:

a) Reproducción o transmisión de información codificada por el ácido


desoxirribonucleico o ADN.
b) Mantenimiento de la homeostasis interna gracias a su capacidad para
obtener energía externa (metabolismo).
c) Tener capacidad para producir respuestas a estímulos externos o internos.
d) Evolución condicionada por la interacción con el medio externo,
capacidad para la adaptación (evolución darwiniana).
• Formación de moléculas orgánicas
• Las células están formadas por moléculas
orgánicas, además del agua e iones. Las
principales son proteínas, nucleótidos,
azúcares y grasas. ¿Cómo se formaron? a) En la
Tierra en condiciones físicas extremas. Si se
coloca en un matraz una disolución acuosa con
sustancias como CO2, amoniaco, metano e
hidrógeno, y se les somete a una alta
temperatura y a descargas eléctricas, se
consigue que se formen pequeñas moléculas
orgánicas como cianuro de hidrógeno,
formaldehído, aminoácidos, azúcares, purinas
y pirimidinas. Éste fue el experimento que
realizaron Miller y Urey intentando simular las
condiciones primitivas.
• Formación de polímeros
• Ya tenemos moléculas orgánicas, pero las más importantes para la célula suelen aparecer en
forma de polímeros complejos y no como moléculas simples: las cadenas de aminoácidos
forman las proteínas y los polinucleótidos forman el ADN y el ARN. ¿Cómo se formaron estos
polímeros?:
• a) Calor sobre compuestos secos. Hay experimentos en los cuales la aplicación de calor sobre
componentes secos lleva a la aparición de polímeros orgánicos.
• b) Catálisis por superficies minerales. Los minerales: concentran, seleccionan, hacen de molde
y catalizan reacciones de moléculas orgánicas. Los minerales podrían haber servido además
como lugares de protección frente a las adversas condiciones atmosféricas y como sustratos o
moldes para la polimerización y las reacciones químicas.
• c) Fuentes hidrotermales. El proceso de formación de moléculas orgánicas se produce hoy en
día en las fumarolas, que, bajo unas condiciones de presión y calor elevados, con la ayuda de
minerales, pueden producir polímeros orgánicos. Este ambiente es más favorable para formar
membranas espontáneamente a partir de lípidos anfipáticos que el agua de mar.
• e) Membranas lipídicas. Distintos experimentos en laboratorio muestran que las membranas
lipídicas, como las que hoy tienen las células, podrían ser centros de atracción, selección y
concentración de moléculas simples.
Membrana celular
Uno de los principales eventos en el origen de las células fue el desarrollo
de una envuelta que aislara un medio interno de otro externo. Esto tiene
muchas ventajas:
a) Permite tener todos los componentes necesarios próximos para las
reacciones metabólicas y se hace más eficiente el proceso de
replicación.
b) Evita que variantes ventajosas de moléculas orgánicas sean
aprovechadas por grupos competidores, es decir, egoísmo evolutivo.
c) Gana una cierta independencia respecto a las alteraciones del medio
externo favoreciendo la homeostasis interna.
Las membranas lipídicas se producen fácilmente de forma espontánea a
partir de ácidos grasos anfipáticos, es decir, moléculas que tienen una parte
cargada eléctricamente y otra que es hidrófoba.
Hay dos posibilidades para la asociación entre moléculas como
nucleótidos y aminoácidos y las membranas (Figura 3).
a) Las membranas iniciales formaron pequeñas bolsas o vesículas
que englobaron poblaciones de moléculas. Se producirían reacciones
moleculares internas gracias a que las membranas serían permeables
a moléculas pequeñas, pero no a los polímeros creados
internamente, a los cuales no les sería fácil escapar.
b) Otra posibilidad es que hubo una asociación inicial de moléculas
orgánicas simples con membranas de lípidos. Este sistema de
polímeros (oligopéptidos y oligonucleótidos) y membranas fue
ganando en complejidad y dependencia hasta que algunos polímeros
atravesaron la propia membrana y quedaron en su interior.
