cromosómicas (AC) tales como las aneuploidías
cromosómicas (AC) tales como las aneuploidías
cromosómicas (AC) tales como las aneuploidías
RESUMEN
La prueba prenatal no invasiva es un método de cribado de aneuploidías fetales y de resultar con riesgo alto debe
ser confirmado a través de prueba genética diagnóstica. Es la prueba de detección más sensible y específica para las
aneuploidías fetales comunes y minimiza la realización de técnicas invasivas, solo para las gestantes con riesgo elevado.
Se debe realizar asesoramiento genético pre- y poscribado. Este estudio tiene como objetivo describir los fundamentos
básicos de la prueba prenatal no invasiva mediante el análisis del ácido desoxirribonucleíco libre circulante en plasma
materno para cribado de aneuploidías, y de los métodos primordiales y avances en biología molecular incluyendo las
tecnologías de secuenciación de nueva generación, que lo han facilitado, considerando sus beneficios y limitaciones al
aplicarla en la práctica clínica, en este campo que cambia con tanta rapidez.
Palabras clave: Cribado prenatal, Aneuploidías, Ácido desoxirribonucleíco fetal libre, Avances en biología molecular,
Secuenciación de nueva generación, Asesoramiento genético.
Prenatal screening for aneuploidies by analysis of circulating total free deoxyribonucleic acid
in maternal plasma. Narrative review
SUMMARY
The non-invasive prenatal test is a screening method for fetal aneuploidies and if the result is at high risk, it must be
confirmed through diagnostic genetic test. It is the most sensitive and specific detection test for common fetal aneuploidies
and minimizes the use of invasive techniques, only for pregnant women at high risk. Genetic counseling should be
performed before and after screening. This study aims to describe the basic fundamentals of non-invasive prenatal
testing by analyzing free circulating deoxyribonucleic acid in maternal plasma for aneuploidy screening, and the primary
methods and advances in molecular biology, including next-generation sequencing technologies, which have facilitated it,
considering its benefits and limitations when applying it in clinical practice, in this rapidly changing field.
Keywords: Prenatal screening, Aneuploidy, Free fetal deoxyribonucleic acid, Advances in molecular biology, Next
generation sequencing, Genetic counseling.
ausencia de las mismas y aplican un nivel de corte El valor predictivo positivo (VPP) es la probabilidad de
para separar la población cribada en dos grupos: uno que la enfermedad esté presente cuando el resultado de
con riesgo positivo y otro con riesgo negativo para la prueba es positivo, y se expresa como el porcentaje
la anormalidad en cuestión (2). Deben mantener un de verdaderos enfermos entre los que tuvieron pruebas
rendimiento apropiado que tiene que ser evaluado positivas. El valor predictivo negativo (VPN) es la
mediante controles de calidad (3). probabilidad de que la enfermedad no esté presente
cuando el resultado de la prueba es negativo. Se
La evaluación de la eficacia, que mide la valoración expresa como el porcentaje de verdaderos sanos entre
teórica de un método de cribado prenatal de las los que tuvieron pruebas negativas. La prevalencia
aneuploidías, se realiza mediante modelos y de la enfermedad modifica el valor predictivo. Con
simulaciones matemáticas que estiman la tasa de una alta prevalencia, cabe esperar un alto VPP y con
detección (TD) o sensibilidad (capacidad de la prueba baja prevalencia, disminuye el VPP de la prueba. Se
de detectar la enfermedad cuando esta se encuentra entiende por prevalencia el número de pacientes con
presente) y la tasa de falsos positivos (TFP) utilizando, la enfermedad que se desea diagnosticar, en relación
habitualmente, las técnicas de integración numérica al total de casos considerados al realizar la prueba (4).
o la simulación de Monte-Carlo. Para comparar
los resultados que producen estos modelos para las La prevalencia de una determinada aneuploidía, en cada
distintas estrategias de cribado se suele expresar la momento de la gestación, depende de la edad materna,
TD para una TFP fija del 1 % o 5 %, o bien la TFP del antecedente de un feto previamente afectado de
necesaria para conseguir una detección del 85 %, en dicha aneuploidía, y de la letalidad intrauterina que se
una población concreta, o la detección y TFP que produce para la misma, en el transcurso de la gestación
produce un determinado nivel de corte en el riesgo (2). (2).
La evaluación de la efectividad o comportamiento Las aneuploidías fetales son una de las principales
en la práctica real, debe realizarse mediante estudios causas de muerte perinatal y discapacidad cognitiva,
prospectivos, bien diseñados y, preferiblemente, no lo que ha llevado al desarrollo de esquemas de cribado
intervencionistas, con pacientes que incluyan individuos prenatal con el fin de detectarlas tempranamente (1, 5).
sanos y afectados de la enfermedad que se valora, con
una prevalencia de estos últimos y distribución de Los procedimientos de cribado se basan en determinar
edades lo más parecida a la habitual, y un método de los denominados marcadores de aneuploidía, es decir,
confirmación de los casos verdaderamente positivos parámetros biológicos, ecográficos, bioquímicos,
altamente preciso. Los resultados se expresan en TD y de origen materno, fetal o placentario, que han
TFP que produce un determinado nivel de corte en el demostrado presentar diferencias cuantitativas o
riesgo para la población estudiada (2). cualitativas estadísticamente significativas, entre los
fetos afectados y no afectados de un determinado tipo
Otro parámetro a tomar en cuenta es la especificidad de aneuploidía, y puede realizarse durante el primer
(capacidad de la prueba de detectar ausencia de trimestre (1er T) de gestación, el segundo trimestre
enfermedad cuando esta se encuentra ausente). (2do T), o en ambos (2).
