Métodos y técnicas en

micología y virología
Semana 13
Virus respiratorios

Blgo. Giancarlo Ubillus Celi

 Temario

I. Virus respiratorios. Influenza. Coronavirus.

1. Características en la infección humana

2. Cuadro clínico
3. Diagnóstico de laboratorio

Pág. 1
 Introducción

• Las infecciones respiratorias agudas (IRA) se encuentran entre las tres

primeras causas de morbimortalidad en la población general, y primera
causa de mortalidad en menores de cinco años, principalmente en países en
vías de desarrollo.
• El 80% a 90% de las IRA son de etiología viral, las infecciones de las vías
respiratorias altas son las de mayor frecuencia. Sin embargo, las neumonías
son las que representan un mayor problema para la salud pública 
 Introducción

• En el Perú, durante el 2018 la tasa de incidencia acumulada de episodios de

IRA fue 9297 por 10 000 niños menores de cinco años y de neumonía fue
de 100 por 10 000 menores de cinco años; mientras la tasa de letalidad (1,0
muertes por 100 episodios de neumonía) se ha mantenido constante.
• Estudios realizados en el extranjero, muestran una frecuencia de virus
respiratorios (VR) en pacientes pediátricos entre el 34,1% a 76,7%, en el
Perú se reportó entre 33,5% a 49,7%.
 Influenza virus

• La influenza es una infección viral aguda de las vías

respiratorias, altamente contagiosa, que puede afectar la
mucosa nasal, la faríngea, bronquios y en ocasiones hasta los
alvéolos pulmonares.
• Esta infección puede tener un comportamiento endémico,
epidémico o de una pandemia. Los síntomas son parecidos al
los del resfriado; sin embargo, son más graves y su inicio es
generalmente abrupto.
 Influenza virus

• En ocasiones se utiliza en forma equivocada el término de

gripe como sinónimo, cuando en realidad se trata de casos de
catarro común o rinofaringitis.
• La gripe es causada por el virus de la influenza (virus de
influenza A, B y C), el catarro común es causado por múltiples
virus respiratorios (rinovirus, coronavirus, adenovirus, virus
parainfluenza, entre otros).
 Influenza virus
Etiología

• Los virus asociados a la influenza humana son miembros de la

familia Orthomyxoviridae, tienen una morfología helicoidal y
su genoma está constituido por una cadena segmentada de
ARN, los virus influenza A y B causan infecciones
respiratorias en humanos y animales, el virus A es causa de
pandemias.
Influenza virus
Etiología
 Influenza virus
Etiología

• El virus de influenza C afecta en forma moderada a los niños y

en forma ocasional a los adultos.
• Los virus de la influenza A se clasifican en subtipos de
acuerdo a dos antígenos de superficie: hemaglutinina (H) y
neuraminidasa (N). La hemaglutinina es considerada el
antígeno mayor cuya función es la adhesión del virus mediante
residuos de ácido siálico en la superficie del epitelio
respiratorio humano.
 Influenza virus
Etiología

• La expresión de la neuraminidasa es menos abundante en la

superficie viral y su papel es facilitar la liberación de viriones
de células infectadas del hospedero.
• La cubierta del virus de la influenza A contiene proteínas de la
matriz (M1) y transmembranales (M2). La proteína M1
confiere rigidez a la capa bilipídica del virus, mientras que la
proteína M2 es un canal iónico dependiente de pH.
• Para la clasificación de este virus se utiliza el siguiente orden
en la nomenclatura: el tipo, el lugar en donde fue aislado, el
año de aislamiento, el número de identificación del laboratorio
y, en los aislamientos del virus de la influenza A, el subtipo H-
N (por ejemplo: A/Moscow/10/99 [H3N2]).
Influenza virus
Etiología
 Influenza virus
Etiología

• Las aves constituyen un reservorio potencial de intercambio

genético para los virus de la influenza, lo que representa un
riesgo latente de pandemias. Los virus de la influenza A
también infectan a pollos, cerdos, caballos y ocasionalmente a
mamíferos marinos.
 Influenza virus
Epidemiología

• La influenza puede afectar a todos los grupos etarios durante

epidemias; sin embargo, la mayoría de los casos de la
influenza durante la época estacional de la enfermedad en los
meses de invierno en el hemisferio occidental ocurren en los
extremos de la vida. La enfermedad frecuentemente requiere
de atención médica y hospitalización, contribuyendo
sustancialmente a pérdidas económicas, exceso en el número
de hospitalizaciones y muertes.
 Influenza virus
Epidemiología