Figura 3. Modelos de la vida
dentro de la vesículas (arriba) y
fuera de la vesícula"(abajo) en los
que la membrana es el elemento
clave para seleccionar, concentrar
y favorecer las reacciones de las
moléculas (modificado de Black y
Blosser, 2016).
Bioelementos y Biomoléculas

https://www.youtube.com/watch?v=G2VcCAAEQso
Los bioelementos
Estos no se pueden dividir en sustancias mas simples por medio de reacciones
químicas ordinarias. Solo cuatro elementos, oxigeno, carbono, hidrogeno y
nitrógeno, son responsables de más del 96% de la masa de la mayoría de los
organismos. Otros, tales como calcio, fosforo, potasio y magnesio, están
también constantemente presentes, pero en cantidades mas pequeñas. Algunos
elementos, como el yodo y cobre, se conocen como oligoelementos, ya que solo
son necesarios en cantidades muy pequeñas.
I. BIOMOLÉCULAS
Las biomoléculas son los compuestos químicos que forman la materia
viva. Resultan de la unión de los bioelementos por enlaces químicos
entre los que destacan los de tipo covalente
1.1 Biomoléculas inorgánicas: son características de la materia inerte,
pero se encuentran también entre los seres vivos. No poseen átomos de
carbono. Son el agua, las sales minerales y algunos gases que pueden
desprenderse o utilizarse en el transcurso de las reacciones químicas de
las células como el oxígeno (O2) y el dióxido de carbono (CO2).
A. EL AGUA. El agua es una molécula de enorme importancia biológica,
tanto por su abundancia como por las funciones que desempeña en la
materia viva así como por el papel que ha jugado en el origen y evolución
de la vida.
• Abundancia. El agua es la biomolécula más abundante de los seres vivos,
alcanzando una proporción media del 75% del peso total. Hay seres con
mayor proporción (lechugas o medusas, por ejemplo con más de un 90%)
y otros con mucha menos (por ejemplo las semillas de los vegetales 15%).
En los tejidos humanos el porcentaje de agua varía del 20% en los huesos
al 85% en las células cerebrales, aproximadamente el 70% de nuestro
peso corporal total es agua.
Funciones biológicas. Están relacionadas con sus propiedades fisicoquímicas.
Las principales son:
• Función disolvente. El agua es un líquido que disuelve un gran número de
sustancias diferentes (disolvente universal). Esto hace que casi todas las reacciones
biológicas tengan lugar en medio acuoso.
• Funciónes cohesivas
• La cohesión se refiere a la unión de dos moléculas del mismo tipo; por ejemplo,
dos moléculas de agua. Las moléculas de agua son cohesivas: se unen unas a otras
mediante los puentes de hidrogeno. Esta propiedad es útil para el transporte de
agua en las plantas.
• Función bioquímica. El agua participa en reacciones bioquímicas como sustancia
reaccionante o sustrato, como por ejemplo en las llamadas hidrólisis, mediante
las cuales muchas macromoléculas orgánicas son descompuestas en biomoléculas
más simples. En procesos como la fotosíntesis, el agua interviene aportando
hidrógenos. En otras reacciones, se obtiene agua como producto de reacción, como
por ejemplo en la respiración u oxidación de la glucosa.
• Función estructural. El agua puede servir de auténtico esqueleto, dando
consistencia a ciertas células o estructuras. Por ejemplo esto sucede en
plantas herbáceas o en animales como las medusas.
• Medio de reacción. Además, constituye un medio que facilita la movilidad de
las moléculas, favoreciendo el que puedan reaccionar entre ellas. (Las
semillas pueden mantenerse “dormidas” mucho tiempo porque al no tener
agua, no hay reacciones químicas).
• Función termorreguladora. El agua, debido a su elevado calor específico es un
excelente regulador, evitando los cambios bruscos que podrían afectar a los
seres vivos. Por ejemplo, la sangre calienta la piel cuando ésta pierde calor, o
el sudor la enfría si hay un sobrecalentamiento. Pero todo ello sin tener que
movilizar o perder mucha cantidad de líquido.