La sensibilidad y la especificidad no varían con la
prevalencia de la enfermedad (4). En la década de los 70, se introdujo la edad materna
≥ de 35 años como cribado (4, 6) con TD del 30 %
con 5 % de TFP (5). La edad materna avanzada es un (uE3) y se denomina triple prueba del 2do T (2, 11), con
factor de riesgo para las aneuploidías, especialmente una TD de 60 % para una TFP de 5 % (4). La adición
la trisomía (T) 21 o síndrome Down, T18 o síndrome de un cuarto marcador, la inhibina A, constituyó la
Edward, T13 o síndrome Patau, y de las aneuploidías cuádruple prueba, con TD de 75 % para una TFP de
47, XXX y 47, XXY (2, 7, 8). 5 % (2, 4, 12).
Los métodos de cribado han ido evolucionando, pero A partir de la década de los 90 se utilizan marcadores
todos utilizan, al menos, la edad materna y la edad bioquímicos de T21 del 1er T de gestación, tales
gestacional como punto de partida, es decir, como como la proteína A plasmática asociada al embarazo
riesgo a priori, que se ajusta por diversos factores (PAPP-A), la inhibina A, la β-hCG (4, 13). Se realizan
correctores o cocientes de probabilidad, que dependen entre las semanas 9 a 13+6 de gestación (3).
de los resultados de una serie de pruebas de cribado
que se han llevado a cabo a lo largo del embarazo, para La TD para la T21 en el 1er T es de 60 % con TFP de
determinar el riesgo específico de cada paciente (3, 9). 5 %, cuando a la edad materna se le suma la PAPP-A
El teorema de Bayes permite combinar este riesgo con y la β-hCG (4, 9, 14) y se denomina doble prueba
el riesgo a priori y, de este modo, obtener el riesgo bioquímica. La cuádruple prueba del 1er T, añadiendo
final (2). a los anteriores la AFP y el uE3, conseguiría, según
los modelos matemáticos, una capacidad de detección
El riesgo a priori para la edad materna es el riesgo de T21 del 70 % para una TFP del 5 % o, una TFP de
que presenta cualquier embarazada, debido a su aproximadamente el 14 % para conseguir una TD del
edad, de tener un feto afectado de T21 para la edad 85 % (2).
que tendrá en la fecha probable del parto, o también
en el momento del cribado, ya sea en el 1er o 2do T En la primera década de este siglo, se valora la
de la gestación y debe tenerse en cuenta la letalidad utilización del antígeno trofoblástico invasivo (ITA) (2,
intrauterina o su recíproco, supervivencia intrauterina 15, 16), y de la desintegrina A y la metaloproteasa 12
(10), que se produce durante toda la gestación, que es (ADAM 12), sola o combinada con otros marcadores,
específica de cada aneuploidía (2). en el 1er T de la gestación (2, 4, 17). La edad materna,
en combinación con las mediciones de PAPP-A, más
El riesgo a priori de trisomía de una paciente que ITA produce TD de 75 % y TFP de 8 % (15), o TD de
ha presentado un feto afectado de la misma en una 71 % para TFP: 5 % (16). Cuando a la edad materna se
gestación anterior es mayor que el esperado con base le suma la PAPP-A y la ADAM 12 a las 8-9 semanas la
a su edad y es específico para cada AC. El riesgo a TD para la T21 es de 91 % con TFP de 5 % (17).
priori para la edad materna para T21 se incrementa
aproximadamente un 0,75 % en el 1er T, un 0,54 % en En 1985 se describió el pliegue nucal como marcador
el 2do T y un 0,42 % a término (2). ecográfico para la T21 en el 2do T (18), el pliegue
nucal engrosado ≥ 6 mm incrementa el riesgo de T21
En la década de los 80 nació el cribado para AC en (2, 19).
el 2do T de gestación, este se realiza entre las 15 a
22+6 semanas de gestación (SG), con la dosificación Se han identificado marcadores ecográficos blandos
en suero materno de la alfafetoproteina (AFP), la (anomalías menores) y anomalías estructurales
gonadotrofina coriónica humana (hCG) o la subunidad mayores asociados a la presencia de un feto afecto de
libre β de la hCG (β-hCG), y el estriol no conjugado una AC. Los marcadores blandos son considerados
variaciones de la normalidad, la detección de múltiples 3,5 mm. El aumento de la TN se define como un valor
marcadores blandos implica un aumento del riesgo de por encima del percentil 95 de acuerdo a la LCC.
AC (20). Como marcadores blandos en el 2do T de La prevalencia de AC, malformaciones estructurales
T21 se destacan: pliegue nucal, acortamiento de los y muerte fetal aumentan dependiendo de qué tan
huesos largos (fémur y húmero), foco hiperecogénico incrementada se encuentre la TN (2-4, 24, 25).
intracardíaco, hiperecogenicidad intestinal, ectasia
piélica, quistes de plexos coroideos y el hueso nasal El cribado mediante TN y edad materna puede
(HN), clinodactilia, separación entre el primer y el identificar el 75 % - 80 % de los fetos con T21 y otras
segundo dedo del pie, braquicefalia, ventriculomegalia trisomías con una TFP del 5 % (9). La combinación
leve, megacisterna magna, ángulo ilíaco aumentado, de la TN con alteración del índice de pulsatilidad del
arteria umbilical única y alteración del índice de conducto venoso incrementa la TD de T21 al 85 %,
pulsatilidad del conducto venoso (2). aumentando al 92 % cuando se incorpora el cribado
bioquímico temprano (2).
La evaluación del riesgo de AC mediante la asociación
de varios marcadores blandos y anomalías mayores por En 2001 se reportó la ausencia o hipoplasia del HN
una evaluación ecográfica en 2do T se conoce como fetal por ecografía en el 73 % de fetos con T21 (26).
sonograma genético, y se realiza en gestaciones de alto
riesgo de AC para reevaluación del riesgo (2, 20).