• Por lo menos cuatro pandemias han afectado a la humanidad

en el siglo XIX y tres en el siglo XX.
• La pandemia de influenza española ocurrida entre los años
1918-1919 causó aproximadamente 21 millones de muertes
mundialmente.
• Nuevas variantes de los virus de influenza resultan por
cambios antigénicos debido a mutaciones puntuales que
ocurren durante la replicación del virus.
 Influenza virus
Epidemiología

• En los virus de la influenza B estos cambios o mutaciones

aparecen a una tasa menor que la influenza A.
• El virus de la influenza A se caracteriza por causar enfermedad
moderada a grave; tiende a afectar a todos los grupos etarios y
tiene la característica de afectar tanto a aves como a cerdos.
 Influenza virus
Epidemiología

• El virus B de la influenza causa cuadros clínicos menos graves

que el tipo A y tradicionalmente produce infección y
enfermedad durante la infancia.
• La capacidad del virus de la influenza A y B de sufrir cambios
antigénicos graduales en sus dos antígenos de superficie, la
hemaglutinina y la neuraminidasa, complica la vacunación
contra esta enfermedad.
 Influenza virus
Manifestaciones clínicas

• El período de incubación es de 1 a 4 días (promedio de dos

días). Los adultos pueden ser infectantes un día antes de que
los síntomas inicien hasta aproximadamente 3-5 días después.
• Los niños pueden ser infectantes por 10 días o más. Las
personas con estados de inmunosupresión pueden excretar los
virus por períodos más prolongados.
 Influenza virus
Manifestaciones clínicas

• La influenza se caracteriza por el inicio agudo de síntomas y

signos respiratorios que incluyen: fiebre, tos seca, coriza,
cefalea, odinofagia, ardor faríngeo, mialgias, artralgias, y
ataque importante al estado general (postración).
• Estos síntomas ocurren en 50 a 70% de las infecciones por
influenza, tanto estacional como por el virus de influenza
humana H1N1 2009
 Influenza virus
Manifestaciones clínicas

• Otros síntomas menos comunes son: fotofobia, dolor

abdominal, náusea, vómito y diarrea. La duración de la
enfermedad sin complicaciones habitualmente es de una
semana, aunque la tos y debilidad pueden persistir por más de
14 días.
• En el examen físico se puede encontrar, fiebre, taquicardia,
inyección conjuntival e hiperemia faríngea.
 Influenza virus
Manifestaciones clínicas
 Influenza virus
Diagnóstico

• El diagnóstico diferencial debe establecerse con otros agentes

que afectan el tracto respiratorio como son: virus sincitial
respiratorio, adenovirus, parainfluenza, rhinovirus,
Mycoplasma pneumoniae, Chlamydophila pneumoniae,
Legionella pneumophila, Metapneumovirus, y coronavirus
(SARS).
 Influenza virus
Diagnóstico

• El diagnóstico es inicialmente clínico, los datos que más

orientan son la fiebre elevada de inicio abrupto, gran ataque al
estado general, cefalea, mialgias y escalofríos.
• Idealmente, la muestra de exudado faríngeo, nasofaríngeo,
lavado nasal, aspirado bronquial o traqueal debe tomarse en
los primeros tres días del inicio de los síntomas.
• RT-PCR.
 Influenza virus
Prevención

• La vacunación anual de personas en grupos de alto riesgo de

desarrollar complicaciones y sus contactos, representa la
principal estrategia.
• Diversos estudios han demostrado una eficacia de 80% en
niños y de 77% en adultos.
 Coronavirus

• La actual pandemia de Covid-19, producida por una cepa

mutante de coronavirus el SARS-CoV-2, se inició en China a
fines de diciembre 2019, en la provincia de Hubei (cuidad
Wuhan) donde se reportó un grupo de 27 casos de neumonía
de etiología desconocida, con siete pacientes graves.
 Coronavirus

• El virus SARS-CoV-2 es muy contagioso y se transmite

rápidamente de persona a persona a través de la tos o
secreciones respiratorias, y por contactos cercanos; las gotas
respiratorias de más de cinco micras, son capaces de
transmitirse a una distancia de hasta dos metros, y las manos o
los fómites contaminados con estás secreciones seguido del
contacto con la mucosa de la boca, nariz u ojos.