B. LAS SALES MINERALES
Están formadas por un catión y un anión. Las sales pueden presentarse de dos
formas diferentes:
1. Sales insolubles o no disociadas. Se dicen también sales precipitadas. Presentan
una función esquelética, formando caparazones (carbonato cálcico) o conchas o
bien huesos (fosfato cálcico).
En algunos casos, los iones pueden estar unidos a moléculas orgánicas, de modo
que no están disociados pero tampoco forman sales minerales. Sus funciones
dependerán de la molécula de que se trate. Por ejemplo, la hemoglobina lleva el
ion hierro, la clorofila contiene magnesio, la vitamina B12 lleva el ion Cobalto, etc.
2. Sales solubles o en forma disociada. Los iones se encuentran disueltos en agua
y son responsables de algunas funciones muy específicas, pero también
intervienen de manera decisiva en procesos físico-químicos de importancia vital
para los organismos.
Dos de los fenómenos fundamentales desde el punto de vista biológico son el
equilibrio osmótico y el pH:
1.2 Biomoléculas orgánicas: están formadas por carbono, hidrógeno y
oxígeno y, en muchos casos nitrógeno, fósforo y azufre. En general son
moléculas exclusivas de los seres vivos, salvo el caso del metano, que es
el hidrocarburo más simple y que sabemos que puede tener un origen no
biológico.
• Los principales tipos de biomoléculas son:
• Glúcidos, lípidos, prótidos y ácidos nucleicos.

• El metano es el gas de efecto invernadero que tiene el segundo mayor efecto sobre el clima, después del CO2
CARBOHIDRATOS
Los azúcares, los almidones y la celulosa son carbohidratos. Los azúcares y los
almidones sirven como fuentes de energía para las células, mientras que la
celulosa es el componente estructural principal de las paredes que rodean a
las células vegetales. Los carbohidratos se componen de átomos de carbono,
hidrógeno y oxígeno en proporción aproximada de un átomo de carbono por
cada dos de hidrógeno y uno de oxígeno (CH2O). El término carbohidrato, que
significa “hidrato (agua) de carbono” refleja la proporción 2:1 de hidrógeno a
oxígeno, que es la misma presente en el agua (H2O).
• Los monosacáridos por lo general, contienen de tres a siete átomos de
carbono. En un monosacárido, todos los carbonos excepto uno están unidos
a un grupo hidroxilo; este carbono único presenta un enlace doble con un
átomo de oxígeno, constituyendo un grupo carbonilo. Si el grupo carbonilo
está en el extremo de la cadena, el monosacárido es un aldehído; si el
grupo carbonilo está en cualquier otra posición, el monosacárido es una
cetona.
• Los carbohidratos más simples son los azúcares de tres carbonos (triosas):
gliceraldehído y dihidroxiacetona. La ribosa y la desoxirribosa son pentosas
comunes, es decir azúcares de cinco átomos de carbono, son componentes
de los ácidos nucleicos (ADN, ARN y compuestos relacionados). La glucosa,
fructosa, galactosa y otros azúcares de seis átomos de carbono se llaman
hexosas.
• Un disacárido (dos azúcares) consiste en dos anillos de monosacáridos
unidos por un enlace glucosídico o glicosídico, que consta de un
oxígeno central unido covalentemente a dos carbonos, uno en cada
anillo . El enlace glucosídico de un disacárido en general se forma entre
el carbono 1 de una molécula y el carbono 4 de la otra molécula.
• El disacárido maltosa (azúcar de malta) consiste en la unión de dos
unidades de a-glucosa mediante un enlace covalente. La sacarosa,
azúcar de mesa, consta de una unidad de glucosa combinada con otra
de fructosa. La lactosa (el azúcar de la leche) se compone de una
molécula de glucosa y otra de galactosa.
Un polisacárido es una macromolécula consistente en unidades repetidas de
azúcares simples, en general glucosa. Los polisacáridos son los más
abundantes, grupo que incluye almidones, glucógeno y celulosa. Aunque el
número exacto de unidades de azúcar varía, por lo general hay miles de
unidades en una sola molécula. Un polisacárido puede ser una cadena larga
simple o una cadena ramificada.