La combinación de PAPP-A, β-hCG libre y la TN,
conocido como cribado combinado del 1er T (CCPT),
La ecografía transvaginal de alta resolución durante se ha consolidado en el ámbito de la Medicina Privada
el 1er T facilita la detección temprana de anomalías como de la Medicina Pública en España ofrece TD de
estructurales mayores fetales (defectos cardíacos, alrededor del 85-90 % para el 5 % de FP (2, 3, 5, 9).
atresia duodenal, onfalocele, holoprosencefalia,
higroma quístico) y anomalías blandas asociadas a
Desde 1999, se realizan marcadores usados en el 1er
AC; además, permite establecer criterios ecográficos
y 2do T, bajo el nombre de prueba integrada (27),
de sospecha de estas anomalías. Se realiza entre las 11
incluye la edad materna junto con la medición de TN
y 13+6 SG, estos hallazgos se utilizan para definir un
y determinación de PAPP-A del 1er T, y de AFP, hCG,
grupo de gestantes de alto riesgo (2, 21).
uE3 e inhibina A del 2do T; es un cribado secuencial en
dos o tres pasos, ofreciendo hasta el 2do T el resultado
En 1990, se describió, en el 1er T del embarazo, la de riesgo estimado en relación con la integración de
presencia de líquido subcutáneo en la región nucal de todos los marcadores del mismo (2). Con TD de 94 %
un feto afectado de T21. Se denominó translucencia y de FP de 5 %, o de 85 % para 1 % de FP (4, 28, 29).
nucal (TN), es el marcador más temprano y sensible
(22, 23).
El cribado secuencial contingente, se basa en el nivel
del riesgo indicado por el cribado del 1er T, se fijan
En los fetos euploides, el grosor de la TN aumenta con dos niveles de corte (por ejemplo, 1:100 y 1:1000)
la longitud céfalo-caudal fetal (LCC). La mediana y el que separan a las gestantes en tres grupos de riesgo.
percentil 95 de la TN para una LCC de 45 mm son de A las pacientes con alto riesgo se les ofrece prueba
1,2 y 2,1 mm y los respectivos valores para una LCC de diagnóstica a través de técnica invasiva y a las
84 mm son de 1,9 y 2,7 mm. El percentil 99 no cambia pacientes con un riesgo intermedio se les valora la
significativamente con la LCC y es aproximadamente AFP, la β-hCG libre o la hCG, el uE3 y la inhibina A en
el 2do T y el riesgo de estas últimas se estima mediante bases de datos Pubmed, Elsevier y publicaciones de
la combinación de todos los marcadores, mientras que la Sociedad Española de Ginecología y Obstetricia, el
la de bajo riesgo no se les valora ningún otro marcador Colegio Americano de Obstetras y Ginecólogos y de
(2). la Sociedad internacional de ultrasonido en obstetricia
y ginecología entre septiembre 2022 y marzo 2023.
Existen alternativas tales como la realización de la Se incluyeron artículos hasta 2021 y se seleccionaron
prueba combinada de 1er T y en función del resultado aquellos que los autores consideraron relevantes. Se
obtenido se establecen distintas actuaciones. En riesgos incluyeron como palabras clave de búsqueda todas las
superiores a 1/100 se ofrece una prueba diagnóstica, combinaciones de ácido desoxirribonucleíco fetal libre,
en riesgos inferiores a 1/1000 se considera negativa cribado prenatal, aneuploidia, avances en biología
y en riesgos intermedios (entre 1/101 y 1/1000 se molecular, secuenciación de nueva generación,
determinan marcadores ecográficos de segunda línea asesoramiento genético y sus traducciones al inglés.
(HN, insuficiencia tricuspídea y alteración del índice Se describe el resultado del análisis bibliográfico.
de pulsatilidad del conducto venoso) de los cuales
se ha estimado cociente de probabilidad positivo y
negativo. Con esta estrategia se ha estimado más del ÁCIDOS NUCLEICOS Y AVANCES
90 % de T21 con un índice de FP del 2-3 % (2, 30). TECNOLÓGICOS DE GRAN IMPACTO EN
BIOLOGÍA MOLECULAR
en el ADN, que se estructura en los cromosomas, que el de las endonucleasas o enzimas de restricción (grupo
se localizan en el núcleo de cada célula. La naturaleza de enzimas cada una de las cuales reconoce secuencias de
específica de la información genética codificada en el doble cadena específicas en el ADN, las corta a nivel de
genoma humano se corresponde a la secuencia de las los elementos fosfodiéster en el lugar de reconocimiento
bases C, G, A y T existentes en las dos cadenas que se o cerca de este, y produce, de esta forma, fragmentos de
disponen en cada uno de los cromosomas (1). ADN de diferentes tamaños), por este descubrimiento en
1978, Werner Arber, Daniel Nathans y Hamilton Smith
En 1953, Watson y Crick, sugirieron que la molécula de recibieron el premio nobel (1, 7); la clonación de genes
ADN estaba compuesta por dos cadenas de nucleótidos en plásmidos y fagos, y las técnicas de hibridación en
dispuestas en una doble hélice. El esqueleto de cada filtro para ADN y ARN, conocidas como Southern y
cadena está formado por puentes fosfodiésteres entre los Northern blot, respectivamente; así como las técnicas de
carbonos 3´ y 5´ de los azúcares adyacentes, y las dos secuenciación para el ADN (42).
cadenas se mantienen juntas por puentes de hidrógeno
entre las bases nitrogenadas, que apuntan hacia el centro Con el método Sanger de secuenciación, en 1977, los
de la hélice. Cada cadena de ADN tiene una polaridad laboratorios pudieron disponer de un método fiable y
determinada por la orientación del esqueleto de azúcar- reproducible para el análisis de secuencias de ADN
fosfato. El final de la cadena lo constituye el átomo de (conocer, el orden de los nucleótidos en un segmento
carbono 5´ de la molécula de azúcar y se denomina el de ADN o ARN) (43). Fred Sanger y Walter Gilbert
extremo 5´, mientras que el final representado por el recibieron el premio nobel en 1980 por desarrollar la
átomo de carbono 3´ se denomina el extremo 3´. En la secuenciación de ADN (1).