• Este nuevo virus tiene predilección por el árbol respiratorio,

una vez que penetra genera una respuesta inmune anormal de
tipo inflamatorio con incremento de citoquinas, lo que agrava
al paciente y causa daño multiorgánico.
 Coronavirus

• Es de la familia de los viejos virus coronavirus, dos de cuyas

cepas antiguas causan la gripe común, pero en el 2003 surgió
la primera mutación, el SARS que se inició en China, con más
de 8 460 pacientes en 27 países y una letalidad de 10% , y
luego en el año 2012 apareció otra cepa mutante de
coronavirus en Arabia Saudita, el MERS-CoV, con más de
2499 enfermos y una letalidad del 37%
 Coronavirus
Estructura viral

• Son virus envueltos, pleomórficos o esféricos, que presentan

ARN como genoma y cuyo tamaño oscila entre los 80 a 120
nm de diámetro. Superficialmente pueden observarse
proyecciones de la glicoproteína spike (S), y posee dímeros de
proteínas hemaglutinina-esterasa (HE).
 Coronavirus
Estructura viral

• La envoltura viral consta de dos proteínas que resaltan: la

proteína M y la proteína E, siendo la primera la más
abundante, mientras que la segunda se caracteriza por su
carácter hidrofóbico; ambas proteínas se encuentran
fusionadas con membranas lipídicas obtenidas de la célula
hospedera.
 Coronavirus
Estructura viral

• El genoma, está constituido por ARN de cadena simple, no

segmentado y de polaridad positiva cargado con
aproximadamente entre 27 a 32 Kilobases, las cuales codifican
para 16 proteínas no estructurales; para evitar la
desintegración del genoma, el ARN se encuentra unido a otra
proteína estructural conocida como la nucleoproteína (Proteína
N)
 Coronavirus
Tipos

• Pertenecientes al orden Nidovirales y a la familia

Coronaviridae, estos virus envueltos de tipo ARN se
distinguen en 4 géneros: alfa, beta, delta y gamma; siendo los
dos primeros quienes infectan a los humanos, provocando
enfermedades que van desde un resfrío leve hasta infecciones
severas como el MERS, y el SARS causantes de miles de
muertes.
 Coronavirus
Tipos

• De los siete coronavirus que afectan a humanos (HCoV),

cuatro son endémicos en todo el mundo y generan síntomas de
resfrío, siendo los tipos 229E y OC43 los responsables del
resfrío común, mientras que los tipos NL63 y HKU1 también
se le asocian a problemas respiratorios. En algunos casos
pueden producir infección en vías respiratorias inferiores,
incluso neumonía en pacientes vulnerables, adultos mayores o
personas inmunocomprometidas.
 Naturaleza del virus

• El nuevo coronavirus repite casi el 80% de la secuencia

genética de su predecesor SARS-CoV, y al igual que otros
coronavirus muta de patogenia.
• Los coronavirus expresan glucoproteínas transmembrana
(proteínas de "pico") que permiten que el virus se adhiera y
entre en la célula objetivo. Las proteínas de pico en el SARS-
CoV-2 comparten muchas similitudes con las del SARS-CoV
y se unen a los receptores de la enzima convertidora de
angiotensina 2 de superficie (ACE2)
 Naturaleza del virus

• La proteína espiga del SARS-CoV-2 parece unirse a ACE2 con

mayor afinidad que el SARS-CoV, lo que puede explicar su
mayor transmisibilidad
• La principal vía de trasmisión es la respiratoria, a través de la
tos y estornudos, se ha detectado en las heces pero en poca
cantidad, de ahí que las medidas de protección contemplan el
uso de mascarillas, la higiene frecuente de manos con agua y
jabón, a lo que se han sumado otras medidas preventivas
adoptadas en muchos países, como la cuarentena y el
distanciamiento social.
 Coronavirus
Clínica

• El periodo de incubación se estimó entre 4 a 7 días, pero el

95% de los casos fue de 12 días, sin embargo, basados en otras
estudios de casos de Europa, podría ser de 2 a 14 días.
• La gran mayoría (80%) de los casos son asintomáticos
(pueden ser contagiosos) o tienen cuadros leves con malestar
general y tos ligera, en tanto que el 15% hace un cuadro
moderado con fiebre, tos seca persistente, fatiga, sin
neumonía, y el 5% hacen cuadros severos, caracterizados por
fiebre constante, tos, disnea severa, debido especialmente a la
neumonía viral; daño cardiovascular, falla multiorgánica, y
pueden fallecer entre 3 a 4% de los afectados.
 Coronavirus
Fases de evolución