El almidón, es la forma común de carbohidrato que utilizan las plantas para
el almacenamiento de energía, es un polímero que consiste en subunidades
de a-glucosa. Estos monómeros están unidos por enlaces a 1—4, lo que
significa que el carbono 1 de una glucosa está enlazado al carbono 4 de la
siguiente glucosa en la cadena.
El almidón se presenta en dos formas: amilosa y amilopectina. La amilosa,
que es la forma más sencilla, no es ramificada, mientras que la amilopectina,
que es la forma más frecuente, por lo general se compone de
aproximadamente 1000 unidades de glucosa en una cadena ramificada.
• El glucógeno (a veces denominado almidón animal) es la forma en que las unidades
de glucosa, unidas mediante enlaces a 1-4 glucosídicos, se almacenan como
fuente de energía en los tejidos animales. Su estructura es similar a la del
almidón vegetal, aunque presenta muchas ramificaciones y es más soluble
en agua. En vertebrados, el glucógeno se almacena sobre todo en las células
hepáticas y musculares, donde se requiere para cumplir con su intensa
actividad.
• La celulosa es un polisacárido insoluble, que se compone de muchas
moléculas de glucosa muy juntas entre sí. Los enlaces entre estas unidades
de azúcar son diferentes a los del almidón. Recuerde que el almidón está
formado por subunidades de a-glucosa, unidas mediante enlaces a 1-4
glucosídicos. La celulosa contiene monómeros de β-glucosa unidos por
enlaces β 1-4 glucosídicos, que no se pueden romper por las enzimas que
producen la hidrólisis de los enlaces a del almidón
LIPIDOS
A diferencia de los carbohidratos, que se
definen por su estructura, los lípidos son un
grupo heterogéneo de compuestos que se
caracterizan por el hecho de que son
solubles en solventes no polares (como éter
y cloroformo) y relativamente insolubles en
agua.
Entre los grupos de lípidos biológicamente
importantes están las grasas, los
fosfolípidos, los carotenoides, esteroides y
ceras. Hay lípidos que se utilizan como
reserva de energía, algunos son
componentes estructurales de las
membranas celulares y otros son hormonas
importantes.
La enfermedad de Gaucher
Es una enfermedad hereditaria poco frecuente en donde una persona no tiene
una cantidad suficiente de una enzima llamada glucocerebrosidasa. Esto causa
una acumulación de sustancias grasosas en el bazo, hígado, pulmones, huesos
y, a veces, en el cerebro.
Glucocerebrosidasa .- Es una enzima lisosomal que degrada lípidos ( grasas )
complejos, glucoesfingolípidos , como la glucosilceramida.
La enfermedad de Farber (Lipogranulomatosis de Farber).- Es
una rara enfermedad hereditaria de transmisión autosómica recesiva
caracterizada por déficit deceraminidasa y acúmulo de ceramida en
los lisosomas de las células. Se incluye dentro de las lipidosis o enfermedades
por almacenamiento de lípidos. Entre las manifestaciones clínicas se incluyen
nódulos subcutáneos, artritis y retraso mental.
• Los triacilgliceroles (triglicéridos) se forman a partir de glicerol y tres ácidos
grasos Los lípidos más abundantes en los seres vivos son los triacilgliceroles.
Estos compuestos, comúnmente conocidos como grasas, son una forma
económica de almacenar reservas de energía ya que, cuando se metabolizan,
liberan más del doble de energía por gramo que los carbohidratos.
• Los ácidos grasos saturados e insaturados.- difieren en sus propiedades físicas
En los lípidos se pueden encontrar unos 30 ácidos grasos diferentes, que en
general son cadenas carbonadas con un número par de átomos de carbono.
Por ejemplo, el ácido butírico, presente en la mantequilla rancia, es una
cadena de cuatro átomos de carbono. El ácido oleico, con 18 carbonos, es el
ácido graso de distribución más amplia en la naturaleza y se encuentra en la
mayoría de las grasas animales y vegetales.