doble hélice, el extremo 5´ de una hebra se opone al
extremo 3´ de la otra. Una purina en una cadena siempre El método de secuenciación de ácidos nucleicos diseñado
se empareja con una pirimidina en la otra cadena, con un por Sanger (método de terminadores dideoxi) (44), que
apareamiento específico de los pares de bases (pb): la G usa los cuatro nucleótidos modificados con la ausencia del
de una cadena siempre se empareja con la C de la otra extremo 3’OH, grupo esencial para la polimerización por
cadena, mientras que la A lo hace siempre con la T, de la ADNpolimerasa, conocidos como dideoxi nucleótidos
forma que estos pb forman hebras complementarias. Por (ddA, ddC, ddG y ddT), es uno de los más utilizado. En la
su trabajo, Watson y Crick, junto con Maurice Wilkins, secuenciación Sanger, un fragmento de ADN que va a ser
fueron galardonados con el premio Nobel de Medicina secuenciado se usa como plantilla para la síntesis de ADN
en 1962, con lo que se inauguró la era de la genética cebado por un nucleótido corto, y la ADNpolimerasa
molecular (7, 41). sigue la secuencia de la plantilla, ampliando el cebador e
incorporando nucleótidos. Para obtener información de la
En 1966 se había dilucidado la estructura química del secuencia, en primer lugar, se añaden a las reacciones de
ADN y el sistema por el cual esta determina la secuencia de secuenciación análogos dideoxi (cada análogo se marca
aminoácidos de las proteínas (41). En 1968, Robert Holley, con un colorante fluorescente diferente que presenta su
Gobind Khorana y Marshall Nirenberg recibieron el propia emisión lumínica distintiva) junto con los cuatro
premio Nobel por el desciframiento del código genético nucleótidos normales. La polimerasa incorpora un
(7). nucleótido normal, de manera que sigue extendiendo la
cadena, o bien una base dideoxi, lo que interrumpe la
Rodríguez y cols. (42) citan que el progreso de la biología síntesis. Las cadenas finalizadas son separadas mediante
molecular ha sucedido con grandes cambios. Una época electroforesis capilar y el nucleótido dideoxi concreto
nutrida de dichos cambios fue la década de 1970, en la que fue responsable de la terminación es identificado a
que se produjo un gran número de descubrimientos, como través de la molécula concreta del colorante fluorescente
que es incorporada, y se puede determinar el orden de los de tamaño nanométrico y se produce una reacción de RCP
nucleótidos. Se han diseñado máquinas para automatizar separada en cada una. Se pueden usar diferentes métodos
el procedimiento de la secuenciación de ADN (1). para dividir muestras, incluidas placas de micropocillos,
capilares, emulsión de aceite y matrices de cámaras
Otro salto tecnológico ocurrió en 1983, cuando se miniaturizadas con superficies de unión de ácido nucleico
desarrolló una nueva técnica que hizo posible la síntesis (48). Luego, cada producto se analiza por separado
de grandes cantidades de un fragmento de ADN in vitro: utilizando sondas fluorescentes. Se analiza cada gota
la reacción en cadena de la polimerasa (RCP) (45). La con estadísticas de Poisson para determinar el porcentaje
técnica de RCP emplea un par de oligonucleótidos de gotas de RCP positivas en la muestra original, las
(cebadores) para delimitar una región de interés y una particiones se clasifican como positivas diana detectada
polimerasa para extenderlos, utilizando ambas hebras o negativa objetivo no detectado, que proporciona la base
del gen en cuestión como plantilla. Al repetir este ciclo para un formato de salida digital (47).
decenas de veces, se duplica cada vez el fragmento
de ADN en cuestión. Así se logra copiar millones de A comienzos del siglo XXI, el proyecto genoma humano
veces la secuencia de interés, aunque se encuentre entre proporcionó una secuencia casi completa del ADN
millones de otras secuencias de ADN (42). Se utilizan humano, el borrador de la secuencia de ADN se completó
termocicladores o máquinas de RCP diseñadas al efecto, con éxito en el año 2000 y la secuencia completa se publicó
una ronda de amplificación requiere solo unos minutos. en el 2004 (7), que ahora sirve como base para catalogar
De este modo, en pocas horas pueden crearse muchos a todos los genes humanos. Estos avances hacen posible
billones de copias de una molécula de ADN (1). Esta la medicina genómica, que persigue la aplicación a gran
técnica es considerada la más revolucionaria del último escala del análisis del genoma humano y sus productos
cuarto del siglo XX, se cataloga como la estrella de las (incluyendo el control de la expresión genética, la
herramientas de la biología molecular. Debido a esto, variación de los genes humanos y las interacciones entre
Kary Mullis se hizo acreedor, en 1993, del premio nobel los genes y el ambiente) en la asistencia médica (1).
en química (42).