• En la primera semana(primera fase), el test de RT-PCR

nasofaríngea es positiva, y los anticuerpos (IgM, IgG) son
generalmente negativos; en cambio en la denominada fase dos
(denominada pulmonar), que se inicia a partir del día al 15, es
la fase donde se complica con neumonía, presentándose signos
de consolidación bilateral distribución periférica).
 Coronavirus
Fases de evolución

• RT-PCR positiva en vías bajas a través del lavado

broncoalveolar, la serología IgM/IgG comienza a ser positiva a
partir del 6 día. La tercera fase (inflamatoria), ocurre a partir
del día 10 a 15, no se presenta en todos los casos, y cuando
ello sucede, se da especialmente en mayores de 65 años y
pacientes inmunodeprimidos o con otros factores de riesgo,
produciéndose una desregulación con una respuesta
inflamatoria exacerbada.
 Coronavirus
Evolución

• Normalmente el COVID-19 se presenta de forma leve o

moderada y en una minoría, la forma grave (fiebre alta, >30
respiraciones/minuto, SpO2 <93%), la mortalidad en UCI en
Wuhan fue de 61%.
• Entre los síntomas observados en los pacientes peruanos
destacan: la tos seca, dolor de garganta, cansancio y fiebre.
 Coronavirus
Diagnóstico

• La mayoría de las pruebas que existen son las que detectan

anticuerpos (IgM e IgG), son reactivas a partir del séptimo día
de infección, estás usan diversas técnicas como las de
inmunocromatografía.
• El test de anticuerpos IgM/IgG se va haciendo
progresivamente positivo con el paso de los días desde el
inicio de los síntomas, siendo positivo a partir del 7º día en el
50% de los pacientes, en el 10º día en el 70% y en el 14º día
desde el inicio de los síntomas en el 100% de los pacientes.
 Coronavirus
Diagnóstico

• Las mejores pruebas son las moleculares, especialmente la

RT_PCR cuya sensibilidad varía según el área, siendo de 93%
en muestras de lavado bronco alveolar, en esputo 72%, en
hisopado faríngeo 32%, y nasal 63%, por mencionar algunos.
• La prueba proporciona una identificación rápida del
coronavirus pandémico en aproximadamente 45 minutos,
tomando menos de un minuto de preparación de la muestra. La
rapidez de la prueba se considera una gran ventaja para la
toma de decisiones en el tratamiento del paciente.
 Coronavirus
Métodos complementarios

• El hemograma generalmente es normal aunque en algunos

casos hay leucopenia y linfopenia.
• En pacientes hospitalizados puede haber elevación del dímero
D, prolongación del tiempo de protrombina, ferritina y DHL.
• Se tienen marcadores de mal pronóstico, el más precoz, el
aumento de ferritina (a partir del 4º día), el dímero D después
de la primera semana y va progresivamente aumentando con
los días.
 Coronavirus
Terapia

• Con respecto al abordaje terapéutico se puede señalar que el

manejo es básicamente sintomático y de sostén, no hay droga
antiviral efectiva, ni cura alguna ; se han investigado varias
drogas tanto in vitro como in vivo en varios ensayos, con
diversos resultados, algunos eficaces y otros no.
 Coronavirus
Terapia

• Entre ellos se tiene al Lopinavir/ritonavir, Remdesivir,

favipiravir, azitromicina, interferón,
cloroquina/hidroxicloroquina, ivermectina, nitoxazanida,
doxiciclina, tocilizumab, sarilumab, siltuximab, bevacizumad,
plasma de convalecientes, ozono, células madre, oxido nítrico,
etc.
• De todas ellas en el Perú se ha recomendado el uso de algunas
medicinas de manera individual y con el consentimiento
informado únicamente para pacientes con enfermedad leve
con ambulatorios con factores de riesgo (diabetes mellitus,
hipertensión, etc.) y en hospitalizados
Coronavirus
Vacunas
Coronavirus
Vacunas
Coronavirus
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Coronavirus
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Muchas gracias