Un ácido graso con enlaces simples entre todos sus átomos de carbono
contiene la mayor cantidad posible de hidrogeno y se llama acido graso
saturado.
Los ácidos grasos que poseen uno o más enlaces dobles son insaturados
porque contienen menos de la cantidad posible de hidrogeno. Si hay un solo
enlace doble, el acido graso es monoinsaturado y, si hay más de un enlace
doble, es poliinsaturado.
LAS PROTEÍNAS
Las proteínas son macromoléculas compuestas de aminoácidos, son los
componentes más versátiles de las células. Los científicos han conseguido
secuenciar prácticamente toda la información genética de una célula humana, y se
está estudiando la información genética de muchos otros organismos. Algunas
personas podrían pensar que la secuenciación de los genes es el final de la historia,
pero realmente es sólo el principio. La mayor parte de la información genética se
utiliza para especificar la estructura de las proteínas, y los biólogos podrían dedicar
la mayor parte del siglo XXI a entender estas macromoléculas extraordinariamente
polifacéticas que son de importancia central para la química de la vida.
En un sentido real, las proteínas están implicadas en prácticamente todos los
aspectos del metabolismo ya que la mayoría de las enzimas, las moléculas que
aceleran las miles de reacciones químicas que tienen lugar en un organismo, son
proteínas.
Del ADN a la PROTEÍNA - YouTube
Los aminoácidos.
Son las unidades básicas que
forman las proteínas. Su
denominación responde a la
composición química general que
presentan, en la que un grupo
amino (-NH2) y otro carboxilo o
ácido (-COOH) se unen a un
carbono α (-C-). Las otras dos
valencias de ese carbono quedan
saturadas con un átomo de
hidrógeno (-H) y con un grupo
químico variable al que se
denomina radical (-R).
LAS PROTEÍNAS TIENEN CUATRO NIVELES DE ORGANIZACIÓN
• Los científicos reconocen cuatro niveles de organización
principales en las proteínas: primario, secundario, terciario
y cuaternario.
• La estructura primaria es la secuencia de aminoácidos
• La secuencia de aminoácidos, unidos por enlaces
peptídicos, es la estructura primaria de la cadena
polipeptídica, es decir, el número de aminoácidos presentes
y el orden en que están enlazados. Esta secuencia está
determinada por las instrucciones de un gen.
• Utilizando métodos analíticos, los investigadores pueden
determinar la secuencia exacta de aminoácidos de las
moléculas de proteínas. Por ejemplo, el glucagón, una
hormona secretada por el páncreas, es un polipéptido
pequeño que consiste en sólo 29 unidades de aminoácidos.
La estructura secundaria
• Es el resultado de los enlaces de
hidrógeno en la cadena
polipeptídica. Esta estructura se
forma y mantiene debido a la
formación de enlaces de
hidrógeno entre los aminoácidos
de cada una de las vueltas o
giros sucesivos de la espiral.
La estructura terciaria
• Depende de interacciones entre cadenas laterales. La estructura
terciaria de una molécula proteínica corresponde a la forma global
que toma por cada una de sus cadenas polipeptídica.
Estructura cuaternaria
• Están compuestas de dos o más cadenas polipeptídicas, que
interactúan entre sí de manera específica para formar la molécula
biológicamente activa.
Funciones de las proteínas
• Catálisis: hay miles de enzimas diferentes que catalizan reacciones químicas
específicas dentro o fuera de la célula.
• Contracción muscular: juntas, la actina y la miosina causan las contracciones
musculares que se utilizan para la locomoción y el transporte alrededor del
cuerpo.
• Citoesqueleto: la tubulina es la subunidad de microtúbulos que da a las células
animales su forma y tira de los cromosomas durante la mitosis.
• Resistencia a la tensión: las proteínas fibrosas aportan a la piel, los tendones, los
ligamentos y las paredes de los vasos sanguíneos la resistencia a la tensión que
necesitan.
• Coagulación de la sangre: las proteínas del plasma actúan como factores de
coagulación que hacen que la sangre pase de estado líquido a gel en las heridas.