En 2005, aparecieron nuevos métodos de secuenciación y
La técnica de RCP ha evolucionado, dando lugar al analizadores capaces de multiplicar la cantidad de datos
desarrollo de la RCP cuantitativa (RCPc), utilizada desde obtenidos, pasando de 84 kilobase/ensayo a 1 gigabase/
1996 (46). Esta técnica permite la monitorización, en ensayo. Es el nacimiento de lo que se conoce como
tiempo real, del proceso de amplificación y la detección secuenciación de nueva generación (SNG) (49, 50). Esta
de los productos de RCP a medida que se elaboran. nueva tecnología ha permitido la lectura de millones
Los termocicladores de RCPc han reducido el tiempo de secuencias de forma masiva y paralela (SMP) en un
para generar productos de RCP, en lugar de horas de la menor lapso y a un menor costo por base, su evolución
RCP convencional a menos de una hora, y se utiliza la ha sido constante, desde la aparición de las primeras
tecnología de fluorescencia para controlar la generación plataformas de SNG, con incrementos de capacidad de
de productos de la RCP durante cada ciclo (monitorean la generación de datos de más del doble cada año; facilitando
señal fluorescente a medida que ocurre la amplificación), el diagnóstico de enfermedades de alta heterogeneidad
con referencia a estándares que contienen números de genética y su aplicación en la práctica clínica (51-53).
copias conocidos, eliminando de esta forma utilizar la El elevado número de datos obtenidos implica una
electroforesis en gel (7). gran complejidad en el manejo y almacenamiento de
los mismos y ha ido acompañado del desarrollo de
En la RCP digital (RCPd), utilizada desde 1999 (47), la herramientas bioinformáticas para su análisis (54).
solución de RCP se divide en decenas de miles de gotas
En 2008, se describió, por primera vez, el uso de la SMP decenas de millones de fragmentos cortos de 37-200
para el análisis del ADN-lc, ya que además de la bases, dependiendo del método. La secuenciación por
secuenciación, permite la cuantificación de los síntesis permite la resecuenciación de genomas, haciendo
fragmentos de ADN de todo el genoma presentes en la realidad la medicina genómica personalizada donde se
muestra. Mediante SMP es posible obtener millones de pueden buscar marcadores o descubrir alelos responsables
fragmentos de ADN, tanto fetales como maternos, que de enfermedades genéticas en individuos (60).
pueden ser asignados al cromosoma del cual provienen
gracias a la disponibilidad de la secuencia completa del La tecnología de SNG incluye varios métodos que
genoma humano (55, 56). se agrupan en un esquema de trabajo que consta de
los siguientes pasos: 1) Preparación del ADN para la
La secuenciación bidireccional permite secuenciar los secuenciación (construcción de una genoteca de ADN, a
dos extremos de los fragmentos de ADN y alinear las partir de la muestra a analizar); implica la fragmentación del
lecturas hacia adelante y hacia atrás como par de lecturas. ADN y la incorporación de adaptadores para su adhesión
Así se obtienen el doble de lecturas para la misma en la plataforma de secuenciación, y la amplificación de
genoteca o librería en un único ensayo. Los algoritmos los fragmentos de ADN por métodos basados en RCP;
de alineamiento utilizan esta información para alinear 2) secuenciación o lectura de los fragmentos de ADN,
de forma más precisa lecturas que quedan en regiones y 3) reconstrucción de la secuencia completa por medio
repetitivas, difíciles de secuenciar, incrementando así de secuencias de referencia y exportación a ficheros de
el número de secuencias útiles para la cuantificación. almacenamiento de datos (61, 62).
Después del alineamiento frente a la secuencia del genoma
de referencia y la determinación de su localización, se
pueden identificar la distancia entre los extremos y el ADN LIBRE FETAL CIRCULANTE EN
tamaño de todos los fragmentos de ADN (57). SANGRE MATERNA
Los nuevos métodos de secuenciación se han alejado Martínez y cols. (63), en 2001, describieron que se ha
de la metodología de Sanger y se han movido hacia experimentado un creciente interés por desarrollar
la secuenciación por síntesis catalizada por la ADN técnicas no invasivas para obtener células fetales. Las
polimerasa. Si a la molécula de ADN a secuenciar se le primeras técnicas de separación y enriquecimiento de
agregan, mediante pasos de ligación y RCP, nucleótidos de células fetales en sangre materna se utilizaron en los años
secuencia conocida en sus extremos para que se adsorba 70. Fundamentalmente, hay tres tipos de células fetales
por hibridación a una superficie, las bases incorporadas en la circulación materna: trofoblásticas, linfocitos y
al ADN se pueden detectar de manera directa, durante su eritroblastos.
síntesis, mediante marcado fluorescente diferencial de los
cuatro posibles nucleótidos del ADN (58). La placenta constituye el punto de máxima proximidad
entre la circulación sanguínea fetal y la materna y
También se puede detectar la incorporación de las permite el intercambio de sustancias en ambos sentidos.
bases de manera indirecta midiendo los cambios de Pero, además del intercambio de nutrientes entre madre
pH ocasionados por la producción de protones durante y feto, se ha descubierto que existe un intercambio
la polimerización o midiendo la concentración del celular durante el embarazo (64). La detección de
pirofosfato producido durante la polimerización (49, 59). células de origen fetal en sangre periférica materna
Así, llevando a cabo estas reacciones sobre plataformas (mayoritariamente eritroblastos nucleados) (65) y el
nanométricas, se pueden secuenciar simultáneamente aislamiento de células fetales del canal endocervical (66),
han permitido la identificación no invasiva de anomalías después del parto es indetectable ya que es rápidamente
en el feto. Sin embargo, existen grandes dificultades eliminado por la orina (77).
como el escaso número de células presentes (1 célula/mL
de sangre aproximadamente) y la dificultad tecnológica Se ha demostrado que la distribución por tamaño de los
que implica su aislamiento y enriquecimiento (67). fragmentos de ADN-lf circulante en plasma es diferente
a la de los maternos, siendo los menores de 150 pb
Se ha demostrado la presencia de secuencias de ADN mayoritariamente de origen fetal (78). Esta diferencia de
de feto masculino en sangre de mujeres embarazadas en tamaño permite hacer una estimación de la proporción de
cantidades significativamente más elevadas que las que ADN-lf en la muestra (39).
se pueden obtener a partir de células fetales aisladas (68),
y también que la concentración de ADN libre fetal (ADN- Se han publicado varios marcadores con diferencias en
lf) es similar en plasma y suero materno, pero en suero cuanto a patrones de metilación entre el ADN fetal y
es más grande el contenido de ADN materno presente, el materno. Comparar la relativa representación de los
causando una detección menos eficiente del ADN-lf; por haplotipos fetales y maternos puede usarse para calcular
esta razón, se prefiere el plasma materno como fuente de la fracción fetal (FF). Se ha demostrado la posibilidad
ADN-lf (61,69). de detección del gen inhibidor de la serina proteasa,
miembro 5 de la familia B (SERPINB5), hipometilado
El ADN-lf coexiste con el ADN libre materno (procedente en la placenta, pero hipermetilado en ADN materno; la
de procesos apoptóticos de diferente origen celular). localización de este gen en el brazo largo del cromosoma
Puede ser detectado desde la 4a semana de gestación (70). 18 (18q) permite una aproximación diagnóstica de
aneuploidías debidas a sobreexpresión de este cromosoma.
Los procesos de apoptosis en la placenta, que también Posteriormente, se han descrito otros marcadores fetales
se dan en gestaciones normales, y que, al igual que las epigenéticos como el gen de la proteína 1 de la familia
concentraciones de ADN-lf, aumentan con las semanas del dominio de asociación RAS (RASSF1A), presente
de gestación, señalan a la placenta como principal fuente en el brazo corto del cromosoma 3 (3p) y numerosos
de origen de este ADN, con un papel mínimo adicional marcadores existentes en el cromosoma 21 (79-83).
de las células hematopoyéticas y la transferencia directa
(71-74). La FF varía entre individuos y puede verse alterada
debido a diversos factores biológicos, disminuye al
La concentración total de ADN-lf, alcanza una media de aumentar el peso materno o índice de masa corporal por
25,4 equivalentes genómicos/ml (rango 3,3–69,4) en el un efecto dilucional producido por el mayor volumen
embarazo temprano y 292,2 equivalentes genómicos/ ml plasmático y debido a que el recambio de adipocitos
(rango 76,9-769) al final del embarazo, siendo el genoma aumenta el porcentaje de ADN materno circulante,
equivalente definido como la cantidad de una secuencia de con la edad materna avanzada, en presencia de algunas
ADN presente en una célula diploide (69). El porcentaje aneuploidías fetales como la trisomia 13 y 18. Respecto
de ADN-lf representa una fracción de 3 % a 13 % del total al grupo étnico, se ha detectado menor FF en mujeres de
de ADN libre en sangre materna en el primer y segundo origen afrocaribeño y del sur de Asia en comparación con
trimestre, la mediana de la fracción fetal obtenida entre las caucásicas, en embarazos obtenidos por técnicas de
10 y 14 semanas de embarazo es de alrededor del 10 % reproducción asistida, y el uso de heparina de bajo peso
(75). Se ha reportado que, entre la semana 10 y 21 de molecular (75, 76, 84-88). En presencia de patologías
gestación, aumenta en 0,1 % por semana y luego de la placentarias se incrementa (89).
semana 21, aumenta 1 % por semana (76). Pocas horas
La FF también puede verse alterada por factores relativos Las distintas metodologías se basan en la detección de
al procesamiento de la muestra, tales como factores un aumento de un 50 % de un determinado cromosoma
preanalíticos, como la lisis de las células sanguíneas en la pequeña proporción del ADN-lf mezclado con el
maternas que se produce en el periodo comprendido materno (92). Es decir, en presencia de una trisomía
entre la extracción y la separación del plasma previa a fetal, se detecta un incremento en la cantidad relativa de
la extracción del ADN e implica una reducción de la FF, lecturas de ADN alineadas en el cromosoma implicado
el anticoagulante utilizado, el volumen total de sangre respecto a lo esperado en un feto euploide para dicho
periférica, las condiciones de transporte de las muestras, cromosoma. Las diferencias en el número de lecturas
la temperatura de almacenamiento y el tratamiento obtenidas que deban ser detectadas son muy pequeñas
posterior que se hace de este (por ejemplo doble o simple pero significativas, respecto al número de secuencias
centrifugación, tratamientos con formaldehido) (84, 85, correspondientes a un cromosoma de referencia (1).
90).
Las tecnologías de secuenciación más utilizadas son
los métodos de secuenciación Illumina e Ion Torrent.
PRUEBA PRENATAL NO INVASIVA La secuenciación por medio de Illumina se lleva a cabo
en una superficie sólida de vidrio separada por carriles,
La mayoría de los ensayos desarrollados utilizan la se caracteriza básicamente por la amplificación de los
secuenciación completa del genoma (evalúa todas las fragmentos de ADN para la generación de colonias del
bases del genoma, incluyendo las regiones no codificantes) mismo fragmento mediante el método de RCP en puente
(31, 32, 55, 56) y la secuenciación de regiones específicas y la detección de bases en la secuenciación se hace a
del genoma, donde se secuencian las regiones de los través de etiquetas fluorescentes (93-95).
cromosomas más frecuentes asociados a las aneuploidías
fetales (21, 18, 13, X, Y) (34-36). La exactitud de la secuenciación en el secuenciador
Illumina será determinada por la intensidad de la señal,
También se utilizan metodologías, que incluyen y la longitud de las lecturas, por el número de ciclos
información genómica, a través de polimorfismos de realizados. Actualmente, alcanzan una longitud por
nucleótido único de los cromosomas más frecuentes lectura de hasta 300 pb (96).