• Transporte de nutrientes y gases: las proteínas en la sangre ayudan a
transportar oxígeno, dióxido de carbono, hierro y lípidos.
Adhesión celular: las proteínas de membrana hacen que las células animales
adyacentes se peguen unas a otras en los tejidos.
Transporte de membrana: las proteínas de membrana se utilizan para la
difusión facilitada y el transporte activo, así como para el transporte de
electrones durante la respiración celular y la fotosíntesis.
Hormonas: algunas como la insulina, FSH y LH son proteínas, pero las
hormonas son químicamente muy diversas.
Receptores: sitios de unión en las membranas y el citoplasma para las
hormonas, neurotransmisores, sabores y olores, y también receptores de luz
en el ojo y en las plantas.
Empaquetamiento del ADN: las histonas se asocian al ADN en los eucariotas y
ayudan a los cromosomas a condensarse durante la mitosis.
Inmunidad: este es el grupo de proteínas más diverso, ya que las células
pueden producir un gran número de anticuerpos diferentes.
ÁCIDOS NUCLEICOS
• Los ácidos nucleicos transmiten la información hereditaria y determinan qué
proteínas produce una célula. En las células se encuentran dos tipos de
ácidos nucleicos: el ácido desoxirribonucleico y el ácido ribonucleico. El ácido
desoxirribonucleico (ADN) es el componente de los genes, el material
hereditario de la célula, y contiene instrucciones para la síntesis de todas las
proteínas y de todo el ARN que necesita el organismo. El ácido ribonucleico
(ARN) participa en el proceso de unión de aminoácidos para formar
polipéptidos.
• Los ácidos nucleicos son polímeros de nucleótidos, unidades
moleculares que consisten en:
• (1) un azúcar de cinco átomos de carbono, ya sea desoxirribosa (en el
ADN) o ribosa (en el ARN)
• (2) uno o más grupos fosfato, que hacen ácida a la molécula.
• (3) una base nitrogenada, compuesto anular que contiene nitrógeno. La
base nitrogenada puede ser una purina de doble anillo o una pirimidina
de un solo anillo.
Metabolismo
El metabolismo es el conjunto de todas las reacciones catalizadas por enzimas en una
célula o un organismo. Todos los organismos vivos llevan a cabo una gran
cantidad de reacciones químicas diferentes. La mayoría de ellas tienen lugar en
el citoplasma de las células, pero algunas son extracelulares, como las
reacciones utilizadas para digerir los alimentos en el intestino delgado. El
metabolismo es la suma de todas las reacciones que se producen en el
organismo. El metabolismo son las vías por las cuales un tipo de molécula se
transforma en otra, mediante una serie de pequeños pasos.
Anabolismo
El anabolismo es la síntesis de moléculas complejas a partir de
moléculas más simples, incluida la formación de macromoléculas a
partir de monómeros, por reacciones de condensación. El
anabolismo consiste en reacciones que forman moléculas más
grandes a partir de moléculas más pequeñas. El anabolismo incluye
estos procesos:
• Síntesis de proteínas mediante los ribosomas
• Síntesis de ADN durante la replicación
• Fotosíntesis, incluida la producción de glucosa a partir de dióxido
de carbono y agua
• Síntesis de glúcidos complejos, como el almidón, la celulosa y el
glucógeno
Catabolismo
El catabolismo es la descomposición de moléculas complejas en moléculas más
simples, incluida la hidrolisis de macromoléculas en monómeros.
El catabolismo es la parte del metabolismo en la que se descomponen
moléculas más grandes en otras más pequeñas. Las reacciones catabólicas
liberan energía y, en algunos casos, esta energía es capturada en forma de ATP,
que puede utilizarse en la célula. El catabolismo incluye estos procesos:
• La digestión de los alimentos en la boca, el estomago y el intestino delgado
• La respiración celular, en la que la glucosa o los lípidos se oxidan para obtener
dióxido de carbono y agua
• La digestión por parte de descomponedores de los compuestos de carbono
complejos existentes en la materia orgánica muerta

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