asociados a aneuploidías, permitiendo la identificación
de regiones específicas fetales o maternas en las lecturas La secuenciación por medio del secuenciador Ion Torrent
realizadas, analizando las diferencias de polimorfismo se lleva a cabo en un circuito integrado semiconductor,
entre el feto y la madre, mediante la comparación del ADN y se caracteriza por la amplificación de los fragmentos
de la fase celular (ADN materno) y del plasma (materno de ADN utilizando la técnica de RCP en emulsión y
y fetal). Previamente a la secuenciación, se realiza una la detección de las bases en la secuenciación se da por
RCP múltiple de 20 000 secuencias de polimorfismos de medio de la detección de un ion semiconductor (94, 97).
nucleótido único y posterior análisis bioinformático con Este método de secuenciación se basa en la detección del
base en las hipótesis de feto con trisomía, monosomía o cambio de voltaje por medio de un sensor o transistor de
euploide. En función de la posición de los polimorfismos efecto de campo sensible a los iones, que indica que el
de nucleótido único, y teniendo en cuenta la posibilidad nucleótido se ha incorporado correctamente (98). Este
de recombinación, se obtiene un valor estadístico de proceso alcanza una longitud de lectura de hasta 400 pb
índice de probabilidad que establece un riesgo relativo de (94, 97).
aneuploidía (91).
Para el análisis se han usado diferentes abordajes, puede ser realizada a partir de la semana 10, pero no existe
realizarse mediante la normalización del número de un límite superior. El tiempo promedio para entrega
lecturas obtenidas para el cromosoma de interés respecto del resultado está entre 4 a 10 días (dependiendo del
a otros cromosomas de referencia, de contenido en GC laboratorio y de las enfermedades que se detecten en
comparable y esperados disómicos, que son analizados una muestra) y el resultado se expresa como positivo
en el mismo ensayo (56, 99), o bien, mediante o negativo o sospecha de aneuploidía o ausencia de
la comparación con un grupo de casos euploides aneuploidía o como riesgo alto > 99 % o riesgo bajo
conocidos (31). También, mediante un valor Z-Score menor a 1/10 000 (3,101,104).
que expresa el valor de desviación del resultado
obtenido en el cromosoma de interés respecto a la Se necesita una FF mínima del 4 % para emitir un
situación euploide (32, 55). Las muestras se clasifican resultado fiable. Para interpretar la PPNI desde un
como positivas para T21 si en los valores de Z-Score punto de vista clínico, se recomienda que todos los
superan un valor límite preestablecido sobre la base de laboratorios incluyan en el informe emitido con
los casos euploides (32). los resultados la FF hallada, la técnica de análisis
empleada, la TFP y TFN para esa técnica, TD y el VPP
Otro abordaje se basa en el análisis mediante t-Students para la trisomía cribada (3,105-107).
de dos hipótesis: y el resultado se deba a la presencia
de un feto euploide o que sea consecuencia de la En cuanto a la forma de aplicación de la PPNI en el
presencia de un feto aneuploide y así calcular un valor ámbito clínico, se realiza como cribado primario. El
estadístico o índice de probabilidad (100). costo de esta prueba hace que, cualquier estrategia
basada en él como primera línea, suponga una
Varias compañías han comercializado la PPNI en todo derivación de recursos sanitarios difícilmente
el mundo, generalmente se toman muestras localmente justificable, especialmente en sectores poblacionales
y las envían a laboratorios para su procesamiento con un riego a priori bajo (3).
(101).
Como cribado secundario o modelo contingente,
Se encuentran disponibles PPNI de diferentes casas se utiliza el CCPT como prueba de primera línea
comerciales que ofrecen la detección de aneuploidías para detectar a las pacientes de alto riesgo o riesgo
de los cromosomas 13,18,21, y aneuploidias intermedio y ofrecer la posibilidad de realizar la PPNI
cromosómicas sexuales y adicional la detección frente a la prueba diagnóstica de AC. Se espera que
de otras alteraciones como aneuploidía en los este sistema incremente la TD y reduzca los FP sin
cromosomas 22, 16, 9; microdeleciones [síndrome de el incremento del costo que representaría aplicar el
deleción 1p36, 4p- o síndrome de Wolf-Hirschnorn, cribado mediante la PPNI a todas las pacientes (21,
5p- o síndrome de Cri-du-chat, 8q24.1 síndrome 40,108).
de Langer-Giedion, 11q23 síndrome de Jacobsen,
15q11 (asociada a los síndromes de Prader-Willi y El Colegio Americano de Obstetras y Ginecólogos y
Angelman) y 22q11.2 o síndrome de Di George], y la Sociedad de Medicina Materno-Fetal recomiendan
microduplicaciones (61,101-103). La cobertura de que las opciones de cribado genético y pruebas de
aneuploidías cromosómicas sexuales, otras AC y sexo diagnóstico prenatal se deben ofrecer a todas las
fetal varía según la compañía y el país (101). mujeres embarazadas, independiente de la edad
materna o riesgo de AC, y cada paciente tiene el
Por recomendaciones internacionales la PPNI debe derecho de continuar o rechazarlas (19).
en fetos sin afectación, se debe tener en cuenta que la cromosoma en concreto, pero los cromosomas varían
mayoría de FP son analíticamente correctos (realmente ligeramente entre individuos debido a variantes de
hay un aumento de material genético correspondiente número de copias (heredadas o de novo). En estos
a ese cromosoma) pero clínicamente incorrectos (ese individuos, la PPNI podría reportar un resultado
aumento de material genético no procede del feto). Las positivo cuando el tamaño de la duplicación materna
causas más frecuentes de FP son: el feto evanescente es relativamente grande y ocurre en un cromosoma de
en gestación inicialmente gemelar, la contribución de interés (por ejemplo, el cromosoma 18) (115,116).
ADN en plasma de un feto no evolutivo puede generar
resultados discordantes, debido a que ambos contribuyen Si la madre es receptora de trasplante obtenido de
a la FF (122). un donante masculino, la PPNI puede identificar
incorrectamente a un feto femenino como masculino.
En el mosaicismo confinado a la placenta (coexistencia Si ha recibido una transfusión de un donante masculino
de dos líneas celulares diferentes en la placenta: una antes de 4 semanas desde la obtención de la muestra
euploide y otra aneuploide), dado que la fuente principal de sangre, se puede identificar incorrectamente un feto
de ADN libre en la circulación materna procede de la femenino como masculino (124,127).
placenta, la PPNI proporcionará resultados relativos a
la placenta, que pueden ser discordantes con el tejido Los resultados FP también pueden ser fruto de
fetal. La experiencia adquirida mediante biopsia de la probabilidad estadística, ya que el límite para
vellosidades coriales indica que esto puede ocurrir en una prueba positiva a menudo se establece en +3
1 % - 2 % de los embarazos (123,124). desviaciones estándar. Por lo tanto, 1 o 2 por cada
1000 fetos euploides podrían tener un resultado FP
El cromosoma X, en particular, es el que más contribuye solo por casualidad (116).
al índice de FP debido a la pérdida relacionada con la
edad materna, una proporción cada vez mayor presenta En la interpretación de los resultados FN, en los cuales
un pequeño porcentaje de células que han perdido un la prueba es informada con un resultado que indica que
cromosoma X, a la presencia de un mosaicismo materno no existe ninguna AC y el feto está afectado, se debe
no diagnosticado como por ejemplo 45,X/46,XX. En tener en cuenta las siguientes causas:
estas mujeres, fenotípicamente normales, la pérdida de En el mosaicismo confinado a la placenta el ADN
una porción de la señal del cromosoma X se atribuiría al producto de la apoptosis de las células placentarias
feto siendo informadas como monosomía X fetal, algunas puede ser discordante con el tejido fetal, con lo cual es
mujeres pueden tener una aneuploidía de los cromosomas posible que un feto sea aneuploide, pero la placenta no
sexuales 47,XXX, desconocida en el 90 % de los casos refleje ese hallazgo. En estos casos, la PPNI detecta las
(125,126). células placentarias del mosaicismo que son euploides
aunque el feto es aneuploide (130).
La aparición de más de una aneuploidía al mismo
tiempo, ganancias y pérdidas subcromosómicas en La FF límite da como resultado una diferencia muy
múltiples cromosomas, puede sugerir una neoplasia pequeña en el porcentaje esperado (referencia normal)
maligna oculta materna, en la que el ADN tumoral se versus el porcentaje observado de fragmentos de
disemina hacia la circulación materna (127-129). cromosomas. Si no se secuencia una cantidad suficiente
de fragmentos, esta diferencia no se identifica y
La metodología de la PPNI supone que cada mujer los resultados se informan incorrectamente como
porta la misma proporción de material genético en un negativos (106).
En la PPNI con detección de microdeleciones y entre las 10-12 SG (3), debe incluir una breve
microduplicaciones y debido al número limitado de descripción de posibles pruebas de cribado, el
trastornos incluidos en la prueba, pueden dar FN como rendimiento y el marco de tiempo para el retorno de
es el caso del síndrome Prader-Willi, que representa los resultados, explicar al paciente en qué consisten,
solo el 65 % - 75 % de los casos con deleción sus beneficios y limitaciones, que su realización es
cromosómica, mientras que el resto son causados por voluntaria, se describen las AC a estudiar, que es
disomia uniparental o un solo gen afectado; o en el una prueba de cribado y si resulta positiva ha de ser
caso del síndrome de deleción 22q11.2, en el cual el confirmada con prueba genética diagnóstica y llevar
85 % tiene una deleción de 3 Mb en el cromosoma 22, a cabo un proceso de consentimiento informado (135,
pero existen deleciones atípicas las cuales no serían 136).
detectadas por la PPNI (131).
En el AG poscribado, los progenitores deben ser
Las mezclas de muestras u otros errores técnicos informados de forma oral y escrita. El informe que reciba
pueden dar lugar a resultados FP o FN, pero, es el paciente debe ser claro, junto con una explicación por
probable que estos se identifiquen como parte de las parte del profesional a cargo sobre la implicación de este
pruebas de seguimiento (106,132). La probabilidad resultado (137). Esto se realiza a través de una atención
estimada de FN de la PPNI varía entre 0,02 % y personalizada que se adecúe a la condición de cada
0,26 % (133). paciente, posibles procedimientos que pudieran derivar
del resultado, todas las opciones diagnósticas con los
El Colegio Americano de Genética Médica y Genómica, beneficios, riesgos y limitaciones de cada una de ellas y
publicó una guía de recomendaciones para llevar las posibilidades tras el diagnóstico, la descripción clínica,
a cabo la PPNI. Incluye recomendaciones para los pronóstico fetal, las posibles decisiones terapéuticas,
laboratorios que ofrecen PPNI, para que los pacientes riesgo de recurrencia y, en caso necesario, de la necesidad
reciban información precisa y actualizada y que los de estudios familiares. Según sea el caso, indicaciones a
profesionales médicos dispongan de herramientas seguir en futuro embarazo. Se notifica de las opciones
adecuadas y reciban informes de laboratorio claros reproductivas de estas parejas, nuevo embarazo sin o con
para proporcionar asesoramiento genético (AG), en las técnicas de reproducción asistida, tales como diagnóstico
primeras etapas del embarazo, para optimizar la toma de genético preimplantacional, donación de gametos o
decisiones por parte de los pacientes y la colaboración embriones, adopción (3, 135).
de los laboratorios con oficinas públicas de salud,
agencias reguladoras y fondos privados, para hacer
que estas pruebas así como el AG previo y posterior
estén al alcance de todas las mujeres embarazadas. Sin conflictos de interés.
La mayoría de los centros médicos académicos y las
clínicas especializadas de medicina materno-fetal en
los EE. UU, proporcionan ambos (101,134). REFERENCIAS
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